FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9667, 1226 aa 1>>>pF1KE9667 1226 - 1226 aa - 1226 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3962+/-0.000999; mu= 12.5310+/- 0.060 mean_var=114.7181+/-22.441, 0's: 0 Z-trim(107.8): 28 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.119745 statistics sampled from 9945 (9964) to 9945 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16 Scan time: 2.610 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (1226) 8209 1430.0 0 CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 ( 931) 6203 1083.4 0 CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 701) 894 166.2 2.7e-40 CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs109|chr10 ( 739) 853 159.1 3.8e-38 CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 741) 550 106.8 2.2e-22 CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 ( 714) 486 95.7 4.5e-19 >>CCDS1071.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (1226 aa) initn: 8209 init1: 8209 opt: 8209 Z-score: 7663.0 bits: 1430.0 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 8209; 99.8% identity (99.9% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1226) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MNPRQGYSLSGYYTHPFQGYEHRQLRYQQPGPGSSPSSFLLKQIEFLKGQLPEAPVIGKQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MNPRQGYSLSGYYTHPFQGYEHRQLRYQQPGPGSSPSSFLLKQIEFLKGQLPEAPVIGKQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 TPSLPPSLPGLRPRFPVLLASSTRGRQVDIRGVPRGVHLGSQGLQRGFQHPSPRGRSLPQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: CCDS10 TPSLPPSLPGLRPRFPVLLASSTRGRQVDIRGVPRGVHLRSQGLQRGFQHPSPRGRSLPQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 RGVDCLSSHFQELSIYQDQEQRILKFLEELGEGKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYSLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RGVDCLSSHFQELSIYQDQEQRILKFLEELGEGKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLYSLA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 KKGKLQKEAGTPPLWKIAVSTQAWNQHSGVVRPDGHSQGAPNSDPSLEPEDRNSTSVSED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KKGKLQKEAGTPPLWKIAVSTQAWNQHSGVVRPDGHSQGAPNSDPSLEPEDRNSTSVSED 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 LLEPFIAVSAQAWNQHSGVVRPDSHSQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LLEPFIAVSAQAWNQHSGVVRPDSHSQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 EKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLTKARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLTKARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 ERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETRRNAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLE :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETKRNAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 NRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAGYVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 SFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPISGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVV 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 INGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 INGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKAMTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQ 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 TPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 TPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 SAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEATNSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEATNSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELV 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 RYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQG 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 KQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTF 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 HDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 HDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLS 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 LKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLY 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE9 ISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVP 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE9 TWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 TWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAI 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE9 CCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 CCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE9 GTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLFKKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLFKKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFK 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 KGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV :::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV 1210 1220 >>CCDS30879.1 ADAR gene_id:103|Hs109|chr1 (931 aa) initn: 6203 init1: 6203 opt: 6203 Z-score: 5792.0 bits: 1083.4 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 6203; 99.9% identity (100.0% similar) in 931 aa overlap (296-1226:1-931) 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 SQGSPNSDPGLEPEDSNSTSALEDPLEFLDMAEIKEKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLT :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MAEIKEKICDYLFNVSDSSALNLAKNIGLT 10 20 30 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 KARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKRERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETRR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS30 KARDINAVLIDMERQGDVYRQGTTPPIWHLTDKKRERMQIKRNTNSVPETAPAAIPETKR 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 NAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLENRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 NAEFLTCNIPTSNASNNMVTTEKVENGQEPVIKLENRQEARPEPARLKPPVHYNGPSKAG 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 YVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 YVDFENGQWATDDIPDDLNSIRAAPGEFRAIMEMPSFYSHGLPRCSPYKKLTECQLKNPI 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 SGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SGLLEYAQFASQTCEFNMIEQSGPPHEPRFKFQVVINGREFPPAEAGSKKVAKQDAAMKA 220 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 MTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MTILLEEAKAKDSGKSEESSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHK 280 290 300 310 320 330 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 LGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LGNSCEFRLLSKEGPAHEPKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKALHGEAT 340 350 360 370 380 390 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 NSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 NSMASDNQPEGMISESLDNLESMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLEYARSHGFAAEFK 400 410 420 430 440 450 750 760 770 780 790 800 pF1KE9 LVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFT 460 470 480 490 500 510 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 EVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTFHDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 EVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGSTFHDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLG 520 530 540 550 560 570 870 880 890 900 910 920 pF1KE9 RKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 RKILAAIIMKKDSEDMGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYS 580 590 600 610 620 630 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 ELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 ELMKYNSQTAKDSIFEPAKGGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTE 640 650 660 670 680 690 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 SRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNV 700 710 720 730 740 750 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 LGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 LGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPK 760 770 780 790 800 810 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 VGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 VGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFLLF 820 830 840 850 860 870 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 KKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 KKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCP 880 890 900 910 920 930 pF1KE9 V : CCDS30 V >>CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 (701 aa) initn: 711 init1: 372 opt: 894 Z-score: 837.2 bits: 166.2 E(33420): 2.7e-40 Smith-Waterman score: 978; 33.5% identity (60.0% similar) in 672 aa overlap (615-1225:79-701) 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP : ..:.. .... . .. :::. ::.: : CCDS33 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP 50 60 70 80 90 100 650 660 670 680 690 pF1KE9 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD-- : . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .: CCDS33 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT 110 120 130 140 150 160 700 710 720 730 pF1KE9 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------ .: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . : CCDS33 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV 170 180 190 200 210 220 740 750 760 770 pF1KE9 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ . : .. ....:: : .::... : :..: . ...:: CCDS33 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL 230 240 250 260 270 280 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST .: .::..:: .... : :...: :: .: : CCDS33 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ 290 300 310 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN .: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: :. :..::. CCDS33 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT 320 330 340 350 360 370 900 910 920 930 940 pF1KE9 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: . CCDS33 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR 380 390 400 410 420 430 950 960 970 980 990 1000 pF1KE9 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAMESTESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGE : :..:.:::::::.::::. .: : . .: .:: : . .:.::::.:.:: CCDS33 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIF--SPHEPILEEPADRH-P--NRKARGQLRTKIESGE 440 450 460 470 480 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 GTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLG :::::.:. . ::::. :::: :::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: CCDS33 GTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILG 490 500 510 520 530 540 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 YLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNW :. ::.::. :. : .:: : . .:.: .. .: .. :: ::. . :::: CCDS33 SLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED-LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNW 550 560 570 580 590 600 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 CLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNELSRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YG ..:. .:....: : . : ::. :. .. . :. : : . . . : CCDS33 TVGDSA-IEVINATTGKDELGRA--SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYH 610 620 630 640 650 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 EAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKNFYLCPV :.: ::..:..:: . .. : : :. :: :. .: : : CCDS33 ESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP 660 670 680 690 700 >>CCDS7058.1 ADARB2 gene_id:105|Hs109|chr10 (739 aa) initn: 792 init1: 386 opt: 853 Z-score: 798.5 bits: 159.1 E(33420): 3.8e-38 Smith-Waterman score: 921; 31.4% identity (60.2% similar) in 633 aa overlap (614-1223:125-737) 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 SSHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHE .: ..:.. .:.: . ..: .:. ::.: CCDS70 GAKRKRPLEEGNGGHLCKLQLVWKKLSWSVAPKNALVQ-LHELRPGLQYRTVSQTGPVHA 100 110 120 130 140 150 650 660 670 680 690 pF1KE9 PKFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEATNSMASDNQPEGMI : : : :.. :: . ..:.:: ::. ::: :.... .: .:.. : . CCDS70 PVFAVAVEVNGLTFEG-TGPTKKKAKMRAAELALRSFVQFPNACQAHLAMGGGPGPGTDF 160 170 180 190 200 210 700 710 720 730 740 750 pF1KE9 SESLDNLESMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLL---EYARSHGFAAEFKLVDQS-GPPH . . .. . . .. . . . : . : :.: . . . :: . . : CCDS70 TSDQADFPDTLFQEFEPPAPRPGLAGGRPGDAALLSAAYGRRRLLCRALDLVGPTPATPA 220 230 240 250 260 270 760 770 780 790 800 pF1KE9 EPK------FVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQGKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVT : .. . ..: :. :: . . .. :. : : . : CCDS70 APGERNPVVLLNRLRAGLRY---VCLAEPAERRARSFVMAVSVDGRTFEGSGRSKKLARG 280 290 300 310 320 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 PVTGASLRRTM-LLLSRSPEAQPKTLPLTGSTFHDQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRK .. :.:.. . . . .. . :. . : :.:..: . : .:... : .: CCDS70 QAAQAALQELFDIQMPGHAPGRARRTPMP-QEFADSISQLVTQKFREVTTDLTPMHARHK 330 340 350 360 370 380 870 880 890 900 910 920 pF1KE9 ILAAIIMKKDSED-MGVVVSLGTGNRCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSE ::.:.: : . .. ::.:..:..:..:. :: .: .:::::::...::.:..:::.. CCDS70 ALAGIVMTKGLDARQAQVVALSSGTKCISGEHLSDQGLVVNDCHAEVVARRAFLHFLYTQ 390 400 410 420 430 440 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 LMKYNSQTAKDS---IFEPAK-GGEKLQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKSCSDRAME : . :. .:: :: : :: .: .... ::::.::.::::. : . .. CCDS70 LELHLSKRREDSERSIFVRLKEGGYRL--RENILFHLYVSTSPCGDARLHSPYEITTDLH 450 460 470 480 490 500 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 STESRHYPVFENPKQGKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRTMSCSDKILR : :.: . .:.::::.:.::::.::.. . : ::::. :::.: ::::.::: : CCDS70 S--SKH---LVRKFRGHLRTKIESGEGTVPVRGPSAVQTWDGVLLGEQLITMSCTDKIAR 510 520 530 540 550 560 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 WNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFEDGLRHPFIVN :::::::::::.::..:.::.:...: : :::.:.. :. :. . . :: : CCDS70 WNVLGLQGALLSHFVEPVYLQSIVVGSLHHTGHLARVMSHRMEGVGQ-LPASYRH----N 570 580 590 600 610 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 HPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRG--TVDGPRNELSRVSKKN .: .. :: .. :: ::. :.:: .... ::::...: : . :: ..: . CCDS70 RPLLSGVSDAEA-RQPGKSPPFSMNWVVGSA-DLEIINATTGRRSCGGPSRLCKHVLSAR 620 630 640 650 660 670 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 IFLLFKKLCSFRYRRDLLRLSYGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGYGNWISKPQEEKN :. .: . : ::: .:. :...:. . :... : :.:. :: :... CCDS70 WARLYGRLSTRTPSPGDTPSMYCEAKLGAHTYQSVKQQLFKAFQKAGLGTWVRKPPEQQQ 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 FYLCPV : : CCDS70 FLLTL >>CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 (741 aa) initn: 711 init1: 372 opt: 550 Z-score: 515.6 bits: 106.8 E(33420): 2.2e-22 Smith-Waterman score: 917; 31.8% identity (58.0% similar) in 707 aa overlap (615-1225:79-741) 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP : ..:.. .... . .. :::. ::.: : CCDS33 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP 50 60 70 80 90 100 650 660 670 680 690 pF1KE9 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD-- : . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .: CCDS33 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT 110 120 130 140 150 160 700 710 720 730 pF1KE9 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------ .: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . : CCDS33 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV 170 180 190 200 210 220 740 750 760 770 pF1KE9 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ . : .. ....:: : .::... : :..: . ...:: CCDS33 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL 230 240 250 260 270 280 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST .: .::..:: .... : :...: :: .: : CCDS33 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ 290 300 310 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN .: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: :. :..::. CCDS33 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVI-SVSTGT 320 330 340 350 360 370 900 910 920 930 940 pF1KE9 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: . CCDS33 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR 380 390 400 410 420 430 950 960 970 980 pF1KE9 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKS-----------------CSDRAME--------- : :..:.:::::::.::::. .:. :. ... CCDS33 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSD 440 450 460 470 480 490 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE9 -STESRH-----YPVFENPKQ---GKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRT :: . . :. ..:.. :.::::.:.:::::::.:. . ::::. :::: : CCDS33 PSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLT 500 510 520 530 540 550 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 MSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFED ::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: :. ::.::. :. : .:: CCDS33 MSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED 560 570 580 590 600 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 GLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNEL : . .:.: .. .: .. :: ::. . :::: ..:. .:....: : . : CCDS33 -LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNWTVGDSA-IEVINATTGKDELGRA-- 610 620 630 640 650 660 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE9 SRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGY ::. :. .. . :. : : . . . : :.: ::..:..:: . .. : CCDS33 SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGL 670 680 690 700 710 720 1210 1220 pF1KE9 GNWISKPQEEKNFYLCPV : :. :: :. .: : : CCDS33 GAWVEKPTEQDQFSLTP 730 740 >>CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs109|chr21 (714 aa) initn: 711 init1: 372 opt: 486 Z-score: 456.1 bits: 95.7 E(33420): 4.5e-19 Smith-Waterman score: 853; 31.9% identity (58.4% similar) in 678 aa overlap (615-1196:79-712) 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 SHYSTEKESEKTAESQTPTPSATSFFSGKSPVTTLLECMHKLGNSCEFRLLSKEGPAHEP : ..:.. .... . .. :::. ::.: : CCDS42 PGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQ-LNEIKPGLQYTLLSQTGPVHAP 50 60 70 80 90 100 650 660 670 680 690 pF1KE9 KFQYCVAVGAQTFPSVSAPSKKVAKQMAAEEAMKAL-----HGEA------TNSMASD-- : . : :..:.: . :.:.:: :: :::.:.... .:: : :. .: CCDS42 LFVMSVEVNGQVFEG-SGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFT 110 120 130 140 150 160 700 710 720 730 pF1KE9 -NQ---PEGMIS--ESLDNLE------SMMPNKVRKIGELVRYLNTNPVGGLLE------ .: :. ... :. :. : : .. . :.: :...:: . : CCDS42 SDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLS--LSASPVPASLAQPPLPV 170 180 190 200 210 220 740 750 760 770 pF1KE9 ---YARSHGFAA-----------EFKLVDQSGPPHEPKFVYQAKVGGRWFPAVCAHSKKQ . : .. ....:: : .::... : :..: . ...:: CCDS42 LPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEG-SGRNKKL 230 240 250 260 270 280 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 GKQEAADAALRVLIGENEKAERMGFTEVTPVTGASLRRTMLLLSRSPEAQPKTLPLTGST .: .::..:: .... : :...: :: .: : CCDS42 AKARAAQSALAAIFN-------------------------LHLDQTPSRQP--IPSEGLQ 290 300 310 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 FH------DQIAMLSHRCFNTLTNSFQPSLLGRKILAAIIMKK--DSEDMGVVVSLGTGN .: : .. : :. ::..:. ::.::...: : .: . :.:..::. CCDS42 LHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKD-AKVISVSTGT 320 330 340 350 360 370 900 910 920 930 940 pF1KE9 RCVKGDSLSLKGETVNDCHAEIISRRGFIRFLYSELMKY--NSQTAKDSIFEPA-KGGEK .:..:. .: .: ..:::::::::::...::::..: : :.. : :::. . .:: . CCDS42 KCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFR 380 390 400 410 420 430 950 960 970 980 pF1KE9 LQIKKTVSFHLYISTAPCGDGALFDKS-----------------CSDRAME--------- : :..:.:::::::.::::. .:. :. ... CCDS42 L--KENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSD 440 450 460 470 480 490 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE9 -STESRH-----YPVFENPKQ---GKLRTKVENGEGTIPVESSDIVPTWDGIRLGERLRT :: . . :. ..:.. :.::::.:.:::::::.:. . ::::. :::: : CCDS42 PSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGERLLT 500 510 520 530 540 550 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 MSCSDKILRWNVLGLQGALLTHFLQPIYLKSVTLGYLFSQGHLTRAICCRVTRDGSAFED ::::::: ::::.:.::.::. :..:::..:. :: :. ::.::. :. : .:: CCDS42 MSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRI----SNIED 560 570 580 590 600 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 GLRHPFIVNHPKVGRVSIYDSKRQSGKTKETSVNWCLADGYDLEILDGTRGTVDGPRNEL : . .:.: .. .: .. :: ::. . :::: ..:. .:....: : . : CCDS42 -LPPLYTLNKPLLSGISNAEA-RQPGKAPNFSVNWTVGDSA-IEVINATTGKDELGRA-- 610 620 630 640 650 660 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE9 SRVSKKNIFL----LFKKLCSFRYRRDLLRLS-YGEAKKAARDYETAKNYFKKGLKDMGY ::. :. .. . :. : : . . . : :.: ::..:..:: CCDS42 SRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHESKLAAKEYQAAKVH 670 680 690 700 710 1210 1220 pF1KE9 GNWISKPQEEKNFYLCPV 1226 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Sep 1 16:07:26 2019 done: Sun Sep 1 16:07:26 2019 Total Scan time: 2.610 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]