Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6015
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6015, 1828 aa
1>>>pF1KB6015 1828 - 1828 aa - 1828 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7378+/-0.00192; mu= -5.3864+/- 0.112
mean_var=446.7532+/-94.824, 0's: 0 Z-trim(104.7): 161 B-trim: 11 in 1/52
Lambda= 0.060679
statistics sampled from 8038 (8167) to 8038 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs109|chr15 (1828) 11907 1059.7 0
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs109|chr15 (1855) 8648 774.4 0
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs109|chr18 (1848) 5037 458.2 1.3e-127
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs109|chr15 (1742) 3614 333.6 3.9e-90
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs109|chr16 (1938) 2046 196.4 8.8e-49
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs109|chr16 (1972) 2046 196.4 8.9e-49
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs109|chr17 (1976) 2031 195.1 2.2e-48
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs109|chr22 (1960) 2010 193.3 7.9e-48
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs109|chr2 (2116) 1947 187.8 3.8e-46
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs109|chr19 (1995) 1887 182.5 1.4e-44
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs109|chr16 (1945) 1674 163.9 5.6e-39
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs109|chr16 (1979) 1674 163.9 5.7e-39
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs109|chr17 (1985) 1642 161.1 4e-38
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs109|chr20 (1983) 1640 160.9 4.5e-38
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs109|chr3 (1946) 1552 153.2 9.2e-36
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs109|chr19 (2003) 1529 151.2 3.8e-35
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs109|chr11 (2175) 1524 150.8 5.4e-35
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs109|chr11 (2215) 1524 150.8 5.5e-35
CCDS42271.1 MYO15A gene_id:51168|Hs109|chr17 (3530) 1432 142.9 2e-32
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs109|chr14 (1939) 1397 139.6 1.1e-31
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs109|chr17 (1938) 1365 136.8 7.8e-31
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs109|chr17 (1941) 1346 135.1 2.5e-30
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs109|chr2 (1136) 1323 132.9 6.8e-30
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs109|chr15 (1108) 1316 132.3 1e-29
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs109|chr12 (1043) 1303 131.1 2.1e-29
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs109|chr2 (1107) 1303 131.1 2.2e-29
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs109|chr19 (1098) 1301 131.0 2.5e-29
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs109|chr2 (1078) 1299 130.8 2.8e-29
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs109|chr17 (1939) 1298 130.9 4.5e-29
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs109|chr17 (1939) 1294 130.6 5.8e-29
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs109|chr19 (2022) 1292 130.4 6.7e-29
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs109|chr14 (1935) 1261 127.7 4.3e-28
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs109|chr17 (2007) 1243 126.1 1.3e-27
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs109|chr17 (1940) 1202 122.5 1.5e-26
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs109|chr12 (1022) 1184 120.7 2.9e-26
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs109|chr17 ( 961) 1162 118.7 1.1e-25
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs109|chr17 (1006) 1162 118.8 1.1e-25
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs109|chr17 (1937) 1165 119.3 1.4e-25
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs109|chr17 (1028) 1155 118.2 1.7e-25
CCDS86556.1 MYO1C gene_id:4641|Hs109|chr17 (1039) 1155 118.2 1.7e-25
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs109|chr17 (1044) 1155 118.2 1.7e-25
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs109|chr17 (1063) 1155 118.2 1.7e-25
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs109|chr17 ( 970) 1070 110.7 2.8e-23
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs109|chr17 ( 436) 1056 109.1 3.7e-23
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs109|chr19 (2036) 1074 111.4 3.7e-23
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs109|chr7 (1018) 917 97.3 3.1e-19
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs109|chr2 (1341) 768 84.4 3.2e-15
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs109|chr17 ( 770) 751 82.7 6.1e-15
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs109|chr2 (1314) 745 82.4 1.3e-14
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs109|chr6 (1262) 714 79.6 8.2e-14
>>CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs109|chr15 (1828 aa)
initn: 11907 init1: 11907 opt: 11907 Z-score: 5655.2 bits: 1059.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 11907; 99.9% identity (100.0% similar) in 1828 aa overlap (1-1828:1-1828)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EDIINAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDIINAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFGKYIEIGFDKRYRIIGANMR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKLPEFKMLRLGNADNFNYTKQGGSPVIEGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKLPEFKMLRLGNADNFNYTKQGGSPVIEGVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DAKEMAHTRQACTLLGISESHQMGIFRILAGILHLGNVGFTSRDADSCTIPPKHEPLCIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DAKEMAHTRQACTLLGISESHQMGIFRILAGILHLGNVGFTSRDADSCTIPPKHEPLCIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 CDLMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFNWIVDNVN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CELMGVDYEEMCHWLCHRKLATATETYIKPISKLQATNARDALAKHIYAKLFNWIVDNVN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 QALHSAVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QALHSAVKQHSFIGVLDIYGFETFEINSFEQFCINYANEKLQQQFNMHVFKLEQEEYMKE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 QIPWTLIDFYDNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QIPWTLIDFYDNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTDDTWAQKLYNTHLNKCALFEK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRLSNKAFIIQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRLSNKAFIIQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVLKSSKFKMLPELFQDDEKAIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PTSATSSGRTPLTRTPAKPTKGRPGQMAKEHKKTVGHQFRNSLHLLMETLNATTPHYVRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PTSATSSGRTPLTRTPAKPTKGRPGQMAKEHKKTVGHQFRNSLHLLMETLNATTPHYVRC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 IKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMKQKDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IKPNDFKFPFTFDEKRAVQQLRACGVLETIRISAAGFPSRWTYQEFFSRYRVLMKQKDVL
670 680 690 700 710 720
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pF1KB6 SDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SDRKQTCKNVLEKLILDKDKYQFGKTKIFFRAGQVAYLEKLRADKLRAACIRIQKTIRGW
730 740 750 760 770 780
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pF1KB6 LLRKKYLRMRKAAITMQRYVRGYQARCYAKFLRRTKAATIIQKYWRMYVVRRRYKIRRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLRKKYLRMRKAAITMQRYVRGYQARCYAKFLRRTKAATIIQKYWRMYVVRRRYKIRRAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TIVLQSYLRGFLARNRYRKILREHKAVIIQKRVRGWLARTHYKRSMHAIIYLQCCFRRMM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AKRELKKLKIEARSVERYKKLHIGMENKIMQLQRKVDEQNKDYKCLVEKLTNLEGIYNSE
910 920 930 940 950 960
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pF1KB6 TEKLRSDLERLQLSEEEAKVATGRVLSLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKCIEEHADRYKQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEKLRSDLERLQLSEEEAKVATGRVLSLQEEIAKLRKDLEQTRSEKKCIEEHADRYKQET
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB6 EQLVSNLKEENTLLKQEKEALNHRIVQQAKEMTETMEKKLVEETKQLELDLNDERLRYQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQLVSNLKEENTLLKQEKEALNHRIVQQAKEMTETMEKKLVEETKQLELDLNDERLRYQN
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pF1KB6 LLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMVHVPKPGHKRTDSTHSSNESEYIFSSEIAEMEDIPSRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLNEFSRLEERYDDLKEEMTLMVHVPKPGHKRTDSTHSSNESEYIFSSEIAEMEDIPSRT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB6 EEPSEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQVMQDELDRKEEQVLRSKAKEEERPQIRGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEPSEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQVMQDELDRKEEQVLRSKAKEEERPQIRGAE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KB6 LEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKSAPEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEYESLKRQELESENKKLKNELNELRKALSEKSAPEVTAPGAPAYRVLMEQLTSVSEELD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KB6 VRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDVQKMKDKGEIAQAYIGLKETNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VRKEEVLILRSQLVSQKEAIQPKDDKNTMTDSTILLEDVQKMKDKGEIAQAYIGLKETNR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
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pF1KB6 LLESQLQSQKRSHENEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLESQLQSQKRSHENEAEALRGEIQSLKEENNRQQQLLAQNLQLPPEARIEASLQHEITR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTNENLDLMEQLEKQDKTVRKLKKQLKVFAKKIGELEVGQMENISPGQIIDEPIRPVNIP
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pF1KB6 RKEKDFQGMLEYKKEDEQKLVKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RKEKDFQGMLEYKKEDEQKLVKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQ
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pF1KB6 KVRSLLTSTINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHCLKQYSGEEGFMKHNTSRQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVRSLLTSTINSIKKVLKKRGDDFETVSFWLSNTCRFLHCLKQYSGEEGFMKHNTSRQNE
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB6 HCLTNFDLAEYRQVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HCLTNFDLAEYRQVLSDLAIQIYQQLVRVLENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB6 KRTSSIADEGTYTLDSILRQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIIGAITLNNLLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRTSSIADEGTYTLDSILRQLNSFHSVMCQHGMDPELIKQVVKQMFYIIGAITLNNLLLR
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB6 KDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KDMCSWSKGMQIRYNVSQLEEWLRDKNLMNSGAKETLEPLIQAAQLLQVKKKTDDDAEAI
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB6 CSMCNALTTAQIVKVLNLYTPVNEFEERVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSMCNALTTAQIVKVLNLYTPVNEFEERVSVSFIRTIQMRLRDRKDSPQLLMDAKHIFPV
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820
pF1KB6 TFPFNPSSLALETIQIPASLGLGFISRV
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFPFNPSSLALETIQIPASLGLGFISRV
1810 1820
>>CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs109|chr15 (1855 aa)
initn: 8619 init1: 8619 opt: 8648 Z-score: 4113.2 bits: 774.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 11843; 98.5% identity (98.5% similar) in 1855 aa overlap (1-1828:1-1855)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAASELYTKFARVWIPDPEEVWKSAELLKDYKPGDKVLLLHLEEGKDLEYHLDPKTKELP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLRVRFIDSKLIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 EDIINAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDIINAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDERNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
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CCDS42 KAQLEALKEEMDKQQQTFCQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNER
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CCDS10 CINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIELIERPNNPPGVLAL
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CCDS10 KNMDPLNDNVTSLLNASSDKFVADLWKDVDRIVGLDQMAKMTESSL---PSA-SKTKKGM
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CCDS10 RNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVTRQEEEMQAKEDELQKTKERQQKAENELKELEQ
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CCDS10 KHSQLTEEKN----LLQEQLQAETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHEMEARLEEEED
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CCDS10 RGQQLQ-AERKKMAQQMLDLEEQLEEEEAARQKL-QLEKV-TAEAKIKKLEDEILVMDDQ
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