Result of FASTA (ccds) for pF1KA1016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1016, 728 aa
  1>>>pF1KA1016 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0595+/-0.00103; mu= 8.0557+/- 0.062
 mean_var=188.3206+/-38.854, 0's: 0 Z-trim(110.8): 103  B-trim: 74 in 1/51
 Lambda= 0.093460
 statistics sampled from 11752 (11857) to 11752 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.364), width:  16
 Scan time:  2.640

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13        ( 728) 4851 667.1 2.6e-191
CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13        ( 696) 4422 609.3 6.4e-174
CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13        ( 763) 3672 508.2 1.9e-143
CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3          ( 712) 1227 178.5 3.1e-44
CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX         ( 748) 1127 165.0 3.7e-40
CCDS48155.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX         ( 765) 1127 165.0 3.8e-40
CCDS34706.1 LRCH4 gene_id:4034|Hs108|chr7          ( 683) 1040 153.3 1.2e-36


>>CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13             (728 aa)
 initn: 4851 init1: 4851 opt: 4851  Z-score: 3548.2  bits: 667.1 E(32554): 2.6e-191
Smith-Waterman score: 4851; 99.9% identity (99.9% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS31 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
              670       680       690       700       710       720

               
pF1KA1 YHWNALSA
       ::::::::
CCDS31 YHWNALSA
               

>>CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13             (696 aa)
 initn: 4825 init1: 4422 opt: 4422  Z-score: 3235.9  bits: 609.3 E(32554): 6.4e-174
Smith-Waterman score: 4422; 99.0% identity (99.1% similar) in 671 aa overlap (1-671:1-671)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS53 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STAPFGLKPRSVFLRPQRNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 ADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYIT
         :: :  ::.                                                 
CCDS53 EKLCLPHHILEEKGLVKVGITIQALLDITVTKALFT                        
              670       680       690                              

>>CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13             (763 aa)
 initn: 3672 init1: 3672 opt: 3672  Z-score: 2688.8  bits: 508.2 E(32554): 1.9e-143
Smith-Waterman score: 4756; 95.3% identity (95.3% similar) in 760 aa overlap (1-725:1-760)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS53 PEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRENSPAVSPTTN
              490       500       510       520       530       540

              550                                          560     
pF1KA1 STAPFGLKPRS-----------------------------------VFLRPQRNLESIDP
       :::::::::::                                   ::::::::::::::
CCDS53 STAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQRNLESIDP
              550       560       570       580       590       600

         570       580       590       600       610       620     
pF1KA1 QFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVA
              610       620       630       640       650       660

         630       640       650       660       670       680     
pF1KA1 SIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLL
              670       680       690       700       710       720

         690       700       710       720        
pF1KA1 ALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS53 ALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
              730       740       750       760   

>>CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3               (712 aa)
 initn: 1394 init1: 1024 opt: 1227  Z-score: 907.5  bits: 178.5 E(32554): 3.1e-44
Smith-Waterman score: 1456; 43.3% identity (66.3% similar) in 695 aa overlap (38-634:22-710)

        10        20        30        40        50           60    
pF1KA1 PQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-GFNLP--LNRGLE
                                     : . ::   : ..:.: ::. :   .:.:.
CCDS33          MAAAGLVAVAAAAEYSGTVASGGNLPGVHCGPSSGAGPGFG-PGSWSRSLD
                        10        20        30        40         50

           70        80        90       100       110       120    
pF1KA1 RALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEI
       ::::::: .: :.::.:::.:::: :: .:::.::..::::.::: :.:.: ::::::: 
CCDS33 RALEEAAVTGVLSLSGRKLREFPRGAA-NHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLEN
               60        70         80        90       100         

          130       140       150       160       170       180    
pF1KA1 LNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEI
       ::::.:::: :::::.::: ::.::.::::::.::. ::.::::::::::::: ::::::
CCDS33 LNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNISRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEI
     110       120       130       140       150       160         

          190       200       210       220       230       240    
pF1KA1 GQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNK
       :.:..::::::::::: ..:.:::.:..::.::::::.:  ::.::..:::...::::::
CCDS33 GHLRHLMELDVSCNEIQTIPSQIGNLEALRDLNVRRNHLVHLPEELAELPLIRLDFSCNK
     170       180       190       200       210       220         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KA1 VLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHT
       . .::.:.:....::.. :.:::::::::::: ::::::::::.::::.:  : .:  . 
CCDS33 ITTIPVCYRNLRHLQTITLDNNPLQSPPAQICIKGKVHIFKYLNIQACKI--APDLPDYD
     230       240       250       260       270         280       

              310       320          330       340       350       
pF1KA1 MERP----HLHQHVEDGKKDS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEE
        .::      :... ...  .  ::: .: :.:::: :..::.:: . .: . ...: .:
CCDS33 -RRPLGFGSCHEELYSSRPYGALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFS-DLPLRVAEITKE
        290       300       310       320       330        340     

       360         370       380       390           400       410 
pF1KA1 EQIIKEDSCH--RLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEF
       ... .:.. .  : : :  .   : . .     :: .. ::    :.      :.: :.:
CCDS33 QRLRRESQYQENRGSLVVTNGGVEHDLDQIDYIDSCTAEEEEAEVRQPKGPDPDSLSSQF
         350       360       370       380       390       400     

                              420         430       440            
pF1KA1 MNY-------------KARA----EDCEELLRI--EEDVHWQTEGIIS--SSKDQ----D
       : :             :  :    .  :.. :   .. :  .  ...:  .:..:    :
CCDS33 MAYIEQRRISHEGSPVKPVAIREFQKTEDMRRYLHQNRVPAEPSSLLSLSASHNQLSHTD
         410       420       430       440       450       460     

             450       460          470        480       490       
pF1KA1 MDI-----AMIEQLREAVDL--LQ-DPNGLSTDITER-SVLNLYPMGSAEALELQDSALN
       ...      ..:. :. ..:  :: . . . :   .: .::..  . .... . :   :.
CCDS33 LELHQRREQLVERTRREAQLAALQYEEEKIRTKQIQRDAVLDFVKQKASQSPQKQHPLLD
         470       480       490       500       510       520     

                  500       510             520         530        
pF1KA1 G-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNGSQYSP--NEIREN----SPA
       :           . . . : .:   : :.         ..: ..:  .. : :    :::
CCDS33 GVDGECPFPSRRSQHTDDSALCMSLSGLNQVGCAATLPHSSAFTPLKSDDRPNALLSSPA
         530       540       550       560       570       580     

          540                550                      560       570
pF1KA1 VSPTTNSTA---PFGL------KPRSVFLR---------------PQRNLESIDPQFTIR
       .  . .: :   : ..      .:.: ..:               :     . :   .: 
CCDS33 TETVHHSPAYSFPAAIQRNQPQRPESFLFRAGVRAETNKGHASPLPPSAAPTTDSTDSIT
         590       600       610       620       630       640     

              580        590       600       610       620         
pF1KA1 RKMEQMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHV
        .  ..:::. ::..:::. ::.::::::  :::::: ::::::::.::.::::: ::::
CCDS33 GQNSRQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHV
         650       660       670       680       690       700     

     630       640       650       660       670       680         
pF1KA1 PSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGE
       :::::                                                       
CCDS33 PSPAVVS                                                     
         710                                                       

>>CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX              (748 aa)
 initn: 1843 init1: 977 opt: 1127  Z-score: 834.4  bits: 165.0 E(32554): 3.7e-40
Smith-Waterman score: 1872; 48.3% identity (68.9% similar) in 726 aa overlap (37-687:29-737)

         10        20        30        40        50                
pF1KA1 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
                                     :: :  :::::::::.::           :
CCDS59   MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
                 10        20        30          40        50      

          60                        70        80        90         
pF1KA1 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
       . :.  :                :.::::::..:: :.::.:::..::   . :.::.::
CCDS59 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP---GSGYDLTDT
         60        70        80        90       100          110   

     100       110       120       130       140       150         
pF1KA1 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
       .:::::.::..:.: ..  :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS59 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
           120       130       140       150       160       170   

     160       170       180       190       200       210         
pF1KA1 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
         :  ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS59 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
           180       190       200       210       220       230   

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA1 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
       :: :.:::.:: ::::::.:::::::  ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS59 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
           240       250       260       270       280       290   

     280       290         300       310       320                 
pF1KA1 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
       ::::::::.::::  . :  ::: : .. .    : . :. .:         :::.::::
CCDS59 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
           300       310       320       330       340       350   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
       :.::::.:::::.:::::.  .:.  ..::  ..::    : . ..  ::         :
CCDS59 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
           360       370        380       390       400            

     390       400       410       420       430           440     
pF1KA1 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
        .. . :     .....  . :...    : : :  : .:..    . . : ...  ...
CCDS59 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
         410       420       430       440       450       460     

         450        460            470                       480   
pF1KA1 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
       : :.  . .::. :..:::. .     . ::..           :.::    .:  : :.
CCDS59 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
           470       480       490       500       510       520   

           490       500       510       520                530    
pF1KA1 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNG---------SQYSPNEIRENSPA
        . . :: : . .. :   :. :.   ::.   .:.          :. . .   ::.  
CCDS59 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIW-QSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEE
            530       540        550       560       570       580 

          540        550        560       570       580       590  
pF1KA1 VSPTTN-STAPFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEM
        . : . : .::::::::.: : .:.   . :: ::.:::::..:::.: ..:::...: 
CCDS59 YDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHLREEREQIRQLRNNLES
             590       600       610       620       630       640 

            600       610       620       630       640       650  
pF1KA1 RLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLEA
       :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS59 RLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRRNVENFLDA
             650       660       670       680       690       700 

            660       670        680       690       700       710 
pF1KA1 CRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIGFCLVHI
       :.:::: .  :: :  ::.   . ..  ::..:: :                        
CCDS59 CKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQLSVA             
             710       720       730       740                     

             720        
pF1KA1 LFIVLVYITYHWNALSA

>>CCDS48155.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX              (765 aa)
 initn: 1843 init1: 977 opt: 1127  Z-score: 834.3  bits: 165.0 E(32554): 3.8e-40
Smith-Waterman score: 1860; 47.4% identity (68.2% similar) in 742 aa overlap (37-687:29-754)

         10        20        30        40        50                
pF1KA1 EPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGG-----------F
                                     :: :  :::::::::.::           :
CCDS48   MAASQGGGGNSGGGGCGGGGSSGGCGTAGGGG--GGAGGGGGGGGGTLVVPIPVPTLF
                 10        20        30          40        50      

          60                        70        80        90         
pF1KA1 NLPLNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDT
       . :.  :                :.::::::..:: :.::.:::..::   . :.::.::
CCDS48 GQPFPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP---GSGYDLTDT
         60        70        80        90       100          110   

     100       110       120       130       140       150         
pF1KA1 VQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALP
       .:::::.::..:.: ..  :. :: ::::::::..::::: :::::::::.::: ::.::
CCDS48 TQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNISRNLLSTLP
           120       130       140       150       160       170   

     160       170       180       190       200       210         
pF1KA1 ACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVR
         :  ::::::..::::: :.:::::.::.:::::.::::: .::::.:.:.::::::.:
CCDS48 KYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKLHSLRELNIR
           180       190       200       210       220       230   

     220       230       240       250       260       270         
pF1KA1 RNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKG
       :: :.:::.:: ::::::.:::::::  ::.:.:....:::..:.::::: :::::: ::
CCDS48 RNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQVPPAQICLKG
           240       250       260       270       280       290   

     280       290         300       310       320                 
pF1KA1 KVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKD--------SDSGVGSDN
       ::::::::.::::  . :  ::: : .. .    : . :. .:         :::.::::
CCDS48 KVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKRMPSQPLTDSMEDFYPNKNHGPDSGIGSDN
           300       310       320       330       340       350   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA1 GDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGD
       :.::::.:::::.:::::.  .:.  ..::  ..::    : . ..  ::         :
CCDS48 GEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHIIGSKTDSQKDQEVY-------D
           360       370        380       390       400            

     390       400       410       420       430           440     
pF1KA1 STNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDV----HWQTEGIISSSKDQ
        .. . :     .....  . :...    : : :  : .:..    . . : ...  ...
CCDS48 FVDPNTEDVAVPEQGNAHIGSFVSFFKGKEKCSEKSRKNEELGDEKRLEKEQLLA--EEE
         410       420       430       440       450       460     

         450        460            470                       480   
pF1KA1 DMDIAMIEQLRE-AVDLLQDPN-----GLSTDIT----------ERSV----LN--LYPM
       : :.  . .::. :..:::. .     . ::..           :.::    .:  : :.
CCDS48 DDDLKEVTDLRKIAAQLLQQEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEKSVSADEVNSPLSPL
           470       480       490       500       510       520   

           490       500                 510             520       
pF1KA1 GSAEALELQDSALNGQIQLETSPVC----------EVQSD------LTLQSNGS----QY
        . . :: : . .. :   :. :.           .....      .  .:.:.    : 
CCDS48 -TWQPLENQKDQIDEQPWPESHPIIWQSEERRRSKQIRKEYFKYKSMRKSSSGNENDEQD
            530       540       550       560       570       580  

            530       540            550        560       570      
pF1KA1 SPN-EIRENSPAVSPTTNST-----APFGLKPRSVFLRPQRN-LESIDPQFTIRRKMEQM
       : : ..  .::. :   . :     .::::::::.: : .:.   . :: ::.:::::..
CCDS48 SDNANMSTQSPVSSEEYDRTDGFSHSPFGLKPRSAFSRSSRQEYGAADPGFTMRRKMEHL
            590       600       610       620       630       640  

        580       590       600       610       620       630      
pF1KA1 REEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPK
       :::.: ..:::...: :::: : .:.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS48 REEREQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPAVPK
            650       660       670       680       690       700  

        640       650       660       670        680       690     
pF1KA1 LSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPT
       ::::::::::::::.::.:::: .  :: :  ::.   . ..  ::..:: :        
CCDS48 LSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLELPTTKASQL
            710       720       730       740       750       760  

         700       710       720        
pF1KA1 SALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
                                        
CCDS48 SVA                              
                                        

>>CCDS34706.1 LRCH4 gene_id:4034|Hs108|chr7               (683 aa)
 initn: 1441 init1: 976 opt: 1040  Z-score: 771.5  bits: 153.3 E(32554): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 1517; 43.1% identity (65.6% similar) in 707 aa overlap (41-721:7-677)

               20        30        40        50             60     
pF1KA1 FVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGS-----GGFNLPLNRGLER
                                     :: .:::  ...     :. .::  :. ::
CCDS34                         MAAAVAAPLAAGGEEAAATTSVPGSPGLPGRRSAER
                                       10        20        30      

          70        80        90       100       110       120     
pF1KA1 ALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEIL
       :::::. .: :::: :.::.::: :: ..:::: .:::::.::. :::   :..:::: :
CCDS34 ALEEAVATGTLNLSNRRLKHFPRGAARSYDLSDITQADLSRNRFPEVPEAACQLVSLEGL
         40        50        60        70        80        90      

         130       140       150       160       170       180     
pF1KA1 NLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIG
       .:::::.: .  :. ::  :::::::::::: ::  .: :::.:::.::::::.:: .::
CCDS34 SLYHNCLRCLNPALGNLTALTYLNLSRNQLSLLPPYICQLPLRVLIVSNNKLGALPPDIG
        100       110       120       130       140       150      

         190       200       210       220       230       240     
pF1KA1 QLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKV
        : .: .:::: ::. .::...  :.:::.:::::: :..::.:: :::::..:::::.:
CCDS34 TLGSLRQLDVSSNELQSLPSELCGLSSLRDLNVRRNQLSTLPEELGDLPLVRLDFSCNRV
        160       170       180       190       200       210      

         250       260       270       280       290       300     
pF1KA1 LVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTM
         ::. : ....:::.::..:::::::::.: :::.::::::: .: :  .:  :   . 
CCDS34 SRIPVSFCRLRHLQVILLDSNPLQSPPAQVCLKGKLHIFKYLSTEAGQRGSA--LGDLAP
        220       230       240       250       260         270    

         310             320          330       340       350      
pF1KA1 ERPHLHQH--VED---GKK-DS--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIME
        ::   .   .::   :.. :.  :::  : :.:.:: :..: .:: .  :.  .:.. .
CCDS34 SRPPSFSPCPAEDLFPGHRYDGGLDSGFHSVDSGSKRWSGNESTDEFS-ELSFRISELAR
          280       290       300       310       320        330   

        360          370       380       390       400        410  
pF1KA1 EEQII---KEDSCHRLSPVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDR-ADGLHSEFM
       : .     :::.    .::. .: .   :     :.. . :  ..:   . . :  ..  
CCDS34 EPRGPRERKEDGSADGDPVQIDFIDSHVP-----GEDEERGTVEEQRPPELSPGAGDRER
           340       350       360            370       380        

            420         430       440       450       460       470
pF1KA1 NYKARAED--CEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKDQDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLST
         ..: :.   ::  : .    :: .      ..:... :     .   : :  : ::  
CCDS34 APSSRREEPAGEERRRPDTLQLWQER----ERRQQQQSGAWGAPRK---DSLLKP-GL--
      390       400       410           420       430              

              480       490       500       510       520       530
pF1KA1 DITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQSNGSQYSPNEIRE
           :.:.     :.: :.  : .  ::      ::   ...  .  ..:.       .:
CCDS34 ----RAVV-----GGAAAVSTQ-AMHNG------SPKSSASQAGAAAGQGAPAPAPASQE
          440            450              460       470       480  

              540          550         560       570        580    
pF1KA1 NSPAVSPTTNSTA-PFG--LKPRSVFLRP--QRNLESIDPQFTIR-RKMEQMREEKELVE
         : ..:.:  .  :.:   .: : ..:   : .    .:. ..: :.. :. .::.:. 
CCDS34 PLPIAGPATAPAPRPLGSIQRPNSFLFRSSSQSGSGPSSPDSVLRPRRYPQVPDEKDLMT
            490       500       510       520       530       540  

          590       600       610       620       630       640    
pF1KA1 QLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPAVPKLSMAKCRR
       :::. .: ::.  : :::. :: .::.::.:.:..:::::  ::::::::::::  : :.
CCDS34 QLRQVLESRLQRPLPEDLAEALASGVILCQLANQLRPRSVPFIHVPSPAVPKLSALKARK
            550       560       570       580       590       600  

          650       660       670       680       690       700    
pF1KA1 NVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLI
       :::.:::::::.:::::::::: :.::   : .: .....  .: :: ::        : 
CCDS34 NVESFLEACRKMGVPEADLCSPSDLLQGTARGLRTALEAVKRVGGKALPPLWP--PSGLG
            610       620       630       640       650         660

          710       720        
pF1KA1 GFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
       :: . ......:.:.::       
CCDS34 GFVVFYVVLMLLLYVTYTRLLGS 
              670       680    




728 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 20:16:17 2016 done: Wed Nov  2 20:16:17 2016
 Total Scan time:  2.640 Total Display time:  0.110

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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