Result of FASTA (ccds) for pF1KA0473
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0473, 913 aa
  1>>>pF1KA0473 913 - 913 aa - 913 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3518+/-0.00104; mu= -0.4639+/- 0.062
 mean_var=327.8559+/-68.555, 0's: 0 Z-trim(113.2): 38  B-trim: 254 in 2/51
 Lambda= 0.070833
 statistics sampled from 13813 (13841) to 13813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.425), width:  16
 Scan time:  4.850

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1         ( 913) 6291 657.4 3.3e-188
CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1         ( 970) 6249 653.2 6.8e-187
CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1         ( 900) 6205 648.7 1.5e-185
CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4            (1232) 1589 177.1 1.8e-43
CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4             (1311) 1589 177.1 1.9e-43


>>CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1              (913 aa)
 initn: 6291 init1: 6291 opt: 6291  Z-score: 3492.3  bits: 657.4 E(32554): 3.3e-188
Smith-Waterman score: 6291; 100.0% identity (100.0% similar) in 913 aa overlap (1-913:1-913)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 FHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 FCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 IPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 YHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
              850       860       870       880       890       900

              910   
pF1KA0 WSEFENQGQKPLY
       :::::::::::::
CCDS30 WSEFENQGQKPLY
              910   

>>CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1              (970 aa)
 initn: 6249 init1: 6249 opt: 6249  Z-score: 3468.8  bits: 653.2 E(32554): 6.8e-187
Smith-Waterman score: 6249; 99.7% identity (100.0% similar) in 909 aa overlap (5-913:62-970)

                                         10        20        30    
pF1KA0                           MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLF
                                     ...:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGGVGGKQRVNAGAAARSPARQPPDRASTMDSSGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLF
              40        50        60        70        80        90 

           40        50        60        70        80        90    
pF1KA0 SNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDI
             100       110       120       130       140       150 

          100       110       120       130       140       150    
pF1KA0 RSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQ
             160       170       180       190       200       210 

          160       170       180       190       200       210    
pF1KA0 NPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGY
             220       230       240       250       260       270 

          220       230       240       250       260       270    
pF1KA0 MCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERM
             280       290       300       310       320       330 

          280       290       300       310       320       330    
pF1KA0 KEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDT
             340       350       360       370       380       390 

          340       350       360       370       380       390    
pF1KA0 TVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSS
             400       410       420       430       440       450 

          400       410       420       430       440       450    
pF1KA0 HQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESE
             460       470       480       490       500       510 

          460       470       480       490       500       510    
pF1KA0 QSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKKPSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKKPSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPP
             520       530       540       550       560       570 

          520       530       540       550       560       570    
pF1KA0 AAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAGQSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAGQSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLR
             580       590       600       610       620       630 

          580       590       600       610       620       630    
pF1KA0 VGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPD
             640       650       660       670       680       690 

          640       650       660       670       680       690    
pF1KA0 VSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKP
             700       710       720       730       740       750 

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA0 TTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNV
             760       770       780       790       800       810 

          760       770       780       790       800       810    
pF1KA0 SFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAADFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAADFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKE
             820       830       840       850       860       870 

          820       830       840       850       860       870    
pF1KA0 MDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVL
             880       890       900       910       920       930 

          880       890       900       910   
pF1KA0 VVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
             940       950       960       970

>>CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1              (900 aa)
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                    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58              MEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSP
       170       180       190       200       210       220       

              250       260       270       280       290       300
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVT
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pF1KA0 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
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pF1KA0 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
       410       420       430       440       450       460       

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
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pF1KA0 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
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              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
       590       600       610       620       630       640       

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
       650       660       670       680       690       700       

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pF1KA0 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
       710       720       730       740       750       760       

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
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pF1KA0 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
       830       840       850       860       870       880       

              910   
pF1KA0 WSEFENQGQKPLY
       :::::::::::::
CCDS58 WSEFENQGQKPLY
       890       900

>>CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4                 (1232 aa)
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Smith-Waterman score: 2555; 44.2% identity (69.6% similar) in 960 aa overlap (8-891:282-1210)

                                      10        20        30       
pF1KA0                        MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNL
                                     : .  ...  ::: ..:...::. :::.::
CCDS82 LLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSGGLALAEYDQPYGG-FLDILRGGTERLFTNL
             260       270       280       290        300       310

        40        50        60        70        80        90       
pF1KA0 KDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSF
       ::        :::.:::::..:.:::::..:.:::: ::::: ..:. ...:...:.: :
CCDS82 KD--------TSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVMSFPAEGVESALKNNIEDVRLF
                      320       330       340       350       360  

       100       110       120       130       140       150       
pF1KA0 LDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPK
       :::.:  ::.::::::..:: ..::.:::::.:  :.:: ::.:. .::::. :: :. :
CCDS82 LDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHK
            370       380       390       400       410       420  

       160       170       180       190       200       210       
pF1KA0 NVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCD
       :::::::.::::::.. : ... :: :.::   :. ..  ::   :. :::.::. ::::
CCDS82 NVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCD
            430       440       450       460       470       480  

       220       230       240       250       260       270       
pF1KA0 LLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEY
       ..:..:  :: ::. .......:.:.:.:::.::::.:.: .:. .. ::  ....:...
CCDS82 MVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCEVYVGDERVASTSQEYDKMRDF
            490       500       510       520       530       540  

       280       290       300       310       320       330       
pF1KA0 RVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVL
       ...:::  :::..::::::.. .:: :::.:.:::::... ..::.::::::.: ..:..
CCDS82 KIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTV
            550       560       570       580       590       600  

       340       350       360       370       380       390       
pF1KA0 KFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQE
       ::.: .:::::. ::::.::::.:.::..:.:.    .::::.   . .::.:::::..:
CCDS82 KFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREE
            610       620       630       640       650       660  

       400       410       420                             430     
pF1KA0 HQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQ----------------------SGFFASLCWQDQK
       .:: :.  :.  .   : .  .:                        : :. .: ::..:
CCDS82 QQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEK
            670       680       690       700       710       720  

              440       450         460       470        480       
pF1KA0 -----SEKSFCEEDHAALVNQ--ESEQSDDELLTLSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ--
            .:..  .:...::...  ::: ::.    .::   .  .: .: :.     .:  
CCDS82 EAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDL
            730       740       750       760       770       780  

             490           500       510          520       530    
pF1KA0 ----QEPAA---PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSFSPPAA---PPTNSELLSDLFGGGGAA
           . ::.   : : :: ::::::.. . ..   :: :   : .:..::: :.:   ::
CCDS82 VFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAA
            790       800       810       820       830       840  

            540          550       560       570       580         
pF1KA0 --GPTQAGQSGVEDVF---HPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSK
         :: .   :  :: .    :. : :.::::: ..  ..:.:      :  .   :  :.
CCDS82 SQGPPEDLLS--EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-GGPPAAADPF-----GPLLPSSGNNSQ
            850         860       870        880            890    

     590        600       610        620                   630     
pF1KA0 P-SGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRS-PSPT-----VHASSTP-------AVNIQPDV
       : :. ::.: :::..:..  : .  ..: : :.     .: .. :       : . .::.
CCDS82 PCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDL
          900       910       920       930       940       950    

         640       650       660             670       680         
pF1KA0 SGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSS
        :::   .. .. ...   :. .:  :  : :.        .: :. ::::::: : ::.
CCDS82 LGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSG
          960       970       980       990      1000      1010    

     690       700       710       720             730       740   
pF1KA0 FASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGG-WQQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPH
       . ..:.       :::: .   :..  : :.. :: .     :: .:  :: :: :  :.
CCDS82 LQGSPA-------GFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PK
                 1020      1030      1040      1050           1060 

           750       760       770       780         790       800 
pF1KA0 SSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPR
       .  : ::::  .::.. :...:::  . ..  : :..  :::::::.:::....:::::.
CCDS82 ACTQPRPNYASNFSVI-GAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPK
            1070       1080      1090      1100      1110      1120

             810       820       830       840       850       860 
pF1KA0 TIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVT
       :::::::...::. :: :::.:.:::::::::::::::.::::: ::..: ::::::::.
CCDS82 TIAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVA
             1130      1140      1150      1160      1170      1180

             870       880       890       900       910   
pF1KA0 PEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
       :::::: ::.:::.::::::.::::::.::                      
CCDS82 PEQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
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>>CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4                  (1311 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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