Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3221
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3221, 501 aa
1>>>pF1KE3221 501 - 501 aa - 501 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1501+/-0.00083; mu= 9.2524+/- 0.049
mean_var=124.7017+/-26.744, 0's: 0 Z-trim(110.3): 120 B-trim: 176 in 1/50
Lambda= 0.114852
statistics sampled from 11376 (11519) to 11376 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34959.2 NRBP2 gene_id:340371|Hs108|chr8 ( 501) 3387 572.6 3.5e-163
CCDS82433.1 NRBP1 gene_id:29959|Hs108|chr2 ( 543) 2029 347.6 2.1e-95
CCDS1753.1 NRBP1 gene_id:29959|Hs108|chr2 ( 535) 1958 335.8 7.1e-92
CCDS75858.1 WNK2 gene_id:65268|Hs108|chr9 (2297) 467 89.1 5.5e-17
CCDS35302.1 WNK3 gene_id:65267|Hs108|chrX (1743) 450 86.3 3.1e-16
CCDS14357.1 WNK3 gene_id:65267|Hs108|chrX (1800) 450 86.3 3.2e-16
CCDS53731.1 WNK1 gene_id:65125|Hs108|chr12 (2134) 443 85.1 8.1e-16
CCDS8506.1 WNK1 gene_id:65125|Hs108|chr12 (2382) 443 85.2 8.9e-16
CCDS73419.1 WNK1 gene_id:65125|Hs108|chr12 (2634) 443 85.2 9.7e-16
CCDS11439.1 WNK4 gene_id:65266|Hs108|chr17 (1243) 415 80.4 1.3e-14
>>CCDS34959.2 NRBP2 gene_id:340371|Hs108|chr8 (501 aa)
initn: 3387 init1: 3387 opt: 3387 Z-score: 3043.1 bits: 572.6 E(32554): 3.5e-163
Smith-Waterman score: 3387; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRREQVNQGNMPGLQSTFLAMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRREQVNQGNMPGLQSTFLAMD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNIVKLHKYWLDTSEACARVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNIVKLHKYWLDTSEACARVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWKRWCTQILSALSFLHACSPPIIHGNLTSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWKRWCTQILSALSFLHACSPPIIHGNLTSDT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IFIQHNGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSPIRAEREELRNLHFFPPEYGEVADGTAVDIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFIQHNGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSPIRAEREELRNLHFFPPEYGEVADGTAVDIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SFGMCALEMAVLEIQTNGDTRVTEEAIARARHSLSDPNMREFILCCLARDPARRPSAHSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFGMCALEMAVLEIQTNGDTRVTEEAIARARHSLSDPNMREFILCCLARDPARRPSAHSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LFHRVLFEVHSLKLLAAHCFIQHQYLMPENVVEEKTKAMDLHAVLAELPRPRRPPLQWRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFHRVLFEVHSLKLLAAHCFIQHQYLMPENVVEEKTKAMDLHAVLAELPRPRRPPLQWRY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SEVSFMELDKFLEDVRNGIYPLMNFAATRPLGLPRVLAPPPEEVQKAKTPTPEPFDSETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEVSFMELDKFLEDVRNGIYPLMNFAATRPLGLPRVLAPPPEEVQKAKTPTPEPFDSETR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLLVLEDRLHRQLTYDLLPTDSAQDLASELVHYGFLHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLLVLEDRLHRQLTYDLLPTDSAQDLASELVHYGFLHED
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE3 DRMKLAAFLESTFLKYRGTQA
:::::::::::::::::::::
CCDS34 DRMKLAAFLESTFLKYRGTQA
490 500
>>CCDS82433.1 NRBP1 gene_id:29959|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 1923 init1: 1095 opt: 2029 Z-score: 1826.5 bits: 347.6 E(32554): 2.1e-95
Smith-Waterman score: 2029; 63.4% identity (82.0% similar) in 489 aa overlap (17-496:44-526)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRREQVNQ
:.:.::::::.:::::::::::::::.:::
CCDS82 SDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQ
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GNMPGLQSTFLAMDTEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNIVKLH
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CCDS82 RNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFH
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 KYWLDTSEACARVIFITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWKRWCTQILSALSFLHA
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CCDS82 KYWADIKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHS
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 CSPPIIHGNLTSDTIFIQHNGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSPIRAEREELRNLHFFPP
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CCDS82 CDPPIIHGNLTCDTIFIQHNGLIKIGSVFHRIFANVAPDTINNHVKTCREEQKNLHFFAP
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 EYGEVAD-GTAVDIFSFGMCALEMAVLEIQTNGDTR-VTEEAIARARHSLSDPNMREFIL
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CCDS82 EYGEVTNVTTAVDIYSFGMCALEMAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQ
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 CCLARDPARRPSAHSLLFHRVLFEVHSLKLLAAHCFIQHQYLMPENVVEEKTKAMDLHAV
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CCDS82 KCLQSEPARRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAV
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LAELPR-PRRPPLQWRYSEVSFMELDKFLEDVRNGIYPLMNFAATRPLGLPRVLAPPPEE
:::.: : : :.: ::. .:::::::::::::::: : :::: : ::
CCDS82 LAEIPAGPGREPVQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAF------GLPRPQQPQQEE
380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KE3 VQK------AKTPTPEPFDSETRKVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLLVLEDRLHRQLTYD
: . .::::::: . :::::. ::::.: :. .. :::::: :::.:.:.:. :
CCDS82 VTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEEGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCD
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500
pF1KE3 LLPTDSAQDLASELVHYGFLHEDDRMKLAAFLESTFLKYRGTQA
:.:... .::.:::. ::. : :. .:...:: :. :.
CCDS82 LMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS
490 500 510 520 530 540
>>CCDS1753.1 NRBP1 gene_id:29959|Hs108|chr2 (535 aa)
initn: 1852 init1: 948 opt: 1958 Z-score: 1763.0 bits: 335.8 E(32554): 7.1e-92
Smith-Waterman score: 1964; 62.4% identity (80.4% similar) in 489 aa overlap (17-496:44-518)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRREQVNQ
:.:.::::::.:::::::::::::::.:::
CCDS17 SDPKVESSSSAPGLTSVSPPVTSTTSAASPEEEEESEDESEILEESPCGRWQKRREEVNQ
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GNMPGLQSTFLAMDTEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNIVKLH
:.::..:..:::::::::::::::..:..:: . .:::...::..:. ..: ::::.:
CCDS17 RNVPGIDSAYLAMDTEEGVEVVWNEVQFSERKNYKLQEEKVRAVFDNLIQLEHLNIVKFH
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 KYWLDTSEACARVIFITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWKRWCTQILSALSFLHA
::: : .: :::::::::.:::::::::::::::::.:: .::::::::::::::.::.
CCDS17 KYWADIKENKARVIFITEYMSSGSLKQFLKKTKKNHKTMNEKAWKRWCTQILSALSYLHS
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 CSPPIIHGNLTSDTIFIQHNGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSPIRAEREELRNLHFFPP
:.::::::::: :::::::::::::::: :: . . ... ::: .::::: :
CCDS17 CDPPIIHGNLTCDTIFIQHNGLIKIGSV--------APDTINNHVKTCREEQKNLHFFAP
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 EYGEVAD-GTAVDIFSFGMCALEMAVLEIQTNGDTR-VTEEAIARARHSLSDPNMREFIL
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CCDS17 EYGEVTNVTTAVDIYSFGMCALEMAVLEIQGNGESSYVPQEAISSAIQLLEDPLQREFIQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 CCLARDPARRPSAHSLLFHRVLFEVHSLKLLAAHCFIQHQYLMPENVVEEKTKAMDLHAV
:: .:::::.:. :::: .:::: :::::::::.. ::...:::..:: :: :: ::
CCDS17 KCLQSEPARRPTARELLFHPALFEVPSLKLLAAHCIVGHQHMIPENALEEITKNMDTSAV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LAELPR-PRRPPLQWRYSEVSFMELDKFLEDVRNGIYPLMNFAATRPLGLPRVLAPPPEE
:::.: : : :.: ::. .:::::::::::::::: : :::: : ::
CCDS17 LAEIPAGPGREPVQTLYSQSPALELDKFLEDVRNGIYPLTAF------GLPRPQQPQQEE
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE3 VQK------AKTPTPEPFDSETRKVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLLVLEDRLHRQLTYD
: . .::::::: . :::::. ::::.: :. .. :::::: :::.:.:.:. :
CCDS17 VTSPVVPPSVKTPTPEPAEVETRKVVLMQCNIESVEEGVKHHLTLLLKLEDKLNRHLSCD
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE3 LLPTDSAQDLASELVHYGFLHEDDRMKLAAFLESTFLKYRGTQA
:.:... .::.:::. ::. : :. .:...:: :. :.
CCDS17 LMPNENIPELAAELVQLGFISEADQSRLTSLLEETLNKFNFARNSTLNSAAVTVSS
480 490 500 510 520 530
>>CCDS75858.1 WNK2 gene_id:65268|Hs108|chr9 (2297 aa)
initn: 402 init1: 159 opt: 467 Z-score: 418.5 bits: 89.1 E(32554): 5.5e-17
Smith-Waterman score: 502; 28.3% identity (57.0% similar) in 453 aa overlap (2-418:159-593)
10 20 30
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEE
: .: : :.:. : :.:...::. .
CCDS75 IAAAVETAPAPDGGPREEAAATVRKEDEGAAEAKPEPGRTRRDEPEEEEDDEDDLKAVAT
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 SPCGRWQKRREQVNQGNMPGLQSTFLAMDTEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVF
: ::. : ....:. ..... ..::: :::.: ::. ::: ......
CCDS75 SLDGRFLKFDIELGRGS---FKTVYKGLDTETWVEVAWCELQ--DRKLTKLERQRFKEEA
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 EQLVLVDHPNIVKLHKYWLDTSEACARVIFITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWK
:.: ..:::::... .: ..... ....:: ..::.:: .::. :.:. .. .
CCDS75 EMLKGLQHPNIVRFYDFWESSAKGKRCIVLVTELMTSGTLKTYLKR----FKVMKPKVLR
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RWCTQILSALSFLHACSPPIIHGNLTSDTIFIQH-NGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSP
:: :::..: :::. .::::: .: :.::: .: .:::.. .: :.
CCDS75 SWCRQILKGLLFLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDL-------GLATLKRAS
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KE3 IRAEREELRNLHFFPPEYGEVADGTAVDIFSFGMCALEMAVLEI-----QTNGDT--RVT
. . . . .:. ::. : .::...:::: ::::. : :. .. .::
CCDS75 F--AKSVIGTPEFMAPEMYEEHYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRKVT
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 EEAIARARHSLSDPNMREFILCCLARDPARRPSAHSLLFHRVLFEVHSLKL-LAAHCFIQ
. ... ::...:.: :. .. .: ..:: : . : .... :: . .
CCDS75 CGIKPASFEKVHDPEIKEIIGECICKNKEERYEIKDLLSHAFFAEDTGVRVELAEEDHGR
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370
pF1KE3 HQYLMPENVVEE----KTKAMDLHAVLAELPRPRRPPLQWRYSEVS---FMELD-----K
.. . . ::. : : : :. . .. : . . : : : :
CCDS75 KSTIALRLWVEDPKKLKGKPKDNGAIEFTFDLEKETPDEVAQEMIESGFFHESDVKIVAK
480 490 500 510 520 530
380 390 400 410
pF1KE3 FLEDV-------RNGIYPLMNFAATRPLGLP-RVLAPP-PEEVQ-----KAKTP-TPEPF
..: :. :.: .. . .: : .. .:: : .:: .: : :::
CCDS75 SIRDRVALIQWRRERIWPALQPKEQQDVGSPDKARGPPVPLQVQVTYHAQAGQPGPPEPE
540 550 560 570 580 590
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 DSETRKVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLLVLEDRLHRQLTYDLLPTDSAQDLASELVHYG
. :
CCDS75 EPEADQHLLPPTLPTSATSLASDSTFDSGQGSTVYSDSQSSQQSVMLGSLADAAPSPAQC
600 610 620 630 640 650
>>CCDS35302.1 WNK3 gene_id:65267|Hs108|chrX (1743 aa)
initn: 346 init1: 162 opt: 450 Z-score: 405.0 bits: 86.3 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 502; 26.3% identity (55.9% similar) in 479 aa overlap (13-473:122-578)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRRE
... :.: : : : . :: ::. :
CCDS35 KLPSNVLRGGQEVKYEQCSKSTSEISKDCFKEKNEKEMEEEAEMKAVATSPSGRFLKFDI
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 QVNQGNMPGLQSTFLAMDTEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNI
....: ...... ..::: :::.: ::. ::: :...... :.: ..::::
CCDS35 ELGRG---AFKTVYKGLDTETWVEVAWCELQ--DRKLTKAEQQRFKEEAEMLKGLQHPNI
160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 VKLHKYWLDTSEACARVIFITEYVSSGSLKQFLKKTKKNHKAMNARAWKRWCTQILSALS
:... : . .. ....:: ..::.:: .::. :.:. .. . :: :::..:.
CCDS35 VRFYDSWESILKGKKCIVLVTELMTSGTLKTYLKR----FKVMKPKVLRSWCRQILKGLQ
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 FLHACSPPIIHGNLTSDTIFIQH-NGLIKIGSVWHRIFSNALPDDLRSPIRAEREELRNL
:::. .::::: .: :.::: .: .:::.. .: .:. . . . .
CCDS35 FLHTRTPPIIHRDLKCDNIFITGPTGSVKIGDL-------GLATLMRTSF--AKSVIGTP
270 280 290 300 310
230 240 250 260 270
pF1KE3 HFFPPEYGEVADGTAVDIFSFGMCALEMAVLEI-----QTNGDT--RVTEEAIARARHSL
.:. ::. : .::...:::: ::::. : :. .. .:: . ...
CCDS35 EFMAPEMYEEHYDESVDVYAFGMCMLEMATSEYPYSECQNAAQIYRKVTSGIKPASFNKV
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320
pF1KE3 SDPNMREFILCCLARDPARRPSAHSLLFHRVLFEVHSLKLLAAH---CFIQHQ--YLMPE
.::...:.: :. .. ..: : ..:: : . : .:.. :. : . : :
CCDS35 TDPEVKEIIEGCIRQNKSERLSIRDLLNHAFFAEDTGLRVELAEEDDCSNSSLALRLWVE
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 NVVEEKTKAMDLHAVLAELPRPRRPPLQWRYSEVS---FMELDK--FLEDVRNGIYPLMN
. . : : : .:. . : . : :. : : :. ...:. . :. .
CCDS35 DPKKLKGKHKDNEAIEFSFNLETDTPEEVAYEMVKSGFFHESDSKAVAKSIRDRVTPIKK
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 FAATRPLGLPRVLAPPPEEVQKAKTPTPEPFDSETRKVIQMQCNLERSEDKARWHLTLLL
.: : . . .. . :.: .. . .: . : : .. :. :
CCDS35 TREKKPAGC--LEERRDSQCKSMGNVFPQPQNTTLPLAPAQQTGAECEETEVDQHVRQQL
500 510 520 530 540 550
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 VLEDRLHRQLTYDLLPTDSAQDLASELVHYGFLHEDDRMKLAAFLESTFLKYRGTQA
. .: .: .. . .. :. ..:
CCDS35 L--QRKPQQHCSSVTGDNLSEAGAASVIHSDTSSQPSVAYSSNQTMGSQMVSNIPQAEVN
560 570 580 590 600
>>CCDS14357.1 WNK3 gene_id:65267|Hs108|chrX (1800 aa)
initn: 346 init1: 162 opt: 450 Z-score: 404.8 bits: 86.3 E(32554): 3.2e-16
Smith-Waterman score: 502; 26.3% identity (55.9% similar) in 479 aa overlap (13-473:122-578)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAPEPAPRRAREREREREDESEDESDILEESPCGRWQKRRE
... :.: : : : . :: ::. :
CCDS14 KLPSNVLRGGQEVKYEQCSKSTSEISKDCFKEKNEKEMEEEAEMKAVATSPSGRFLKFDI
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 QVNQGNMPGLQSTFLAMDTEEGVEVVWNELHFGDRKAFAAHEEKIQTVFEQLVLVDHPNI
....: ...... ..::: :::.: ::. ::: :...... :.: ..::::
CCDS14 ELGRG---AFKTVYKGLDTETWVEVAWCELQ--DRKLTKAEQQRFKEEAEMLKGLQHPNI
160 170 180 190 200
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]