FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9569, 387 aa 1>>>pF1KE9569 387 - 387 aa - 387 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5773+/-0.000821; mu= 16.5326+/- 0.049 mean_var=116.2930+/-29.799, 0's: 0 Z-trim(110.7): 348 B-trim: 1437 in 2/50 Lambda= 0.118932 statistics sampled from 11177 (11822) to 11177 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16 Scan time: 3.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 2633 462.7 2.5e-130 CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 1263 227.6 1.4e-59 CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 834 154.0 1.9e-37 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 639 120.6 2.4e-27 CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 625 118.3 1.4e-26 CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 608 115.3 1e-25 CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 608 115.4 1.1e-25 CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 605 114.8 1.5e-25 CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 600 113.9 2.6e-25 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 599 113.7 2.8e-25 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 599 113.7 2.9e-25 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 599 113.7 2.9e-25 CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 599 113.7 2.9e-25 CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 599 113.8 3e-25 CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 582 110.8 2.1e-24 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 581 110.6 2.3e-24 CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 578 110.1 3.3e-24 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 577 110.0 4.1e-24 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 574 109.4 5.4e-24 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 565 107.9 1.6e-23 CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 543 104.0 1.9e-22 CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 543 104.0 2e-22 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 540 103.6 3.1e-22 CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 539 103.4 3.6e-22 CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 524 100.8 1.9e-21 CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 518 99.8 4.4e-21 CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 498 96.3 3.9e-20 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 495 95.8 6.3e-20 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 493 95.5 7.6e-20 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 492 95.3 9.1e-20 CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 482 93.6 3.1e-19 CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 476 92.6 6.2e-19 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 472 91.9 1e-18 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 472 92.0 1.1e-18 CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 453 88.6 9.3e-18 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 453 88.6 9.4e-18 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 451 88.3 1.2e-17 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 450 88.1 1.3e-17 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 450 88.2 1.4e-17 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 450 88.2 1.4e-17 CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 449 88.0 1.7e-17 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 448 87.8 1.7e-17 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 444 87.1 2.7e-17 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 444 87.1 2.8e-17 CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 443 87.0 3.7e-17 CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 439 86.2 4.8e-17 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 437 85.9 6.3e-17 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 437 85.9 6.5e-17 CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 434 85.4 9.8e-17 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 423 83.5 3.4e-16 >>CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 (387 aa) initn: 2633 init1: 2633 opt: 2633 Z-score: 2453.3 bits: 462.7 E(32554): 2.5e-130 Smith-Waterman score: 2633; 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CCDS13 MADAQNISLDSPGSVGAVAVPVVFALIFLLGTVGNGLVLAVLLQPGPSAWQE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 --STTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASSFT :::.::::::.:::::::::::::::::::::.:.::.:.:::::.::.:::.::::: CCDS13 PGSTTDLFILNLAVADLCFILCCVPFQATIYTLDAWLFGALVCKAVHLLIYLTMYASSFT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLTVC :::::.:::::.:.::.:: ::::::: ::.::.: :. :::.:::::: . . : .: CCDS13 LAAVSVDRYLAVRHPLRSRALRTPRNARAAVGLVWLLAALFSAPYLSYYGTVRYGALELC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 HPAWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPV--AAGSGARRAKRK ::: ::::.:. ::. .::::: :..:.:.::::.:: :: :. ::. . ::: . CCDS13 VPAWEDARRRALDVATFAAGYLLPVAVVSLAYGRTLRFLWAAVGPAGAAAAEARRRATGR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYA . : .: ::::. ::: :::::::: :.:.: .. :::: :. :: ..:::::.::.::: CCDS13 AGRAMLAVAALYALCWGPHHALILCFWYGRFAFSPATYACRLASHCLAYANSCLNPLVYA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 LVSKHFRKGFRTI--CAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMSEAAGA :.:.::: :: . :. . :: :: :. : . : :. :: :.:. CCDS13 LASRHFRARFRRLWPCGRRRRHRARRALRRVRPASSGPPGCPGDARPSGRLL----AGGG 300 310 320 330 340 360 370 380 pF1KE9 LRPCPGASQPCILEPCPGPSWQGPKAGDSILTVDVA : : CCDS13 QGPEPREGPVHGGEAARGPE 350 360 >>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa) initn: 715 init1: 379 opt: 834 Z-score: 785.7 bits: 154.0 E(32554): 1.9e-37 Smith-Waterman score: 834; 42.5% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (12-306:20-317) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLR : . : : : .. ..:.::: .:..::.::..:: : CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVITVLAR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 G--GQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMH . :. ::::::::::..::: ..: :.:::::.:.: ::.:...:: .:... ..: CCDS12 SKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSML 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE9 ASSFTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYR---QS .: :::::.:.:::.:: . .: ::. :::: ..: ::.::. ...: ..:.. . CCDS12 VSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALSIAMASP-VAYHQGLFHP 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 QLANLTVCHPAWSAPR-RRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPVAAGSG . .: : : : :: ..:. .:::::.::::.:.. . ::..: .: . . .. : CCDS12 RASNQTFCWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHLHKKLKNMSKKSE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 ARRAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSC : .:.:... .:.:...: . :.::: . : . :: :::: :.. .:: .: ..:.:: CCDS12 A--SKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFGVFPLTPASFLFRITAHCLAYSNSS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 VNPIVYALVSKHFRKGFRTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMS ::::.::..:..:::... . CCDS12 VNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV 300 310 320 330 340 >>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa) initn: 434 init1: 188 opt: 639 Z-score: 604.3 bits: 120.6 E(32554): 2.4e-27 Smith-Waterman score: 642; 35.9% identity (61.8% similar) in 382 aa overlap (2-369:24-376) 10 20 30 pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLV :.:. :. .. . :: : . : . ..::. :: CCDS42 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLV 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 GTVGNTLVLAVLLRGGQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLC : :::.::. :.:: .. ..::...:::.::: :.: ::: :. .: : :::.:: CCDS42 GLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLS-VPFVASSAALRHWPFGSVLC 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 KAVHFLIFLTMHASSFTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNA-LAAIGLIWGLSLLFS .:: . :.: .: : :...:.:::.:. .::.. : : : : .: .: ::: . CCDS42 RAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLG-VWLASLLVT 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 GPYLSYY--RQSQLANLTVC-----HPAWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYART : . : .. .. ..: :::::: .. . ::....:::::..:: : CCDS42 LPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPAWSA----VFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLI 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 LRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRAT . . ::: :. . ::...:.::..:.:...: ::::: ... : : .: CCDS42 VGKM-RAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLF----VTSLD 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE9 YALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVSKHFRKGF-RTICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGT .. .: ..::::::.:::.:...: .::. : :..: : : .: CCDS42 ATVNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRFFQRVLCL------------RCCLL-EG- 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 HSGSVLERESSDLLH--MSEAAGALRPCPGASQPC---ILEPCPGPSWQGPKAGDSILTV .:.. :.: : .. .:: :: :: :.: :: CCDS42 -AGGA-EEEPLDYYATALKSKGGAGCMCP--PLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF 340 350 360 370 380 pF1KE9 DVA >>CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (446 aa) initn: 569 init1: 206 opt: 625 Z-score: 590.6 bits: 118.3 E(32554): 1.4e-26 Smith-Waterman score: 632; 30.2% identity (60.6% similar) in 378 aa overlap (4-375:57-415) 10 20 30 pF1KE9 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFA : :: .:. :. :. . :.. 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