FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9638, 1828 aa 1>>>pF1KE9638 1828 - 1828 aa - 1828 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3461+/-0.00114; mu= 8.5167+/- 0.069 mean_var=287.8450+/-56.634, 0's: 0 Z-trim(111.4): 82 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.075595 statistics sampled from 12264 (12333) to 12264 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16 Scan time: 7.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 12296 1356.3 0 CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 4987 559.2 4.8e-158 CCDS45356.1 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 ( 501) 3351 380.2 1e-104 CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 1468 175.2 1.2e-42 CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 1468 175.5 1.8e-42 CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 1468 175.5 1.8e-42 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CCDS34 MNGHS-DEESVRNSSGESSQSDDDSGSASGSGSGSSSGSSSD 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 SSESQS-ESESES---AGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRS-- .: ::: :.:.: .::.:. ..:. .. : .: ..:. :.. .:.:: CCDS34 GSSSQSGSSDSDSGSESGSQSESESDTSRENKVQAKPPKVDGAEFWKSSPSILAVQRSAI 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KE9 ---------NRSRQEPSRFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQG ....: : . .:..::. .: . . . .:. .:.: :.. : . ...: CCDS34 LKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSG 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 TSAESEPEQKKVKARRPV----PRRTVP--KPRVKKQPKTQR---GKRKKQ-DSSDEDDD ...::: :..: . . :. : ::. ... :. . :..:.: :::.:::: CCDS34 SDSESEEEREKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDD 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 --DDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDE-QQDNSETIEKVLDSR : . ::..::.:. :::::::....::::::.:. :: : . .... ::::. .: : CCDS34 EEDYDNDKRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCR 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 LGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQ .:.::::::.::.::.::.:::.. :. .:. :::::::::::::.::.:::.::.:.:: CCDS34 IGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQ 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 KVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSK .:.:.:::.:.:::..: :.:: ..:::::::.::::::...:.::::::::.:: CCDS34 NVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIA----- 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 STLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNS :: . . .. :.: :::.::::::::::: :::.:::: ::: . :::.: CCDS34 ----------HSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQS 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 pF1KE9 KTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGG-ENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILAD :: : ..::.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:::::::::::.:: :::: CCDS34 KTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILAD 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 EMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLM ::::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :: ..:.:::.::. CCDS34 EMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDIN 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 SRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLL ::: :: .:: : :::::::: :.::::::::::. ::..::::.::::::::::::::: CCDS34 SRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLL 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::: :: :: CCDS34 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASL 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 HKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTS :: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::..:::: CCDS34 HKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTS 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KE9 GFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNR :::::.::::::::::::::::..:: : :: : ::::::::::::::: :::::::: CCDS34 GFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNR 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 VLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRA :::::::::::::::::: ...::::::::::::.::::::::::.::::::::::::: CCDS34 VLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRA 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 pF1KE9 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::: CCDS34 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERA 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 KKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESE ::::::::::::::::::.:.:...:. :.:.:::::::.::::::::.:::: ::::.: CCDS34 KKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQE 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 PQEMDIDEILRLAETRENEVST-SATDELLSQFKVANFATM-EDEEELE-ERPHKDWDEI ::::::::::. :::.::: . .. ::::::::::::..: ::. ::: :: :.:.:: CCDS34 PQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEI 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 IPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETE :::.::...:::::::::::::::::.:. .:. . : :.. . ...: :.:.:.. CCDS34 IPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEG---RRSRSRRYSGSDSDS- 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 DSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKS .. :.::.:::::.. .. ..::.:::::::::.::::: :::::. ::::::::::: CCDS34 -ISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 VADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE .::.:::::.::.:..:... ... : :: .:::..:::::::.: .:.:: CCDS34 ETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERT---GGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHE 1170 1180 1190 1200 1210 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE9 EEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKT ::. :::::: ::::.:.: . :..::::::..:: :::: ::.::::.:::.::.:: CCDS34 EELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKM 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE9 DPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRV ::.:.:: :::: . :::::.::::::::::.::: . : :: :..:. .: .:: :. CCDS34 DPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSK--RRKARA 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE9 KKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMS ::.. . .: .. :.:.:. ::. : CCDS34 KKNKAMKSIKVKE-----------------EIKSDS---SPLP----------------S 1340 1350 1360 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE9 SRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQ ..:.. :: ....: .:. : ::. :..::::::..:::::.: :...::: CCDS34 EKSDEDDDKLSESKSDGRERSK--------KSSVSDAPVHITASGEPVPISE-ESEELDQ 1370 1380 1390 1400 1410 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE9 ETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHI .::::::::::::: ::::::.:.:::. .:::::::.::.::::.:.:::: :.. :.: CCDS34 KTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQI 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE9 KLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVTGGKKPFRPEASGS : ::.:::::::::::::::::::::: : ::: .:.....: ... .: . CCDS34 KQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKR----QESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDV 1480 1490 1500 1510 1520 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KE9 SRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERKF : . .:.:. . . : :.: : .: :: ... . . .:.: . CCDS34 ER----LKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKD-------RHQGDSYKKSDSRKRPY 1530 1540 1550 1560 1570 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KE9 N-YGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPNNMSRKRPYDQYSS . ...:... : :.. ....:.:.. .:..: ::: ..: : . . CCDS34 SSFSNGKDHRDWD---HYKQDSRYYSDRE--KHRKLDDHRSRDHRSN-------LEGSLK 1580 1590 1600 1610 1620 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE9 DRDHRGHRDYYDRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQDFRRMSDHRPAMGYHGQGPSDHYRSF ::.: ::.. :.. : : .: :.:. :... : :.: ::.. :: : CCDS34 DRSHSDHRSHSDHRLH-SDHRSSSEYT----HHKSSR---DYR----YHSDWQMDHRAS- 1630 1640 1650 1660 1670 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE9 HTDKLGEYKQPLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNV : :::: .:.::. :.::..: :.:.:..:...:. CCDS34 ------------------SSGPRSPLDQRSPYGSRSPFEH------SVEHKSTPEHTWSS 1680 1690 1700 pF1KE9 RKT ::: CCDS34 RKT 1710 >>CCDS45356.1 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (501 aa) initn: 3351 init1: 3351 opt: 3351 Z-score: 1993.4 bits: 380.2 E(32554): 1e-104 Smith-Waterman score: 3351; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV ::::::::::::::::::::: CCDS45 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCK 490 500 >>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa) initn: 1255 init1: 633 opt: 1468 Z-score: 879.4 bits: 175.2 E(32554): 1.2e-42 Smith-Waterman score: 1599; 32.2% identity (60.9% similar) in 1049 aa overlap (342-1347:55-1057) 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 KGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELAS :::: ..... :.. . . . CCDS76 EDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAK-------APKSEK 30 40 50 60 70 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 ELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEY-LCKWMGLPYSECSWEDE :.. .:. .. .: . : ::.. :: .:. .. : : .: : . . : . CCDS76 EMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQ 80 90 100 110 120 130 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 ALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGENLELRDYQLE .::. : : :.... .. : . .. .:.:. : :::::.. CCDS76 SLISAG-----DYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGG--PLRDYQIR 140 150 160 170 180 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 GLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQR ::::: . .. . :::::::::::.:::..:.:: : ... :: ...:: ::: .:. CCDS76 GLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMN 190 200 210 220 230 240 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 EFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSIN ::. :.: . :. ..:: .: .. . : . .. ... .:.::...:.:.:. ... CCDS76 EFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGE-----WDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFH 250 260 270 280 290 300 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 WAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEF : .: .:::::.::. : : . . .:::..:::.:::::::.:.:::.::.:..:. :. CCDS76 WRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNS 310 320 330 340 350 360 680 690 700 710 720 pF1KE9 WEDFEE--DHGK--GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQK .::. : . : .. . :: ::.::::::.: ::::::: : : . . .: .:. CCDS76 ADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQR 370 380 390 400 410 420 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 QYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSL ..: :: .. .: .. . . .:::.:.:.::::: ::. : . . .: . CCDS76 EWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDE---HI 430 440 450 460 470 480 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 IRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIR . .:::...:::::..:.:.:.::::::::.:.:::: .: . : . ::::. : : CCDS76 VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEER 490 500 510 520 530 540 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 KQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQ ..:.. ::: .: : :.::::::::::::::::.:...::::::: ::::. ::::::: CCDS76 EEAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQ 550 560 570 580 590 600 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 KKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKE :: : ..::.: .::::.:.:::. :. :: .:::. :: : .. :: . :: CCDS76 KKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ----GRLIDQQ------SNKLAKE 610 620 630 640 650 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE9 ELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVST---SATDELLSQFKV :. ... :: .: ..::: . :: ::. .: . :.. . . : .:.. CCDS76 EMLQMIRHGATHVFA---SKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM 660 670 680 690 700 1030 1040 1050 pF1KE9 ANFATM-----EDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRK-------------KVEEEE------ .. :: .: .. .: : :...:: .: : . CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPR 710 720 730 740 750 760 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE9 --RQKELEEIYMLP-RIRSSTKKAQTNDSDS-DTESKRQAQRSSASESETEDSD--DDKK .: ..... ..: :. .: . . :. . . . .. :.. : . CCDS76 PPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAE 770 780 790 800 810 820 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE9 PKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIR---RFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADL : . . .: :..:::. : .:::: .:.: . .. :::..: :: .. CCDS76 PLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGR--DDIDNIAREVE--GKSPEEV 830 840 850 860 870 880 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE9 KRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFE . . .. . : . .:. :. . . .:.. .:: : ... . :. ... CCDS76 MEYSAVFWERC-NELQDIEKIMAQ-IERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQ 890 900 910 920 930 940 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE9 MLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPEL . .. ::. .. : : .. :: : .: .. : . . .: .::. . 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CCDS32 EEKPEKNSRIGEKMETEAD----------APSPAPSLGE--RLEPRK--IPLEDEVPGVP 1640 1650 1660 1670 1680 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE9 EEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKE : : . .. . :. . : :: :. :...: :.. ....:.: .::.: CCDS32 GEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEK-PLDG-QEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRE 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE9 RKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERM . . ...:.: ... :... . .:. : CCDS32 LRPG--PRDEPRS-NGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW 1750 1760 1770 1780 1790 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE9 RPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHIKLWRRNLWIF CCDS32 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 >>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966 aa) initn: 1495 init1: 688 opt: 1447 Z-score: 863.7 bits: 173.2 E(32554): 8.7e-42 Smith-Waterman score: 1978; 36.6% identity (64.9% similar) in 1056 aa overlap (263-1245:509-1526) 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 KEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDP ..:.: : :. .. . .:.:.: CCDS32 HIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQ----QADGNP 480 490 500 510 520 530 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 SGDFDTE-KDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQW . . ..: ....:: : :: : .: .: : .. : .:...:.: . CCDS32 DVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKE---LQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDE-- 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 pF1KE9 LGKVSPEDVEYFNCQQELASELNK----QY-QIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPA : ..: . ... :. : .: .. :. . . . :: CCDS32 -----PPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVD-- 590 600 610 620 630 640 410 420 430 440 450 460 pF1KE9 PSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSF--HSRNNSKTIPTRECKALKQR ... .:: :: :::.. .::.. . .... .:. : . :.. : :.. CCDS32 KKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKK 650 660 670 680 690 700 470 480 490 500 510 pF1KE9 PRF--------------VALKKQPAYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADE .. : . :: .. . . :. ::::::::: :: .....::::: CCDS32 KELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADE 710 720 730 740 750 760 520 530 540 550 560 570 pF1KE9 MGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMS :::::::::: :: :... . ::::. .::::. .:.:::..:::.. ::.: :: : CCDS32 MGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDS 770 780 790 800 810 820 580 590 600 610 pF1KE9 RNTIREYEW------IHSQTK--------RLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGV : ::: :. :.. : ..::..:.:.::.. :...:::: :: : : CCDS32 RAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVV 830 840 850 860 870 880 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 DEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEE ::::::::..: ....: .: .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.:. : : : CCDS32 DEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLE 890 900 910 920 930 940 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 DHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR . . ..:. ..:: .: : .:::.: :: :..:::.: :.:::.: .::.:::.:::: CCDS32 EFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTR 950 960 970 980 990 1000 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYL--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKL :..:: . :. ..:::.:.::::::: :: . : . .: .::.::::: CCDS32 NFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 800 810 820 830 840 850 pF1KE9 ILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHF .::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.: ..: . : ..:.::.: : .:..:.:.: CCDS32 MLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRF 1070 1080 1090 1100 1110 1120 860 870 880 890 900 910 pF1KE9 NADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIY :: :...:::::::::::::::::.::::.::::::::.::.:: .::::::: ..: :: CCDS32 NAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIY 1130 1140 1150 1160 1170 1180 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 RLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILK :.::...:::.: . ::.::.: :::. : : ...: ..:.:: ::: CCDS32 RFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV-------RPGLGSKAGS-----MSKQELDDILK 1190 1200 1210 1220 1230 980 990 1000 1010 1020 pF1KE9 FGAEDLFK-ELEGEESEPQ----EMDIDEILRLAETREN---EVSTSATDELLSQFKVAN ::.:.::: : :::..: . ..: . : :: . .. ..... .: ::.::::. CCDS32 FGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQ 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE9 FATMEDE--EELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTN ... :.. ::.:.. :. ... :. .: .... .:.. . : . . :... : CCDS32 YVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYN 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 DSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPK-RRGRPRSVR--KDL------------- :. .. ... :.. : .:: : :: :. .:. :: :..: :: CCDS32 DAAQEDQDN-QSEYSVGSEEEDEDFDE--RPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNI 1360 1370 1380 1390 1400 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 -VEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQ : ::. . . :..: ..:.: .:: .. : ::. : .. :: .. CCDS32 EVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMP-------PQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFM 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE9 EYEEQLKENASEGKGPG-KRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE-EEFEMLHK--SIPV---D .. . ..:: . : :.: . . ....: :..... .::: .. :.: : CCDS32 RHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPD 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE9 PEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPV : .: CCDS32 PSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGIRTPLEKEEAENQE 1530 1540 1550 1560 1570 1580 >>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa) initn: 1440 init1: 607 opt: 1435 Z-score: 860.0 bits: 171.6 E(32554): 1.4e-41 Smith-Waterman score: 1563; 33.7% identity (61.4% similar) in 1011 aa overlap (393-1351:96-1035) 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 FNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWM-GLP : ::.. :: .:: .. : : : : CCDS37 SPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRP 70 80 90 100 110 120 430 440 450 460 470 pF1KE9 YSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKT---IPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLG . .:: ... . : : :.... . :. :: . :: . .:.:. CCDS37 RIK---KDEK---QNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRF---EDSPSYV- 130 140 150 160 170 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 GENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLI . .:::::..::::: . .. . :::::::::::.::::.:.:. : ... :: .. CCDS37 -KWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMV 180 190 200 210 220 230 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 VVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEI .:: ::: .:. ::. :.: . : ::: .: . .... .... .:.::. CCDS37 LVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAA-----FVRDVLLPGEWDVCVTSYEM 240 250 260 270 280 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 LLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWS :.:.:.:. ..:: .: .:::::.::. : : . . .::...:::.:::::::.:.:::: CCDS37 LIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWS 290 300 310 320 330 340 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 LLHFIMPEKFEFWEDFEE----DHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVE ::.:..:. :. .::. .. : .. . :: ::.::::::.: ::::::: : : CCDS37 LLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKE 350 360 370 380 390 400 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 QILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEEN . : .: .:...: :: .. : .. . . .:::.:.:.::::: ::. : . CCDS37 VKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG 410 420 430 440 450 460 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 ERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPF . . . :. .:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .: ..: . CCDS37 PPYTTD---MHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEY 470 480 490 500 510 520 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 QRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQND ::::. . :..... .: .: : :.:::::::::::::.::.:...::::::: : CCDS37 CRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVD 530 540 550 560 570 580 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 LQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENN :::. ::::::: : : ..:..: .::::.:.:::. :. :: .:::. :: . .: CCDS37 LQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQ----GRLVDQN- 590 600 610 620 630 640 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 SGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEIL-RLAE-TRE-NEVST : ..:.:. ... :: .: ..::: . ::: :: : :. : : :: . CCDS37 -----LNKIGKDEMLQMIRHGATHVF---ASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLS 650 660 670 680 690 1020 1030 1040 1050 pF1KE9 SATDELLSQF------KVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRK------------ . . : .: .: :: :: .: .. .: : :...:: CCDS37 KMGESSLRNFTMDTESSVYNFEG-EDYREKQKIAFTEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREA 700 710 720 730 740 750 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 -KVEEEE--------RQKELEEIYMLP-RIRSSTKK---------AQTNDSDSDTESKRQ .: : . .: ..... ..: :. .: . . . . : CCDS37 LRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQ 760 770 780 790 800 810 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 AQRSSASESETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIR---RFIKAYKKFGLPLE ::. . . .: .:.. ... .: :..:::. . : .:::: .:.: . CCDS37 AQKEEQLKIDEAESLNDEELEEK------EKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGR--D 820 830 840 850 860 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 RLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIK .: :::..: :. .. . . .. . : . .:. :. . . .:.. .:: : CCDS37 DIENIAREVE--GKTPEEVIEYSAVFWERC-NELQDIEKIMAQ-IERGEARIQRRISIKK 870 880 890 900 910 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE9 ISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLL .... . :. .. . .. ::. .. : : .. :: : .: :. : CCDS37 ALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRF-LICMLHKLGFDKE-NVYDELR--- 920 930 940 950 960 970 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE9 GIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLL-RKGLEKKGA . :...:.... : .: .: . .:: : . :. :. :...: CCDS37 ----------QCIRNSPQFRF-DWFLKSRT-----AMELQRRCNTLITLIERENME---- 980 990 1000 1010 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE9 VTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKK . :.:. ::: :. . ... CCDS37 LEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKLKL 1020 1030 1040 1050 >>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905 aa) initn: 1632 init1: 699 opt: 1416 Z-score: 845.6 bits: 169.8 E(32554): 8.9e-41 Smith-Waterman score: 2012; 34.9% identity (63.0% similar) in 1220 aa overlap (292-1426:516-1688) 270 280 290 300 310 pF1KE9 TIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKD---EG--EIQYLIKWKGWSY :..: .: . :: : :...::.: :: CCDS76 CTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSY 490 500 510 520 530 540 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 IHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQ : .: :: .:. .. ..:...:.: . : . .. . ... .. : CCDS76 WHCSWVSELQLE---LHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEK----SRKRKNKDPKF 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 YQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKK .. :: . . . :: ... .:: :: :::.. :::.: . . 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