FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2669, 354 aa 1>>>pF1KE2669 354 - 354 aa - 354 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 61127809 residues in 85815 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9850+/-0.000478; mu= 18.2381+/- 0.030 mean_var=105.9812+/-28.431, 0's: 0 Z-trim(108.5): 483 B-trim: 1807 in 2/47 Lambda= 0.124583 statistics sampled from 16030 (16642) to 16030 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 6.650 The best scores are: opt bits E(85815) NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo ( 354) 2316 427.9 1.7e-119 XP_006713727 (OMIM: 606380) PREDICTED: P2Y purinoc ( 224) 1347 253.5 3.4e-67 NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 206.2 8.6e-53 NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 206.2 8.6e-53 XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y ( 342) 1083 206.2 8.6e-53 XP_011511642 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 XP_005247979 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 XP_005247980 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 NP_001074924 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [H ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 XP_016863072 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 NP_055694 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [Homo ( 338) 1031 196.9 5.6e-50 NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 915 176.1 1.1e-43 NP_005291 (OMIM: 300241) probable G-protein couple ( 381) 537 108.2 3.2e-23 XP_005272654 (OMIM: 300241) PREDICTED: probable G- ( 381) 537 108.2 3.2e-23 NP_001091048 (OMIM: 300241) probable G-protein cou ( 381) 537 108.2 3.2e-23 XP_016875894 (OMIM: 605741) PREDICTED: G-protein c ( 361) 500 101.5 3.1e-21 NP_004942 (OMIM: 605741) G-protein coupled recepto ( 361) 500 101.5 3.1e-21 NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 480 97.8 3.6e-20 NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 480 97.8 3.6e-20 NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 480 97.9 3.8e-20 XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 480 97.9 3.8e-20 NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 480 97.9 3.8e-20 NP_001269117 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19 NP_006630 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene rec ( 337) 464 95.0 2.6e-19 NP_001269115 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19 NP_001269116 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 95.0 2.6e-19 NP_000943 (OMIM: 173393) platelet-activating facto ( 342) 447 91.9 2.2e-18 NP_001158194 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18 NP_001158195 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18 NP_001158193 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 91.9 2.2e-18 NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 89.3 1.5e-17 NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 89.3 1.5e-17 NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 432 89.3 1.6e-17 NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 89.3 1.6e-17 NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 89.3 1.6e-17 NP_002556 (OMIM: 300038) P2Y purinoceptor 4 [Homo ( 365) 415 86.2 1.2e-16 NP_001155970 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 85.3 2.2e-16 NP_001155969 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 85.3 2.2e-16 NP_005758 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidic a ( 344) 410 85.3 2.2e-16 XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16 XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16 XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16 XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 84.1 5.6e-16 NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 403 84.1 5.6e-16 NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 403 84.1 5.6e-16 NP_002554 (OMIM: 601167) P2Y purinoceptor 1 [Homo ( 373) 401 83.7 7.2e-16 NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16 NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16 NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 399 83.3 8.8e-16 NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 399 83.3 8.8e-16 >>NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo sap (354 aa) initn: 2316 init1: 2316 opt: 2316 Z-score: 2266.4 bits: 427.9 E(85815): 1.7e-119 Smith-Waterman score: 2316; 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XP_006 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMICAERKKKRPTLEVHC 190 200 210 220 >>NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa) initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53 Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA : :: .:.:..:: ::::.:..:.. : :: NP_795 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE . .: .: :.:.:::.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: NP_795 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE :::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. 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NP_795 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL . ::.. :::...::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.: NP_795 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG .. : :.::.::.::::.: ..: : ..:.: :.:.... : NP_795 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM 290 300 310 320 330 340 >>NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa) initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53 Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA : :: .:.:..:: ::::.:..:.. : :: NP_073 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE . .: .: :.:.:::.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: NP_073 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE :::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. NP_073 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK ..::::. ::. .:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... NP_073 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL . ::.. :::...::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.: NP_073 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KE2 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG .. : :.::.::.::::.: ..: : ..:.: :.:.... : NP_073 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM 290 300 310 320 330 340 >>XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y puri (342 aa) initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1068.8 bits: 206.2 E(85815): 8.6e-53 Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (36-349:17-332) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA : :: .:.:..:: ::::.:..:.. : :: XP_016 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE . .: .: :.:.:::.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: XP_016 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKE :::..: .::::..::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. XP_016 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK ..::::. ::. .:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... 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