Result of FASTA (ccds) for pF1KA0816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0816, 1902 aa
  1>>>pF1KA0816 1902 - 1902 aa - 1902 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2349+/-0.00143; mu= 15.7103+/- 0.085
 mean_var=172.3252+/-34.222, 0's: 0 Z-trim(105.5): 173  B-trim: 21 in 1/49
 Lambda= 0.097701
 statistics sampled from 8252 (8437) to 8252 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.259), width:  16
 Scan time:  5.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11          (1905) 13476 1914.1       0
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs108|chr12           (1613) 3022 440.5 2.4e-122
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs108|chr11           (1615) 2952 430.7 2.3e-119
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12           (4544) 2142 316.9 1.1e-84
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 819) 1859 276.3 3.3e-73
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2            (4655) 1496 225.9 2.9e-57
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2          (4599) 1493 225.5 3.8e-57
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 682) 1456 219.4 3.7e-56
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 692) 1396 211.0 1.3e-53
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1166) 1063 164.3 2.5e-39
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4             (1207) 1063 164.3 2.6e-39
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4            (1165) 1035 160.3 3.9e-38
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9          ( 845)  979 152.3 7.4e-36
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs108|chr9           ( 873)  979 152.3 7.6e-36
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 700)  880 138.3   1e-31
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 793)  871 137.1 2.7e-31
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1           ( 904)  871 137.1   3e-31
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs108|chr1             ( 963)  871 137.1 3.1e-31
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11          (2214)  832 132.0 2.5e-29
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs108|chr1            (1247)  693 112.2 1.3e-23
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 858)  653 106.4 5.1e-22
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19          ( 860)  653 106.4 5.1e-22
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs108|chr22        ( 252)  644 104.6 5.2e-22
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs108|chr14          (1375)  652 106.4 7.9e-22
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11           ( 855)  521 87.8   2e-16
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1          (4391)  494 84.6   9e-15
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5           (2912)  456 79.1 2.8e-13
CCDS46761.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3          (1231)  445 77.2 4.4e-13
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2          (1353)  436 76.0 1.1e-12
CCDS31462.1 LDLRAD3 gene_id:143458|Hs108|chr11     ( 345)  405 71.0 8.9e-12
CCDS46762.1 FBLN2 gene_id:2199|Hs108|chr3          (1184)  409 72.1 1.4e-11


>>CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs108|chr11               (1905 aa)
 initn: 13478 init1: 10587 opt: 13476  Z-score: 10272.6  bits: 1914.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13476; 99.6% identity (99.8% similar) in 1905 aa overlap (1-1902:1-1905)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYW
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITM
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 KNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNTIAIGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGC
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVAR
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470         1480      1490       
pF1KA0 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDD---IAAFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
       :::::::::::::::::::::::::::::::.   ::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDEPRAIAVFPRKGYLFWTDWGHIAKIERAN
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KA0 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGHVSHPF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS31 LDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVSHVSHPF
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pF1KA0 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVN
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pF1KA0 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSRPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLY
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pF1KA0 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLLSILLILVV
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pF1KA0 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAALMLYRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQLCYKKEGGPDH
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pF1KA0 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVSIQASSGSLDDT
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pF1KA0 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ETEQLLQEEQSECSSVHTAATPERRGSLPDTGWKHERKLSSESQV
             1870      1880      1890      1900     

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CCDS86                  MGAVLRSLLACSFCVLLRAAPLLLYANRRDLRLVDATNGKENA
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pF1KA0 TLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGS-NVEEVVSTGLESPGGLAVD
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CCDS86 TIVVGGLEDAAAVDFVFSHGLIYWSDVSEEAIKRTEFNKTESVQNVVVSGLLSPDGLACD
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pF1KA0 WVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRI
       :. .::::::: :.::::.::::. ::::.::.:..:::::: :  : .::::::..:.:
CCDS86 WLGEKLYWTDSETNRIEVSNLDGSLRKVLFWQELDQPRAIALDPSSGFMYWTDWGEVPKI
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pF1KA0 EASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQG
       : ..::::.: :: .....::::::.::  ...::.::: . :...::::..:.::.. .
CCDS86 ERAGMDGSSRFIIINSEIYWPNGLTLDYEEQKLYWADAKLNFIHKSNLDGTNRQAVVKGS
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pF1KA0 LPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGK
       ::::::.:.::: :::::: :.:: . ::.::.. . :.. .  :::::..  :::: . 
CCDS86 LPHPFALTLFEDILYWTDWSTHSILACNKYTGEGLREIHSDIFSPMDIHAFSQQRQPNAT
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pF1KA0 NRCGDNNGGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKI-SSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRIS
       : :: .::::.::::  :    : :::::: . . ....: ..  ..::.::: :.::::
CCDS86 NPCGIDNGGCSHLCLMSPVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRIS
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pF1KA0 FDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLE
       .:: :..: :. : :.: :.:.:.:  . ..::::  . .: :.  ::.:.. :: ... 
CCDS86 LDTPDFTDIVLQLEDIRHAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIA
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pF1KA0 SPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWT
        : :.:.:::. .:::::.:::::::.  .:.:: .:: :.:..:: ::..:: ::::::
CCDS86 HPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWT
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pF1KA0 DWGASPKIERAGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSK
       :::  ::::::..:.: : :.....: ::::::.::   ..::.::    ::  . ::. 
CCDS86 DWGEIPKIERAALDGSDRVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTG
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pF1KA0 RKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFH
       :.::. ...:: ::.:: :. .:::::: .::. . . .. .::.. ..: .:: ... .
CCDS86 RRVLVEDKIPHIFGFTLLGDYVYWTDWQRRSIERVHKRSA-EREVIIDQLPDLMGLKATN
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pF1KA0 RRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTC-SPGMNSFLIFAR
        .:   :.::: ::::::::::  :  .:. :.:: :..:.:: :::  :  ..::.:.:
CCDS86 VHRVIGSNPCAEENGGCSHLCLYRP--QGLRCACPIGFELISDMKTCIVP--EAFLLFSR
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pF1KA0 RIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQH
       : ::: .::.     .:..:..  .:.. :.  :  ....::.: .:. :::: ..::  
CCDS86 RADIRRISLETNN-NNVAIPLT-GVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSAL
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pF1KA0 EDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLY
       : ..  ::.  .:.::: .:...::.:::::::::..:::. :.::::..::::::..: 
CCDS86 EHVVEFGLDYPEGMAVDWLGKNLYWADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALD
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pF1KA0 HEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERI
          ::::::.:: . :..:..::::.:..:. : .:  ::::.: :. .: :.:  :. :
CCDS86 PAEGFMYWTEWGGKPKIDRAAMDGSERTTLVPN-VGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLI
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pF1KA0 EAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPG
       :.... : ::..... . ::.:::  ..:::::::. :::.::.: .:.:  .....:  
CCDS86 ESSNMLGLNREVIADDLPHPFGLTQYQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDY
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pF1KA0 LMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRP-SGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPET
       .::. .   ..  :.:.:.: :: ::::::  : .:: :.::.  .:..:..::. .: :
CCDS86 VMDILVFHSSRQSGWNECASSNGHCSHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCS-APTT
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pF1KA0 YLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADL
       .::::....: :. .: ..  :. .:.  : :: ..::: .: ..:. :   ..::.:. 
CCDS86 FLLFSQKSAINRMVIDEQQSPDIILPIHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQE
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pF1KA0 NGSNMETVIGRGLKTTD------GLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINN
       .::.  ::.  .. . .       :..:  .: .:::  . :.:...::::    :....
CCDS86 DGSQGFTVVVSSVPSQNLEIQPYDLSIDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKG
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pF1KA0 SLDD---IAAFPRKGYLFWTDWGHIA-KIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTR
         :    ... :.:::...:.  . . ::::: :::.::.::. . :. : .:.::    
CCDS86 EQDRPRAVVVNPEKGYMYFTNLQERSPKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLG
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pF1KA0 RIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLV-GHVSHPFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYS
       ...:.:. : ::::.::.:  : ::  ... .: .::  . :.:: : : . :...: ..
CCDS86 KLFWADSDLRRIESSDLSGANRIVLEDSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKID-MT
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pF1KA0 GRNKET-VLANVEGLMDIIVVSPQ--RQTGTNACGVNNGGCTHLCFARASDFVCACPDEP
       ::. .: : : .  : :: .:.    ..   . :. .:::                    
CCDS86 GREGRTKVQARIAQLSDIHAVKELNLQEYRQHPCAQDNGGCSHICLVKGDGTTRCSCPMH
          1180      1190      1200      1210      1220      1230   

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pF1KA0 DSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDAR
                                                                   
CCDS86 LVLLQDELSCGEPPTCSPQQFTCFTGEIDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQF
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>--
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pF1KA0  MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALG--ECTCIPAQWQCDGDN-D
                                     ::. : :.. :  .:.: : .     :. .
CCDS86 IAQLSDIHAVKELNLQEYRQHPCAQDNGGCSHI-CLVKGDGTTRCSC-PMHLVLLQDELS
         1190      1200      1210       1220      1230       1240  

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pF1KA0 CGDHSDEDGCILPTCSPLDFHCDNGK--CIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDE
       ::.         ::::: .: : .:.  ::  .: ::: ..::: ::: .::   : :..
CCDS86 CGEP--------PTCSPQQFTCFTGEIDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPV--CSESQ
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pF1KA0 FPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQ-CDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDC
       : : .: :: .  .:.:: .: :.:::. :..  :   .:::..:.::..:  :: ..::
CCDS86 FQCASGQCIDGALRCNGDANCQDKSDEKNCEVL-CLIDQFRCANGQCIGKHKKCDHNVDC
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pF1KA0 KDGSDEENC-PSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCR
       .: ::: .: :.  :::                                           
CCDS86 SDKSDELDCYPTEEPAPQATNTVGSVIGVIVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTN
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pF1KA0 GYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKA-LGPEPVLLFANRIDIRQVLPH--RSE
                                     : :  .  :.:::::: :.: :     . :
CCDS81       MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGVKLE
                     10        20        30        40        50    

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pF1KA0 YTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLN--GSNVEEVVSTGLESPGGLA
        :.....::.: :.::.  .  :.:.::. . : .. ::  :. :..:: .:: :: :::
CCDS81 STIVVSGLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLA
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pF1KA0 VDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTP
        :::  ::::::: :.:::::::.:. ::::.::.:..:::::: : .: .::::::.::
CCDS81 CDWVGKKLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETP
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pF1KA0 RIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVIS
       ::: ..:::: :.::.:. ..::::::::   ...::.:::   :.::::::: :. :. 
CCDS81 RIERAGMDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSFRQKVVE
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pF1KA0 QGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPA
        .: ::::.:.  :.::::::.:.::.. :: :: ... : . :. ::::..:  .::: 
CCDS81 GSLTHPFALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPF
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pF1KA0 GKNRCGDNNGGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFR-KISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRR
        ..:: ..::::.::::  ::   :::::::: . . ....:  . .. ::.::: :.::
CCDS81 FHTRCEEDNGGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAEEVLLLARRTDLRR
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pF1KA0 ISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTS
       ::.:: :..: :. . :.: :.:.:.:  . .:::::  . .: ::  ::.: ...:.: 
CCDS81 ISLDTPDFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTE
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pF1KA0 LESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMY
       ...: :.:.:::. .:::::.:::::::.  .:. : .:. :.::.:: :...:. : ::
CCDS81 INDPDGIAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMY
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pF1KA0 WTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDG
       ::::: .:::: :..:.. :.:.....: ::::::.:    .:::.::    ::  ..::
CCDS81 WTDWGENPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDG
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pF1KA0 SKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHV
       .::..:. ..::: ::.:: :. ::::::: .::. . .. . .:... ..: .:: ...
CCDS81 TKRRTLLEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKA-SRDVIIDQLPDLMGLKA
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pF1KA0 FHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTC-SPGMNSFLIF
        .  .   ..::: .::::::::. .:. .   : :: :..:::: :::  :  ..::.:
CCDS81 VNVAKVVGTNPCADRNGGCSHLCFFTPHAT--RCGCPIGLELLSDMKTCIVP--EAFLVF
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pF1KA0 ARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGS
       . :  :. .::.     ::..:..  .:.. :.  : .....::.: .:. :::: ..::
CCDS81 TSRAAIHRISLETNN-NDVAIPLT-GVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGS
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pF1KA0 QHEDIITTGLQTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIV
       . : ..  ::.  .:.::: .:...::.:::::::::. :::..:.::::..::.::...
CCDS81 SVEHVVEFGLDYPEGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLA
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pF1KA0 LYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTE
       :    :..:::.:: . .. :. :::..  .:... .:  : ::.: :...: :.:  :.
CCDS81 LDPTKGYIYWTEWGGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDK-VGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTN
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pF1KA0 RIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNL
        ::.... : .: .... . ::.:::  ..:::::::. .::.:::: .: :  :....:
CCDS81 MIESSNMLGQERVVIADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHL
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pF1KA0 PGLMDMQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPE
         .::. .   ..  :.: :   :: :..:::  :.:  :.: .   :  ....:.: : 
CCDS81 DFVMDILVFHSSRQDGLNDCMHNNGQCGQLCLAIPGGHRCGCASHYTLDPSSRNCSP-PT
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pF1KA0 TYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRAD
       :.::::....: :.  : .   :. .:.  : :: ..::: .:  .:..:   . :.:: 
CCDS81 TFLLFSQKSAISRMIPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQN-IKRAK
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pF1KA0 LNGSN--METVIGRGL---KTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINN
        .:..  . : ...:    .    :..:  .:.:.::  . :::.. ::.:    :.. .
CCDS81 DDGTQPFVLTSLSQGQNPDRQPHDLSIDIYSRTLFWTCEATNTINVHRLSGEAMGVVLRG
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pF1KA0 SLDD---IAAFPRKGYLFWTDW-GHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTR
       . :    :..  ..:::..:.   . :::::: :::.::.::..: :  : .:..:    
CCDS81 DRDKPRAIVVNAERGYLYFTNMQDRAAKIERAALDGTEREVLFTTGLIRPVALVVDNTLG
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pF1KA0 RIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLV-GHVSHPFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYS
       ...:::: : :::: ::.:  : .:  ... .:..::   . .:: : : . :.::.: .
CCDS81 KLFWVDADLKRIESCDLSGANRLTLEDANIVQPLGLTILGKHLYWIDRQQQMIERVEKTT
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

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pF1KA0 GRNKETV---LANVEGLMDIIVVSPQRQTGTNACGVNNGGCTHLCFARASDFVCACPDEP
       : ..  .   .:.. :.  .  :: . . ... :. .::::.:                 
CCDS81 GDKRTRIQGRVAHLTGIHAVEEVSLE-EFSAHPCARDNGGCSHICIAKGDGTPRCSCPVH
         1190      1200      1210       1220      1230      1240   

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pF1KA0 DSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDAR
                                                                   
CCDS81 LVLLQNLLTCGEPPTCSPDQFACATGEIDCIPGAWRCDGFPECDDQSDEEGCPVCSAAQF
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>>CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs108|chr12                (4544 aa)
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pF1KA0                     MRRQWGALLLGALLCAHGLASSP--ECACGRSHFTCAVSA
                                     ::  :. :    :  . ::: ..: :    
CCDS89 KPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPCNKTACGVGEFRCR---
       2560      2570      2580      2590      2600      2610      

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pF1KA0 LGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCILPTCSP--------LDFH-CDNGK-CIRRSW
         . :::  . .:.   :: : ::: .:    ::         . :. :.  . :   ::
CCDS89 --DGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRLGVKGVLFQPCERTSLCYAPSW
            2620      2630      2640      2650      2660      2670 

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pF1KA0 VCDGDNDCEDDSDEQDCP----PRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDE-QC
       :::: ::: : :::.:::    :: :  . : : .: ::   : :: ..::  . :: .:
CCDS89 VCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPR-CPLNYFACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGEDETHC
            2680      2690       2700      2710      2720      2730

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pF1KA0 DMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEE-NCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGR
       . . ::. .:.:..  ::...: :::. :: :::::  .: . .    :.   :.:   .
CCDS89 N-KFCSEAQFECQNHRCISKQWLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKT----CGPSSFSCPGTH
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pF1KA0 -CILDIYHCDGDDDCGDWSDES---DCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDD
        :. . . :::: ::.: .:::    :  .. : . ::::..  ::   . :: : :: :
CCDS89 VCVPERWLCDGDKDCADGADESIAAGCLYNSTCDDREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCAD
        2790      2800      2810      2820      2830      2840     

      260        270       280        290       300           310  
pF1KA0 QSDER-NCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRL-SWRCDGEDDCADNSDEE----NCENTGSPQC
        :::  .:    :   .::: .:::.   .:.::::.:: :.:::     .: .      
CCDS89 GSDESPECEYPTCGPSEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQEHKCN
        2850      2860      2870      2880      2890      2900     

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pF1KA0 ALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMV
       : .:::: .:::...  :::: .::::.:::   ..:.    .:  . . .::.: :. .
CCDS89 ASSQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDE---RGCHI---NECLSRKLSGCSQDCEDL
        2910      2920      2930         2940         2950         

            380       390       400       410       420        430 
pF1KA0 RGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRP-DRR
       . . .: :. :.:: .::.:: ::.::.    ::: : :..:...: :  ::  :  : .
CCDS89 KIGFKCRCRPGFRLKDDGRTCADVDECSTTFPCSQRCINTHGSYKCLCVEGYAPRGGDPH
    2960      2970      2980      2990      3000      3010         

              440       450       460       470       480       490
pF1KA0 SCKAL-GPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLD
       ::::.   :: :.::::  .:..    :.:::: ..:.::.:::: .:.....:.::: .
CCDS89 SCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNYTLLKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQ
    3020      3030      3040      3050      3060      3070         

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pF1KA0 --RILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVL
          : : .::::::. .  ::: .: :::::::  .::: :.: . :::..:.::.: ::
CCDS89 GSMIRRMHLNGSNVQVLHRTGLSNPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVL
    3080      3090      3100      3110      3120      3130         

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pF1KA0 LWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYA
       . ..:..:::...  ..: .::::::.   :   .::::.: .:.::.. ::::::.::.
CCDS89 VSSGLREPRALVVDVQNGYLYWTDWGDHSLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYV
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pF1KA0 GRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANK
        .:.::.::..  :: :.::::.:..:.:: .:: ::.:.::: .:::::.::::: :.:
CCDS89 TERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVYWTDWETKSINRAHK
    3200      3210      3220      3230      3240      3250         

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pF1KA0 FTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNR-CGDNNGGCTHLCLPS-GQNYTCACPT
        :: :. .. . :: :::.:..:  :::   :. :  :::::..::: : : .. :::::
CCDS89 TTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVNNGGCSNLCLLSPGGGHKCACPT
    3260      3270      3280      3290      3300      3310         

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pF1KA0 GFRKISS-HACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW--DSR
       .:   :. ..:...     .  .              .:  ::.          :  :..
CCDS89 NFYLGSDGRTCVSNCTASQFVCK--------------NDKCIPFW---------WKCDTE
    3320      3330      3340                    3350               

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pF1KA0 DDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVA
       ::    .:   :        :         ...  .:.     ::  .  :. .:  .  
CCDS89 DDCGDHSDEPPDCPEFKCRPG---------QFQCSTGIC----TNPAFICDGDNDCQD--
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pF1KA0 NTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERA-GMD--ASGRQVIISS
       :.:            .   :: :   . .   .     : : :  :.:  ..:..     
CCDS89 NSD------------EANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCIPGIFRCNGQDNCGDGEDERDCP
                        3410      3420      3430      3440         

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pF1KA0 NLT-WPNGLAIDYGSQ---RLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGE
       ..:  :: .  .  ..   :..  :     .. .   ..  ..  : .    :     : 
CCDS89 EVTCAPNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDEPANCTQMTCGVD---EFRCKDSG-
    3450      3460      3470      3480      3490         3500      

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pF1KA0 RIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMEN--GGCS
       :   . :.  . ..    .   .:  .:   . ....  . :  :    : ..:  :  :
CCDS89 RCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVPGRWQCDYDNDCGDNS
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pF1KA0 HLCLRSPNP---SGFSCT---CPTGINLLSDG-KTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIP
            .: :   : :::.   : .:     :: . :. : .      :         :. 
CCDS89 DEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAG-RWKCDGDHDCADGSDEKDCTPR--------CDMD
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pF1KA0 YFADVVVPINITMKNTIAVGVDPQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTT-
        :           :.   .   :    . :  ..    .   .:::. :.   ::..:  
CCDS89 QFQ---------CKSGHCI---P----LRWRCDA----DADCMDGSD-EEACGTGVRTCP
                3620             3630          3640       3650     

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pF1KA0 -DGLAVD-AIGRKVYWTDTGTNRIEVG-NLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYW
        : .  . .. . . :   : .  . : : : . ..   .  .  :      ..     :
CCDS89 LDEFQCNNTLCKPLAWKCDGED--DCGDNSDENPEECARF--VCPPNRPFRCKNDRVCLW
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          1190      1200      1210       1220          1230        
pF1KA0 TDWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVD-KASSQLLWAD----AHTERIEAA
          :..     .  ::.:     ...   :.. :.  : ....:  .    . . : .  
CCDS89 I--GRQCDGTDNCGDGTD-----EEDCEPPTAHTTHCKDKKEFLCRNQRCLSSSLRCNMF
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pF1KA0 DLNGANRHTLVSPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNVILVRSNLPGLMD
       :  : .       .. :  ::   .       ..: . :..:..         ..::   
CCDS89 DDCGDGSDEEDCSID-PK-LTSCATNASICGDEARCV-RTEKAAYCACRSGFHTVPGQPG
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pF1KA0 MQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRPSGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLF
        : .        :.:  : : ::.::    .:  :.:  ...   .    . :    : .
CCDS89 CQDI--------NEC-LRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCARNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYI
                     3830      3840      3850      3860      3870  

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pF1KA0 SSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPVP--ELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVFLDVIRRADLNG
       .. . :: . .    :.  .      :   . ..:     :.::.:.    .:   .:  
CCDS89 ADDNEIRSL-FPGHPHSAYEQAFQGDESVRIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPP
           3880       3890      3900      3910      3920      3930 

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pF1KA0 SNMETVIGR---------------GLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSC
       .   :. .:               :::   :.:.:::: :.::::.::..::.... :  
CCDS89 AAPPTTSNRHRRQIDRGVTHLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGEN
            3940      3950      3960      3970      3980      3990 

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pF1KA0 RKVLINNSLDDIAAF---PRKGYLFWTDWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLT
       ::.::.. .:.  :.   : .: ..:.:::.  ::: : .::. :..:.. .. ::.::.
CCDS89 RKTLISGMIDEPHAIVVDPLRGTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGLA
            4000      4010      4020      4030      4040      4050 

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pF1KA0 LDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGH---VSHPFALTQQDRWIYWTDWQTKS
       .:: ..:.::.::.:. : :  :::    : .     .::::..   . .:: . . .. 
CCDS89 VDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGTDPIVAADSKRGLSHPFSIDVFEDYIYGVTYINNR
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pF1KA0 IQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTG-TNACGVNNGGCTHLCFARASDFVC
       . .. :..     .. ...    :...   ..:   :: :  .   :  ::.   :  ::
CCDS89 VFKIHKFGHSPLVNLTGGLSHASDVVLYHQHKQPEVTNPC--DRKKCEWLCLLSPSGPVC
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pF1KA0 ACPDEP--DSQPCSLVPGLVPP--APRATGMSEKSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEV
       .::.    :.  :  ::. .::  :::                                 
CCDS89 TCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPRPGTCNLQCFNGGSCFLNARRQPKCRCQPRYTGD
    4170      4180      4190      4200      4210      4220         

>--
 initn: 1677 init1: 604 opt: 1628  Z-score: 1242.3  bits: 244.5 E(32554): 7.1e-63
Smith-Waterman score: 3242; 36.7% identity (68.7% similar) in 1418 aa overlap (282-1636:1118-2505)

             260       270       280       290       300       310 
pF1KA0 GDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQ
                                     :.  .: :::..:: :::::::::. .   
CCDS89 CMDSSDEKSCEGVTHVCDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDGDNDCEDNSDEENCESLA---
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pF1KA0 CALDQFLCWNGR--CIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKC
       :   .  : :.   :.   :::.: .::::.:::.  . :      ..:..:::::...:
CCDS89 CRPPSHPCANNTSVCLPPDKLCDGNDDCGDGSDEG--ELC------DQCSLNNGGCSHNC
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pF1KA0 QMVRG-AVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRP
       ... : .. :.:  :..:  :.::::  . ::..  ::: : ... . .: :  :. :.:
CCDS89 SVAPGEGIVCSCPLGMELGPDNHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYEGWVLEP
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       : .::..: : .: ..:.:: .::..  :...:..:. .:.:.::::::  .  ..:.::
CCDS89 DGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRIDLHKGDYSVLVPGLRNTIALDFHLSQSALYWTDV
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pF1KA0 TLDRILRANL--NG--SNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGA
       . :.: :..:  ::  .. : :.. :: .: ::::::.  ..::..:. ..::::.:::.
CCDS89 VEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLATPEGLAVDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGT
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pF1KA0 HRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNT-PRIEASSMDGSGRRII--ADTHLFWP
        : .::  ..:.:::::: : .: ..::::  . :::::.::.:.::: .        ::
CCDS89 LRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGILFWTDWDASLPRIEAASMSGAGRRTVHRETGSGGWP
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pF1KA0 NGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVIS--QGLPHPFAITVFEDSLYWTDW
       ::::.::  .:. :.::.  .:  :  ::: .  :.   . : ::::.:..   .:::::
CCDS89 NGLTVDYLEKRILWIDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEFLSHPFAVTLYGGEVYWTDW
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pF1KA0 HTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGG---CTHLCLP
       .:... .:::.::.:  ...     :.:... ::.::: . : : . :::   :.:::: 
CCDS89 RTNTLAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPC-EANGGQGPCSHLCLI
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pF1KA0 S-GQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDV-IPLADVR
       . ... .::::  ..  ....    . ::::.::.:.:: ...:.   .  . . . :. 
CCDS89 NYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYIISFTVPDID
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       ....::.:.:...:::.:: :..:.::  .::: :.::...: .  :::.:::. .:.::
CCDS89 NVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVETVVSADLPNAHGLAVDWVSRNLFWT
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pF1KA0 DAGTDR--IEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDA
       .  :..  :.::  :::...... ..:..:. .::.:. : .::::   . .:  :.::.
CCDS89 SYDTNKKQINVARLDGSFKNAVV-QGLEQPHGLVVHPLRGKLYWTD---GDNISMANMDG
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       :.: ...:..   : :::::.  ..::: ..: .::.  .::::  .:.  . ::: .  
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pF1KA0 GLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRR---RPPVSTPC
       .:...:....:.:  .... . ..  :    .:...   .: ..:. .        ..::
CCDS89 ALAIMGDKLWWADQVSEKMGTCSKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLDHKGTNPC
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       ...:: ::.::: . . .  :: : .: .: :  ..:  :..:::... .  :: . :: 
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pF1KA0 PYFADVVVPINITMKNTIAVGVD--PQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQ
          .:..::.. :   ..:::.:   ..  .:: :  :  ::::. : . .::..:.:. 
CCDS89 NDKSDALVPVSGT---SLAVGIDFHAENDTIYWVDMGLSTISRAKRDQTWREDVVTNGIG
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pF1KA0 TTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWT
        ..:.::: :. ..:::: : . :::. :.::.: :.. :.::.::::... : :...::
CCDS89 RVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGSFRYVVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWT
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pF1KA0 DWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLN-GA
       .::.  ..::: .::..:.::.: ...::::..::  ...: : ::.:..::  ::. : 
CCDS89 EWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVSISWPNGISVDYQDGKLYWCDARTDKIERIDLETGE
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pF1KA0 NRHTLVSPVQHP-YGLTLLDSYIYWTDWQ--TRSIHRADKGTGSNVILVRSNLP-GLMDM
       ::....:  .   .........:::.:    . ::.:..: .... . .:...   : :.
CCDS89 NREVVLSSNNMDMFSVSVFEDFIYWSDRTHANGSIKRGSKDNATDSVPLRTGIGVQLKDI
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       .. .: .  : : :.  ::::..::: :  :  .:::  :. :  :: .:      :::.
CCDS89 KVFNRDRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACACAHGM-LAEDGASCREYA-GYLLY
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pF1KA0 SSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPV-----PE-LNNVISLDYDSVDG-------KVYYTDVF
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CCDS89 SERTILKSIHL--SDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPGTPNRIFFSDIH
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CCDS89 FGNIQQINDDGSRRITIV-ENVGSVEGLAYHRGWDTLYWTSYTTSTITRHTVDQTRPGAF
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CCDS89 ERETVITMSGDD---HPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIR
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CCDS89 TPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDW
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       .  : :.:                                                    
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CCDS89 PGSRQCACAEDQVLDADGVTCLANPSYVPPPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLD
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       .:::    :  . :  :.: :.:. :: . : ::::::::.. ::.   :. : :  ..:
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pF1KA0 RCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPC-NLEEFQCAYGRCILDIYHCDG
        :..: ::   : :: : :: : :::    ..   : :  : .: :  ::::   ..::.
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       :.:::: :::. ::  . : : .: :.:: ::   : :::: :: : :::   :::..  
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>--
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Smith-Waterman score: 1631; 34.0% identity (63.4% similar) in 826 aa overlap (270-1043:27-842)

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pF1KA0 SGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSG-RCVRLSWRCDGEDDCADN
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CCDS89     MLTPPLLLLLPLLSALVAAAIDAPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGERDCPDG
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       :::  : : .. . .:  ..  : . . :. . .:::::.:: :.:::.:  .::   : 
CCDS89 SDEAPEICPQSKAQRCQPNEHNCLGTELCVPMSRLCNGVQDCMDGSDEGP--HCRELQG-
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        ::.    :: ..:  .  .  : :.....:  ::.::.: .::.  : ::: :::..:.
CCDS89 -NCS--RLGCQHHCVPTLDGPTCYCNSSFQLQADGKTCKDFDECSVYGTCSQLCTNTDGS
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       : : :  :: :.:: ::::: . :    ::::.::  .:  . :   .  :.  .. ...
CCDS89 FICGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEPVDRPPVLLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQT
              180       190       200       210       220       230

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        :.:: .  : : :   .: . .  :. : . : .  :.:    .: .:.    .:.::.
CCDS89 TAMDFSYANETVCWVHVGDSAAQTQLKCARMPGLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWL
              240       250       260       270       280       290

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         ..:..:.  .:: : : .:    .::  .: .:..::: :  : ...::.:. :..: 
CCDS89 TGNFYFVDDIDDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYNPKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVER
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        .:::..:  ..:... .:.:.:.: ..: .::.::    :: .. .:. :...: ::. 
CCDS89 CDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLDYIEVVDYEGKGRQTII-QGIL
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pF1KA0 -PHPFAITVFEDSLYWTD------WHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQ
         : ...::::. :: :.       .  :.  .:.:.. . ... ...     .:  : .
CCDS89 IEHLYGLTVFENYLYATNSDNANAQQKTSVIRVNRFNSTEYQVV-TRVDKGGALHIYHQR
     410       420       430       440       450        460        

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pF1KA0 RQPAGKNRCGDNN-----GGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKISS-HACAQSLDK-FL
       :::  ...  .:.     :::. .::   : .  :: : .::   :. ..: .   . ::
CCDS89 RQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHKARTCRCRSGFSLGSDGKSCKKPEHELFL
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pF1KA0 LFARRMD--IRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKW
       ....     :: ... ..  .. .::. .. .  :::. ..   .:..:...  :.: : 
CCDS89 VYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDEHMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIGRQKI
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KA0 DGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDR-IEVANTD--GSMRTVLIWENLD
       ::: .:...  ....  :.:.::. ..::::: :  . : ::  .  .. : .::  .. 
CCDS89 DGTERETILKDGIHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMT
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     860       870       880             890       900        910  
pF1KA0 RPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPK------IERAGMDASGRQVIISSN-LTWPNGLAIDY
       .:: :::.:..:.::::::  .::      .::: ::.: :.....:. . :::::..: 
CCDS89 HPRAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLWPNGLSLDI
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pF1KA0 GSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLI-GSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSA
        . ::::.:: .  ::   :.:. ::..  : .: : :::  .:. ..::.... :.   
CCDS89 PAGRLYWVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCHHGNYLFWTEYRSGSVYRL
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pF1KA0 DRLTGLDRET---LQENLENLMDIHVFHRRRPPVST-PCAMENGGCSHLCLRSPNPSGFS
       .: .:    :   :. .   ...:...  ..  :.:  : ..::::: ::: .:.    .
CCDS89 ERGVGGAPPTVTLLRSERPPIFEIRMYDAQQQQVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSR--Q
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pF1KA0 CTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAVG
       :.:     : .:: ::                                            
CCDS89 CACAEDQVLDADGVTCLANPSYVPPPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEA
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>>CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19               (819 aa)
 initn: 1857 init1: 400 opt: 1859  Z-score: 1427.7  bits: 276.3 E(32554): 3.3e-73
Smith-Waterman score: 1894; 41.0% identity (68.0% similar) in 646 aa overlap (110-727:27-660)

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pF1KA0 NGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNS
                                     ::..:: ::.: ::   : :::. .: :.:
CCDS56     MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAECQDGS
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pF1KA0 DEQ---CDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEF
       ::.   :. . ::. :::: ::.::.... ::.: :: ::::: .::  .    :.   :
CCDS56 DESQETCSPKTCSQDEFRCHDGKCISRQFVCDSDRDCLDGSDEASCPVLT----CGPASF
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pF1KA0 QCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDE--SDC-------SSHQPCRSGEFMCDSGLCINAG
       ::  . :: ... ::.: :: : :::  . :       .. .:: . :: : :: ::...
CCDS56 QCNSSTCIPQLWACDNDPDCEDGSDEWPQRCRGLYVFQGDSSPCSAFEFHCLSGECIHSS
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pF1KA0 WRCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENT
       :::::  :: :.:::.::... :  ..:.: .: :.. : .:: : :: : ::: .: :.
CCDS56 WRCDGGPDCKDKSDEENCAVATCRPDEFQCSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNV
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pF1KA0 GSPQC-ALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCA
           : . ..: : .:.::   :.:: . :: : ::: : ..:    : ..:  :::::.
CCDS56 --TLCEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDE-PIKEC----GTNECLDNNGGCS
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pF1KA0 QKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYEL
       . :. .. . .: :  :..:. . . :.:..:: .   ::: :.: ::...: :: :..:
CCDS56 HVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQ-RRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQL
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pF1KA0 RPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSD
        :  ..:::.:    :.:.:: ..:..   ::::: :. ::.:..::: .   . ..:::
CCDS56 DPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSD
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pF1KA0 VTLDRILRANLN---G-SNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDG
       ..   :  ..:.   : :. . :.:  ...: ::::::.:...:::::  . . ::.  :
CCDS56 LSQRMICSTQLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKG
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pF1KA0 AHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNG
       ..::.:. .:  :::::.. :..: .::::::.  .:. ....:     ..  .. ::::
CCDS56 VKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNG
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pF1KA0 LTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVIS--QGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHT
       .:.:  . :.::::.: : :   ...:..::...   . : :::...::::...:::  .
CCDS56 ITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIIN
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pF1KA0 KSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGD---NNGGCTHLCLPSG
       ..: :::..::.. ... ..:  : :.  .:   :: : : :     .:::: .::::. 
CCDS56 EAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAP
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pF1KA0 Q------NYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLAD
       :      ..::::: :                                            
CCDS56 QINPHSPKFTCACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRP
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>>CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs108|chr2                 (4655 aa)
 initn: 1380 init1: 662 opt: 1496  Z-score: 1141.6  bits: 225.9 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 2463; 36.1% identity (64.3% similar) in 1012 aa overlap (66-1043:19-1013)

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pF1KA0 VSALGECTCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCILPT----CSPLDFHCDNGKCIRRSWVCD
                                     :. :.    :.   :.: .:.::  .: ::
CCDS22             MDRGPAAVACTLLLALVACLAPASGQECDSAHFRCGSGHCIPADWRCD
                           10        20        30        40        

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pF1KA0 GDNDCEDDSDEQDCPPRECEEDEFPCQN-GYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQ--CDMRKC
       : .:: ::.::  :    :..  : ::. : :: . : :: :.:: :.:::.  :..  :
CCDS22 GTKDCSDDADEIGCAVVTCQQGYFKCQSEGQCIPNSWVCDQDQDCDDGSDERQDCSQSTC
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pF1KA0 SDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIY
       :.... ::.:.::  .. ::   :: ::.::..:      : :  :.. :  : :     
CCDS22 SSHQITCSNGQCIPSEYRCDHVRDCPDGADENDCQ----YPTC--EQLTCDNGACYNTSQ
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pF1KA0 HCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTTS
       .::   :: : ::: .:.  . :  .:: : .: ::  .. :: : ::.: :::. :.  
CCDS22 KCDWKVDCRDSSDEINCT--EICLHNEFSCGNGECIPRAYVCDHDNDCQDGSDEHACNYP
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pF1KA0 MCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSP--QCALDQFLC-WNGRCI
        : . :: : ::::.  .: ::::::: ::.::..::.      .:.  .. :  .::::
CCDS22 TCGGYQFTCPSGRCIYQNWVCDGEDDCKDNGDEDGCESGPHDVHKCSPREWSCPESGRCI
              230       240       250       260       270       280

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pF1KA0 GQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYR
       .  :.:.:. ::    ::.  .. .   .   :.. :  :  .:. .  .  : :  :: 
CCDS22 SIYKVCDGILDCPGREDENNTSTGK-YCSMTLCSALN--CQYQCHETPYGGACFCPPGYI
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pF1KA0 LTE-DGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKA---LGPEPV
       ... :..:: . ..:   : :.: : .  :   : :: :: :.  .  :::   .: :  
CCDS22 INHNDSRTCVEFDDCQIWGICDQKCESRPGRHLCHCEEGYILERGQY-CKANDSFG-EAS
       340       350       360       370       380        390      

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pF1KA0 LLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALD--FHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNG
       ..:.:  :.     :   . .:... . ..:.   ::.. . :::.:.. .... ...::
CCDS22 IIFSNGRDLLIGDIHGRSFRILVESQNRGVAVGVAFHYHLQRVFWTDTVQNKVFSVDING
         400       410       420       430       440       450     

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pF1KA0 SNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAI
        :..::.....:.: .::::::..:.: ... ..::...::::..: .:. .:: .::.:
CCDS22 LNIQEVLNVSVETPENLAVDWVNNKIYLVETKVNRIDMVNLDGSYRVTLITENLGHPRGI
         460       470       480       490       500       510     

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pF1KA0 ALHPMEGTIYWTDW---GNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVD
       :. :  : ....::   .. :..: . ::::.:. .. :.: :: :.:.:. ..:.::::
CCDS22 AVDPTVGYLFFSDWESLSGEPKLERAFMDGSNRKDLVKTKLGWPAGVTLDMISKRVYWVD
         520       530       540       550       560       570     

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pF1KA0 AKHHVIERANLDGSHRKAVISQG--LPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQ
       ..   :: .. :: .::.:.  :  .::::....:: ....:::   .. .:::::  : 
CCDS22 SRFDYIETVTYDGIQRKTVVHGGSLIPHPFGVSLFEGQVFFTDWTKMAVLKANKFTETNP
         580       590       600       610       620       630     

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pF1KA0 EIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPS------GQNYTCACPTGF
       ..  .    :. . . :  ::: . : : :::::: ..:. :      : .. : :  ::
CCDS22 QVYYQASLRPYGVTVYHSLRQPYATNPCKDNNGGCEQVCVLSHRTDNDGLGFRCKCTFGF
         640       650       660       670       680       690     

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pF1KA0 RKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSA-VALDWDSRDDHV
       .  ...    ....::.:. .. :: : :      : ..:..   :  :..:.:..:. .
CCDS22 QLDTDERHCIAVQNFLIFSSQVAIRGIPFTLSTQEDVMVPVSGNPSFFVGIDFDAQDSTI
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pF1KA0 YWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVAN-TD
       ...:.:   : . : ::::.:... . .:.  .::.::....:::::.    : :   .:
CCDS22 FFSDMSKHMIFKQKIDGTGREILAANRVENVESLAFDWISKNLYWTDSHYKSISVMRLAD
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pF1KA0 GSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQVIISSNLTWPN
        . :::.  . :. ::..::.:..::...:::    :: ::  :.:    .:...: :::
CCDS22 KTRRTVV--QYLNNPRSVVVHPFAGYLFFTDWFRPAKIMRAWSDGSHLLPVINTTLGWPN
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pF1KA0 GLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGS--QLPHPFGLTLYGERIYWTDWQ
       :::::....::::.:: .  :: . .::  :. : :   :. :::::...::....:::.
CCDS22 GLAIDWAASRLYWVDAYFDKIEHSTFDGLDRRRL-GHIEQMTHPFGLAIFGEHLFFTDWR
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pF1KA0 TKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAME---NGGCSHLCLRSP
         .:  . .  : .  ... ..  .. .. .       :. : .    :: :::.:.  :
CCDS22 LGAIIRVRKADGGEMTVIRSGIAYILHLKSYDVNIQTGSNACNQPTHPNGDCSHFCFPVP
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pF1KA0 NPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMK
       : .   : :: :. : :.  ::                                      
CCDS22 NFQRV-CGCPYGMRLASNHLTCEGDPTNEPPTEQCGLFSFPCKNGRCVPNYYLCDGVDDC
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>--
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CCDS22 TCSNGRCISEEWKCDNDNDCGDGSDEMESVCALHTCSPTAFTCANG-----RCVQYSYRC
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CCDS22 DYYNDCGDGSDEAGCLFRDCNATTEFMCNNRRCIPREFICNGVDNCHDNNTSDEKNCPDR
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        :.     :.:.  ::  .. :::::::::::::.   :  . ::..::.:..: :: .:
CCDS22 TCQSGYTKCHNSNICIPRVYLCDGDNDCGDNSDENPTYCTTHTCSSSEFQCASGRCIPQH
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       :::: .::: :.:::  .:  .     :  .::.:  :::: . . ::::.:::: :::.
CCDS22 WYCDQETDCFDASDEPASCGHS--ERTCLADEFKCDGGRCIPSEWICDGDNDCGDMSDED
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pF1KA0 ---DCSSHQPCRSGEFMCDSGL-----CINAGWRCDGDADCDDQSDE-RNCTTSMCTAEQ
          .:.. : : ..::.: .       ::  .: ::::.:: :  :: .:::   :. ..
CCDS22 KRHQCQN-QNCSDSEFLCVNDRPPDRRCIPQSWVCDGDVDCTDGYDENQNCTRRTCSENE
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pF1KA0 FRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGV
       : :  : :.   .::: ..::.: :::..:       :  .:: : :::::..  .:.  
CCDS22 FTCGYGLCIPKIFRCDRHNDCGDYSDERGCLYQ---TCQQNQFTCQNGRCISKTFVCDED
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pF1KA0 NDCGDNSDE------SPQQNCRPR-------------------------TGEENCNVNN-
       :::::.:::      .:. .: :.                         . :..:..:. 
CCDS22 NDCGDGSDELMHLCHTPEPTCPPHEFKCDNGRCIEMMKLCNHLDDCLDNSDEKGCGINEC
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CCDS22 HDPSISGCDHNCTDTLTSFYCSCRPGYKLMSDKRTCVDIDECTEMPFVCSQKCENVIGSY
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pF1KA0 QCWCETGYELRPDRRSCKALGP-EPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDF
        : :  ::  .:: ..:.  .  :: :.:.::  .:..      :.:.:..:.:..::::
CCDS22 ICKCAPGYLREPDGKTCRQNSNIEPYLIFSNRYYLRNLTIDGYFYSLILEGLDNVVALDF
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pF1KA0 HHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRI
        . .. ..: :.  . : :  :: .: : ...  : .  .::::::  :::: :.  . .
CCDS22 DRVEKRLYWIDTQRQVIERMFLNKTNKETIINHRLPAAESLAVDWVSRKLYWLDARLDGL
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pF1KA0 EVANLDGAHRKVLLWQNLE--------KPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGS
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CCDS22 FVSDLNGGHRRMLAQHCVDANNTFCFDNPRGLALHPQYGYLYWADWGHRAYIGRVGMDGT
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pF1KA0 GRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAIT
       .. .: .:.: ::::.::::..  .::.::.   :: ..:.: ::..: . .::::::::
CCDS22 NKSVIISTKLEWPNGITIDYTNDLLYWADAHLGYIEYSDLEGHHRHTVYDGALPHPFAIT
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CCDS22 IFEDTIYWTDWNTRTVEKGNKYDGSNRQTLVNTTHRPFDIHVYHPYRQPIVSNPCGTNNG
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pF1KA0 GCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKIS---SHACAQ--SLDKFLLFARR--MDIRRISFD
       ::.::::  :.:...:: ::  :: ..   :  :    :  .::    .  . :      
CCDS22 GCSHLCLIKPGGKGFTCECPDDFRTLQLSGSTYCMPMCSSTQFLCANNEKCIPIWWKCDG
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        .: ::  : . :   :     ...  : .     .: .:.  :.    ::. .. ..  
CCDS22 QKDCSDGSDELALCPQRFCRLGQFQCSDGNC----TSPQTLCNAHQNCPDGSDEDRLL--
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         :.    . .:  .::      :  :. .:  . .. :.:  .        :: ..   
CCDS22 -CENHHCDSNEWQCANKRCIPESWQCDTFNDCEDNSDEDSSHCA----SRTCRPGQFRC-
      3590      3600      3610      3620      3630          3640   

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pF1KA0 PMGGYMYWTDWGASPKIERAGMDASGRQV--IISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMK
         .:      :  .  ..    : : . .   .::     :    ... .  :      :
CCDS22 -ANGRCIPQAWKCD--VDNDCGDHSDEPIEECMSSAHLCDN--FTEFSCKTNYRCIP--K
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pF1KA0 TIEFAGLDGSKRKV-LIGSQ--LPHPFGLTLYGER----IYWT-DWQTKSIQSADRLTGL
            :.:  . .    : .    :: :     ..    . :  : :.   ...:. .  
CCDS22 WAVCNGVDDCRDNSDEQGCEERTCHPVGDFRCKNHHCIPLRWQCDGQNDCGDNSDEENCA
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pF1KA0 DRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLL
        ::  . ... . .  .  :      . :. .:.      .:. .:  :.::  .:  . 
CCDS22 PRECTESEFRCVNQQCIPSRWICDHYNDCG-DNSDERDCEMRTCHPEYFQCT--SGHCVH
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pF1KA0 SDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAVGVDPQEGKVYW
       :. : :. :  . :  . . :      :  :   ..    .  :: . .   :     ::
CCDS22 SELK-CD-GSADCLDASDEADCPTRFPDGAYCQATM----FECKNHVCI---PP----YW
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                  . ::   .:    : .    : .:.         .. ::..  : .  .
CCDS22 -----------KCDG---DDDCGDGSDEELHLCLDV-------PCNSPNRFRCDN-NRCI
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        .  : ...:         . :    ::  :.   . .    ..     .:.   :.  .
CCDS22 YSHEVCNGVD---------DCG--DGTDETEEHCRKPTPKPCTEYEYKCGNGHCIPHDNV
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pF1KA0 VDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLVSPVQHPYGLTLLDSYIYWTDWQTRSIHR
        : :..   :.:      : .  .: .:    .  ..  . : :.   .        :  
CCDS22 CDDADDCGDWSD------ELGCNKGKERTCAENICEQ--NCTQLNEGGF--------ICS
       3950            3960      3970        3980              3990

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          :  .::.               ::.. : .:.:  . : : . :    ... :.:  
CCDS22 CTAGFETNVF---------------DRTSCLDINEC-EQFGTCPQHCRNTKGSYECVCAD
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pF1KA0 GIQLKGD--GKTC---DPSPETYLLFSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPVPELNNVISLDY
       :.   .:  :: :     ::   ::. .   ::. .: .:.. . ..   :  .... :.
CCDS22 GFTSMSDRPGKRCAAEGSSP--LLLLPDNVRIRKYNL-SSERFSEYLQDEEYIQAVDYDW
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pF1KA0 DSVD---GKVYYT----DVFLDVIRRADL----NG-SNMETVIGRGLKTT---DGLAVDW
       :  :   . ::::       . .:.:: .    .: .:.   .   :: .   ::.::::
CCDS22 DPKDIGLSVVYYTVRGEGSRFGAIKRAYIPNFESGRNNLVQEVDLKLKYVMQPDGIAVDW
            4100      4110      4120      4130      4140      4150 

      1440      1450      1460      1470         1480      1490    
pF1KA0 VARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDDIAAF---PRKGYLFWTDWGHIAKIE
       :.:..::.:.  . ::...:::  :: ::...::. ::.   :. : .::::::.  :::
CCDS22 VGRHIYWSDVKNKRIEVAKLDGRYRKWLISTDLDQPAAIAVNPKLGLMFWTDWGKEPKIE
            4160      4170      4180      4190      4200      4210 

         1500      1510      1520       1530      1540      1550   
pF1KA0 RANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDY-DTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGHV
        : ..: .:..:.  :::::.::..:: .. :::: : . : ::.   .:  :.:.. ..
CCDS22 SAWMNGEDRNILVFEDLGWPTGLSIDYLNNDRIYWSDFKEDVIETIKYDGTDRRVIAKEA
            4220      4230      4240      4250      4260      4270 

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pF1KA0 SHPFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDIIVVSPQRQTGT--
        .:..:   .  .:: . .   . . .:..  .:: .:.    : .. .    : . .  
CCDS22 MNPYSLDIFEDQLYWISKEKGEVWKQNKFGQGKKEKTLVVNPWLTQVRIFHQLRYNKSVP
            4280      4290      4300      4310      4320      4330 

            1620      1630      1640      1650      1660       1670
pF1KA0 NACGVNNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPV-LPN
       : :   .  :.:::. : . . ::::     :  :.. : .     :  .    :. :: 
CCDS22 NLC---KQICSHLCLLRPGGYSCACP-----QGSSFIEGSTTECDAAIEL----PINLP-
               4340      4350           4360      4370             

             1680      1690       1700      1710      1720         
pF1KA0 TPPTTLYSSTTRTRTSLEEVE-GRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISYAIGGLL
        ::   . . .     ..:..  .:.  ..  :   .   .   .::     . :.. ::
CCDS22 -PPCRCMHGGN---CYFDETDLPKCKCPSGYTGKYCEMAFSKGISPG-----TTAVAVLL
      4380         4390      4400      4410      4420              

    1730      1740         1750      1760      1770      1780      
pF1KA0 SILLILVVIAALML---YRHKKSKFTDPGMGNLTYSNPSYRTSTQEVKIEAIPKPAMYNQ
       .:::: :::.:: .   ......    :.. .:                           
CCDS22 TILLI-VVIGALAIAGFFHYRRTGSLLPALPKLPSLSSLVKPSENGNGVTFRSGADLNMD
    4430       4440      4450      4460      4470      4480        

       1790      1800      1810      1820      1830      1840      
pF1KA0 LCYKKEGGPDHNYTKEKIKIVEGICLLSGDDAEWDDLKQLRSSRGGLLRDHVCMKTDTVS
                                                                   
CCDS22 IGVSGFGPETAIDRSMAMSEDFVMEMGKQPIIFENPMYSARDSAVKVVQPIQVTVSENVD
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>--
 initn: 957 init1: 380 opt: 1194  Z-score: 911.6  bits: 183.3 E(32554): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 2939; 35.6% identity (65.3% similar) in 1386 aa overlap (311-1639:1311-2680)

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pF1KA0 RCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGR-CIGQRKLCNGVNDCGD
                                     .:   :. : .   :..   .:.:. :: .
CCDS22 GNCIHRAWLCDRDNDCGDMSDEKDCPTQPFRCPSWQWQCLGHNICVNLSVVCDGIFDCPN
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pF1KA0 NSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKC-QMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNE
       ..::::  :     :. .:.  ::::...: :   :: .: :  :. :..:..::.:..:
CCDS22 GTDESPLCN-----GN-SCSDFNGGCTHECVQEPFGA-KCLCPLGFLLANDSKTCEDIDE
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pF1KA0 CAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFA---NRIDIRQVLP
       :   : ::: : : .:.:.: :.::: :. : :.::. . : .::..   :.:   .:  
CCDS22 CDILGSCSQHCYNMRGSFRCSCDTGYMLESDGRTCKVTASESLLLLVASQNKIIADSVTS
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pF1KA0 HRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGG
       .  .   :..:    .:.::      .::::.:  .   :  ::.. . : ....     
CCDS22 QVHNIYSLVENGSYIVAVDFDSISGRIFWSDATQGKTWSAFQNGTDRRVVFDSSIILTET
          1460      1470      1480      1490      1500      1510   

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pF1KA0 LAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPM--EGTIYWTDW
       .:.:::  .::::: .   :::...::.:: ::. .:: .::..:: :   :  ..:.::
CCDS22 IAIDWVGRNLYWTDYALETIEVSKIDGSHRTVLISKNLTNPRGLALDPRMNEHLLFWSDW
          1520      1530      1540      1550      1560      1570   

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pF1KA0 GNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRK
       :. :::: .::::: : .:.. ..::: :::::: .: .:..:.    ..  . .: ::.
CCDS22 GHHPRIERASMDGSMRTVIVQDKIFWPCGLTIDYPNRLLYFMDSYLDYMDFCDYNGHHRR
          1580      1590      1600      1610      1620      1630   

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pF1KA0 AVISQGLP--HPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLH
        ::.. :   ::.:.:.::::.::::  :. .  :::. : :: ..  ....:. : ..:
CCDS22 QVIASDLIIRHPYALTLFEDSVYWTDRATRRVMRANKWHGGNQSVVMYNIQWPLGIVAVH
          1640      1650      1660      1670      1680      1690   

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pF1KA0 PQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQN---YTCACPTGFRKISSH--ACAQSLDKFLLF
       :..:: . : :. .   :.:::: :.:.   :.:.::.:. ..:     : .. . ::. 
CCDS22 PSKQPNSVNPCAFSR--CSHLCLLSSQGPHFYSCVCPSGW-SLSPDLLNCLRDDQPFLIT
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pF1KA0 ARRMDIRRISFDTEDLSDD-VIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGT
       .:.  :  ::.. :  :.: ..:.: ..... ...:. ....::.. .   : :.: :::
CCDS22 VRQHIIFGISLNPEVKSNDAMVPIAGIQNGLDVEFDDAEQYIYWVE-NPGEIHRVKTDGT
             1760      1770      1780      1790       1800         

         810        820       830       840       850              
pF1KA0 GQEVVVDTSLESPA-GLAIDWVTNKLYWTDAGTDRIEVANTDGSMR--TVLIWEN-----
       .. : .. :. .:. .::.::.. .:: :.  :. ::: .  :..:   .:: ..     
CCDS22 NRTVFASISMVGPSMNLALDWISRNLYSTNPRTQSIEVLTLHGDIRYRKTLIANDGTALG
    1810      1820      1830      1840      1850      1860         

       860       870       880           890       900       910   
pF1KA0 LDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGAS---P-KIERAGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYG
       .  :  :.:.:  : .::.: :..   : ::  :.::... ......::   . ...:  
CCDS22 VGFPIGITVDPARGKLYWSDQGTDSGVPAKIASANMDGTSVKTLFTGNLEHLECVTLDIE
    1870      1880      1890      1900      1910      1920         

           920       930       940       950       960       970   
pF1KA0 SQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVLIGSQLPHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADR
        :.:::: .:  .:: ...::. : .:.  :: ::.:....   .:.:: : . :. .:.
CCDS22 EQKLYWAVTGRGVIERGNVDGTDRMILV-HQLSHPWGIAVHDSFLYYTDEQYEVIERVDK
    1930      1940      1950       1960      1970      1980        

           980       990      1000       1010      1020       1030 
pF1KA0 LTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTP-CAMENGGCSHLCLRSPNPSG-FSCTCP
        :: .. .:..:. ::  ..:.:::    :.  :. . ..:...::  : :.: :::.: 
CCDS22 ATGANKIVLRDNVPNLRGLQVYHRRNAAESSNGCSNNMNACQQICL--PVPGGLFSCACA
     1990      2000      2010      2020      2030        2040      

            1040      1050      1060      1070      1080      1090 
pF1KA0 TGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLDIPYFADVVVPINITMKNTIAVGVDPQ
       ::..:  :...::: .:::.. .    ::  ::..   ....::.    .:.. : :: .
CCDS22 TGFKLNPDNRSCSP-YNSFIVVSMLSAIRGFSLELSDHSETMVPVAGQGRNALHVDVDVS
       2050      2060       2070      2080      2090      2100     

                 1100      1110      1120        1130      1140    
pF1KA0 EGKVYWSD-----STLHRISRANLDGSQHEDIITTGLQTTD--GLAVDAIGRKVYWTDTG
        : .:: :     .. . : : . :::.  .:.: :.  .   :.::: .. ..:.:.. 
CCDS22 SGFIYWCDFSSSVASDNAIRRIKPDGSSLMNIVTHGIGENGVRGIAVDWVAGNLYFTNAF
        2110      2120      2130      2140      2150      2160     

           1150      1160      1170      1180      1190      1200  
pF1KA0 TNR--IEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYWTDWGENAKLERSGMDGSDR
       ...  :::  .. ..:.::.  ..: :: ::.  .  ...:.:.:.  :.::: .: ..:
CCDS22 VSETLIEVLRINTTYRRVLLKVTVDMPRHIVVDPKNRYLFWADYGQRPKIERSFLDCTNR
        2170      2180      2190      2200      2210      2220     

           1210      1220      1230      1240        1250      1260
pF1KA0 AVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLNGANRHTLV--SPVQHPYGLTL
       .::.....  : ::.::.... . :.:   . :    .:: : ...   :    :::.:.
CCDS22 TVLVSEGIVTPRGLAVDRSDGYVYWVDDSLDIIARIRINGENSEVIRYGSRYPTPYGITV
        2230      2240      2250      2260      2270      2280     

             1270      1280        1290      1300            1310  
pF1KA0 LDSYIYWTDWQTRSIHRADKGTGSNV--ILVRSNLPGLMDMQAVDR-AQP-----LGFNK
       ... : :.: . ..: .:.:   ..    ..:.:.  : :.   :. .::     .. : 
CCDS22 FENSIIWVDRNLKKIFQASKEPENTEPPTVIRDNINWLRDVTIFDKQVQPRSPAEVNNNP
        2290      2300      2310      2320      2330      2340     

           1320      1330        1340      1350      1360      1370
pF1KA0 CGSRNGGCSHLCLPRPSGFS--CACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLLFSSRGSIRRISLD
       :   ::::::::.  :.  .  : :  :  :..:::.:  : :..:.:.  .:.: . ::
CCDS22 CLENNGGCSHLCFALPGLHTPKCDCAFGT-LQSDGKNCAISTENFLIFALSNSLRSLHLD
        2350      2360      2370       2380      2390      2400    

             1380      1390      1400         1410       1420      
pF1KA0 TSDHTDVHVPVPELNNVISLDYDSVDGKVYYTDVF---LDVIRRADLN-GSNMETVIGRG
         .:.     .    .:.:::::::. ..:.:. .   .  :  : :. : .  :::. :
CCDS22 PENHSPPFQTINVERTVMSLDYDSVSDRIYFTQNLASGVGQISYATLSSGIHTPTVIASG
         2410      2420      2430      2440      2450      2460    

       1430      1440      1450      1460      1470       1480     
pF1KA0 LKTTDGLAVDWVARNLYWTDTGRNTIEASRLDGSCRKVLINNSLDDIAAF-PRKGYLFWT
       . :.::.: ::..: .:..:   . :..   ::: : :.         .. : .:::.:.
CCDS22 IGTADGIAFDWITRRIYYSDYLNQMINSMAEDGSNRTVIARVPKPRAIVLDPCQGYLYWA
         2470      2480      2490      2500      2510      2520    

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pF1KA0 DWGHIAKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNGLTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKL
       ::   ::::::.: :. :  ..:..:  :.::::::.   .::::: :.::: . :.:  
CCDS22 DWDTHAKIERATLGGNFRVPIVNSSLVMPSGLTLDYEEDLLYWVDASLQRIERSTLTGVD
         2530      2540      2550      2560      2570      2580    

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pF1KA0 RQVLVGHVSHPFALTQQDRWIYWTDWQTKSIQRVDKYSGRNKETVLANVEGLMDII--VV
       :.:.:. . : :.::   ..:::::  :. : :..::.: .. .. .:. .    :  ::
CCDS22 REVIVNAAVHAFGLTLYGQYIYWTDLYTQRIYRANKYDGSGQIAMTTNLLSQPRGINTVV
         2590      2600      2610      2620      2630      2640    

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pF1KA0 SPQRQTGTNACGVNNGGCTHLCFARASDFVCACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSE
       . :.:  .: :   ::::.:.:    .   : :: :                        
CCDS22 KNQKQQCNNPCEQFNGGCSHICAPGPNGAECQCPHEGNWYLANNRKHCIVDNGERCGASS
         2650      2660      2670      2680      2690      2700    

          1670      1680      1690      1700      1710      1720   
pF1KA0 KSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEVEGRCSERDARLGLCARSNDAVPAAPGEGLHISY
                                                                   
CCDS22 FTCSNGRCISEEWKCDNDNDCGDGSDEMESVCALHTCSPTAFTCANGRCVQYSYRCDYYN
         2710      2720      2730      2740      2750      2760    

>--
 initn: 575 init1: 372 opt: 888  Z-score: 678.5  bits: 140.2 E(32554): 1.8e-31
Smith-Waterman score: 914; 42.5% identity (61.6% similar) in 294 aa overlap (23-304:1022-1305)

                       10        20        30        40        50  
pF1KA0         MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCD
                                     :   ::   : :  .      :.:  . ::
CCDS22 PNFQRVCGCPYGMRLASNHLTCEGDPTNEPPTEQCGLFSFPCKNG-----RCVPNYYLCD
            1000      1010      1020      1030           1040      

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pF1KA0 GDNDCGDHSDEDGC--ILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCP---P
       : .:: :.:::. :  .  :::   : : .:.::   : ::  ::: : :::..::   :
CCDS22 GVDDCHDNSDEQLCGTLNNTCSSSAFTCGHGECIPAHWRCDKRNDCVDGSDEHNCPTHAP
       1050      1060      1070      1080      1090      1100      

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pF1KA0 RECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQ-CDMRK-CSDKEFRCSDGSCIAEHW
         : . .. :.:  :: . : :: ::::::.:::. :.  . :. ..: : .  ::   .
CCDS22 ASCLDTQYTCDNHQCISKNWVCDTDNDCGDGSDEKNCNSTETCQPSQFNCPNHRCIDLSF
       1110      1120      1130      1140      1150      1160      

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pF1KA0 YCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYG-RCILDIYHCDGDDDCGDWSDESD
        :::: :: ::::: .:     .  :.  .:.:: : .::    .:::  ::.: :::. 
CCDS22 VCDGDKDCVDGSDEVGC-----VLNCTASQFKCASGDKCIGVTNRCDGVFDCSDNSDEAG
       1170      1180           1190      1200      1210      1220 

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pF1KA0 CSSHQP--CRSGEFMC-DSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERN-CTTSMCTAEQFRCHSG
       : .. :  :.: ::.: ..:.::   :.:::  ::   :::.: :. . : .  :.: .:
CCDS22 CPTRPPGMCHSDEFQCQEDGICIPNFWECDGHPDCLYGSDEHNACVPKTCPSSYFHCDNG
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

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pF1KA0 RCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDN
        :.. .: :: ..::.: :::..:                                    
CCDS22 NCIHRAWLCDRDNDCGDMSDEKDCPTQPFRCPSWQWQCLGHNICVNLSVVCDGIFDCPNG
            1290      1300      1310      1320      1330      1340 

>>CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs108|chr2               (4599 aa)
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Smith-Waterman score: 3100; 35.5% identity (68.5% similar) in 1414 aa overlap (279-1636:1106-2491)

      250       260       270       280       290       300        
pF1KA0 RCDGDADCDDQSDERNCTTSMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCEN--
                                     .:::.  .: :::. :: :.:::..:..  
CCDS21 EKDCEDGSDEKGCNGTIRLCDHKTKFSCWSTGRCINKAWVCDGDIDCEDQSDEDDCDSFL
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pF1KA0 TGSPQ--CALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGG
        : :.  :: :     .. :.  .::::: .:: :.:::.    :      ..:..::::
CCDS21 CGPPKHPCAND-----TSVCLQPEKLCNGKKDCPDGSDEGYL--C------DECSLNNGG
        1140           1150      1160      1170              1180  

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pF1KA0 CAQKCQMVRG-AVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETG
       :...:..: : .. :.:  : .:..:..::. :. :...  ::: : . . . .: :  :
CCDS21 CSNHCSVVPGRGIVCSCPEGLQLNKDNKTCEIVDYCSNHLKCSQVCEQHKHTVKCSCYEG
           1190      1200      1210      1220      1230      1240  

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pF1KA0 YELRPDRRSCKALGP-EPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELV
       ..:  : .:: .. : :  ..:. : .::..  :. .:.::. .:.:.::::::  . :.
CCDS21 WKLDVDGESCTSVDPFEAFIIFSIRHEIRRIDLHKRDYSLLVPGLRNTIALDFHFNQSLL
           1250      1260      1270      1280      1290      1300  

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pF1KA0 FWSDVTLDRILRANLNGSN----VEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVA
       .:.::. ::: :..:. :.    .: ::  :: .: ::.:::.  ..:: ::. ..::::
CCDS21 YWTDVVEDRIYRGKLSESGGVSAIEVVVEHGLATPEGLTVDWIAGNIYWIDSNLDQIEVA
           1310      1320      1330      1340      1350      1360  

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pF1KA0 NLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDW-GNTPRIEASSMDGSGRRII-ADTH
       .:::. : .:.   .:.:::::: :  : ..:::: .: ::::..::.:.::. :  : .
CCDS21 KLDGSLRTTLIAGAMEHPRAIALDPRYGILFWTDWDANFPRIESASMSGAGRKTIYKDMK
           1370      1380      1390      1400      1410      1420  

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pF1KA0 L-FWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVIS--QGLPHPFAITVFEDSL
          ::::::.:.  .:. :.::.  .:  :  ::..   .:   . : ::::.... . .
CCDS21 TGAWPNGLTVDHFEKRIVWTDARSDAIYSALYDGTNMIEIIRGHEYLSHPFAVSLYGSEV
           1430      1440      1450      1460      1470      1480  

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pF1KA0 YWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCG--DNNGGCTH
       :::::.:.....:::.::.:  .:..    :.:..  ::.::: . : :.  :..: :.:
CCDS21 YWTDWRTNTLSKANKWTGQNVSVIQKTSAQPFDLQIYHPSRQPQAPNPCAANDGKGPCSH
           1490      1500      1510      1520      1530      1540  

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pF1KA0 LCLPS-GQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLS-DDVIPL
       .:: . ... .::::  ..  :..     . ::::.::: .:: ...:.  ..   .. .
CCDS21 MCLINHNRSAACACPHLMKLSSDKKTCYEMKKFLLYARRSEIRGVDIDNPYFNFITAFTV
           1550      1560      1570      1580      1590      1600  

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pF1KA0 ADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNK
        :. .....:.:. ....::::..:.::.::  .::: :.:.. ...:  :::.:::. .
CCDS21 PDIDDVTVIDFDASEERLYWTDIKTQTIKRAFINGTGLETVISRDIQSIRGLAVDWVSRN
           1610      1620      1630      1640      1650      1660  

     830         840       850       860       870       880       
pF1KA0 LYWTDAGTD--RIEVANTDGSMRTVLIWENLDRPRDIVVEPMGGYMYWTDWGASPKIERA
       ::: ..  :  .:.::  :::..: .: ...:.:. ....:. : .:::: : .  :. :
CCDS21 LYWISSEFDETQINVARLDGSLKTSII-HGIDKPQCLAAHPVRGKLYWTD-GNT--INMA
           1670      1680       1690      1700      1710           

       890       900       910       920       930       940       
pF1KA0 GMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWADAGMKTIEFAGLDGSKRKVL--IGSQL
       .::.:. ..... :   : ::.:::  ..::: ..:  ::.  .:::.. .:.  .  .:
CCDS21 NMDGSNSKILFQ-NQKEPVGLSIDYVENKLYWISSGNGTINRCNLDGGNLEVIESMKEEL
     1720      1730       1740      1750      1760      1770       

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KA0 PHPFGLTLYGERIYWTDWQTKSIQSADRLTGLDRETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTP
        .  .::.. ....:.: .  .. . ..  : .   :...  ... ..:. ..    :. 
CCDS21 TKATALTIMDKKLWWADQNLAQLGTCSKRDGRNPTILRNKTSGVVHMKVYDKEAQQGSNS
      1780      1790      1800      1810      1820      1830       

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KA0 CAMENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLSDGKTCSPGMNSFLIFARRIDIRMVSLD
       : ..:::::.::: . . .  .: : .:  : ..  .:. :..:::... .  :: . :.
CCDS21 CQLNNGGCSQLCLPTSETTR-TCMCTVGYYLQKNRMSCQ-GIESFLMYSVHEGIRGIPLE
      1840      1850       1860      1870       1880      1890     

        1070      1080        1090      1100      1110      1120   
pF1KA0 IPYFADVVVPINITMKNTIAVGVD--PQEGKVYWSDSTLHRISRANLDGSQHEDIITTGL
            :...::. :   ..:::.:   ..  .::.:  ...::::. : . .:::::.::
CCDS21 PSDKMDALMPISGT---SFAVGIDFHAENDTIYWTDMGFNKISRAKRDQTWKEDIITNGL
        1900         1910      1920      1930      1940      1950  

          1130      1140      1150      1160      1170      1180   
pF1KA0 QTTDGLAVDAIGRKVYWTDTGTNRIEVGNLDGSMRKVLVWQNLDSPRAIVLYHEMGFMYW
         ..:.::: :. ..:::: : : :::. :.::.: :.. :.::.::.:... : :...:
CCDS21 GRVEGIAVDWIAGNIYWTDHGFNLIEVARLNGSFRYVIISQGLDQPRSIAVHPEKGLLFW
           1960      1970      1980      1990      2000      2010  

          1190      1200      1210      1220      1230      1240   
pF1KA0 TDWGENAKLERSGMDGSDRAVLINNNLGWPNGLTVDKASSQLLWADAHTERIEAADLN-G
       :.::.   . .. .:::...::.. ...::::...:   ..: : ::.:..::  ::. :
CCDS21 TEWGQMPCIGKARLDGSEKVVLVSMGIAWPNGISIDYEENKLYWCDARTDKIERIDLETG
           2020      2030      2040      2050      2060      2070  

           1250       1260      1270        1280      1290         
pF1KA0 ANRHTLVSPVQ-HPYGLTLLDSYIYWTDWQ--TRSIHRADKGTGSNVILVRSNLP-GLMD
       .::. ..:  .   ...... .::::.:    . :..:. :. ....: .:..:  .: .
CCDS21 GNREMVLSGSNVDMFSVAVFGAYIYWSDRAHANGSVRRGHKNDATETITMRTGLGVNLKE
           2080      2090      2100      2110      2120      2130  

     1300      1310      1320       1330      1340      1350       
pF1KA0 MQAVDRAQPLGFNKCGSRNGGCSHLCLPRP-SGFSCACPTGIQLKGDGKTCDPSPETYLL
       ..  .:..  : : :.  ::::..::: :  :  .:::  :  :  :: ::    : :::
CCDS21 VKIFNRVREKGTNVCARDNGGCKQLCLYRGNSRRTCACAHGY-LAEDGVTCL-RHEGYLL
           2140      2150      2160      2170       2180       2190

      1360      1370      1380            1390           1400      
pF1KA0 FSSRGSIRRISLDTSDHTDVHVPV-PELN-----NVISLDYDSVD-----GKVYYTDVFL
       .:.:  .. : :  ::.:... :. :  :     :::.: .:  .     ....:.:. .
CCDS21 YSGRTILKSIHL--SDETNLNSPIRPYENPRYFKNVIALAFDYNQRRKGTNRIFYSDAHF
             2200        2210      2220      2230      2240        

       1410      1420      1430      1440           1450      1460 
pF1KA0 DVIRRADLNGSNMETVIGRGLKTTDGLAVDWVARNLYWTDTG-----RNTIEASRLDGSC
         :.    :  . .... ... ...:::   .  .::::..      :.:.. .:  .  
CCDS21 GNIQLIKDNWEDRQVIV-ENVGSVEGLAYHRAWDTLYWTSSTTSSITRHTVDQTRPGAFD
     2250      2260       2270      2280      2290      2300       

            1470          1480      1490       1500      1510      
pF1KA0 RKVLINNSLDD---IAAFPR-KGYLFWTDWGHI-AKIERANLDGSERKVLINTDLGWPNG
       :...:. : ::   . :. . .. .:::.:..   .: :..: :.. .:...::.  :::
CCDS21 REAVITMSEDDHPHVLALDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRSTLTGKNAQVVVSTDILTPNG
      2310      2320      2330      2340      2350      2360       

       1520      1530      1540      1550       1560      1570     
pF1KA0 LTLDYDTRRIYWVDAHLDRIESADLNGKLRQVLVGHVSHPF-ALTQQDRWIYWTDWQTKS
       ::.:: ....:. :. : .::  . .:. :.:.:      : .:.  : .:.:.::  ..
CCDS21 LTIDYRAEKLYFSDGSLGKIERCEYDGSQRHVIVKSGPGTFLSLAVYDNYIFWSDWGRRA
      2370      2380      2390      2400      2410      2420       

        1580      1590       1600      1610       1620      1630   
pF1KA0 IQRVDKYSGRNKETVLANVEGL-MDIIVVSPQRQTGT-NACGVNNGGCTHLCFARASDFV
       : : .::.: . . . ...    : ::.:. . ..   . :.. ::::  ::.   .  :
CCDS21 ILRSNKYTGGDTKILRSDIPHQPMGIIAVANDTNSCELSPCALLNGGCHDLCLLTPNGRV
      2430      2440      2450      2460      2470      2480       

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pF1KA0 -CACPDEPDSQPCSLVPGLVPPAPRATGMSEKSPVLPNTPPTTLYSSTTRTRTSLEEVEG
        :.:                                                        
CCDS21 NCSCRGDRILLEDNRCVTKNSSCNAYSEFECGNGECIDYQLTCDGIPHCKDKSDEKLLYC
      2490      2500      2510      2520      2530      2540       

>--
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pF1KA0         MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRSHFTCAVSALGECTCIPAQWQCD
                                     :: .:. ..: : ..      ::   : ::
CCDS21 KCTKNQKCIPVNLRCNGQDDCGDEEDERDCPENSCSPDYFQCKTTK----HCISKLWVCD
            3410      3420      3430      3440          3450       

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pF1KA0 GDNDCGDHSDEDGCILPTCSPLDFHCDNGKCIRRSWVCDGDNDCEDDSDEQDCPPRECEE
        : ::.: ::: .:   ::.: .:.: :..::   : ::..::: :.:::..: :. :  
CCDS21 EDPDCADASDEANCDKKTCGPHEFQCKNNNCIPDHWRCDSQNDCSDNSDEENCKPQTCTL
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pF1KA0 DEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDEQCDMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTD
        .: : :: :. : . :::: ::.:.:::.    .::  .::::.:.::  .: :::  :
CCDS21 KDFLCANGDCVSSRFWCDGDFDCADGSDERNCETSCSKDQFRCSNGQCIPAKWKCDGHED
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pF1KA0 CKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWSDESDCSSHQPCR
       :: : ::..:  :  .: :. .:. ::   ::    .:.:. ::.: ::: :: ..  :.
CCDS21 CKYGEDEKSCEPA--SPTCSSREYICASDGCISASLKCNGEYDCADGSDEMDCVTE--CK
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pF1KA0 SGEFMC-DSGLCINAGWRCDGDADCDDQSDERNCTT--SMCTAEQFRCHSGRCVRLSWRC
         .: : ... ::   : :::  :: : :::.::    ..: :..: :... :    : :
CCDS21 EDQFRCKNKAHCIPIRWLCDGIHDCVDGSDEENCERGGNICRADEFLCNNSLCKLHFWVC
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pF1KA0 DGEDDCADNSDE---------------ENCENT----GSPQ-------------------
       ::::::.:::::               . :.:.     : :                   
CCDS21 DGEDDCGDNSDEAPDMCVKFLCPSTRPHRCRNNRICLQSEQMCNGIDECGDNSDEDHCGG
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pF1KA0 --------CALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENC--NVN
               :  :.: : : .:: .   :. ..::::.:::   :.::    : .:  :::
CCDS21 KLTYKARPCKKDEFACSNKKCIPMDLQCDRLDDCGDGSDE---QGCRIAPTEYTCEDNVN
          3760      3770      3780      3790         3800      3810

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pF1KA0 NGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCE
         :    :.... .: : :. :.. .  .. :.:.:::   : ::. : : ::...: :.
CCDS21 PCGDDAYCNQIKTSVFCRCKPGFQRNMKNRQCEDLNECLVFGTCSHQCINVEGSYKCVCD
             3820      3830      3840      3850      3860      3870

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pF1KA0 TGYELRPDRRSCKALGPEP-VLLFANRIDIRQ-VLP-HRSEYTLLLNNLENA---IALDF
        ... : .  .: : : :  :: .::  ::   . : . :     ....:.     ..: 
CCDS21 QNFQERNN--TCIAEGSEDQVLYIANDTDILGFIYPFNYSGDHQQISHIEHNSRITGMDV
               3880      3890      3900      3910      3920        

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pF1KA0 HHRRELVFWS-DVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGL-----ESPGGLAVDWVHDKLYWTD
       ...:....:: . .   :.   ..: . ... ..::     . :  .:::::  ..::::
CCDS21 YYQRDMIIWSTQFNPGGIFYKRIHGREKRQA-NSGLICPEFKRPRDIAVDWVAGNIYWTD
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pF1KA0 SG------------TS---RIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWG
        .            ::    :.:..:.: .   :: .   .: :::..: .: .:::  :
CCDS21 HSRMHWFSYYTTHWTSLRYSINVGQLNGPNCTRLLTNMAGEPYAIAVNPKRGMMYWTVVG
      3990      4000      4010      4020      4030      4040       

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pF1KA0 NTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKA
       .  .:: ..:::. :::... .:  :.::..:: ..:.::.: .  .:  .  :::.  .
CCDS21 DHSHIEEAAMDGTLRRILVQKNLQRPTGLAVDYFSERIYWADFELSIIGSVLYDGSNSVV
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pF1KA0 VIS--QGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHP
        .:  ::: ::  : .::: .: .    ...  ..::   . : .  ..     .   : 
CCDS21 SVSSKQGLLHPHRIDIFEDYIYGAG-PKNGVFRVQKFGHGSVEYLALNIDKTKGVLISHR
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pF1KA0 QRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCL--PSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRM
        .:    : : :   .:  :::  :::   ::.:: :   :..    .::          
CCDS21 YKQLDLPNPCLD--LACEFLCLLNPSGA--TCVCPEGKYLINGTCNDDSLLDDSCKLTCE
       4170        4180      4190        4200      4210      4220  

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pF1KA0 DIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVV
                                                                   
CCDS21 NGGRCILNEKGDLRCHCWPSYSGERCEVNHCSNYCQNGGTCVPSVLGRPTCSCALGFTGP
           4230      4240      4250      4260      4270      4280  

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pF1KA0               MRRQWGALLLGALLCAHGLASSPECACGRS--HFTCAVSALG----
                                     ::   . :  :: .  .. : ::. .    
CCDS21 KDKSDEKLLYCENRSCRRGFKPCYNRRCIPHGKLCDGENDCGDNSDELDCKVSTCATVEF
       2540      2550      2560      2570      2580      2590      

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pF1KA0 EC---TCIPAQWQCDGDNDCGDHSDEDGCILPTCSPL--------DF-HCDNGK-CIRRS
       .:   :::: . .:. . ::.: ::: .:    :. .         : .:.. . :.  .
CCDS21 RCADGTCIPRSARCNQNIDCADASDEKNCNNTDCTHFYKLGVKTTGFIRCNSTSLCVLPT
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pF1KA0 WVCDGDNDCEDDSDEQDCP---PRECEEDEFPCQNGYCIRSLWHCDGDNDCGDNSDE-QC
       :.:::.::: : :::  ::    ..:::. : : .: :: . : :::..:: :. :: .:
CCDS21 WICDGSNDCGDYSDELKCPVQNKHKCEENYFSCPSGRCILNTWICDGQKDCEDGRDEFHC
       2660      2670      2680      2690      2700      2710      

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pF1KA0 DMRKCSDKEFRCSDGSCIAEHWYCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGR-
       :  .:: ..: ::  .::..:: :::. :: :: :: .  :   :  :  . :.:  .: 
CCDS21 D-SSCSWNQFACSAQKCISKHWICDGEDDCGDGLDESD--SICGAITCAADMFSCQGSRA
        2720      2730      2740      2750        2760      2770   

            210       220          230       240       250         
pF1KA0 CILDIYHCDGDDDCGDWSDE---SDCSSHQPCRSGEFMCDSGLCINAGWRCDGDADCDDQ
       :.   . :::. :: : :::   . :. .. :  . ::: . .::   . :: : :: : 
CCDS21 CVPRHWLCDGERDCPDGSDELSTAGCAPNNTCDENAFMCHNKVCIPKQFVCDHDDDCGDG
          2780      2790      2800      2810      2820      2830   

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pF1KA0 SDER-NCTTSMCTAEQFRCHSGRCV-RLSWRCDGEDDCADNSDEE----NCENTGSPQCA
       :::  .:   .: .:.: : .:::.   .:.:::. :: :.:::     .:. ..  .: 
CCDS21 SDESPQCGYRQCGTEEFSCADGRCLLNTQWQCDGDFDCPDHSDEAPLNPKCK-SAEQSCN
          2840      2850      2860      2870      2880       2890  

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pF1KA0 LDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVR
        . :.: ::::: .  ::.. .::::.:::   .::.    .:  . . .::.: :: . 
CCDS21 SSFFMCKNGRCIPSGGLCDNKDDCGDGSDE---RNCHI---NECLSKKVSGCSQDCQDLP
           2900      2910      2920            2930      2940      

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pF1KA0 GAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDR-RS
        . .: :  :..: .::.:: :..::.    ::: : :. :...: :  :::..::   .
CCDS21 VSYKCKCWPGFQLKDDGKTCVDIDECSSGFPCSQQCINTYGTYKCLCTDGYEIQPDNPNG
       2950      2960      2970      2980      2990      3000      

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pF1KA0 CKALGPE-PVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTL--
       ::.:. : : :..:.. .::..    :.:::: ..:.:.::.:: .:.:...: : .   
CCDS21 CKSLSDEEPFLILADHHEIRKISTDGSNYTLLKQGLNNVIAIDFDYREEFIYWIDSSRPN
       3010      3020      3030      3040      3050      3060      

      490       500       510       520       530       540        
pF1KA0 -DRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVL
        .:: :  ::::... : .:..  :..:::::.  .:::.:.    :::..:.: .  .:
CCDS21 GSRINRMCLNGSDIKVVHNTAV--PNALAVDWIGKNLYWSDTEKRIIEVSKLNGLYPTIL
       3070      3080        3090      3100      3110      3120    

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pF1KA0 LWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYA
       . . :. :: ..: :. : .:: :  . :.:   .:::... .. .:..  : .:::::.
CCDS21 VSKRLKFPRDLSLDPQAGYLYWIDCCEYPHIGRVGMDGTNQSVVIETKISRPMALTIDYV
         3130      3140      3150      3160      3170      3180    

      610       620       630       640       650       660        
pF1KA0 GRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANK
       .::.::.: .:  :: .:.:::::. : .: .:  .:.:.::: .:::: .:::.. :.:
CCDS21 NRRLYWADENH--IEFSNMDGSHRHKVPNQDIPGVIALTLFEDYIYWTDGKTKSLSRAHK
         3190        3200      3210      3220      3230      3240  

      670       680       690        700       710        720      
pF1KA0 FTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQP-AGKNRCGDNNGGCTHLCL-PSGQNYTCACPT
        .: ..  .  . :   ::.. :  ::: ..:. :  :::::.::::   :...::::::
CCDS21 TSGADRLSLIYSWHAITDIQVYHSYRQPDVSKHLCMINNGGCSHLCLLAPGKTHTCACPT
           3250      3260      3270      3280      3290      3300  

        730                 740       750       760       770      
pF1KA0 GFRKISSH-----ACAQS-----LDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAV
       .:   ...      :. :      :: . :  . :      :  :  ::           
CCDS21 NFYLAADNRTCLSNCTASQFRCKTDKCIPFWWKCDTVDDCGDGSDEPDDCPEFRCQPGRF
           3310      3320      3330      3340      3350      3360  

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 ALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYWTDAG
                                                                   
CCDS21 QCGTGLCALPAFICDGENDCGDNSDELNCDTHVCLSGQFKCTKNQKCIPVNLRCNGQDDC
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                                     .:   .: ::.   ::  :: :::. :: :
CCDS21 MSEFLLALLTLSGLLPIARVLTVGADRDQQLCDPGEFLCHDHVTCVSQSWLCDGDPDCPD
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pF1KA0 NSDE--ENCENTGSPQCALDQFLCWN-GRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTG
       .:::  ..: .    .: :... : . ..:.   .::::: :: :. ::. .  :.   .
CCDS21 DSDESLDTCPEEVEIKCPLNHIACLGTNKCVHLSQLCNGVLDCPDGYDEGVH--CQELLS
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pF1KA0 EENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEG
         ::.  :  :  :: :::....: :. :...::::..:.: .:::  : ::: : :..:
CCDS21 --NCQQLN--CQYKCTMVRNSTRCYCEDGFEITEDGRSCKDQDECAVYGTCSQTCRNTHG
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pF1KA0 AFQCWCETGYELRPDRRSCKA-LGPE---PVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENA
       .. : :  :: ..:: ::::: . :    :.::.::   :.    . :... : .   : 
CCDS21 SYTCSCVEGYLMQPDNRSCKAKIEPTDRPPILLIANFETIEVFYLNGSKMATLSSVNGNE
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       : .::: . .... :     :.  :  :  .. .: . : ...   ....   .:.::. 
CCDS21 IHTLDFIYNEDMICWIESRESSNQLKCIQITKAGGLTDEWTINILQSFHNVQQMAIDWLT
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        .::..:   .:: : : .:.   .:.  .:..:.:::. :. : ...::.::. ..:  
CCDS21 RNLYFVDHVGDRIFVCNSNGSVCVTLIDLELHNPKAIAVDPIAGKLFFTDYGNVAKVERC
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pF1KA0 SMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQG--L
       .::: .:  : :..   : .:..: ... .::::     .  .. .:..:..:: ::  .
CCDS21 DMDGMNRTRIIDSKTEQPAALALDLVNKLVYWVDLYLDYVGVVDYQGKNRHTVI-QGRQV
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pF1KA0 PHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKN
        : ..:::::: :: :.  . .:   :.:.: . . .  :..    :.  . . ::. ..
CCDS21 RHLYGITVFEDYLYATNSDNYNIVRINRFNGTDIHSL-IKIENAWGIRIYQKRTQPTVRS
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pF1KA0 RCGDNN-----GGCTHLCLPSG--QNYTCACPTGFRKISS-HACAQSLDKFLLF---ARR
       .  . .     :::.:.:: :.  .. :: : :::   :. ..: .  ....::   .: 
CCDS21 HACEVDPYGMPGGCSHICLLSSSYKTRTCRCRTGFNLGSDGRSCKRPKNELFLFYGKGRP
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pF1KA0 MDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEV
         .: ....:.  .. .::. .. .  :::. .. ...:..:...  :.: : ::: .:.
CCDS21 GIVRGMDLNTKIADEYMIPIENLVNPRALDFHAETNYIYFADTTSFLIGRQKIDGTERET
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       ..  .:..  :.:.::. :.::::. :  . :.::  .  .. : .:.  ....:: :::
CCDS21 ILKDDLDNVEGIAVDWIGNNLYWTNDGHRKTINVARLEKASQSRKTLLEGEMSHPRGIVV
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pF1KA0 EPMGGYMYWTDW------GASPKIERAGMDASGRQVIISSNLTWPNGLAIDYGSQRLYWA
       .:..:.::::::       .  .::.: ::. .::....:.. :::::..:. .. ::: 
CCDS21 DPVNGWMYWTDWEEDEIDDSVGRIEKAWMDGFNRQIFVTSKMLWPNGLTLDFHTNTLYWC
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       :: .  :: . :.:..::..  : .: :::::. .:. ..:::... :: . : .:. . 
CCDS21 DAYYDHIEKVFLNGTHRKIVYSGRELNHPFGLSHHGNYVFWTDYMNGSIFQLDLITS-EV
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pF1KA0 ETLQENLENLMDIHVFHRRRPPVSTPCAMENGGCSHLCLRSPNPSGFSCTCPTGINLLSD
         :...   :. ....  :.   .. : ..::::: :::    :.:  :.:  .  :  .
CCDS21 TLLRHERPPLFGLQIYDPRKQQGDNMCRVNNGGCSTLCL--AIPGGRVCACADNQLLDEN
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       : ::.                                                       
CCDS21 GTTCTFNPGEALPHICKAGEFRCKNRHCIQARWKCDGDDDCLDGSDEDSVNCFNHSCPDD
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CCDS21 LCLAIPGGRVCACADNQLLDENGTTCTFNPGEALPHICKAGEFRCKNRHCIQARWKCDGD
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       .:: : :::.  .:  . : .:.: :::. :: . : ::: ::::.: ::.   :  : :
CCDS21 DDCLDGSDEDSVNCFNHSCPDDQFKCQNNRCIPKRWLCDGANDCGSNEDESNQTCTARTC
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       .  .: :..: :: . : :: . :: : .::  .:      : :. : .: :  :::: .
CCDS21 QVDQFSCGNGRCIPRAWLCDREDDCGDQTDEMASCEF----PTCEPLTQFVCKSGRCISS
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        .:::.:::::: :::  :   . : ...: :.:: :: . : :::: :: : :::   :
CCDS21 KWHCDSDDDCGDGSDEVGCV--HSCFDNQFRCSSGRCIPGHWACDGDNDCGDFSDEAQIN
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       ::       . :....:.:: .: ::   :::::: :: :.:::..:..:        .:
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        ::.                                                        
CCDS21 SCWSTGRCINKAWVCDGDIDCEDQSDEDDCDSFLCGPPKHPCANDTSVCLQPEKLCNGKK
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>>CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19               (682 aa)
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pF1KA0 IAEHWYCDGDTDCKDGSDEENCPSAVPAPPCNLEEFQCAYGRCILDIYHCDGDDDCGDWS
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CCDS56     MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAECQDGS
                   10        20        30        40        50      

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       :::.  : :   :.::.: : . .  ::   :::::..:::. :::..: .. :  ..:.
CCDS56 DESQETCLS-VTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCPVATCRPDEFQ
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       : .: :.. : .:: : :: : ::: .: :.    : . ..: : .:.::   :.:: . 
CCDS56 CSDGNCIHGSRQCDREYDCKDMSDEVGCVNV--TLCEGPNKFKCHSGECITLDKVCNMAR
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pF1KA0 DCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQD
       :: : ::: : ..:    : ..:  :::::.. :. .. . .: :  :..:. . . :.:
CCDS56 DCRDWSDE-PIKEC----GTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQ-RRCED
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pF1KA0 VNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLP
       ..:: .   ::: :.: ::...: :: :..: :  ..:::.:    :.:.:: ..:..  
CCDS56 IDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKAVGSIAYLFFTNRHEVRKMTL
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        ::::: :. ::.:..::: .   . ..:::..   :  ..:.   : :. . :.:  ..
CCDS56 DRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICSTQLDRAHGVSSYDTVISRDIQ
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pF1KA0 SPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWT
       .: ::::::.:...:::::  . . ::.  :..::.:. .:  :::::.. :..: .:::
CCDS56 APDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRENGSKPRAIVVDPVHGFMYWT
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       :::.  .:. ....:     ..  .. ::::.:.:  . :.::::.: : :   ...:..
CCDS56 DWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGRLYWVDSKLHSISSIDVNGGN
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       ::...   . : :::...::::...:::  ...: :::..::.. ... ..:  : :.  
CCDS56 RKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRLTGSDVNLLAENLLSPEDMVL
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pF1KA0 LHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCLPSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARR
       .:   ::                                                     
CCDS56 FHNLTQPREAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPGATPGLTTVEIV
       530       540       550       560       570       580       

>>CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs108|chr19               (692 aa)
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                                     :. .::.:..: ::.  : :::.:.:.: :
CCDS56     MGPWGWKLRWTVALLLAAAGTAVGDRCERNEFQCQDGKCISYKWVCDGSAECQDGS
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pF1KA0 DE--RNCTTSMCTAEQFRCHS--GRCVRLSWRCDGEDDCADNSDEENCENTGSPQC-ALD
       ::  ..: .  : . .: : .  .::.   :::::. :: ..:::..: .     : . .
CCDS56 DESQETCLSVTCKSGDFSCGGRVNRCIPQFWRCDGQVDCDNGSDEQGCLTL----CEGPN
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pF1KA0 QFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEENCNVNNGGCAQKCQMVRGA
       .: : .:.::   :.:: . :: : ::: : ..:    : ..:  :::::.. :. .. .
CCDS56 KFKCHSGECITLDKVCNMARDCRDWSDE-PIKEC----GTNECLDNNGGCSHVCNDLKIG
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pF1KA0 VQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTNSEGAFQCWCETGYELRPDRRSCKA
        .: :  :..:. . . :.:..:: .   ::: :.: ::...: :: :..: :  ..:::
CCDS56 YECLCPDGFQLVAQ-RRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACKA
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pF1KA0 LGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEYTLLLNNLENAIALDFHHRRELVFWSDVTLDRILRA
       .:    :.:.:: ..:..   ::::: :. ::.:..::: .   . ..:::..   :  .
CCDS56 VGSIAYLFFTNRHEVRKMTLDRSEYTSLIPNLRNVVALDTEVASNRIYWSDLSQRMICST
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pF1KA0 NLN---G-SNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSRIEVANLDGAHRKVLLWQ
       .:.   : :. . :.:  ...: ::::::.:...:::::  . . ::.  :..::.:. .
CCDS56 QLDRAHGVSSYDTVISRDIQAPDGLAVDWIHSNIYWTDSVLGTVSVADTKGVKRKTLFRE
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pF1KA0 NLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIADTHLFWPNGLTIDYAGRR
       :  :::::.. :..: .::::::.  .:. ....:     ..  .. ::::.:.:  . :
CCDS56 NGSKPRAIVVDPVHGFMYWTDWGTPAKIKKGGLNGVDIYSLVTENIQWPNGITLDLLSGR
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pF1KA0 MYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVIS--QGLPHPFAITVFEDSLYWTDWHTKSINSANKF
       .::::.: : :   ...:..::...   . : :::...::::...:::  ...: :::..
CCDS56 LYWVDSKLHSISSIDVNGGNRKTILEDEKRLAHPFSLAVFEDKVFWTDIINEAIFSANRL
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pF1KA0 TGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGD---NNGGCTHLCLPSGQ------NY
       ::.. ... ..:  : :.  .:   :: : : :     .:::: .::::. :      ..
CCDS56 TGSDVNLLAENLLSPEDMVLFHNLTQPRGVNWCERTTLSNGGCQYLCLPAPQINPHSPKF
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pF1KA0 TCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADVRSAVALDW
       ::::: :                                                     
CCDS56 TCACPDGMLLARDMRSCLTEAEAAVATQETSTVRLKVSSTAVRTQHTTTRPVPDTSRLPG
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>>CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs108|chr4                 (1166 aa)
 initn: 845 init1: 695 opt: 1063  Z-score: 819.4  bits: 164.3 E(32554): 2.5e-39
Smith-Waterman score: 1068; 34.2% identity (60.6% similar) in 530 aa overlap (269-792:317-827)

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CCDS54 SSFVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKGNCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYA
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pF1KA0 DNSDEENCENTGSPQCALDQFLCWNGRCIGQRKLCNGVNDCGDNSDESPQQNCRPRTGEE
        . :.. ::...  .::.     ::  :    :   :   :          . .      
CCDS54 LSRDRKYCEDVN--ECAF-----WNHGCTLGCKNTPGSYYCTCPVGFVLLPDGKRCHQLV
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pF1KA0 NCNVNNGGCAQKCQMVRGAVQCTCHTGYRLTEDGHTCQDVNECAEEGYCSQGCTN-SEGA
       .:  : . :.. : ..  .  : :  :  : .::.::.  .   ..: ::: :.  :  .
CCDS54 SCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSGCSS-PDNGGCSQLCVPLSPVS
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pF1KA0 FQCWCETGYELRPDRRSCKALGPEPVLLFANRIDIRQVLPHRSEY-TLLLNNLENAIALD
       ..: :  ::.:. :..:: : ::.: :::::  :::..    ..: ::: ...  . :::
CCDS54 WECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDYGTLLSQQMGMVYALD
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pF1KA0 FHHRRELVFWSDVTLDRILRANLNGSNVEEVVSTGLESPGGLAVDWVHDKLYWTDSGTSR
           .. .... ..:  : :::..::. :...  :.. : ::::::.  ..:::: : : 
CCDS54 HDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLAVDWIGRRFYWTDRGKSL
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pF1KA0 IEVANLDGAHRKVLLWQNLEKPRAIALHPMEGTIYWTDWGNTPRIEASSMDGSGRRIIAD
       :  ..:.: . :..  .:. .::.::.:::   ..::: : .::::.::..: :: .::.
CCDS54 IGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINPRIESSSLQGLGRLVIAS
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pF1KA0 THLFWPNGLTIDYAGRRMYWVDAKHHVIERANLDGSHRKAVISQGLPHPFAITVFEDSLY
       . :.::.:.:::.   ..:: :::. ::: ::::::.:. . .. . ::::..:::: ..
CCDS54 SDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQNDVGHPFAVAVFEDYVW
      640       650       660       670       680       690        

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pF1KA0 WTDWHTKSINSANKFTGKNQEIIRNKLHFPMDIHTLHPQRQPAGKNRCGDNNGGCTHLCL
       ..::   :.  .:: :::..  .....  : .. ..::  .: : . :  .:::: :.: 
CCDS54 FSDWAMPSVMRVNKRTGKDRVRLQGSMLKPSSLVVVHPLAKP-GADPCLYQNGGCEHICK
      700       710       720       730       740        750       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 PSGQNYTCACPTGFRKISSHACAQSLDKFLLFARRMDIRRISFDTEDLSDDVIPLADV--
           .  :.:  :: : :.     .::   :.:             ::...: :: :.  
CCDS54 KRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAG---------GEVDLKNQVTPL-DILS
       760       770       780       790                800        

            780       790       800       810       820       830  
pF1KA0 RSAVALDWDSRDDHVYWTDVSTDTISRAKWDGTGQEVVVDTSLESPAGLAIDWVTNKLYW
       .. :. :  ....:.  ...                                        
CCDS54 KTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKGFAGDGKL
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1902 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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