Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1254, 547 aa
1>>>pF1KE1254 547 - 547 aa - 547 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1212+/-0.000442; mu= -18.1355+/- 0.028
mean_var=601.2218+/-123.713, 0's: 0 Z-trim(124.9): 51 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.052307
statistics sampled from 47443 (47504) to 47443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.799), E-opt: 0.2 (0.557), width: 16
Scan time: 13.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_997046 (OMIM: 608006) leiomodin-2 [Homo sapiens ( 547) 3558 283.0 1.6e-75
NP_036266 (OMIM: 602715) leiomodin-1 [Homo sapiens ( 600) 927 84.5 1e-15
NP_001291347 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Ho ( 560) 780 73.4 2.1e-12
NP_938012 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Homo ( 560) 780 73.4 2.1e-12
NP_055363 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform a ( 351) 607 60.2 1.3e-08
NP_055362 (OMIM: 605112) tropomodulin-3 [Homo sapi ( 352) 555 56.2 1.9e-07
XP_016877576 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomoduli ( 352) 555 56.2 1.9e-07
XP_016877577 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomoduli ( 352) 555 56.2 1.9e-07
NP_001159588 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo s ( 359) 540 55.1 4.3e-07
NP_003266 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapi ( 359) 540 55.1 4.3e-07
NP_037485 (OMIM: 605834) tropomodulin-4 [Homo sapi ( 345) 494 51.6 4.6e-06
XP_016856578 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomoduli ( 345) 494 51.6 4.6e-06
XP_011507751 (OMIM: 605834) PREDICTED: tropomoduli ( 345) 494 51.6 4.6e-06
XP_016877578 (OMIM: 602928) PREDICTED: tropomoduli ( 306) 436 47.2 8.8e-05
NP_001136357 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform ( 315) 353 40.9 0.0069
>>NP_997046 (OMIM: 608006) leiomodin-2 [Homo sapiens] (547 aa)
initn: 3558 init1: 3558 opt: 3558 Z-score: 1476.7 bits: 283.0 E(85289): 1.6e-75
Smith-Waterman score: 3558; 100.0% identity (100.0% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-547)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNLPVGLRQKSLTEKTP
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NP_997 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNLPVGLRQKSLTEKTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TGTFSREALMAYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDKEESEEELIFTESNSEVSEEVYTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 TGTFSREALMAYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDKEESEEELIFTESNSEVSEEVYTEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EEEESQEEEEEEDSDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENINLTNGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 EEEESQEEEEEEDSDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENINLTNGSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 GRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDNT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VVKTFSLANTHADDSAAMAIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHNTVLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 VVKTFSLANTHADDSAAMAIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHNTVLTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 LRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 QEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 PPPPPPPPPPPPPSSQRLPPPPPPPPPPLPEKKLITRNIAEVIKQQESAQRALQNGQKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 PPPPPPPPPPPPPSSQRLPPPPPPPPPPLPEKKLITRNIAEVIKQQESAQRALQNGQKKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KGKKVKKQPNSILKEIKNSLRSVQEKKMEDSSRPSTPQRSAHENLMEAIRGSSIKQLKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_997 KGKKVKKQPNSILKEIKNSLRSVQEKKMEDSSRPSTPQRSAHENLMEAIRGSSIKQLKRV
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 EVPEALR
:::::::
NP_997 EVPEALR
>>NP_036266 (OMIM: 602715) leiomodin-1 [Homo sapiens] (600 aa)
initn: 1215 init1: 770 opt: 927 Z-score: 403.2 bits: 84.5 E(85289): 1e-15
Smith-Waterman score: 952; 37.1% identity (62.7% similar) in 553 aa overlap (7-547:127-600)
10 20 30
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERE
: ::.: : :.:: .. :.:. :: :.
NP_036 DAKNGEERGRDASKKALGPRRDSDLGKEPKRGGLKKSFSRDRDEA-GGKSGEKPKE-EKI
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LEDIEPDRNLPVGLRQKSLTEKTPTGTFSREALMAYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDK
.. : :.. : .. ..: .: .: : :. . ::. . ...::
NP_036 IRGI--DKG-----RVRAAVDKKEAGKDGRGEERAVATKKEE---EKKGSDRNTGLSRDK
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 EESEEELIFTESNSEVSEEVYTEEEEEESQEEEEE--EDSDEEERTIETAKGINGTVNYD
....::. . ...: .:.: :... ....: :. . . . . : : :: : :
NP_036 DKKREEMKEV-AKKEDDEKVKGERRNTDTRKEGEKMKRAGGNTDMKKEDEKVKRGTGNTD
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200
pF1KE1 SVNSDNSKPK---IFKSQIENINLTNGS-----NG--RNTESPAAIHPCGNPTVIEDALD
. ..:.. : . ... .. . :. .: . .:.:: .. . :..... :.
NP_036 TKKDDEKVKKNEPLHEKEAKDDSKTKTPEKQTPSGPTKPSEGPAKVEEEAAPSIFDEPLE
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 KIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDNTVVKTFSLANTHADDSAAMAIAEML
..:.:::. ::::.:: . ::.. :.::.:::. ::::: :.::::.::: .:.::: ::
NP_036 RVKNNDPEMTEVNVNNSDCITNEILVRFTEALEFNTVVKLFALANTRADDHVAFAIAIML
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHNTVLTELRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKE
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NP_036 KANKTITSLNLDSNHITGKGILAIFRALLQNNTLTELRFHNQRHICGGKTEMEIAKLLKE
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 NTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGT
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NP_036 NTTLLKLGYHFELAGPRMTVTNLLSRNMDKQRQKRLQEQRQAQEAKGEKKDLLEV-----
450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 PSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVATPPPPPPPPPPPPPSSQRLPPPPPP
:: .... :: .: : : : : :.. : :::
NP_036 -------------------PKAGAVAKG---SPKPSPQPSPKPSPKNSPKKGGAPAAPPP
500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 PPPPLPEKKLITRNIAEVIKQQESAQRALQNGQKKKKGKKVKKQPNSILKEIKNSLRSVQ
::::: : :....:::: .
NP_036 PPPPLA--------------------------------------PPLIMENLKNSLSPAT
540 550
510 520 530 540
pF1KE1 EKKMEDSSRPSTPQRSAHENLMEAIRGSSIKQLKRVEVPEALR
..:: :. :. .......:. :::.:..::::.::::. :.
NP_036 QRKMGDKVLPAQ-EKNSRDQLLAAIRSSNLKQLKKVEVPKLLQ
560 570 580 590 600
>>NP_001291347 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Homo s (560 aa)
initn: 1125 init1: 724 opt: 780 Z-score: 343.6 bits: 73.4 E(85289): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 1107; 38.5% identity (62.5% similar) in 574 aa overlap (14-546:16-559)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNLPVGLRQKSLTEK
: :.:::.::.:::::::::. :.: . :: .::::. ::. :.:
NP_001 MSEHSRNSDQEELLDEEINEDEILANLSAEELKELQSEMEVMAPDPSLPVGMIQKDQTDK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 TPTGTFSREALM--AYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDK--EESEE-------------
:::.:....:. :::: :...::.::. .:.: :: ::
NP_001 PPTGNFNHKSLVDYMYWEKASRRMLEEERVPVTFVKSEEKTQEEHEEIEKRNKNMAQYLK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE1 -----ELIFTESNSEVSEEVYTEEEEEESQEEEEEEDSDEE--ERTIETAKGINGTVNYD
:.. .. .:. : .. .::.: .:.....: :. :.. :: . .: .. .
NP_001 EKLNNEIVANKRESKGSSNIQETDEEDEEEEDDDDDDEGEDDGEESEETNREEEGKAKEQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 SVNSDNS----KPKIFKSQIENINLTNGSNGRNTE-SPAAI-----------HPCGNPTV
: .:. : :: : . . . :. . .. .: . .: :: :
NP_001 IRNCENNCQQVTDKAFKEQRDRPEAQEQSEKKISKLDPKKLALDTSFLKVSTRPSGNQTD
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 IEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDNTVVKTFSLANTHADDSAAM
.. .: ....:::: :.:::::::: . : :..:.: : .:::::::. ::...:.
NP_001 LDGSLRRVRKNDPDMKELNLNNIENIPKEMLLDFVNAMKKNKHIKTFSLANVGADENVAF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHNTVLTELRFHNQRHIMGSQVEMEI
:.:.::. :. ::..:.::::::::::.:::: :: : .:::::::::::..: ..::::
NP_001 ALANMLRENRSITTLNIESNFITGKGIVAIMRCLQFNETLTELRFHNQRHMLGHHAEMEI
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 VKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTK
..::: :.:::..::::::::::: .:..::::.::::::: .:::::. . .
NP_001 ARLLKANNTLLKMGYHFELPGPRMVVTNLLTRNQDKQRQKRQEEQKQQQLKEQKKLIAML
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 VWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVATPPPPPPPPPPPPPSSQRL
: : : . : :: :: .. :::: :: : : :::
NP_001 ENGLGLP---PGM------WELLGGPKP----DSR-MQEFFQPPPPRPPNPQNVPFSQRS
430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 PPPPPPPPPPLPEKKLITRNIAEVIKQQESAQRALQNGQKKKKGKKVKKQPNSI-LKEIK
: : : . .:.: :. :.:.. .... :.. ::..
NP_001 EMMKKPSQAP---KYRTDPDSFRVVK--------LKRIQRKSRMPEAREPPEKTNLKDVI
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KE1 NSLRSVQEKKMEDSSRPSTPQRSAHENLMEAIRGSSIKQLKRVEVPEALR
..:. : ... : . . ...:.. :: ::. :: :..:. :
NP_001 KTLKPVPRNR-----PPPLVEITPRDQLLNDIRHSSVAYLKPVQLPKELA
520 530 540 550 560
>>NP_938012 (OMIM: 616112,616165) leiomodin-3 [Homo sapi (560 aa)
initn: 1125 init1: 724 opt: 780 Z-score: 343.6 bits: 73.4 E(85289): 2.1e-12
Smith-Waterman score: 1107; 38.5% identity (62.5% similar) in 574 aa overlap (14-546:16-559)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNLPVGLRQKSLTEK
: :.:::.::.:::::::::. :.: . :: .::::. ::. :.:
NP_938 MSEHSRNSDQEELLDEEINEDEILANLSAEELKELQSEMEVMAPDPSLPVGMIQKDQTDK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 TPTGTFSREALM--AYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDK--EESEE-------------
:::.:....:. :::: :...::.::. .:.: :: ::
NP_938 PPTGNFNHKSLVDYMYWEKASRRMLEEERVPVTFVKSEEKTQEEHEEIEKRNKNMAQYLK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE1 -----ELIFTESNSEVSEEVYTEEEEEESQEEEEEEDSDEE--ERTIETAKGINGTVNYD
:.. .. .:. : .. .::.: .:.....: :. :.. :: . .: .. .
NP_938 EKLNNEIVANKRESKGSSNIQETDEEDEEEEDDDDDDEGEDDGEESEETNREEEGKAKEQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 SVNSDNS----KPKIFKSQIENINLTNGSNGRNTE-SPAAI-----------HPCGNPTV
: .:. : :: : . . . :. . .. .: . .: :: :
NP_938 IRNCENNCQQVTDKAFKEQRDRPEAQEQSEKKISKLDPKKLALDTSFLKVSTRPSGNQTD
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 IEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDNTVVKTFSLANTHADDSAAM
.. .: ....:::: :.:::::::: . : :..:.: : .:::::::. ::...:.
NP_938 LDGSLRRVRKNDPDMKELNLNNIENIPKEMLLDFVNAMKKNKHIKTFSLANVGADENVAF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHNTVLTELRFHNQRHIMGSQVEMEI
:.:.::. :. ::..:.::::::::::.:::: :: : .:::::::::::..: ..::::
NP_938 ALANMLRENRSITTLNIESNFITGKGIVAIMRCLQFNETLTELRFHNQRHMLGHHAEMEI
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 VKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTK
..::: :.:::..::::::::::: .:..::::.::::::: .:::::. . .
NP_938 ARLLKANNTLLKMGYHFELPGPRMVVTNLLTRNQDKQRQKRQEEQKQQQLKEQKKLIAML
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 VWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVATPPPPPPPPPPPPPSSQRL
: : : . : :: :: .. :::: :: : : :::
NP_938 ENGLGLP---PGM------WELLGGPKP----DSR-MQEFFQPPPPRPPNPQNVPFSQRS
430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 PPPPPPPPPPLPEKKLITRNIAEVIKQQESAQRALQNGQKKKKGKKVKKQPNSI-LKEIK
: : : . .:.: :. :.:.. .... :.. ::..
NP_938 EMMKKPSQAP---KYRTDPDSFRVVK--------LKRIQRKSRMPEAREPPEKTNLKDVI
470 480 490 500 510
500 510 520 530 540
pF1KE1 NSLRSVQEKKMEDSSRPSTPQRSAHENLMEAIRGSSIKQLKRVEVPEALR
..:. : ... : . . ...:.. :: ::. :: :..:. :
NP_938 KTLKPVPRNR-----PPPLVEITPRDQLLNDIRHSSVAYLKPVQLPKELA
520 530 540 550 560
>>NP_055363 (OMIM: 602928) tropomodulin-2 isoform a [Hom (351 aa)
initn: 692 init1: 565 opt: 607 Z-score: 275.8 bits: 60.2 E(85289): 1.3e-08
Smith-Waterman score: 814; 40.5% identity (71.8% similar) in 365 aa overlap (6-365:5-351)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRN-LPVGLRQKSLTEKT
... : ::..:::::::..:: ::::.:: :.:..:. ::.:.:::. :.:.
NP_055 MALPFQKELEKYKNIDEDELLGKLSEEELKQLENVLDDLDPESAMLPAGFRQKDQTQKA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PTGTFSREALMAYWEKESQKLLEKERLGECGKVAEDKEESEEELIFTESNSEVSEEVYTE
:: :.:: :. : :::. : .:.: ..: : . .: ... . :.
NP_055 ATGPFDREHLLMYLEKEA--LEQKDREDFVPFTGEKKGR-----VFIPKEKPIE----TR
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 EEEEESQEEEEEED----SDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENINL
.::. . . : :: :: : . .. :... .: . . .... : :. ..:.
NP_055 KEEKVTLDPELEEALASASDTELYDLAAVLGVHNLLNNPKFDEETANNKGGKGPVRNV--
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 TNGSNGRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEA
.:.... :. .: ::: .: .:...:.:::. :::::::.:: :: .::.:
NP_055 ---VKGEKVK-PVFEEP-PNPTNVEISLQQMKANDPSLQEVNLNNIKNIPIPTLREFAKA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKDNTVVKTFSLANTHADDSAAMAIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQHN
:. :: :: :::: :...: .:.:.:.:::::. .:..:.::::::: ::::...::..:
NP_055 LETNTHVKKFSLAATRSNDPVAIAFADMLKVNKTLTSLNIESNFITGTGILALVEALKEN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TVLTELRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQ
.:::... :::. .:. :::::...:.::. .:..::.: ::: ... .:.: :
NP_055 DTLTEIKIDNQRQQLGTAVEMEIAQMLEENSRILKFGYQFTKQGPRTRVAAAITKNNDLV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 RQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPL
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NP_055 RKKRVEADRR
350
>>NP_055362 (OMIM: 605112) tropomodulin-3 [Homo sapiens] (352 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNL-PVGLRQKSLTEKT
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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NP_055 VEGDHQ
350
>>XP_016877576 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomodulin-3 (352 aa)
initn: 704 init1: 520 opt: 555 Z-score: 254.5 bits: 56.2 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 769; 41.0% identity (68.7% similar) in 361 aa overlap (6-365:5-352)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNL-PVGLRQKSLTEKT
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pF1KE1 EEEEESQEEEEEEDSDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENINLTNGS
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pF1KE1 ELRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKR
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XP_016 ELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRR
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pF1KE1 LQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVA
.. ..:
XP_016 VEGDHQ
350
>>XP_016877577 (OMIM: 605112) PREDICTED: tropomodulin-3 (352 aa)
initn: 704 init1: 520 opt: 555 Z-score: 254.5 bits: 56.2 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 769; 41.0% identity (68.7% similar) in 361 aa overlap (6-365:5-352)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNL-PVGLRQKSLTEKT
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XP_016 TTGPFDREHLLSYLEKEA--LEHKDREDYVPYTGEKKGK-----IFIPKQKPV--QTFTE
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pF1KE1 EEEEESQEEEEEEDSDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENINLTNGS
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XP_016 EKVSLDPELEEALTSASDTELCDLA-AILGMHNLIT-NTKFCNIMGSSNGVDQEHFSNVV
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pF1KE1 NGRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAEALKDN
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XP_016 THVKCFSLAATRSNDPVATAFAEMLKVNKTLKSLNVESNFITGVGILALIDALRDNETLA
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pF1KE1 ELRFHNQRHIMGSQVEMEIVKLLKENTTLLRLGYHFELPGPRMSMTSILTRNMDKQRQKR
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XP_016 ELKIDNQRQQLGTAVELEMAKMLEENTNILKFGYQFTQQGPRTRAANAITKNNDLVRKRR
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pF1KE1 LQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRPLSPVA
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XP_016 VEGDHQ
350
>>NP_001159588 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapie (359 aa)
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pF1KE1 MSTFGYRRGLSKYESIDEDELLASLSAEELKELERELEDIEPDRNL-PVGLRQKSLTEKT
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NP_001 MSYRRELEKYRDLDEDEILGALTEEELRTLENELDELDPDNALLPAGLRQKDQTTKA
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::: :.:: :. . ::..... ..: : :: ::: :.. . .. :
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pF1KE1 EVYTEEEEEESQEEEEEEDSDEEERTIETAKGINGTVNYDSVNSDNSKPKIFKSQIENIN
: : : ::. . :: : : . :.. .. .. . :. .:... :..:
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pF1KE1 LTNGSNGRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAE
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pF1KE1 QRQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRP
:..:: .
NP_001 VRKRRLADLTGPIIPKCRSGV
340 350
>>NP_003266 (OMIM: 190930) tropomodulin-1 [Homo sapiens] (359 aa)
initn: 705 init1: 511 opt: 540 Z-score: 248.3 bits: 55.1 E(85289): 4.3e-07
Smith-Waterman score: 780; 40.5% identity (68.0% similar) in 363 aa overlap (6-362:3-346)
10 20 30 40 50
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NP_003 MSYRRELEKYRDLDEDEILGALTEEELRTLENELDELDPDNALLPAGLRQKDQTTKA
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::: :.:: :. . ::..... ..: : :: ::: :.. . .. :
NP_003 PTGPFKREELLDHLEKQAKEFKDREDLVPYTGEKRGKVWVPKQKPLDPVL---------E
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110 120 130 140 150 160
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pF1KE1 LTNGSNGRNTESPAAIHPCGNPTVIEDALDKIKSNDPDTTEVNLNNIENITTQTLTRFAE
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NP_003 ----SVIKPTQYKPVPDEEPNSTDVEETLERIKNNDPKLEEVNLNNIRNIPIPTLKAYAE
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ALKDNTVVKTFSLANTHADDSAAMAIAEMLKVNEHITNVNVESNFITGKGILAIMRALQH
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NP_003 ALKENSYVKKFSIVGTRSNDPVAYALAEMLKENKVLKTLNVESNFISGAGILRLVEALPY
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NP_003 NTSLVEMKIDNQSQPLGNKVEMEIVSMLEKNATLLKFGYHFTQQGPRLRASNAMMNNNDL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 QRQKRLQEQKQQEGYDGGPNLRTKVWQRGTPSSSPYVSPRHSPWSSPKLPKKVQTVRSRP
:..:: .
NP_003 VRKRRLADLTGPIIPKCRSGV
340 350
547 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:38:55 2016 done: Sun Nov 6 09:38:57 2016
Total Scan time: 13.020 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]