FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1144, 477 aa 1>>>pF1KA1144 477 - 477 aa - 477 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7016+/-0.000976; mu= 14.8712+/- 0.058 mean_var=70.1522+/-14.423, 0's: 0 Z-trim(104.1): 126 B-trim: 86 in 2/47 Lambda= 0.153128 statistics sampled from 7594 (7742) to 7594 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16 Scan time: 3.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 3168 709.5 1.9e-204 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 1703 385.9 5.3e-107 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 1002 231.0 2.3e-60 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 989 228.2 1.8e-59 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 960 221.7 1.4e-57 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 944 218.2 1.7e-56 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 864 200.6 5.7e-51 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 861 200.0 8.5e-51 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 812 189.0 8.5e-48 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 756 176.7 5e-44 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 662 155.9 9.1e-38 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 645 152.1 1.1e-36 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 644 151.9 1.5e-36 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 633 149.5 7.1e-36 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 625 147.7 2.5e-35 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 616 145.7 1e-34 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 605 143.4 7.1e-34 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 594 140.9 3.4e-33 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 568 135.2 2e-31 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 568 135.2 2.1e-31 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 545 130.1 6.9e-30 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 541 129.2 1.2e-29 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 446 108.2 2.2e-23 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 435 105.8 1.4e-22 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 370 91.4 2.9e-18 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 370 91.4 2.9e-18 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 347 86.3 8.1e-17 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 283 72.3 2.1e-12 CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 268 69.0 2.5e-11 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 263 67.8 3.2e-11 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 263 67.8 3.6e-11 CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 264 68.1 4.1e-11 CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 264 68.1 4.6e-11 CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 264 68.1 4.7e-11 CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 255 65.9 8.6e-11 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa) initn: 3168 init1: 3168 opt: 3168 Z-score: 3783.8 bits: 709.5 E(32554): 1.9e-204 Smith-Waterman score: 3168; 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CCDS16 TSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 RQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR .::... . : : . .:.: :.:: ::........::... CCDS16 KQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIE 420 430 440 450 460 470 CCDS16 DNEDICNTTSLENCTAK 480 490 >>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa) initn: 862 init1: 358 opt: 1002 Z-score: 1197.2 bits: 231.0 E(32554): 2.3e-60 Smith-Waterman score: 1003; 38.6% identity (69.4% similar) in 438 aa overlap (8-428:51-476) 10 20 30 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR :.: .... :: ::::: . : :: : CCDS10 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KA1 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC :: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.: : .. : .::: .. :.: CCDS10 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND ..::..:. ::::.: .. :: . ::.: .: . .:.. . : . CCDS10 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS .:.. : .. .:... .:: .. ..::. :::: : . ...:....::.. .. CCDS10 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV ::. .. . ::: . .:::..:. ::. : : .::.. ::.::...: :.:..:. CCDS10 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 pF1KA1 VNLVVESTPT----------LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSY :. : : : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :.. CCDS10 VS---EEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCT 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 KEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGT .: :::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. : ..::: .::: .:::::::::.:: . CCDS10 REFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRS 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 TAGKLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVP . :...: . ::.:::....: : ::. ::: : ..:.::.. .: CCDS10 VPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECE 430 440 450 460 470 480 450 460 470 pF1KA1 SVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR CCDS10 LLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM 490 500 510 >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 1008 init1: 301 opt: 989 Z-score: 1181.3 bits: 228.2 E(32554): 1.8e-59 Smith-Waterman score: 989; 39.2% identity (67.8% similar) in 416 aa overlap (19-424:99-507) 10 20 30 40 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL . .:::: . .: : ::.:::::: CCDS64 DDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFPKTRLGRLAT 70 80 90 100 110 120 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW :: : :::::.. :..:::.: .: : .:: .: : :. :: : .:. :: CCDS64 STSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPRRFLEELGYW 130 140 150 160 170 180 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN :. . :: .. :. : .:. : . .. .. .: .. : .: : : CCDS64 GVRLKYTPRCCRICFEERRDE-LSERLKIQHELRAQ-AQVEEAEELFRDM-RFYG-PQ-- 190 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGED--PR ::.:: ...: :: ...... : :. :.... ::.. ..: ..::. : : : CCDS64 -RRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLRPI 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 FEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVV----E .: :: . ...::.: . :.: .::. .: ..::::.::..:.:.:. :... . . CCDS64 LEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEGHQ 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 pF1KA1 STPTLANLGRVAQVLR---LMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVG :....:.:.:::: ::::::::::::::::::..: ::. :..:: :::....: CCDS64 RGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIAMG 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 ISIFSVVAYTIEKE-ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG : ::...:..:.. . ...::: ::::.::..::::::. : : :.. : :: : CCDS64 IFTFSAAVYSVEHDVPSTNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCIAFG 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS :.. .::....:::: .: . : : CCDS64 IILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQLTP 490 500 510 520 530 540 >>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa) initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1147.1 bits: 221.7 E(32554): 1.4e-57 Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (19-422:65-472) 10 20 30 40 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL : :::::.: : :: .:: ::::.: CCDS13 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW : . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. :: CCDS13 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG :: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .: CCDS13 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG 160 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE . :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. .. CCDS13 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE ::: ..::..:.. :. ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. .. CCDS13 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 pF1KA1 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY . : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::. CCDS13 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LSVGISIFSVVAYTIEKEENEG--LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA : :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: . CCDS13 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK ::.:::....:.: ::. ::. : . :: CCDS13 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG 450 460 470 480 490 500 >>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa) initn: 1534 init1: 750 opt: 944 Z-score: 1127.9 bits: 218.2 E(32554): 1.7e-56 Smith-Waterman score: 1561; 51.3% identity (77.5% similar) in 472 aa overlap (16-469:49-519) 10 20 30 40 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGR : .:.:::: .:.: ...: ::: ::::: CCDS13 VLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGR 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 LLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEI : :.: .::::::.. :::::::.: .: .::::.::.:::. :::::.:.:: CCDS13 LQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEA 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 EYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSF-DEILAFYNDASKFDGQ .:::..: . .:: : :.. . . :::.:: :... ::: . ... . CCDS13 DYWGLGENALAACCRARYLERRLT-QPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAA 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 pF1KA1 PLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQG----- : .::.:::...:::::. :..:: .:: ::..:: .::..:::..: .. . CCDS13 RCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAV 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 ----NP-G--EDPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFY .: : .:: .. .:.: ::::.::. .:. .::. .:: . :::::..:..::: CCDS13 AAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFY 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 ITLVVNLVV--ESTPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVG .::...... .. ...::.:.::.:::::::.::::::::::::::::::.::.::: CCDS13 LTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVG 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLT .:::::.::.:.:: :::: ::::. :. ::::::::.:::::::::::::: :.::::. CCDS13 ILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVGFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLA 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 pF1KA1 ASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCD---FGDGMKEVPSVNLRDY ::.:::.:::::.::::.::::::::::::: ::.:.:. . : : .. . .:. . CCDS13 ASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSIDGVSEASL 440 450 460 470 480 490 450 460 470 pF1KA1 YAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR . . : .. ... ..::: CCDS13 ETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY 500 510 520 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 1249 init1: 562 opt: 864 Z-score: 1028.6 bits: 200.6 E(32554): 5.7e-51 Smith-Waterman score: 1270; 41.1% identity (75.4% similar) in 472 aa overlap (8-475:26-485) 10 20 30 40 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETR :. .... . ...:::::..... .:: :.:.:: CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 LGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFS ::.: :...:..::.::::. . :..:::.: : .:.::.:::::.: :.:..::. CCDS62 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 QEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFD ::..::::.:....:::. :: .: :. .:. .:. : : . .:: CCDS62 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELRREAETMRERE-------GEEFD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 GQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPG . . :..:: :..:. :: .....:.::: .. : :.. ::.::..: : :. . CCDS62 NTCCPDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLN 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 EDPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE .. .. :: :::::.: . :: .:. ::::. ::.:::..:.:.:.:. .. . CCDS62 DNRQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNK 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 STPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISI :. . :. ::.:..:.:::.::::::::::::.::: ::. ::.:.:::.:.:..:: : CCDS62 SVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMI 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 FSVVAYTIEKEENEG-LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILV :: ... ::.:. ...::: .::::..::::::::. : : ::.... : .::.:: CCDS62 FSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 VVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKE---VPSVNLRDYYAHKVKSLMAS ..::: .: :.::.::..::. :.:.. . . :. . :.::.: .:.... . .. CCDS62 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVA 410 420 430 440 450 460 460 470 pF1KA1 LTNMSRSSPSELSLNDSLR . . ..:. .. : .:. CCDS62 VEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTS 470 480 490 500 510 520 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 1290 init1: 567 opt: 861 Z-score: 1025.4 bits: 200.0 E(32554): 8.5e-51 Smith-Waterman score: 1256; 42.6% identity (75.3% similar) in 441 aa overlap (19-455:33-461) 10 20 30 40 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL .:.::::. ... .:: :.:.::::.: CCDS13 AGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW :......::.::::. . :..:::.: : .:.::.::.::.: :.:..:::::..:: CCDS13 CNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYW 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGN ::.:....:::. :: .: :. .:. .:. : : . .::. .. CCDS13 GIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELKREAETLRERE-------GEEFDNTCCAE 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 FRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFE :..:: :..:. :: .....:.::. .. : :.. ::.::..: : :. ..:.. CCDS13 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 IVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLA :: :::::.: . :: .: ::::. :: :::..:.:.:.:. .. .:. . CCDS13 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 NLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAY :. ::.:..:.:::.::::::::::::.::: ::. ::.:.:::.:.:..:: ::: ... CCDS13 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 TIEKEENEG-LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPIT ::.:.. . .::: .::::..::::::::. : : ::.... : .::.::..::: CCDS13 FAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 LIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKE---VPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSR .: :.::.::..::. :.:.. . . :. . :.:..: .:.... . CCDS13 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGE 420 430 440 450 460 470 470 pF1KA1 SSPSELSLNDSLR CCDS13 NMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSSPQHLNVQQLE 480 490 500 510 520 530 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 824 init1: 324 opt: 812 Z-score: 971.5 bits: 189.0 E(32554): 8.5e-48 Smith-Waterman score: 871; 33.9% identity (66.1% similar) in 433 aa overlap (19-429:11-427) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHSREAILELCD . .:::: . : . : :: :..:: :.:.. .::.:: CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVCD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KA1 DYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHT-GKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINEFFIDSCC ::: . :..:::. : : ..: . . :::. ..: .:: .:. :::.. .. :: CCDS18 DYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYCC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 SYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQLWL---- :.. :.. .. : : :: .. : .. : . :: :: CCDS18 ------------QRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRR--WLERMR 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KA1 -ALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQ--IPDSQG---------NPGE ....: :. ..... .:.. :. :....: ..:::.. :... .::. CCDS18 RTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGR 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 DPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVES .: :.: . :.::: : ..:: :. . .: : ::.:::..:.:.::...... . CCDS18 EPS-GIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 TPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIF . : : . .:::.:::: ..::::: ::..:: ::: :.:. .::... :...:: CCDS18 NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIF 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 pF1KA1 SVVAYTIE-----KEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAG :... .: . :. ...::: ::. .:::::::::. : :. :.. ...:...: CCDS18 SALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSG 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 ILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMAS :....::::.:...: . :.. : ..:: : CCDS18 IVLLALPITFIYHSFVQCYHELK-FRSARYSRSLSTEFLN 400 410 420 430 460 470 pF1KA1 LTNMSRSSPSELSLNDSLR >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa) initn: 1039 init1: 497 opt: 756 Z-score: 903.8 bits: 176.7 E(32554): 5e-44 Smith-Waterman score: 1047; 39.3% identity (71.8% similar) in 425 aa overlap (10-428:16-424) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLLCHS--R : : .: :: .:::: .. : . : ..:::::..:. : . CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 EAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYWGINE ..:. :::::: .:::::::.:. : :.. :. :..:. .: . :..:...: .. CCDS16 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 FFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDGQPLGNFRRQ :.:.::. :. ..: .:. .: . . . .:.. . ::.. : .:: CCDS16 KFLDDCCK-SHLSEK----REELEEIARRVQLI--LDDLGV---DAAE------GRWRRC 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KA1 ---LWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGEDPRFEI .: :..: : .:: ..::.:... : ..::....:..:. :..:: : : .: CCDS16 QKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLEN 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 VEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVESTPTLAN :: :.:::.: . :. .:. :.: . .:..:...:.:::..:... . :.: CCDS16 VETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTN 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISIFSVVAYT . ...:.::.::: ::.::::::.::..: .:: :.::.::::.::.::: .::...:: CCDS16 VQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYT 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 IEKEENEGL-ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILVVVLPITL .:. . : : .:: .::: ..::::::::. : :: :::.:. .: :.....::: CCDS16 MEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHP 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 IFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPS :.:.: ..: .:. ::.: . CCDS16 IINNFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSC 410 420 430 440 450 460 477 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 20:36:43 2016 done: Wed Nov 2 20:36:44 2016 Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]