FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2154, 347 aa 1>>>pF1KE2154 347 - 347 aa - 347 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4613+/-0.000834; mu= 16.1088+/- 0.050 mean_var=95.3602+/-19.959, 0's: 0 Z-trim(110.4): 208 B-trim: 453 in 2/50 Lambda= 0.131338 statistics sampled from 11303 (11549) to 11303 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16 Scan time: 2.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12130.1 LRG1 gene_id:116844|Hs108|chr19 ( 347) 2317 449.1 2.5e-126 CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 ( 581) 393 84.8 2e-16 CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 518) 383 82.8 6.8e-16 CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 519) 383 82.8 6.8e-16 CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 590) 383 82.9 7.4e-16 CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 ( 591) 383 82.9 7.5e-16 CCDS54068.1 GP1BA gene_id:2811|Hs108|chr17 ( 652) 371 80.7 3.9e-15 CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 365 79.3 6.2e-15 CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 359 78.4 1.9e-14 CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 356 77.8 3e-14 CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 349 76.5 7.8e-14 CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 343 75.3 1.5e-13 CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 343 75.3 1.5e-13 CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 343 75.3 1.5e-13 CCDS8057.1 FLRT1 gene_id:23769|Hs108|chr11 ( 674) 336 74.0 3.9e-13 CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 334 73.6 4.4e-13 CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 333 73.4 5.2e-13 CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 333 73.4 5.3e-13 CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 326 72.3 1.9e-12 CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 315 70.2 8e-12 CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 304 67.9 2.3e-11 CCDS10514.1 VASN gene_id:114990|Hs108|chr16 ( 673) 305 68.2 2.3e-11 CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 299 66.9 4.2e-11 CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 293 65.7 8.6e-11 >>CCDS12130.1 LRG1 gene_id:116844|Hs108|chr19 (347 aa) initn: 2317 init1: 2317 opt: 2317 Z-score: 2381.6 bits: 449.1 E(32554): 2.5e-126 Smith-Waterman score: 2317; 99.7% identity (99.7% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQLRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQLRV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRKLP :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LDLTRNALTGLPPGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRKLP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 PGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDLRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 PGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDLRY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPNWDMRDGFDISGNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPNWDMRDGFDISGNP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 WICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKGQTLLAVAKSQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 WICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKGQTLLAVAKSQ 310 320 330 340 >>CCDS7270.1 LRRTM3 gene_id:347731|Hs108|chr10 (581 aa) initn: 243 init1: 243 opt: 393 Z-score: 408.4 bits: 84.8 E(32554): 2e-16 Smith-Waterman score: 393; 29.8% identity (63.6% similar) in 275 aa overlap (73-346:90-357) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 CQVFRSDHGSSISCQPPAEIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSN : .. ..... : ..: .:.:: :::: CCDS72 SAGCLGLSLRYNSLQKLKYNQFKGLNQLTWLYLDHNHISNIDENAFNGIRRLKELILSSN 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 GLESLSPEFLRPVPQLRVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHG . . . .::: .:: :::. : : .: : :.. : .: :. :.:... : .. 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CCDS72 DAVKNYSICGKSTTERFDLARALPKPTFKPKLPRPKHESKPPLPPTVGATEPGPETDADA 360 370 380 390 400 410 >>CCDS46347.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (518 aa) initn: 336 init1: 299 opt: 383 Z-score: 398.8 bits: 82.8 E(32554): 6.8e-16 Smith-Waterman score: 392; 27.1% identity (56.5% similar) in 340 aa overlap (22-338:21-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA ::.:..: .:. ::.: : : :. . :. : CCDS46 MGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQ----RACPKNC---RCD-GKIVYCESHA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 --EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQL .:: . . . :...: .. .: .: . : ..: :.:. : . :.. . .. . .: CCDS46 FADIPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRK . : :. : .: : . :. .: .: :. :.:..:. ..::. : : : .: :. 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CCDS46 EKVSDAVETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPG 350 360 370 380 390 400 >>CCDS74530.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (519 aa) initn: 336 init1: 299 opt: 383 Z-score: 398.8 bits: 82.8 E(32554): 6.8e-16 Smith-Waterman score: 392; 27.1% identity (56.5% similar) in 340 aa overlap (22-338:22-349) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA ::.:..: .:. ::.: : : :. . :. : CCDS74 MPGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQ----RACPKNC---RCD-GKIVYCESHA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 --EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQL .:: . . . :...: .. .: .: . : ..: :.:. : . :.. . .. . .: CCDS74 FADIPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRK . : :. : .: : . :. .: .: :. :.:..:. ..::. : : : .: :. CCDS74 KELILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LPPGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDL .: .. . : :::: :.:..: . . : :.:..:::: :... .. . .: CCDS74 VPIRVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RYLFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPN----------- : ..:. :.. .. : .: ::::.:.. .. : . : :: CCDS74 RSIYLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCL--PNLQKLNLDSNKL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE2 ----------WDMRDGFDISGNPWICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKG : .. .::: : :.... :. ::. : . ... ::::. ..: CCDS74 TNISQETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGN--KESTMICAGPKHIQG 300 310 320 330 340 340 pF1KE2 QTLLAVAKSQ . CCDS74 EKVSDAVETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPG 350 360 370 380 390 400 >>CCDS46346.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (590 aa) initn: 336 init1: 299 opt: 383 Z-score: 398.1 bits: 82.9 E(32554): 7.4e-16 Smith-Waterman score: 392; 27.1% identity (56.5% similar) in 340 aa overlap (22-338:21-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA ::.:..: .:. ::.: : : :. . :. : CCDS46 MGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQ----RACPKNC---RCD-GKIVYCESHA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 --EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQL .:: . . . :...: .. .: .: . : ..: :.:. : . :.. . .. . .: CCDS46 FADIPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRK . : :. : .: : . :. .: .: :. :.:..:. ..::. : : : .: :. 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CCDS46 EKVSDAVETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPG 350 360 370 380 390 400 >>CCDS82475.1 LRRTM4 gene_id:80059|Hs108|chr2 (591 aa) initn: 336 init1: 299 opt: 383 Z-score: 398.1 bits: 82.9 E(32554): 7.5e-16 Smith-Waterman score: 392; 27.1% identity (56.5% similar) in 340 aa overlap (22-338:22-349) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA ::.:..: .:. ::.: : : :. . :. : CCDS82 MPGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQ----RACPKNC---RCD-GKIVYCESHA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 --EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQL .:: . . . :...: .. .: .: . : ..: :.:. : . :.. . .. . .: CCDS82 FADIPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRK . : :. : .: : . :. .: .: :. :.:..:. ..::. : : : .: :. CCDS82 KELILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LPPGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDL .: .. . : :::: :.:..: . . : :.:..:::: :... .. . .: CCDS82 VPIRVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RYLFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPN----------- : ..:. :.. .. : .: ::::.:.. .. : . : :: CCDS82 RSIYLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCL--PNLQKLNLDSNKL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE2 ----------WDMRDGFDISGNPWICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKG : .. .::: : :.... :. ::. : . ... ::::. ..: CCDS82 TNISQETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGN--KESTMICAGPKHIQG 300 310 320 330 340 340 pF1KE2 QTLLAVAKSQ . CCDS82 EKVSDAVETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPTIFKPDVTQSTFETPSPSPG 350 360 370 380 390 400 >>CCDS54068.1 GP1BA gene_id:2811|Hs108|chr17 (652 aa) initn: 501 init1: 229 opt: 371 Z-score: 385.3 bits: 80.7 E(32554): 3.9e-15 Smith-Waterman score: 371; 34.8% identity (66.1% similar) in 233 aa overlap (91-322:26-244) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQLRV ::.: :.. .. .: .: :.. . . . CCDS54 MPLLLLLLLLPSPLHPHPICEVSKVASHL-EVNCDKRNLTALPPDLPKDTT---I 10 20 30 40 50 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRKLP : :..: : . . .. . : : : . .: :.:. : .:: :::: :.:..:: CCDS54 LHLSENLLYTFSLATLMPYTRLTQLNLDRCELTKLQVDGT--LPVLGTLDLSHNQLQSLP 60 70 80 90 100 190 200 210 220 230 pF1KE2 PGLLAN-FTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDLR ::.. . : .::.. :.: .:: ::: .:..:.:.::.:..: :: : : :. CCDS54 --LLGQTLPALTVLDVSFNRLTSLPLGALRGLGELQELYLKGNELKTLPPGLLTPTPKLE 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 YLFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPNWDMRDGFDISGN : : .:.:... :: ..::..:: : :..::: ..:.:...: : .: . :: CCDS54 KLSLANNNLTELPAGLLNGLENLDTLLLQENSLYTIPKGFFGSHLLPF-----AF-LHGN 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 pF1KE2 PWICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKGQTLLAVAKSQ ::.:. .. . :::: . .... CCDS54 PWLCNCEILYFRRWLQDNAENVYVWKQGVDVKAMTSNVASVQCDNSDKFPVYKYPGKGCP 230 240 250 260 270 280 >>CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 (420 aa) initn: 531 init1: 220 opt: 365 Z-score: 381.6 bits: 79.3 E(32554): 6.2e-15 Smith-Waterman score: 367; 30.6% identity (55.0% similar) in 320 aa overlap (25-343:17-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPA :::.: : .. : : . : ..::: CCDS79 MLPGLRRLLQAPASACLLLMLLALPLAAPSCPMLCTCYSSP--PTVSCQAN- 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 EIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQLRV :.. .: .: . :.: :..: ...: : . .: . CCDS79 ------------------NFSSVPLSL---PPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG--SNLLT 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE2 LDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQ-LEVLEVSWLHGLKALGHLDLSGNRLRKL : : : :. . : :. .:. : : .:. :. :: . ..::. : : : .: .: CCDS79 LWLFSNNLSTIYPGTFRHLQALEELDLGDNRHLRSLEPDTFQGLERLQSLHLYRCQLSSL 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 PPGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDLR : ... ... :. : : ::.: : ::. .: .: :.::.:..: . .. .: CCDS79 PGNIFRGLVSLQYLYLQENSLLHLQDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLD 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 YLFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPNWDMRDGFDISGN :.:.::.: : .::.:: .: .: : ::::::.: :.: :. .. . ...: CCDS79 RLLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLTILYLFNNSLASLPGEALADL--PSLEF---LRLNAN 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE2 PWICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKGQTLLAVAKSQ :: :: :. :.: . :..:. :: : .:. : :. CCDS79 PWACDCRARPLWAWFQRAR---VSSSDVTCATPPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRP 270 280 290 300 310 CCDS79 GSRARGNSSSNHLYGVAEAGAPPADPSTLYRDLPAEDSRGRQGGDAPTEDDYWGGYGGED 320 330 340 350 360 370 >>CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 (649 aa) initn: 309 init1: 154 opt: 359 Z-score: 373.0 bits: 78.4 E(32554): 1.9e-14 Smith-Waterman score: 359; 28.3% identity (59.6% similar) in 307 aa overlap (40-340:57-345) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 KSPGGIQPHVSRTLFLLLLLAASAWGVTLSPKDCQVFRSDHGSSISCQPPAEIPGYLPAD :.: .. .... . :... . : .. CCDS13 MAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVE 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TVHLAVEFFN-LTHLPANLLQGASKLQELHLSSNGLESLSPEFLRPVPQLRVLDLTRNAL ..: . : : ..:.:: . ..::::. :...... . : .: :. : : :.. CCDS13 RIYL---YHNSLDEFPTNL---PKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSV 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TG--LPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLHGL-KALGHLDLSGNRLRKLPPGLLA .. . : :. : : : :..:.: . . : :: ... .: :. ::. . : CCDS13 SAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLST--IPW--GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQ 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 NFTLLRTLDLGENQLET--LPPDLLRGPLQLERLHLEGNKLQVLGKDLLLPQPDLRYLFL ..: :. : : : :.. : .. . ..: .: : :.: . . :: .:: :.: CCDS13 GLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVN--LPGTNLRKLYL 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 NGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLWASLGQPNWDMRDGFDISGNPWIC . :.. :: .::. :::: ::.:::.:...:.:.. .: : . . .::: : CCDS13 QDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDL-----DNITQLILRNNPWYC 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 DQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQNDTRCAGPEAVKGQTLLAVAKSQ ... . :::. :. . : .:: :.:... CCDS13 GCKMKWVRDWLQSLPVKV-NVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGIVSTIQITT 310 320 330 340 350 360 CCDS13 AIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWK 370 380 390 400 410 420 >>CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 (713 aa) initn: 313 init1: 136 opt: 356 Z-score: 369.4 bits: 77.8 E(32554): 3e-14 Smith-Waterman score: 367; 27.6% identity (59.9% similar) in 359 aa overlap (9-347:11-358) 10 20 30 40 pF1KE2 MSSWSRQRPKSPGGIQ-PHVSRTLFLLLL---LAASAWGVTL-------SPK--DCQV : :: .. :: . ::: :. :.:.. ::.. :: .: : CCDS42 MARARGSPCPPLPPGRMSWPH-GALLFLWLFSPPLGAGGGGVAVTSAAGGGSPPATSCPV 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 FRS--DHGSSISC--QPPAEIPGYLPADTVHLAVEFFNLTHLPANLLQGASKLQELHLSS : ...: . : . ::.:. .:..: .: .. .. . .. .. .:. :.::. CCDS42 ACSCSNQASRVICTRRDLAEVPASIPVNTRYLNLQENGIQVIRTDTFKHLRHLEILQLSK 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 NGLESLSPEFLRPVPQLRVLDLTRNALTGLPSGLFQASATLDTLVLKENQLEVLEVSWLH : .... . .:.: .:.: : :: .:. :. . : : :..: .: . .. CCDS42 NLVRKIEVGAFNGLPSLNTLELFDNRLTTVPTQAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GLKALGHLDLSG-NRLRKLPPGLLANFTLLRTLDLGENQLETLPPDLLRGPLQLERLHLE . .: .:::. .::. . . . ... :: :.:: .:. .: : . ..::.:.: CCDS42 RVPSLRRLDLGELKRLEYISEAAFEGLVNLRYLNLGMCNLKDIPN--LTALVRLEELELS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 GNKLQVLGKDLLLPQPDLRYLFLNGNKLARVAAGAFQGLRQLDMLDLSNNSLASVPEGLW ::.:... . .:: :.: ..: . .::. :..:. :.::.:.: :.:. :. CCDS42 GNRLDLIRPGSFQGLTSLRKLWLMHAQVATIERNAFDDLKSLEELNLSHNNLMSLPHDLF 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE2 ASLGQPNWDMRDGFDISGNPWICDQNLSDLYRWLQAQKDKMFSQND--TRCAGPEAVKGQ . : . . .. ::: :. .. : :: :. . :.. .:: .: ..::. CCDS42 TPLHR-----LERVHLNHNPWHCNCDVLWLSWWL---KETVPSNTTCCARCHAPAGLKGR 300 310 320 330 340 340 pF1KE2 TLLAVAKSQ . . .:. CCDS42 YIGELDQSHFTCYAPVIVEPPTDLNVTEGMAAELKCRTGTSMTSVNWLTPNGTLMTHGSY 350 360 370 380 390 400 347 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 17:19:52 2016 done: Tue Nov 8 17:19:52 2016 Total Scan time: 2.260 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]