FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5738, 703 aa 1>>>pF1KE5738 703 - 703 aa - 703 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6457+/-0.000911; mu= 14.6670+/- 0.056 mean_var=101.9674+/-20.137, 0's: 0 Z-trim(108.8): 13 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.127012 statistics sampled from 10443 (10446) to 10443 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16 Scan time: 3.850 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8690.1 GYS2 gene_id:2998|Hs108|chr12 ( 703) 4789 888.2 0 CCDS12747.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 ( 737) 3547 660.7 2.2e-189 CCDS54292.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 ( 673) 2810 525.6 9.2e-149 >>CCDS8690.1 GYS2 gene_id:2998|Hs108|chr12 (703 aa) initn: 4789 init1: 4789 opt: 4789 Z-score: 4743.8 bits: 888.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4789; 99.9% identity (100.0% similar) in 703 aa overlap (1-703:1-703) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 TVVVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDIL ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 TVMVFFIMPAKTNNFNVETLKGQAVRKQLWDVAHSVKEKFGKKLYDALLRGEIPDLNDIL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 DRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 DRDDLTIMKRAIFSTQRQSLPPVTTHNMIDDSTDPILSTIRRIGLFNNRTDRVKVILHPE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 FLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 FLSSTSPLLPMDYEEFVRGCHLGVFPSYYEPWGYTPAECTVMGIPSVTTNLSGFGCFMQE 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 HVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 HVADPTAYGIYIVDRRFRSPDDSCNQLTKFLYGFCKQSRRQRIIQRNRTERLSDLLDWRY 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 LGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSPQSSDVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 LGRYYQHARHLTLSRAFPDKFHVELTSPPTTEGFKYPRPSSVPPSPSGSQASSPQSSDVE 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE5 DEVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 DEVEDERYDEEEEAERDRLNIKSPFSLSHVPHGKKKLHGEYKN 670 680 690 700 >>CCDS12747.1 GYS1 gene_id:2997|Hs108|chr19 (737 aa) initn: 3496 init1: 2727 opt: 3547 Z-score: 3513.5 bits: 660.7 E(32554): 2.2e-189 Smith-Waterman score: 3547; 72.5% identity (91.7% similar) in 688 aa overlap (5-684:5-691) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MLRGRSLSVTSLGGLPQWEVEELPVEELLLFEVAWEVTNKVGGIYTVIQTKAKTTADEWG :.::..:: :: .:: .:. .:. .::::::::.:::::::::.:::::.:.:::: CCDS12 MPLNRTLSMSSLPGLEDWE-DEFDLENAVLFEVAWEVANKVGGIYTVLQTKAKVTGDEWG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ENYFLIGPYFEHNMKTQVEQCEPVNDAVRRAVDAMNKHGCQVHFGRWLIEGSPYVVLFDI .::::.::: :....:::: : . :..:..:.::..::.:.::::::::.: :::.:. 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CCDS54 DNYFLVGPYTEQGVRTQVELLEAPTPALKRTLDSMNSKGCK------------------- 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GYSAWNLDRWKGDLWEACSVGIPYHDREANDMLIFGSLTAWFLKEVTDHADGKYVVAQFH :: . .. .:::.:: CCDS54 -----------------------------------------FLAQSEEKP---HVVAHFH 110 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EWQAGIGLILSRARKLPIATIFTTHATLLGRYLCAANIDFYNHLDKFNIDKEAGERQIYH :: ::.:: : :::.::.:::::::::::::::::. .::::.:..::.::::::::::: CCDS54 EWLAGVGLCLCRARRLPVATIFTTHATLLGRYLCAGAVDFYNNLENFNVDKEAGERQIYH 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 RYCMERASVHCAHVFTTVSEITAIEAEHMLKRKPDVVTPNGLNVKKFSAVHEFQNLHAMY :::::::..::::::::::.::::::.:.::::::.:::::::::::::.::::::::. CCDS54 RYCMERAAAHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLKRKPDIVTPNGLNVKKFSAMHEFQNLHAQS 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 KARIQDFVRGHFYGHLDFDLEKTLFLFIAGRYEFSNKGADIFLESLSRLNFLLRMHKSDI :::::.::::::::::::.:.:::..::::::::::::::.:::.:.:::.:::.. :. 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