Result of FASTA (omim) for pF1KA0929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0929, 3623 aa
  1>>>pF1KA0929 3623 - 3623 aa - 3623 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.7585+/-0.000599; mu= -30.0580+/- 0.038
 mean_var=753.4514+/-157.066, 0's: 0 Z-trim(122.4): 134  B-trim: 651 in 1/59
 Lambda= 0.046725
 statistics sampled from 40210 (40373) to 40210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.473), width:  16
 Scan time: 30.420

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055816 (OMIM: 613484) msx2-interacting protein  (3664) 23205 1582.0       0
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289)  553 55.1 4.1e-05
NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [H (5654)  483 50.4  0.0011
NP_001188474 (OMIM: 606077) putative RNA-binding p ( 969)  448 47.6  0.0014
NP_073605 (OMIM: 606077) putative RNA-binding prot ( 977)  448 47.7  0.0014
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078)  427 46.4  0.0068
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  427 46.4  0.0068
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  427 46.4  0.0068
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  427 46.4  0.0068


>>NP_055816 (OMIM: 613484) msx2-interacting protein [Hom  (3664 aa)
 initn: 23205 init1: 23205 opt: 23205  Z-score: 8467.5  bits: 1582.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 23205; 100.0% identity (100.0% similar) in 3529 aa overlap (95-3623:136-3664)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KA0 KRGQNWGSYVHNSLPRFNWDYRSCFHTWKRASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFRGGGGGPAYGPPPSLHAREGRYERRLDGASDNRERAYEHSAYGHHERGTGGFDRTRHY
         110       120       130       140       150       160     

          130       140       150       160       170       180    
pF1KA0 DQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DQDYYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTLPSVVHRDIYRDDIT
         170       180       190       200       210       220     

          190       200       210       220       230       240    
pF1KA0 REVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REVRGRRPERNYQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLASQASRPTRSPSGSGSRSRSSSSDSIS
         230       240       250       260       270       280     

          250       260       270       280       290       300    
pF1KA0 SSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSLEKDEPRKSFGIKVQNLPVR
         290       300       310       320       330       340     

          310       320       330       340       350       360    
pF1KA0 STDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQIHGTSEERYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFFGMQ
         350       360       370       380       390       400     

          370       380       390       400       410       420    
pF1KA0 IEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IEVTAWIGPETESENEFRPLDERIDEFHPKATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIFQRFGEIV
         410       420       430       440       450       460     

          430       440       450       460       470       480    
pF1KA0 DIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DIDIKKVNGVPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPTNCVWLDGLS
         470       480       490       500       510       520     

          490       500       510       520       530       540    
pF1KA0 SNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRKIGGNKIKVD
         530       540       550       560       570       580     

          550       560       570       580       590       600    
pF1KA0 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRTYYESVRTPGTYPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FANRESQLAFYHCMEKSGQDIRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRTYYESVRTPGTYPED
         590       600       610       620       630       640     

          610       620       630       640       650       660    
pF1KA0 SRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQDIREYSYRQRERERE
         650       660       670       680       690       700     

          670       680       690       700       710       720    
pF1KA0 RERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERLPSDSERRLYSRSSDRSGS
         710       720       730       740       750       760     

          730       740       750       760       770       780    
pF1KA0 CSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTDKQKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERRLIRKEKVEKDKTDKQKRK
         770       780       790       800       810       820     

          790       800       810       820       830       840    
pF1KA0 GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEGIAKNRLELMPCVVLTRVKE
         830       840       850       860       870       880     

          850       860       870       880       890       900    
pF1KA0 KEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAKSDLSKLESVRMKVPKEKGL
         890       900       910       920       930       940     

          910       920       930       940       950       960    
pF1KA0 SSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSHVEVVEKEGRLKARKHLKPEQPADGVSAVDLEKLEARKRRFADSNLKAEKQKPEVKKS
         950       960       970       980       990      1000     

          970       980       990      1000      1010      1020    
pF1KA0 SPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREGEAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPEMEDARVLSKKQPDVSSREVILLREGEAERKPVRKEILKRESKKIKLDRLNTVASPKD
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

         1030      1040      1050      1060      1070      1080    
pF1KA0 CQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CQELASISVGSGSRPSSDLQARLGELAGESVENQEVQSKKPIPSKPQLKQLQVLDDQGPE
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

         1090      1100      1110      1120      1130      1140    
pF1KA0 REDVRKNYCSLRDETPERKSGQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REDVRKNYCSLRDETPERKSGQEKSHSVNTEEKIGIDIDHTQSYRKQMEQSRRKQQMEME
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

         1150      1160      1170      1180      1190      1200    
pF1KA0 IAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IAKSEKFGSPKKDVDEYERRSLVHEVGKPPQDVTDDSPPSKKKRMDHVDFDICTKRERNY
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

         1210      1220      1230      1240      1250      1260    
pF1KA0 RSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNITVREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSSRQISEDSERTGGSPSVRHGSFHEDEDPIGSPRLLSVKGSPKVDEKVLPYSNITVREE
        1250      1260      1270      1280      1290      1300     

         1270      1280      1290      1300      1310      1320    
pF1KA0 SLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLKFNPYDSSRREQMADMAKIKLSVLNSEDELNRWDSQMKQDAGRFDVSFPNSIIKRDSL
        1310      1320      1330      1340      1350      1360     

         1330      1340      1350      1360      1370      1380    
pF1KA0 RKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RKRSVRDLEPGEVPSDSDEDGEHKSHSPRASALYESSRLSFLLRDREDKLRERDERLSSS
        1370      1380      1390      1400      1410      1420     

         1390      1400      1410      1420      1430      1440    
pF1KA0 LERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LERNKFYSFALDKTITPDTKALLERAKSLSSSREENWSFLDWDSRFANFRNNKDKEKVDS
        1430      1440      1450      1460      1470      1480     

         1450      1460      1470      1480      1490      1500    
pF1KA0 APRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APRPIPSWYMKKKKIRTDSEGKMDDKKEDHKEEEQERQELFASRFLHSSIFEQDSKRLQH
        1490      1500      1510      1520      1530      1540     

         1510      1520      1530      1540      1550      1560    
pF1KA0 LERKEEDSDFISGRIYGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LERKEEDSDFISGRIYGKQTSEGANSTTDSIQEPVVLFHSRFMELTRMQQKEKEKDQKPK
        1550      1560      1570      1580      1590      1600     

         1570      1580      1590      1600      1610      1620    
pF1KA0 EVEKQEDTENHPKTPESAPENKDSELKTPPSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKTVEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EVEKQEDTENHPKTPESAPENKDSELKTPPSVGPPSVTVVTLESAPSALEKTTGDKTVEA
        1610      1620      1630      1640      1650      1660     

         1630      1640      1650      1660      1670      1680    
pF1KA0 PLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPAPAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PLVTEEKTVEPATVSEEAKPASEPAPAPVEQLEQVDLPPGADPDKEAAMMPAGVEEGSSG
        1670      1680      1690      1700      1710      1720     

         1690      1700      1710      1720      1730      1740    
pF1KA0 DQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DQPPYLDAKPPTPGASFSQAESNVDPEPDSTQPLSKPAQKSEEANEPKAEKPDATADAEP
        1730      1740      1750      1760      1770      1780     

         1750      1760      1770      1780      1790      1800    
pF1KA0 DANQKAEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DANQKAEAAPESQPPASEDLEVDPPVAAKDKKPNKSKRSKTPVQAAAVSIVEKPVTRKSE
        1790      1800      1810      1820      1830      1840     

         1810      1820      1830      1840      1850      1860    
pF1KA0 RIDREKLKRSNSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RIDREKLKRSNSPRGEAQKLLELKMEAEKITRTASKNSAADLEHPEPSLPLSRTRRRNVR
        1850      1860      1870      1880      1890      1900     

         1870      1880      1890      1900      1910      1920    
pF1KA0 SVYATMGDHENRSPVKEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVYATMGDHENRSPVKEPVEQPRVTRKRLERELQEAAAVPTTPRRGRPPKTRRRADEEEE
        1910      1920      1930      1940      1950      1960     

         1930      1940      1950      1960      1970      1980    
pF1KA0 NEAKEPAETLKPPEGWRSPRSQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATTEVGPQIGVKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NEAKEPAETLKPPEGWRSPRSQKTAAGGGPQGKKGKNEPKVDATRPEATTEVGPQIGVKE
        1970      1980      1990      2000      2010      2020     

         1990      2000      2010      2020      2030      2040    
pF1KA0 SSMEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SSMEPKAAEEEAGSEQKRDRKDAGTDKNPPETAPVEVVEKKPAPEKNSKSKRGRSRNSRL
        2030      2040      2050      2060      2070      2080     

         2050      2060      2070      2080      2090      2100    
pF1KA0 AVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AVDKSASLKNVDAAVSPRGAAAQAGERESGVVAVSPEKSESPQKEDGLSSQLKSDPVDPD
        2090      2100      2110      2120      2130      2140     

         2110      2120      2130      2140      2150      2160    
pF1KA0 KEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYKADAPEGLAPEDRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEASASAAYKADAPEGLAPEDRDK
        2150      2160      2170      2180      2190      2200     

         2170      2180      2190      2200      2210      2220    
pF1KA0 PAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGMET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAHQASETELAAAIGSIINDISGEPENFPAPPPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGMET
        2210      2220      2230      2240      2250      2260     

         2230      2240      2250      2260      2270      2280    
pF1KA0 DEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTL
        2270      2280      2290      2300      2310      2320     

         2290      2300      2310      2320      2330      2340    
pF1KA0 VRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEK
        2330      2340      2350      2360      2370      2380     

         2350      2360      2370      2380      2390      2400    
pF1KA0 QSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QSEKPHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQ
        2390      2400      2410      2420      2430      2440     

         2410      2420      2430      2440      2450      2460    
pF1KA0 ARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQ
        2450      2460      2470      2480      2490      2500     

         2470      2480      2490      2500      2510      2520    
pF1KA0 EEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAA
        2510      2520      2530      2540      2550      2560     

         2530      2540      2550      2560      2570      2580    
pF1KA0 PCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRM
        2570      2580      2590      2600      2610      2620     

         2590      2600      2610      2620      2630      2640    
pF1KA0 PVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKGSVTTLKSLVST
        2630      2640      2650      2660      2670      2680     

         2650      2660      2670      2680      2690      2700    
pF1KA0 PAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAGPVNVLKGPVNVLTGPVNVLTTPVNATVGTVNAAPGTVNAAASAVNATASAVTVTAGA
        2690      2700      2710      2720      2730      2740     

         2710      2720      2730      2740      2750      2760    
pF1KA0 VTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAG
        2750      2760      2770      2780      2790      2800     

         2770      2780      2790      2800      2810      2820    
pF1KA0 LRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQ
        2810      2820      2830      2840      2850      2860     

         2830      2840      2850      2860      2870      2880    
pF1KA0 PPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQ
        2870      2880      2890      2900      2910      2920     

         2890      2900      2910      2920      2930      2940    
pF1KA0 GGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPH
        2930      2940      2950      2960      2970      2980     

         2950      2960      2970      2980      2990      3000    
pF1KA0 HPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPSST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPSST
        2990      3000      3010      3020      3030      3040     

         3010      3020      3030      3040      3050      3060    
pF1KA0 ASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTL
        3050      3060      3070      3080      3090      3100     

         3070      3080      3090      3100      3110      3120    
pF1KA0 PSITYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPAPAGVPALASQHPPEEEVHYHLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSITYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPAPAGVPALASQHPPEEEVHYHLP
        3110      3120      3130      3140      3150      3160     

         3130      3140      3150      3160      3170      3180    
pF1KA0 VARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVKVPPASKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVKVPPASKA
        3170      3180      3190      3200      3210      3220     

         3190      3200      3210      3220      3230      3240    
pF1KA0 PQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQLQGLPLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQLQGLPLTP
        3230      3240      3250      3260      3270      3280     

         3250      3260      3270      3280      3290      3300    
pF1KA0 PVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRTKTAAQGPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVVVTHGVQIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRTKTAAQGPP
        3290      3300      3310      3320      3330      3340     

         3310      3320      3330      3340      3350      3360    
pF1KA0 PEGEPLQPPQPVQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAKGTQTGVEQPRLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PEGEPLQPPQPVQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAKGTQTGVEQPRLP
        3350      3360      3370      3380      3390      3400     

         3370      3380      3390      3400      3410      3420    
pF1KA0 AGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTSGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTSGP
        3410      3420      3430      3440      3450      3460     

         3430      3440      3450      3460      3470      3480    
pF1KA0 STPPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 STPPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTAAVQLH
        3470      3480      3490      3500      3510      3520     

         3490      3500      3510      3520      3530      3540    
pF1KA0 FVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALPCGRDQ
        3530      3540      3550      3560      3570      3580     

         3550      3560      3570      3580      3590      3600    
pF1KA0 EDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EDVVSQTESLKAAFITYLQAKQAAGIINVPNPGSNQPAYVLQIFPPCEFSESHLSRLAPD
        3590      3600      3610      3620      3630      3640     

         3610      3620   
pF1KA0 LLASISNISPHLMIVIASV
       :::::::::::::::::::
NP_055 LLASISNISPHLMIVIASV
        3650      3660    

>>NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo sapie  (5289 aa)
 initn: 366 init1: 143 opt: 553  Z-score: 212.8  bits: 55.1 E(85289): 4.1e-05
Smith-Waterman score: 740; 19.6% identity (47.0% similar) in 1370 aa overlap (2115-3433:2734-4053)

         2090      2100      2110      2120      2130      2140    
pF1KA0 SPQKEDGLSSQLKSDPVDPDKEPEKEDVSASGPSPEATQLAKQMELEQAVEHIAKLAEAS
                                     : :.: .::      .  ..   .  . . 
NP_002 STTTTVTPTATPTGTQTPTLTPITTTTTVTSTPTPTGTQTPTPTPITTTT--TVTPTPTP
          2710      2720      2730      2740      2750        2760 

         2150      2160      2170      2180       2190      2200   
pF1KA0 ASAAYKADAPEGLAPEDRDKPAHQASETELAAAIGSIIN-DISGEPENFPAPPPYPGESQ
       .:.   ...:   .      :.  ...:  .. : .  .   .  : .  :: :    . 
NP_002 TSTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTHITTTTTVTPTPTPTGTQAPTPTAITTT
            2770      2780      2790      2800      2810      2820 

             2210      2220      2230      2240      2250      2260
pF1KA0 TDLQP---PAGAQALQPSEEGMETDEAVSGILETEAATESSRPPVNAPDPSAGPTDTKEA
       : . :   :.:.:.  :.   . :  .:.    : ..:.:  : . .   .. :: :   
NP_002 TTVTPTPTPTGTQT--PTTTPITTTTTVTPT-PTPTGTQSPTPTAITTTTTVTPTPTPT-
            2830        2840      2850       2860      2870        

             2270      2280      2290      2300      2310      2320
pF1KA0 RGNSSETSHSVPEAKGSKEVEVTLVRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVESHVPESNQ
        :... :.  .     .  . :: .    : :.:: .     :.  .:.:. .  : ..:
NP_002 -GTQTPTTTPI-----TTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTP---ITTTTTVTPIPT--PTGTQ
       2880           2890      2900         2910      2920        

             2330      2340      2350         2360      2370       
pF1KA0 AQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHSTPPQ---SCTSDLSKIPSTENSSQEISVE
       .   .: ..  :..  :     .  .  : ::      . :   .. :.:   .   .: 
NP_002 TPTSTPITTTITVTPTPTPTGTQTPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVT
       2930      2940      2950      2960      2970      2980      

       2380      2390            2400      2410      2420      2430
pF1KA0 ER-TPTKASVPPDLPPP------PQPAPVDEEPQARFRVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPT
          ::: ...:   :        : :.:.  .  .   . .     :.  :.  . : ::
NP_002 PTPTPTGTQTPTTTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPT
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pF1KA0 LPSVTAAKLSP-PVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQEEPRAQSTPSPALPPDTKASDVDTS
        : .:.. ..: :. .:     : :  .:  .:    : . .::.:. :  : .. . : 
NP_002 -PITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPT-PITTTTTVTPTP
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pF1KA0 SSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAAPCLHEAPPPPVDSKKPLEEKTAPPV
       . :  .   .   ...:.:: : . :.   :... :    .   :. .    .  :  :.
NP_002 TPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTT-PITTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTPI
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pF1KA0 TNNSEIQASEVLVAADKEKVAPV-----IAPKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQ
       :... .  . . ....    .:.     ..:  :.  .. :.   . ..  .:   :.: 
NP_002 TTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTG--TQTPTPTPISTTTTVT-PTPTPT
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pF1KA0 -TLTGLVSALTGLVNVSLVPV-NALKGPVKGSVTTLKSLVSTPAGPVNVLKGPVNVLTGP
        : :  .. .:  ..:. .:. .. . :.   ..:  ... ::. :...     . .:  
NP_002 GTQTPTMTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPISTTTTVTPTPT-PTGTQTPTSTPITTT
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       ..:  ::. . . : ...: :...... . . ... ..:   .:...  . . : : :..
NP_002 TTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQSTTLTPITTTTTVTPTPTPTGTQT
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        .    ::      . . ..   : . :.     .   :. .:. .   .  :  ...  
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         . .: .:     :..  .  :  .       :. . . .   ....  :   : :::.
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         : ..: ..    . : . .:. . . .       : :   .  .:::.:   ::    
NP_002 PTAITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTMVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTP
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          : .:: :. . .  ..::. . :. .    . .   : :    .  .: ::   :  
NP_002 TPTGTQTPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTPIS
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        .   : .  .:.: . :..  ..  ...   . .: :.:     : : .   .  :. :
NP_002 TTTTVTPTP-TPTGTQTPTSTPITTTTTV---TPTPTPTGTQTPTPTPITTTTTVTPTPT
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        . :   :.. .  .. . :.:   ..  :  . :    ..: : . .  .:. .     
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       :  ..: .  : . ..: . :.      . .:  ..:  :.:. . . ..  :    .  
NP_002 TTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPTPISTTSTVTPTPTPTGT
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       . :.    .:. . . :  .        : ..:  .   : :  : .. :  .   .. .
NP_002 QTPT---MTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTMTPITTT
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pF1KA0 PPASKAPQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPS-NQL
         .. .:   : .:  :: :  . : : .:.:.:.   .:. .:   .  .: ::. .  
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pF1KA0 QGLPLTPPVVVTHGVQIVHSSG-ELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRT
       :.  ::: ...:  .     .: .       .   :  :    : :: :. . .   . :
NP_002 QSTTLTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTPTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTMTPI---TTT
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        :..  : : :       :...:  . :.:   :.    :   : .    :.      ::
NP_002 TTVTPTPTPTGTQTPTTTPISTTTTVTPTPT--PTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGT
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pF1KA0 QTGVEQPRLPAGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQ
       :: .  :   .  ..  : : : .:       ::. :  ..... :  :.   :::    
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       :. . ::  :. :: :   :                                        
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>--
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        :  . .: .       .  : .     ..  .. :. .  : .. .    :... .  .
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         : .:     .  : .::    :.  .  :.:  :    .    ::.  ..    ::: 
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NP_002 TTPSP----PTT-----TTTTPPPTTTPSPPTTT-PITPPTSTTTL-PPTTT---PSPPP
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        : .:   :    : . .:::: .   :    . : :: .      :    .:..:. : 
NP_002 TTTTTPPPTTTPSPPTTTTPSPPITTTTTPPPTTTPSSPITTTPSPP----TTTMTTPSP
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       ::. . :....  :    .: :::.    :    : .::.:. . .  . .        .
NP_002 TTTPSSPITTTTTPSSTTTPSPPPTTMTTPSPTTTPSPPTTTMTTLPPTTTSSPLTTTPL
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        : :.:   : .:   :..  . : :      : : .. ::. .: : : : .    .:.
NP_002 PPSITPPTFSPFSTTTPTTPCVPLCNWTGWLDSGKPNFHKPGGDTELIGDVCGPGWAANI
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       :        ::.. :   :  .:..    :.  . :.: . .   :.  .::     .: 
NP_002 SCRATMYPDVPIGQLGQTVVCDVSVGLICKNEDQKPGGVIPMAFCLNYEINVQCCECVTQ
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pF1KA0 PVNVLTT----PVNATVGTVNAA-PGTVNAAASAVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATT
       :... ::    :. . . :.... :  . ....... :  ..: :.  . . .:  : : 
NP_002 PTTMTTTTTENPTPTPITTTTTVTPTPTPTSTQSTTPTPITTTNTVTPTPTPTGTQTPTP
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pF1KA0 GTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSG--AGLRVNTSEGVV
         .: . ....:.       .....    : .  ..   :. ...   .   ..:.  :.
NP_002 TPITTTTTMVTPTPT----ITSTQTPTPTPITTTTVTPTPTPTSTQRTTPTSITTTTTVT
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pF1KA0 LL-SYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMDIEFQQSVSKSQVKPDSVTASQPPSKGPQA-
          . .: .:     :..  .  :  .       :. . . ..  ....  :   : :. 
NP_002 PTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGT---QTPTTTPISTTTMVTPTPTPTGTQTL
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pF1KA0 ---PAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKADRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVK
          :   ....: .     .:: ...: ::.. .  :.   :   .  . ::.:   :: 
NP_002 TPTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTP-ISTTTTVTPT-PTPTGTQTPTLTPITTTTTVT
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pF1KA0 VLTQ--GINTPPVL-VHNQLVLTPSIVTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPHHP
             : .:: .  . .  ..::. . :. : . :...   : :       .: ::   
NP_002 PTPTPTGTQTPTTTPITTTTTVTPTPTPTGTKSTTPTSITTTTMVTPTPPPTGTQTPTTT
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pF1KA0 PALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAHSPRPSGPG-PSSFPRASH-----
       :   .   : .  .:.: . :.   ..  ...   . .: :.:   :.: : ...     
NP_002 PITTTTTVTPTP-TPTGTQTPTPTPITTTTTV---TPTPTPTGTQTPTSTPITTNTTVTP
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pF1KA0 ---PSSTASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEV
          :..: ::.:.  .:. ...  :.:         :.    : : : ::. .    : .
NP_002 TPTPTGTPSTTLTPITTTTMVTPTPTPT------GTQTPTSTPISTTTTVTPTPTPTG-T
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pF1KA0 RMNTPTLPSITYSIRPEALHSPRAPLQPQQIEVRAPQRASTPQPAPAGVPALASQHPPEE
       .  :::  : : .. :    .: .   :    . .   . ::.:.:.:     .: :   
NP_002 QTPTPTPISTTTTVTPTP--TPTSTQTPTTTPITTTTTV-TPNPTPTG-----TQTPTTT
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pF1KA0 EVHYHLPVARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVK
        .     :. . .:. ...          : :.: ..   : :  : .. :  .. ... 
NP_002 PITTTTTVTPTPTPTGTQT----------PTTTPISTTTTVTPTPTPTGTQTPTTTAITT
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pF1KA0 VPPASKAPQQPGKEAAKTPDAKAAPTPTPA-PVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVTPSNQ
       .  .. .:   :   ..:: .    : : . :.:.:.   .:. .: ...  .: ::.  
NP_002 TTTVTPTPTPTG---TQTPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPISNTTTVTPTPTPT
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pF1KA0 LQGLPLTPPVVVTHGVQIVHS-SGELFQEYRYGDIRTYHPPAQL-THTQFPAASSVGLPS
           : . :...:  :  ... .:            :.  :.   : :. :... .   .
NP_002 GTQTPTVTPITTTTTVTPTRTPTGTKSTTPTSITTTTMVTPTPTPTGTHTPTTTPI---T
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pF1KA0 RTKTAAQGPPPEGEPLQPPQPVQSTQPAQPAPPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAK--
        : :..  : : :     : :. .:  . :.:   :.    : . : .    :.      
NP_002 TTTTVTPTPTPTGTQTPTPTPITTTTTVTPTPT--PTGTQTPTSTPITTTTTVTPTPTPT
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pF1KA0 GTQTGVEQPRLPAGPANRPPEPH-TQVQRAQAETGPTSF-PSPVSVSMKPDL--PVSLPT
       :::: .  :      ..  : :  ::.  .   :  :.. :.:. .: :     :..  :
NP_002 GTQTPTTTPITTNTTVTPTPTPTGTQTPTTVLITTTTTMTPTPTPTSTKSTTVTPITTTT
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pF1KA0 QTAPKQPLFVPTTSGPSTPPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVW
        ..:  :  . : :   ::   .   :   :.:   ..:  :                  
NP_002 TVTPT-PTPTGTQSTTLTPITTTTTVTP-TPTPTGTQTPTTTPISTTTTVIPTPTPTGTQ
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pF1KA0 QGLLALKNDTAAVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTV
                                                                   
NP_002 TPTSTPITTTTTVTPTPTPTGTQTPTSTPISTTTTVTPTATPTGTQTPTLTPITTTTTVT
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>>NP_001291288 (OMIM: 158373) mucin-5AC precursor [Homo   (5654 aa)
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       :: ..   :.:  :. .:. :   :  :.: :  . :.. :. .:. .. ..   : .. 
NP_001 SATTT-STTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTT-STTSGPGTTPSAVPTTSITSA---PTTST
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       ..      ...   :  . :   .. : :.: :: ..: ..      .: :  .:.  . 
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         . : .   .:.. .  .:.  . .. : . : :.     .. :...  . :. :  : 
NP_001 TISVPTTSTTSASTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTIS-
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       .:. ... . . . ..  . :       :...:   . .    .  .   : :.: ....
NP_001 APTTSTTSATTTSTTSAPTPR-------RTSAPTTSTISASTTSTTSATTTSTTSATTTS
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        .  :  :  :: :   .  .. .: .     .:..  .  :...          ... :
NP_001 TISAPTTSTTLSPTTSTTSTTITSTTS-----APISSTTSTPQTSTTSAPTT--STTSGP
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        :     :  .   :     . :     :  :  .  :  . .:..: :  :.     . 
NP_001 GTTSSPVPTTSTTSAPTTSTTSAPTTRTTSVPTSSTTSTATTSTTSGPGTTPSPVPTTST
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        .. .::    : ..:  .:  .   ..  : ..   : . .  .   ..: . :  : .
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       :: ..    .:  .. :    : .:  ..  :  . ..... .:  ....:    : . :
NP_001 PVPTTSTISVPTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSP-VPTTSTTSAPTTSTTSA-PTTSTISA
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        .     .:     :.   ..  . :     .  .:..  ::...  . .          
NP_001 PTTSTPSAPTTSTTLAPTTSTTSA-PTTSTTSTPTSSTTSSPQTSTTSASTTSITSGPGT
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pF1KA0 LEQAVEHIAKLAEASASAAYKADAPEGLAPEDRDKPAHQASETELAAAIGSIINDISGEP
         . :   .  .  ..:..  : .    ::      :  .: :  .:. .:  . ..  :
NP_001 TPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAATTSTISAPTTSTTSAPTTSTT--SASTASKTSGLGTTP
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pF1KA0 ENFPAP----PPYPGESQTDLQPPAGAQALQPSEEGMETDEAVSGILETEAATESSRP-P
         .:.     ::  . ....    ... .  ::     .   .     : :.: :. : :
NP_001 SPIPTTSTTSPPTTSTTSASTASKTSGPGTTPSPVPTTSTIFAPRTSTTSASTTSTTPGP
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pF1KA0 VNAPDP-----SAGPTDTKEARGNSSETSHSVPEAKG-------SKEVEVTLVRKD-KGR
        ..:.:     .:. . :. .. . :.:.:: : ..        .:  .. .     .: 
NP_001 GTTPSPVPTTSTASVSKTSTSHVSISKTTHSQPVTRDCHLRCTWTKWFDIDFPSPGPHGG
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pF1KA0 QKTTRSRRKRNTNKKVVAPVE-SHVPESNQAQGESPAANEGTTVQHPEAPQEEKQ--SEK
       .: : .   :. .:    : : ...    ... :    . : .::     .::     ..
NP_001 DKETYNNIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAESHPEVSIEHLGQVVQ---CSREEGLVCRNQ
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pF1KA0 PHSTPPQSCTSDLSKIPSTENSSQEISVEERTPTKASVPPDLPPPPQPAPVDEEPQ-ARF
        .. : . : .   ..   : . .   :   ::. :   :. :     .:..   .  . 
NP_001 DQQGPFKMCLNYEVRVLCCE-TPKGCPVTS-TPVTA---PSTPSGRATSPTQSTSSWQKS
            3310      3320       3330          3340      3350      

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pF1KA0 RVHSIIESDPVTPPSDPSIPIPTLPSVTAAKLSPPVASGGIPHQSPPTKVTEWITRQEEP
       :. ... .. .. :.  .   ::  ...:   :   :      ..: :...        :
NP_001 RTTTLVTTSTTSTPQTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSTPQTSISS------AP
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pF1KA0 RAQSTPSPALPPDTKASDVDTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVTTAIAEPVSAAPCL
        ...: .:.     .:  ..  :.   .   .:  .:.::.:.::.:.: .  ....:  
NP_001 TSSTTSAPT-SSTISARTTSIISAPTTSTTSSPT-TSTTSATTTSTTSAPTSSTTSTP--
              3420      3430      3440       3450      3460        

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pF1KA0 HEAPPPPVDSKKPLEEKTAP-PVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVIAPKITSVISRMPV
       . .    . :.      :.: :::..:  ..:       : ... : . : :     .::
NP_001 QTSKTSAATSSTTSGSGTTPSPVTTTSTASVS-------KTSTSHVSVSKTT---HSQPV
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pF1KA0 SIDLEN----SQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLV----NVSLVP--VNALKGPVKG---
       . : .     .. . .  :.:    :   . ....    ..   :  .. :.  .:.   
NP_001 TRDCHPRCTWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEKICRRPEEITRLQCRAKSHPE
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pF1KA0 -SVTTLKSLV--STPAGPV---NVLKGPVNV-LTGPVNVLT--TPVNATVGTVNA-APGT
        :.  : ..:  :   : :   .  .:: .. :.  : ::   :: .  : .... ::.:
NP_001 VSIEHLGQVVQCSREEGLVCRNQDQQGPFKMCLNYEVRVLCCETPKGCPVTSTSVTAPST
       3580      3590      3600      3610      3620      3630      

          2690      2700      2710      2720      2730      2740   
pF1KA0 VNAAASAVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTVTMAGAVIAPSTKCKQRASANENSR
        .. :.. . ..:.    . ..: .....:.:: : : .    ::.:.            
NP_001 PSGRATSPTQSTSSWQ-KSRTTTLVTSSITSTTQTSTTS----APTTSTT----------
       3640      3650       3660      3670          3680           

          2750      2760      2770      2780      2790      2800   
pF1KA0 FHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPPASAMD
         :.:.:   . :. . ..:    .::  ..  . . : : .    :.  :  : .:...
NP_001 --PASIPSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSTPQTTTSSAPTSSTTSA-PTTSTIS
              3690      3700      3710      3720      3730         

          2810      2820      2830      2840      2850      2860   
pF1KA0 IEFQQSVSKSQVKPDSVTASQPPSKGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYNASPVISSVKA
           ...:     : . :.: : ..  .::.. ... : .:    . . ...:. :...:
NP_001 APTTSTIS----APTTSTTSAPTASTTSAPTSTSSAPTTNTTSAPTTSTTSAPITSTISA
     3740          3750      3760      3770      3780      3790    

          2870      2880      2890      2900      2910      2920   
pF1KA0 DRPSLEKPEPIHLSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSIVTTNKKLADPV
                :   ..:::  : .:..  : . .. :   ... . .:.  ::.     :.
NP_001 ---------PTTSTTSTP--QTSTISSPTTSTTSTP---QTSTTSSPTTSTTSA----PT
                  3800        3810         3820      3830          

          2930      2940      2950      2960      2970      2980   
pF1KA0 TLKIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSKLPTEVNHVPSGPSIPADRTVSHLAAAKLDAH
       :    . .  :    .: :   : .  :. ::      :  : :.  :.:  ...  . :
NP_001 T----STTSAP----TTSTTSTPQTSISSAPTS-----STTSAPTASTISAPTTSTTSFH
           3840          3850      3860           3870      3880   

          2990      3000      3010      3020      3030      3040   
pF1KA0 SPRPSGPGPSSFPRASHPSSTASTALSTNATVMLAAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSI
       .   ..:  ::   .: :... ..: .:..:.  ..  : :       :  :.     :.
NP_001 TTSTTSPPTSS--TSSTPQTSKTSA-ATSSTTSGSGTTPSPV------PTTSTA----SV
          3890        3900       3910      3920                3930

          3050      3060          3070       3080         3090     
pF1KA0 TQTVSLSHLSQGEVRMNTPTL----PSITYSIRPEA-LHSPRAPLQPQQIE---VRAPQR
       ..: : ::.: ...  . :.     :  :..   .. . ::      ..     .:. ..
NP_001 SKT-STSHVSVSKTTHSQPVTRDCHPRCTWTKWFDVDFPSPGPHGGDKETYNNIIRSGEK
              3940      3950      3960      3970      3980         

        3100      3110      3120      3130      3140      3150     
pF1KA0 ASTPQPAPAGVPALASQHPPEEEVHYHLPVARATAPVQSEVLVMQSEYRLHPYTV--PRD
               . .   : .:: :  ...   :.. .   . : :: ... .  :. .    .
NP_001 ICRRPEEITRLQCRAESHP-EVSIEHLGQVVQCS---REEGLVCRNQDQQGPFKMCLNYE
    3990      4000       4010      4020         4030      4040     

            3160      3170          3180      3190             3200
pF1KA0 VRIMV--HPHVTAVSEQPRAA----DGVVKVPPASKAPQQPGKEAA-------KTPDAKA
       ::..    :.   :.  : .:    .: .  :  : .  : .. ..       .::....
NP_001 VRVLCCETPKGCPVTSTPVTAPSTPSGRATSPTQSTSSWQKSRTTTLVTTSTTSTPQTST
        4050      4060      4070      4080      4090      4100     

             3210      3220      3230         3240           3250  
pF1KA0 APTPTPAPVPVPVPLPAPAPAPHGEARILTVT---PSNQLQGLP-----LTPPVVVTHGV
       . .:: . .:. .:  . ::.    .   : :   :...  . :     :.: . .: . 
NP_001 TSAPTTSTIPASTPSTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTHRTTSGPTTSTTLAPTTSTTSAP
        4110      4120      4130      4140      4150      4160     

           3260      3270      3280      3290       3300      3310 
pF1KA0 QIVHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSRTKT-AAQGPPPEGEPLQ
           .:.   .    .   :   :.  : .. :..:... :. .:: :: .    :    
NP_001 TTSTNSAPTTSTISASTTSTISAPTTSTISS-PTSSTTSTPQTSKTSAATSSTTSGSGTT
        4170      4180      4190       4200      4210      4220    

             3320          3330      3340      3350      3360      
pF1KA0 P-PQPVQSTQPAQP----APPCPPSQLGQPGQPPSSKMPQVSQEAKGTQTGVEQPR----
       : : :. ::  :.     . :   .  : ::  ::  .:..:  . .: . .  :     
NP_001 PSPVPTTSTTSASTTSTTSAPTTSTTSG-PGTTPSP-VPSTSTTSAATTSTTSAPTTRTT
         4230      4240      4250        4260      4270      4280  

                 3370       3380         3390      3400      3410  
pF1KA0 ------LPAGPANRP-PEPHTQVQRA---QAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAP
             . .::.. : : : :..  :   .. .:: . :::: ..   . :..  :.   
NP_001 SAPTSSMTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPITSTTSGPG
           4290      4300      4310      4320      4330      4340  

           3420      3430      3440      3450      3460      3470  
pF1KA0 KQPLFVPTTSGPSTPPGLVLPHTEFQPAPKQDSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLL
       . :  :::::  :.:                                             
NP_001 STPSPVPTTSTTSAPTTSTTSASTASTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTRTTSASTASTT
           4350      4360      4370      4380      4390      4400  

>>NP_001188474 (OMIM: 606077) putative RNA-binding prote  (969 aa)
 initn: 420 init1: 193 opt: 448  Z-score: 185.5  bits: 47.6 E(85289): 0.0014
Smith-Waterman score: 532; 25.9% identity (49.9% similar) in 795 aa overlap (158-810:10-776)

       130       140       150       160       170        180      
pF1KA0 YYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTL-PSVVHRDIYR---DDI
                                     ::  :: :.   :  . . : . .   ::.
NP_001                      MRTAGRDPVPRRSPRWRRAVPLCETSAGRRVTQLRGDDL
                                    10        20        30         

           190        200       210           220       230        
pF1KA0 TREVRGRRPERN-YQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLA----SQASRPTRSPSGSGSR----
        : .  .  ::.  . .:::. ..: ::..  ..:.    :..:   .. ::.:::    
NP_001 RRPATMKGKERSPVKAKRSRGGEDSTSRGERSKKLGGSGGSNGSSSGKTDSGGGSRRSLH
      40        50        60        70        80        90         

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pF1KA0 ---------SRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSL
                ::  .. . ::::   : :: :...::  . .:: . ..     :   :. 
NP_001 LDKSSSRGGSREYDTGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGGGESRS---SGA
     100       110       120       130       140       150         

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pF1KA0 EKDEPRKSFG-----IKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQI-H----GTSEE
        .. :  . :     .:...:  . .: ...::::::::.:: : ::.: :    :...:
NP_001 ASSAPGGGDGAEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDV-SVKISHLSGSGSGDE
        160       170       180       190       200        210     

         340       350       360                                   
pF1KA0 RYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFF---GMQIE------------------------VT
       : ..: ::. ::  .:   ..:.: .    ..::                        : 
NP_001 RVAFVNFRRPEDA-RAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDTYPPSASVVG
         220        230       240       250       260       270    

      370                                                     380  
pF1KA0 AWIG----P------------------------------------------ETESENEF-
       : .:    :                                          . : : .. 
NP_001 ASVGGHRHPPGGGGGQRSLSPGGAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRDLERERDYP
          280       290       300       310       320       330    

                                 390           400       410       
pF1KA0 -----RP---LDERI------------DEFHP----KATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIF
            ::   :. :.            ::. :    .:.::::.:::. :.:  :::  :
NP_001 FYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQRANRTLFLGNLDITVTESDLRRAF
          340       350       360       370       380       390    

       420       430         440       450       460       470     
pF1KA0 QRFGEIVDIDIKKVN-G-VPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPT
       .::: :...:::. . : .  :.::.. ..    .:   :.:. .  : .:.:.::. ::
NP_001 DRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPIKIGYGKATPT
          400       410       420       430       440       450    

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pF1KA0 NCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRK
       . .:. ::.  :    :.:.: :.: .  . . .  . : . :. .. :.::  . .:  
NP_001 TRLWVGGLGPWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFP
          460       470       480       490       500       510    

           540       550         560        570       580       590
pF1KA0 IGG--NKIKVDFANRES--QLAFYHCMEKSGQD-IRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRT
       .::   ...::::. :   :  . . .  .  . . : .   :   .  :.. : .    
NP_001 LGGPDRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYELVTDAFGHRAP--DPLRGARDRTPPLL
          520       530       540       550         560       570  

              600       610       620       630       640       650
pF1KA0 YYESVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQD
       : .  :    ::...    :   ::  ..  . .   ::      : .  : : : .  :
NP_001 YRD--RDRDLYPDSDWVPPPPPVRERSTRTAATSVPAYE------PLDSLDRRRDGWSLD
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                  660       670       680       690       700      
pF1KA0 IREYSYRQ----RERERERERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERL
        :. . :.    :.. :.:.  : .  :  .: :  .:. :   .:  .:  ::... .:
NP_001 -RDRGDRDLPSSRDQPRKRRLPEESGGRHLDRSP--ESDRP--RKRHCAP--SPDRSPEL
           630       640       650         660           670       

        710       720       730       740       750       760      
pF1KA0 PSDSERRLYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERR
        :. .:  :. ..::: :   :  :   .  .. ::. ....: :.. . . :: ...: 
NP_001 SSSRDR--YNSDNDRS-SRLLLERPSPIRDRRGSLEK-SQGDKRDRKNSASAERDRKHRT
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pF1KA0 LIRKEKVEKDKTDKQKRK-GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEG
           :   :.   :. :. :.. : :. ::.  . ......   :               
NP_001 TAPTEG--KSPLKKEDRSDGSAPSTSTASSKLKSPSQKQDGGTAPVASASPKLCLAWQGM
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pF1KA0 IAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAK
                                                                   
NP_001 LLLKNSNFPSNMHLLQGDLQVASSLLVEGSTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKV
             800       810       820       830       840       850 

>>NP_073605 (OMIM: 606077) putative RNA-binding protein   (977 aa)
 initn: 420 init1: 193 opt: 448  Z-score: 185.5  bits: 47.7 E(85289): 0.0014
Smith-Waterman score: 532; 25.9% identity (49.9% similar) in 795 aa overlap (158-810:10-776)

       130       140       150       160       170        180      
pF1KA0 YYRDPRERTLQHGLYYASRSRSPNRFDAHDPRYEPRAREQFTL-PSVVHRDIYR---DDI
                                     ::  :: :.   :  . . : . .   ::.
NP_073                      MRTAGRDPVPRRSPRWRRAVPLCETSAGRRVTQLRGDDL
                                    10        20        30         

           190        200       210           220       230        
pF1KA0 TREVRGRRPERN-YQHSRSRSPHSSQSRNQSPQRLA----SQASRPTRSPSGSGSR----
        : .  .  ::.  . .:::. ..: ::..  ..:.    :..:   .. ::.:::    
NP_073 RRPATMKGKERSPVKAKRSRGGEDSTSRGERSKKLGGSGGSNGSSSGKTDSGGGSRRSLH
      40        50        60        70        80        90         

                   240       250       260       270       280     
pF1KA0 ---------SRSSSSDSISSSSSTSSDSSDSSSSSSDDSPARSVQSAAVPAPTSQLLSSL
                ::  .. . ::::   : :: :...::  . .:: . ..     :   :. 
NP_073 LDKSSSRGGSREYDTGGGSSSSRLHSYSSPSTKNSSGGGESRSSSRGGGGESRS---SGA
     100       110       120       130       140       150         

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pF1KA0 EKDEPRKSFG-----IKVQNLPVRSTDTSLKDGLFHEFKKFGKVTSVQI-H----GTSEE
        .. :  . :     .:...:  . .: ...::::::::.:: : ::.: :    :...:
NP_073 ASSAPGGGDGAEYKTLKISELGSQLSDEAVEDGLFHEFKRFGDV-SVKISHLSGSGSGDE
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pF1KA0 RYGLVFFRQQEDQEKALTASKGKLFF---GMQIE------------------------VT
       : ..: ::. ::  .:   ..:.: .    ..::                        : 
NP_073 RVAFVNFRRPEDA-RAAKHARGRLVLYDRPLKIEAVYVSRRRSRSPLDKDTYPPSASVVG
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pF1KA0 AWIG----P------------------------------------------ETESENEF-
       : .:    :                                          . : : .. 
NP_073 ASVGGHRHPPGGGGGQRSLSPGGAALGYRDYRLQQLALGRLPPPPPPPLPRDLERERDYP
          280       290       300       310       320       330    

                                 390           400       410       
pF1KA0 -----RP---LDERI------------DEFHP----KATRTLFIGNLEKTTTYHDLRNIF
            ::   :. :.            ::. :    .:.::::.:::. :.:  :::  :
NP_073 FYERVRPAYSLEPRVGAGAGAAPFREVDEISPEDDQRANRTLFLGNLDITVTESDLRRAF
          340       350       360       370       380       390    

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pF1KA0 QRFGEIVDIDIKKVN-G-VPQYAFLQYCDIASVCKAIKKMDGEYLGNNRLKLGFGKSMPT
       .::: :...:::. . : .  :.::.. ..    .:   :.:. .  : .:.:.::. ::
NP_073 DRFGVITEVDIKRPSRGQTSTYGFLKFENLDMSHRAKLAMSGKIIIRNPIKIGYGKATPT
          400       410       420       430       440       450    

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pF1KA0 NCVWLDGLSSNVSDQYLTRHFCRYGPVVKVVFDRLKGMALVLYNEIEYAQAAVKETKGRK
       . .:. ::.  :    :.:.: :.: .  . . .  . : . :. .. :.::  . .:  
NP_073 TRLWVGGLGPWVPLAALAREFDRFGTIRTIDYRKGDSWAYIQYESLDAAHAAWTHMRGFP
          460       470       480       490       500       510    

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pF1KA0 IGG--NKIKVDFANRES--QLAFYHCMEKSGQD-IRDFYEMLAERREERRASYDYNQDRT
       .::   ...::::. :   :  . . .  .  . . : .   :   .  :.. : .    
NP_073 LGGPDRRLRVDFADTEHRYQQQYLQPLPLTHYELVTDAFGHRAP--DPLRGARDRTPPLL
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pF1KA0 YYESVRTPGTYPEDSRRDYPARGREFYSEWETYQGDYYESRYYDDPREYRDYRNDPYEQD
       : .  :    ::...    :   ::  ..  . .   ::      : .  : : : .  :
NP_073 YRD--RDRDLYPDSDWVPPPPPVRERSTRTAATSVPAYE------PLDSLDRRRDGWSLD
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pF1KA0 IREYSYRQ----RERERERERFESDRDRDHERRPIERSQSPVHLRRPQSPGASPSQAERL
        :. . :.    :.. :.:.  : .  :  .: :  .:. :   .:  .:  ::... .:
NP_073 -RDRGDRDLPSSRDQPRKRRLPEESGGRHLDRSP--ESDRP--RKRHCAP--SPDRSPEL
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pF1KA0 PSDSERRLYSRSSDRSGSCSSLSPPRYEKLDKSRLERYTKNEKTDKERTFDPERVERERR
        :. .:  :. ..::: :   :  :   .  .. ::. ....: :.. . . :: ...: 
NP_073 SSSRDR--YNSDNDRS-SRLLLERPSPIRDRRGSLEK-SQGDKRDRKNSASAERDRKHRT
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pF1KA0 LIRKEKVEKDKTDKQKRK-GKVHSPSSQSSETDQENEREQSPEKPRSCNKLSREKADKEG
           :   :.   :. :. :.. : :. ::.  . ......   :               
NP_073 TAPTEG--KSPLKKEDRSDGSAPSTSTASSKLKSPSQKQDGGTAPVASASPKLCLAWQGM
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pF1KA0 IAKNRLELMPCVVLTRVKEKEGKVIDHTPVEKLKAKLDNDTVKSSALDQKLQVSQTEPAK
                                                                   
NP_073 LLLKNSNFPSNMHLLQGDLQVASSLLVEGSTGGKVAQLKITQRLRLDQPKLDEVTRRIKV
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>>XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent polypep  (2078 aa)
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       .: .  : . :  :   :     .  ::  :: :  ::. :     .  .     .::  
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       :  : ::...   .   :   .:   .:.:  ::.:. .:.        :  :.: .:.:
XP_011 ALVALAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVIT-LSA--------PIAPSEPKTNL
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       .  :.    . :. .:  .   . . .  . .:  .:     :  :.. :: :       
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pF1KA0 -KEARGNSSETSHSVPEA---KGSKEVEVTLVRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVE-
        :..  .:   : . : .   ::     ..:  . ..   .: :..  . :     :.  
XP_011 VKDTTISSVLISPQNPGSLSLKGPVSPPAALSLSTQSLPVVTSSQKTAGPNTPPDFPISL
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pF1KA0 -SHVPESNQAQ-------GES-PAANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHST---PPQSCTSD
        ::.   .:..       :.. :.:    ::.   . .    .  : .    ::    ..
XP_011 GSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPPLPSRNE
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pF1KA0 LSKI---------PSTENSSQEISVEERTPTKA-SVPPDLPPPPQPAPV-DEEPQARFRV
       .            ::.... . ::    .:. . .:  ..   :  . .    :.: .. 
XP_011 VVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPNATYH-
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pF1KA0 HSIIESDPV----TPPSDPSIP--IPTLPSVT---AAKLSPPVASGGIPHQSP--PTKVT
       . .. . ::    : :   . :  : . :..:   :. .:::..:: : .  :  :. ..
XP_011 YPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALV
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pF1KA0 EWITRQEEPRAQSTPS---PALPPDTKASDV-DTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVT
          .  .:: .: . .   :. ::     :. .  ::.: :.   :   .  .: . :. 
XP_011 MAPVAPKEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKF---PTQKDLQTVPA-SLE
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pF1KA0 TAIAEPVSAAPCLHEAPPP-PVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVI
        :   :..:.   .. :   :. .  : .  .   .... ::  :   . : :    :. 
XP_011 GAPFSPAQAGLTTKKDPTVLPLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLP
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pF1KA0 APKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKG
         : .: ..  :....   :   : .  .:..   :...     .:.  :...   :.  
XP_011 IGKPASSMTS-PLGVNSSASVIKTDSYAGPDSAGPLLKSSLITPTVAAFPLES-ADPAGV
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pF1KA0 SVTTLK--SLVSTPAGPVNVLKGPVNVL--TGPVN--VLTT-PVNATVG-TVNAAPGTVN
       . :: :  :  .: :.:   :.: :..   . ::.  .::: :.  :.. .  .::.  :
XP_011 APTTAKGTSTYTTTASP--FLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPLVPTASENCPVAPSPQN
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pF1KA0 AAAS-AVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTV-----TMAGAVIAPSTK-CKQRASA
       . :  :. . :  .  .. . .   .:.   :  :     : : : .: : : :  . :.
XP_011 TCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKECPTEDSG
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pF1KA0 NENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPP
          .    :..  . : :.  : ... ...          . . . ::.   ...:.  :
XP_011 ASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPP-------TKKGSAGPDTPIGNLSS--P
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pF1KA0 ASAMDIEF--QQSVS--KSQVKPDSVTASQPPS-KGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYN
       .: ..  :  ..:.:   :. .: .. .  ::: ::  .:.. . .. ... .   .: .
XP_011 VSPVEASFLPENSLSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPT
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pF1KA0 ASPVISSVKADRPSLEKPEPIH-LSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSI
        : :      . :.   :.    ::...   . . .    .:: . :     . . ::  
XP_011 PSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPALSMTSSSPKKARATPAPKGIPASP---SPKGAPTPPA
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pF1KA0 VTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSK--LPTEVNHVP----SGPSI
       .:  .  . :.: . .     ::  ..  .:.  :: ::    ::    .:    .::. 
XP_011 ATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPA--ATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPAT
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pF1KA0 PADR------TVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPS---STASTALSTNATVML
       :. .      .:.  .     : .: :.:   :. : :. ::   : :.: :  .: .  
XP_011 PSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKG--ASTPPAATPPSPKGSPAATPLPKGAPTTP
           1010      1020      1030        1040      1050      1060

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pF1KA0 AAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSITYSIRPEALH
       :: .: :.   .    ...  :: .   . . .  . .    ..:  :. :      .: 
XP_011 AATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSP--KGAPMPPAATPPSPKGGLA
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pF1KA0 SPRAPLQPQQIEVRAPQ-RASTPQPAPAGVPALASQHPPEEEVHYHLPVARATAPVQSEV
       .:     :    .  :. ...   : : :.:.  .  ::  .     :  .. ::.   .
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pF1KA0 LVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVKVPPASKAPQQPG-KEAAKT
          . .  :   ..:      . : .:  : .   :    :  :.. :   :. : .  :
XP_011 TPPSPKGGL---ATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLAT
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pF1KA0 PDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPA-PAPHGEARILTVTPSNQLQGLPLTPPVVVTHGVQI
       :. :.::: ::: .: : :  .:: : :.:     ..:: . :.:   :::   . .  .
XP_011 PSPKGAPT-TPAATP-PSPKGGPATPPPKGAPTPPAATPPS-LKGGLATPPHKGAPNPAV
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pF1KA0 VHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSR---TKTAAQGPPPEGEPLQ
       :   .            .  :::    .  : .:    : .   :  :.  : :.: :  
XP_011 VTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPS--PKGSPGTPPPKGAPTPPAVTPPSPKGTPTL
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pF1KA0 P---PQ----PVQSTQPAQPAPPCP-PSQLGQPGQ-PPSSKMPQVSQEAKGTQTGVEQPR
       :   :.    :.  ..   :.::   ::. : :.. ::: :   .    ::  :.     
XP_011 PATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKGDPTS--PAV
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pF1KA0 LPAGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTS
       .: .: . :  : :.   :    :  . :. . ::.:     . :. .:::    .:...
XP_011 IPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLK-----KAPATSAPKGGPATPSSK
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pF1KA0 GPSTPPGLVLPHTEFQPAPKQ---DSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTA
       :  : :... :  .  :::::   .:::. .   :. :                      
XP_011 GDPTLPAVTPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPAVIPSSPKEVPATPSS
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pF1KA0 AVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALP
                                                                   
XP_011 RRDPIAPTATLLSKKTPATLAPKEALIPPAMTVPSPKKTPAIPTPKEAPATPSSKEASSP
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>>XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent polypep  (2082 aa)
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XP_006 PMSSALSVTAALGQPGPTLPPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSPSTIASTPLEVPFPQSS
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       .: .  : . :  :   :     .  ::  :: :  ::. :     .  .     .::  
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       :  : ::...   .   :   .:   .:.:  ::.:. .:.        :  :.: .:.:
XP_006 ALVALAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVIT-LSA--------PIAPSEPKTNL
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pF1KA0 QP-PAGAQALQPSEEGMETDEAVSGILETEAATE-SSRPPVNAPDPSAGPTDT-------
       .  :.    . :. .:  .   . . .  . .:  .:     :  :.. :: :       
XP_006 NKVPS---EVVPNPKGTPSPPCIVSTVPYHCVTPMASIQSGVASLPQTTPTTTLAIASPQ
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pF1KA0 -KEARGNSSETSHSVPEA---KGSKEVEVTLVRKDKGRQKTTRSRRKRNTNKKVVAPVE-
        :..  .:   : . : .   ::     ..:  . ..   .: :..  . :     :.  
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pF1KA0 -SHVPESNQAQ-------GES-PAANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHST---PPQSCTSD
        ::.   .:..       :.. :.:    ::.   . .    .  : .    ::    ..
XP_006 GSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPPLPSRNE
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pF1KA0 LSKI---------PSTENSSQEISVEERTPTKA-SVPPDLPPPPQPAPV-DEEPQARFRV
       .            ::.... . ::    .:. . .:  ..   :  . .    :.: .. 
XP_006 VVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPNATYH-
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pF1KA0 HSIIESDPV----TPPSDPSIP--IPTLPSVT---AAKLSPPVASGGIPHQSP--PTKVT
       . .. . ::    : :   . :  : . :..:   :. .:::..:: : .  :  :. ..
XP_006 YPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALV
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pF1KA0 EWITRQEEPRAQSTPS---PALPPDTKASDV-DTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVT
          .  .:: .: . .   :. ::     :. .  ::.: :.   :   .  .: . :. 
XP_006 MAPVAPKEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKF---PTQKDLQTVPA-SLE
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pF1KA0 TAIAEPVSAAPCLHEAPPP-PVDSKKPLEEKTAPPVTNNSEIQASEVLVAADKEKVAPVI
        :   :..:.   .. :   :. .  : .  .   .... ::  :   . : :    :. 
XP_006 GAPFSPAQAGLTTKKDPTVLPLVQAAPKNSPSFQSTSSSPEIPLSPEATLAKKSLGEPLP
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pF1KA0 APKITSVISRMPVSIDLENSQKITLAKPAPQTLTGLVSALTGLVNVSLVPVNALKGPVKG
         : .: ..  :....   :   : .  .:..   :...     .:.  :...   :.  
XP_006 IGKPASSMTS-PLGVNSSASVIKTDSYAGPDSAGPLLKSSLITPTVAAFPLES-ADPAGV
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pF1KA0 SVTTLK--SLVSTPAGPVNVLKGPVNVL--TGPVN--VLTT-PVNATVG-TVNAAPGTVN
       . :: :  :  .: :.:   :.: :..   . ::.  .::: :.  :.. .  .::.  :
XP_006 APTTAKGTSTYTTTASP--FLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPLVPTASENCPVAPSPQN
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pF1KA0 AAAS-AVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTV-----TMAGAVIAPSTK-CKQRASA
       . :  :. . :  .  .. . .   .:.   :  :     : : : .: : : :  . :.
XP_006 TCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKECPTEDSG
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pF1KA0 NENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPP
          .    :..  . : :.  : ... ...          . . . ::.   ...:.  :
XP_006 ASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPP-------TKKGSAGPDTPIGNLSS--P
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pF1KA0 ASAMDIEF--QQSVS--KSQVKPDSVTASQPPS-KGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYN
       .: ..  :  ..:.:   :. .: .. .  ::: ::  .:.. . .. ... .   .: .
XP_006 VSPVEASFLPENSLSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPT
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pF1KA0 ASPVISSVKADRPSLEKPEPIH-LSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSI
        : :      . :.   :.    ::...   . . .    .:: . :     . . ::  
XP_006 PSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPALSMTSSSPKKARATPAPKGIPASP---SPKGAPTPPA
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pF1KA0 VTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSK--LPTEVNHVP----SGPSI
       .:  .  . :.: . .     ::  ..  .:.  :: ::    ::    .:    .::. 
XP_006 ATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPA--ATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPAT
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pF1KA0 PADR------TVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPS---STASTALSTNATVML
       :. .      .:.  .     : .: :.:   :. : :. ::   : :.: :  .: .  
XP_006 PSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKG--ASTPPAATPPSPKGSPAATPLPKGAPTTP
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pF1KA0 AAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSITYSIRPEALH
       :: .: :.   .    ...  :: .   . . .  . .    ..:  :. :      .: 
XP_006 AATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSP--KGAPMPPAATPPSPKGGLA
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XP_006 TPPHKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPPPKG-APTTPAA
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pF1KA0 LVMQSEYRLHPYTVPRDVRIMVHPHVTAVSEQPRAADGVVKVPPASKAPQQPG-KEAAKT
          . .  :   ..:      . : .:  : .   :    :  :.. :   :. : .  :
XP_006 TPPSPKGGL---ATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGLAT
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pF1KA0 PDAKAAPTPTPAPVPVPVPLPAPA-PAPHGEARILTVTPSNQLQGLPLTPPVVVTHGVQI
       :. :.::: ::: .: : :  .:: : :.:     ..:: . :.:   :::   . .  .
XP_006 PSPKGAPT-TPAATP-PSPKGGPATPPPKGAPTPPAATPPS-LKGGLATPPHKGAPNPAV
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pF1KA0 VHSSGELFQEYRYGDIRTYHPPAQLTHTQFPAASSVGLPSR---TKTAAQGPPPEGEPLQ
       :   .            .  :::    .  : .:    : .   :  :.  : :.: :  
XP_006 VTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPS--PKGSPGTPPPKGAPTPPAVTPPSPKGTPTL
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pF1KA0 P---PQ----PVQSTQPAQPAPPCP-PSQLGQPGQ-PPSSKMPQVSQEAKGTQTGVEQPR
       :   :.    :.  ..   :.::   ::. : :.. ::: :   .    ::  :.     
XP_006 PATTPSSKGGPTTPSSKEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRGPAIPSPKGDPTS--PAV
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pF1KA0 LPAGPANRPPEPHTQVQRAQAETGPTSFPSPVSVSMKPDLPVSLPTQTAPKQPLFVPTTS
       .: .: . :  : :.   :    :  . :. . ::.:     . :. .:::    .:...
XP_006 IPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLK-----KAPATSAPKGGPATPSSK
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pF1KA0 GPSTPPGLVLPHTEFQPAPKQ---DSSPHLTSQRPVDMVQLLKKYPIVWQGLLALKNDTA
       :  : :... :  .  :::::   .:::. .   :. :                      
XP_006 GDPTLPAVTPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPAVIPSSPKEVPATPSS
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pF1KA0 AVQLHFVSGNNVLAHRSLPLSEGGPPLRIAQRMRLEATQLEGVARRMTVETDYCLLLALP
                                                                   
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>>XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent polypep  (2082 aa)
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       .: .  : . :  :   :     .  ::  :: :  ::. :     .  .     .::  
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        :..  .:   : . : .   ::     ..:  . ..   .: :..  . :     :.  
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pF1KA0 -SHVPESNQAQ-------GES-PAANEGTTVQHPEAPQEEKQSEKPHST---PPQSCTSD
        ::.   .:..       :.. :.:    ::.   . .    .  : .    ::    ..
XP_006 GSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPPLPSRNE
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pF1KA0 LSKI---------PSTENSSQEISVEERTPTKA-SVPPDLPPPPQPAPV-DEEPQARFRV
       .            ::.... . ::    .:. . .:  ..   :  . .    :.: .. 
XP_006 VVPATVAAFPVVAPSVDKGPSTISSITCSPSGSLNVATSFSLSPTTSLILKSSPNATYH-
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       . .. . ::    : :   . :  : . :..:   :. .:::..:: : .  :  :. ..
XP_006 YPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNPCTIAAAPTTTFEVATCVSPPMSSGPISNIEPTSPAALV
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pF1KA0 EWITRQEEPRAQSTPS---PALPPDTKASDV-DTSSSTLRKILMDPKYVSATSVTSTSVT
          .  .:: .: . .   :. ::     :. .  ::.: :.   :   .  .: . :. 
XP_006 MAPVAPKEPSTQVATTLRIPVSPPLPDPEDLKNLPSSVLVKF---PTQKDLQTVPA-SLE
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        :   :..:.   .. :   :. .  : .  .   .... ::  :   . : :    :. 
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XP_006 IGKPASSMTS-PLGVNSSASVIKTDSYAGPDSAGPLLKSSLITPTVAAFPLES-ADPAGV
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pF1KA0 SVTTLK--SLVSTPAGPVNVLKGPVNVL--TGPVN--VLTT-PVNATVG-TVNAAPGTVN
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XP_006 APTTAKGTSTYTTTASP--FLEGTVSLAPKNHPVKEGTLTTLPLVPTASENCPVAPSPQN
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pF1KA0 AAAS-AVNATASAVTVTAGAVTAASGGVTATTGTV-----TMAGAVIAPSTK-CKQRASA
       . :  :. . :  .  .. . .   .:.   :  :     : : : .: : : :  . :.
XP_006 TCAPLATLVLAPEIPKSVPSPSLPPAGTPPGTKKVDGISHTSALAPVASSPKECPTEDSG
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pF1KA0 NENSRFHPGSMPVIDDRPADAGSGAGLRVNTSEGVVLLSYSGQKTEGPQRISAKISQIPP
          .    :..  . : :.  : ... ...          . . . ::.   ...:.  :
XP_006 ASATASSKGTLTYLADSPSPLGVSVSPQTKRPP-------TKKGSAGPDTPIGNLSS--P
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pF1KA0 ASAMDIEF--QQSVS--KSQVKPDSVTASQPPS-KGPQAPAGYANVATHSTLVLTAQTYN
       .: ..  :  ..:.:   :. .: .. .  ::: ::  .:.. . .. ... .   .: .
XP_006 VSPVEASFLPENSLSFQGSKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETPT
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pF1KA0 ASPVISSVKADRPSLEKPEPIH-LSVSTPVTQGGTVKVLTQGINTPPVLVHNQLVLTPSI
        : :      . :.   :.    ::...   . . .    .:: . :     . . ::  
XP_006 PSVVNLPFPKEGPATPAPKQAPALSMTSSSPKKARATPAPKGIPASP---SPKGAPTPPA
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pF1KA0 VTTNKKLADPVTLKIETKVLQPANLGSTLTPHHPPALPSK--LPTEVNHVP----SGPSI
       .:  .  . :.: . .     ::  ..  .:.  :: ::    ::    .:    .::. 
XP_006 ATPPSPKGGPATPSPKWAPTPPA--ATPPSPKGGPATPSPKGAPTPPAATPPSPKGGPAT
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pF1KA0 PADR------TVSHLAAAKLDAHSPRPSGPGPSSFPRASHPS---STASTALSTNATVML
       :. .      .:.  .     : .: :.:   :. : :. ::   : :.: :  .: .  
XP_006 PSPKGAPTPPAVTPPSPKGSPAATPFPKG--ASTPPAATPPSPKGSPAATPLPKGAPTTP
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pF1KA0 AAGIPVPQFISSIHPEQSVIMPPHSITQTVSLSHLSQGEVRMNTPTLPSITYSIRPEALH
       :: .: :.   .    ...  :: .   . . .  . .    ..:  :. :      .: 
XP_006 AATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSP--KGAPMPPAATPPSPKGGLA
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       .:     :    .  :. ...   : : :.:.  .  ::  .     :  .. ::.   .
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       :. :.::: ::: .: : :  .:: : :.:     ..:: . :.:   :::   . .  .
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XP_006 IPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLK-----KAPATSAPKGGPATPSSK
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        :..  .:   : . : .   ::     ..:  . ..   .: :..  . :     :.  
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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