Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4118
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4118, 496 aa
  1>>>pF1KE4118 496 - 496 aa - 496 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1998+/-0.00083; mu= 13.4932+/- 0.050
 mean_var=254.2208+/-52.183, 0's: 0 Z-trim(116.7): 867  B-trim: 1008 in 1/52
 Lambda= 0.080439
 statistics sampled from 16342 (17306) to 16342 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.809), E-opt: 0.2 (0.532), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12928.1 FIZ1 gene_id:84922|Hs108|chr19         ( 496) 3588 429.3 4.7e-120
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19       ( 970)  705 95.1 3.6e-19
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19      ( 936)  680 92.2 2.7e-18
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058)  660 90.0 1.4e-17
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090)  660 90.0 1.4e-17
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782)  657 89.4 1.5e-17
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818)  657 89.4 1.6e-17
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 819)  642 87.7 5.2e-17
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 825)  642 87.7 5.2e-17
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19      ( 717)  631 86.4 1.2e-16
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059)  620 85.3 3.6e-16
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620)  616 84.5 3.6e-16
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19     ( 641)  610 83.8 5.9e-16
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19     ( 642)  610 83.8   6e-16
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688)  609 83.8 6.7e-16
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1159)  599 82.9   2e-15
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19         (1191)  599 82.9 2.1e-15
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19      ( 903)  583 80.9 6.4e-15
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19      ( 722)  578 80.2 8.4e-15
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19       ( 671)  574 79.7 1.1e-14
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3         (1029)  569 79.4 2.1e-14
CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17       ( 807)  567 79.0 2.2e-14
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4       ( 923)  566 79.0 2.5e-14
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19       ( 611)  555 77.4 4.8e-14
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19       ( 643)  555 77.5   5e-14
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8           ( 590)  554 77.3 5.1e-14
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8            ( 686)  554 77.4 5.6e-14
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8           ( 697)  554 77.4 5.6e-14
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19       ( 781)  554 77.5   6e-14
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19        ( 615)  551 77.0 6.7e-14
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19        ( 663)  551 77.0   7e-14
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19     ( 833)  548 76.8   1e-13
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5        ( 867)  543 76.3 1.6e-13
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5        ( 900)  543 76.3 1.6e-13
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19          ( 734)  537 75.5 2.3e-13
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19      ( 638)  529 74.4   4e-13
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19      ( 673)  529 74.5 4.1e-13
CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7        ( 839)  529 74.6 4.7e-13
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20       ( 751)  522 73.7 7.7e-13
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19       ( 610)  517 73.0   1e-12
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19        (1280)  512 72.9 2.4e-12
CCDS43678.1 ZNF775 gene_id:285971|Hs108|chr7       ( 537)  500 71.0 3.7e-12
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19      ( 661)  499 71.0 4.6e-12
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19      ( 674)  499 71.0 4.6e-12
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19      ( 642)  498 70.9 4.9e-12
CCDS73868.1 ZNF48 gene_id:197407|Hs108|chr16       ( 495)  493 70.1 6.3e-12
CCDS10679.1 ZNF48 gene_id:197407|Hs108|chr16       ( 618)  493 70.2 7.1e-12
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19      ( 563)  492 70.1 7.3e-12
CCDS2713.1 ZNF445 gene_id:353274|Hs108|chr3        (1031)  495 70.8 8.2e-12
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 465)  489 69.6 8.3e-12


>>CCDS12928.1 FIZ1 gene_id:84922|Hs108|chr19              (496 aa)
 initn: 3588 init1: 3588 opt: 3588  Z-score: 2268.8  bits: 429.3 E(32554): 4.7e-120
Smith-Waterman score: 3588; 99.8% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACPRCGKGF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCELRFSSRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCSVCGGSGAGGGEGPEGAGAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCDCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAATAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFI
              430       440       450       460       470       480

              490      
pF1KE4 TLSNLSRHLKLHRGMD
       ::::::::::::::::
CCDS12 TLSNLSRHLKLHRGMD
              490      

>>CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19            (970 aa)
 initn: 1844 init1: 405 opt: 705  Z-score: 457.6  bits: 95.1 E(32554): 3.6e-19
Smith-Waterman score: 852; 31.7% identity (53.5% similar) in 477 aa overlap (22-494:438-883)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH
                                     :..: :: ..: ..:.:.::   ::. ::.
CCDS46 EKPYKCNDCGKTFSQMSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAFSFKSNLERHRRIHTGEKPY
       410       420       430       440       450       460       

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV
        :  ::: :... .:. : : ::::.::.:  : ..:  ...: .:...::::: : :  
CCDS46 KCNDCGKTFSQTSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAFSFKSNLERHRIIHTGEKLYKCNE
       470       480       490       500       510       520       

             120       130       140        150         160        
pF1KE4 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLPALSAPC--SVCCNVGPCSVCGGSGA
       :   :: .::: ::  : : :  :   .  : .. . ::    ..  ..:    :.    
CCDS46 CGKTFSRKSSLTRHC-RLHTGEKPYQCNECGKAFRGQSALIYHQAIHGIGKLYKCNDCH-
       530       540        550       560       570       580      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KE4 GGGEGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVKPF
          .   .: .  . : . .   .       . :. :.. : :   ::.:: .:.  ::.
CCDS46 ---QVFSNATTIANHWRIHNEERS-------YKCNRCGKFFRHRSYLAVHWRTHSGEKPY
            590       600              610       620       630     

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE4 KCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLA
       :: .:.. :.  . :.::.  :                 :  :   .:   . .  . :.
CCDS46 KCEECDEAFSFKSNLQRHRRIHT----------------GEKPYRCNECGKTFSRKSYLT
         640       650                       660       670         

      290       300       310       320       330        340       
pF1KE4 SDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCD-CGTFFASAAALAS
         :::  :       . :  .  : . :     : . .:   :.:. ::  :.. ..:. 
CCDS46 CHRRLHTGEKPYKCNECGKTF--GRNSALIIHKAIHTGEKP-YKCNECGKAFSQKSSLTC
     680       690       700         710        720       730      

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE4 HLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGS
       ::. :.:   : : .:  ...  ..::.:::.  ::   .  .      . .     .  
CCDS46 HLRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSSLEKHRRIHTGEKPYKCKVCDKAFGRDSHLAQHTRI
        740       750       760       770       780       790      

       410       420       430       440       450       460       
pF1KE4 GRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTE
         :.: . :.:: : ::    :  :  .:.::::. : :::: :::.  :. :. .:  :
CCDS46 HTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVIHKAIHSGEKPYKCNECGKTFRHNSALEIHKAIHTGE
        800       810       820       830       840       850      

       470       480       490                                     
pF1KE4 RPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD                               
       .:. :  ::: :   .::::: .:: :                                 
CCDS46 KPYKCSECGKVFNRKANLSRHHRLHTGEKPYKCNKCGKVFNQQAHLACHHRIHTGEKPYK
        860       870       880       890       900       910      

>>CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19           (936 aa)
 initn: 1067 init1: 379 opt: 680  Z-score: 442.1  bits: 92.2 E(32554): 2.7e-18
Smith-Waterman score: 859; 32.3% identity (50.5% similar) in 507 aa overlap (22-494:357-830)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH
                                     :..:. ::: ::  :.:  :   ::. ::.
CCDS46 EKPYKCNECGKTFKQGSCLTTHQIIHTGEKPYQCDICGKVFRQNSNLVNHQRIHTGEKPY
        330       340       350       360       370       380      

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV
        :  :::.:..: :::.:   :.:..::.:. : : :. :..:  ::..::::::: : :
CCDS46 KCNICGKSFSQSSNLATHQTVHSGNKPYKCDECGKTFKRSSSLTTHQIIHTGEKPYTCDV
        390       400       410       420       430       440      

             120       130       140       150         160         
pF1KE4 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNV--GPCSVCGGSGAG
       :.  ::.::.:.:: .:.: :  :               :. : .:      . :     
CCDS46 CDKVFSQRSQLARH-QRSHTGEKPYK-------------CNECGKVFSQTSHLVGHRRIH
        450       460        470                    480       490  

     170          180       190       200       210       220      
pF1KE4 GGEGP---EGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAHWAAHTDVK
        :: :   .  : .. . .:        .    . :: :.. :...  :. :   ::  .
CCDS46 TGEKPYKCDKCGKAFKQGSLLTRHKIIHTREKRYQCGECGKVFSENSCLVRHLRIHTGEQ
            500       510       520       530       540       550  

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE4 PFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAP
       :.::  : . ::  . :  ::  :     :  : :    :            ..  . . 
CCDS46 PYKCNVCGKVFNYSGNLSIHKRIHT----GEKPFQCNECG------------TVFRNYSC
            560       570           580                   590      

        290       300       310       320       330        340     
pF1KE4 LASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCD-CGTFFASAAAL
       ::   :.  :         : .. ..:. .         . .  .::. ::  :.  . :
CCDS46 LARHLRIHTGQKPYKCNVCGKVFNDSGNLSNHKRIH---TGEKPFQCNECGKVFSYYSCL
        600       610       620       630          640       650   

         350       360       370       380                390      
pF1KE4 ASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEG-------GGE--EAAAAARER
       : : . :.:   : :. ::  :.  ..: .:  .  ::        ::   ...  :: .
CCDS46 ARHRKIHTGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLIIHTGEKPYNCNEFGGAFIQSSKLARYH
           660       670       680       690       700       710   

        400                          410       420       430       
pF1KE4 EPASGEPP---SGSGR----------------GKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHT
       .  .:: :   :  ::                :.  . : :: ..: :  .: ::  .::
CCDS46 RNPTGEKPHKCSHCGRTFSHITGLTYHQRRHTGEMPYKCIECGQVFNSTSNLARHRRIHT
           720       730       740       750       760       770   

       440       450       460       470       480       490       
pF1KE4 GEKPFPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD 
       ::::. : :::: :::.  : ::: .:  :.:. :. :::.: . : :  : :.: :   
CCDS46 GEKPYKCNECGKVFRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKP
           780       790       800       810       820       830   

CCDS46 YKCNECGKAFIERSKLVYHQRNHTGEKPYKCIECGKAFGRFSCLNKHQMIHSGEKPYKCN
           840       850       860       870       880       890   

>>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19           (1058 aa)
 initn: 1019 init1: 405 opt: 660  Z-score: 429.0  bits: 90.0 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 792; 30.8% identity (51.8% similar) in 496 aa overlap (22-494:360-833)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH
                                     :. :.:::::: .:: :  : : ::. ::.
CCDS74 EKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPY
     330       340       350       360       370       380         

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV
        : .:::.:  . .: .: : ::::.:: :. : :.: ....::.:: .:::::::::  
CCDS74 DCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKE
     390       400       410       420       430       440         

             120       130       140        150            160     
pF1KE4 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLPALSAPCS---VCCNVGP--CSVCGG
       :   :. ::. .:: .: : :  :   .  : .. . ::  .   .  .  :  :. :: 
CCDS74 CGKSFTFRSTRNRH-QRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGK
     450       460        470       480       490       500        

              170                180       190       200       210 
pF1KE4 S-----GAGG------GEGP---EGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDH
       :     :  :      :: :   .  : .. : .         ..  :. :  :.. :  
CCDS74 SFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTV
      510       520       530       540       550       560        

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE4 GRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGP
       :  :  :   ::  ::. : .: . :     : .:.  :     :  : :          
CCDS74 GSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHT----GEKPYQC---------
      570       580       590       600           610              

             280       290       300       310         320         
pF1KE4 ETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGG--GEAPAPAAAAEPSEDT
       .  :.. .. .:   :.. .:.  :      :  :  . .    ..     .. .:    
CCDS74 QECGKAFVSVSG---LTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKP----
         620          630       640       650       660            

     330        340       350       360       370       380        
pF1KE4 LYQC-DCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEE
        :.: .::  :.  ..: .: . :.    :   .::  ... ..: .:...  ::   . 
CCDS74 -YECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDC
       670       680       690       700       710       720       

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE4 AAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECG
          .      ..    .    :.:.. :.:: : : :   : .:  .::::::. : :::
CCDS74 KECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECG
       730       740       750       760       770       780       

      450       460       470       480       490                  
pF1KE4 KFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD            
       : :  .  : .:: .:  :. . :. :::.: . :.: .: ..: :              
CCDS74 KSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFA
       790       800       810       820       830       840       

CCDS74 FRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSG
       850       860       870       880       890       900       

>>CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19           (1090 aa)
 initn: 1019 init1: 405 opt: 660  Z-score: 428.8  bits: 90.0 E(32554): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 792; 30.8% identity (51.8% similar) in 496 aa overlap (22-494:392-865)

                        10        20        30        40        50 
pF1KE4          MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPH
                                     :. :.:::::: .:: :  : : ::. ::.
CCDS59 EKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPY
             370       380       390       400       410       420 

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE4 ACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLV
        : .:::.:  . .: .: : ::::.:: :. : :.: ....::.:: .:::::::::  
CCDS59 DCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKE
             430       440       450       460       470       480 

             120       130       140        150            160     
pF1KE4 CELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLPALSAPCS---VCCNVGP--CSVCGG
       :   :. ::. .:: .: : :  :   .  : .. . ::  .   .  .  :  :. :: 
CCDS59 CGKSFTFRSTRNRH-QRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGK
             490        500       510       520       530       540

              170                180       190       200       210 
pF1KE4 S-----GAGG------GEGP---EGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDH
       :     :  :      :: :   .  : .. : .         ..  :. :  :.. :  
CCDS59 SFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTV
              550       560       570       580       590       600

             220       230       240       250       260       270 
pF1KE4 GRELAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGP
       :  :  :   ::  ::. : .: . :     : .:.  :     :  : :          
CCDS59 GSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHT----GEKPYQC---------
              610       620       630       640                    

             280       290       300       310         320         
pF1KE4 ETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGG--GEAPAPAAAAEPSEDT
       .  :.. .. .:   :.. .:.  :      :  :  . .    ..     .. .:    
CCDS59 QECGKAFVSVSG---LTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKP----
       650          660       670       680       690       700    

     330        340       350       360       370       380        
pF1KE4 LYQC-DCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEE
        :.: .::  :.  ..: .: . :.    :   .::  ... ..: .:...  ::   . 
CCDS59 -YECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDC
               710       720       730       740       750         

      390       400       410       420       430       440        
pF1KE4 AAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECG
          .      ..    .    :.:.. :.:: : : :   : .:  .::::::. : :::
CCDS59 KECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECG
     760       770       780       790       800       810         

      450       460       470       480       490                  
pF1KE4 KFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD            
       : :  .  : .:: .:  :. . :. :::.: . :.: .: ..: :              
CCDS59 KSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFA
     820       830       840       850       860       870         

CCDS59 FRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSG
     880       890       900       910       920       930         

>>CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19            (782 aa)
 initn: 728 init1: 372 opt: 657  Z-score: 428.4  bits: 89.4 E(32554): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 820; 30.4% identity (50.9% similar) in 503 aa overlap (25-494:251-749)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE4       MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACP
                                     ::::::.:  ::.:  : . ::. ::. : 
CCDS82 YKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCH
              230       240       250       260       270       280

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE4 RCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCEL
       .::: :.:.  ::.: : ::::.::.:. : :.::  ..:  ::..::::::. :  :  
CCDS82 ECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGK
              290       300       310       320       330       340

          120       130       140           150         160        
pF1KE4 RFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLP---ALSAPCSVCCNVGP--CSVCG----
        :.. : :  :  : : :  :   .  : ..    .:.   ..  .  :  :. ::    
CCDS82 LFTQNSHLISHW-RIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFR
              350        360       370       380       390         

                 170       180       190          200       210    
pF1KE4 -GSGAG------GGEGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAAAA---SLPPFACGACARRFDHGRE
        .:  :       :: :   .    ....    :.  .   .  :: :. :.. : .. .
CCDS82 YNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQ
     400       410       420       430       440       450         

          220       230       240       250             260        
pF1KE4 LAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGP------GAPPAQA------
       :: :   ::  ::.:: .: . :.. . :  :.  :. . :      :   .:       
CCDS82 LANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSH
     460       470       480       490       500       510         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE4 WAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAA
        .   :  :   .:   . :  . ::   :.  :         :  . .   ..      
CCDS82 RGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSD---RSSLTFHQ
     520       530       540       550       560          570      

            330        340       350       360       370       380 
pF1KE4 AEPSEDTLYQC-DCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSH
       :  . .  :.: .::  :   . ::.: . :.:   : :..::  ..  . :  :. .  
CCDS82 AIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHT
        580       590       600       610       620       630      

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE4 GEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKP
       ::   .    .    . .     . .  :.: . :.:: : :    .:  :  .:::.::
CCDS82 GEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKP
        640       650       660       670       680       690      

             450       460       470       480       490           
pF1KE4 FPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD     
       . : :::: : .. .:  :: .:  :.:. :  :::.: . :.:. :. .: :       
CCDS82 YKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCN
        700       710       720       730       740       750      

CCDS82 ECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
        760       770       780  

>>CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19            (818 aa)
 initn: 728 init1: 372 opt: 657  Z-score: 428.2  bits: 89.4 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 820; 30.4% identity (50.9% similar) in 503 aa overlap (25-494:287-785)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE4       MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFARHTALKPHACP
                                     ::::::.:  ::.:  : . ::. ::. : 
CCDS12 YKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCH
        260       270       280       290       300       310      

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE4 RCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTGEKPYCCLVCEL
       .::: :.:.  ::.: : ::::.::.:. : :.::  ..:  ::..::::::. :  :  
CCDS12 ECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGK
        320       330       340       350       360       370      

          120       130       140           150         160        
pF1KE4 RFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQP-GPGLP---ALSAPCSVCCNVGP--CSVCG----
        :.. : :  :  : : :  :   .  : ..    .:.   ..  .  :  :. ::    
CCDS12 LFTQNSHLISHW-RIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFR
        380        390       400       410       420       430     

                 170       180       190          200       210    
pF1KE4 -GSGAG------GGEGPEGAGAGLGSWGLAEAAAAAAA---SLPPFACGACARRFDHGRE
        .:  :       :: :   .    ....    :.  .   .  :: :. :.. : .. .
CCDS12 YNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQ
         440       450       460       470       480       490     

          220       230       240       250             260        
pF1KE4 LAAHWAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGP------GAPPAQA------
       :: :   ::  ::.:: .: . :.. . :  :.  :. . :      :   .:       
CCDS12 LANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSH
         500       510       520       530       540       550     

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE4 WAAGPGAGPETAGEGTAAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAA
        .   :  :   .:   . :  . ::   :.  :         :  . .   ..      
CCDS12 RGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSD---RSSLTFHQ
         560       570       580       590       600          610  

            330        340       350       360       370       380 
pF1KE4 AEPSEDTLYQC-DCGTFFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSH
       :  . .  :.: .::  :   . ::.: . :.:   : :..::  ..  . :  :. .  
CCDS12 AIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHT
            620       630       640       650       660       670  

             390       400       410       420       430       440 
pF1KE4 GEGGGEEAAAAAREREPASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKP
       ::   .    .    . .     . .  :.: . :.:: : :    .:  :  .:::.::
CCDS12 GEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKP
            680       690       700       710       720       730  

             450       460       470       480       490           
pF1KE4 FPCLECGKFFRHECYLKRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD     
       . : :::: : .. .:  :: .:  :.:. :  :::.: . :.:. :. .: :       
CCDS12 YKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCN
            740       750       760       770       780       790  

CCDS12 ECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
            800       810        

>>CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19             (819 aa)
 initn: 463 init1: 463 opt: 642  Z-score: 418.8  bits: 87.7 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 804; 32.0% identity (51.3% similar) in 487 aa overlap (14-494:334-758)

                                10        20        30        40   
pF1KE4                  MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFA
                                     : : .  .:..:. :::.:::.: :  : .
CCDS62 RHQRVPTGEKSVKSLERGRGVRQNTHIRNHPRAPVGDMPYRCDVCGKGFRYKSVLLIHQG
           310       320       330       340       350       360   

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE4 RHTALKPHACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTG
        ::. .:. : .:::.: .: ::  : : ::::.::.:: : :::  :. :  :: .:::
CCDS62 VHTGRRPYKCEECGKAFGRSSNLLVHQRVHTGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTG
           370       380       390       400       410       420   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KE4 EKPYCCLVCELRFSSRSSLGRHLKRQHRGVLPSPLQPGPGLPALSAPCSVCCNVGPCS--
       :::: :  :   : ..:.: .:   ::       ..::   :     :. : .   ::  
CCDS62 EKPYTCSECGKGFCAKSALHKH---QH-------IHPGEK-PY---SCGECGKGFSCSSH
           430       440                 450           460         

             170          180       190       200       210        
pF1KE4 VCGGSGAGGGEGP---EGAGAGLGSWGLAEAAAAAAASLPPFACGACARRFDHGRELAAH
       . . . .  :: :   .  : :..  .  .:   .  .   . :..:.. :...  :  :
CCDS62 LSSHQKTHTGERPYQCDKCGKGFSHNSYLQAHQRVHMGQHLYKCNVCGKSFSYSSGLLMH
     470       480       490       500       510       520         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE4 WAAHTDVKPFKCPRCERDFNAPALLERHKLTHDLQGPGAPPAQAWAAGPGAGPETAGEGT
          ::  ::.:: .: ..:.  . :. :. .:     :  : .    : :          
CCDS62 QRLHTGEKPYKC-ECGKSFGRSSDLHIHQRVHT----GEKPYKCSECGKGF---------
     530       540        550       560           570              

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE4 AAEAGDAPLASDRRLLLGPAGGGVPKLGGLLPEGGGEAPAPAAAAEPSEDTLYQCD-CGT
            .. : : .:.  :                  : :             : :: :: 
CCDS62 ---RRNSDLHSHQRVHTG------------------ERP-------------YVCDVCGK
            580       590                                      600 

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE4 FFASAAALASHLEAHSGPATYGCGHCGALYAALAALEEHRRVSHGEGGGEEAAAAARERE
        :  .. :  : ..:.:   : :..::  ..  ..:  :.::  ::   .    .   : 
CCDS62 GFIYSSDLLIHQRVHTGEKPYKCAECGKGFSYSSGLLIHQRVHTGEKPYRCQECGKGFRC
             610       620       630       640       650       660 

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE4 PASGEPPSGSGRGKKIFGCSECEKLFRSPRDLERHVLVHTGEKPFPCLECGKFFRHECYL
        .: .  .    ::: . :..: : :    .:. :  .::::::. : :::: ::.   :
CCDS62 TSSLHKHQRVHTGKKPYTCDQCGKGFSYGSNLRTHQRLHTGEKPYTCCECGKGFRYGSGL
             670       680       690       700       710       720 

       460       470       480       490                           
pF1KE4 KRHRLLHGTERPFPCHICGKGFITLSNLSRHLKLHRGMD                     
         :. .:  :.:. ::.::::.   :.:. : ..: :                       
CCDS62 LSHKRVHTGEKPYRCHVCGKGYSQSSHLQGHQRVHTGEKPYKCEECGKGFGRNSCLHVHQ
             730       740       750       760       770       780 

CCDS62 RVHTGEKPYTCGVCGKGFSYTSGLRNHQRVHLGENPYK
             790       800       810         

>>CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19             (825 aa)
 initn: 463 init1: 463 opt: 642  Z-score: 418.8  bits: 87.7 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 804; 32.0% identity (51.3% similar) in 487 aa overlap (14-494:340-764)

                                10        20        30        40   
pF1KE4                  MDDVPAPTPAPAPPAAAAPRVPFHCSECGKSFRYRSDLRRHFA
                                     : : .  .:..:. :::.:::.: :  : .
CCDS42 RHQRVPTGEKSVKSLERGRGVRQNTHIRNHPRAPVGDMPYRCDVCGKGFRYKSVLLIHQG
     310       320       330       340       350       360         

            50        60        70        80        90       100   
pF1KE4 RHTALKPHACPRCGKGFKHSFNLANHLRSHTGERPYRCSACPKGFRDSTGLLHHQVVHTG
        ::. .:. : .:::.: .: ::  : : ::::.::.:: : :::  :. :  :: .:::
CCDS42 VHTGRRPYKCEECGKAFGRSSNLLVHQRVHTGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTG
     370       380       390       400       410       420         

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       :::: :  :   : ..:.: .:   ::       ..::   :     :. : .   ::  
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       . . . .  :: :   .  : :..  .  .:   .  .   . :..:.. :...  :  :
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          ::  ::.:: .: ..:.  . :. :. .:     :  : .    : :          
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            .. : : .:.  :                  : :             : :: :: 
CCDS42 ---RRNSDLHSHQRVHTG------------------ERP-------------YVCDVCGK
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        :  .. :  : ..:.:   : :..::  ..  ..:  :.::  ::   .    .   : 
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        .: .  .    ::: . :..: : :    .:. :  .::::::. : :::: ::.   :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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