Result of FASTA (ccds) for pF1KA0424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0424, 516 aa
  1>>>pF1KA0424 516 - 516 aa - 516 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4557+/-0.00101; mu= 8.6268+/- 0.061
 mean_var=159.1557+/-34.400, 0's: 0 Z-trim(109.7): 129  B-trim: 276 in 1/51
 Lambda= 0.101663
 statistics sampled from 10949 (11098) to 10949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.341), width:  16
 Scan time:  3.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 516) 3567 535.5 5.5e-152
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 495) 3435 516.1 3.6e-146
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 463) 3132 471.6 8.2e-133
CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX       ( 414) 2840 428.8 5.9e-120
CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13     ( 574) 2163 329.6 5.8e-90
CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13     ( 596) 2163 329.6   6e-90
CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13      ( 652) 2163 329.6 6.4e-90
CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13     (1277) 2163 329.9 1.1e-89
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2        ( 690) 2107 321.4   2e-87
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2       ( 670) 2044 312.2 1.2e-84
CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13     ( 512) 1677 258.3 1.5e-68
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8          (1606)  644 107.2 1.5e-22
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20        (1659)  573 96.8 2.1e-19
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6       (1385)  445 77.9 8.1e-14
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14      (1219)  441 77.3 1.1e-13


>>CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (516 aa)
 initn: 3567 init1: 3567 opt: 3567  Z-score: 2842.1  bits: 535.5 E(32554): 5.5e-152
Smith-Waterman score: 3567; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (1-516:1-516)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510      
pF1KA0 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
              490       500       510      

>>CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (495 aa)
 initn: 3435 init1: 3435 opt: 3435  Z-score: 2737.7  bits: 516.1 E(32554): 3.6e-146
Smith-Waterman score: 3435; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (22-516:1-495)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
                            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83                      MANRELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPAS
                                    10        20        30         

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIK
      40        50        60        70        80        90         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEI
     100       110       120       130       140       150         

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLL
     160       170       180       190       200       210         

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQW
     220       230       240       250       260       270         

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDIL
     280       290       300       310       320       330         

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAF
     340       350       360       370       380       390         

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 REERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQY
     400       410       420       430       440       450         

              490       500       510      
pF1KA0 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
     460       470       480       490     

>>CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (463 aa)
 initn: 3129 init1: 3129 opt: 3132  Z-score: 2497.9  bits: 471.6 E(32554): 8.2e-133
Smith-Waterman score: 3132; 98.5% identity (99.1% similar) in 461 aa overlap (56-516:3-463)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KA0 ELAFKAGDVIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLD
                                     :. ..   ::::::::::::::::::::::
CCDS55                             MQWIRGGSGMLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLD
                                           10        20        30  

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA0 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQL
             40        50        60        70        80        90  

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA0 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDAC
            100       110       120       130       140       150  

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA0 MELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHS
            160       170       180       190       200       210  

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA0 DYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEM
            220       230       240       250       260       270  

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA0 AWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFN
            280       290       300       310       320       330  

         390       400       410       420       430       440     
pF1KA0 VSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQA
            340       350       360       370       380       390  

         450       460       470       480       490       500     
pF1KA0 AMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFW
            400       410       420       430       440       450  

         510      
pF1KA0 QNFSRLTPFKK
       :::::::::::
CCDS55 QNFSRLTPFKK
            460   

>>CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX            (414 aa)
 initn: 2840 init1: 2840 opt: 2840  Z-score: 2267.1  bits: 428.8 E(32554): 5.9e-120
Smith-Waterman score: 2840; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (103-516:1-414)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KA0 EEGPSDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQ
                                             10        20        30

            140       150       160       170       180       190  
pF1KA0 CRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CRKRRDMFSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFW
               40        50        60        70        80        90

            200       210       220       230       240       250  
pF1KA0 IYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IYSEYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQ
              100       110       120       130       140       150

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pF1KA0 LAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDI
              160       170       180       190       200       210

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pF1KA0 LDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDRSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYE
              220       230       240       250       260       270

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pF1KA0 VVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VVDIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEK
              280       290       300       310       320       330

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pF1KA0 IGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGFEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVF
              340       350       360       370       380       390

            500       510      
pF1KA0 EFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFTEPKRSQSPFWQNFSRLTPFKK
              400       410    

>>CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13          (574 aa)
 initn: 2143 init1: 1140 opt: 2163  Z-score: 1728.5  bits: 329.6 E(32554): 5.8e-90
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:65-574)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS66 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
           40        50        60        70        80        90    

            40        50        60        70        80        90   
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...    
CCDS66 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
          100       110       120       130        140        150  

           100       110       120       130       140       150   
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
        :  .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::.  ::.  :: .::::::
CCDS66 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
            160       170       180       190       200       210  

           160       170       180       190       200       210   
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
       :::.::  :..:::::::...::::::: :::..:.:: :::::::::  ::.::..:::
CCDS66 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
            220       230       240       250       260       270  

           220       230       240       250       260       270   
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
       ...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::  . ::
CCDS66 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
            280       290       300       310       320       330  

           280       290       300       310       320       330   
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
         .:.::.  ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : .  :
CCDS66 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
            340       350       360       370       380       390  

           340       350       360       370       380       390   
pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
       ..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS66 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
             400       410       420       430       440       450 

           400       410       420       430       440       450   
pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
       : .. :.:..:: ::: :.: :::.:  .::. ::::...:.:::::::. : ....:. 
CCDS66 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
             460       470       480       490       500       510 

             460       470         480       490       500         
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
         :.:: :      :  :: :   :... .  .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS66 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
             520           530       540       550       560       

     510      
pF1KA0 RLTPFKK
       :::::.:
CCDS66 RLTPFRK
       570    

>>CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13          (596 aa)
 initn: 2143 init1: 1140 opt: 2163  Z-score: 1728.3  bits: 329.6 E(32554): 6e-90
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:87-596)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS66 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
         60        70        80        90       100       110      

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pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...    
CCDS66 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
        120       130       140       150        160       170     

           100       110       120       130       140       150   
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
        :  .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::.  ::.  :: .::::::
CCDS66 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
          180       190       200       210       220       230    

           160       170       180       190       200       210   
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
       :::.::  :..:::::::...::::::: :::..:.:: :::::::::  ::.::..:::
CCDS66 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
          240       250       260       270       280       290    

           220       230       240       250       260       270   
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
       ...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::  . ::
CCDS66 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
          300       310       320       330       340       350    

           280       290       300       310       320       330   
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
         .:.::.  ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : .  :
CCDS66 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
          360       370       380       390       400       410    

           340       350       360       370       380       390   
pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
       ..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS66 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
       : .. :.:..:: ::: :.: :::.:  .::. ::::...:.:::::::. : ....:. 
CCDS66 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
           480       490       500       510       520       530   

             460       470         480       490       500         
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
         :.:: :      :  :: :   :... .  .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS66 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
           540           550       560       570       580         

     510      
pF1KA0 RLTPFKK
       :::::.:
CCDS66 RLTPFRK
     590      

>>CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13           (652 aa)
 initn: 2143 init1: 1140 opt: 2163  Z-score: 1727.8  bits: 329.6 E(32554): 6.4e-90
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:143-652)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS93 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
            120       130       140       150       160       170  

            40        50        60        70        80        90   
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...    
CCDS93 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
            180       190       200        210       220        230

           100       110       120       130       140       150   
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
        :  .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::.  ::.  :: .::::::
CCDS93 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
              240       250       260       270       280       290

           160       170       180       190       200       210   
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
       :::.::  :..:::::::...::::::: :::..:.:: :::::::::  ::.::..:::
CCDS93 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
              300       310       320       330       340       350

           220       230       240       250       260       270   
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
       ...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::  . ::
CCDS93 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
              360       370       380       390       400       410

           280       290       300       310       320       330   
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
         .:.::.  ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : .  :
CCDS93 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
              420       430       440       450       460          

           340       350       360       370       380       390   
pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
       ..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS93 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
     470       480       490       500       510       520         

           400       410       420       430       440       450   
pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
       : .. :.:..:: ::: :.: :::.:  .::. ::::...:.:::::::. : ....:. 
CCDS93 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
     530       540       550       560       570       580         

             460       470         480       490       500         
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
         :.:: :      :  :: :   :... .  .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS93 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
     590           600       610       620       630       640     

     510      
pF1KA0 RLTPFKK
       :::::.:
CCDS93 RLTPFRK
         650  

>>CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13          (1277 aa)
 initn: 2118 init1: 1140 opt: 2163  Z-score: 1723.8  bits: 329.9 E(32554): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 2163; 61.5% identity (83.9% similar) in 517 aa overlap (4-516:768-1277)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  ..: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS53 GSEEDFSYEDLCQASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
       740       750       760       770       780       790       

            40        50        60        70        80        90   
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . . : ...    
CCDS53 VIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPSEEQDEEAS-QSR
       800       810       820       830        840       850      

           100       110       120       130       140       150   
pF1KA0 GRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNIE
        :  .:..:::.::: :::.::: :::::.::::::..::::.  ::.  :: .::::::
CCDS53 HRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIE
         860       870       880       890       900       910     

           160       170       180       190       200       210   
pF1KA0 DIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLMK
       :::.::  :..:::::::...::::::: :::..:.:: :::::::::  ::.::..:::
CCDS53 DIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMK
         920       930       940       950       960       970     

           220       230       240       250       260       270   
pF1KA0 DSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAAA
       ...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::  . ::
CCDS53 QGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAA
         980       990      1000      1010      1020      1030     

           280       290       300       310       320       330   
pF1KA0 LAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPYG
         .:.::.  ::::::.::.:::::.::.:.. ::: ::::::::::..::.. : .  :
CCDS53 YEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQ-G
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

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pF1KA0 RNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAFK
       ..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: : :.:.:::::
CCDS53 KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFK
         1100      1110      1120      1130      1140      1150    

           400       410       420       430       440       450   
pF1KA0 LHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKVP
       : .. :.:..:: ::: :.: :::.:  .::. ::::...:.:::::::. : ....:. 
CCDS53 LVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAG
         1160      1170      1180      1190      1200      1210    

             460       470         480       490       500         
pF1KA0 --KQKGVNSARSVPPSYPPPQD--PLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFS
         :.:: :      :  :: :   :... .  .: .. :.::: ..::::..: ::..:.
CCDS53 HGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFN
         1220          1230      1240      1250      1260      1270

     510      
pF1KA0 RLTPFKK
       :::::.:
CCDS53 RLTPFRK
              

>>CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2             (690 aa)
 initn: 2104 init1: 1674 opt: 2107  Z-score: 1683.1  bits: 321.4 E(32554): 2e-87
Smith-Waterman score: 2107; 60.8% identity (81.7% similar) in 515 aa overlap (4-516:190-690)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  :.: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS21 SEEDLYDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
     160       170       180       190       200       210         

            40        50        60        70        80        90   
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.:.::.:..::::.. : ::::::::::: ::: ::    :.: ... :  ::     
CCDS21 VIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQ-DE----PAD-DDAPLAGNSGAEDG
     220       230       240       250             260       270   

            100       110       120       130       140       150  
pF1KA0 GRPLQN-RDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNI
       :   :. .::::.::::::.:::: :::::.::::::..::::: ::::.:::..:::::
CCDS21 GAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNI
           280       290       300       310       320       330   

            160       170       180       190       200       210  
pF1KA0 EDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLM
       ::::: : .::. ::...: . :::::.: ::::::  : ::::::::: .::.:::.: 
CCDS21 EDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLT
           340       350       360       370       380       390   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KA0 KDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAA
       : :.: .:::::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::  .: :.. : :
CCDS21 KLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEA
           400       410       420       430       440       450   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KA0 ALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPY
       :: .:.::.: ::::::::::::::::::.:. ::::::.: :::::::.::.. . :: 
CCDS21 ALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQ
           460       470       480       490       500       510   

            340       350       360       370       380       390  
pF1KA0 GRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAF
       ...:::.:::::::.. :::::.:::.::::::.:::  ::::.:::.: :..::.::::
CCDS21 AKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAF
           520       530       540       550       560       570   

            400       410       420       430       440       450  
pF1KA0 KLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKV
       .::   : . ::. ..: :.: :::.:: .::..:: :.. :: :.: :..:: ... : 
CCDS21 RLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASK-
           580       590       600       610       620       630   

            460        470       480       490       500       510 
pF1KA0 PKQKGVNSARSVP-PSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRL
         :. ... ..:  : :   :   .:    .:..  :.::. ..::.:. : ::...:::
CCDS21 --QQVTGKPKAVGRPCYLTRQ---KHPA--LPSNRPQQQVLVLAEPRRKPSTFWHSISRL
              640       650            660       670       680     

            
pF1KA0 TPFKK
       .::.:
CCDS21 APFRK
         690

>>CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2            (670 aa)
 initn: 2052 init1: 1674 opt: 2044  Z-score: 1633.3  bits: 312.2 E(32554): 1.2e-84
Smith-Waterman score: 2044; 61.1% identity (81.8% similar) in 488 aa overlap (4-490:190-668)

                                          10        20        30   
pF1KA0                            MTLLITGDSIVSAEAVWDHVTMANRELAFKAGD
                                     ::.  :.: :::.:::::: ..::.:::::
CCDS42 SEEDLYDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAEALWDHVTMDDQELGFKAGD
     160       170       180       190       200       210         

            40        50        60        70        80        90   
pF1KA0 VIKVLDASNKDWWWGQIDDEEGWFPASFVRLWVNQEDEVEEGPSDVQNGHLDPNSDCLCL
       ::.:.::.:..::::.. : ::::::::::: :::..     :.: ... :  ::     
CCDS42 VIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDE-----PAD-DDAPLAGNSGAEDG
     220       230       240       250             260       270   

            100       110       120       130       140       150  
pF1KA0 GRPLQN-RDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKRRDMFSDEQLKVIFGNI
       :   :. .::::.::::::.:::: :::::.::::::..::::: ::::.:::..:::::
CCDS42 GAEAQSSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKRADMFSEEQLRTIFGNI
           280       290       300       310       320       330   

            160       170       180       190       200       210  
pF1KA0 EDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYSEYCNNHLDACMELSKLM
       ::::: : .::. ::...: . :::::.: ::::::  : ::::::::: .::.:::.: 
CCDS42 EDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSEYCNNHPNACVELSRLT
           340       350       360       370       380       390   

            220       230       240       250       260       270  
pF1KA0 KDSRYQHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTAQDHSDYRYVAA
       : :.: .:::::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::  .: :.. : :
CCDS42 KLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTHPQHRDFKDVEA
           400       410       420       430       440       450   

            280       290       300       310       320       330  
pF1KA0 ALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIYTGEMAWIYQPY
       :: .:.::.: ::::::::::::::::::.:. ::::::.: :::::::.::.. . :: 
CCDS42 ALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRSSELIYSGELTRVTQPQ
           460       470       480       490       500       510   

            340       350       360       370       380       390  
pF1KA0 GRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRDDDFNVSMKNAF
       ...:::.:::::::.. :::::.:::.::::::.:::  ::::.:::.: :..::.::::
CCDS42 AKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDLEDGKDRDLHVSIKNAF
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KA0 KLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQKRQAAMTVRKV
       .::   : . ::. ..: :.: :::.:: .::..:: :.. :: :.: :..:: ... : 
CCDS42 RLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFSITELQRKQAMLNASK-
           580       590       600       610       620       630   

            460       470       480       490       500       510  
pF1KA0 PKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEPKRSQSPFWQNFSRLT
         :. ... ..   . :::. :  .   ..: .  :::                      
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