FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2737, 281 aa 1>>>pF1KE2737 281 - 281 aa - 281 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9036+/-0.000895; mu= 17.5364+/- 0.053 mean_var=66.0908+/-13.294, 0's: 0 Z-trim(105.7): 52 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.157762 statistics sampled from 8612 (8664) to 8612 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16 Scan time: 1.080 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS12760.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 ( 281) 1896 440.3 7.5e-124 CCDS46139.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 ( 213) 1449 338.5 2.6e-93 CCDS7909.1 CD82 gene_id:3732|Hs109|chr11 ( 267) 503 123.2 2e-28 CCDS7721.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 ( 238) 378 94.7 6.7e-20 CCDS7910.1 TSPAN18 gene_id:90139|Hs109|chr11 ( 248) 342 86.6 2e-17 CCDS829.1 CD53 gene_id:963|Hs109|chr1 ( 219) 334 84.7 6.5e-17 CCDS7719.1 CD151 gene_id:977|Hs109|chr11 ( 253) 329 83.6 1.6e-16 CCDS44949.1 TSPAN19 gene_id:144448|Hs109|chr12 ( 248) 314 80.2 1.7e-15 CCDS8520.1 TSPAN9 gene_id:10867|Hs109|chr12 ( 239) 313 80.0 1.9e-15 CCDS31765.1 TSPAN11 gene_id:441631|Hs109|chr12 ( 253) 311 79.5 2.7e-15 CCDS31469.1 CD82 gene_id:3732|Hs109|chr11 ( 242) 298 76.5 2.1e-14 CCDS530.1 TSPAN1 gene_id:10103|Hs109|chr1 ( 241) 286 73.8 1.4e-13 CCDS10292.1 TSPAN3 gene_id:10099|Hs109|chr15 ( 253) 285 73.6 1.7e-13 CCDS7734.1 CD81 gene_id:975|Hs109|chr11 ( 236) 275 71.3 7.6e-13 CCDS8999.1 TSPAN8 gene_id:7103|Hs109|chr12 ( 237) 273 70.8 1e-12 CCDS77130.1 TSPAN10 gene_id:83882|Hs109|chr17 ( 393) 269 70.1 2.9e-12 CCDS8540.1 CD9 gene_id:928|Hs109|chr12 ( 228) 266 69.2 3.1e-12 CCDS7369.1 TSPAN14 gene_id:81619|Hs109|chr10 ( 270) 262 68.4 6.6e-12 CCDS3646.1 TSPAN5 gene_id:10098|Hs109|chr4 ( 268) 251 65.9 3.7e-11 CCDS41589.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 ( 174) 247 64.8 5e-11 >>CCDS12760.1 CD37 gene_id:951|Hs109|chr19 (281 aa) initn: 1896 init1: 1896 opt: 1896 Z-score: 2337.2 bits: 440.3 E(33420): 7.5e-124 Smith-Waterman score: 1896; 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CCDS79 FIGVGAVTMLMGFLGCIGAVNEVRCLLGLYFAFLLLILIAQVTAGALFYFNMGKLKQEMG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS .: . :. :... :.. ...::::: :..:::: .: . : : :. ::: CCDS79 GIVTELIRDYNSSREDSL-QDAWDYVQAQVKCCGWVSFYNWTDNAELM-NRPEV-TYPCS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN : .... .:... : : . .. : . .:.::: . .: ::.. CCDS79 C-EVKGEEDNSLS--------VRKGFCEAPGNRTQSGNHPEDWPVYQEGCMEKVQAWLQE 180 190 200 210 220 250 260 270 280 pF1KE2 NLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNL-DHVYNRLARYR :: :.:. .::...:: :.::: :::.. .. :... .: CCDS79 NLGIILGVGVGVAIIELLGMVLSICLCRHVHSEDYSKVPKY 230 240 250 260 >>CCDS7721.1 TSPAN4 gene_id:7106|Hs109|chr11 (238 aa) initn: 395 init1: 184 opt: 378 Z-score: 470.9 bits: 94.7 E(33420): 6.7e-20 Smith-Waterman score: 387; 29.5% identity (59.8% similar) in 261 aa overlap (6-262:4-226) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV .::. .::..:.:::.:.. : .. :::. . ::... . .: :. ... CCDS77 MARACLQAVKYLMFAFNLLFWLGGCGVLGVGIWLAATQGSFATLSS-SFPSLSA-ANL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR : :.: :.:.:...::.::.:: .::: .: .:::.: . :..::. . ...: . CCDS77 LIITGAFVMAIGFVGCLGAIKENKCLLLTFFLLLLLVFLLEATIAILFFAYTDKIDRYAQ 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS . ..: .. :::. . .. ..:. .: ..:::: :::.: .: ::: : CCDS77 QDLKKGLHLYGTQGN-VGLTNAWSIIQTDFRCCGVSNYTDWFEVY-------NATRVPDS 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN : . .. :.. : . .. : . .. ::.. CCDS77 C----------------------------CLEFSESCGLHAPGTWWKAPCYETVKVWLQE 170 180 190 200 250 260 270 280 pF1KE2 NL--ISIVGICLG-VGLLELGF-MTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR :: ..: :.: . : .: : : ::. CCDS77 NLLAVGIFGLCTALVQILGLTFAMTMYCQVVKADTYCA 210 220 230 >>CCDS7910.1 TSPAN18 gene_id:90139|Hs109|chr11 (248 aa) initn: 234 init1: 159 opt: 342 Z-score: 426.4 bits: 86.6 E(33420): 2e-17 Smith-Waterman score: 346; 27.1% identity (59.0% similar) in 266 aa overlap (7-270:5-247) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSK- ::: .::..::::.:.:. :. .. .:::...: :.: .: : :: . . CCDS79 MEGDCLSCMKYLMFVFNFFIFLGGACLLAIGIWVMVDPTGFREIV--AANPLLLTGAY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 -VLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERS .::..:.. . ...::: ::..: .::: ..: ..:..: .... .:: : .: : CCDS79 ILLAMGGLLFL-LGFLGCCGAVRENKCLLLFFFLFILIIFLAELSAAILAFIFRENLTRE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVP . ... ..: : . . .:. :.. . ::: . :.:. . ..: ....:: CCDS79 F--FTKELTKHYQGNNDTDVFSATWNSVMITFGCCGVNGPEDFKFASVFRLLTLDSEEVP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 CSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWL .: :: :: : : : . : . . ..:: . . . CCDS79 EACCRRE-------------PQ-SRDGVLL----SREECLLGRSLFLNKQGCYTVILNTF 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KE2 HNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR .. . .. .:: .:: : ... : :.. CCDS79 ETYVYLAGALAIGVLAIELFAMIFAMCLFRGIQ 220 230 240 >>CCDS829.1 CD53 gene_id:963|Hs109|chr1 (219 aa) initn: 247 init1: 141 opt: 334 Z-score: 417.3 bits: 84.7 E(33420): 6.5e-17 Smith-Waterman score: 334; 36.5% identity (67.3% similar) in 156 aa overlap (6-161:4-153) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV : :.:.:: :: :::.:.. : :. :::..:: .. : : .: : ..: CCDS82 MGMSSLKLLKYVLFFFNLLFWICGCCILGFGIYLLIHNNFGVLFHNL---PSLTLGNV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR ..: : . : .:.:::.:..:: .::: .: .::... ...::.::. . . .:.. . CCDS82 FVIVGSIIMVVAFLGCMGSIKENKCLLMSFFILLLIILLAEVTLAILLFVYEQKLNEYVA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS . .:..: .. :: :: .: :.::: . .:: CCDS82 KGLTDSIHRYHSDNSTKAA---WDSIQSFLQCCGINGTSDWTSGPPASCPSDRKVEGCYA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN CCDS82 KARLWFHSNFLYIGIITICVCVIEVLGMSFALTLNCQIDKTSQTIGL 180 190 200 210 >>CCDS7719.1 CD151 gene_id:977|Hs109|chr11 (253 aa) initn: 338 init1: 225 opt: 329 Z-score: 410.3 bits: 83.6 E(33420): 1.6e-16 Smith-Waterman score: 329; 31.8% identity (62.6% similar) in 179 aa overlap (4-181:8-184) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSAQESCLSL-IKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQ . .: .. .::.::..: :.. : .. ::: : :....:. :: CCDS77 MGEFNEKKTTCGTVCLKYLLFTYNCCFWLAGLAVMAVGIWTLALKSDYISL--LASGTYL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 IWSKVLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQL . .:...: .: ..::: ...:: : :: ::: .::..: .: ::: . :: CCDS77 ATAYILVVAGTVVMVTGVLGCCATFKERRNLLRLYFILLLIIFLLEIIAGILAYAYYQQL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ERSLRDVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAH . :.. .. :. : .: . :. . : .: ...::: . ::: . .:.. . .. CCDS77 NTELKENLKDTMTKRYHQPGHEAVTSAVDQLQQEFHCCGSNNSQDWRDSEWIRSQEAGGR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ :: :: CCDS77 VVPDSCCKTVVALCGQRDHASNIYKVEGGCITKLETFIQEHLRVIGAVGIGIACVQVFGM 180 190 200 210 220 230 >>CCDS44949.1 TSPAN19 gene_id:144448|Hs109|chr12 (248 aa) initn: 377 init1: 215 opt: 314 Z-score: 391.9 bits: 80.2 E(33420): 1.7e-15 Smith-Waterman score: 352; 27.5% identity (56.5% similar) in 269 aa overlap (10-273:9-243) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLA---FVPLQIW .::::: ..: :.::: :.. :: :.:.:...:.. .::. CCDS44 MLRNNKTIIIKYFLNLINGAFLVLGLLFMGFGAWLLLDRNNFLTAFDENNHFIVPI--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SKVLAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLER :..: : :. . ::: .: .:.: :: .: .. ::.:..:. .: :.. .... CCDS44 SQILIGMGSSTVLFCLLGYIGIHNEIRWLLIVYAVLITWTFAVQVVLSAFIITKKEEVQQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SLRDVVEKTIQKYGTN--PEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAH .: .. .:..::.. ::. . . .: :.::: : :: : : .. CCDS44 LWHDKIDFVISEYGSKDKPEDITKWTILNALQKTLQCCGQHNYTDW----IKNKNKENSG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RVPCSCYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQ .::::: ..: .: : .. : ::: . .. CCDS44 QVPCSC--------------------------TKSTLRKWFCDEPLNA-TYLEGCENKIS 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KE2 KWLHNNLISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR : . :.....:: .:. :. ..:.. . .:. .. CCDS44 AWYNVNVLTLIGINFGLLTSEVFQVSLTVCFFKNIKNIIHAEM 210 220 230 240 >>CCDS8520.1 TSPAN9 gene_id:10867|Hs109|chr12 (239 aa) initn: 296 init1: 123 opt: 313 Z-score: 390.9 bits: 80.0 E(33420): 1.9e-15 Smith-Waterman score: 334; 25.7% identity (58.7% similar) in 276 aa overlap (7-280:5-237) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQIWSKV :: .::..:.:::.:.. : .. :::. ... .:..: .: :. . : CCDS85 MARGCLCCLKYMMFLFNLIFWLCGCGLLGVGIWLSVSQGNFATFSP-SFPSLSAANLV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LAISGIFTMGIALLGCVGALKELRCLLGLYFGMLLLLFATQITLGILISTQRAQLERSLR .:: : ..: ..:::.::.:: .::: .: .::... ... : ::. . ..... . CCDS85 IAI-GTIVMVTGFLGCLGAIKENKCLLLSFFIVLLVILLAELILLILFFVYMDKVNENAK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DVVEKTIQKYGTNPEETAAEESWDYVQFQLRCCGWHYPQDWFQVLILRGNGSEAHRVPCS ... . : :. .... ...:. .: ..:::: ::. :: :... :: CCDS85 KDLKEGLLLYHTE-NNVGLKNAWNIIQAEMRCCGVTDYTDWYPVL---GENT----VPDR 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 CYNLSATNDSTILDKVILPQLSRLGHLARSRHSADICAVPAESHIYREGCAQGLQKWLHN : .... :. : . ..: :: . .. :. . CCDS85 C----------------------------CMENSQGCGRNATTPLWRTGCYEKVKMWFDD 170 180 190 200 250 260 270 280 pF1KE2 N--LISIVGICLGVGLLELGFMTLSIFLCRNLDHVYNRLARYR : ... ::.:. . . :: :..:. : ..:.. .: CCDS85 NKHVLGTVGMCILI-MQILG-MAFSMTL---FQHIHRTGKKYDA 210 220 230 >>CCDS31765.1 TSPAN11 gene_id:441631|Hs109|chr12 (253 aa) initn: 192 init1: 192 opt: 311 Z-score: 388.1 bits: 79.5 E(33420): 2.7e-15 Smith-Waterman score: 332; 28.2% identity (58.3% similar) in 266 aa overlap (11-274:16-253) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSAQESCLSLIKYFLFVFNLFFFVLGSLIFCFGIWILIDKTSFVSFVGLAFVPLQ .::.:::::.::.: :. .. ::: :..:....: :: . 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