Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3478
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3478, 1613 aa
1>>>pF1KE3478 1613 - 1613 aa - 1613 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4393+/-0.00135; mu= 4.3486+/- 0.081
mean_var=231.1254+/-46.502, 0's: 0 Z-trim(108.1): 73 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.084363
statistics sampled from 10082 (10136) to 10082 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs109|chr12 (1613) 11148 1371.7 0
CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs109|chr11 (1615) 7864 972.0 0
CCDS31478.1 LRP4 gene_id:4038|Hs109|chr11 (1905) 3069 388.4 1.2e-106
CCDS2182.1 LRP1B gene_id:53353|Hs109|chr2 (4599) 1405 186.2 2.3e-45
CCDS33626.1 LRP5L gene_id:91355|Hs109|chr22 ( 252) 1082 146.0 1.5e-34
CCDS8932.1 LRP1 gene_id:4035|Hs109|chr12 (4544) 996 136.4 2.2e-30
CCDS2232.1 LRP2 gene_id:4036|Hs109|chr2 (4655) 887 123.1 2.2e-26
CCDS54795.1 EGF gene_id:1950|Hs109|chr4 (1165) 862 119.7 5.9e-26
CCDS54794.1 EGF gene_id:1950|Hs109|chr4 (1166) 855 118.8 1.1e-25
CCDS3689.1 EGF gene_id:1950|Hs109|chr4 (1207) 855 118.8 1.1e-25
CCDS6446.1 VLDLR gene_id:7436|Hs109|chr9 ( 873) 827 115.3 9.1e-25
CCDS34979.1 VLDLR gene_id:7436|Hs109|chr9 ( 845) 819 114.3 1.7e-24
CCDS579.1 LRP8 gene_id:7804|Hs109|chr1 ( 700) 751 106.0 4.6e-22
CCDS580.1 LRP8 gene_id:7804|Hs109|chr1 ( 793) 751 106.0 5.1e-22
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs109|chr11 (2214) 760 107.4 5.4e-22
CCDS30720.1 LRP8 gene_id:7804|Hs109|chr1 ( 904) 751 106.1 5.7e-22
CCDS578.1 LRP8 gene_id:7804|Hs109|chr1 ( 963) 751 106.1 6e-22
CCDS56084.1 LDLR gene_id:3949|Hs109|chr19 ( 692) 741 104.8 1.1e-21
CCDS56085.1 LDLR gene_id:3949|Hs109|chr19 ( 819) 741 104.8 1.2e-21
CCDS58651.1 LDLR gene_id:3949|Hs109|chr19 ( 858) 741 104.9 1.3e-21
CCDS12254.1 LDLR gene_id:3949|Hs109|chr19 ( 860) 741 104.9 1.3e-21
CCDS56083.1 LDLR gene_id:3949|Hs109|chr19 ( 682) 673 96.5 3.3e-19
CCDS1608.1 NID1 gene_id:4811|Hs109|chr1 (1247) 655 94.5 2.4e-18
CCDS9706.1 NID2 gene_id:22795|Hs109|chr14 (1375) 576 84.9 2e-15
>>CCDS8647.1 LRP6 gene_id:4040|Hs109|chr12 (1613 aa)
initn: 11148 init1: 11148 opt: 11148 Z-score: 7343.4 bits: 1371.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 11148; 99.9% identity (100.0% similar) in 1613 aa overlap (1-1613:1-1613)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGAVLRSLLACSFCVLLRAAPLLLYANRRDLRLVDATNGKENATIVVGGLEDAAAVDFVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MGAVLRSLLACSFCVLLRAAPLLLYANRRDLRLVDATNGKENATIVVGGLEDAAAVDFVF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SHGLIYWSDVSEEAIKRTEFNKTESVQNVVVSGLLSPDGLACDWLGEKLYWTDSETNRIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SHGLIYWSDVSEEAIKRTEFNKTESVQNVVVSGLLSPDGLACDWLGEKLYWTDSETNRIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VSNLDGSLRKVLFWQELDQPRAIALDPSSGFMYWTDWGEVPKIERAGMDGSSRFIIINSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VSNLDGSLRKVLFWQELDQPRAIALDPSSGFMYWTDWGEVPKIERAGMDGSSRFIIINSE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IYWPNGLTLDYEEQKLYWADAKLNFIHKSNLDGTNRQAVVKGSLPHPFALTLFEDILYWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IYWPNGLTLDYEEQKLYWADAKLNFIHKSNLDGTNRQAVVKGSLPHPFALTLFEDILYWT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DWSTHSILACNKYTGEGLREIHSDIFSPMDIHAFSQQRQPNATNPCGIDNGGCSHLCLMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DWSTHSILACNKYTGEGLREIHSDIFSPMDIHAFSQQRQPNATNPCGIDNGGCSHLCLMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRISLDTPDFTDIVLQLEDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRISLDTPDFTDIVLQLEDIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 HAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIAHPDGIAVDWVARNLYWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIAHPDGIAVDWVARNLYWT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWTDWGEIPKIERAALDGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWTDWGEIPKIERAALDGSD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTGRRVLVEDKIPHIFGFTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTGRRVLVEDKIPHIFGFTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LGDYVYWTDWQRRSIERVHKRSAEREVIIDQLPDLMGLKATNVHRVIGSNPCAEENGGCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LGDYVYWTDWQRRSIERVHKRSAEREVIIDQLPDLMGLKATNVHRVIGSNPCAEENGGCS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 HLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISLETNNNNVAIPLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISLETNNNNVAIPLTG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYPEGMAVDWLGKNLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYPEGMAVDWLGKNLY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 WADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEWGGKPKIDRAAMDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 WADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEWGGKPKIDRAAMDG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREVIADDLPHPFGLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREVIADDLPHPFGLTQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQSGWNECASSNGHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQSGWNECASSNGHC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 SHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRMVIDEQQSPDIILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRMVIDEQQSPDIILP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 IHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSVPSQNLEIQPYDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSVPSQNLEIQPYDLS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 IDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKGEQDRPRAIVVNPEKGYMYFTNLQERS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS86 IDIYSRYIYWTCEATNVINVTRLDGRSVGVVLKGEQDRPRAVVVNPEKGYMYFTNLQERS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 PKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLGKLFWADSDLRRIESSDLSGANRIVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PKIERAALDGTEREVLFFSGLSKPIALALDSRLGKLFWADSDLRRIESSDLSGANRIVLE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 DSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKIDMTGREGRTKVQARIAQLSDIHAVKELNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DSNILQPVGLTVFENWLYWIDKQQQMIEKIDMTGREGRTKVQARIAQLSDIHAVKELNLQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 EYRQHPCAQDNGGCSHICLVKGDGTTRCSCPMHLVLLQDELSCGEPPTCSPQQFTCFTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EYRQHPCAQDNGGCSHICLVKGDGTTRCSCPMHLVLLQDELSCGEPPTCSPQQFTCFTGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 IDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQFQCASGQCIDGALRCNGDANCQDKSDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IDCIPVAWRCDGFTECEDHSDELNCPVCSESQFQCASGQCIDGALRCNGDANCQDKSDEK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 NCEVLCLIDQFRCANGQCIGKHKKCDHNVDCSDKSDELDCYPTEEPAPQATNTVGSVIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NCEVLCLIDQFRCANGQCIGKHKKCDHNVDCSDKSDELDCYPTEEPAPQATNTVGSVIGV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 IVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTNDYVVHGPASVPLGYVPHPSSLSGSLPGMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IVTIFVSGTVYFICQRMLCPRMKGDGETMTNDYVVHGPASVPLGYVPHPSSLSGSLPGMS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 RGKSMISSLSIMGGSSGPPYDRAHVTGASSSSSSSTKGTYFPAILNPPPSPATERSHYTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 RGKSMISSLSIMGGSSGPPYDRAHVTGASSSSSSSTKGTYFPAILNPPPSPATERSHYTM
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 EFGYSSNSPSTHRSYSYRPYSYRHFAPPTTPCSTDVCDSDYAPSRRMTSVATAKGYTSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EFGYSSNSPSTHRSYSYRPYSYRHFAPPTTPCSTDVCDSDYAPSRRMTSVATAKGYTSDL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE3 NYDSEPVPPPPTPRSQYLSAEENYESCPPSPYTERSYSHHLYPPPPSPCTDSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 NYDSEPVPPPPTPRSQYLSAEENYESCPPSPYTERSYSHHLYPPPPSPCTDSS
1570 1580 1590 1600 1610
>>CCDS8181.1 LRP5 gene_id:4041|Hs109|chr11 (1615 aa)
initn: 6373 init1: 4592 opt: 7864 Z-score: 5183.3 bits: 972.0 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 8021; 70.3% identity (87.8% similar) in 1612 aa overlap (8-1613:19-1615)
10 20 30 40
pF1KE3 MGAVLRSLLACSFCVLLRAA-PLLLYANRRDLRLVDATNGKENATIVVG
::: : :: ::::.:::::.::::: . : ..::::.
CCDS81 MEAAPPGPPWPLLLLLLLLLALCGCPAPAAASPLLLFANRRDVRLVDAGGVKLESTIVVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GLEDAAAVDFVFSHGLIYWSDVSEEAIKRTEFNKT-ESVQNVVVSGLLSPDGLACDWLGE
:::::::::: ::.: .::.::::::::.: .:.: .:::::.:::.:::::::::.:.
CCDS81 GLEDAAAVDFQFSKGAVYWTDVSEEAIKQTYLNQTGAAVQNVVISGLVSPDGLACDWVGK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 KLYWTDSETNRIEVSNLDGSLRKVLFWQELDQPRAIALDPSSGFMYWTDWGEVPKIERAG
::::::::::::::.::.:. :::::::.:::::::::::. :.::::::::.:.:::::
CCDS81 KLYWTDSETNRIEVANLNGTSRKVLFWQDLDQPRAIALDPAHGYMYWTDWGETPRIERAG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 MDGSSRFIIINSEIYWPNGLTLDYEEQKLYWADAKLNFIHKSNLDGTNRQAVVKGSLPHP
::::.: ::..:.::::::::.: ::::::::::::.:::..::::. :: ::.::: ::
CCDS81 MDGSTRKIIVDSDIYWPNGLTIDLEEQKLYWADAKLSFIHRANLDGSFRQKVVEGSLTHP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 FALTLFEDILYWTDWSTHSILACNKYTGEGLREIHSDIFSPMDIHAFSQQRQPNATNPCG
::::: : ::::::.:.:: :::: :: .:: : ..:::::...::.::: . :
CCDS81 FALTLSGDTLYWTDWQTRSIHACNKRTGGKRKEILSALYSPMDIQVLSQERQPFFHTRCE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 IDNGGCSHLCLMSPVKPFYQCACPTGVKLLENGKTCKDGATELLLLARRTDLRRISLDTP
::::::::::.:: .::: :::::::.: .::.::: :: :.:::::::::::::::::
CCDS81 EDNGGCSHLCLLSPSEPFYTCACPTGVQLQDNGRTCKAGAEEVLLLARRTDLRRISLDTP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DFTDIVLQLEDIRHAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIAHPDG
::::::::..::::::::::::.:::.::::::::::::...::::.: .:...: :::
CCDS81 DFTDIVLQVDDIRHAIAIDYDPLEGYVYWTDDEVRAIRRAYLDGSGAQTLVNTEINDPDG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWTDWGE
:::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::.:::::.: :..: ::::::::
CCDS81 IAVDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTSRKILVSEDLDEPRAIALHPVMGLMYWTDWGE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 IPKIERAALDGSDRVVLVNTSLGWPNGLALDYDEGKIYWGDAKTDKIEVMNTDGTGRRVL
:::: : :::..: ::::.::::::::::: .:::.::::::::::::.:.::: ::.:
CCDS81 NPKIECANLDGQERRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEVINVDGTKRRTL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 VEDKIPHIFGFTLLGDYVYWTDWQRRSIERVHKRSAEREVIIDQLPDLMGLKATNVHRVI
.:::.:::::::::::..::::::::::::::: .: :.::::::::::::::.:: .:.
CCDS81 LEDKLPHIFGFTLLGDFIYWTDWQRRSIERVHKVKASRDVIIDQLPDLMGLKAVNVAKVV
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 GSNPCAEENGGCSHLCLYRPQGLRCACPIGFELISDMKTCIVPEAFLLFSRRADIRRISL
:.::::..::::::::.. :.. ::.::::.::.:::::::::::::.:. :: :.::::
CCDS81 GTNPCADRNGGCSHLCFFTPHATRCGCPIGLELLSDMKTCIVPEAFLVFTSRAAIHRISL
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 ETNNNNVAIPLTGVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYP
:::::.::::::::::::::::::..:.:::::.:::::::::::::..:::::::::::
CCDS81 ETNNNDVAIPLTGVKEASALDFDVSNNHIYWTDVSLKTISRAFMNGSSVEHVVEFGLDYP
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 EGMAVDWLGKNLYWADTGTNRIEVSKLDGQHRQVLVWKDLDSPRALALDPAEGFMYWTEW
:::::::.::::::::::::::::..:::: ::::::.:::.::.:::::..:..:::::
CCDS81 EGMAVDWMGKNLYWADTGTNRIEVARLDGQFRQVLVWRDLDNPRSLALDPTKGYIYWTEW
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 GGKPKIDRAAMDGSERTTLVPNVGRANGLTIDYAKRRLYWTDLDTNLIESSNMLGLNREV
::::.: :: :::.. ::: .::::: :::::: .::::::::::.:::::::: .: :
CCDS81 GGKPRIVRAFMDGTNCMTLVDKVGRANDLTIDYADQRLYWTDLDTNMIESSNMLGQERVV
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 IADDLPHPFGLTQYQDYIYWTDWSRRSIERANKTSGQNRTIIQGHLDYVMDILVFHSSRQ
::::::::::::::.::::::::. .:::::.::::.:::.::::::.::::::::::::
CCDS81 IADDLPHPFGLTQYSDYIYWTDWNLHSIERADKTSGRNRTLIQGHLDFVMDILVFHSSRQ
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KE3 SGWNECASSNGHCSHLCLAVPVGGFVCGCPAHYSLNADNRTCSAPTTFLLFSQKSAINRM
.: :.: .::.:..::::.: :: ::: .::.:. ..:.:: :::::::::::::.::
CCDS81 DGLNDCMHNNGQCGQLCLAIP-GGHRCGCASHYTLDPSSRNCSPPTTFLLFSQKSAISRM
910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KE3 VIDEQQSPDIILPIHSLRNVRAIDYDPLDKQLYWIDSRQNMIRKAQEDGSQGFTVVVSSV
. :.:.:::.:::.:.::::.::::::::: .::.:.::: :..:..::.: : :..:
CCDS81 IPDDQHSPDLILPLHGLRNVKAIDYDPLDKFIYWVDGRQN-IKRAKDDGTQPF-VLTSLS
960 970 980 990 1000 1010
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1610
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CCDS81 PPPSPCTDSS
1610
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CCDS21 ALMPISGTSFAVGIDFHAENDTIYWTDMGFNKISRAKRDQTWKEDIITNGLGRVEGIAVD
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CCDS21 WIAGNIYWTDHGFNLIEVARLNGSFRYVIISQGLDQPRSIAVHPEKGLLFWTEWGQMPCI
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CCDS21 SNVDMFSVAVFGAYIYWSDRAHANGSVRRGHKNDATETITMRTGLGVNLKEVKIFNRVRE
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CCDS21 DRQVIVENVGS--VEGLAYHRAWDT----LYWTSSTTSSITRHTVDQTRPGAFDREAVIT
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.:.:.:...... .. :..:: .:. :.: :..: : . .:. . . : .:..: :
CCDS21 MSEDDHPHVLALDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRSTLTGKNAQVVVSTDILTPNGLTIDYR
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CCDS21 YTG--GDTKILRSDIPHQPMGIIAVANDTNSCELS--PCALLNGGCHDLCLLTPNGRVNC
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CCDS21 SCRGDRILLEDNRCVTKNSSCNAYSEFECGNGE--CIDYQLTCDGIPHCKDKSDEKLLYC
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CCDS21 ENRSCRRGFKPCYNRRCIPHGKLCDGENDCGDNSDELDCKVSTCATVEFRCADGTCIPRS
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CCDS21 ARCNQNIDCADASDEKNCNNTD-------CTHFYKLGVKTTGFIRCNSTSLC---VLPTW
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CCDS21 ICDGSNDCGDYSDELKCPVQNKHKCEENYFSCPSGRCILNTWICDGQKDCEDGRDEFHCD
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CCDS21 GSYTCSCVEGYLMQPDNRSCKAKIEPTDRPPILLIANFETIE-VFYLNGSKMATLSSVNG
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CCDS21 NEIHTLDFIYNEDMICWIESRESSNQLKCIQITKAGGLTDEWTINILQSFHNVQQMAIDW
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CCDS21 LTRNLYFVDHVGDRIFVCNSNGSVCVTLIDLELHNPKAIAVDPIAGKLFFTDYGNVAKVE
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CCDS21 RCDMDGMNRTRIIDSKTEQPAALALDLVNKLVYWVDLYLDYVGVVDYQGKNRHTVIQGRQ
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CCDS21 VRHLYGITVFEDYLYATNSDNYNIVRINRFNGT---DIHSLIKIENAWGIRIYQKRTQPT
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CCDS21 VRSHACEVDPYGMPGGCSHICLLSSSYKTRTCRCRTGFNLGSDGRSCKRPKNELFLFYGK
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CCDS21 GRPGIVRGMDLNTKIADEYMIPIENLVNPRALDFHAETNYIYFADTTSFLIGRQKIDGTE
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CCDS21 RETILKDDLDNVEGIAVDWIGNNLYWTNDGHRKTINVARLEKASQSRKTLLEGEMSHPRG
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CCDS21 IVVDPVNGWMYWTDWEEDEIDDSVGRIEKAWMDGFNRQIFVTSKMLWPNGLTLDFHTNTL
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CCDS21 YWCDAYYDHIEKVFLNGTHRKIVYSGRELNHPFGLSHHGNYVFWTDYMNGSIFQLDLITS
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CCDS21 EVTLLRHERPPLFGLQIYDPRKQQGDNMCRVNNGGCSTLCLAIPGGRVCACADNQLLDEN
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:: : ::. . . ...: : :. . . .. : : : :.
CCDS21 GTTCTFNPGEALPHICKAGEFRCKNRHCIQARWKCDGDDDCLDGSDEDSVNCFNHSCPDD
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CCDS21 QFKCQNNRCIPKRWLCDGANDCGSNEDESNQTCTARTCQVDQFSCGNGRCIPRAWLCDRE
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:. .... :: : . : :. . : : : . :: : .:.
CCDS21 DDCGDQTDEMASCEFPTCEPLTQFVCKSGRCISSKWHCDSDDDCGDGSDEVGCVHSCFDN
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CCDS21 QFRCSSGRCIPGHWACDGDNDCGDFSDEAQINCTKEEIHSPAGCNGNEFQCHPDGNCVPD
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CCDS21 LWRCDGEKDCEDGSDEKGCNGTIRLCDHKTKFSCWSTGRCINKAWVCDGDIDCEDQSDED
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: . . :: :: : . . .:. : .. . :. .::. .::
CCDS21 DCDSFLCGPPKH-PCANDTSVCLQPEKLCNGKKD-------CPDGSDEGYLCDECSLNNG
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::. : .:: :.::.:: .:: ::.::
CCDS21 GCSNHCSVVPGRGIVCSCPEGLQLNKDNKTCEIVDYCSNHLKCSQVCEQHKHTVKCSCYE
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CCDS21 GWKLDVDGESCTSVDPFEAFIIFSIRHEIRR--IDLHKR-DYSLLVPGLRNTIALDFHFN
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.. . .:: : . . . : . .. . .: :: :..
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CCDS21 KGPCSHMCLINHNRSAACACPHLMKLSSDKKTCYEMKKFLLYARRSEIRGVDIDNPYFNF
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: : .:. . : :.:. . : :: . : :. . . ::
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CCDS21 TECKEDQFRCKNKAHCIPIRWLCDGIHDCVDGSDEENCERGGNICRADEFLCNNSLCKLH
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CCDS21 FWVCDGEDDCGDNSDEAPDMCVKFLCPSTRPHRCRNNRICLQSEQMCNGIDECGDNSDED
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CCDS33 MEGHVYWTDDEVWAIRRAYLDGSGAQTLIN
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CCDS33 TKINDPDDIAVNWVARSLYWTHTGTEHIEVTCLNSTSHKILVSEDMDEPRAIALHPEMGL
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CCDS33 TYWIDWGENPEIKRANLDRQELRVLVNASLGWPNGLALDLQEGKLYWGDAKTDKIEAISV
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CCDS33 DETKRQTLLKDKLPHIFRFTLLGDFIYWTAWQHHSIKRVHKVKANRDVIIDQLPDLMGLK
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CCDS89 AKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEA-NGGQGPCSHLCLINYNRT
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CCDS89 V-SCACPHLMKLHKDNTTCYE-FKKFLLYARQMEIRGVDLDAPYYNYIISFTVPDIDNVT
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CCDS89 TNKKQINVARLDGSFKNAVV-QGLEQPHGLVVHPLRGKLYWTD-GD--NISMANMDGSNR
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..: . . : : :::.:. :.:.:: .. . :. : ::.: .:. ..... . ...
CCDS89 TLLFSGQKG-PVGLAIDFPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSGLEVIDAMRSQLGKATALA
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..:: ..:.: ... : .. :.. . : : .:. . :. :.:::.
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. : .:..:.. : ..:: . .. :::.:..:.::::: . . : :: :. ::.:
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::.: : :: .:: :..::: : .:.: :: : :. .: . .::.:... ..
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. . ::.. . :... ..:: :. .: : ..... : . . :.. ..
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CCDS89 TVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTNWNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLA
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.: : ::...:. : .:: . .:..: :. :. ..: ::.:. . ..: : .. ..
CCDS89 IDHRAEKLYFSDATLDKIERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQ
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CCDS89 RANKHVGSNMKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCEL--SPCRINNGGCQDLCLLTHQGHV
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CCDS89 GSFICGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEPVDRPPVLLIANSQNI-LATYLSGAQVSTITPTST
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CCDS22 NDCGDYSDERGCLYQTCQQNQFTCQNGRCISKTFVCDEDNDCGDGSDELMHLCHTPEPTC
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:
CCDS22 PPHEFKCDNGRCIEMMKLCNHLDDCLDNSDEKGCGINECHDPSISGCDHNCTDTLTSFYC
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150 160 170 180 190
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:: :..:.. :: .. :: .:: . . .. .:: ....:: ...:.:
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310 320
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330 340
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: :.:: ..:.: :.:.....: ::.:...:. :.:: ::: . ::. : ::. ::
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:... . : :. ... :::...:: :. ::.::... .: .: : :: ..
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CCDS54 SLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVH-ISKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTW
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300 310
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.: :: .:: : .:: :
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330 340
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:..:: .:::: :.: : :.: :: :: :::.. .. :..
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CCDS54 TPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKG
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CCDS36 HILL-SALKYPANVAVDPVERFIFWS--SEVAGSLYRADLDGVGVKALLETSEKI--TAV
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CCDS36 SLDVLDKRLFWIQYNREGSNSLICSCDYDGGSVH-ISKHPTQHNLFAMSLFGDRIFYSTW
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250 260 270 280 290
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CCDS36 KMKTIWIANKHTGKDMVRINLHSS-FVPLGELKVVHPLAQPKAEDDTWEPEQKLCKLRKG
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pF1KE3 GCS----------HLCL------MSPVKPF------------------------YQCACP
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CCDS36 NCSSTVCGQDLQSHLCMCAEGYALSRDRKYCEDVNECAFWNHGCTLGCKNTPGSYYCTCP
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320
pF1KE3 TGVKLLENGKTC-----------------------------------KDGAT--------
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CCDS36 VGFVLLPDGKRCHQLVSCPRNVSECSHDCVLTSEGPLCFCPEGSVLERDGKTCSGCSSPD
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330 340
pF1KE3 ---------------------------------------ELLLLARRTDLRRISLDTPDF
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CCDS36 NGGCSQLCVPLSPVSWECDCFPGYDLQLDEKSCAASGPQPFLLFANSQDIRHMHFDGTDY
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pF1KE3 TDIVLQLEDIRHAIAIDYDPVEGYIYWTDDEVRAIRRSFIDGSGSQFVVTAQIAHPDGIA
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CCDS36 GTLLSQ--QMGMVYALDHDPVENKIYFAHTALKWIERANMDGSQRERLIEEGVDVPEGLA
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pF1KE3 VDWVARNLYWTDTGTDRIEVTRLNGTMRKILISEDLEEPRAIVLDPMVGYMYWTDWGEIP
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CCDS36 VDWIGRRFYWTDRGKSLIGRSDLNGKRSKIITKENISQPRGIAVHPMAKRLFWTDTGINP
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CCDS36 RIESSSLQGLGRLVIASSDLIWPSGITIDFLTDKLYWCDAKQSVIEMANLDGSKRRRLTQ
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CCDS36 NDVGHPFAVAVFEDYVWFSDWAMPSVMRVNKRTGKDRVRL-QGSMLKPSSLVVVHPLAKP
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CCDS36 GADPCLYQNGGCEHICKKRLGTAWCSCREGFMKASDGKTCLALDGHQLLAGGEVDLKNQV
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pF1KE3 ETNNNNVAIPLTGVKEASALDFDVTDNRIYWTDISLKTISRAFMNGSALEHVVEFGLDYP
CCDS36 TPLDILSKTRVSEDNITESQHMLVAEIMVSDQDDCAPVGCSMYARCISEGEDATCQCLKG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]