FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2704, 1349 aa 1>>>pF1KE2704 1349 - 1349 aa - 1349 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9891+/-0.00127; mu= -2.0282+/- 0.076 mean_var=320.1462+/-66.058, 0's: 0 Z-trim(111.2): 58 B-trim: 17 in 1/50 Lambda= 0.071680 statistics sampled from 12136 (12182) to 12136 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16 Scan time: 6.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9454.1 LMO7 gene_id:4008|Hs108|chr13 (1349) 8922 937.7 0 CCDS81774.1 LMO7 gene_id:4008|Hs108|chr13 (1398) 6522 689.5 1.6e-197 CCDS81773.1 LMO7 gene_id:4008|Hs108|chr13 (1631) 6522 689.6 1.9e-197 CCDS53876.1 LMO7 gene_id:4008|Hs108|chr13 (1385) 5959 631.3 5.5e-180 CCDS54764.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (1056) 1331 152.6 5.2e-36 CCDS54763.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (1057) 1331 152.6 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CCDS54 QEKERRERELHEAYKNARSQEEAEGILQQ--YIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHST 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 KEDSTTFAKREDRVTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKT . . ..: . . . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: CCDS54 EPNLSSFLNDPNPMK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKT 480 490 500 510 520 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 DTVRLTSVVTPRPFGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDA : . . ..::.:. :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: CCDS54 VTPKAVPMLTPKPY-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP-- 530 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 SQLASSLSSQKEVAATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEG : ::.... : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : CCDS54 ---AHSLTKSQMF----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE- 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 EISPQREVSRSQDQFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQL . :. ::.. .: ::: .. . . : :...: ::. : .. CCDS54 KTEPN-----SQEDKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEF 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 QVDDEIIAINNTKFSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIY . . ..: .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: CCDS54 PSSPQ---LKNDVSEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT---- 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 NSEKSSNLSVTTDFSESLQSSNIESKEINGIHDESNAFESKASESISLKNLKRRSQFFEQ .: : ... : : .: : ::. :: CCDS54 ---------LTFPFLDKMP-------EANQLH---------------LPNLN--SQVDSP 730 740 750 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 GSSDSVVPDLPVPTISAPSRWVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQR .: : :... . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::.. CCDS54 SSEKS-------PVMTPFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLKEEWEK 760 770 780 790 800 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 AKQEAERENSKYLDEELMVLSSNSMSLTTREPSLATWEATWSEGSKSSDREGTRAGEEER :..:.:.:. .: .:: .. .. . .:. .:.:.:. .: .. : CCDS54 AQKEVEEEERRYYEEERKIIEDTVVPFTV--------------SSSSADQLSTSSSMTEG 810 820 830 840 850 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 RQPQEEVVHEDQGKKPQDQLVIERERKWEQQLQEEQEQKRLQAEAEEQKRPAEEQKRQAE .... : :. ::. ...:.:....: . CCDS54 SGTMNKI---DLGNC-QDE---KQDRRWKKSFQGD------------------------- 860 870 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 IERETSVRIYQYRRPVDSYDIPKTEEASSGFLPGDRNKSRSTTELDDYSTNKNGNNKYLD :: . ::.:. :: :. CCDS54 ----------------DSDLLLKTRES-------DR----------------------LE 880 890 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 QIGNMTSSQRRSKKEQVPSGAELERQQILQEMRKRTPLHNDNSWIRQRSASVNKEPVSLP . :..: :: :. : ::: CCDS54 EKGSLTE------------GALA---------------HSGN-------------PVS-K 900 910 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 GIMRRGESLDNLDSPRSNSWRQPPWLNQPTGFYASSSVQDFSRPPPQLVSTSNRAYMRNP :. . . . .:. .. : : : : : : CCDS54 GVHEDHQLDTEAGAPHCGT---NPQLAQD---------------PSQ-----------NQ 920 930 940 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 SSSVPPPSAGSVKTSTTGVATTQSPTPRSHSPSASQSGSQLRNRSVSGKRICSYCNNILG ..: : :. .:: .: . .: . . .::: : .:.:::..:: :. :: CCDS54 QTSNPTHSSEDVKPKT--LPLDKSINHQIESPSE-------RRKSISGKKLCSSCGLPLG 950 960 970 980 990 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 KGAAMIIESLGLCYHLHCFKCVACECDLGGSSSGAEVRIRNHQLYCNDCYLRFKS-GRPT ::::::::.:.: .:..::.: :. .:: . ::..::::: : :::::.: .: :.:: CCDS54 KGAAMIIETLNLYFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQPT 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 AM .. CCDS54 TL >>CCDS54763.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (1057 aa) initn: 1598 init1: 547 opt: 1331 Z-score: 759.9 bits: 152.6 E(32554): 5.2e-36 Smith-Waterman score: 1662; 32.4% identity (55.7% similar) in 1292 aa overlap (74-1349:31-1057) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 CVGWLYLRDRVCSKKDIILRTEQNSGRTILIKAVTEKNFETKDFRASLENGVLLCDLINK :. :: ..: ::::..::::.:::.:.: CCDS54 MACPALGLEALQPLQPEPPPEPAFSEAQKWIEQVTGRSFGDKDFRTGLENGILLCELLNA 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LKPGVIKKINRLSTPIAGLDNINVFLKACEQIGLKEAQLFHPGDLQDLSNRVTVKQEETD .:::..:::::: ::::::::: .::..:...::::.::: :.:::: :::::::. . . 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CCDS54 QEKERRERELHEAYKNARSQEEAEGILQQ--YIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHST 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 KEDSTTFAKREDRVTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKT . . ..: . . . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: CCDS54 EPNLSSFLNDPNPMK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKT 480 490 500 510 520 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 DTVRLTSVVTPRPFGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDA : . . ..::.:. :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: CCDS54 VTPKAVPMLTPKPY-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP-- 530 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 SQLASSLSSQKEVAATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEG : ::.... : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : CCDS54 ---AHSLTKSQMF----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE- 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 EISPQREVSRSQDQFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQL . :. ::.. .: ::: .. . . : :...: ::. : .. CCDS54 KTEPN-----SQEDKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEF 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 QVDDEIIAINNTKFSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIY . . ..: .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: CCDS54 PSSPQ---LKNDVSEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT---- 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 NSEKSSNLSVTTDFSESLQSSNIESKEINGIHDESNAFESKASESISLKNLKRRSQFFEQ .: : ... : : .: : ::. :: CCDS54 ---------LTFPFLDKMP-------EANQLH---------------LPNLN--SQVDSP 730 740 750 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 GSSDSVVPDLPVPTISAPSRWVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQR .: : :: : . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::.. CCDS54 SSEKS-----PVMT-PQFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLKEEWEK 760 770 780 790 800 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 AKQEAERENSKYLDEELMVLSSNSMSLTTREPSLATWEATWSEGSKSSDREGTRAGEEER :..:.:.:. .: .:: .. .. . .:. .:.:.:. .: .. : CCDS54 AQKEVEEEERRYYEEERKIIEDTVVPFTV--------------SSSSADQLSTSSSMTEG 810 820 830 840 850 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 RQPQEEVVHEDQGKKPQDQLVIERERKWEQQLQEEQEQKRLQAEAEEQKRPAEEQKRQAE .... : :. ::. ...:.:....: . CCDS54 SGTMNKI---DLGNC-QDE---KQDRRWKKSFQGD------------------------- 860 870 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 IERETSVRIYQYRRPVDSYDIPKTEEASSGFLPGDRNKSRSTTELDDYSTNKNGNNKYLD :: . ::.:. :: :. CCDS54 ----------------DSDLLLKTRES-------DR----------------------LE 880 890 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 QIGNMTSSQRRSKKEQVPSGAELERQQILQEMRKRTPLHNDNSWIRQRSASVNKEPVSLP . :..: :: :. : ::: CCDS54 EKGSLTE------------GALA---------------HSGN-------------PVS-K 900 910 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 GIMRRGESLDNLDSPRSNSWRQPPWLNQPTGFYASSSVQDFSRPPPQLVSTSNRAYMRNP :. . . . .:. .. : : : : : : CCDS54 GVHEDHQLDTEAGAPHCGT---NPQLAQD---------------PSQ-----------NQ 920 930 940 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 SSSVPPPSAGSVKTSTTGVATTQSPTPRSHSPSASQSGSQLRNRSVSGKRICSYCNNILG ..: : :. .:: .: . .: . . .::: : .:.:::..:: :. :: CCDS54 QTSNPTHSSEDVKPKT--LPLDKSINHQIESPSE-------RRKSISGKKLCSSCGLPLG 950 960 970 980 990 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 KGAAMIIESLGLCYHLHCFKCVACECDLGGSSSGAEVRIRNHQLYCNDCYLRFKS-GRPT ::::::::.:.: .:..::.: :. .:: . ::..::::: : :::::.: .: :.:: CCDS54 KGAAMIIETLNLYFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQPT 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 AM .. CCDS54 TL >>CCDS33977.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (1083 aa) initn: 1682 init1: 547 opt: 1331 Z-score: 759.8 bits: 152.6 E(32554): 5.3e-36 Smith-Waterman score: 1719; 32.5% identity (56.8% similar) in 1294 aa overlap (74-1349:31-1083) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 CVGWLYLRDRVCSKKDIILRTEQNSGRTILIKAVTEKNFETKDFRASLENGVLLCDLINK :. :: ..: ::::..::::.:::.:.: CCDS33 MACPALGLEALQPLQPEPPPEPAFSEAQKWIEQVTGRSFGDKDFRTGLENGILLCELLNA 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LKPGVIKKINRLSTPIAGLDNINVFLKACEQIGLKEAQLFHPGDLQDLSNRVTVKQEETD .:::..:::::: ::::::::: .::..:...::::.::: :.:::: :::::::. . . 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CCDS33 QEKERRERELHEAYKNARSQEEAEGILQQ--YIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHST 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 KEDSTTFAKREDRVTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKT . . ..: . . . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: CCDS33 EPNLSSFLNDPNPMK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKT 480 490 500 510 520 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 DTVRLTSVVTPRPFGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDA : . . ..::.:. :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: CCDS33 VTPKAVPMLTPKPY-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP-- 530 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 SQLASSLSSQKEVAATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEG : ::.... : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : CCDS33 ---AHSLTKSQMF----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE- 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 EISPQREVSRSQDQFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQL . :. ::.. .: ::: .. . . : :...: ::. : .. CCDS33 KTEPN-----SQEDKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEF 640 650 660 670 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 QVDDEIIAINNTKFSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIY . . ..: .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: CCDS33 PSSPQ---LKNDVSEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT---- 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 NSEKSSNLSVTTDFSESLQSSNIESKEINGIHDESNAFESKASESISLKNLKRRSQFFEQ .: : ... : : .: : ::. :: CCDS33 ---------LTFPFLDKMP-------EANQLH---------------LPNLN--SQVDSP 730 740 750 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 GSSDSVVPDLPVPTISAPSR-WVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQ .: : :... . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::. CCDS33 SSEKS-------PVMTPQFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLKEEWE 760 770 780 790 800 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 RAKQEAERENSKYLDEELMVLSSNSMSLTTREPSLATWEATWSEGSKSSDREGTRAGEEE .:..:.:.:. .: .:: .. .. . .:. .:.:.:. .: .. : CCDS33 KAQKEVEEEERRYYEEERKIIEDTVVPFTV--------------SSSSADQLSTSSSMTE 810 820 830 840 850 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 RRQPQEEVVHEDQGKKPQDQLVIERERKWEQQLQEEQEQKRLQAEAEEQKRPAEEQKRQA .... : :. ::. ...:.:....: .. . :. ..:. : CCDS33 GSGTMNKI---DLGNC-QDE---KQDRRWKKSFQGDDSDLLLK---------TRESDRLE 860 870 880 890 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 EIERETSVRIYQYRRPVDSYDIPKTEEASSGFLPGDRNKSRSTTELD-DYSTNKNGNNKY : : . . :: :.: . .:: . .. . :.: CCDS33 EKGSLTEGALAHSGNPV-----------SKGV--------HEDHQLDTEAGAPHCGTNPQ 900 910 920 930 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 LDQIGNMTSSQRRSKKEQVPSGAELERQQILQEMRKRTPLHNDNSWIRQRSASVNKEPVS : : :: :... .: :. : . .: . CCDS33 L---------------AQDPS----------QNQQTSNPTHS----------SEDVKPKT 940 950 960 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 LPGIMRRGESLDNLDSPRSNSWRQPPWLNQPTGFYASSSVQDFSRPPPQLVSTSNRAYMR :: ::. ... ...:. .: . :. : CCDS33 LP-----------LDKSINHQ------IESPSERRKKSPREHFQAGP------------F 970 980 990 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 NPSSSVPPPSAGSVKTSTTGVATTQSPTPRSHSPSASQSGSQLRNRSVSGKRICSYCNNI .: : .:: : ::: :::.:::..:: :. CCDS33 SPCSPTPP---G------------QSP-----------------NRSISGKKLCSSCGLP 1000 1010 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 LGKGAAMIIESLGLCYHLHCFKCVACECDLGGSSSGAEVRIRNHQLYCNDCYLRFKS-GR ::::::::::.:.: .:..::.: :. .:: . ::..::::: : :::::.: .: :. CCDS33 LGKGAAMIIETLNLYFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQ 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 PTAM ::.. CCDS33 PTTL 1080 >>CCDS75119.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (1069 aa) initn: 1648 init1: 547 opt: 1086 Z-score: 622.9 bits: 127.3 E(32554): 2.2e-28 Smith-Waterman score: 1745; 33.0% identity (56.7% similar) in 1293 aa overlap (74-1349:31-1069) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 CVGWLYLRDRVCSKKDIILRTEQNSGRTILIKAVTEKNFETKDFRASLENGVLLCDLINK :. :: ..: ::::..::::.:::.:.: CCDS75 MACPALGLEALQPLQPEPPPEPAFSEAQKWIEQVTGRSFGDKDFRTGLENGILLCELLNA 10 20 30 40 50 60 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LKPGVIKKINRLSTPIAGLDNINVFLKACEQIGLKEAQLFHPGDLQDLSNRVTVKQEETD .:::..:::::: ::::::::: .::..:...::::.::: :.:::: :::::::. . . CCDS75 IKPGLVKKINRLPTPIAGLDNIILFLRGCKELGLKESQLFDPSDLQDTSNRVTVKSLDYS 70 80 90 100 110 120 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 RRVKNVLITLYWLGRKAQSNPYYNGPHLNLKAFENLLGQALTKALEDSSFLKRSGRDSGY :..::::.:.::::. :.: :.: :::: ::.::.: . : .: ::: ::::: CCDS75 RKLKNVLVTIYWLGKAANSCTSYSGTTLNLKEFEGLLAQ-MRKDTDDIESPKRSIRDSGY 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 GDIWCPERGEFLAPPRHHKREDSFESLDSLGSRSLTSCSSDITLRGGREGFESDTDSEFT : : ::.. :.:::: :.:::.::::.:::: . : :..:::. .: ::..:.. CCDS75 IDCWDSERSDSLSPPRHG-RDDSFDSLDSFGSRSRQTPSPDVVLRGSSDGRGSDSESDLP 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 F-KMQDYNKDDMSYRRISAVEPKTALPFNRFLPNKSRQPSYVPAPLRKKKPDKHEDNRRS :. : .::::: :: : :::.:.:::..::::: : .:::::::::: .. :. :.: CCDS75 HRKLPDVKKDDMSARRTSHGEPKSAVPFNQYLPNKSNQTAYVPAPLRKKKAER-EEYRKS 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 pF1KE2 WASPVYTEADGTFSRLFQKIYGENGSKSMSDVSAED---VQNLRQLRYEEMQKIKSQLKE : : . . : : :. : :: :. :. :: . : :..: :..::.: CCDS75 W-STATSPLGG--ERPFR-------STSMFDMRCEEEAAVQPHSRARQEQLQLINNQLRE 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 QDQKWQDDLAKWKDRRKSYTSDLQKKKEEREEIEK-----QALEKSKRSSKTFKEMLQDR .:.:::::::.::.::.: ..:: ::.:::...:: .. . ..: ::..:..:.. CCDS75 EDDKWQDDLARWKSRRRSVSQDLIKKEEERKKMEKLLAGEDGTSERRKSIKTYREIVQEK 350 360 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ESQNQK--STVPSRRRMYSFDDVLEEGKRPPTMTVSEASYQSERVEEKGATYPSEIPKED : .... . . : . . .:.. .:.::: ::.: :. . . CCDS75 ERRERELHEAYKNARSQEEAEGILQQ--YIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHSTEPN 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 STTFAKREDRVTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKTDTV ..: . . . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: : CCDS75 LSSFLNDPNPMK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKTVTP 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 RLTSVVTPRPFGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDASQL . . ..::.:. :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: CCDS75 KAVPMLTPKPY-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP----- 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 ASSLSSQKEVAATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEGEIS : ::.... : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : . CCDS75 AHSLTKSQMF----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE-KTE 580 590 600 610 620 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 PQREVSRSQDQFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQLQVD :. ::.. .: ::: .. . . : :...: ::. : .. . CCDS75 PN-----SQEDKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEFPSS 630 640 650 660 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 DEIIAINNTKFSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIYNSE . ..: .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: CCDS75 PQ---LKNDVSEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT------- 670 680 690 700 710 820 830 840 850 860 pF1KE2 KSSNLSVTTDFSESLQSSNIESKEINGIHDES-NAFESKASESISLK--NLKRRSQFFEQ .: : ... : : .: . :. :: .. :. :. : :::::: : CCDS75 ------LTFPFLDKMP-------EANQLHLPNLNSQESPGTASVPLRVQNSWRRSQFFSQ 720 730 740 750 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 GSSDSVVPDLPVPTISAPSR-WVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQ : :: :. . .: . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::. CCDS75 -SVDS--PSSEKSPVMTPFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLKEEWE 760 770 780 790 800 810 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 RAKQEAERENSKYLDEELMVLSSNSMSLTTREPSLATWEATWSEGSKSSDREGTRAGEEE .:..:.:.:. .: .:: .. .. . .:. .:.:.:. .: .. : CCDS75 KAQKEVEEEERRYYEEERKIIEDTVVPFTV--------------SSSSADQLSTSSSMTE 820 830 840 850 860 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 RRQPQEEVVHEDQGKKPQDQLVIERERKWEQQLQEEQEQKRLQAEAEEQKRPAEEQKRQA .... : :. ::. ...:.:....: . CCDS75 GSGTMNKI---DLGNC-QDE---KQDRRWKKSFQGD------------------------ 870 880 890 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 EIERETSVRIYQYRRPVDSYDIPKTEEASSGFLPGDRNKSRSTTELDDYSTNKNGNNKYL :: . ::.:. :: : CCDS75 -----------------DSDLLLKTRES-------DR----------------------L 900 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 DQIGNMTSSQRRSKKEQVPSGAELERQQILQEMRKRTPLHNDNSWIRQRSASVNKEPVSL .. :..: :: :. : ::: CCDS75 EEKGSLTE------------GALA---------------HSGN-------------PVS- 910 920 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 PGIMRRGESLDNLDSPRSNSWRQPPWLNQPTGFYASSSVQDFSRPPPQLVSTSNRAYMRN :. . . . .:. .. : : : : : : CCDS75 KGVHEDHQLDTEAGAPHCGT---NPQLAQD---------------PSQ-----------N 930 940 950 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 PSSSVPPPSAGSVKTSTTGVATTQSPTPRSHSPSASQSGSQLRNRSVSGKRICSYCNNIL ..: : :. .:: .: . .: . . .::: : .:.:::..:: :. : CCDS75 QQTSNPTHSSEDVKPKT--LPLDKSINHQIESPSE-------RRKSISGKKLCSSCGLPL 960 970 980 990 1000 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 GKGAAMIIESLGLCYHLHCFKCVACECDLGGSSSGAEVRIRNHQLYCNDCYLRFKS-GRP :::::::::.:.: .:..::.: :. .:: . ::..::::: : :::::.: .: :.: CCDS75 GKGAAMIIETLNLYFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 TAM :.. CCDS75 TTL >>CCDS47047.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (902 aa) initn: 1065 init1: 295 opt: 750 Z-score: 436.2 bits: 92.5 E(32554): 5.6e-18 Smith-Waterman score: 1131; 29.0% identity (52.6% similar) in 1160 aa overlap (206-1349:8-902) 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LGRKAQSNPYYNGPHLNLKAFENLLGQALTKALEDSSFLKRSGRDSGYGDIWCPERGEFL : .: ::: ::::: : : ::.. : CCDS47 MDSERQVKDTDDIESPKRSIRDSGYIDCWDSERSDSL 10 20 30 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 APPRHHKREDSFESLDSLGSRSLTSCSSDITLRGGREGFESDTDSEFTF-KMQDYNKDDM .:::: :.:::.::::.:::: . : :..:::. .: ::..:.. :. : .:::: CCDS47 SPPRHG-RDDSFDSLDSFGSRSRQTPSPDVVLRGSSDGRGSDSESDLPHRKLPDVKKDDM 40 50 60 70 80 90 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 SYRRISAVEPKTALPFNRFLPNKSRQPSYVPAPLRKKKPDKHEDNRRSWA---SPVYTEA : :: : :::.:.:::..::::: : .:::::::::: .. :. :.::. ::. : CCDS47 SARRTSHGEPKSAVPFNQYLPNKSNQTAYVPAPLRKKKAER-EEYRKSWSTATSPLGGER 100 110 120 130 140 150 360 370 380 390 400 pF1KE2 DGTFSRLFQKIYGENGSKSMSDVSAED---VQNLRQLRYEEMQKIKSQLKEQDQKWQDDL .. . . : :: :. :. :: . : :..: :..::.:.:.:::::: CCDS47 PFRYGPR-TPVSDDAESTSMFDMRCEEEAAVQPHSRARQEQLQLINNQLREEDDKWQDDL 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 AKWKDRRKSYTSDLQKKKEEREEIEK-----QALEKSKRSSKTFKEMLQDRESQNQK--S :.::.::.: ..:: ::.:::...:: .. . ..: ::..:..:..: .... CCDS47 ARWKSRRRSVSQDLIKKEEERKKMEKLLAGEDGTSERRKSIKTYREIVQEKERRERELHE 220 230 240 250 260 270 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 TVPSRRRMYSFDDVLEEGKRPPTMTVSEASYQSERVEEKGATYPSEIPKEDSTTFAKRED . . : . . .:. . .:.::: ::.: :. . . ..: . . CCDS47 AYKNARSQEEAEGILQ--QYIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHSTEPNLSSFLNDPN 280 290 300 310 320 330 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 RVTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKTDTVRLTSVVTPR . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: : . . ..::. CCDS47 PMK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKTVTPKAVPMLTPK 340 350 360 370 380 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 PFGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDASQLASSLSSQKE :. :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: : ::.... CCDS47 PY-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP-----AHSLTKSQM 390 400 410 420 430 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 VAATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEGEISPQREVSRSQ : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : . :. :: CCDS47 F----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE-KTEPN-----SQ 440 450 460 470 480 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 DQFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQLQVDDEIIAINNT .. .: ::: .. . . : :...: ::. : .. . .. .: CCDS47 EDKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEFPSSPQL---KND 490 500 510 520 530 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 KFSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIYNSEKSSNLSVTT .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: .: CCDS47 VSEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT-------------LTF 540 550 560 570 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 DFSESLQSSNIESKEINGIHDESNAFESKASESISLKNLKRRSQFFEQGSSDSVVPDLPV : ... : : .: : ::. :: .: : CCDS47 PFLDKMP-------EANQLH---------------LPNLN--SQVDSPSSEKS------- 580 590 600 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 PTISAPSRWVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQRAKQEAERENSKY :... . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::..:..:.:.:. .: CCDS47 PVMTPFKFWAWDPEEERRRQEKWQQEQERLLQERYQKEQDKLKEEWEKAQKEVEEEERRY 610 620 630 640 650 660 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 LDEELMVLSSNSMSLTTREPSLATWEATWSEGSKSSDREGTRAGEEERRQPQEEVVHEDQ .:: .. .. . .:. .:.:.:. .: .. : .... : CCDS47 YEEERKIIEDTVVPFTV--------------SSSSADQLSTSSSMTEGSGTMNKI---DL 670 680 690 700 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 GKKPQDQLVIERERKWEQQLQEEQEQKRLQAEAEEQKRPAEEQKRQAEIERETSVRIYQY :. ::. ...:.:....: . CCDS47 GNC-QDE---KQDRRWKKSFQGD------------------------------------- 710 720 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 RRPVDSYDIPKTEEASSGFLPGDRNKSRSTTELDDYSTNKNGNNKYLDQIGNMTSSQRRS :: . ::.:. :: :.. :..: CCDS47 ----DSDLLLKTRES-------DR----------------------LEEKGSLTE----- 730 740 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 KKEQVPSGAELERQQILQEMRKRTPLHNDNSWIRQRSASVNKEPVSLPGIMRRGESLDNL :: :. : ::: .: :. CCDS47 -------GALA---------------HSGN-------------PVS------KGVHEDH- 750 760 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 DSPRSNSWRQPPWLNQPTGFYASSSVQDFSRPPPQLVSTSNRAYMRNPSSSVPPPSAGSV :. .: .. .... : : .::: : :. .: CCDS47 ------------QLDTEAGAPHCGTNPQLAQDPSQNQQTSN-----------PTHSSEDV 770 780 790 800 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 KTSTTGVATTQSPTPRSHSPSASQSGSQLRNRSVSGKRICSYCNNILGKGAAMIIESLGL : .: . .: . . .::: : .:.:::..:: :. ::::::::::.:.: CCDS47 KPKT--LPLDKSINHQIESPSE-------RRKSISGKKLCSSCGLPLGKGAAMIIETLNL 810 820 830 840 850 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 CYHLHCFKCVACECDLGGSSSGAEVRIRNHQLYCNDCYLRFKS-GRPTAM .:..::.: :. .:: . ::..::::: : :::::.: .: :.::.. CCDS47 YFHIQCFRCGICKGQLGDAVSGTDVRIRNGLLNCNDCYMRSRSAGQPTTL 860 870 880 890 900 >>CCDS75121.1 LIMCH1 gene_id:22998|Hs108|chr4 (910 aa) initn: 1115 init1: 295 opt: 716 Z-score: 417.1 bits: 89.0 E(32554): 6.5e-17 Smith-Waterman score: 1210; 29.8% identity (53.6% similar) in 1163 aa overlap (204-1349:1-910) 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YWLGRKAQSNPYYNGPHLNLKAFENLLGQALTKALEDSSFLKRSGRDSGYGDIWCPERGE . : .: ::: ::::: : : ::.. CCDS75 MRKDTDDIESPKRSIRDSGYIDCWDSERSD 10 20 30 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 FLAPPRHHKREDSFESLDSLGSRSLTSCSSDITLRGGREGFESDTDSEFTF-KMQDYNKD :.:::: :.:::.::::.:::: . : :..:::. .: ::..:.. :. : .:: CCDS75 SLSPPRHG-RDDSFDSLDSFGSRSRQTPSPDVVLRGSSDGRGSDSESDLPHRKLPDVKKD 40 50 60 70 80 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 DMSYRRISAVEPKTALPFNRFLPNKSRQPSYVPAPLRKKKPDKHEDNRRSWASPVYTEAD ::: :: : :::.:.:::..::::: : .:::::::::: .. :. :.:: : . . CCDS75 DMSARRTSHGEPKSAVPFNQYLPNKSNQTAYVPAPLRKKKAER-EEYRKSW-STATSPLG 90 100 110 120 130 140 360 370 380 390 400 pF1KE2 GTFSRLFQKIYGENGSKSMSDVSAED---VQNLRQLRYEEMQKIKSQLKEQDQKWQDDLA : : :. : :: :. :. :: . : :..: :..::.:.:.::::::: CCDS75 GE--RPFR-------STSMFDMRCEEEAAVQPHSRARQEQLQLINNQLREEDDKWQDDLA 150 160 170 180 190 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 KWKDRRKSYTSDLQKKKEEREEIEK-----QALEKSKRSSKTFKEMLQDRESQNQK--ST .::.::.: ..:: ::.:::...:: .. . ..: ::..:..:..: .... . CCDS75 RWKSRRRSVSQDLIKKEEERKKMEKLLAGEDGTSERRKSIKTYREIVQEKERRERELHEA 200 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 VPSRRRMYSFDDVLEEGKRPPTMTVSEASYQSERVEEKGATYPSEIPKEDSTTFAKREDR . : . . .:.. .:.::: ::.: :. . . ..: . . CCDS75 YKNARSQEEAEGILQQ--YIERFTISEAVL--ERLEMPKILERSHSTEPNLSSFLNDPNP 260 270 280 290 300 310 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 VTTEIQLPSQSPVEEQSPASLSSLRSRSTQMESTRVSASLPRSYRKTDTVRLTSVVTPRP . : .:: . :.. . .:.. .... ..: : :: : . . ..::.: CCDS75 MK---YLRQQSLPPPKFTATVETTIARASVLDTSMSAGS--GSPSKTVTPKAVPMLTPKP 320 330 340 350 360 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 FGSQTRGISSLPRSYTMDDAWKYNGDVEDIKRTPNNVVSTPAPSPDASQLASSLSSQKEV . :: .. ... ... .: . :: : ..: .. :. .: : ::.... CCDS75 Y-SQPKNSQDVLKTFKVDGKVSVNG--ETVHREEEKERECPTVAP-----AHSLTKSQMF 370 380 390 400 410 420 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 AATEEDVTRLPSPTSPFSSLSQDQAATSKATLSSTSGLDLMSESGEGEISPQREVSRSQD : :.:. . ::. :.::... . .: . .. . : . :. ::. CCDS75 ----EGVARVHG--SPLE-LKQDNGSIEINIKKPNSVPQELAATTE-KTEPN-----SQE 430 440 450 460 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 QFSDMRISINQTPGKSLDFGFTIKWDIPGIFVASVEAGSPA-EFSQLQVDDEIIAINNTK . .: ::: .. . . : :...: ::. : .. . .. .: CCDS75 DKND--------GGKSRKGNIELASSEPQHFTTTVTRCSPTVAFVEFPSSPQL---KNDV 470 480 490 500 510 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 FSYNDSKEWEEAMAKAQETGHLVMDVRRYGKAGSPETKWIDATSGIYNSEKSSNLSVTTD .:.:. :. :. : ::.. .. : ::: .:: .: CCDS75 SEEKDQKKPENEMSGKVE---LVLS-QKVVKPKSPEP---EAT-------------LTFP 520 530 540 550 830 840 850 860 870 pF1KE2 FSESLQSSNIESKEINGIHDES-NAFESKASESISLK--NLKRRSQFFEQGSSDSVVPDL : ... : : .: . :. :: .. :. :. : :::::: : : :: :. CCDS75 FLDKMP-------EANQLHLPNLNSQESPGTASVPLRVQNSWRRSQFFSQ-SVDS--PSS 560 570 580 590 600 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 PVPTISAPSR-WVWDQEEERKRQERWQKEQDRLLQEKYQREQEKLREEWQRAKQEAEREN . .: . :.:: ::::.:::.::.::.:::::.::.::.::.:::..:..:.:.:. 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