Result of SIM4 for pF1KA0602

seq1 = pF1KA0602.tfa, 2712 bp
seq2 = pF1KA0602/gi568815584f_105214919.tfa (gi568815584f:105214919_105494669), 279751 bp

>pF1KA0602 2712
>gi568815584f:105214919_105494669 (Chr14)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-207  (133575-133662)   100% ->
208-297  (137460-137549)   100% ->
298-423  (140134-140259)   100% ->
424-586  (152295-152457)   100% ->
587-660  (153156-153229)   100% ->
661-741  (153541-153621)   100% ->
742-801  (154923-154982)   100% ->
802-959  (161850-162007)   100% ->
960-1050  (164821-164911)   100% ->
1051-1125  (165162-165236)   100% ->
1126-1268  (166039-166181)   100% ->
1269-1413  (166996-167140)   100% ->
1414-1518  (167559-167663)   100% ->
1519-1625  (167889-167995)   100% ->
1626-1780  (168441-168595)   100% ->
1781-1891  (169435-169545)   100% ->
1892-2000  (169961-170069)   100% ->
2001-2033  (170767-170799)   100% ->
2034-2076  (175043-175085)   100% ->
2077-2119  (176289-176331)   100% ->
2120-2255  (176713-176848)   100% ->
2256-2482  (177701-177927)   100% ->
2483-2596  (178304-178417)   100% ->
2597-2712  (179636-179751)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGCGAGGCCGCCTCGGCCTCCCCGGCGCGCCCGGCGCGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGCGAGGCCGCCTCGGCCTCCCCGGCGCGCCCGGCGCGCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGCCCGTGCCCATGAACCTGTTCGCCACCTGGGAGGTGGACGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACGCCCGTGCCCATGAACCTGTTCGCCACCTGGGAGGTGGACGGCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCAGCTGCGTGCCCAG         GTTGTGCAGCCTGACTCTGAAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCAGCTGCGTGCCCAGGTA...CAGGTTGTGCAGCCTGACTCTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCTGGTGGTCTTCAAGGAGCTGGAGAAGGAGCTGATCTCCGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133597 AAGCTGGTGGTCTTCAAGGAGCTGGAGAAGGAGCTGATCTCCGTGGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCTGTCAAGATGCAG         GGCTCCAAACGAATCCTGCGGTCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 133647 CGCTGTCAAGATGCAGGTG...CAGGGCTCCAAACGAATCCTGCGGTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGAGATTGTGCTGCCCCCCAGTGGACAAGTGGAGACAGACCTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137485 ATGAGATTGTGCTGCCCCCCAGTGGACAAGTGGAGACAGACCTGGCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTTCTCCTTGCAG         TATCCTCACTTCTTGAAGAGGGAAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 137535 ACCTTCTCCTTGCAGGTG...CAGTATCCTCACTTCTTGAAGAGGGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACAAGCTTCAGATCATGCTGCAGCGCAGAAAGCGCTACAAGAACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140160 CAACAAGCTTCAGATCATGCTGCAGCGCAGAAAGCGCTACAAGAACAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCATCCTGGGCTACAAGACGCTGGCCGCGGGCTCCATCAGCATGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140210 CCATCCTGGGCTACAAGACGCTGGCCGCGGGCTCCATCAGCATGGCTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          GTGATGCAACACCCGTCTGAAGGTGGCCAGGTGCTGAGCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140260 GTG...CAGGTGATGCAACACCCGTCTGAAGGTGGCCAGGTGCTGAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGCAGCAGCATCAAGGAGGCCCCCGTCAAGGCGGCCGAGATCTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152336 CTGCAGCAGCATCAAGGAGGCCCCCGTCAAGGCGGCCGAGATCTGGATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTCCCTGTCCAGCCAGCCCATTGACCACGAAGACAGCACCATGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152386 CCTCCCTGTCCAGCCAGCCCATTGACCACGAAGACAGCACCATGCAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGCCCCAAGGCCAAGTCCACGG         ATAACTACTCCGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 152436 GGCCCCAAGGCCAAGTCCACGGGTG...CAGATAACTACTCCGAGGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTATGAGAGCTTCTCCTCCGAGCAGGAGGCCAGTGACGACGCCGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153175 GTATGAGAGCTTCTCCTCCGAGCAGGAGGCCAGTGACGACGCCGTGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGCAG         GACTTGGACGAGGACGACTTTGACGTGGGGAAGCCG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153225 GGCAGGTG...CAGGACTTGGACGAGGACGACTTTGACGTGGGGAAGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGAAGCAGCGGAGATCGATTGTAAGAACGACGTCCATGACCAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 153577 AAGAAGCAGCGGAGATCGATTGTAAGAACGACGTCCATGACCAGGGTT..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742     CAACAGAACTTCAAGCAGAAAGTGGTAGCGCTGCTGCGGAGGTTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153627 .CAGCAACAGAACTTCAAGCAGAAAGTGGTAGCGCTGCTGCGGAGGTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAGTGTCCGACGAG         GTCCTGGACTCGGAGCAGGACCCTGCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 154969 AAGTGTCCGACGAGGTG...CAGGTCCTGGACTCGGAGCAGGACCCTGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GAGCACATCCCCGAGGCAGAGGAGGACCTGGACCTCCTGTATGACACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161877 GAGCACATCCCCGAGGCAGAGGAGGACCTGGACCTCCTGTATGACACCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGACATGGAGCACCCCAGCGACAGCGGCCCCGACATGGAGGATGACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161927 GGACATGGAGCACCCCAGCGACAGCGGCCCCGACATGGAGGATGACGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCGTCCTCAGCACCCCCAAGCCGAAGCTGCG         GCCATACTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 161977 GCGTCCTCAGCACCCCCAAGCCGAAGCTGCGGTG...CAGGCCATACTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAAGGCCTGTCGCACTCGAGCTCGCAGACGGAGATTGGGAGCATCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164831 GAAGGCCTGTCGCACTCGAGCTCGCAGACGGAGATTGGGAGCATCCACAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CGCCCGCAGCCACAAGGAGCCCCCAAGCCCG         GCTGACGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 164881 CGCCCGCAGCCACAAGGAGCCCCCAAGCCCGGTG...CAGGCTGACGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CCGAGAAGACGCGGTCCCTGGGAGGCAGGCAGCCGAGCGACAGTGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165172 CCGAGAAGACGCGGTCCCTGGGAGGCAGGCAGCCGAGCGACAGTGTCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GACACGGTGGCCCTC         GGTGTGCCAGGCCCGAGGGAGCACCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 165222 GACACGGTGGCCCTCGTA...CAGGGTGTGCCAGGCCCGAGGGAGCACCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGGACAGCCTGAGGACAGCCCCGAGGCTGAGGCCTCCACCCTGGATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166065 TGGACAGCCTGAGGACAGCCCCGAGGCTGAGGCCTCCACCCTGGATGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TCACGGAGAGGCTGCCGCCCAGCGGGAGGATCACCAAGACAGAGTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166115 TCACGGAGAGGCTGCCGCCCAGCGGGAGGATCACCAAGACAGAGTCCCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GTCATCCCCTCCACCAG         GTCCGAGGGGAAGCAGGCTGGCCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 166165 GTCATCCCCTCCACCAGGTG...TAGGTCCGAGGGGAAGCAGGCTGGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ACGGGGCCGGAGCACATCCTTGAAGGAGCGGCAGGCAGCACGGCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167020 ACGGGGCCGGAGCACATCCTTGAAGGAGCGGCAGGCAGCACGGCCCCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ATGAGCGGGCCAACAGCCTGGACAACGAGCGCTGCCCGGACGCCCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167070 ATGAGCGGGCCAACAGCCTGGACAACGAGCGCTGCCCGGACGCCCGGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CAGCTACAGGTGCAGCTGCAG         ATCCCCAGGAAGACTGTGTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 167120 CAGCTACAGGTGCAGCTGCAGGTG...CAGATCCCCAGGAAGACTGTGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGACCAGCTCAACCACATCCTCATCTCCGATGACCAGCTTCCCGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167579 TGACCAGCTCAACCACATCCTCATCTCCGATGACCAGCTTCCCGAAAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCATCCTTGTCAACACCTCGGACTGGCAGGGGCAG         TTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 167629 TCATCCTTGTCAACACCTCGGACTGGCAGGGGCAGGTA...CAGTTCCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TCCGACGTCCTGCAGAGGCACACGCTCCCCGTGGTGTGCACGTGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167895 TCCGACGTCCTGCAGAGGCACACGCTCCCCGTGGTGTGCACGTGCTCTCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGCGGACGTCCAGGCGGCCTTCAGCACCATCGTCTCACGGATACAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167945 TGCGGACGTCCAGGCGGCCTTCAGCACCATCGTCTCACGGATACAGAGAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 A         CTGCAACTGCAATTCCCAGCCCCCGACCCCCGTGAAGATC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167995 AGTG...CAGCTGCAACTGCAATTCCCAGCCCCCGACCCCCGTGAAGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GCCGTGGCGGGAGCGCAGCATTACCTCAGTGCCATCCTGCGGCTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168481 GCCGTGGCGGGAGCGCAGCATTACCTCAGTGCCATCCTGCGGCTCTTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GGAGCAGCTGTCCCACAAGACACCCGACTGGCTCGGCTACATGCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168531 GGAGCAGCTGTCCCACAAGACACCCGACTGGCTCGGCTACATGCGCTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TGGTCATCCCACTGG         GCTCCCACCCCGTGGCCAGGTACCTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 168581 TGGTCATCCCACTGGGTG...CAGGCTCCCACCCCGTGGCCAGGTACCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GGCTCCGTGGACTACCGCTACAACAACTTCTTCCAGGACCTGGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169461 GGCTCCGTGGACTACCGCTACAACAACTTCTTCCAGGACCTGGCCTGGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 AGACCTGTTCAACAAGCTGGAGGCCCAGAGTGCGG         TACAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 169511 AGACCTGTTCAACAAGCTGGAGGCCCAGAGTGCGGGTG...CAGTACAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ACACGCCAGACATTGTGTCACGCATCACGCAGTACATCGCAGGGGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169967 ACACGCCAGACATTGTGTCACGCATCACGCAGTACATCGCAGGGGCCAAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 TGTGCCCACCAGCTCCCCATCGCAGAGGCCATGCTGACCTACAAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170017 TGTGCCCACCAGCTCCCCATCGCAGAGGCCATGCTGACCTACAAGCAGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 GAG         GAAAAAGCATTTTCATTTTGACTTTACCCTAAG     
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 170067 GAGGTA...AAGGAAAAAGCATTTTCATTTTGACTTTACCCTAAGGTA..

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034     CCCTGACGAAGAGTCCTCCCAAAAGTTCATTCCCTTTGTCGGG   
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 170805 .TAGCCCTGACGAAGAGTCCTCCCAAAAGTTCATTCCCTTTGTCGGGGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2077       GTTGTGAAGGTTGGAATTGTGGAGCCATCCTCGGCCACATCAG 
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 175089 ...TAGGTTGTGAAGGTTGGAATTGTGGAGCCATCCTCGGCCACATCAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120         GCGACTCGGACGACGCGGCCCCCTCGGGCTCTGGCACGCTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176333 TA...AAGGCGACTCGGACGACGCGGCCCCCTCGGGCTCTGGCACGCTCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 CCTCCACCCCGCCGTCCGCATCTCCTGCGGCCAAGGAGGCCTCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176755 CCTCCACCCCGCCGTCCGCATCTCCTGCGGCCAAGGAGGCCTCACCCACC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 CCGCCCTCCTCCCCGTCGGTGAGCGGAGGCCTGTCCTCCCCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 176805 CCGCCCTCCTCCCCGTCGGTGAGCGGAGGCCTGTCCTCCCCCAGGTA...

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256    CCAGGGTGTCGGCGCCGAGCTGATGGGGCTGCAGGTGGACTACTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177698 CAGCCAGGGTGTCGGCGCCGAGCTGATGGGGCTGCAGGTGGACTACTGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 CGGCAGCACAGCCTGCGGACAGGAAGAGGGACGCCGAGAAGAAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177748 CGGCAGCACAGCCTGCGGACAGGAAGAGGGACGCCGAGAAGAAGGACCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 CCTGTCACCAAAAACACGCTCAAGTGCACTTTCCGGTCCCTCCAGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177798 CCTGTCACCAAAAACACGCTCAAGTGCACTTTCCGGTCCCTCCAGGTCAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 CAGGCTGCCCAGCAGCGGCGAGGCTGCAGCCACGCCCACCATGTCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177848 CAGGCTGCCCAGCAGCGGCGAGGCTGCAGCCACGCCCACCATGTCCATGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 CCGTGGTCACCAAGGAGAAGAACAAGAAGG         TGATGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 177898 CCGTGGTCACCAAGGAGAAGAACAAGAAGGGTG...CAGTGATGTTTCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2494 CCCAAGAAAGCGAAGGACAAGGACGTGGAGTCTAAGAGCCAGTGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178315 CCCAAGAAAGCGAAGGACAAGGACGTGGAGTCTAAGAGCCAGTGCATTGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 GGGCATCAGCCGGCTCATCTGCACTGCCAGGCAGCAGCAGAACATGCTGC
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 178365 GGGCATCAGCCGGCTCATCTGCACTGCCAGGCAGCAGCAGAACATGCTGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 GGG         TCCTCATCGACGGCGTGGAGTGCAGCGACGTCAAGTTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178415 GGGGTG...CAGTCCTCATCGACGGCGTGGAGTGCAGCGACGTCAAGTTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2635 TTCCAGCTGGCCGCGCAGTGGTCCTCGCACGTGAAGCACTTCCCCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179674 TTCCAGCTGGCCGCGCAGTGGTCCTCGCACGTGAAGCACTTCCCCATCTG

   2900     .    :    .    :    .
   2685 CATCTTCGGACACTCCAAGGCCACCTTC
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 179724 CATCTTCGGACACTCCAAGGCCACCTTC

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