FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4118, 496 aa 1>>>pF1KE4118 496 - 496 aa - 496 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1998+/-0.00083; mu= 13.4932+/- 0.050 mean_var=254.2208+/-52.183, 0's: 0 Z-trim(116.7): 867 B-trim: 1008 in 1/52 Lambda= 0.080439 statistics sampled from 16342 (17306) to 16342 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.809), E-opt: 0.2 (0.532), width: 16 Scan time: 3.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12928.1 FIZ1 gene_id:84922|Hs108|chr19 ( 496) 3588 429.3 4.7e-120 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 705 95.1 3.6e-19 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 680 92.2 2.7e-18 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 660 90.0 1.4e-17 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 660 90.0 1.4e-17 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 657 89.4 1.5e-17 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 657 89.4 1.6e-17 CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 642 87.7 5.2e-17 CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 642 87.7 5.2e-17 CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 631 86.4 1.2e-16 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 620 85.3 3.6e-16 CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 616 84.5 3.6e-16 CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 610 83.8 5.9e-16 CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 610 83.8 6e-16 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 609 83.8 6.7e-16 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 599 82.9 2e-15 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 599 82.9 2.1e-15 CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 583 80.9 6.4e-15 CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 578 80.2 8.4e-15 CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 574 79.7 1.1e-14 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 569 79.4 2.1e-14 CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 567 79.0 2.2e-14 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 566 79.0 2.5e-14 CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 555 77.4 4.8e-14 CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 555 77.5 5e-14 CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 554 77.3 5.1e-14 CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 686) 554 77.4 5.6e-14 CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 554 77.4 5.6e-14 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 554 77.5 6e-14 CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 551 77.0 6.7e-14 CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 551 77.0 7e-14 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 548 76.8 1e-13 CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 543 76.3 1.6e-13 CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 543 76.3 1.6e-13 CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 537 75.5 2.3e-13 CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 529 74.4 4e-13 CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 529 74.5 4.1e-13 CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7 ( 839) 529 74.6 4.7e-13 CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 522 73.7 7.7e-13 CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 517 73.0 1e-12 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 512 72.9 2.4e-12 CCDS43678.1 ZNF775 gene_id:285971|Hs108|chr7 ( 537) 500 71.0 3.7e-12 CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 499 71.0 4.6e-12 CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 499 71.0 4.6e-12 CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 498 70.9 4.9e-12 CCDS73868.1 ZNF48 gene_id:197407|Hs108|chr16 ( 495) 493 70.1 6.3e-12 CCDS10679.1 ZNF48 gene_id:197407|Hs108|chr16 ( 618) 493 70.2 7.1e-12 CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 492 70.1 7.3e-12 CCDS2713.1 ZNF445 gene_id:353274|Hs108|chr3 (1031) 495 70.8 8.2e-12 CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 489 69.6 8.3e-12 >>CCDS12928.1 FIZ1 gene_id:84922|Hs108|chr19 (496 aa) initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588 Z-score: 2268.8 bits: 429.3 E(32554): 4.7e-120 Smith-Waterman score: 3588; 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CCDS46 KCEECDEAFSFKSNLQRHRRIHT----------------GEKPYRCNECGKTFSRKSYLT 640 650 660 670 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 SDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCD-CGTFFASAAALAS ::: : . : . : . : : . .: :.:. :: :.. ..:. CCDS46 CHRRLHTGEKPYKCNECGKTF--GRNSALIIHKAIHTGEKP-YKCNECGKAFSQKSSLTC 680 690 700 710 720 730 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 HLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGS ::. :.: : : .: ... ..::.:::. :: . . . . . CCDS46 HLRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSSLEKHRRIHTGEKPYKCKVCDKAFGRDSHLAQHTRI 740 750 760 770 780 790 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 GRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTE :.: . :.:: : :: : : .:.::::. : :::: :::. :. :. .: : CCDS46 HTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVIHKAIHSGEKPYKCNECGKTFRHNSALEIHKAIHTGE 800 810 820 830 840 850 470 480 490 pF1KE4 RPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD .:. : ::: : .::::: .:: : CCDS46 KPYKCSECGKVFNRKANLSRHHRLHTGEKPYKCNKCGKVFNQQAHLACHHRIHTGEKPYK 860 870 880 890 900 910 >>CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 (936 aa) initn: 1067 init1: 379 opt: 680 Z-score: 442.1 bits: 92.2 E(32554): 2.7e-18 Smith-Waterman score: 859; 32.3% identity (50.5% similar) in 507 aa overlap (22-494:357-830) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :..:. ::: :: :.: : ::. ::. CCDS46 EKPYKCNECGKTFKQGSCLTTHQIIHTGEKPYQCDICGKVFRQNSNLVNHQRIHTGEKPY 330 340 350 360 370 380 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV : :::.:..: :::.: :.:..::.:. : : :. :..: ::..::::::: : : CCDS46 KCNICGKSFSQSSNLATHQTVHSGNKPYKCDECGKTFKRSSSLTTHQIIHTGEKPYTCDV 390 400 410 420 430 440 120 130 140 150 160 pF1KE4 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNV--GPCSVCGGSGAG :. ::.::.:.:: .:.: : : :. : .: . : CCDS46 CDKVFSQRSQLARH-QRSHTGEKPYK-------------CNECGKVFSQTSHLVGHRRIH 450 460 470 480 490 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 GGEGP---EGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVK :: : . : .. . .: . . :: :.. :... :. : :: . CCDS46 TGEKPYKCDKCGKAFKQGSLLTRHKIIHTREKRYQCGECGKVFSENSCLVRHLRIHTGEQ 500 510 520 530 540 550 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 PFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAP :.:: : . :: . : :: : : : : : .. . . CCDS46 PYKCNVCGKVFNYSGNLSIHKRIHT----GEKPFQCNECG------------TVFRNYSC 560 570 580 590 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCD-CGTFFASAAAL :: :. : : .. ..:. . . . .::. :: :. . : CCDS46 LARHLRIHTGQKPYKCNVCGKVFNDSGNLSNHKRIH---TGEKPFQCNECGKVFSYYSCL 600 610 620 630 640 650 350 360 370 380 390 pF1KE4 ASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEG-------GGE--EAAAAARER : : . :.: : :. :: :. ..: .: . :: :: ... :: . CCDS46 ARHRKIHTGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLIIHTGEKPYNCNEFGGAFIQSSKLARYH 660 670 680 690 700 710 400 410 420 430 pF1KE4 EPASGEPP---SGSGR----------------GKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHT . .:: : : :: :. . : :: ..: : .: :: .:: CCDS46 RNPTGEKPHKCSHCGRTFSHITGLTYHQRRHTGEMPYKCIECGQVFNSTSNLARHRRIHT 720 730 740 750 760 770 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 GEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD ::::. : :::: :::. : ::: .: :.:. :. :::.: . : : : :.: : CCDS46 GEKPYKCNECGKVFRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKP 780 790 800 810 820 830 CCDS46 YKCNECGKAFIERSKLVYHQRNHTGEKPYKCIECGKAFGRFSCLNKHQMIHSGEKPYKCN 840 850 860 870 880 890 >>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058 aa) initn: 1019 init1: 405 opt: 660 Z-score: 429.0 bits: 90.0 E(32554): 1.4e-17 Smith-Waterman score: 792; 30.8% identity (51.8% similar) in 496 aa overlap (22-494:360-833) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH :. :.:::::: .:: : : : ::. ::. 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