FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2331, 727 aa 1>>>pF1KE2331 727 - 727 aa - 727 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9619+/-0.00102; mu= 16.8820+/- 0.061 mean_var=74.2949+/-14.604, 0's: 0 Z-trim(104.5): 30 B-trim: 4 in 2/48 Lambda= 0.148797 statistics sampled from 7944 (7958) to 7944 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16 Scan time: 3.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 727) 4806 1041.5 0 CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 720) 3705 805.2 0 CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 632) 3286 715.2 7.6e-206 CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 ( 773) 2125 466.0 9.6e-131 CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 247) 1662 366.4 2.9e-101 >>CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (727 aa) initn: 4806 init1: 4806 opt: 4806 Z-score: 5571.6 bits: 1041.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4806; 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CCDS13 YEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSS 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 YDFVYDCN ::::: CCDS13 YDFVYHYG 720 >>CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (632 aa) initn: 2348 init1: 2157 opt: 3286 Z-score: 3809.1 bits: 715.2 E(32554): 7.6e-206 Smith-Waterman score: 3286; 77.0% identity (93.1% similar) in 636 aa overlap (90-724:2-629) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQE :: :::.:...:.:.:.::.:: ::::: : CCDS82 MERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATE 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 FINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVA :::.::: .::..::::: :... ...::.::::::.::::::::::: :.. CCDS82 FINMDGIIVLTRLVESGT-------KLLSH-YSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSIT 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEI :::.::..:.. .:.:::::::::::::::::..::::.:.:::.:::: ::: :.::: CCDS82 FIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEI 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 QTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQV :::.::.:::::::::...::.::: .:::.::::::.::::..: :..::::::::::: CCDS82 QTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQV 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 LTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGS-MEKRKSMYTRDYKK :::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.:.:. :: ::::.:::.::: CCDS82 LTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKM 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSI ::: ::.:::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::.: CCDS82 LGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAI 270 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 ELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFN ::::::::::.:::::.: ::.:::::::::.:::.: ::::::::::::::::.:::: CCDS82 ELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFN 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 KVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKE ::::::.::. ::: .::.:::::::::..:::.:::..::::::.:.:::: ::.::.: CCDS82 KVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELRE 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 KIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGE :::::::::::::::::: ::. :::.. ::::..::::::. ::::::::::...:::: CCDS82 KIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGE 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 VPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPD : .:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::: . ::::::. CCDS82 VTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPN 510 520 530 540 550 560 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 KHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPS :.::::: :::.::::::: :.::..:::::::::.:::::::::::::.:::::::::: CCDS82 KYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPS 570 580 590 600 610 620 720 pF1KE2 NYDFVYDCN .::::: CCDS82 SYDFVYHYG 630 >>CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 (773 aa) initn: 2577 init1: 1045 opt: 2125 Z-score: 2460.8 bits: 466.0 E(32554): 9.6e-131 Smith-Waterman score: 2530; 51.6% identity (79.8% similar) in 732 aa overlap (1-727:54-769) 10 20 30 pF1KE2 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPL : :: ..::.::. : :.:...:: ::: CCDS10 PRPQGPQARCTLGRRCTVSGKCRRPRPSWTMAPPRNVVKIAIKMRDAIPQLIQLDQAKPL 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFYITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHE .:..:::::.:::.. : .::: ::. ::::.:: :::::.:: :.:.: .:.:: CCDS10 AAVLKEVCDAWSLTHSERYALQFADGHRRYITENNRAEIKNGSILCLSTAPDLEAEQLLG 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 RIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPC .::.: ... :::. :. :. :. ::.: :. .:...: ..:.: . CCDS10 GLQSNSPEGRREALRRLVPLASDMIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDD------------ 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVL .:..:...: :: :::.::.:::.:.:. :..:.. .:: . .: :. .:..:::..: CCDS10 LGEVLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTL 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 NSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQ .: : : : .:. . .:. ::: .:..:: ..:...::. : .:..: . : :.. CCDS10 SSPALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRN 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 LRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRI ::..: ..:.. ...::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. CCDS10 LRQFIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQA 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 AFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKH ::..:.: .... : ..:.:. .:...:::: : :::.:. ..:::.:::::::::... 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CCDS10 SFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALT 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR : :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::...::: CCDS10 YGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRR 560 570 580 590 600 610 580 590 600 610 620 pF1KE2 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEK :::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..:::::::..:: CCDS10 QDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREK 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 GALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRND :. ::::.. :::::: :: . . ::::::.:.:. .:::::.::::. : :. :: : CCDS10 GSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLD 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 pF1KE2 LDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN :. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::. 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