Result of FASTA (ccds) for pF1KA0234
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0234, 1482 aa
  1>>>pF1KA0234 1482 - 1482 aa - 1482 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6456+/-0.00101; mu= 17.6798+/- 0.061
 mean_var=114.2405+/-22.709, 0's: 0 Z-trim(107.9): 87  B-trim: 2 in 1/50
 Lambda= 0.119995
 statistics sampled from 9797 (9886) to 9797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time:  4.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1482) 10074 1756.1       0
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1539) 9250 1613.5       0
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1560) 7293 1274.7       0
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1559) 7291 1274.4       0
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY          (1570) 7273 1271.3       0
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX          (1379) 7263 1269.5       0
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12         (1690) 3801 670.2 1.4e-191
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1544) 3442 608.0 6.8e-173
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1         (1580) 3442 608.0  7e-173
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11       ( 506)  492 97.0 1.5e-19
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11         ( 523)  461 91.7 6.4e-18
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1            (1064)  453 90.5   3e-17
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 813)  440 88.2 1.1e-16
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9         ( 835)  440 88.2 1.2e-16
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9          (1056)  440 88.2 1.4e-16
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19        (1096)  434 87.2   3e-16
CCDS58996.1 JARID2 gene_id:3720|Hs108|chr6         (1074)  403 81.8 1.2e-14
CCDS4533.1 JARID2 gene_id:3720|Hs108|chr6          (1246)  403 81.9 1.4e-14


>>CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1482 aa)
 initn: 10074 init1: 10074 opt: 10074  Z-score: 9422.6  bits: 1756.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10074; 100.0% identity (100.0% similar) in 1482 aa overlap (1-1482:1-1482)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKQCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKQCN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 THPFDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 THPFDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 IYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 TTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 CPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLDQSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLDQSVL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 CHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 VMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 KEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 KRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQLTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQLTL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 TELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 LGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKAR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 AELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 AWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 KKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAF
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 KEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFH
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 GQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 RLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 TACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 AIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 ALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480  
pF1KA0 TDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
             1450      1460      1470      1480  

>>CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1539 aa)
 initn: 10060 init1: 9250 opt: 9250  Z-score: 8651.4  bits: 1613.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9745; 96.2% identity (96.2% similar) in 1514 aa overlap (26-1482:26-1539)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KA0 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSK---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS14 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKIVI
               70        80        90       100       110       120

                                                             120   
pF1KA0 ------------------------------------------------------QCNTHP
                                                             ::::::
CCDS14 EEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIYPYEMFQSGANHVQCNTHP
              130       140       150       160       170       180

           130       140       150       160       170       180   
pF1KA0 FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYG
              190       200       210       220       230       240

           190       200       210       220       230       240   
pF1KA0 PGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTKTTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTKTTM
              250       260       270       280       290       300

           250       260       270       280       290       300   
pF1KA0 QLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWRCPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWRCPK
              310       320       330       340       350       360

           310       320       330       340       350       360   
pF1KA0 CILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVS
              370       380       390       400       410       420

           370       380       390       400       410       420   
pF1KA0 SIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHI
              430       440       450       460       470       480

           430       440       450       460       470       480   
pF1KA0 NADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMK
              490       500       510       520       530       540

           490       500       510       520       530       540   
pF1KA0 MLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYN
              550       560       570       580       590       600

           550       560       570       580       590       600   
pF1KA0 FAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEM
              610       620       630       640       650       660

           610       620       630       640       650       660   
pF1KA0 FIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVC
              670       680       690       700       710       720

           670       680       690       700       710       720   
pF1KA0 LSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRS
              730       740       750       760       770       780

           730       740       750       760       770       780   
pF1KA0 FEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQLTLTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQLTLTEL
              790       800       810       820       830       840

           790       800       810       820       830       840   
pF1KA0 RVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGV
              850       860       870       880       890       900

           850       860       870       880       890       900   
pF1KA0 EVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAEL
              910       920       930       940       950       960

           910       920       930       940       950       960   
pF1KA0 QELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWI
              970       980       990      1000      1010      1020

           970       980       990      1000      1010      1020   
pF1KA0 ADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

          1030      1040      1050      1060      1070      1080   
pF1KA0 SCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

          1090      1100      1110      1120      1130      1140   
pF1KA0 EQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQC
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

          1150      1160      1170      1180      1190      1200   
pF1KA0 VSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

          1210      1220      1230      1240      1250      1260   
pF1KA0 EGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATAC
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

          1270      1280      1290      1300      1310      1320   
pF1KA0 DPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPEAIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPEAIR
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

          1330      1340      1350      1360      1370      1380   
pF1KA0 APLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALE
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

          1390      1400      1410      1420      1430      1440   
pF1KA0 RRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDH
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

          1450      1460      1470      1480  
pF1KA0 SPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
             1510      1520      1530         

>>CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1560 aa)
 initn: 5505 init1: 3556 opt: 7293  Z-score: 6820.4  bits: 1274.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8203; 81.3% identity (89.5% similar) in 1528 aa overlap (36-1482:36-1560)

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pF1KA0 DEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRF
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pF1KA0 TPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSK--------
       :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::        
CCDS14 TPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGY
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pF1KA0 -------------------------------------------------QCNTHPFDNEV
                                                        ::::.::::: 
CCDS14 EAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPFDNEE
         130       140       150       160       170       180     

      130       140       150       160       170       180        
pF1KA0 KDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKM
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.:::::::::: ::::
CCDS14 KDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKM
         190       200       210       220       230       240     

      190       200           210       220       230              
pF1KA0 MGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHL--------SLE
       ::::::::::  :..::      :::::.::.: .:  .: ::  :  :        : :
CCDS14 MGLGLMAKDK--TLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPE
         250         260       270       280       290       300   

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA0 PCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPR
       :::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.:::::::::::::::::::::.
CCDS14 PCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPK
           310       320       330       340       350       360   

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA0 GIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEK
       :.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS14 GVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEK
           370       380       390       400       410       420   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA0 EFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLD
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::.:::::::::::::::.
CCDS14 EFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLE
           430       440       450       460       470       480   

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 QSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAE
           490       500       510       520       530       540   

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA0 HLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHS
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHS
           550       560       570       580       590       600   

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pF1KA0 GFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::
CCDS14 GFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLA
           610       620       630       640       650       660   

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 VAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYD
       .::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYD
           670       680       690       700       710       720   

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 CPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 CPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEV
           730       740       750       760       770       780   

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 EDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVA---RM
       :::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::....::::::: :   :.
CCDS14 EDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRV
           790       800       810       820       830       840   

           780       790       800       810       820       830   
pF1KA0 DTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRS
          :.::::::..:.::..:::::::::::: :::::::::::::::::.::::::::.:
CCDS14 AGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQS
           850       860       870       880       890       900   

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 LLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASS
       :::::.:::::::::.:::.:::::.::::::..:::::.::.:..:.:::: ::..: :
CCDS14 LLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPS
           910       920       930       940       950       960   

           900       910       920       930       940       950   
pF1KA0 PSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALK
       :.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS14 PAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALK
           970       980       990      1000      1010      1020   

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KA0 EALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWRE
       :::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWRE
          1030      1040      1050      1060      1070      1080   

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KA0 KASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::::::
CCDS14 KASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDP
          1090      1100      1110      1120      1130      1140   

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KA0 GSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::: ::::::::: ::.:.::::
CCDS14 GSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCD
          1150      1160      1170      1180      1190      1200   

          1140      1150      1160      1170      1180      1190   
pF1KA0 LCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLV
       ::::::::.:::::.::.::.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLV
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

          1200      1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KA0 ALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEE
       :::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::: .::::::.:::.:::::
CCDS14 ALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRPEE
          1270      1280      1290      1300      1310      1320   

          1260      1270      1280      1290         1300      1310
pF1KA0 ASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGS---DLELLSSLLPQ
          : .: : ::.:::::... ::::::::::::::::..:: .::   :::::::::::
CCDS14 PPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQ
          1330      1340      1350      1360      1370      1380   

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA0 LTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKF
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: 
CCDS14 LTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKA
          1390      1400      1410      1420      1430      1440   

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KA0 EHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKA
       :..:::.:.::::::::: :::.: . .. ...::. ::.::::  ..  .:::. .:..
CCDS14 ERHGSRARGRALERRRRR-KVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEET
          1450      1460       1470      1480      1490      1500  

             1440      1450         1460      1470         1480  
pF1KA0 DRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKD---SGSSAACPSLMPLLQL---SYSDEQQL
         :.      :  ::  . :::.:.  .   :: ::   .: : :.:   .   .:::
CCDS14 GGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
           1510      1520      1530      1540      1550      1560

>>CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1559 aa)
 initn: 5498 init1: 3556 opt: 7291  Z-score: 6818.5  bits: 1274.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8202; 81.3% identity (89.5% similar) in 1528 aa overlap (35-1482:35-1559)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KA0 CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFR
           10        20        30        40        50        60    

           70        80        90       100       110              
pF1KA0 FTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKQ------
       ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::       
CCDS65 FTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGG
           70        80        90       100       110       120    

                                                        120        
pF1KA0 --------------------------------------------------CNTHPFDNEV
                                                         :::.::::: 
CCDS65 YEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVCNTRPFDNEE
          130       140       150       160       170       180    

      130       140       150       160       170       180        
pF1KA0 KDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKM
       :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.:::::::::: ::::
CCDS65 KDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKM
          190       200       210       220       230       240    

      190       200           210       220       230              
pF1KA0 MGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHL--------SLE
       ::::::::::  :..::      :::::.::.: .:  .: ::  :  :        : :
CCDS65 MGLGLMAKDK--TLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSHSPE
          250         260       270       280       290       300  

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA0 PCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPR
       :::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.:::::::::::::::::::::.
CCDS65 PCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPK
            310       320       330       340       350       360  

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA0 GIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEK
       :.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS65 GVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTELVEK
            370       380       390       400       410       420  

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA0 EFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLD
       ::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::.:::::::::::::::.
CCDS65 EFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLE
            430       440       450       460       470       480  

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 QSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAE
            490       500       510       520       530       540  

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA0 HLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHS
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHS
            550       560       570       580       590       600  

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA0 GFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::
CCDS65 GFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAACPEKLDLNLA
            610       620       630       640       650       660  

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 VAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYD
       .::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYD
            670       680       690       700       710       720  

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 CPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::
CCDS65 CPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEV
            730       740       750       760       770       780  

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 EDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVA---RM
       :::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::....::::::: :   :.
CCDS65 EDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRV
            790       800       810       820       830       840  

           780       790       800       810       820       830   
pF1KA0 DTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRS
          :.::::::..:.::..:::::::::::: :::::::::::::::::.::::::::.:
CCDS65 AGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQS
            850       860       870       880       890       900  

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 LLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASS
       :::::.:::::::::.:::.:::::.::::::..:::::.::.:..:.:::: ::..: :
CCDS65 LLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPS
            910       920       930       940       950       960  

           900       910       920       930       940       950   
pF1KA0 PSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALK
       :.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS65 PAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALK
            970       980       990      1000      1010      1020  

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KA0 EALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWRE
       :::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWRE
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KA0 KASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. :::::::::::::::
CCDS65 KASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDP
           1090      1100      1110      1120      1130      1140  

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KA0 GSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::: ::::::::: ::.:.::::
CCDS65 GSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCD
           1150      1160      1170      1180      1190      1200  

          1140      1150      1160      1170      1180      1190   
pF1KA0 LCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLV
       ::::::::.:::::.::.::.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLV
           1210      1220      1230      1240      1250      1260  

          1200      1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KA0 ALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEE
       :::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::: .::::::.:::.:::::
CCDS65 ALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAELRQRLQAEPRPEE
           1270      1280      1290      1300      1310      1320  

          1260      1270      1280      1290         1300      1310
pF1KA0 ASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGS---DLELLSSLLPQ
          : .: : ::.:::::... ::::::::::::::::..:: .::   :::::::::::
CCDS65 PPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQ
           1330      1340      1350      1360      1370      1380  

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA0 LTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKF
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: 
CCDS65 LTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKA
           1390      1400      1410      1420      1430      1440  

             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KA0 EHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKA
       :..:::.:.::::::::: :::.: . .. ...::. ::.::::  ..  .:::. .:..
CCDS65 ERHGSRARGRALERRRRR-KVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEEET
           1450      1460       1470      1480      1490      1500 

             1440      1450         1460      1470         1480  
pF1KA0 DRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKD---SGSSAACPSLMPLLQL---SYSDEQQL
         :.      :  ::  . :::.:.  .   :: ::   .: : :.:   .   .:::
CCDS65 GGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
            1510      1520      1530      1540      1550         

>>CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY               (1570 aa)
 initn: 8083 init1: 7273 opt: 7273  Z-score: 6801.6  bits: 1271.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9442; 94.2% identity (94.2% similar) in 1514 aa overlap (57-1482:57-1570)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KA0 PLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYL
         30        40        50        60        70        80      

         90       100       110                                    
pF1KA0 DQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSK-----------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS55 DQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPG
         90       100       110       120       130       140      

                                   120       130       140         
pF1KA0 ----------------------------QCNTHPFDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKF
                                   ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KNIGSLLRSHYERIIYPYEMFQSGANHVQCNTHPFDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKF
        150       160       170       180       190       200      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KA0 SSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCP
        210       220       230       240       250       260      

     210       220       230       240       250       260         
pF1KA0 PTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDED
        270       280       290       300       310       320      

     270       280       290       300       310       320         
pF1KA0 DKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQS
        330       340       350       360       370       380      

     330       340       350       360       370       380         
pF1KA0 FGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVS
        390       400       410       420       430       440      

     390       400                                      410        
pF1KA0 NSKQNLSPEEK-------------------------------EYATSGWNLNVMPVLDQS
       :::::::::::                               ::::::::::::::::::
CCDS55 NSKQNLSPEEKRQSLTVLTRLISSFWAQAVLPPWPPKVLGLQEYATSGWNLNVMPVLDQS
        450       460       470       480       490       500      

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 VLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHL
        510       520       530       540       550       560      

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 EEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGF
        570       580       590       600       610       620      

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 NQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVA
        630       640       650       660       670       680      

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 VHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCP
        690       700       710       720       730       740      

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 DGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVED
        750       760       770       780       790       800      

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA0 GRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTPQL
        810       820       830       840       850       860      

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA0 TLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERG
        870       880       890       900       910       920      

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA0 QQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDK
        930       940       950       960       970       980      

      900       910       920       930       940       950        
pF1KA0 ARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTK
        990      1000      1010      1020      1030      1040      

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KA0 AQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKT
       1050      1060      1070      1080      1090      1100      

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KA0 FLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSAQDLRDPGSVIV
       1110      1120      1130      1140      1150      1160      

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
pF1KA0 AFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDW
       1170      1180      1190      1200      1210      1220      

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
pF1KA0 FHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRL
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

     1200      1210      1220      1230      1240      1250        
pF1KA0 PVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYT
       1290      1300      1310      1320      1330      1340      

     1260      1270      1280      1290      1300      1310        
pF1KA0 SATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSDLELLSSLLPQLTGPVLEL
       1350      1360      1370      1380      1390      1400      

     1320      1330      1340      1350      1360      1370        
pF1KA0 PEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTR
       1410      1420      1430      1440      1450      1460      

     1380      1390      1400      1410      1420      1430        
pF1KA0 SRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLT
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

     1440      1450      1460      1470      1480  
pF1KA0 PSTDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PSTDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
       1530      1540      1550      1560      1570

>--
 initn: 436 init1: 436 opt: 436  Z-score: 404.9  bits: 87.7 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 436; 100.0% identity (100.0% similar) in 56 aa overlap (1-56:1-56)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS55 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKQCN
                                                                   
CCDS55 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLSKIVI
               70        80        90       100       110       120

>>CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX               (1379 aa)
 initn: 3683 init1: 3683 opt: 7263  Z-score: 6793.1  bits: 1269.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7734; 84.3% identity (92.6% similar) in 1366 aa overlap (1-1346:1-1349)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEV
       :::: :.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::     ..:: 
CCDS55 MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPA-----IVVEE
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110          
pF1KA0 DNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKIL--DLYSLSK-
        ...   . .:  .. ::   .:::        .  :: :.  . :: .   ..:. .  
CCDS55 GGYEAICKDRRWARV-AQ---RLNYPPG-----KNIGSLLR-SHYERIVYPYEMYQSGAN
          60        70                 80         90       100     

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA0 --QCNTHPFDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEPTEEDIEKHPE
         ::::.::::: :::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::.::
CCDS55 LVQCNTRPFDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPE
         110       120       130       140       150       160     

         180       190       200           210       220       230 
pF1KA0 LKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKK----VTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQ
       :::::::: :::::::::::::  ::..::      :::::.::.: .:  .: ::  : 
CCDS55 LKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKD--KTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKT
         170       180         190       200       210       220   

                     240       250       260       270       280   
pF1KA0 HL--------SLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYH
        :        : ::::: ::.::.:::.::::.::.:..:::::::::::.:::::::::
CCDS55 FLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYH
           230       240       250       260       270       280   

           290       300       310       320       330       340   
pF1KA0 IFCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFN
       ::::::::::::.:.::::::..::::.:::::::::::.::.::::::::::::.::::
CCDS55 IFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMADSFKADYFN
           290       300       310       320       330       340   

           350       360       370       380       390       400   
pF1KA0 MPVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYA
       :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::..:.:::.:::
CCDS55 MPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRHLTPEEEEYA
           350       360       370       380       390       400   

           410       420       430       440       450       460   
pF1KA0 TSGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGE
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGE
           410       420       430       440       450       460   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KA0 PKTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCA
       :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCA
           470       480       490       500       510       520   

           530       540       550       560       570       580   
pF1KA0 GEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICK
           530       540       550       560       570       580   

           590       600       610       620       630       640   
pF1KA0 MAAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKC
       ::: :: ::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS55 MAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKC
           590       600       610       620       630       640   

           650       660       670       680       690       700   
pF1KA0 KTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::
CCDS55 KTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLHKLKVRAESF
           650       660       670       680       690       700   

           710       720       730       740       750       760   
pF1KA0 DTWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVL
       ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::.:::....:
CCDS55 DTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRAL
           710       720       730       740       750       760   

           770          780       790       800       810       820
pF1KA0 GLVSGQVA---RMDTPQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREA
       :::::: :   :.   :.::::::..:.::..:::::::::::: :::::::::::::::
CCDS55 GLVSGQEAGPHRVAGLQMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREA
           770       780       790       800       810       820   

              830       840       850       860       870       880
pF1KA0 LATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIM
       ::.::::::::.::::::.:::::::::.:::.:::::.::::::..:::::.::.:..:
CCDS55 LASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVM
           830       840       850       860       870       880   

              890       900       910       920       930       940
pF1KA0 QGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETE
       .:::: ::..: ::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:
CCDS55 RGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPATLEAIIREAE
           890       900       910       920       930       940   

              950       960       970       980       990      1000
pF1KA0 NIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQ
       ::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQ
           950       960       970       980       990      1000   

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
pF1KA0 LELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKALGLYQCDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::. ::
CCDS55 LELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDT
          1010      1020      1030      1040      1050      1060   

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KA0 ELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :  ::: ::::::
CCDS55 ELLGLSAQDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVC
          1070      1080      1090      1100      1110      1120   

             1130      1140      1150      1160      1170      1180
pF1KA0 GQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRS
       ::: ::.:.::::::::::::.:::::.::.::.:. :::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRS
          1130      1140      1150      1160      1170      1180   

             1190      1200      1210      1220      1230      1240
pF1KA0 RRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::: .:::
CCDS55 RRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASEDVTALLGRLAE
          1190      1200      1210      1220      1230      1240   

             1250      1260      1270      1280      1290      1300
pF1KA0 LRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQGLLENGDSVTSPENMAPGKGSD
       :::.:::.:::::   : .: : ::.:::::... ::::::::::::::::..:: .:::
CCDS55 LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSD
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

             1310      1320      1330      1340      1350      1360
pF1KA0 LELLSSLLPQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLDR
       ::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::              
CCDS55 LELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIPESLDFCILTPRYC
          1310      1320      1330      1340      1350      1360   

             1370      1380      1390      1400      1410      1420
pF1KA0 IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVG
                                                                   
CCDS55 SDLSSWGPAPGVFPPW                                            
          1370                                                     

>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12              (1690 aa)
 initn: 4711 init1: 2660 opt: 3801  Z-score: 3552.8  bits: 670.2 E(32554): 1.4e-191
Smith-Waterman score: 4751; 48.8% identity (72.0% similar) in 1562 aa overlap (3-1409:6-1525)

                    10        20        30        40        50     
pF1KA0    MEPG--CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPP
            ::    ::.:::::::::::: :: :::..:..:::.:::.:::::::: :::::
CCDS41 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPP
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KA0 FAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSL
       :: :: .:::::::::::::::.:::.:..:::.:::::.:::.:::: :::::::::.:
CCDS41 FACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYAL
               70        80        90       100       110       120

         120        130                                            
pF1KA0 SKQCNTHP-FDNEVKDKEY-------------------KPH-------------------
       ::   ..  :.  .:.:..                   : :                   
CCDS41 SKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMG
              130       140       150       160       170       180

            140       150           160               170       180
pF1KA0 -SIP---LRQSVQPSKFSSYSRRAK----RLQPDPEPTEE--------DIEKHPELKKLQ
        ..:   :...:.:  .:. .. .     :..  :. :..        :. .. ::::::
CCDS41 VQMPNLDLKEKVEPEVLSTDTQTSPEPGTRMNILPKRTRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQ
              190       200       210       220       230       240

              190       200         210       220       230        
pF1KA0 IYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTV--HKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLEPC
       :.: :::..::.. .:::.  :  ..:::               : :...  :       
CCDS41 IFGAGPKVVGLAMGTKDKEDEVTRRRKVT---------------NRSDAFNMQ-------
              250       260                      270               

      240       250       260       270       280       290        
pF1KA0 TKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPRGI
           :. ::.  :..:.: :.:. :.::...::::.::::::.:: :::.::::..:.: 
CCDS41 ----MRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGD
          280       290       300       310       320       330    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 WRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEF
       ::::::.  ::..: ::::::::..::.:::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS41 WRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEF
          340       350       360       370       380       390    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 WRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGWNLNVMPVLDQS
       ::::::::::: ::::::: ::.:::::::....... :::.::: :::::: ::::.::
CCDS41 WRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQS
          400       410       420       430       440       450    

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 VLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHL
       :: :::.:::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::: :::.:
CCDS41 VLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQL
          460       470       480       490       500       510    

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 EEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGF
       ::::. :.::::.:::::::::::.::::.:: ::::: ::::::::::.::::::::::
CCDS41 EEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGF
          520       530       540       550       560       570    

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 NQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVA
       ::::::::::::::::::: ::::..:::::::.::::::::: :::: :: ::..::. 
CCDS41 NQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAM
          580       590       600       610       620       630    

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 VHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCP
       : ::. .:..:: :::..... ::  .:.:.:::.:::::::  :.::::::::.:   :
CCDS41 VCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNP
          640       650       660       670       680       690    

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 DGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVED
       . :::: : .::: :  ... ::::: :..::..:. .:.::.:.:::...:  :: .. 
CCDS41 ERLVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANF
          700       710       720       730       740       750    

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA0 GRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQVARMDTP--
       ..:... :::..  .:..:..:...:...:.. ..:.:.: . .  :.: .  . ..:  
CCDS41 NHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDS
          760       770       780       790       800       810    

             780       790       800       810       820       830 
pF1KA0 -----QLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLL
            .::. ::.....:. ::::.. :  .::..:..:: .. .:.::.     . . :
CCDS41 GRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKL
          820       830       840       850       860       870    

             840       850       860       870       880       890 
pF1KA0 RSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQALAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIA
       . :.. :..: ::.::  .:.:...::.:::::. .:. . .. .: .:. :.  :. .:
CCDS41 QMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLS-DPQQVTLDVMKKLIDSGVGLA
          880       890       900       910        920       930   

             900       910       920       930       940       950 
pF1KA0 SSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQA
          .:.:: ::::::::..:::::::. ::.:: .:  :.::.:. :..:::. :::. .
CCDS41 PHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLS
           940       950       960       970       980       990   

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KA0 LKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSW
       ::::: ::. : : :. ::.:..:  :..::.: : :: .:: :: : :.: :: .:..:
CCDS41 LKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAW
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

            1020      1030         1040      1050      1060        
pF1KA0 REKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAG---SDSTKRSRWMEKALGLYQCDTELLGLSA-
       ::....::::::: .:::.:: : .: :   : ...:..  :      . : .:  ::  
CCDS41 RERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDLDLEPLSDL
          1060      1070      1080      1090      1100      1110   

          1070      1080      1090      1100      1110      1120   
pF1KA0 ----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQV
           .. :: . :...::: :::: :.. .:: .: :: . ..  .     ...:.: ..
CCDS41 EEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAKMT-MVDRI---EEVKFCICRKT
          1120      1130      1140      1150          1160         

          1130      1140      1150      1160      1170      1180   
pF1KA0 PAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRP
        .:  .:::.::.::::..:: .:.  .. : :       .:   ..:::::::::::::
CCDS41 ASGF-MLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGS-------SWQAKEVKFLCPLCMRSRRP
    1170       1180      1190      1200             1210      1220 

          1190      1200      1210      1220      1230      1240   
pF1KA0 RLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQ
       ::::::.:::.::.::::::::::::::::::..::::::.:::...... : .:. : :
CCDS41 RLETILSLLVSLQKLPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQ
            1230      1240      1250      1260      1270      1280 

             1250       1260                                       
pF1KA0 QL---QAKPRPEEA-SVYTSATACDPIREG------------------------------
       ..    :. . :.  :.  . .: .:  .:                              
CCDS41 RMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSVSSSPRQTMDYDDE
            1290      1300      1310      1320      1330      1340 

       1270      1280       1290      1300                         
pF1KA0 ---SGNNISKVQGL-LENGDSVTSPENMAPGKGSDLEL----------------------
          : ..: .. :  ...  :: :  .. :.   : :.                      
CCDS41 ETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKSSSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHA
            1350      1360      1370      1380      1390      1400 

                              1310       1320      1330      1340  
pF1KA0 --------------------LSSLLPQ-LTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDE
                            : :.:. :  :::::  . .: :::::: ::::::.:::
CCDS41 YSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDE
            1410      1420      1430      1440      1450      1460 

           1350      1360      1370      1380      1390      1400  
pF1KA0 NHSIWQLLQAGQPPDLDRIRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQ
       .. ::..::: .::. ::.  ..: ...:..  .....   ...:..:...   ::.:  
CCDS41 TQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGKDSSEKKRKRKLEK---VEQLFG
            1470      1480      1490      1500      1510           

           1410      1420      1430      1440      1450      1460  
pF1KA0 QELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKDSGSS
       .  :...                                                     
CCDS41 EGKQKSKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKAAAAKVELVKE
     1520      1530      1540      1550      1560      1570        

>>CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1              (1544 aa)
 initn: 4253 init1: 2529 opt: 3442  Z-score: 3217.4  bits: 608.0 E(32554): 6.8e-173
Smith-Waterman score: 4202; 44.9% identity (69.3% similar) in 1551 aa overlap (7-1468:25-1490)

                                 10        20        30        40  
pF1KA0                   MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
                               ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS30 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KA0 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
       :::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS30 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
               70        80        90       100       110       120

            110                 120                                
pF1KA0 PNVERKILDLYSLSKQ----------CN--------------------TH----------
       :.::::::::..:.:           :.                    .:          
CCDS30 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
              130       140       150       160       170       180

                             130       140       150       160     
pF1KA0 PFD-----------------NEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEP
       :..                 ...::::::::.:: :::::::.    .:::::.. .   
CCDS30 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM-
              190       200       210       220       230          

         170       180       190       200       210       220     
pF1KA0 TEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVS
          .:. .::                   .. . ....... :: :   ..:.   ....
CCDS30 ---NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSIK
        240                        250       260        270        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KA0 STLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIF
       .  ....  .    :   . :.....   .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: :
CCDS30 QEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTF
      280       290       300        310       320       330       

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA0 CLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMP
       ::.::: ..:.: ::::::.  ::..: ::::::::...:.:..::::::.:::::::::
CCDS30 CLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMP
       340       350       360       370       380       390       

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pF1KA0 VHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATS
       ::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.::  :
CCDS30 VHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDS
       400       410       420       430       440       450       

         410       420       430       440       450       460     
pF1KA0 GWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
       ::::: :::..:::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::::::::::::::
CCDS30 GWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
       460       470       480       490       500       510       

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pF1KA0 TWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGE
       ::::::. :::.::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: ::::::::
CCDS30 TWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGE
       520       530       540       550       560       570       

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pF1KA0 FVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMA
       ::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::::::.:.:::::
CCDS30 FVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMA
       580       590       600       610       620       630       

         590       600       610       620       630       640     
pF1KA0 AFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKT
       .  ..::. .: .:.:.: ::...:. ::... . :: ..::  :::::::::::.::::
CCDS30 SKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKT
       640       650       660       670       680       690       

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pF1KA0 TCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDT
       :::.::..:   :  :::: :...::.:   .  ::::::::.:  :.. ::.::::.. 
CCDS30 TCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNE
       700       710       720       730       740       750       

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pF1KA0 WANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGL
       :: .:  :::.. ..:.:.  ..::  :.. ..::...::..:.   ...: : . .  :
CCDS30 WALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQL
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pF1KA0 VSGQV-ARMDTP------QLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAR
       ..:.  .:. .       :::..::: .. :. .:::.. :   .::.:..:: .: ...
CCDS30 LNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQ
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pF1KA0 EALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGSL
       . :.    : . :..::. . .. ::.:.  ... ..:::.::.::.:: : ::.   .:
CCDS30 KLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TL
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pF1KA0 VIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIR
         :. :. .:. .:   .:.:: :.::::::..:.:..::.  :.:: .:   .: . ..
CCDS30 DDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVK
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pF1KA0 ETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEE
       : :.::..:::  :::... .:. :. ::. .: : . : :: :  ::. ::..:: :. 
CCDS30 EIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNS
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pF1KA0 LRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GL
       : .::  :  ...:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::. : ... : . 
CCDS30 LPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNG
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

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pF1KA0 YQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLM
        . .:.: .::       . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .:   :.:  .
CCDS30 KKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--L
        1120      1130      1140      1150      1160        1170   

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pF1KA0 ASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDT
        .   .::.: ..::.  ..::.::.: :: .::.:: .         :. :  :     
CCDS30 QDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-----
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pF1KA0 KFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASED
         ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: .
CCDS30 --LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGN
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pF1KA0 VTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSV
       .        .. :.                      : :::   :. :   : . . ..:
CCDS30 L--------KFVQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKV
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pF1KA0 TSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELP-EAIRAPLEELMMEGDLLEVT
       ..:    ::  :     : .  .: :  :  ::    .: ...   ..::.::..::.:.
CCDS30 SQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSC-IPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVS
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pF1KA0 LDENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQG
       : : . ..: : :   :  . ::   .:   : .    .:.:    .:::. .:.   .:
CCDS30 LPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREG
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pF1KA0 RNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSL
        . :   ..  . .  ... :  .  .. .... . .:   ..  .  ::  : .. .  
CCDS30 LSSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYS
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pF1KA0 QHKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL                               
       ...::   .: ::..                                             
CCDS30 EQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRC
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CCDS81 LPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPR
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       .:::::::::::::::.::::::.::.:::.::::.::::::::..:.:           
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pF1KA0 CN--------------------TH----------PFD-----------------NEVKDK
       :.                    .:          :..                 ...:::
CCDS81 CKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDK
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pF1KA0 EYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPE-----PTEE---DIEKHPELKKLQIYG
       :::::.:: :::::::.    .:::::.. . .     :  :    :  : .:. :.  .
CCDS81 EYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAERQSLAVLPRLECSGAILAHCNLRLLDSSN
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pF1KA0 PGP---KMMGLGLMAKD----KDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVSSTLLKQHLSLE
        .    . :.. .  ..    . ....... :: :   ..:.   .....  ....  . 
CCDS81 SSASASQAMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIV
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pF1KA0 PCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPR
          :   . :.....   .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: :::.::: ..:.
CCDS81 ENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPK
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       : ::::::.  ::..: ::::::::...:.:..::::::.::::::::::::::::::::
CCDS81 GDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEK
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       :::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.::  :::::: :::..
CCDS81 EFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVME
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       :::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. :::
CCDS81 QSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAE
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       .::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: :::::::::::::::::::
CCDS81 QLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHS
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CCDS81 GFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVA
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        .:.:.: ::...:. ::... . :: ..::  :::::::::::.:::::::.::..:  
CCDS81 STVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSC
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CCDS81 KPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEA
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pF1KA0 EDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQV-ARMDT
       . ..:.:.  ..::  :.. ..::...::..:.   ...: : . .  :..:.  .:. .
CCDS81 KINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRS
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pF1KA0 P------QLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPG
              :::..::: .. :. .:::.. :   .::.:..:: .: .... :.    : .
CCDS81 GGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAA
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CCDS81 ELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGV
          930       940       950       960         970       980  

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pF1KA0 KIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPN
        .:   .:.:: :.::::::..:.:..::.  :.:: .:   .: . ..: :.::..:::
CCDS81 GLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPN
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KA0 IQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTA
         :::... .:. :. ::. .: : . : :: :  ::. ::..:: :. : .::  :  .
CCDS81 GAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEV
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

     1010      1020      1030      1040       1050       1060      
pF1KA0 HSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GLYQCDTELLGLS
       ..:.: : .::: .:: :.:::::::  : :  . ::. : ... : .  . .:.: .::
CCDS81 QAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLS
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

            1070      1080      1090      1100      1110      1120 
pF1KA0 A-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCG
              . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .:   :.:  . .   .::.: 
CCDS81 DLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--LQDVDIKICLCQ
           1170      1180      1190      1200          1210        

            1130      1140      1150      1160      1170      1180 
pF1KA0 QVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSR
       ..::.  ..::.::.: :: .::.:: .         :. :  :       ::: : ::.
CCDS81 KAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-------LCPHCRRSE
     1220       1230      1240               1250             1260 

            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KA0 RPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAEL
       .: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: ..        ..
CCDS81 KPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNL--------KF
            1270      1280      1290      1300      1310           

            1250      1260      1270         1280      1290        
pF1KA0 RQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSVTSPENMAPGKG
        :.                      : :::   :. :   : . . ..:..:    ::  
CCDS81 VQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQP----PGTT
                                1320      1330      1340           

          1300        1310       1320      1330      1340      1350
pF1KA0 S-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELP-EAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLL
       :     : .  .: :  :  ::    .: ...   ..::.::..::.:.: : . ..: :
CCDS81 SFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSC-IPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTL
      1350      1360      1370       1380      1390      1400      

               1360         1370      1380      1390      1400     
pF1KA0 QAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQEL
        :   :  . ::   .:   : .    .:.:    .:::. .:.   .: . :   ..  
CCDS81 LAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERW-ERVK
       1410      1420      1430       1440      1450      1460     

        1410      1420      1430      1440      1450       1460    
pF1KA0 QSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKDS-GSSAA
       . .  ... :  .  .. .... . .:   ..  .  ::  : .. .  ...::   .: 
CCDS81 KMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYSEQEDSEDEDAI
         1470      1480      1490      1500        1510      1520  

         1470      1480                                          
pF1KA0 CPSLMPLLQLSYSDEQQL                                        
       ::..                                                      
CCDS81 CPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
           1530      1540      1550      1560      1570      1580

>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11            (506 aa)
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Smith-Waterman score: 506; 32.4% identity (56.8% similar) in 352 aa overlap (318-660:83-396)

       290       300       310       320       330       340       
pF1KA0 LPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMPVH
                                     : :  .. . .  :..    .:  .. : :
CCDS44 EWKARQMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPH
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pF1KA0 MVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATSGW
       .  ..: :...:.   :   .  . :::::     :: :  :... ::          : 
CCDS44 QNFADL-EQRYWK---SHPGNPPI-YGADIS----GSLFEESTKQWNL----------GH
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pF1KA0 NLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
         ... .:.:   : .   : :...:.:: ::  ..: :: ::   :::::::.::::::
CCDS44 LGTILDLLEQE--CGVV--IEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTW
           160           170       180       190       200         

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pF1KA0 YGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFV
       : ::   ..:::.. . : :..  .   .:.. :.:..:..:  .:.:    .: ::::.
CCDS44 YVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFM
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KA0 ITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGR---QCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKM
       .::: .::.:::.:.: :::.:: :  :.  :.   ::      .    .:: . .. ..
CCDS44 VTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTV----TFSMDPFV-RI
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pF1KA0 AAFPETLDL-----NLAVAVHKEMFIM-VQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDER
       .  ::. .:     .::.. : :  .   ::    :  .. . .. . :    :::.   
CCDS44 VQ-PESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRDDIVLRRAALGLR----LLPNLTA
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       ::     :  .:.  ::. : :                                      
CCDS44 QC----PTQPVSSGHCYN-PKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLTLGMSARVLLPSTGS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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