FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2776, 405 aa 1>>>pF1KE2776 405 - 405 aa - 405 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6786+/-0.00108; mu= 16.2671+/- 0.065 mean_var=131.9373+/-24.017, 0's: 0 Z-trim(108.3): 86 B-trim: 25 in 1/49 Lambda= 0.111658 statistics sampled from 10183 (10258) to 10183 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16 Scan time: 1.310 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 405) 2824 466.7 1.8e-131 CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 628) 2815 465.4 6.6e-131 CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 ( 705) 2815 465.5 7.1e-131 CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210) 2815 465.8 9.9e-131 CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091) 1614 272.3 1.6e-72 CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165) 1614 272.3 1.7e-72 CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292) 1353 230.3 8.2e-60 CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308) 1353 230.3 8.2e-60 CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342) 1233 211.0 5.5e-54 CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 ( 603) 948 164.7 2.2e-40 CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1055) 948 165.0 3.1e-40 CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1225) 948 165.0 3.4e-40 CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1240) 948 165.1 3.5e-40 CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (1255) 948 165.1 3.5e-40 CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs109|chr19 (1370) 444 83.9 1e-15 CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs109|chr19 (1382) 444 83.9 1e-15 CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs109|chr15 (1366) 391 75.4 3.8e-13 CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs109|chr15 (1367) 391 75.4 3.8e-13 CCDS44918.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 ( 183) 341 66.3 2.8e-11 >>CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (405 aa) initn: 2824 init1: 2824 opt: 2824 Z-score: 2473.9 bits: 466.7 E(33420): 1.8e-131 Smith-Waterman score: 2824; 100.0% identity (100.0% similar) in 405 aa overlap (1-405:1-405) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS 370 380 390 400 >>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (628 aa) initn: 2904 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 2463.9 bits: 465.4 E(33420): 6.6e-131 Smith-Waterman score: 2815; 99.8% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF 370 380 390 400 410 420 CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL 430 440 450 460 470 480 >>CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (705 aa) initn: 2904 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 2463.3 bits: 465.5 E(33420): 7.1e-131 Smith-Waterman score: 2815; 99.8% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF 370 380 390 400 410 420 CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL 430 440 450 460 470 480 >>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1210 aa) initn: 2904 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 2460.7 bits: 465.8 E(33420): 9.9e-131 Smith-Waterman score: 2815; 99.8% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF 370 380 390 400 410 420 CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL 430 440 450 460 470 480 >>CCDS87507.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1091 aa) initn: 2571 init1: 1600 opt: 1614 Z-score: 1415.6 bits: 272.3 E(33420): 1.6e-72 Smith-Waterman score: 2394; 88.6% identity (88.9% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-359) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF ::::::::::::::::::::: : CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G---------------------------------- 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF 320 330 340 350 360 370 CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL 380 390 400 410 420 430 >>CCDS87506.1 EGFR gene_id:1956|Hs109|chr7 (1165 aa) initn: 2513 init1: 1600 opt: 1614 Z-score: 1415.3 bits: 272.3 E(33420): 1.7e-72 Smith-Waterman score: 2394; 88.6% identity (88.9% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-359) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF ::::::::::::::::::::: : CCDS87 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQ----G---------------------------------- 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 -------QKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS87 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 pF1KE2 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS87 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF 320 330 340 350 360 370 CCDS87 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL 380 390 400 410 420 430 >>CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1292 aa) initn: 1085 init1: 775 opt: 1353 Z-score: 1187.5 bits: 230.3 E(33420): 8.2e-60 Smith-Waterman score: 1353; 45.6% identity (77.8% similar) in 406 aa overlap (1-404:1-401) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....:::: CCDS42 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. :::: CCDS42 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM .. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::... CCDS42 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA : ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::. CCDS42 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN ::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.: CCDS42 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: . CCDS42 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS : :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.::::. CCDS42 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS 360 370 380 390 400 410 CCDS42 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT 420 430 440 450 460 470 >>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs109|chr2 (1308 aa) initn: 1085 init1: 775 opt: 1353 Z-score: 1187.5 bits: 230.3 E(33420): 8.2e-60 Smith-Waterman score: 1353; 45.6% identity (77.8% similar) in 406 aa overlap (1-404:1-401) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV :.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....:::: CCDS23 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. :::: CCDS23 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE2 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM .. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::... CCDS23 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA : ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::. CCDS23 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN ::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.: CCDS23 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH .:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: . CCDS23 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS : :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.::::. CCDS23 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS 360 370 380 390 400 410 CCDS23 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT 420 430 440 450 460 470 >>CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs109|chr12 (1342 aa) initn: 1203 init1: 494 opt: 1233 Z-score: 1082.9 bits: 211.0 E(33420): 5.5e-54 Smith-Waterman score: 1233; 42.5% identity (74.7% similar) in 395 aa overlap (11-403:9-395) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV .:.:: .: .:.. . . :: :: : :. : :... .: .... ::: CCDS31 MRANDALQVLGLLFSLARGSEVGNSQAVCPGTLNGLSVTGDAENQYQTLYKLYERCEV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA :.:::::. . .: :::::. :.::.::::.:.: .:: ::...::.. :....:. CCDS31 VMGNLEIVLTGHNADLSFLQWIREVTGYVLVAMNEFSTLPLPNLRVVRGTQVYDGKFAIF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE2 VLSNYDANKT-GLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMD :. ::..:.. .:..: . .: ::: :.: . .: ::....:.::::: . . . CCDS31 VMLNYNTNSSHALRQLRLTQLTEILSGGVYIEKNDKLCHMDTIDWRDIVRD---RDAEIV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAG ... :: : : .: ::: : :.:: ::: ::: ::.:.: : .:..:::..::.: CCDS31 VKDNGRSCPPCHEVC-KGRCWGPGSEDCQTLTKTICAPQCNGHCFGPNPNQCCHDECAGG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 CTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNY :.::...::..::.: : ..: :: ..:: :.:.. ::. ::..:..:: .::.:. CCDS31 CSGPQDTDCFACRHFNDSGACVPRCPQPLVYNKLTFQLEPNPHTKYQYGGVCVASCPHNF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIG-EFKDSLSINATNIKH :: :. :::::: :..:....:.. :. : : : :.:.: : : .:. .....:: CCDS31 VV-DQTSCVRACPPDKMEVDKNGLKMCEPCGGLCPKACEGTGSGSRFQ---TVDSSNIDG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS : :::.: :.: .: ... :: . . : :::..:....::.:::: CCDS31 FVNCTKILGNLDFLITGLNGDPWHKIPALDPEKLNVFRTVREITGYLNIQSWPPHMHNFS 360 370 380 390 400 410 CCDS31 VFSNLTTIGGRSLYNRGFSLLIMKNLNVTSLGFRSLKEISAGRIYISANRQLCYHHSLNW 420 430 440 450 460 470 >>CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs109|chr17 (603 aa) initn: 756 init1: 423 opt: 948 Z-score: 838.7 bits: 164.7 E(33420): 2.2e-40 Smith-Waterman score: 1209; 44.2% identity (72.8% similar) in 378 aa overlap (37-403:2-378) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 AGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEVVLGNLE :: .. : :. :......:.:: :::: CCDS77 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 ITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALAVLSNYD .::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::::.: : CCDS77 LTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGD 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE2 ----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNM :. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .. . CCDS77 PLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLAL 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 SMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQC .. :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.::::.:: CCDS77 TLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTDCCHEQC 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 AAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCP :::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.:: :: CCDS77 AAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATN ::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. .... .....: CCDS77 YNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSAN 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KE2 IKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGLS :..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..:::: CCDS77 IQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLP 340 350 360 370 380 390 CCDS77 DLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTV 400 410 420 430 440 450 405 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Feb 19 20:37:12 2021 done: Fri Feb 19 20:37:13 2021 Total Scan time: 1.310 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]