Result of FASTA (ccds) for pF1KA0476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0476, 1496 aa
  1>>>pF1KA0476 1496 - 1496 aa - 1496 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8964+/-0.000941; mu= 3.3498+/- 0.057
 mean_var=259.3940+/-51.926, 0's: 0 Z-trim(114.4): 67  B-trim: 3 in 1/52
 Lambda= 0.079633
 statistics sampled from 14904 (14962) to 14904 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.46), width:  16
 Scan time:  6.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44228.1 DENND4B gene_id:9909|Hs108|chr1        (1496) 10250 1191.9       0
CCDS45285.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15      (1863) 3530 420.0 3.4e-116
CCDS53949.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15      (1906) 3530 420.0 3.5e-116
CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9        (1909) 2476 298.9 9.9e-80
CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9       (1958) 2470 298.2 1.6e-79


>>CCDS44228.1 DENND4B gene_id:9909|Hs108|chr1             (1496 aa)
 initn: 10250 init1: 10250 opt: 10250  Z-score: 6373.3  bits: 1191.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10250; 100.0% identity (100.0% similar) in 1496 aa overlap (1-1496:1-1496)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDVD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 NLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPEQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 EKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFESLQEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFESLQEQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 PGALPVPGPSRSAPSSPAPRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYGLWFLCLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGALPVPGPSRSAPSSPAPRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYGLWFLCLP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 AYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSVRVMLEMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSVRVMLEMR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 QAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 QQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPASPPGRLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPASPPGRLVK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 SGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 SGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 LPPDLPPPARRSPMDSLLHPRERPGSTASESSASLGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPPDLPPPARRSPMDSLLHPRERPGSTASESSASLGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 TPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 QTLDSRPSVPSPKSAGASGSKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMGGASRRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTLDSRPSVPSPKSAGASGSKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMGGASRRVE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 SGAWAYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGAWAYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 VLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWRVHSQIPQRVVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWRVHSQIPQRVVW
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 PGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KA0 LGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAIDCRKCFGAPPEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAIDCRKCFGAPPEC
             1450      1460      1470      1480      1490      

>>CCDS45285.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15           (1863 aa)
 initn: 2484 init1: 1137 opt: 3530  Z-score: 2199.5  bits: 420.0 E(32554): 3.4e-116
Smith-Waterman score: 3530; 57.0% identity (80.1% similar) in 906 aa overlap (1-899:1-896)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
       : :.. ::..::::::::.  . :. ::    .    .   .: ::::::.:: ..::::
CCDS45 MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKV--AKPKEPITDVSVIIKSLGEE
               10        20        30          40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
       ::: : ::...  :   .:. : : : :  .:::::::::::..:::::. ::: : : .
CCDS45 VPQDYICIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCE
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
       ....:::.. ::..    .. : :.:::::.:.   ..:..::.:...:::::. :::.:
CCDS45 IIQSTPYGRPANISGSTSSQ-RIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFC
      120       130        140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
       .. .::: .::: ::::::: ..::.::. :.: :. :::.:: :.: ::::::.:::::
CCDS45 KVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPM
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
       ::::::::...:::.:::::::::::...::::::.:::: . .  :.:.:   ::: ::
CCDS45 GATIECWPSNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEENLTEKQRLLLGLTSA
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
          :.. ....... . : .::.:: : ::: :::::::::.:::: ::.: :::::.:.
CCDS45 --DGKSDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHK
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
       ::::::::::::::.::.:::.: :::::::::::..:  :::.:::: :.:::. ..::
CCDS45 VPFPSPQRPRILVQLSPHDNLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTE
         360       370       380       390       400       410     

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
       ::.:.:::::..:::: :::::::::.:: :::.:::::.:::::::: :::::: : ::
CCDS45 HKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYF
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
       ::.::: :: :::.::::. :  .:: .. . ::..: : :. ::.::.::: .    :.
CCDS45 DLYDPPPDVSCVDVDTNTISQIGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPR
         480       490       500       510       520       530     

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pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARL-EREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDV
       ... ... ..::.   :.: .. . :.: ::: ::: .::::: .:::.:::::: : :.
CCDS45 DDGLMDLAINDYDFNSGKRLHMIDLEIQEAFLFFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDA
         540       550       560       570       580       590     

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pF1KA0 DNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPE
        .:: ::.::.::.:: .:.:... .:::: .::::::: : . :.: :::.::.::  .
CCDS45 ASLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKV--D
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pF1KA0 QEKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFES---
       ..:   . :.::.:   :: :::.:::: : ::.: :   :: :.::: :: .:::    
CCDS45 MDKSGEVRLIELDESFKSEHTVFVTPPEIPHLPNGEEPPLQYSYNGFPVLRNNLFERPEG
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pF1KA0 -LQEQPGALPVPGPSRSAPSSPAP--RRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYG
        :: . . ::    . :.:.:: :  ::::::.: :...:.. ...:..:.:::: ::::
CCDS45 FLQAKKNKLP---SKSSSPNSPLPMFRRTKQEIKSAHKIAKRYSSIPQMWSRCLLRHCYG
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pF1KA0 LWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSV
       :::.::::::.   :.:.::.::: ::..:.: :.  :::::::.:::::..: ::::.:
CCDS45 LWFICLPAYVKVCHSKVRALKTAYDVLKKMQSKKMDPPDEVCYRILMQLCGQYDQPVLAV
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pF1KA0 RVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRE
       ::..::..::: ::.::::::::::::: ::: . .: . :.:.::::::..::.. :..
CCDS45 RVLFEMQKAGIDPNAITYGYYNKAVLESTWPSRSRSGYFLWTKVRNVVLGVTQFKRALKK
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pF1KA0 RQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPAS
       . . .:                                                      
CCDS45 HAHLSQTTLSGGQSDLGYNSLSKDEVRRGDTSTEDIQEEKDKKGSDCSSLSESESTKGSA
              900       910       920       930       940       950

>--
 initn: 925 init1: 410 opt: 614  Z-score: 388.9  bits: 85.0 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 816; 28.8% identity (54.0% similar) in 698 aa overlap (896-1493:1178-1861)

         870       880       890       900       910       920     
pF1KA0 GTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAE
                                     .:::..............:. .   .   :
CCDS45 RMNSSFSVKPFEKTDVATGFDPLSLLVAETEQQQKEEEEEDEDDSKSISTPSARRDLAEE
      1150      1160      1170      1180      1190      1200       

         930       940         950          960       970       980
pF1KA0 PYLERPSPTRPLQRQTTWAG--RSLRDP---ASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAH
         .   . . ::  .:      :.  :     :::  :::.      :.. :      ..
CCDS45 IVMYMNNMSSPLTSRTPSIDLQRACDDKLNKKSPP--LVKA----CRRSSLPPNSPKPVR
      1210      1220      1230      1240            1250      1260 

              990        1000      1010      1020      1030        
pF1KA0 MIEALGVLEPRGSPVP--WHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSG
       . .. .  . . .:    : . ..:      ::     . .. .  :..  .  :. : .
CCDS45 LTKSKSYTKSEEKPRDRLWSSPAFSPTCPFREESQDTLTHSSPSFNLDTLLVPKLDVLRN
            1270      1280      1290      1300      1310      1320 

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pF1KA0 RGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPELPPDLPPPARRSPMDSLL
           ::    : ..      .:. .  : :. . ..:     .  .    .  .  : . 
CCDS45 SMFTAGKGVAEKASKWY---SRFTMYTTSSKDQSSDRTSLSSVGAQDSESTSLTDED-VC
            1330         1340      1350      1360      1370        

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pF1KA0 HPRERPGSTASESSASLGSEW-DLS----------ESSLSNLSLRRSSERLSDTPGS---
       :  : : :. .:.::. :..  :::          :.:::...:  .::  :.  .:   
CCDS45 HELEGPISS-QETSATSGTKRIDLSRISLESSASLEGSLSKFALPGKSEVTSSFNASNTN
      1380       1390      1400      1410      1420      1430      

          1150      1160      1170      1180      1190      1200   
pF1KA0 -FQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTL
        ::. ..:.:.:::: ::.:: ::.::::::::. ::::::::::::.  :.:.:...  
CCDS45 IFQNYAMEVLISSCSRCRTCDCLVHDEEIMAGWTADDSNLNTTCPFCGNIFLPFLNIEIR
       1440      1450      1460      1470      1480      1490      

                 1210                                              
pF1KA0 D-SRP------SVPSPK-----------------SAGASG--------------------
       :  ::      : :: .                 :..:::                    
CCDS45 DLRRPGRYFLKSSPSTENMHFPSSISSQTRQSCISTSASGLDTSALSVQGNFDLNSKSKL
       1500      1510      1520      1530      1540      1550      

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pF1KA0 -----SKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMG----GASRRVESGA-------
            ...  .:.. . .  ..   . . .    .: .     : .. . .:.       
CCDS45 QENFCTRSIQIPANRSKTAMSKCPIFPMARSISTSGPLDKEDTGRQKLISTGSLPATLQG
       1560      1570      1580      1590      1600      1610      

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pF1KA0 --------W----------AYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLL
               :           ::::::. ::::::.::::...... .. . :::.::::.
CCDS45 ATDSLGLEWHLPSPDPVTVPYLSPLVVWKELESLLENEGDHAITVADFVDHHPIVFWNLV
       1620      1630      1640      1650      1660      1670      

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pF1KA0 WYFQRLRLPSILPGLVLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLY
       :::.:: ::: ::::.:.:    ..:. :   .. :   : ...::: .    .   :::
CCDS45 WYFRRLDLPSNLPGLILSSEHCNKYSKIPRHCMSEDSKYVLIQMLWDNMKLHQDPGQPLY
       1680      1690      1700      1710      1720      1730      

        1370      1380      1390      1400      1410      1420     
pF1KA0 VLWRVHSQIPQRVVWPGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHL
       .:: .:.:    :        :..  ::.:... . .:.:.  .. .::::.  :  .. 
CCDS45 ILWNAHTQKYPMVHLLQKSDNSFNQELLKSMVKSIKMNDVYGPMSQILETLNKCPH-FKR
       1740      1750      1760      1770      1780      1790      

        1430      1440      1450      1460      1470      1480     
pF1KA0 QRGIYREILFLTMAALGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID
       ::..:::::::...:::....:: ::::.:: :...:. :. :    :   . :.  ...
CCDS45 QRSLYREILFLSLVALGRENIDIDAFDKEYKMAYDRLTPSQVKS--THNCDRPPSTGVME
        1800      1810      1820      1830        1840      1850   

        1490      
pF1KA0 CRKCFGAPPEC
       ::: :: :   
CCDS45 CRKTFGEPYL 
          1860    

>>CCDS53949.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15           (1906 aa)
 initn: 2484 init1: 1137 opt: 3530  Z-score: 2199.3  bits: 420.0 E(32554): 3.5e-116
Smith-Waterman score: 3530; 57.0% identity (80.1% similar) in 906 aa overlap (1-899:1-896)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
       : :.. ::..::::::::.  . :. ::    .    .   .: ::::::.:: ..::::
CCDS53 MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKV--AKPKEPITDVSVIIKSLGEE
               10        20        30          40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
       ::: : ::...  :   .:. : : : :  .:::::::::::..:::::. ::: : : .
CCDS53 VPQDYICIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCE
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
       ....:::.. ::..    .. : :.:::::.:.   ..:..::.:...:::::. :::.:
CCDS53 IIQSTPYGRPANISGSTSSQ-RIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFC
      120       130        140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
       .. .::: .::: ::::::: ..::.::. :.: :. :::.:: :.: ::::::.:::::
CCDS53 KVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPM
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
       ::::::::...:::.:::::::::::...::::::.:::: . .  :.:.:   ::: ::
CCDS53 GATIECWPSNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEENLTEKQRLLLGLTSA
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
          :.. ....... . : .::.:: : ::: :::::::::.:::: ::.: :::::.:.
CCDS53 --DGKSDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHK
         300       310       320       330       340       350     

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
       ::::::::::::::.::.:::.: :::::::::::..:  :::.:::: :.:::. ..::
CCDS53 VPFPSPQRPRILVQLSPHDNLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTE
         360       370       380       390       400       410     

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
       ::.:.:::::..:::: :::::::::.:: :::.:::::.:::::::: :::::: : ::
CCDS53 HKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYF
         420       430       440       450       460       470     

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
       ::.::: :: :::.::::. :  .:: .. . ::..: : :. ::.::.::: .    :.
CCDS53 DLYDPPPDVSCVDVDTNTISQIGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPR
         480       490       500       510       520       530     

              550       560        570       580       590         
pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARL-EREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDV
       ... ... ..::.   :.: .. . :.: ::: ::: .::::: .:::.:::::: : :.
CCDS53 DDGLMDLAINDYDFNSGKRLHMIDLEIQEAFLFFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDA
         540       550       560       570       580       590     

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pF1KA0 DNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPE
        .:: ::.::.::.:: .:.:... .:::: .::::::: : . :.: :::.::.::  .
CCDS53 ASLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKV--D
         600       610       620       630       640       650     

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pF1KA0 QEKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFES---
       ..:   . :.::.:   :: :::.:::: : ::.: :   :: :.::: :: .:::    
CCDS53 MDKSGEVRLIELDESFKSEHTVFVTPPEIPHLPNGEEPPLQYSYNGFPVLRNNLFERPEG
           660       670       680       690       700       710   

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pF1KA0 -LQEQPGALPVPGPSRSAPSSPAP--RRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYG
        :: . . ::    . :.:.:: :  ::::::.: :...:.. ...:..:.:::: ::::
CCDS53 FLQAKKNKLP---SKSSSPNSPLPMFRRTKQEIKSAHKIAKRYSSIPQMWSRCLLRHCYG
           720          730       740       750       760       770

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pF1KA0 LWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSV
       :::.::::::.   :.:.::.::: ::..:.: :.  :::::::.:::::..: ::::.:
CCDS53 LWFICLPAYVKVCHSKVRALKTAYDVLKKMQSKKMDPPDEVCYRILMQLCGQYDQPVLAV
              780       790       800       810       820       830

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pF1KA0 RVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRE
       ::..::..::: ::.::::::::::::: ::: . .: . :.:.::::::..::.. :..
CCDS53 RVLFEMQKAGIDPNAITYGYYNKAVLESTWPSRSRSGYFLWTKVRNVVLGVTQFKRALKK
              840       850       860       870       880       890

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pF1KA0 RQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPAS
       . . .:                                                      
CCDS53 HAHLSQTTLSDGSDLDAVSHGSMDSGHGTHTVEQAPFNTGLIKVYATDDRSSTGGQSDLG
              900       910       920       930       940       950

>--
 initn: 925 init1: 410 opt: 614  Z-score: 388.8  bits: 85.0 E(32554): 2.5e-15
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pF1KA0 GTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAE
                                     .:::..............:. .   .   :
CCDS53 RMNSSFSVKPFEKTDVATGFDPLSLLVAETEQQQKEEEEEDEDDSKSISTPSARRDLAEE
             1200      1210      1220      1230      1240      1250

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pF1KA0 PYLERPSPTRPLQRQTTWAG--RSLRDP---ASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAH
         .   . . ::  .:      :.  :     :::  :::.      :.. :      ..
CCDS53 IVMYMNNMSSPLTSRTPSIDLQRACDDKLNKKSPP--LVKA----CRRSSLPPNSPKPVR
             1260      1270      1280            1290      1300    

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pF1KA0 MIEALGVLEPRGSPVP--WHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSG
       . .. .  . . .:    : . ..:      ::     . .. .  :..  .  :. : .
CCDS53 LTKSKSYTKSEEKPRDRLWSSPAFSPTCPFREESQDTLTHSSPSFNLDTLLVPKLDVLRN
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pF1KA0 RGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPELPPDLPPPARRSPMDSLL
           ::    : ..      .:. .  : :. . ..:     .  .    .  .  : . 
CCDS53 SMFTAGKGVAEKASKWY---SRFTMYTTSSKDQSSDRTSLSSVGAQDSESTSLTDED-VC
         1370      1380         1390      1400      1410       1420

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pF1KA0 HPRERPGSTASESSASLGSEW-DLS----------ESSLSNLSLRRSSERLSDTPGS---
       :  : : :. .:.::. :..  :::          :.:::...:  .::  :.  .:   
CCDS53 HELEGPISS-QETSATSGTKRIDLSRISLESSASLEGSLSKFALPGKSEVTSSFNASNTN
              1430      1440      1450      1460      1470         

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pF1KA0 -FQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTL
        ::. ..:.:.:::: ::.:: ::.::::::::. ::::::::::::.  :.:.:...  
CCDS53 IFQNYAMEVLISSCSRCRTCDCLVHDEEIMAGWTADDSNLNTTCPFCGNIFLPFLNIEIR
    1480      1490      1500      1510      1520      1530         

                 1210                                              
pF1KA0 D-SRP------SVPSPK-----------------SAGASG--------------------
       :  ::      : :: .                 :..:::                    
CCDS53 DLRRPGRYFLKSSPSTENMHFPSSISSQTRQSCISTSASGLDTSALSVQGNFDLNSKSKL
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pF1KA0 -----SKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMG----GASRRVESGA-------
            ...  .:.. . .  ..   . . .    .: .     : .. . .:.       
CCDS53 QENFCTRSIQIPANRSKTAMSKCPIFPMARSISTSGPLDKEDTGRQKLISTGSLPATLQG
    1600      1610      1620      1630      1640      1650         

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pF1KA0 --------W----------AYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLL
               :           ::::::. ::::::.::::...... .. . :::.::::.
CCDS53 ATDSLGLEWHLPSPDPVTVPYLSPLVVWKELESLLENEGDHAITVADFVDHHPIVFWNLV
    1660      1670      1680      1690      1700      1710         

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pF1KA0 WYFQRLRLPSILPGLVLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLY
       :::.:: ::: ::::.:.:    ..:. :   .. :   : ...::: .    .   :::
CCDS53 WYFRRLDLPSNLPGLILSSEHCNKYSKIPRHCMSEDSKYVLIQMLWDNMKLHQDPGQPLY
    1720      1730      1740      1750      1760      1770         

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pF1KA0 VLWRVHSQIPQRVVWPGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHL
       .:: .:.:    :        :..  ::.:... . .:.:.  .. .::::.  :  .. 
CCDS53 ILWNAHTQKYPMVHLLQKSDNSFNQELLKSMVKSIKMNDVYGPMSQILETLNKCPH-FKR
    1780      1790      1800      1810      1820      1830         

        1430      1440      1450      1460      1470      1480     
pF1KA0 QRGIYREILFLTMAALGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID
       ::..:::::::...:::....:: ::::.:: :...:. :. :    :   . :.  ...
CCDS53 QRSLYREILFLSLVALGRENIDIDAFDKEYKMAYDRLTPSQVKS--THNCDRPPSTGVME
     1840      1850      1860      1870      1880        1890      

        1490      
pF1KA0 CRKCFGAPPEC
       ::: :: :   
CCDS53 CRKTFGEPYL 
       1900       

>>CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9             (1909 aa)
 initn: 3253 init1: 1029 opt: 2476  Z-score: 1544.9  bits: 298.9 E(32554): 9.9e-80
Smith-Waterman score: 3209; 48.4% identity (73.3% similar) in 1029 aa overlap (1-1013:1-1015)

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pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
       : :.. ::..::::::::. ... . .:          .   :  ::::.:.: .. :: 
CCDS64 MIEDKGPRVTDYFVVAGLTDTSTLLDQEI----NRLDTKSTGPKAPITDIAIIIKSAGET
               10        20            30        40        50      

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pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
       ::.::::..:. ..   .:. : : . .  .::.::::::::...:::::::::  :: .
CCDS64 VPEGYTCVEATPSALQANLNYGSLKSPELFLCYKRGRDKPPLTDIGVLYEGKERLIPGCE
         60        70        80        90       100       110      

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pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
       :. .:::.. ::.   .    : ..:::::      ..:..::.:... ::::  :::.:
CCDS64 VILATPYGRCANVNNSSTTSQRIFITYRRAPPVRPQNSLAVTDICVIVTSKGETPPHTFC
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPES-VPVFCLP
       .. .::: :::: .:.:::: ..  .:...:.: :. :::::: :.::: :: ::.::::
CCDS64 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
        180       190       200       210       220       230      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 MGATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLS
       ::::::::  .::::.::::::::::... ::::::.:::: . :  :::.:   ::::.
CCDS64 MGATIECWDPETKYPLPVFSTFVLTGSSAKKVYGAAIQFYEPYSRELLSEKQLMHLGLLT
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 AVERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIH
        ::  : . .... . . : .::.:: : ::: :: :.:. :::::: ::.: :::::..
CCDS64 PVE--RKMVSKSINTNKCICLLSHWPFFEAFRKFLMFIYKLSVSGPHPLPIEKHISHFMQ
          300       310       320       330       340       350    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 NVPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLT
       :.:::::::::::::.: .: :.: ::::.:::::::.:  ::..::::   :::: :: 
CCDS64 NIPFPSPQRPRILVQLSVHDALILSQPVSTPLPLSGANFSTLLMNLGPENCATLLLFVLL
          360       370       380       390       400       410    

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pF1KA0 EHKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSY
       : :.:.::::: .::.: ::.:.::::..::::::::::: :: :::::.:::::. : :
CCDS64 ESKILLHSLRPAVLTGVAEAVVAMIFPFQWQCPYIPLCPLSLAAVLSAPLPFIVGVDSRY
          420       430       440       450       460       470    

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pF1KA0 FDLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGP
       ::::::: ::.:.::::: :. ..::: .. . ::..: : ::.:: .:: ::....   
CCDS64 FDLHDPPQDVVCIDLDTNMLYVSDEKKNMNWKQLPKKPCKNLLSTLKKLYPQLSSVHQKT
          480       490       500       510       520       530    

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pF1KA0 EEEASLEFLLTDYEAVCG---RRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGA
       .: ....  .:  ::  .   . ..:: :.: ::::::: .:::::..:::.:.:::. :
CCDS64 QEGSAID--MTPIEADFSWQKKMTQLEMEIQEAFLRFMASILKGYRTYLRPITEAPSNKA
          540         550       560       570       580       590  

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pF1KA0 RDVDNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKV
         .:.::  :::::::.:.  :.:. : .::.: .::::::: : . ..: :::.:.::.
CCDS64 TAADSLFDRQGFLKSRDRAYAKFYTLLSKTQIFIRFIEECSFVSDKDTGLAFFDDCIEKL
            600       610       620       630       640       650  

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        :..  ::         : : :.::.. . :: :::: ::: :   .:.. .:.: :  :
CCDS64 FPDKGTEKTDKVDFDSAEDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPP-DDGKDLSPKYSYKYF
            660       670       680       690        700       710 

        710       720       730         740       750       760    
pF1KA0 PELRAELFESLQEQPGALPVPGPSRSAPSSPA--PRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWA
       :.:  .::.  ::    .     . :  .::    .:::::.:.:...:..  . :  ::
CCDS64 PRLDLKLFDRPQELKLCFSRHPTGNSITKSPPLMAKRTKQEIKTAHKLAKRCYTNPPQWA
             720       730       740       750       760       770 

          770       780       790       800       810       820    
pF1KA0 RCLLGHCYGLWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCS
       .::..:::.:::.::::::: .  .:.::. :: :: .:..  :   :::::::.::::.
CCDS64 KCLFSHCYSLWFICLPAYVRVSHPKVRALQQAYDVLIKMRKTDVDPLDEVCYRVVMQLCG
             780       790       800       810       820       830 

          830       840       850       860       870       880    
pF1KA0 HYGQPVLSVRVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGA
        .:.:::.:::..::. : : ::.::::::::.:::: :::.: .: . :.:.:::: : 
CCDS64 LWGHPVLAVRVLFEMKTARIKPNAITYGYYNKVVLESPWPSSTRSGIFLWTKVRNVVRGL
             840       850       860       870       880       890 

          890       900       910       920       930       940    
pF1KA0 AQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWA
       :::::::..  :..: .. .  :..:   ....:  ...:: .. . . .: :  .:   
CCDS64 AQFRQPLKKTVQRSQVSSISGGQSDQ-GYGSKDELIKDDAEIHVPEEQAARELITKTKMQ
             900       910        920       930       940       950

          950       960       970       980       990      1000    
pF1KA0 GRSLRDPASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSD
        . . : ..  ..  . .    .    :.  ......  ..  .. : : .    ::.:.
CCDS64 TEEVCDASAIVAKHSQPSPEPHSPTEPPAWGSSIVKVPSGIFDVNSRKSST----GSISN
              960       970       980       990      1000          

         1010      1020      1030      1040      1050      1060    
pF1KA0 LSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQL
       . .. ..:.                                                   
CCDS64 VLFSTQDPVEDAVFGEATNLKKNGDRGEKRQKHFPERSCSFSSESRAGMLLKKSSLDSNS
       1010      1020      1030      1040      1050      1060      

>--
 initn: 839 init1: 358 opt: 580  Z-score: 367.7  bits: 81.1 E(32554): 3.7e-14
Smith-Waterman score: 731; 35.2% identity (55.1% similar) in 437 aa overlap (1145-1493:1480-1907)

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pF1KA0 LGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSDTPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMA
                                     .:. ..:.:.:::: :::: .:::::::::
CCDS64 GEVPFPRGMKGQDFEKSDHGSSQNTSMSSIYQNCAMEVLMSSCSQCRACGALVYDEEIMA
    1450      1460      1470      1480      1490      1500         

         1180      1190      1200      1210            1220        
pF1KA0 GWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTLDSRPSVP---SPKSAG---ASGS---KDAPV
       ::. :::::::.::::   :.:::...  : : :.    .:...:    :::    .  .
CCDS64 GWTADDSNLNTACPFCKSNFLPLLNIEFKDLRGSASFFLKPSTSGDSLQSGSIPLANESL
    1510      1520      1530      1540      1550      1560         

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pF1KA0 PGGPGPVLSDRRLCLALDEPQ---------------------------------------
          :   :..  :   .: :.                                       
CCDS64 EHKPVSSLAEPDLINFMDFPKHNQIITEETGSAVEPSDEIKRASGDVQTMKISSVPNSLS
    1570      1580      1590      1600      1610      1620         

            1250             1260                                  
pF1KA0 -----LCNGH-MGGA------SRRVESG--------------------------AWAYLS
            :  .: .::       ..:   :                          .  :::
CCDS64 KRNVSLTRSHSVGGPLQNIDFTQRPFHGISTVSLPNSLQEVVDPLGKRPNPPPVSVPYLS
    1630      1640      1650      1660      1670      1680         

     1270      1280      1290      1300      1310      1320        
pF1KA0 PLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGLVLASCDGP
       :::::::::::.::::..:.    . . ::::::::.:::.:: ::: ::::.:.:    
CCDS64 PLVLRKELESLLENEGDQVIHTSSFINQHPIIFWNLVWYFRRLDLPSNLPGLILTSEHCN
    1690      1700      1710      1720      1730      1740         

     1330      1340      1350      1360       1370      1380       
pF1KA0 SHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWR-VHSQIPQRVVWPGPVPAS
          : :   :. :   : ..:::: ..   .   :::: ::  .:.  . ..      .:
CCDS64 EGVQLPLSSLSQDSKLVYIQLLWDNINLHQEPREPLYVSWRNFNSEKKSSLLSEEQQETS
    1750      1760      1770      1780      1790      1800         

      1390      1400      1410      1420      1430      1440       
pF1KA0 LSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAALGKDHVD
          .:.:.. . .  :.: : ..:: . . :   :.. ::..:::::::....::....:
CCDS64 ---TLVETIRQSIQHNNVLKPINLLSQQMKP---GMKRQRSLYREILFLSLVSLGRENID
       1810      1820      1830         1840      1850      1860   

      1450      1460      1470      1480       1490      
pF1KA0 IVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID-CRKCFGAPPEC
       : :::..:  :.:.:.: . .   : .. . :   ... ::::::::   
CCDS64 IEAFDNEYGIAYNSLSSEILE---RLQKIDAPPSASVEWCRKCFGAPLI 
          1870      1880         1890      1900          

>>CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9            (1958 aa)
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Smith-Waterman score: 3190; 52.7% identity (75.5% similar) in 915 aa overlap (1-899:1-906)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
       : :.. ::..::::::::. ... . .:          .   :  ::::.:.: .. :: 
CCDS83 MIEDKGPRVTDYFVVAGLTDTSTLLDQEI----NRLDTKSTGPKAPITDIAIIIKSAGET
               10        20            30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
       ::.::::..:. ..   .:. : : . .  .::.::::::::...:::::::::  :: .
CCDS83 VPEGYTCVEATPSALQANLNYGSLKSPELFLCYKRGRDKPPLTDIGVLYEGKERLIPGCE
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
       :. .:::.. ::.   .    : ..:::::      ..:..::.:... ::::  :::.:
CCDS83 VILATPYGRCANVNNSSTTSQRIFITYRRAPPVRPQNSLAVTDICVIVTSKGETPPHTFC
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230          
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPES-VPVFCLP
       .. .::: :::: .:.:::: ..  .:...:.: :. :::::: :.::: :: ::.::::
CCDS83 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
        180       190       200       210       220       230      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 MGATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLS
       ::::::::  .::::.::::::::::... ::::::.:::: . :  :::.:   ::::.
CCDS83 MGATIECWDPETKYPLPVFSTFVLTGSSAKKVYGAAIQFYEPYSRELLSEKQLMHLGLLT
        240       250       260       270       280       290      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 AVERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIH
        ::  : . .... . . : .::.:: : ::: :: :.:. :::::: ::.: :::::..
CCDS83 PVE--RKMVSKSINTNKCICLLSHWPFFEAFRKFLMFIYKLSVSGPHPLPIEKHISHFMQ
          300       310       320       330       340       350    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 NVPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLT
       :.:::::::::::::.: .: :.: ::::.:::::::.:  ::..::::   :::: :: 
CCDS83 NIPFPSPQRPRILVQLSVHDALILSQPVSTPLPLSGANFSTLLMNLGPENCATLLLFVLL
          360       370       380       390       400       410    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 EHKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSY
       : :.:.::::: .::.: ::.:.::::..::::::::::: :: :::::.:::::. : :
CCDS83 ESKILLHSLRPAVLTGVAEAVVAMIFPFQWQCPYIPLCPLSLAAVLSAPLPFIVGVDSRY
          420       430       440       450       460       470    

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA0 FDLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGP
       ::::::: ::.:.::::: :. ..::: .. . ::..: : ::.:: .:: ::....   
CCDS83 FDLHDPPQDVVCIDLDTNMLYVSDEKKNMNWKQLPKKPCKNLLSTLKKLYPQLSSVHQKT
          480       490       500       510       520       530    

     540       550          560       570       580       590      
pF1KA0 EEEASLEFLLTDYEAVCG---RRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGA
       .: ....  .:  ::  .   . ..:: :.: ::::::: .:::::..:::.:.:::. :
CCDS83 QEGSAID--MTPIEADFSWQKKMTQLEMEIQEAFLRFMASILKGYRTYLRPITEAPSNKA
          540         550       560       570       580       590  

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pF1KA0 RDVDNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKV
         .:.::  :::::::.:.  :.:. : .::.: .::::::: : . ..: :::.:.::.
CCDS83 TAADSLFDRQGFLKSRDRAYAKFYTLLSKTQIFIRFIEECSFVSDKDTGLAFFDDCIEKL
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pF1KA0 HPEQ--EKP--------EPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGF
        :..  ::         : : :.::.. . :: :::: ::: :   .:.. .:.: :  :
CCDS83 FPDKGTEKTDKVDFDSAEDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPP-DDGKDLSPKYSYKYF
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pF1KA0 PELRAELFESLQEQPGALPVPGPSRSAPSSPA--PRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWA
       :.:  .::.  ::    .     . :  .::    .:::::.:.:...:..  . :  ::
CCDS83 PRLDLKLFDRPQELKLCFSRHPTGNSITKSPPLMAKRTKQEIKTAHKLAKRCYTNPPQWA
             720       730       740       750       760       770 

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pF1KA0 RCLLGHCYGLWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCS
       .::..:::.:::.::::::: .  .:.::. :: :: .:..  :   :::::::.::::.
CCDS83 KCLFSHCYSLWFICLPAYVRVSHPKVRALQQAYDVLIKMRKTDVDPLDEVCYRVVMQLCG
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pF1KA0 HYGQPVLSVRVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGA
        .:.:::.:::..::. : : ::.::::::::.:::: :::.: .: . :.:.:::: : 
CCDS83 LWGHPVLAVRVLFEMKTARIKPNAITYGYYNKVVLESPWPSSTRSGIFLWTKVRNVVRGL
             840       850       860       870       880       890 

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pF1KA0 AQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWA
       :::::::..  :..:                                             
CCDS83 AQFRQPLKKTVQRSQVSSISALQNVTGGSDGDTVSHGSVDSSNDANNGEHTVFVRDLIRL
             900       910       920       930       940       950 

>--
 initn: 892 init1: 358 opt: 580  Z-score: 367.5  bits: 81.1 E(32554): 3.8e-14
Smith-Waterman score: 731; 35.2% identity (55.1% similar) in 437 aa overlap (1145-1493:1529-1956)

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KA0 LGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSDTPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMA
                                     .:. ..:.:.:::: :::: .:::::::::
CCDS83 GEVPFPRGMKGQDFEKSDHGSSQNTSMSSIYQNCAMEVLMSSCSQCRACGALVYDEEIMA
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pF1KA0 GWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTLDSRPSVP---SPKSAG---ASGS---KDAPV
       ::. :::::::.::::   :.:::...  : : :.    .:...:    :::    .  .
CCDS83 GWTADDSNLNTACPFCKSNFLPLLNIEFKDLRGSASFFLKPSTSGDSLQSGSIPLANESL
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pF1KA0 PGGPGPVLSDRRLCLALDEPQ---------------------------------------
          :   :..  :   .: :.                                       
CCDS83 EHKPVSSLAEPDLINFMDFPKHNQIITEETGSAVEPSDEIKRASGDVQTMKISSVPNSLS
     1620      1630      1640      1650      1660      1670        

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pF1KA0 -----LCNGH-MGGA------SRRVESG--------------------------AWAYLS
            :  .: .::       ..:   :                          .  :::
CCDS83 KRNVSLTRSHSVGGPLQNIDFTQRPFHGISTVSLPNSLQEVVDPLGKRPNPPPVSVPYLS
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pF1KA0 PLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGLVLASCDGP
       :::::::::::.::::..:.    . . ::::::::.:::.:: ::: ::::.:.:    
CCDS83 PLVLRKELESLLENEGDQVIHTSSFINQHPIIFWNLVWYFRRLDLPSNLPGLILTSEHCN
     1740      1750      1760      1770      1780      1790        

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pF1KA0 SHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWR-VHSQIPQRVVWPGPVPAS
          : :   :. :   : ..:::: ..   .   :::: ::  .:.  . ..      .:
CCDS83 EGVQLPLSSLSQDSKLVYIQLLWDNINLHQEPREPLYVSWRNFNSEKKSSLLSEEQQETS
     1800      1810      1820      1830      1840      1850        

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pF1KA0 LSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAALGKDHVD
          .:.:.. . .  :.: : ..:: . . :   :.. ::..:::::::....::....:
CCDS83 ---TLVETIRQSIQHNNVLKPINLLSQQMKP---GMKRQRSLYREILFLSLVSLGRENID
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pF1KA0 IVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID-CRKCFGAPPEC
       : :::..:  :.:.:.: . .   : .. . :   ... ::::::::   
CCDS83 IEAFDNEYGIAYNSLSSEILE---RLQKIDAPPSASVEWCRKCFGAPLI 
           1920      1930         1940      1950         




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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