FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3363, 1070 aa 1>>>pF1KE3363 1070 - 1070 aa - 1070 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7317+/-0.00132; mu= -4.2362+/- 0.076 mean_var=429.9347+/-101.879, 0's: 0 Z-trim(109.6): 418 B-trim: 408 in 1/53 Lambda= 0.061855 statistics sampled from 10561 (11016) to 10561 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16 Scan time: 3.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 7288 666.6 8.1e-191 CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 7121 651.7 2.5e-186 CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 4304 400.3 1.1e-110 CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 3595 337.0 1.2e-91 CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 3588 336.4 2e-91 CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 730 81.2 9.5e-15 CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 730 81.2 9.8e-15 CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 725 80.8 1.3e-14 CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 713 79.7 2.8e-14 CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 713 79.7 3e-14 CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 715 80.2 4e-14 CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 706 79.1 4.3e-14 CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 713 80.2 5.8e-14 CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 688 77.5 1.4e-13 CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 680 76.8 2.2e-13 CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 680 76.8 2.2e-13 CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 679 76.7 2.4e-13 CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 679 76.7 2.5e-13 CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 676 76.4 2.9e-13 CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 671 76.0 3.9e-13 CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 671 76.0 4.1e-13 CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 675 76.6 4.2e-13 CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 675 76.6 4.3e-13 CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 666 75.4 4.4e-13 CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 672 76.3 4.9e-13 CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 666 75.6 5.6e-13 CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 667 75.9 6.9e-13 CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 667 75.9 6.9e-13 CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 659 74.8 7.5e-13 CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 661 75.1 7.8e-13 CCDS45807.1 AATK gene_id:9625|Hs108|chr17 (1374) 627 72.3 8.3e-12 CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 617 71.2 1.1e-11 CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 606 70.0 1.6e-11 CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 609 70.5 2e-11 CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 606 70.3 2.5e-11 CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 606 70.3 2.5e-11 CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 606 70.3 2.6e-11 CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 606 70.3 2.6e-11 CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 606 70.3 2.7e-11 CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 606 70.3 2.7e-11 CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 606 70.3 2.7e-11 CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 599 69.6 3.6e-11 CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 602 70.0 3.7e-11 CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 602 70.1 3.8e-11 CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 602 70.1 3.9e-11 CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 597 69.5 4.2e-11 CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 597 69.5 4.6e-11 CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 597 69.5 4.7e-11 >>CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070 aa) initn: 7288 init1: 7288 opt: 7288 Z-score: 3539.2 bits: 666.6 E(32554): 8.1e-191 Smith-Waterman score: 7288; 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CCDS48 -----------------------------------------------------------N 410 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 GSSLPEWVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPER 420 430 440 450 460 470 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 TTVYQGHTALLQCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSG 480 490 500 510 520 530 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 RYTCIAGNSCNIKHTEAPLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVL 540 550 560 570 580 590 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 GLMFYCKKRCKAKRLQKQPEGEEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATN 600 610 620 630 640 650 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 KRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSEFGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQ 660 670 680 690 700 710 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 LDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPHYMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQ 720 730 740 750 760 770 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 PLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNCLVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEY 780 790 800 810 820 830 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 YHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFTHGEMPHGGQADDEVLADLQ 840 850 860 870 880 890 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 AGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTVDSKP 900 910 920 930 940 >>CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030 aa) initn: 7033 init1: 3588 opt: 3588 Z-score: 1755.0 bits: 336.4 E(32554): 2e-91 Smith-Waterman score: 6908; 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