Result of FASTA (omim) for pF1KA1116
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1116, 1271 aa
  1>>>pF1KA1116 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2503+/-0.000549; mu= -21.6270+/- 0.034
 mean_var=743.5602+/-155.170, 0's: 0 Z-trim(122.9): 21  B-trim: 870 in 1/60
 Lambda= 0.047034
 statistics sampled from 41813 (41838) to 41813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.491), width:  16
 Scan time: 12.780

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001273128 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform  (1271) 8658 604.1  2e-171
NP_055707 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [ (1271) 8658 604.1  2e-171
NP_001273123 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform  (1316) 8658 604.1  2e-171
NP_001273117 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform  (1349) 8658 604.1 2.1e-171
NP_001273118 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform  (1337) 8599 600.1 3.3e-170
XP_005261074 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1088) 1325 106.4 1.1e-21
NP_001138916 (OMIM: 616023) splicing factor, argin (1132) 1325 106.4 1.1e-21
XP_016883904 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1146) 1325 106.4 1.1e-21
NP_065757 (OMIM: 616023) splicing factor, arginine (1147) 1325 106.4 1.1e-21
XP_006724098 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1143) 1316 105.8 1.7e-21
XP_016883906 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1066) 1273 102.9 1.3e-20
XP_016883905 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1124) 1273 102.9 1.3e-20
NP_001138917 (OMIM: 616023) splicing factor, argin (1125) 1273 102.9 1.3e-20
XP_006724099 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing fa (1121) 1264 102.3   2e-20


>>NP_001273128 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [H  (1271 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3198.6  bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270 
pF1KA1 PVVESTETEGT
       :::::::::::
NP_001 PVVESTETEGT
             1270 

>>NP_055707 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform d [Homo  (1271 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3198.6  bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270 
pF1KA1 PVVESTETEGT
       :::::::::::
NP_055 PVVESTETEGT
             1270 

>>NP_001273123 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform c [H  (1316 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3198.4  bits: 604.1 E(85289): 2e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:46-1316)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
          20        30        40        50        60        70     

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
          80        90       100       110       120       130     

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
         140       150       160       170       180       190     

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
         200       210       220       230       240       250     

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
         260       270       280       290       300       310     

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
         320       330       340       350       360       370     

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
         380       390       400       410       420       430     

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
         440       450       460       470       480       490     

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
         500       510       520       530       540       550     

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
         560       570       580       590       600       610     

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
         620       630       640       650       660       670     

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
         680       690       700       710       720       730     

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
         740       750       760       770       780       790     

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
         800       810       820       830       840       850     

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
         860       870       880       890       900       910     

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
         920       930       940       950       960       970     

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
         980       990      1000      1010      1020      1030     

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
        1100      1110      1120      1130      1140      1150     

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
        1160      1170      1180      1190      1200      1210     

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
        1220      1230      1240      1250      1260      1270     

             1240      1250      1260      1270 
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
        1280      1290      1300      1310      

>>NP_001273117 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform a [H  (1349 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3198.3  bits: 604.1 E(85289): 2.1e-171
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:79-1349)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRSSPRLALPTQCSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
       50        60        70        80        90       100        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
      110       120       130       140       150       160        

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
      170       180       190       200       210       220        

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
      230       240       250       260       270       280        

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
      290       300       310       320       330       340        

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
      350       360       370       380       390       400        

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
      410       420       430       440       450       460        

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
      470       480       490       500       510       520        

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
      530       540       550       560       570       580        

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
      590       600       610       620       630       640        

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
      650       660       670       680       690       700        

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
      710       720       730       740       750       760        

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
      770       780       790       800       810       820        

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
      830       840       850       860       870       880        

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
      890       900       910       920       930       940        

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
      950       960       970       980       990      1000        

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
     1010      1020      1030      1040      1050      1060        

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
     1190      1200      1210      1220      1230      1240        

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
     1250      1260      1270      1280      1290      1300        

             1240      1250      1260      1270 
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
     1310      1320      1330      1340         

>>NP_001273118 (OMIM: 616024) protein SCAF8 isoform b [H  (1337 aa)
 initn: 8599 init1: 8599 opt: 8599  Z-score: 3176.7  bits: 600.1 E(85289): 3.3e-170
Smith-Waterman score: 8606; 98.3% identity (98.4% similar) in 1292 aa overlap (1-1271:46-1337)

                                             10                    
pF1KA1                               MEAVKTFNSE--------------------
                                     ::::::::::                    
NP_001 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSEDCASTPACTDCFSSSMDTRS
          20        30        40        50        60        70     

                20        30        40        50        60         
pF1KA1 -LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
          80        90       100       110       120       130     

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
         140       150       160       170       180       190     

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA1 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
         200       210       220       230       240       250     

     190       200       210       220       230       240         
pF1KA1 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
         260       270       280       290       300       310     

     250       260       270       280       290       300         
pF1KA1 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
         320       330       340       350       360       370     

     310       320       330       340       350       360         
pF1KA1 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
         380       390       400       410       420       430     

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA1 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
         440       450       460       470       480       490     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
         500       510       520       530       540       550     

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
         560       570       580       590       600       610     

     550       560       570       580       590       600         
pF1KA1 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
         620       630       640       650       660       670     

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA1 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
         680       690       700       710       720       730     

     670       680       690       700       710       720         
pF1KA1 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
         740       750       760       770       780       790     

     730       740       750       760       770       780         
pF1KA1 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
         800       810       820       830       840       850     

     790       800       810       820       830       840         
pF1KA1 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
         860       870       880       890       900       910     

     850       860       870       880       890       900         
pF1KA1 NNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
         920       930       940       950       960       970     

     910       920       930       940       950       960         
pF1KA1 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
         980       990      1000      1010      1020      1030     

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pF1KA1 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

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pF1KA1 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
        1100      1110      1120      1130      1140      1150     

    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KA1 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
        1160      1170      1180      1190      1200      1210     

    1150      1160      1170      1180      1190      1200         
pF1KA1 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
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pF1KA1 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
        1280      1290      1300      1310      1320      1330     

    1270 
pF1KA1 GT
       ::
NP_001 GT
         

>>XP_005261074 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing factor  (1088 aa)
 initn: 1712 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 510.3  bits: 106.4 E(85289): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 2295; 40.3% identity (61.7% similar) in 1150 aa overlap (1-1100:1-1045)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::.:::::: :::::.::::::::
XP_005 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIKLYKHVVQIVEKFIKKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
XP_005 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
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pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
XP_005 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
              130       140          150       160        170      

      180       190       200       210              220       230 
pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQ-------IQQQKPQPSILQALDAGLVV
       : :. ..:..:::::..:. :::  :.:.. ..       ....: . .   .  :  ..
XP_005 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQ--QKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAAA
        180       190         200       210       220       230    

             240       250       260       270       280       290 
pF1KA1 QLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHV
          : :: . :::: : .  :  :.            ::  ..  ..:      .:    
XP_005 VPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQA-----------PFGFPGDGMQQP----AYTQ----
          240       250                  260       270             

             300       310       320       330       340       350 
pF1KA1 SESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSS
                ::  .:.: . .  ..:. ...: :    : ..:   ::     .:     
XP_005 ---------HQNMDQFQPR-MMGIQQDPMHHQVP---LPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPM
                  280        290          300       310         320

               360       370       380          390       400      
pF1KA1 QQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRS
        :  . :   :.   . ..: :.  . .     : :: .   ::.:.    .: ...:::
XP_005 AQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPHQQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRS
              330       340       350       360       370          

        410       420       430       440       450       460      
pF1KA1 RSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPP
        ::::..::::: : ::. .:: :::::::.:.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: 
XP_005 ASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRDRRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQ
     380       390       400        410       420       430        

        470       480       490       500       510       520      
pF1KA1 IRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAF
       .. .: :::::::::::.::..::::...:.:::: ::::::::::::::. :::::::.
XP_005 VKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLLEEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAY
      440       450       460       470       480       490        

        530       540       550       560       570       580      
pF1KA1 RALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAE
       ::::::: :.::...: ::::::::::.:..:::.:::.::::::::.::: ..::.: :
XP_005 RALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKADYKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCE
      500       510       520       530       540       550        

        590       600       610              620       630         
pF1KA1 GGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT-------TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVA
       :::.:..:.: .:. . . .: .:..:.       :.  .:. :   : .     : :..
XP_005 GGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGAETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPIT
      560       570        580       590       600       610       

     640          650        660       670            680       690
pF1KA1 ML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVPPPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPP
       .   :.:   :. :.: .: ::::   . .:::::.:      ::::::: .::: . ::
XP_005 VPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIPPPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPP
       620       630       640       650       660       670       

              700         710       720        730       740       
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPSLS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLA
       ::.::  :::..:: .:::  . : :. . ... .. .:.::...:.             
XP_005 GFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNSTIAGINEDTTKDLSIGN-------------
       680       690       700       710       720                 

       750       760       770       780       790       800       
pF1KA1 TSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVT
           :  .: ..   .::  ..: ..    .  .  :    :  ... ...:: :    .
XP_005 ----PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAVPPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---V
              730       740        750       760        770        

       810       820       830       840        850       860      
pF1KA1 SNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNS
       . . ..:.: :...    .::.::       :.:  : ::         :. :: ..   
XP_005 APGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR--
         780           790              800                810     

        870       880       890       900        910       920     
pF1KA1 GLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLD
         . ..::  :    ..   ::  :. :: ..  :: : .. .:: . :  :   :: : 
XP_005 --FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGFAMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG
             820        830          840       850        860      

         930           940       950       960       970       980 
pF1KA1 IRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPER
         ::  : .:    : . :  ::   ::   :     ..  .:::    :: .  .::..
XP_005 -GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQAPQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ
         870       880       890       900       910         920   

             990        1000         1010        1020      1030    
pF1KA1 PFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVD
        :   .::. ..  . :.  :  .::   .. .. :.:  :      . ::   : :  :
XP_005 -FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVENDRERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRD
            930       940       950       960       970       980  

          1040      1050       1060      1070      1080        1090
pF1KA1 V-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--E
         ::.  :  . : .  :    :.::. .:     ::.    : ..    :. : :   :
XP_005 RHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVE
            990        1000      1010           1020      1030     

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KA1 KPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFD
        : .. :. :                                                  
XP_005 PPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEELPAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR       
        1040      1050      1060      1070      1080               

>>NP_001138916 (OMIM: 616023) splicing factor, arginine/  (1132 aa)
 initn: 1712 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 510.1  bits: 106.4 E(85289): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 2365; 40.4% identity (61.5% similar) in 1179 aa overlap (1-1100:1-1089)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::               :::::::
NP_001 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIK---------------CKPEYKV
               10        20        30                       40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
NP_001 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170          
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
NP_001 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
         110       120          130       140        150       160 

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
NP_001 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
             170       180       190        200          210       

      240           250       260       270       280              
pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.:::.::::. .. :  :: :::            
NP_001 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
       220       230       240       250       260       270       

             290                300             310       320      
pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
NP_001 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
       280       290       300       310       320       330       

            330       340       350         360       370       380
pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
NP_001 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
       340       350         360       370       380       390     

                 390       400       410       420       430       
pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
NP_001 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
         400       410        420       430       440        450   

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
NP_001 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
           460       470       480       490       500       510   

       500       510       520       530       540       550       
pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
NP_001 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
           520       530       540       550       560       570   

       560       570       580       590       600       610       
pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
NP_001 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
           580       590       600       610       620        630  

              620       630       640          650        660      
pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
NP_001 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
            640       650       660       670       680       690  

        670            680       690       700         710         
pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
       ::::.:      ::::::: .::: . ::::.::  :::..:: .:::  . : :. . .
NP_001 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
            700       710       720       730       740       750  

     720        730       740       750       760       770        
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
       .. .. .:.::...:.                 :  .: ..   .::  ..: ..    .
NP_001 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
            760                        770       780        790    

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
         .  :    :  ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       
NP_001 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
          800        810          820       830                    

      840        850       860       870       880       890       
pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
       :.:  : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: .
NP_001 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
     840                850           860        870          880  

       900        910       920       930           940       950  
pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
       .  :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   
NP_001 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
            890        900       910        920       930       940

            960       970       980       990        1000          
pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
       :     ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   ..
NP_001 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
              950       960          970       980       990       

      1010        1020      1030       1040      1050       1060   
pF1KA1 IQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRP
        .. :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .: 
NP_001 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
      1000      1010      1020      1030        1040      1050     

          1070      1080        1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
           ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                     
NP_001 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
                                                                   
NP_001 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR                                      
             1120      1130                                        

>>XP_016883904 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing factor  (1146 aa)
 initn: 1712 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 510.0  bits: 106.4 E(85289): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 2464; 41.3% identity (62.6% similar) in 1179 aa overlap (1-1100:1-1103)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::.:::::: :::::.::::::::
XP_016 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIKLYKHVVQIVEKFIKKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
XP_016 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
XP_016 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
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pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
XP_016 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
        180       190       200        210          220       230  

      240           250       260       270       280              
pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.: :.::::. .. :  :: :::            
XP_016 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDK-LLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
            240       250        260       270       280       290 

             290                300             310       320      
pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
XP_016 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
XP_016 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
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                 390       400       410       420       430       
pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
XP_016 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
     410       420       430        440       450        460       

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
XP_016 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
       470       480       490       500       510       520       

       500       510       520       530       540       550       
pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
XP_016 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
       530       540       550       560       570       580       

       560       570       580       590       600       610       
pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
XP_016 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
       590       600       610       620       630        640      

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pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
XP_016 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
        650       660       670       680       690       700      

        670            680       690       700         710         
pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
       ::::.:      ::::::: .::: . ::::.::  :::..:: .:::  . : :. . .
XP_016 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
        710       720       730       740       750       760      

     720        730       740       750       760       770        
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
       .. .. .:.::...:.                 :  .: ..   .::  ..: ..    .
XP_016 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
        770       780                        790       800         

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
         .  :    :  ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       
XP_016 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
      810        820       830          840           850          

      840        850       860       870       880       890       
pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
       :.:  : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: .
XP_016 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
           860                870            880       890         

       900        910       920       930           940       950  
pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
       .  :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   
XP_016 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
        900       910        920        930       940       950    

            960       970       980       990        1000          
pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
       :     ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   ..
XP_016 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
          960       970         980        990      1000      1010 

      1010        1020      1030       1040      1050       1060   
pF1KA1 IQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRP
        .. :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .: 
XP_016 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
            1020      1030      1040        1050      1060         

          1070      1080        1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
           ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                     
XP_016 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

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pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
                                                                   
XP_016 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR                                      
         1130      1140                                            

>>NP_065757 (OMIM: 616023) splicing factor, arginine/ser  (1147 aa)
 initn: 1955 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 510.0  bits: 106.4 E(85289): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 2482; 41.4% identity (62.7% similar) in 1179 aa overlap (1-1100:1-1104)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::.:::::: :::::.::::::::
NP_065 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIKLYKHVVQIVEKFIKKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
NP_065 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170          
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
NP_065 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
              130       140          150       160        170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
NP_065 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
        180       190       200        210          220       230  

      240           250       260       270       280              
pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.:::.::::. .. :  :: :::            
NP_065 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
            240       250       260       270       280       290  

             290                300             310       320      
pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
NP_065 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
NP_065 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
            360       370         380       390       400       410

                 390       400       410       420       430       
pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
NP_065 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
              420       430        440       450       460         

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
NP_065 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
      470       480       490       500       510       520        

       500       510       520       530       540       550       
pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
NP_065 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
      530       540       550       560       570       580        

       560       570       580       590       600       610       
pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
NP_065 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
      590       600       610       620       630        640       

              620       630       640          650        660      
pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
NP_065 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
       650       660       670       680       690       700       

        670            680       690       700         710         
pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
       ::::.:      ::::::: .::: . ::::.::  :::..:: .:::  . : :. . .
NP_065 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
       710       720       730       740       750       760       

     720        730       740       750       760       770        
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
       .. .. .:.::...:.                 :  .: ..   .::  ..: ..    .
NP_065 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
       770       780                        790       800          

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
         .  :    :  ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       
NP_065 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
     810       820        830          840           850           

      840        850       860       870       880       890       
pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
       :.:  : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: .
NP_065 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
          860                870            880       890          

       900        910       920       930           940       950  
pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
       .  :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   
NP_065 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
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pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
       :     ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   ..
NP_065 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
         960       970         980        990      1000      1010  

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pF1KA1 IQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRP
        .. :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .: 
NP_065 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
           1020      1030      1040        1050      1060          

          1070      1080        1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
           ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                     
NP_065 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
                                                                   
NP_065 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR                                      
        1130      1140                                             

>>XP_006724098 (OMIM: 616023) PREDICTED: splicing factor  (1143 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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