FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2677, 1820 aa 1>>>pF1KE2677 1820 - 1820 aa - 1820 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 61573307 residues in 86401 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.2569+/-0.000827; mu= -38.7976+/- 0.051 mean_var=830.4201+/-176.265, 0's: 0 Z-trim(113.5): 619 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.044507 statistics sampled from 22369 (22951) to 22369 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16 Scan time: 12.110 The best scores are: opt bits E(86401) NP_001271188 (OMIM: 605498) kinesin-like protein K (1820) 11453 753.5 4.3e-216 NP_057279 (OMIM: 605498) kinesin-like protein KIF2 (1780) 6978 466.1 1.3e-129 XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633) 803 69.8 4.2e-10 XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551) 794 69.2 6e-10 XP_011529851 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2553) 794 69.2 6e-10 XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604) 794 69.2 6.1e-10 XP_011529849 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2605) 794 69.2 6.1e-10 XP_011529847 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2648) 794 69.2 6.2e-10 NP_001804 (OMIM: 117143,616051) centromere-associa (2701) 794 69.2 6.3e-10 NP_004847 (OMIM: 605064) kinesin-like protein KIF2 ( 856) 765 67.0 9e-10 NP_612565 (OMIM: 605064) kinesin-like protein KIF2 ( 960) 765 67.0 9.9e-10 NP_001273663 (OMIM: 117143,616051) centromere-asso (2580) 699 63.1 4.2e-08 XP_011529846 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2676) 699 63.1 4.3e-08 NP_060046 (OMIM: 611253) kinesin-like protein KIF2 (1401) 612 57.3 1.2e-06 XP_016870393 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1401) 612 57.3 1.2e-06 XP_016870392 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1401) 612 57.3 1.2e-06 XP_011520541 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 839) 562 54.0 7.5e-06 NP_001258856 (OMIM: 611253) kinesin-like protein K (1335) 563 54.2 1e-05 XP_016870396 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1335) 563 54.2 1e-05 NP_002069 (OMIM: 602509) golgin subfamily A member (2230) 569 54.7 1.2e-05 NP_001166184 (OMIM: 602509) golgin subfamily A mem (2243) 569 54.7 1.2e-05 XP_005265131 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2245) 569 54.7 1.2e-05 XP_016861675 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 569 54.7 1.2e-05 XP_016861674 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 569 54.7 1.2e-05 XP_005265130 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2252) 569 54.7 1.2e-05 XP_016861673 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2276) 569 54.7 1.2e-05 XP_005265128 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2278) 569 54.7 1.2e-05 XP_005265127 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2283) 569 54.7 1.2e-05 XP_005265126 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2285) 569 54.7 1.2e-05 XP_016870395 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1355) 559 53.9 1.3e-05 NP_004514 (OMIM: 148760,152950) kinesin-like prote (1056) 549 53.2 1.6e-05 XP_016870390 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_011517152 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_016870389 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_011517151 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_016870391 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_011517150 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05 XP_005265132 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2214) 562 54.2 1.6e-05 XP_016861676 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2236) 562 54.2 1.7e-05 XP_005265129 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2269) 562 54.2 1.7e-05 XP_016861677 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2195) 559 54.0 1.9e-05 XP_006713173 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2250) 559 54.0 1.9e-05 NP_001258857 (OMIM: 611253) kinesin-like protein K (1304) 549 53.3 1.9e-05 XP_016870397 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1304) 549 53.3 1.9e-05 NP_001268230 (OMIM: 605064) kinesin-like protein K ( 766) 531 52.0 2.8e-05 XP_005254856 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 870) 519 51.2 5.2e-05 XP_005254855 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 890) 519 51.2 5.3e-05 XP_005254854 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 925) 519 51.2 5.5e-05 XP_016870394 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1361) 526 51.8 5.5e-05 XP_005254853 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 974) 519 51.3 5.7e-05 >>NP_001271188 (OMIM: 605498) kinesin-like protein KIF20 (1820 aa) initn: 11453 init1: 11453 opt: 11453 Z-score: 4000.6 bits: 753.5 E(86401): 4.3e-216 Smith-Waterman score: 11453; 99.9% identity (99.9% similar) in 1820 aa overlap (1-1820:1-1820) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILDSQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KEELSASSARTQNLKADLQRKEEDYADLKEKLTDAKKQIKQVQKEVSVMRDEDKLLRIKI 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 NELEKKKNQCSQELDMKQRTIQQLKEQLNNQKVEEAIQQYERACKDLNVKEKIIEDMRMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NELEKKKNQCSQELDMKQRTIQQLKEQLNNQKVEEAIQQYERACKDLNVKEKIIEDMRMT 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 LEEQEQTQVEQDQVLEAKLEEVERLATELEKWKEKCNDLETKNNQRSNKEHENNTDVLGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LEEQEQTQVEQDQVLEAKLEEVERLATELEKWKEKCNDLETKNNQRSNKEHENNTDVLGK 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 LTNLQDELQESEQKYNADRKKWLEEKMMLITQAKEAENIRNKEMKKYAEDRERFFKQQNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LTNLQDELQESEQKYNADRKKWLEEKMMLITQAKEAENIRNKEMKKYAEDRERFFKQQNE 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE2 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