Result of FASTA (ccds) for pF1KA1116
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1116, 1271 aa
  1>>>pF1KA1116 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1900+/-0.00136; mu= -15.9272+/- 0.082
 mean_var=608.8143+/-125.498, 0's: 0 Z-trim(114.8): 39  B-trim: 170 in 1/54
 Lambda= 0.051979
 statistics sampled from 15283 (15314) to 15283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.47), width:  16
 Scan time:  4.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5247.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6          (1271) 8658 665.4 2.6e-190
CCDS75541.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6         (1349) 8658 665.4 2.7e-190
CCDS69226.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6         (1337) 8599 661.0 5.8e-189
CCDS54482.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21        (1132) 1325 115.5 8.2e-25
CCDS33537.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21        (1147) 1325 115.5 8.3e-25
CCDS46644.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21        (1125) 1273 111.5 1.2e-23


>>CCDS5247.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6               (1271 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3530.2  bits: 665.4 E(32554): 2.6e-190
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 QITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 HQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 NLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 SKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 SMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPP
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 FGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270 
pF1KA1 PVVESTETEGT
       :::::::::::
CCDS52 PVVESTETEGT
             1270 

>>CCDS75541.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6              (1349 aa)
 initn: 8658 init1: 8658 opt: 8658  Z-score: 3529.8  bits: 665.4 E(32554): 2.7e-190
Smith-Waterman score: 8658; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:79-1349)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRSSPRLALPTQCSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQIT
       50        60        70        80        90       100        

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSN
      110       120       130       140       150       160        

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLAST
      170       180       190       200       210       220        

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTL
      230       240       250       260       270       280        

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFG
      290       300       310       320       330       340        

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATP
      350       360       370       380       390       400        

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQE
      410       420       430       440       450       460        

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSER
      470       480       490       500       510       520        

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIP
      530       540       550       560       570       580        

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTY
      590       600       610       620       630       640        

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQ
      650       660       670       680       690       700        

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPP
      710       720       730       740       750       760        

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSA
      770       780       790       800       810       820        

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS
      830       840       850       860       870       880        

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS75 GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLG
      890       900       910       920       930       940        

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGL
      950       960       970       980       990      1000        

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQS
     1010      1020      1030      1040      1050      1060        

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPG
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVY
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFC
     1190      1200      1210      1220      1230      1240        

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPV
     1250      1260      1270      1280      1290      1300        

             1240      1250      1260      1270 
pF1KA1 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT
     1310      1320      1330      1340         

>>CCDS69226.1 SCAF8 gene_id:22828|Hs108|chr6              (1337 aa)
 initn: 8599 init1: 8599 opt: 8599  Z-score: 3506.0  bits: 661.0 E(32554): 5.8e-189
Smith-Waterman score: 8606; 98.3% identity (98.4% similar) in 1292 aa overlap (1-1271:46-1337)

                                             10                    
pF1KA1                               MEAVKTFNSE--------------------
                                     ::::::::::                    
CCDS69 SGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSEDCASTPACTDCFSSSMDTRS
          20        30        40        50        60        70     

                20        30        40        50        60         
pF1KA1 -LYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ILYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSI
          80        90       100       110       120       130     

      70        80        90       100       110       120         
pF1KA1 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQ
         140       150       160       170       180       190     

     130       140       150       160       170       180         
pF1KA1 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLA
         200       210       220       230       240       250     

     190       200       210       220       230       240         
pF1KA1 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANT
         260       270       280       290       300       310     

     250       260       270       280       290       300         
pF1KA1 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQ
         320       330       340       350       360       370     

     310       320       330       340       350       360         
pF1KA1 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQ
         380       390       400       410       420       430     

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA1 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRK
         440       450       460       470       480       490     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKAT
         500       510       520       530       540       550     

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWA
         560       570       580       590       600       610     

     550       560       570       580       590       600         
pF1KA1 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVK
         620       630       640       650       660       670     

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA1 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPG
         680       690       700       710       720       730     

     670       680       690       700       710       720         
pF1KA1 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKD
         740       750       760       770       780       790     

     730       740       750       760       770       780         
pF1KA1 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIP
         800       810       820       830       840       850     

     790       800       810       820       830       840         
pF1KA1 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNIL
         860       870       880       890       900       910     

     850       860       870       880       890       900         
pF1KA1 NNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLP
         920       930       940       950       960       970     

     910       920       930       940       950       960         
pF1KA1 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGP
         980       990      1000      1010      1020      1030     

     970       980       990      1000      1010      1020         
pF1KA1 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISR
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

    1030      1040      1050      1060      1070      1080         
pF1KA1 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP
        1100      1110      1120      1130      1140      1150     

    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KA1 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDF
        1160      1170      1180      1190      1200      1210     

    1150      1160      1170      1180      1190      1200         
pF1KA1 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGD
        1220      1230      1240      1250      1260      1270     

    1210      1220      1230      1240      1250      1260         
pF1KA1 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETE
        1280      1290      1300      1310      1320      1330     

    1270 
pF1KA1 GT
       ::
CCDS69 GT
         

>>CCDS54482.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21             (1132 aa)
 initn: 1712 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 558.9  bits: 115.5 E(32554): 8.2e-25
Smith-Waterman score: 2365; 40.4% identity (61.5% similar) in 1179 aa overlap (1-1100:1-1089)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::               :::::::
CCDS54 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIK---------------CKPEYKV
               10        20        30                       40     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
CCDS54 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170          
pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
CCDS54 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
         110       120          130       140        150       160 

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
CCDS54 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
             170       180       190        200          210       

      240           250       260       270       280              
pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.:::.::::. .. :  :: :::            
CCDS54 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
       220       230       240       250       260       270       

             290                300             310       320      
pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
CCDS54 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
       280       290       300       310       320       330       

            330       340       350         360       370       380
pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
CCDS54 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
       340       350         360       370       380       390     

                 390       400       410       420       430       
pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
CCDS54 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
         400       410        420       430       440        450   

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
CCDS54 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
           460       470       480       490       500       510   

       500       510       520       530       540       550       
pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
CCDS54 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
           520       530       540       550       560       570   

       560       570       580       590       600       610       
pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
CCDS54 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
           580       590       600       610       620        630  

              620       630       640          650        660      
pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
CCDS54 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
            640       650       660       670       680       690  

        670            680       690       700         710         
pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
       ::::.:      ::::::: .::: . ::::.::  :::..:: .:::  . : :. . .
CCDS54 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
            700       710       720       730       740       750  

     720        730       740       750       760       770        
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
       .. .. .:.::...:.                 :  .: ..   .::  ..: ..    .
CCDS54 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
            760                        770       780        790    

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
         .  :    :  ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       
CCDS54 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
          800        810          820       830                    

      840        850       860       870       880       890       
pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
       :.:  : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: .
CCDS54 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
     840                850           860        870          880  

       900        910       920       930           940       950  
pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
       .  :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   
CCDS54 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
            890        900       910        920       930       940

            960       970       980       990        1000          
pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
       :     ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   ..
CCDS54 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
              950       960          970       980       990       

      1010        1020      1030       1040      1050       1060   
pF1KA1 IQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRP
        .. :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .: 
CCDS54 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
      1000      1010      1020      1030        1040      1050     

          1070      1080        1090      1100      1110      1120 
pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
           ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                     
CCDS54 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
                                                                   
CCDS54 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR                                      
             1120      1130                                        

>>CCDS33537.1 SCAF4 gene_id:57466|Hs108|chr21             (1147 aa)
 initn: 1955 init1: 986 opt: 1325  Z-score: 558.8  bits: 115.5 E(32554): 8.3e-25
Smith-Waterman score: 2482; 41.4% identity (62.7% similar) in 1179 aa overlap (1-1100:1-1104)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKV
       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::.:::::: :::::.::::::::
CCDS33 MDAVNAFNQELFSLMDMKPPISRAKMILITKAAIKAIKLYKHVVQIVEKFIKKCKPEYKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 PGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKN
       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
CCDS33 PGLYVIDSIVRQSRHQFGTDKDVFGPRFSKNITATFQYLYLCPSEDKSKIVRVLNLWQKN
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pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
CCDS33 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
              130       140          150       160        170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
CCDS33 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
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pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.:::.::::. .. :  :: :::            
CCDS33 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
            240       250       260       270       280       290  

             290                300             310       320      
pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
CCDS33 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
            300       310       320       330       340       350  

            330       340       350         360       370       380
pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
CCDS33 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
            360       370         380       390       400       410

                 390       400       410       420       430       
pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
CCDS33 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
              420       430        440       450       460         

       440       450       460       470       480       490       
pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
CCDS33 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
      470       480       490       500       510       520        

       500       510       520       530       540       550       
pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
CCDS33 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
CCDS33 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
      590       600       610       620       630        640       

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pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
CCDS33 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
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pF1KA1 PPGFSP-----IPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPP--VVPTSLVQPS
       ::::.:      ::::::: .::: . ::::.::  :::..:: .:::  . : :. . .
CCDS33 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPPPHTPPISIPNST
       710       720       730       740       750       760       

     720        730       740       750       760       770        
pF1KA1 LS-MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQI
       .. .. .:.::...:.                 :  .: ..   .::  ..: ..    .
CCDS33 IAGINEDTTKDLSIGN-----------------PIPTVVSGARGNAESGDSV-KMYGSAV
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pF1KA1 SSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSS
         .  :    :  ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       
CCDS33 PPAAPTNLPTP-PVTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------
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pF1KA1 GIIAAQ-PPNILNNSGILGIQPPSVSNNSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLL
       :.:  : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: .
CCDS33 GLIPLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGF
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pF1KA1 GTQPPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGI
       .  :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   
CCDS33 AMPPPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQA
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pF1KA1 PPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DN
       :     ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   ..
CCDS33 PQQPQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVEND
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pF1KA1 IQQEGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRP
        .. :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .: 
CCDS33 RERYGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR-
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pF1KA1 PVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERG
           ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                     
CCDS33 ----REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEEL
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pF1KA1 RFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRD
                                                                   
CCDS33 PAEATSSVEPEKDSGSAAEAPR                                      
        1130      1140                                             

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       :.::..::.::.:: :.:::::.:::  ::::::::::.:::::: :::::.::::::::
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       :::::::::::::::::: .::::.::::.:: .::: :: ::..:::::::::::::::
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pF1KA1 NVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPD--PW
       .::: ::::::::::::     ..:: : ..:   ..:  ::  :.    .:. :.  : 
CCDS46 GVFKIEIIQPLLDMAAGTSN--AAPV-AENVTNNEGSPPPPVK-VSSEPPTQATPNSVPA
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pF1KA1 VSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTA
       : :. ..:..:::::..:. :::::::..::.: :  :::     ::: ....:.::.::
CCDS46 VPQLPSSDAFAAVAQLFQTTQGQQLQQILQTFQ-QPPKPQSP---ALDNAVMAQVQAITA
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pF1KA1 QL----TAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKE------------
       ::    :  .    .. : :: ..:.:::.::::. .. :  :: :::            
CCDS46 QLKTTPTQPSEQKAAFPPPEQKTAFDKKLLDRFDYDDEPEAVEESKKEDTTAVTTTAPAA
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pF1KA1 -IPASQLSHVSESVNNSI---------FHQIAEQLQQ------QNLEHLRQQLLE-QQQP
        .: .  . :  ..  .          :   .. .::      ::..... ...  ::.:
CCDS46 AVPPAPTATVPAAAAPAAASPPPPQAPFGFPGDGMQQPAYTQHQNMDQFQPRMMGIQQDP
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pF1KA1 ---QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPE--VNLDDSIDIQQQDMDIDEGQD
          :   : ..:   ::     .:      :  . :   :.   . ..: :.  . .   
CCDS46 MHHQVPLPPNGQMPGFGLL--PTPPFPPMAQPVIPPTPPVQQPFQASFQAQNEPLTQKPH
            360       370         380       390       400       410

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pF1KA1 GVEEEVFE---QEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRE
         : :: .   ::.:.    .: ...::: ::::..::::: : ::. .:: :::::::.
CCDS46 QQEMEVEQPCIQEVKRHMSDNR-KSRSRSASRSPKRRRSRSGSRSRRSRHR-RSRSRSRD
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pF1KA1 RKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLF
       :.:.: :: :.::: ::.:.::..:::: .. .: :::::::::::.::..::::...:.
CCDS46 RRRHSPRSRSQERRDREKERERRQKGLPQVKPETASVCSTTLWVGQLDKRTTQQDVASLL
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pF1KA1 EEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTE
       :::: ::::::::::::::. :::::::.::::::: :.::...: ::::::::::.:..
CCDS46 EEFGPIESINMIPPRGCAYIVMVHRQDAYRALQKLSRGNYKVNQKSIKIAWALNKGIKAD
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pF1KA1 YKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQT---
       :::.:::.::::::::.::: ..::.: ::::.:..:.: .:. . . .: .:..:.   
CCDS46 YKQYWDVELGVTYIPWDKVKPEELESFCEGGMLDSDTLNPDWKGIPK-KPENEVAQNGGA
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pF1KA1 ----TQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAML--QIPV-APAVPTV-SLVPPAFPVSMPVP
           :.  .:. :   : .     : :...   :.:   :. :.: .: ::::   . .:
CCDS46 ETSHTEPVSPIPKPLPVPVPPIPVPAPITVPPPQVPPHQPGPPVVGALQPPAFTPPLGIP
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CCDS46 PPGFGPGVPPPPPPPPFLRPGFNPMHLPPGFLPPGPPPPITPPVSIPP--PHT---PPIS
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pF1KA1 MTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSG
       . :. :.  :  . .  : ::  ..  ::.: .    :::.   :    :          
CCDS46 I-PNLVS--GARGNAESGDSV--KMYGSAVPPA----APTNLPTP----P----------
               770       780         790                           

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pF1KA1 ENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGII
                 ... ...:: :    .. . ..:.: :...    .::.::       :.:
CCDS46 ----------VTQPVSLLGTQG---VAPGPVIGLQAPSTG----LLGARP-------GLI
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              850       860       870       880       890       900
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         : ::         :. :: ..     . ..::  :    ..   ::  :. :: ..  
CCDS46 PLQRPP---------GMPPPHLQR----FPLMPPR-PMPPHMMHRGPP--PG-PGGFAMP
         840                850            860         870         

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pF1KA1 PPAGPQN-LPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAP----GPRFPLIQPGIPPQRGIPPP
       :: : .. .:: . :  :   :: :   ::  : .:    : . :  ::   ::   :  
CCDS46 PPHGMKGPFPPHG-PFVRPGGMPGLG-GPGPGPGGPEDRDGRQQPPQQPQQQPQPQAPQQ
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pF1KA1 SVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEK--RIPLGN---DNIQQ
          ..  .:::    :: .  .::.. :   .::. ..  . :.  :  .::   .. ..
CCDS46 PQQQQQQQPPPSQQPPPTQ--QQPQQ-FRNDNRQQFNSGRDQERFGRRSFGNRVENDRER
        940       950         960        970       980       990   

               1020      1030       1040      1050       1060      
pF1KA1 EGDR--DYRFPPIETRESISRPPPVDV-RDVVGRPIDPREGPGRP-PLDGRDHFGRPPVD
        :.:  :      . ::   : :  :  ::.  :  . : .  :    :.::. .:    
CCDS46 YGNRNDDRDNSNRDRREWGRRSPDRDRHRDLEER--NRRSSGHRDRERDSRDRESR----
          1000      1010      1020        1030      1040           

       1070      1080        1090      1100      1110      1120    
pF1KA1 IRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNP--EKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFR
        ::.    : ..    :. : :   : : .. :. :                        
CCDS46 -REKEEARGKEKPEVTDRAGGNKTVEPPISQVGNVDTASELEKGVSEAAVLKPSEELPAE
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