Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3363, 1070 aa
  1>>>pF1KE3363     1070 - 1070 aa - 1070 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7317+/-0.00132; mu= -4.2362+/- 0.076
 mean_var=429.9347+/-101.879, 0's: 0 Z-trim(109.6): 418  B-trim: 408 in 1/53
 Lambda= 0.061855
 statistics sampled from 10561 (11016) to 10561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  3.910

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1070) 7288 666.6 8.1e-191
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6           (1078) 7121 651.7 2.5e-186
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1014) 4304 400.3 1.1e-110
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            ( 940) 3595 337.0 1.2e-91
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1030) 3588 336.4   2e-91
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 760)  730 81.2 9.5e-15
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 790)  730 81.2 9.8e-15
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1           ( 796)  725 80.8 1.3e-14
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 803)  713 79.7 2.8e-14
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 864)  713 79.7   3e-14
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2             (1620)  715 80.2   4e-14
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 783)  706 79.1 4.3e-14
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6            (2347)  713 80.2 5.8e-14
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 822)  688 77.5 1.4e-13
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 817)  680 76.8 2.2e-13
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 825)  680 76.8 2.2e-13
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9           ( 838)  679 76.7 2.4e-13
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 885)  679 76.7 2.5e-13
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 869)  676 76.4 2.9e-13
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15         ( 845)  671 76.0 3.9e-13
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15         ( 890)  671 76.0 4.1e-13
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  675 76.6 4.2e-13
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  675 76.6 4.3e-13
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 626)  666 75.4 4.4e-13
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1           (1297)  672 76.3 4.9e-13
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19            ( 894)  666 75.6 5.6e-13
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1366)  667 75.9 6.9e-13
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1367)  667 75.9 6.9e-13
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 734)  659 74.8 7.5e-13
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937)  661 75.1 7.8e-13
CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17          (1374)  627 72.3 8.3e-12
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1            ( 855)  617 71.2 1.1e-11
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             ( 542)  606 70.0 1.6e-11
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2          ( 999)  609 70.5   2e-11
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1043)  606 70.3 2.5e-11
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1058)  606 70.3 2.5e-11
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1064)  606 70.3 2.6e-11
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1079)  606 70.3 2.6e-11
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1161)  606 70.3 2.7e-11
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1167)  606 70.3 2.7e-11
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             (1182)  606 70.3 2.7e-11
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9            ( 943)  599 69.6 3.6e-11
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1294)  602 70.0 3.7e-11
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3          (1351)  602 70.1 3.8e-11
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3           (1400)  602 70.1 3.9e-11
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976)  597 69.5 4.2e-11
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1130)  597 69.5 4.6e-11
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1149)  597 69.5 4.7e-11


>>CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1070 aa)
 initn: 7288 init1: 7288 opt: 7288  Z-score: 3539.2  bits: 666.6 E(32554): 8.1e-191
Smith-Waterman score: 7288; 100.0% identity (100.0% similar) in 1070 aa overlap (1-1070:1-1070)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE3 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
             1030      1040      1050      1060      1070

>>CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                (1078 aa)
 initn: 7119 init1: 7119 opt: 7121  Z-score: 3458.7  bits: 651.7 E(32554): 2.5e-186
Smith-Waterman score: 7121; 98.4% identity (98.9% similar) in 1065 aa overlap (6-1070:17-1078)

                          10        20        30        40         
pF1KE3            MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRA
                       ::  . ...:     . :   :::::::::::::::::::::::
CCDS59 MGSFLSGEKRPSAPTVGSAMEKKEFPTPPGRVGP---GTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRA
               10        20        30           40        50       

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE3 LLRCEVEAPGPVHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLRCEVEAPGPVHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTG
        60        70        80        90       100       110       

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE3 EEARSANASFNIKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EEARSANASFNIKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPL
       120       130       140       150       160       170       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE3 SDGQSNHTVSSKERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SDGQSNHTVSSKERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVL
       180       190       200       210       220       230       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE3 APQDVVVARYEEAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 APQDVVVARYEEAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLT
       240       250       260       270       280       290       

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE3 QVRPRNAGIYRCIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QVRPRNAGIYRCIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGL
       300       310       320       330       340       350       

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE3 PEPSVWWEHAGVRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PEPSVWWEHAGVRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVA
       360       370       380       390       400       410       

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE3 TVPSWLKKPQDSQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TVPSWLKKPQDSQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRIN
       420       430       440       450       460       470       

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE3 SVEVYDGTWYRCMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SVEVYDGTWYRCMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGR
       480       490       500       510       520       530       

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE3 EKPTIKWERADGSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EKPTIKWERADGSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVA
       540       550       560       570       580       590       

     590       600       610       620       630       640         
pF1KE3 VFITFKVEPERTTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VFITFKVEPERTTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSL
       600       610       620       630       640       650       

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE3 VIHDVAPEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VIHDVAPEDSGRYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSV
       660       670       680       690       700       710       

     710       720       730       740       750       760         
pF1KE3 GAAVAYIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAAVAYIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVAL
       720       730       740       750       760       770       

     770       780       790       800       810       820         
pF1KE3 TSLGSGPAATNKRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TSLGSGPAATNKRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLV
       780       790       800       810       820       830       

     830       840       850       860       870       880         
pF1KE3 KSLQSKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSLQSKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRI
       840       850       860       870       880       890       

     890       900       910       920       930       940         
pF1KE3 SKSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SKSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSAL
       900       910       920       930       940       950       

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KE3 GLSKDVYNSEYYHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLSKDVYNSEYYHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGG
       960       970       980       990      1000      1010       

    1010      1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KE3 QADDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QADDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSK
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

    1070
pF1KE3 P
       :
CCDS59 P
        

>>CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1014 aa)
 initn: 4302 init1: 4302 opt: 4304  Z-score: 2100.4  bits: 400.3 E(32554): 1.1e-110
Smith-Waterman score: 6778; 94.8% identity (94.8% similar) in 1070 aa overlap (1-1070:1-1014)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
       ::::::::::::::::::::::::::                                  
CCDS48 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWK----------------------------------
              610       620                                        

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ----------------------DKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
                              630       640       650       660    

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
          670       680       690       700       710       720    

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
          730       740       750       760       770       780    

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
          790       800       810       820       830       840    

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
          850       860       870       880       890       900    

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
          910       920       930       940       950       960    

             1030      1040      1050      1060      1070
pF1KE3 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
          970       980       990      1000      1010    

>>CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (940 aa)
 initn: 3587 init1: 3587 opt: 3595  Z-score: 1758.9  bits: 337.0 E(32554): 1.2e-91
Smith-Waterman score: 6108; 87.8% identity (87.9% similar) in 1070 aa overlap (1-1070:1-940)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
               10        20        30        40        50        60

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE3 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE3 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
              190       200       210       220       230       240

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pF1KE3 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE3 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE3 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS48 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVA-----------
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              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
                                                                   
CCDS48 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
                                                                  .
CCDS48 -----------------------------------------------------------N
                                                                410

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
              420       430       440       450       460       470

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pF1KE3 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
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pF1KE3 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
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pF1KE3 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
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pF1KE3 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
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pF1KE3 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
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pF1KE3 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
              780       790       800       810       820       830

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pF1KE3 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ
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pF1KE3 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
              900       910       920       930       940

>>CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6                 (1030 aa)
 initn: 7033 init1: 3588 opt: 3588  Z-score: 1755.0  bits: 336.4 E(32554): 2e-91
Smith-Waterman score: 6908; 96.3% identity (96.3% similar) in 1070 aa overlap (1-1070:1-1030)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MGAARGSPARPRRLPLLSVLLLPLLGGTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGP
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE3 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVDRLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFN
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE3 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHPRPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSS
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE3 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIADESFARVVLAPQDVVVARYE
              190       200       210       220       230       240

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pF1KE3 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSLLLTQVRPRNAGIYR
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE3 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPEPSVWWEHAG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLKKPQD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 CMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERAD
       :::::::::::::::::::                                        :
CCDS48 CMSSTPAGSIEAQARVQVL----------------------------------------D
              490                                               500

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER
              510       520       530       540       550       560

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG
              570       580       590       600       610       620

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL
              630       640       650       660       670       680

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN
              690       700       710       720       730       740

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pF1KE3 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ
              750       760       770       780       790       800

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ
              810       820       830       840       850       860

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP
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       : ... .  ..: :: .:.:     : .:     . :. .  . :.:. .   :.:   :
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           .:.::....: .  . :. ..   ..:  . :   ..:    ::     .  ... 
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       :     . :: ::.:.  .:. . ::.:: :..  :.: ..::..:.: :..:  ::.::
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       .  :::..::: :.. : :: .        ::.  : .:. .::: :: .:.. .:::.:
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       :.:::..::.::.:..:    .. :..  .  :. .: .:..:: ..: .:. ::   :.
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pF1KE3 DRPSFSEIASALGDSTVDSKP      
       .: :.... . :               
CCDS30 QRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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>>CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1               (790 aa)
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pF1KE3 RCMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKW---
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CCDS30 PEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILT
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           .:.::....: .  . :. ..   ..:  . :   ..:    ::     .  ... 
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pF1KE3 QPSAEIQEEVALTSLGSGPAATNKRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQG
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pF1KE3 LEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEY
       :     . :: ::.:.  .:. . ::.:: :..  :.: ..::..:.: :..:  ::.::
CCDS30 LLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEY
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pF1KE3 VDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ-------PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKD
       .  :::..::: :.. : :: .        ::.  : .:. .::: :: .:.. .:::.:
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pF1KE3 LAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEYYHFR-QAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDV
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CCDS30 LATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDV
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pF1KE3 WAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPK
       :.:::..::.::.:..:    .. :..  .  :. .: .:..:: ..: .:. ::   :.
CCDS30 WSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR-ELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQ
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pF1KE3 DRPSFSEIASALGDSTVDSKP      
       .: :.... . :               
CCDS30 QRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
           770       780       790

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pF1KE3 RCMSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKW---
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CCDS11 PEQKLQCHGQGPLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWILT
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pF1KE3 ERADGSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRD-DAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFK
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CCDS11 ELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDV-G--RAEV--SVQVNVSFP
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pF1KE3 VEPERTTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTK------LGPRMH-IFQNGS
       .  .  :. . :   .   ..:.: : ..:  .  .:. :.      : :  .   ..: 
CCDS11 ASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGC
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pF1KE3 LVIHDVAPEDSGRYTCIAGN-----SCNIK----------HTEAPLYVVDKPVPEESEGP
       : ... .  ..: :: .:.:     : .:           . : :. :  .::  .: . 
CCDS11 LRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTS-
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pF1KE3 GSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAV-LGLMFYCKKRC--KAKRLQKQPEGEEPEMECLN
       :.:   :    .:.::....: .  . :. ..   ..:  . :   ..:    ::     
CCDS11 GDPVEKKDETPFGVSVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAM
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pF1KE3 GGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATNKRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEV
       .  ...   :.    :   ..: .    . .  : .   :. : ..     ::.. ::.:
CCDS11 SLHFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKV
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pF1KE3 FLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEP
       :::. ..:     . :: ::.:.  .:. . ::.:: :..  :.: ..::..:.: :..:
CCDS11 FLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRP
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pF1KE3 HYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ-------PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSN
         ::.::.  :::..::: :.. : :: .        ::.  : .:. .::: :: .:..
CCDS11 LLMVFEYMRHGDLNRFLR-SHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAG
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pF1KE3 NRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEYYHFR-QAWVPLRWMSPEAILEGD
        .:::.:::.:::::.    ::.. .:.:.:.:...::.   .. .:.::: ::.::   
CCDS11 LHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRK
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pF1KE3 FSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQR
       :.:.::::.:::..::.::.:..:    .. :..  .  :. .: .:..:: ..: .:. 
CCDS11 FTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGR-ELERPRACPPEVYAIMRG
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pF1KE3 CWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP      
       ::   :..: :.... . :               
CCDS11 CWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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>>CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15                (803 aa)
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       :.. : . ::.. .   ::.:      :.. . :: .   .    ..: ::: .      
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         ..     .:  . .::.. ::::. . . ::    .   : .:.: .  . :..::: 
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        :  ...:. : :.:: .::  .: :. ..:: .. ::.:.:::  .:. .  . .::  
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       .. . :  ..: : ..: .:.:.:.:.::::::.:    .: .:.. .:...:.: . ::
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       .   .: .:..:: :::.::: :..:.: :.::::.::.:. : ::. :....::: :. 
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       .: .:.  :.:::. .::.: .::   :. ::::. :   :   : :             
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>>CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15                (864 aa)
 initn: 525 init1: 229 opt: 713  Z-score: 369.4  bits: 79.7 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 713; 33.7% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (697-1067:421-783)

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       :.. : . ::.. .   ::.:      :.. . :: .   .    ..: ::: .      
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pF1KE3 RELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQPLST
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CCDS10 MEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLR--HSRPHLGQPSPLVM
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pF1KE3 KQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSA---QRQVKVSALGLSKDVYNSEYY
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CCDS10 RDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRASYY
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CCDS10 PTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQPQN
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1070 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Wed Nov 16 15:01:10 2016 done: Wed Nov 16 15:01:11 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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