FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4307, 312 aa 1>>>pF1KE4307 312 - 312 aa - 312 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5513+/-0.000751; mu= 14.9064+/- 0.045 mean_var=70.3678+/-14.217, 0's: 0 Z-trim(109.1): 26 B-trim: 214 in 1/52 Lambda= 0.152893 statistics sampled from 10661 (10686) to 10661 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16 Scan time: 2.670 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11624.1 CA4 gene_id:762|Hs108|chr17 ( 312) 2102 472.3 2e-133 CCDS10186.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 343) 518 123.0 3.3e-28 CCDS10185.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 354) 502 119.4 4e-27 CCDS947.1 CA14 gene_id:23632|Hs108|chr1 ( 337) 495 117.9 1.1e-26 CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 308) 490 116.8 2.2e-26 CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 313) 490 116.8 2.2e-26 CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 264) 468 111.9 5.6e-25 CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 464 111.4 4.4e-24 CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 ( 260) 451 108.1 7.4e-24 CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 ( 260) 427 102.8 2.9e-22 CCDS76767.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 283) 424 102.2 5e-22 CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 ( 262) 418 100.9 1.2e-21 CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX ( 317) 408 98.7 6.3e-21 CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 ( 290) 398 96.5 2.7e-20 CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 208) 391 94.8 5.9e-20 CCDS6585.1 CA9 gene_id:768|Hs108|chr9 ( 459) 394 95.7 7.3e-20 CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 ( 305) 390 94.7 9.6e-20 CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 391 95.3 3.1e-19 CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 ( 261) 380 92.5 3.9e-19 CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 391 95.4 4.6e-19 CCDS57971.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 248) 374 91.1 9.3e-19 CCDS32684.1 CA10 gene_id:56934|Hs108|chr17 ( 328) 346 85.0 8.5e-17 CCDS12729.1 CA11 gene_id:770|Hs108|chr19 ( 328) 279 70.2 2.4e-12 >>CCDS11624.1 CA4 gene_id:762|Hs108|chr17 (312 aa) initn: 2102 init1: 2102 opt: 2102 Z-score: 2508.7 bits: 472.3 E(32554): 2e-133 Smith-Waterman score: 2102; 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CCDS94 MLFSALLLEVIWILAADGGQHWTYEGPHGQDHWPASYP-----ECGNNAQSPIDIQTDS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE4 AKVDKKLGRFFFSGYDKKQT--WTVQNNGHSVMMLLENKASISGGGLPAPYQAKQLHLHW . : : . :::. : ..::::.:.. : ... :::: : : :::::: CCDS94 VTFDPDLPALQPHGYDQPGTEPLDLHNNGHTVQLSLP--STLYLGGLPRKYVAAQLHLHW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 SDLPYKG-SEHSLDGEHFAMEMHIVHEKEKGTSRNVKEAQDPEDEIAVLAFLVEAGTQVN .. : :::....: :.:::: .. . ...:: . . .:::..:.:.: : CCDS94 GQKGSPGGSEHQINSEATFAELHIVHY-DSDSYDSLSEAAERPQGLAVLGILIEVGETKN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EGFQPLVEALSNIPKPEMSTTMAESSLLDLLPKEEKLRHYFRYLGSLTTPTCDEKVVWTV ... .. : .. . ...:.. .: .:::: .: .:::: :::::: : ..:.::: CCDS94 IAYEHILSHLHEVRHKDQKTSVPPFNLRELLPK--QLGQYFRYNGSLTTPPCYQSVLWTV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KE4 FREPIQLHREQILAFSQKLYYDKEQTVSMK-DNVRPLQQLGQRTV----IKSGAP---GR : . :. ::. .. :. .:. .. .: : :: :.:: : :..:. :. CCDS94 FYRRSQISMEQLEKLQGTLFSTEEEPSKLLVQNYRALQPLNQRMVFASFIQAGSSYTTGE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 PLPWALPALLGPMLACLLAGFLR : .. :.: . ::: CCDS94 MLSLGVGILVGCL--CLLLAVYFIARKIRKKRLENRKSVVFTSAQATTEA 290 300 310 320 330 >>CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 (308 aa) initn: 282 init1: 126 opt: 490 Z-score: 587.1 bits: 116.8 E(32554): 2.2e-26 Smith-Waterman score: 490; 33.1% identity (62.8% similar) in 296 aa overlap (1-289:1-281) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MRMLLALLALSAARPSASAESHWCYEVQA-ESSNYPCLVPVKWGGNCQKDRQSPINIVTT :: :. ::.: .:. : : : : . ...: :. : .::::::. : CCDS30 MRALVLLLSLFLLGGQAQHVSDWTYSEGALDEAHWPQHYPA-----CGGQRQSPINLQRT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KAKVDKKLGRFFFSGYDKKQ-TWTVQNNGHSVMMLLEN--KASISGGGLPAPYQAKQLHL :.. . .: . ..::. . . . ::::.:.. : . . ... : . : :.:.:. CCDS30 KVRYNPSLKGLNMTGYETQAGEFPMVNNGHTVQISLPSTMRMTVADGTV---YIAQQMHF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HW--SDLPYKGSEHSLDGEHFAMEMHIVHEKEKGTSRNVKEAQDPEDEIAVLAFLVEAGT :: .. .::::..:: . ..:.:::: . : : .. ::: : .:::: .::. . CCDS30 HWGGASSEISGSEHTVDGIRHVIEIHIVHYNSKYKSYDI--AQDAPDGLAVLAAFVEVKN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 QV-NEGFQPLVEALSNIPKPEMSTTMAESSLLDLLPKEEKLRHYFRYLGSLTTPTCDEKV : .. .. :.:: : . ::.. .. :.::.. :.::. : :::::: : :.: CCDS30 YPENTYYSNFISHLANIKYPGQRTTLTGLDVQDMLPRN--LQHYYTYHGSLTTPPCTENV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VWTVFREPIQLHREQILAFSQKLYYDKEQTVSMKDNVRPLQQLGQRTVIKSGAPGRPLPW : :. . ..: : :. . ..: ...:. ... : : :..: :..:. :.. CCDS30 HWFVLADFVKLSRTQVWKLENSLLDHRNKTI--HNDYRRTQPLNHR-VVESNFPNQEYTL 230 240 250 260 270 280 300 310 pF1KE4 ALPALLGPMLACLLAGFLR CCDS30 GSEFQFYLHKIEEILDYLRRALN 290 300 >>CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 (313 aa) initn: 282 init1: 126 opt: 490 Z-score: 587.0 bits: 116.8 E(32554): 2.2e-26 Smith-Waterman score: 490; 33.1% identity (62.8% similar) in 296 aa overlap (1-289:1-281) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MRMLLALLALSAARPSASAESHWCYEVQA-ESSNYPCLVPVKWGGNCQKDRQSPINIVTT :: :. ::.: .:. : : : : . ...: :. : .::::::. : CCDS57 MRALVLLLSLFLLGGQAQHVSDWTYSEGALDEAHWPQHYPA-----CGGQRQSPINLQRT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 KAKVDKKLGRFFFSGYDKKQ-TWTVQNNGHSVMMLLEN--KASISGGGLPAPYQAKQLHL :.. . .: . ..::. . . . ::::.:.. : . . ... : . : :.:.:. CCDS57 KVRYNPSLKGLNMTGYETQAGEFPMVNNGHTVQISLPSTMRMTVADGTV---YIAQQMHF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HW--SDLPYKGSEHSLDGEHFAMEMHIVHEKEKGTSRNVKEAQDPEDEIAVLAFLVEAGT :: .. .::::..:: . ..:.:::: . : : .. ::: : .:::: .::. . CCDS57 HWGGASSEISGSEHTVDGIRHVIEIHIVHYNSKYKSYDI--AQDAPDGLAVLAAFVEVKN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 QV-NEGFQPLVEALSNIPKPEMSTTMAESSLLDLLPKEEKLRHYFRYLGSLTTPTCDEKV : .. .. :.:: : . ::.. .. :.::.. :.::. : :::::: : :.: CCDS57 YPENTYYSNFISHLANIKYPGQRTTLTGLDVQDMLPRN--LQHYYTYHGSLTTPPCTENV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VWTVFREPIQLHREQILAFSQKLYYDKEQTVSMKDNVRPLQQLGQRTVIKSGAPGRPLPW : :. . ..: : :. . ..: ...:. ... : : :..: :..:. :.. CCDS57 HWFVLADFVKLSRTQVWKLENSLLDHRNKTI--HNDYRRTQPLNHR-VVESNFPNQGKGH 230 240 250 260 270 280 300 310 pF1KE4 ALPALLGPMLACLLAGFLR CCDS57 GGHRGRSQNPRVQPTSTRHPLALGSLEA 290 300 310 >>CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (264 aa) initn: 391 init1: 191 opt: 468 Z-score: 561.9 bits: 111.9 E(32554): 5.6e-25 Smith-Waterman score: 468; 34.6% identity (63.2% similar) in 269 aa overlap (23-284:7-261) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRMLLALLALSAARPSASAESHWCYEVQAESSNYPCLVPVKWGGNCQKDRQSPINIVTTK : : . :.. : :. : ::::::::.... CCDS10 MTGHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQG-----DRQSPINIISSQ 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KE4 AKVDKKLGRFFFSGYDKKQTWTVQNNGHSVMMLL---ENKASISGGGLPAPYQAKQLHLH : . .: . .: :. .. .. ::::::.. . .... ..:: : .::. ::.:.: CCDS10 AVYSPSLQPLELS-YEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPLEGPYRLKQFHFH 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 WSDLPYKGSEHSLDGEHFAMEMHIVHEKEKGTSRNVKEAQDPEDEIAVLAFLVEAGTQVN :. ::::..::. : :.:.:: . : : . :: . : .::.. ..:.: . . CCDS10 WGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYS-TFGEAASAPDGLAVVGVFLETGDE-H 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EGFQPLVEALSNIPKPEMSTTMAESSLLD---LLPKEEKLRHYFRYLGSLTTPTCDEKVV ... :..:: . ... : :. : .. ::: :::. : :::::: .:.:. 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