Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2775
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2775, 628 aa
  1>>>pF1KE2775     628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1054+/-0.00121; mu= 16.5972+/- 0.073
 mean_var=145.7905+/-27.274, 0's: 0 Z-trim(107.6): 78  B-trim: 38 in 1/49
 Lambda= 0.106221
 statistics sampled from 9712 (9780) to 9712 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time:  1.570

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7            ( 628) 4448 694.3 1.3e-199
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7            ( 705) 4443 693.5 2.5e-199
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7            (1210) 4443 693.8 3.5e-199
CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7           (1091) 3242 509.7 8.3e-144
CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7           (1165) 3242 509.8 8.6e-144
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7           ( 405) 2815 443.8 2.2e-124
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2          (1292) 2195 349.4 1.8e-95
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2           (1308) 2195 349.4 1.9e-95
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12         (1342) 2085 332.5 2.2e-90
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17         ( 603) 1721 276.3 8.3e-74
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17         (1055) 1721 276.6 1.2e-73
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17         (1225) 1721 276.7 1.3e-73
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17         (1240) 1721 276.7 1.3e-73
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17         (1255) 1721 276.7 1.3e-73


>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                 (628 aa)
 initn: 4448 init1: 4448 opt: 4448  Z-score: 3697.1  bits: 694.3 E(33420): 1.3e-199
Smith-Waterman score: 4448; 99.8% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
              550       560       570       580       590       600

              610       620        
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
              610       620        

>>CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                 (705 aa)
 initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443  Z-score: 3692.4  bits: 693.5 E(33420): 2.5e-199
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
              550       560       570       580       590       600

              610       620                                        
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                                
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQSGS
              610       620       630       640       650       660

>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                 (1210 aa)
 initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443  Z-score: 3689.6  bits: 693.8 E(33420): 3.5e-199
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
              550       560       570       580       590       600

              610       620                                        
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                                
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
              610       620       630       640       650       660

>>CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                (1091 aa)
 initn: 4110 init1: 3228 opt: 3242  Z-score: 2695.5  bits: 509.7 E(33420): 8.3e-144
Smith-Waterman score: 4022; 92.7% identity (92.8% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-582)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       :::::::::::::::::::::    :                                  
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
                   150       160       170       180       190     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
         200       210       220       230       240       250     

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
         260       270       280       290       300       310     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
         320       330       340       350       360       370     

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
         380       390       400       410       420       430     

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
         440       450       460       470       480       490     

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
         500       510       520       530       540       550     

              610       620                                        
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                                
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
         560       570       580       590       600       610     

>>CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                (1165 aa)
 initn: 4110 init1: 3228 opt: 3242  Z-score: 2695.2  bits: 509.8 E(33420): 8.6e-144
Smith-Waterman score: 4022; 92.7% identity (92.8% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-582)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       :::::::::::::::::::::    :                                  
CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G----------------------------------
              130       140                                        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
                   150       160       170       180       190     

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
         200       210       220       230       240       250     

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
         260       270       280       290       300       310     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
         320       330       340       350       360       370     

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
         380       390       400       410       420       430     

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS87 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
         440       450       460       470       480       490     

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
         500       510       520       530       540       550     

              610       620                                        
pF1KE2 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                                
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS87 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
         560       570       580       590       600       610     

>>CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7                (405 aa)
 initn: 2904 init1: 2815 opt: 2815  Z-score: 2346.9  bits: 443.8 E(33420): 2.2e-124
Smith-Waterman score: 2815; 99.8% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
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pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.                
CCDS47 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS               
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pF1KE2 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL

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pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       :.:. :.  . ..::.:   . .  . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
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       :.:::::: ...: :::::....::.::::.:::  . .:::::.::::.  ::. ::::
CCDS42 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
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       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
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CCDS42 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
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pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS42 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
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pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
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pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
       .: ::  : ::.   :   : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .:::: 
CCDS42 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
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pF1KE2 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
        ::.: .:.  : .::  ..: : :.::. ::: .::::: : .:.:::  :::: :...
CCDS42 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
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pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
       ::: .:: ::: ..: :..: :.:  . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
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pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                            
        :..: : ....::::  . :: :::::: :                             
CCDS42 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
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>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2                (1308 aa)
 initn: 1728 init1: 967 opt: 2195  Z-score: 1827.4  bits: 349.4 E(33420): 1.9e-95
Smith-Waterman score: 2195; 47.4% identity (76.1% similar) in 631 aa overlap (1-627:1-624)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
       :.:. :.  . ..::.:   . .  . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
CCDS23 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       :.:::::: ...: :::::....::.::::.:::  . .:::::.::::.  ::. ::::
CCDS23 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
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pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
       .. ::  :.:  ::.:: ..:: :::.:.:  ..:  :: ...:.:.::: . . ::...
CCDS23 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
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pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
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CCDS23 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
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pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
       ::.::...::..: .: : ..:   ::  ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
CCDS23 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
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pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
       .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :   : :.:.::: : . .. .....:: .
CCDS23 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
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pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
       : :::.:.:.: .: ....:: ..    .::..:....::.:::::: ::.:: : ::. 
CCDS23 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
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pF1KE2 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
       .: ::  : ::.   :   : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .:::: 
CCDS23 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
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pF1KE2 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
        ::.: .:.  : .::  ..: : :.::. ::: .::::: : .:.:::  :::: :...
CCDS23 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
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pF1KE2 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPEC--LPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCP
       ::: .:: ::: ..: :..: :.:  . ... .:: : ::::: .:.:. :::.::. ::
CCDS23 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGL-LTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCP
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pF1KE2 AGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS                            
        :..: : ....::::  . :: :::::: :                             
CCDS23 DGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCNGPTSHDCIYYPWTGHSTLPQHARTPLI
          600        610       620       630       640       650   

CCDS23 AAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRIL
           660       670       680       690       700       710   

>>CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12              (1342 aa)
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               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
                 .:.:: .:  .:.. . . :: :: : :.  :  :... .: .... :::
CCDS31   MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEV
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pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
       :.:::::. . .: :::::. :.::.::::.:.:    .:: ::...::.. :....:. 
CCDS31 VMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIF
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pF1KE2 VLSNYDANKT-GLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMD
       :. ::..:.. .:..: . .: ::: :.: . .:  ::....:.::::: .    .  . 
CCDS31 VMLNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRD---RDAEIV
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pF1KE2 FQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAG
        ...  ::  :   : .: ::: : :.:: ::: ::: ::.:.: : .:..:::..::.:
CCDS31 VKDNGRSCPPCHEVC-KGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGG
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pF1KE2 CTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNY
       :.::...::..::.: : ..:   ::  ..::  :.:.. ::. ::..:..:: .::.:.
CCDS31 CSGPQDTDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNF
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pF1KE2 VVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIG-EFKDSLSINATNIKH
       :: :. ::::::  :..:....:.. :. : : : :.:.: : : .:.   .....::  
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