FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4362, 380 aa 1>>>pF1KE4362 380 - 380 aa - 380 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3086+/-0.000888; mu= 16.8135+/- 0.054 mean_var=64.4987+/-12.897, 0's: 0 Z-trim(106.2): 32 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.159698 statistics sampled from 8828 (8855) to 8828 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 2.620 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34032.1 ADH4 gene_id:127|Hs108|chr4 ( 380) 2534 592.5 2e-169 CCDS77942.1 ADH4 gene_id:127|Hs108|chr4 ( 399) 2496 583.8 9e-167 CCDS47111.1 ADH5 gene_id:128|Hs108|chr4 ( 374) 1625 383.1 2.2e-106 CCDS34033.1 ADH1B gene_id:125|Hs108|chr4 ( 375) 1578 372.3 4e-103 CCDS3648.1 ADH1A gene_id:124|Hs108|chr4 ( 375) 1556 367.2 1.3e-101 CCDS54780.1 ADH1C gene_id:126|Hs108|chr4 ( 375) 1551 366.1 3e-101 CCDS43255.1 ADH6 gene_id:130|Hs108|chr4 ( 375) 1498 353.8 1.4e-97 CCDS34034.1 ADH7 gene_id:131|Hs108|chr4 ( 386) 1483 350.4 1.6e-96 CCDS3647.1 ADH6 gene_id:130|Hs108|chr4 ( 368) 1475 348.5 5.5e-96 CCDS54781.1 ADH7 gene_id:131|Hs108|chr4 ( 394) 1456 344.2 1.2e-94 CCDS68761.1 ADH1B gene_id:125|Hs108|chr4 ( 335) 1379 326.4 2.3e-89 >>CCDS34032.1 ADH4 gene_id:127|Hs108|chr4 (380 aa) initn: 2534 init1: 2534 opt: 2534 Z-score: 3155.2 bits: 592.5 E(32554): 2e-169 Smith-Waterman score: 2534; 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CCDS47 EINKAFELMHSGKSIRTVVKI 360 370 >>CCDS34033.1 ADH1B gene_id:125|Hs108|chr4 (375 aa) initn: 1586 init1: 1073 opt: 1578 Z-score: 1964.9 bits: 372.3 E(32554): 4e-103 Smith-Waterman score: 1578; 60.5% identity (84.2% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDATVIDSKFEG :.: :::::::::. ::. ::. ::.::::::::.::::...:...:::: :..... 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CCDS36 MSTAGKVIKCKAAVLWELKKPFSIEEVEVAPPKAHEVRIKMVAVGICGTDDHVVSGTMV- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNLK .:::.::::::::::.: :::.:::::::::: : : ::..: .: .: : : .... CCDS36 TPLPVILGHEAAGIVESVGEGVTTVKPGDKVIPLAIPQCGKCRICKNPESNYCLK-NDVS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLGC .: : ..: ::::::. ::..::.: :::::::::.. .:::: . ::.:::.:: CCDS36 NP---QGTLQDGTSRFTCRRKPIHHFLGISTFSQYTVVDENAVAKIDAASPLEKVCLIGC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAKA :::::::.:.: :::::::::::::::::::::.::::::::.:::..:::..::.::: CCDS36 GFSTGYGSAVNVAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAIMGCKAAGAARIIAVDINKDKFAKAKE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIGV ::::.:.::.: .::::::. :.: :::::... : .:: :.: : . :. ...:: CCDS36 LGATECINPQDYKKPIQEVLKEMTDGGVDFSFEVIGRLDTMMASLLCCHEACGTSVIVGV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 AAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFDK :..:.. : :. ::: .:...::.:: . .::::.:. :::.::::.::.:::.: CCDS36 PPDSQNLSMNPMLLLTGRTWKGAILGGFKSKECVPKLVADFMAKKFSLDALITHVLPFEK 300 310 320 330 340 350 370 380 pF1KE4 ISEAFDLMNQGKSIRTILIF :.:.:::...::::::::.: CCDS36 INEGFDLLHSGKSIRTILMF 360 370 >>CCDS54780.1 ADH1C gene_id:126|Hs108|chr4 (375 aa) initn: 1559 init1: 1047 opt: 1551 Z-score: 1931.3 bits: 366.1 E(32554): 3e-101 Smith-Waterman score: 1551; 59.7% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDATVIDSKFEG :.: :::::::::. :: ::. ::::::::::::::::...:...:..: :..... CCDS54 MSTAGKVIKCKAAVLWELKKPFSIEEVEVAPPKAHEVRIKMVAAGICRSDEHVVSGNLV- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNLK .:::.::::::::::.: :::.::::::::::..: : ::..: .: .: : : ..: CCDS54 TPLPVILGHEAAGIVESVGEGVTTVKPGDKVIPLFTPQCGKCRICKNPESNYCLK-NDLG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLGC .: . ..: : ::::.:::..:: :.:::::::::.. .:::: . ::.:::.:: CCDS54 NP---RGTLQDGTRRFTCSGKPIHHFVGVSTFSQYTVVDENAVAKIDAASPLEKVCLIGC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAKA :::::::.:.. ::::::::::::::::::::.:::::::::.:::..:::..::.::: CCDS54 GFSTGYGSAVKVAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSVVMGCKAAGAARIIAVDINKDKFAKAKE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIGV ::::.:.::.: .::::::. :.: :::::... : .:: :.: : . :. ...:: CCDS54 LGATECINPQDYKKPIQEVLKEMTDGGVDFSFEVIGRLDTMMASLLCCHEACGTSVIVGV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 AAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFDK :..:.. : :. ::: .:..:::.:: .:.::::.:. :::.::::.:. :::.: CCDS54 PPDSQNLSINPMLLLTGRTWKGAIFGGFKSKESVPKLVADFMAKKFSLDALITNILPFEK 300 310 320 330 340 350 370 380 pF1KE4 ISEAFDLMNQGKSIRTILIF :.:.:::. .::::::.: : CCDS54 INEGFDLLRSGKSIRTVLTF 360 370 >>CCDS43255.1 ADH6 gene_id:130|Hs108|chr4 (375 aa) initn: 1504 init1: 1043 opt: 1498 Z-score: 1865.3 bits: 353.8 E(32554): 1.4e-97 Smith-Waterman score: 1498; 58.4% identity (81.1% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDATVIDSKFEG :.: :.::.::::: :. : :. :::::::::::.::::...::.:: :. :. :: CCDS43 MSTTGQVIRCKAAILWKPGAPFSIEEVEVAPPKAKEVRIKVVATGLCGTEMKVLGSKHLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNLK : .:.:.:::.:::::::: ::..:::::::: :. : : .: ::. :.: .... : CCDS43 LLYPTILGHEGAGIVESIGEGVSTVKPGDKVITLFLPQCGECTSCLNSEGNFCIQFKQSK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLGC . ::: : ::::::::: .::: .:::: .:::...:..:::: : ::.:::..: CCDS43 T-----QLMSDGTSRFTCKGKSIYHFGNTSTFCEYTVIKEISVAKIDAVAPLEKVCLISC 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAKA :::::.:::::.::::::::::::::::::::.:::::::::.::::.:.:.::: ::. CCDS43 GFSTGFGAAINTAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSVVMGCKAAGAARIIGVDVNKEKFKKAQE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIGV ::::.::::.::.::::::....: .:.:: .. :. ... ::: . ..: :. .:: CCDS43 LGATECLNPQDLKKPIQEVLFDMTDAGIDFCFEAIGNLDVLAAALASCNESYGVCVVVGV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 AAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFDK .: : . . .. ::...:. :::::: . :::::.:: .:.::: :.:::: .:: CCDS43 LPASVQLKISGQLFFSGRSLKGSVFGGWKSRQHIPKLVADYMAEKLNLDPLITHTLNLDK 300 310 320 330 340 350 370 380 pF1KE4 ISEAFDLMNQGKSIRTILIF :.:: .::. :: :: ::.. CCDS43 INEAVELMKTGKCIRCILLL 360 370 >>CCDS34034.1 ADH7 gene_id:131|Hs108|chr4 (386 aa) initn: 1469 init1: 978 opt: 1483 Z-score: 1846.4 bits: 350.4 E(32554): 1.6e-96 Smith-Waterman score: 1483; 58.4% identity (80.8% similar) in 380 aa overlap (1-380:13-386) 10 20 30 40 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCH ::: :::::::::. :: .:. :::.::::::..::::.:.::..:. CCDS34 MFAEIQIQDKDRMGTAGKVIKCKAAVLWEQKQPFSIEEIEVAPPKTKEVRIKILATGICR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 TDATVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSP :: :: . . . :::::::::.::::::: :::.::::::::::. : ::.:. : .: CCDS34 TDDHVIKGTMVS-KFPVIVGHEATGIVESIGEGVTTVKPGDKVIPLFLPQCRECNACRNP 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDD ::: ..: . . .. : :.:::::::::.::..::::..::::.. ..::::: CCDS34 DGNLC-----IRSDITGRGVLADGTTRFTCKGKPVHHFMNTSTFTEYTVVDESSVAKIDD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 DANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGI : :.:::.:::::::::::....:: :::::.::::::::::..::::.::::::::: CCDS34 AAPPEKVCLIGCGFSTGYGAAVKTGKVKPGSTCVVFGLGGVGLSVIMGCKSAGASRIIGI 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 DINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCT :.:..:: :: :.:::.:..:.: :::.::. :.: ..: .... : ::: :: CCDS34 DLNKDKFEKAMAVGATECISPKDSTKPISEVLSEMTGNNVGYTFEVIGHLETMIDALASC 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 TAGWGSCTFIGVAAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNL ..:. . .:: ..: :: : :. ::: .: ::: :: :..:::::.. :::.: CCDS34 HMNYGTSVVVGVPPSAKMLTYDPMLLFTGRTWKGCVFGGLKSRDDVPKLVTEFLAKKFDL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE4 DALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSIRTILIF : :.::.::: ::::.:.:.:.:.::::.: : CCDS34 DQLITHVLPFKKISEGFELLNSGQSIRTVLTF 360 370 380 >>CCDS3647.1 ADH6 gene_id:130|Hs108|chr4 (368 aa) initn: 1023 init1: 1023 opt: 1475 Z-score: 1836.8 bits: 348.5 E(32554): 5.5e-96 Smith-Waterman score: 1475; 58.6% identity (81.2% similar) in 372 aa overlap (1-372:1-367) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDATVIDSKFEG :.: :.::.::::: :. : :. :::::::::::.::::...::.:: :. :. :: CCDS36 MSTTGQVIRCKAAILWKPGAPFSIEEVEVAPPKAKEVRIKVVATGLCGTEMKVLGSKHLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNLK : .:.:.:::.:::::::: ::..:::::::: :. : : .: ::. :.: .... : CCDS36 LLYPTILGHEGAGIVESIGEGVSTVKPGDKVITLFLPQCGECTSCLNSEGNFCIQFKQSK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 SPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLGC . ::: : ::::::::: .::: .:::: .:::...:..:::: : ::.:::..: CCDS36 T-----QLMSDGTSRFTCKGKSIYHFGNTSTFCEYTVIKEISVAKIDAVAPLEKVCLISC 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAKA :::::.:::::.::::::::::::::::::::.:::::::::.::::.:.:.::: ::. CCDS36 GFSTGFGAAINTAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSVVMGCKAAGAARIIGVDVNKEKFKKAQE 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIGV ::::.::::.::.::::::....: .:.:: .. :. ... ::: . ..: :. .:: CCDS36 LGATECLNPQDLKKPIQEVLFDMTDAGIDFCFEAIGNLDVLAAALASCNESYGVCVVVGV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 AAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFDK .: : . . .. ::...:. :::::: . :::::.:: .:.::: :.:::: .:: CCDS36 LPASVQLKISGQLFFSGRSLKGSVFGGWKSRQHIPKLVADYMAEKLNLDPLITHTLNLDK 300 310 320 330 340 350 370 380 pF1KE4 ISEAFDLMNQGKSIRTILIF :.:: .::. :: CCDS36 INEAVELMKTGKW 360 >>CCDS54781.1 ADH7 gene_id:131|Hs108|chr4 (394 aa) initn: 1442 init1: 978 opt: 1456 Z-score: 1812.7 bits: 344.2 E(32554): 1.2e-94 Smith-Waterman score: 1456; 57.4% identity (80.8% similar) in 380 aa overlap (1-380:21-394) 10 20 30 40 pF1KE4 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQ :.... :::::::. :: .:. :::.::::::..::::. CCDS54 MKCLVSRHTVRETLDMVFQRMSVEAGVIKCKAAVLWEQKQPFSIEEIEVAPPKTKEVRIK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 IIATSLCHTDATVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCR :.::..:.:: :: . . . :::::::::.::::::: :::.::::::::::. : :: CCDS54 ILATGICRTDDHVIKGTMVS-KFPVIVGHEATGIVESIGEGVTTVKPGDKVIPLFLPQCR 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 KCKFCLSPLTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSD .:. : .: ::: ..: . . .. : :.:::::::::.::..::::..::::.. CCDS54 ECNACRNPDGNLC-----IRSDITGRGVLADGTTRFTCKGKPVHHFMNTSTFTEYTVVDE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 INLAKIDDDANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAA ..::::: : :.:::.:::::::::::....:: :::::.::::::::::..::::.: CCDS54 SSVAKIDDAAPPEKVCLIGCGFSTGYGAAVKTGKVKPGSTCVVFGLGGVGLSVIMGCKSA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 GASRIIGIDINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSET :::::::::.:..:: :: :.:::.:..:.: :::.::. :.: ..: .... : :: CCDS54 GASRIIGIDLNKDKFEKAMAVGATECISPKDSTKPISEVLSEMTGNNVGYTFEVIGHLET 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 MKAALDCTTAGWGSCTFIGVAAGSKGLTVFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTD : :: ..:. . .:: ..: :: : :. ::: .: ::: :: :..:::::. CCDS54 MIDALASCHMNYGTSVVVGVPPSAKMLTYDPMLLFTGRTWKGCVFGGLKSRDDVPKLVTE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 pF1KE4 YKNKKFNLDALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSIRTILIF . :::.:: :.::.::: ::::.:.:.:.:.::::.: : CCDS54 FLAKKFDLDQLITHVLPFKKISEGFELLNSGQSIRTVLTF 360 370 380 390 380 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 02:04:41 2016 done: Sun Nov 6 02:04:42 2016 Total Scan time: 2.620 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]