Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0455
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0455, 763 aa
1>>>pF1KA0455 763 - 763 aa - 763 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8236+/-0.000996; mu= 8.1835+/- 0.060
mean_var=116.4118+/-23.060, 0's: 0 Z-trim(108.2): 32 B-trim: 6 in 1/50
Lambda= 0.118871
statistics sampled from 10030 (10056) to 10030 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 4.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 ( 763) 5062 879.5 0
CCDS53347.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 ( 705) 2917 511.6 1.7e-144
CCDS58636.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 ( 718) 2028 359.2 1.4e-98
CCDS12043.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 ( 746) 1040 189.7 1.4e-47
CCDS6751.1 PLPPR1 gene_id:54886|Hs108|chr9 ( 325) 710 133.0 7.2e-31
CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 316) 615 116.8 5.6e-26
CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 321) 615 116.8 5.7e-26
CCDS12258.1 PLPPR2 gene_id:64748|Hs108|chr19 ( 343) 589 112.3 1.3e-24
CCDS59352.1 PLPPR2 gene_id:64748|Hs108|chr19 ( 427) 477 93.1 9.9e-19
CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 284) 350 71.3 2.4e-12
CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 285) 350 71.3 2.4e-12
CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 ( 311) 339 69.4 9.8e-12
>>CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 (763 aa)
initn: 5062 init1: 5062 opt: 5062 Z-score: 4695.1 bits: 879.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5062; 100.0% identity (100.0% similar) in 763 aa overlap (1-763:1-763)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQRAGSSGGRGECDISGAGRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVI
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CCDS75 MQRAGSSGGRGECDISGAGRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KDSVTLLPCFYFVELPILASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KDSVTLLPCFYFVELPILASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PFLMLLSLAFAGPAITIMVGEGILYCCLSKRRNGVGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PFLMLLSLAFAGPAITIMVGEGILYCCLSKRRNGVGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VHVFGLCSTALITDIIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VHVFGLCSTALITDIIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 INSGRKSFPSQHATLAAFAAVYVSMYFNSTLTDSSKLLKPLLVFTFIICGIICGLTRITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 INSGRKSFPSQHATLAAFAAVYVSMYFNSTLTDSSKLLKPLLVFTFIICGIICGLTRITQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YKNHPVDVYCGFLIGGGIALYLGLYAVGNFLPSDESMFQHRDALRSLTDLNQDPNRLLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YKNHPVDVYCGFLIGGGIALYLGLYAVGNFLPSDESMFQHRDALRSLTDLNQDPNRLLSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KNGSSSDGIAHTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEIITPRSPMGKENMVTFSNTLPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KNGSSSDGIAHTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEIITPRSPMGKENMVTFSNTLPRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NTPSVEDPVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKNESRKLSLQVIEPEPGQSPPRSIEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NTPSVEDPVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKNESRKLSLQVIEPEPGQSPPRSIEMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGCNNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGCNNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEET
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QENISTSPKSSSARAKWLKAAEKTVACNRSNSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QENISTSPKSSSARAKWLKAAEKTVACNRSNSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENNRPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENNRPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLRQT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKRSNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEGSEIGSETLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKRSNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEGSEIGSETLSI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KA0 SSSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPENTRNIFYKGTSPTRAYKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPENTRNIFYKGTSPTRAYKD
730 740 750 760
>>CCDS53347.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 (705 aa)
initn: 4658 init1: 2914 opt: 2917 Z-score: 2707.6 bits: 511.6 E(32554): 1.7e-144
Smith-Waterman score: 4546; 92.4% identity (92.4% similar) in 763 aa overlap (1-763:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQRAGSSGGRGECDISGAGRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MQRAGSSGGRGECDISGAGRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KDSVTLLPCFYFVELPILASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KDSVTLLPCFYFVELPILASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PFLMLLSLAFAGPAITIMVGEGILYCCLSKRRNGVGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PFLMLLSLAFAGPAITIMVGEGILYCCLSKRRNGVGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 VHVFGLCSTALITDIIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VHVFGLCSTALITDIIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 INSGRKSFPSQHATLAAFAAVYVSMYFNSTLTDSSKLLKPLLVFTFIICGIICGLTRITQ
::::::::::::::::::::::::
CCDS53 INSGRKSFPSQHATLAAFAAVYVS------------------------------------
250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YKNHPVDVYCGFLIGGGIALYLGLYAVGNFLPSDESMFQHRDALRSLTDLNQDPNRLLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ----------------------GLYAVGNFLPSDESMFQHRDALRSLTDLNQDPNRLLSA
270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KNGSSSDGIAHTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEIITPRSPMGKENMVTFSNTLPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNGSSSDGIAHTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEIITPRSPMGKENMVTFSNTLPRA
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 NTPSVEDPVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKNESRKLSLQVIEPEPGQSPPRSIEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NTPSVEDPVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKNESRKLSLQVIEPEPGQSPPRSIEMR
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGCNNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGCNNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEET
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QENISTSPKSSSARAKWLKAAEKTVACNRSNSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QENISTSPKSSSARAKWLKAAEKTVACNRSNSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEGST
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 VSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENNRPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENNRPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLRQT
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKRSNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEGSEIGSETLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKRSNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEGSEIGSETLSI
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760
pF1KA0 SSSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPENTRNIFYKGTSPTRAYKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPENTRNIFYKGTSPTRAYKD
670 680 690 700
>>CCDS58636.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 (718 aa)
initn: 1846 init1: 885 opt: 2028 Z-score: 1883.5 bits: 359.2 E(32554): 1.4e-98
Smith-Waterman score: 2033; 48.5% identity (74.0% similar) in 722 aa overlap (49-745:2-703)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 GRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVIKDSVTLLPCFYFVELPIL
.:.:: :.:. :::.:::::::::::::.
CCDS58 MISTKE--KNKIPKDSMTLLPCFYFVELPIV
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 ASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAIPFLMLLSLAFAGPAITIM
:::.::::::::::.:::.. ::.::::.:::::.: ..: ::.:::::::::.:: .::
CCDS58 ASSIVSLYFLELTDLFKPAKVGFQCYDRTLSMPYVETNEELIPLLMLLSLAFAAPAASIM
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 VGEGILYCCLSK---RRNG-VGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVGVHVFGLCSTALITD
:.::.::: :. : .: .: : .::::::::::::::.::::::::::::.:::.::
CCDS58 VAEGMLYCLQSRLWGRAGGPAGAEGSINAGGCNFNSFLRRTVRFVGVHVFGLCATALVTD
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTVINSGRKSFPSQHAT
.:::.:::..:.:::::::::: :..::. : ::..::::: :. .: :.::.:::::::
CCDS58 VIQLATGYHTPFFLTVCKPNYTLLGTSCEVNPYITQDICSGHDIHAILSARKTFPSQHAT
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LAAFAAVYVSMYFNSTLTDSSKLLKPLLVFTFIICGIICGLTRITQYKNHPVDVYCGFLI
:.:::::::::::::...:..:::::.:::.: : . .::::.::::..:::::: ::::
CCDS58 LSAFAAVYVSMYFNSVISDTTKLLKPILVFAFAIAAGVCGLTQITQYRSHPVDVYAGFLI
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 GGGIALYLGLYAVGNFL--PSDESMFQH--RDALRSLTDLNQDPNRLLSAKNGSSSDGIA
:.::: ::. .::::: :... .::::.::. ..: . . ... :.: ..
CCDS58 GAGIAAYLACHAVGNFQAPPAEKPAAPAPAKDALRALTQRGHDS--VYQQNKSVSTDELG
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KA0 ---HTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEIITPRSPMGKENMVTFSNTLPRANTPSVED
. :: :. .:: .::::..::....:::::.::::::::.:::::..::..:
CCDS58 PPGRLEGAPRPVAREKTSLGSLKRASVDVDLLAPRSPMAKENMVTFSHTLPRASAPSLDD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKN-ESRKLSLQVIEPEPGQ--SPPRSI----EMR
:.::. .::. .:..:::::...::.:. :.: :.: . ::. .: . . : .
CCDS58 PARRHMTIHVPLDASRSKQLISEWKQKSLEGRGLGLPD-DASPGHLRAPAEPMAEEEEEE
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KA0 SSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGCNNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEE-
. : . . . .::. : : :: :::: . : : :::::::
CCDS58 EDEEEEEEEEEEEDEGPAPPSLYPTVQARPGL------GPRVILPPRAGPPPLVHIPEEG
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 TQENISTSPKSSSA-RAKWLKAAEKTVACNRSNSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEG
.: . . ::::... ::::: :::. : . ::..::::::: :. . .: .
CCDS58 AQTGAGLSPKSGAGVRAKWLMMAEKSGAA--VANPPRLLQVIAMSKAPGAPGPKAAETAS
510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 STVSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENNRPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLR
:. . . : .:.. .:.. ..:: ..:: .. :.... . :.. :.::: :.
CCDS58 SSSASSDSSQYRSPSDRDSASIVTIDAHAPHH-PVVHLSA----GGAPWEWKAAGGGAKA
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 QT---YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKRSNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEG-SEIG
.. :::.:: : .. . : : . :..:..: . ...:. .. :: .:
CCDS58 EADGGYELGDLARGFRG--GAKPPGVSPGSSVSDVDQEEPRFGAVATVNLATGEGLPPLG
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760
pF1KA0 SETLSIS-SSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPENTRNIFYKGTSPTRAYKD
. ... .::.:::::... . . :: :
CCDS58 AADGALGPGSRESTLRRHAGGLGLAEREAEAEAEGYFRKMQARRFPD
680 690 700 710
>>CCDS12043.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 (746 aa)
initn: 1531 init1: 570 opt: 1040 Z-score: 967.5 bits: 189.7 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 1967; 46.7% identity (71.2% similar) in 750 aa overlap (49-745:2-731)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 GRLGLEEAARLSCAVHTSPGGGRRPGQAAGMSAKERPKGKVIKDSVTLLPCFYFVELPIL
.:.:: :.:. :::.:::::::::::::.
CCDS12 MISTKE--KNKIPKDSMTLLPCFYFVELPIV
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 ASSVVSLYFLELTDVFKPVHSGFSCYDRSLSMPYIEPTQEAIPFLMLLSLAFAGPAITIM
:::.::::::::::.:::.. ::.::::.:::::.: ..: ::.:::::::::.:: .::
CCDS12 ASSIVSLYFLELTDLFKPAKVGFQCYDRTLSMPYVETNEELIPLLMLLSLAFAAPAASIM
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 VGEGILYCCLSK---RRNG-VGLEPNINAGGCNFNSFLRRAVRFVGVHVFGLCSTALITD
:.::.::: :. : .: .: : .::::::::::::::.::::::::::::.:::.::
CCDS12 VAEGMLYCLQSRLWGRAGGPAGAEGSINAGGCNFNSFLRRTVRFVGVHVFGLCATALVTD
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 IIQLSTGYQAPYFLTVCKPNYTSLNVSCKENSYIVEDICSGSDLTVINSGRKSFPSQHAT
.:::.:::..:.:::::::::: :..::. : ::..::::: :. .: :.::.:::::::
CCDS12 VIQLATGYHTPFFLTVCKPNYTLLGTSCEVNPYITQDICSGHDIHAILSARKTFPSQHAT
150 160 170 180 190 200
260 270 280
pF1KA0 LAAFAAVYVS----------------------------MYFNSTLTDSSKLLKPLLVFTF
:.:::::::: :::::...:..:::::.:::.:
CCDS12 LSAFAAVYVSVSPAPHCPSQALLLTRGEPSLTPTPMPQMYFNSVISDTTKLLKPILVFAF
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 IICGIICGLTRITQYKNHPVDVYCGFLIGGGIALYLGLYAVGNFL--PSDESMFQH--RD
: . .::::.::::..:::::: :::::.::: ::. .::::: :... .:
CCDS12 AIAAGVCGLTQITQYRSHPVDVYAGFLIGAGIAAYLACHAVGNFQAPPAEKPAAPAPAKD
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KA0 ALRSLTDLNQDPNRLLSAKNGSSSDGIA---HTEGILNRNHRDASSLTNLKRANADVEII
:::.::. ..: . . ... :.: .. . :: :. .:: .::::..::...
CCDS12 ALRALTQRGHDS--VYQQNKSVSTDELGPPGRLEGAPRPVAREKTSLGSLKRASVDVDLL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TPRSPMGKENMVTFSNTLPRANTPSVEDPVRRNASIHASMDSARSKQLLTQWKNKN-ESR
.:::::.::::::::.:::::..::..::.::. .::. .:..:::::...::.:. :.:
CCDS12 APRSPMAKENMVTFSHTLPRASAPSLDDPARRHMTIHVPLDASRSKQLISEWKQKSLEGR
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 KLSLQVIEPEPGQ--SPPRSI----EMRSSSEPSRVGVNGDHHGPGNQYLKIQPGAVPGC
:.: . ::. .: . . : . . : . . . .::. : : ::
CCDS12 GLGLPD-DASPGHLRAPAEPMAEEEEEEEDEEEEEEEEEEEDEGPAPPSLYPTVQARPGL
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NNSMPGGPRVSIQSRPGSSQLVHIPEE-TQENISTSPKSSSA-RAKWLKAAEKTVACNRS
:::: . : : ::::::: .: . . ::::... ::::: :::. :
CCDS12 ------GPRVILPPRAGPPPLVHIPEEGAQTGAGLSPKSGAGVRAKWLMMAEKSGAA--V
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580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NSQPRIMQVIAMSKQQGVLQSSPKNTEGSTVSCTGSIRYKTLTDHEPSGIVRVEAHPENN
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CCDS12 ANPPRLLQVIAMSKAPGAPGPKAAETASSSSASSDSSQYRSPSDRDSASIVTIDAHAPHH
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680
pF1KA0 RPIIQIPSTEGEGSGSWKWKAPEKGSLRQT---YELNDLNRDSESCESLKDSFGSGDRKR
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CCDS12 -PVVHLSA----GGAPWEWKAAGGGAKAEADGGYELGDLARGFRG--GAKPPGVSPGSSV
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pF1KA0 SNIDSNEHHHHGITTIRVTPVEG-SEIGSETLSIS-SSRDSTLRRKGNIILIPERSNSPE
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CCDS12 SDVDQEEPRFGAVATVNLATGEGLPPLGAADGALGPGSRESTLRRHAGGLGLAEREAEAE
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750 760
pF1KA0 NTRNIFYKGTSPTRAYKD
CCDS12 AEGYFRKMQARRFPD
740
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CCDS67 YFECTDTFQ-VHIQGFFCQDGDLMKPYPGTEEESFITPLVLYCVLA-ATPTAIIFIGEIS
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CCDS67 MYFIKSTRESLIAQEKTILTGECCYLNPLLRRIIRFTGVFAFGLFATDIFVNAGQVVTGH
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CCDS67 LYATMYITSTIKTKSSRLAKPVLCLGTLCTAFLTGLNRVSEYRNHCSDVIAGFILGTAVA
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CCDS67 LFLGMCVVHNFKGTQGSPSKPKPEDPRGVPLMAFPRIESPLETLSAQNHSASMTEVT
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:. : : : ..
CCDS30 AENEHIHMDNLAQMPMISIPRVESPLEKNHITAFAEVT
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.:: .. :.:..:. :..: ::.: .
CCDS30 MPLLPAALTSSMLYF-QMVIMAGTVMLAYYFEYTDTFTVNVQ
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CCDS30 GFFCHDSAYRKPYPGPEDSSAVPPVLLYSLAAGVPVLVIIVGETAVFCLQLATRDFENQE
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CCDS30 L--GCQQYTQFISGEEACTGNP-DLIMRARKTFPSKEAALSVYAAMYLTMYITNTIKAKG
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CCDS30 TRLAKPVLCLGLMCLAFLTGLNRVAEYRNHWSDVIAGFLVGISIAVFLVVCVVNNFKGRQ
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:. : : : ..
CCDS30 AENEHIHMDNLAQMPMISIPRVESPLEKVTSVQNHITAFAEVT
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CCDS12 LAYRLEFTDTF-PVHTQGFFCYDSTYAKPYPGPEAASRVPPALVYALVTAGPTLTILLGE
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CCDS12 CKDAALCAYAVTYTAMYVTLVFRVKGSRLVKPSLCLALLCPAFLVGVVRVAEYRNHWSDV
210 220 230 240 250 260
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CCDS12 LAGFLTGAAIATFLVTCVVHNFQSRPPS--GRR--LSPWEDLGQAPT-MDSPLEKNPRSA
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CCDS12 GRIRHRHGSPHPSRRTAPAVAT
330 340
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CCDS59 MAGGRPH---LKRSFSIIPCFVFVE---------
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CCDS59 ----------------GFFCYDSTYAKPYPGPEAASRVPPALVYALVTAGPTLTILLGE-
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CCDS59 KDAALCAYAVTYTAMYVTLVFRVKGSRLVKPSLCLALLCPAFLVGVVRVAEYRNHWSDVL
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CCDS59 AGFLTGAAIATFLVTCVVHNFQSRPPS--GRR--LSPWEDLGQAP----TMDSPLEKLSV
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CCDS59 AQ-EPEVCRPHSTPARLTPSKSQNCARRGHLIPSCVSSRAPAMCSSPRVPRPRLRSEPTP
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.
CCDS59 LPLPLPLPAPTPSQGPSPSSPGPGGPGGGGGRGRKLLLPTPLLRDLYTLSGLYPSPFHRD
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CCDS34 MFDKTRLP---YVALDVLCVLLAGLPFAILTSRH
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CCDS34 TPFQRGVFCNDESIKYPYKEDT---IPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNL-----
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CCDS34 -------LHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDP
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CCDS34 DWSKINCS---DGYIEYYICRG-NAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKG
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CCDS34 KERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP
260 270 280
763 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]