FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3449, 1311 aa 1>>>pF1KE3449 1311 - 1311 aa - 1311 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1923+/-0.00125; mu= -18.0419+/- 0.074 mean_var=561.2726+/-125.126, 0's: 0 Z-trim(113.9): 64 B-trim: 886 in 1/53 Lambda= 0.054136 statistics sampled from 14461 (14502) to 14461 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.749), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16 Scan time: 6.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1311) 8945 714.8 3.8e-205 CCDS82902.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1232) 8138 651.7 3.4e-186 CCDS58004.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 970) 1603 141.3 1.2e-32 CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 900) 1589 140.1 2.5e-32 CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 ( 913) 1589 140.1 2.5e-32 >>CCDS3340.1 GAK gene_id:2580|Hs108|chr4 (1311 aa) initn: 8945 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CCDS58 SNDGYESLQLVDSNGDLSAGSGGVGGKQRVNAGAAARSPARQPPD---RASTMDSSGASS 20 30 40 50 60 370 380 390 400 410 pF1KE3 AEYDQPYGG-FLDILRGGTERLFTNLKD--------TSSKVIQSVANYAKGDLDISYITS ... ::: ..:...::. :::.:::: :::.:::::..:.:::::..:.:: CCDS58 PDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTS 70 80 90 100 110 120 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 RIAVMSFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWA :: ::::: ..:. ...:...:.: ::::.: ::.::::::..:: ..::.:::::.: CCDS58 RIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWP 130 140 150 160 170 180 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 ARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAA :.:: ::.:. .::::. :: :. ::::::::.::::::.. : ... :: :.:: : CCDS58 IRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPA 190 200 210 220 230 240 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 VYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGC . .. :: :. :::.::. ::::..:..: :: ::. .......:.:.:.:::.:: CCDS58 IRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGC 250 260 270 280 290 300 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 RPFCEVYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRL ::.:.: .:. .. :: ....:......::: :::..::::::.. .:: :::.:.:: CCDS58 RPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRL 310 320 330 340 350 360 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 QAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRP :::... ..::.::::::.: ..:..::.: .:::::. ::::.::::.:.::..:.:. CCDS58 QAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKV 370 380 390 400 410 420 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 SREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEP .::::. . .::.:::::..:.:: :. :. . : . .: :. CCDS58 IDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY----GQ----- 430 440 450 460 470 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 TDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSP : :. .: ::..: .:.. .:...::... ::: ::. CCDS58 -------------SGFFASLCWQDQK-----SEKSFCEEDHAALVNQ--ESEQSDDELLT 480 490 500 510 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 ISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPA .:: . .: .: :. .: . ::. : : :: ::::::.. . .. CCDS58 LSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ------QEPAA---PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSF 520 530 540 550 560 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 VPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLS--EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-G :: :: .:..::: :.: :: :: . : :: . :. : :.::::: . CCDS58 SPP---AAPPTNSELLSDLFGGGGAA--GPTQAGQSGVED---VFHPSGPASTQSTPRRS 570 580 590 600 610 620 960 970 980 990 1000 pF1KE3 GPPAAADPF-----GPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSC . ..:.: : . : :.: :. ::.: :::..:.. : : . .: :. CCDS58 ATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKP-SGQDLLGSFLNTSSASSDP-FLQPTRSPSPT- 630 640 650 660 670 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 SADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAP .: .. : : . .::. ::: .. .. ... :. .: : : :. CCDS58 ----VHASSTP-------AVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPT- 680 690 700 710 720 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE3 CGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSGLQGSPA-------GFPPGGFIPKTATTPKGSSSW .: :. ::::::: : ::.. ..:. :::: . :.. : :.. : CCDS58 -----HQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGG-W 730 740 750 760 770 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE3 QTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PKACTQPRPNYASNFSVI-GAREERGVRAPSFAQKP : . :: .: :: :: : :.. : :::: .::.. :...::: . .. : CCDS58 QQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQ 780 790 800 810 820 830 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE3 KVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKTIAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRA :.. :::::::.:::....:::::.:::::::...::. :: :::.:.::::::::::: CCDS58 KAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRA 840 850 860 870 880 890 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE3 LLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAPEQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFM ::::.::::: ::..: ::::::::.:::::: ::.:::.::::::.::::::.:::::: CCDS58 LLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFM 900 910 920 930 940 950 1300 1310 pF1KE3 ELNDAWSEFENQGSRPLF :::::::::::::..::. CCDS58 ELNDAWSEFENQGQKPLY 960 970 >>CCDS58005.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 (900 aa) initn: 2513 init1: 1521 opt: 1589 Z-score: 693.9 bits: 140.1 E(32554): 2.5e-32 Smith-Waterman score: 2696; 45.5% identity (70.4% similar) in 970 aa overlap (372-1311:7-900) 350 360 370 380 390 pF1KE3 TLSRGPPPPVGPAGSGYSGGLALAEYDQPYGGFLDILRGGTERLFTNLKD--------TS ::..:...::. :::.:::: :: CCDS58 MEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTS 10 20 30 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 SKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVMSFPAEGVESALKNNIEDVRLFLDSKHPGHYAVY :.:::::..:.:::::..:.:::: ::::: ..:. ...:...:.: ::::.: ::.:: CCDS58 SRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVY 40 50 60 70 80 90 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 NLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHKNVCVVHCMDGRA ::::..:: ..::.:::::.: :.:: ::.:. .::::. :: :. ::::::::.:::: CCDS58 NLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRA 100 110 120 130 140 150 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCDMVAEEPITPHSK ::.. : ... :: :.:: :. .. :: :. :::.::. ::::..:..: :: : CCDS58 ASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFK 160 170 180 190 200 210 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 PILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCEVYVGDERVASTSQEYDKMRDFKIEDGKAVIPLG :. .......:.:.:.:::.::::.:.: .:. .. :: ....:......::: :::. CCDS58 PLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLN 220 230 240 250 260 270 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 VTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTVKFAKYDLDACDI .::::::.. .:: :::.:.:::::... ..::.::::::.: ..:..::.: .:::::. CCDS58 ITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDV 280 290 300 310 320 330 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 QEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREEQQDILSKFGKPE ::::.::::.:.::..:.:. .::::. . .::.:::::..:.:: :. :. CCDS58 PEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAP 340 350 360 370 380 390 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 LPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEKEAETGAENASSK . : . .: : :. .: ::..: .:.. . CCDS58 IDIPPDNPRHYGQ----------------------SGFFASLCWQDQK-----SEKSFCE 400 410 420 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 ESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDLVFEVETPAVLPE :...::... ::: ::. .:: . .: .: :. .: . ::. CCDS58 EDHAALVNQ--ESEQSDDELLTLSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ------QEPAA--- 430 440 450 460 470 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 PVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAASQGPPEDLLS-- : : :: ::::::.. . .. :: :: .:..::: :.: :: :: . : CCDS58 PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSFSPPA---APPTNSELLSDLFGGGGAA--GPTQAGQSGV 480 490 500 510 520 530 940 950 960 970 980 pF1KE3 EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-GGPPAAADPF-----GPLLPSSGNNSQPCSNPDLFGEFL :: . :. : :.::::: .. ..:.: : . : :.: :. ::.: :: CCDS58 EDVF---HPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKP-SGQDLLGSFL 540 550 560 570 580 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE3 NSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDLLGGWAAWTETAA :..:.. : : . .: :. .: .. : : . .::. ::: .. .. CCDS58 NTSSASSDP-FLQPTRSPSPT-----VHASSTP-------AVNIQPDVSGGWDWHAKPGG 590 600 610 620 630 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE3 SAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSGLQGSPA------ ... :. .: : : :. .: :. ::::::: : ::.. ..:. CCDS58 FGMGSKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLG 640 650 660 670 680 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE3 -GFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PKACTQPRPNYASN :::: . :.. : :.. :: . :: .: :: :: : :.. : :::: . CCDS58 GGFPPLSSPQKASPQPMGGG-WQQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVS 690 700 710 720 730 740 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE3 FSVI-GAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPKTIAEMRKQDLAK ::.. :...::: . .. : :.. :::::::.:::....:::::.:::::::...:: CCDS58 FSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAK 750 760 770 780 790 800 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE3 DTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVAPEQVKKHYRRAV . :: :::.:.:::::::::::::::.::::: ::..: ::::::::.:::::: ::.:: CCDS58 EMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAV 810 820 830 840 850 860 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 LAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF :.::::::.::::::.:::::::::::::::::::..::. CCDS58 LVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY 870 880 890 900 >>CCDS30739.1 DNAJC6 gene_id:9829|Hs108|chr1 (913 aa) initn: 2513 init1: 1521 opt: 1589 Z-score: 693.8 bits: 140.1 E(32554): 2.5e-32 Smith-Waterman score: 2697; 45.1% identity (70.2% similar) in 982 aa overlap (361-1311:8-913) 340 350 360 370 380 pF1KE3 LLEQNGGYGSATLSRGPPPPVGPAGSGYSGGLALAEYDQPYGG-FLDILRGGTERLFTNL : . ... ::: ..:...::. :::.:: CCDS30 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNL 10 20 30 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 KD--------TSSKVIQSVANYAKGDLDISYITSRIAVMSFPAEGVESALKNNIEDVRLF :: :::.:::::..:.:::::..:.:::: ::::: ..:. ...:...:.: : CCDS30 KDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSF 40 50 60 70 80 90 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 LDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHK :::.: ::.::::::..:: ..::.:::::.: :.:: ::.:. .::::. :: :. : CCDS30 LDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPK 100 110 120 130 140 150 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 NVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCD :::::::.::::::.. : ... :: :.:: :. .. :: :. :::.::. :::: CCDS30 NVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCD 160 170 180 190 200 210 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 MVAEEPITPHSKPILVRAVVMTPVPLFSKQRSGCRPFCEVYVGDERVASTSQEYDKMRDF ..:..: :: ::. .......:.:.:.:::.::::.:.: .:. .. :: ....:... CCDS30 LLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEY 220 230 240 250 260 270 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 KIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTV ...::: :::..::::::.. .:: :::.:.:::::... ..::.::::::.: ..:.. CCDS30 RVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVL 280 290 300 310 320 330 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 KFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREE ::.: .:::::. ::::.::::.:.::..:.:. .::::. . .::.:::::..: CCDS30 KFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQE 340 350 360 370 380 390 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 QQDILSKFGKPELPRQPGSTAQYDAGAGSPEAEPTDSDSPPSSSADASRFLHTLDWQEEK .:: :. :. . : . .: : :. .: ::..: CCDS30 HQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQ----------------------SGFFASLCWQDQK 400 410 420 430 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 EAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDL .:.. .:...::.. .::: ::. .:: . .: .: :. .: CCDS30 -----SEKSFCEEDHAALVN--QESEQSDDELLTLSSPHGNANGD-KPHGVKKPSKKQ-- 440 450 460 470 480 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 VFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAA . ::. : : :: ::::::.. . .. :: :: .:..::: :.: :: CCDS30 ----QEPAA---PPPPED-VDLLGLEGSAMSNSFSPP---AAPPTNSELLSDLFGGGGAA 490 500 510 520 530 930 940 950 960 970 pF1KE3 SQGPPEDLLS--EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-GGPPAAADPF-----GPLLPSSGNNSQ :: . : :: . :. : :.::::: .. ..:.: : . : :. CCDS30 --GPTQAGQSGVEDVF---HPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSK 540 550 560 570 580 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 PCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDL : :. ::.: :::..:.. : : . .: :. .: .. : : . .::. CCDS30 P-SGQDLLGSFLNTSSASSDP-FLQPTRSPSPT-----VHASSTP-------AVNIQPDV 590 600 610 620 630 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE3 LGGWAAWTETAASAVAPTPATEGPLFSPGGQPAPCGSQASWTKSQNPDPFADLGDL-SSG ::: .. .. ... :. .: : : :. .: :. ::::::: : ::. CCDS30 SGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPT------HQSKPQTLDPFADLGTLGSSS 640 650 660 670 680 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 LQGSPA-------GFPPGGFIPKTATTPKGSSSWQTSRPPAQGA-SWP-PQAKP-P--PK . ..:. :::: . :.. : :.. :: . :: .: :: :: : :. CCDS30 FASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGG-WQQG-----GAYNWQQPQPKPQPSMPH 690 700 710 720 730 740 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 ACTQPRPNYASNFSVI-GAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPK . : :::: .::.. :...::: . .. : :.. :::::::.:::....:::::. CCDS30 SSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA--DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPR 750 760 770 780 790 800 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 TIAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVA :::::::...::. :: :::.:.:::::::::::::::.::::: ::..: ::::::::. CCDS30 TIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVT 810 820 830 840 850 860 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 PEQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF :::::: ::.:::.::::::.::::::.:::::::::::::::::::..::. CCDS30 PEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY 870 880 890 900 910 1311 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:55:04 2016 done: Sun Nov 6 09:55:05 2016 Total Scan time: 6.600 Total Display time: 0.300 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]