Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2703
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2703, 865 aa
  1>>>pF1KE2703     865 - 865 aa - 865 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4487+/-0.00107; mu= 20.4931+/- 0.064
 mean_var=80.3321+/-15.546, 0's: 0 Z-trim(104.0): 30  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.143097
 statistics sampled from 7660 (7679) to 7660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.236), width:  16
 Scan time:  4.180

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 865) 5692 1185.7       0
CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 842) 5493 1144.6       0
CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 834) 5442 1134.1       0
CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4          ( 856) 5025 1048.0       0
CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2         ( 834) 1192 256.7 1.3e-67


>>CCDS47029.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (865 aa)
 initn: 5692 init1: 5692 opt: 5692  Z-score: 6348.0  bits: 1185.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5692; 100.0% identity (100.0% similar) in 865 aa overlap (1-865:1-865)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
              790       800       810       820       830       840

              850       860     
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
              850       860     

>>CCDS54748.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (842 aa)
 initn: 5493 init1: 5493 opt: 5493  Z-score: 6126.1  bits: 1144.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5493; 100.0% identity (100.0% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-838)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNPS
              790       800       810       820       830       840

              850       860     
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
                                
CCDS54 QH                       
                                

>>CCDS54747.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (834 aa)
 initn: 5442 init1: 5442 opt: 5442  Z-score: 6069.3  bits: 1134.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5442; 100.0% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDPSQH      
              790       800       810       820       830          

              850       860     
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH

>>CCDS54746.1 PROM1 gene_id:8842|Hs108|chr4               (856 aa)
 initn: 5025 init1: 5025 opt: 5025  Z-score: 5603.8  bits: 1048.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5609; 99.0% identity (99.0% similar) in 865 aa overlap (1-865:1-856)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIILCCVLGLLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::::::::
CCDS54 IFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDK---------IVYYEAGIILCCVLGLLFI
               70        80        90                100       110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVAN
             120       130       140       150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGG
             180       190       200       210       220       230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS
             240       250       260       270       280       290 

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQG
             300       310       320       330       340       350 

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRLPIQDILSAFSVYVNNTESYI
             360       370       380       390       400       410 

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGG
             420       430       440       450       460       470 

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLMVGVGLSFLFCWILMIIVVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEY
             480       490       500       510       520       530 

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES
             540       550       560       570       580       590 

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANS
             600       610       620       630       640       650 

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVKILQRTGNGLLERVTRILASL
             660       670       680       690       700       710 

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVD
             720       730       740       750       760       770 

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLCSYIIDPLNLFWFGIGKATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNME
             780       790       800       810       820       830 

              850       860     
pF1KE2 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH
             840       850      

>>CCDS2012.1 PROM2 gene_id:150696|Hs108|chr2              (834 aa)
 initn: 926 init1: 275 opt: 1192  Z-score: 1327.4  bits: 256.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 1226; 26.9% identity (65.0% similar) in 825 aa overlap (4-820:7-807)

                  10        20            30        40          50 
pF1KE2    MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTD----APKAWNYELPATN--YETQDSHKAGP
             .:. :: ::: : ..:    ..::    .:       ::.   . .   .  : 
CCDS20 MKHTLALLAPLLGLGL-GLALSQLAAGATDCKFLGPAEHLTFTPAARARWLAPRVRAPGL
               10         20        30        40        50         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE2 IGILFELVHIFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGLKIVYYEAGIIL
       .  :.  :. :: :::   :: . .. .:..    :..           ..: :::: ..
CCDS20 LDSLYGTVRRFLSVVQLNPFPSELVKALLNELASVKVN-----------EVVRYEAGYVV
      60        70        80        90                  100        

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE2 CCVLGLLFIILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISI
       : :.. :...:.: .:  :: :::  .:::... ..:  .   :  . . ::.  ... :
CCDS20 CAVIAGLYLLLVPTAGLCFCCCRCHRRCGGRVKTEHKALA-CERAALMVFLLLTTLLLLI
      110       120       130       140        150       160       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE2 GIFYGFVANHQVRTRIKRSRKLADSNFKDLRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLN
       :.  .::.:.... ..  : .    .. .:  :....:.... .  :..  ....  .:.
CCDS20 GVVCAFVTNQRTHEQMGPSIEAMPETLLSLWGLVSDVPQELQAVAQQFSLPQEQVSEELD
       170       180       190       200       210       220       

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE2 SINSVLGGGILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSL
       ...  .:..:  .:: .. :.:  . :.. ... . . :...:.:.  :.  . .:  ..
CCDS20 GVGVSIGSAIHTQLRSSVYPLLAAVGSLGQVLQVSVHHLQTLNATVVELQAGQQDLEPAI
       230       240       250       260       270       280       

             300       310       320        330       340       350
pF1KE2 TSVKTSLRSSLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQ-LNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLR
          .  :   :..  :     .  : .  :: .. :. . .. :.: ::  : ....: .
CCDS20 REHRDRLLELLQEARC-----QGDCAGA-LSWARTLELGADFSQVPSVDHVLHQLKGVPE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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