Result of FASTA (ccds) for pFN21AE9638
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE9638, 1828 aa
  1>>>pF1KE9638 1828 - 1828 aa - 1828 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3461+/-0.00114; mu= 8.5167+/- 0.069
 mean_var=287.8450+/-56.634, 0's: 0 Z-trim(111.4): 82  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.075595
 statistics sampled from 12264 (12333) to 12264 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.379), width:  16
 Scan time:  7.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828) 12296 1356.3       0
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710) 4987 559.2 4.8e-158
CCDS45356.1 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          ( 501) 3351 380.2  1e-104
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058) 1468 175.2 1.2e-42
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 1468 175.5 1.8e-42
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 1468 175.5 1.8e-42
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 1447 173.2 8.7e-42
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052) 1435 171.6 1.4e-41
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 1416 169.8 8.9e-41
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 1416 169.8 8.9e-41
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897) 1329 160.0 3.8e-38
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 1311 158.3 2.5e-37
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797) 1081 132.9 4.8e-30
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  775 99.4 4.8e-20
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997)  776 100.2 1.3e-19
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302)  751 97.3 6.9e-19
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581)  751 97.4 7.5e-19
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715)  729 95.0 4.1e-18
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054)  714 93.0 6.5e-18
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070)  714 93.0 6.6e-18
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616)  716 93.4 7.6e-18
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617)  716 93.4 7.6e-18
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613)  715 93.2 8.2e-18
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614)  715 93.2 8.2e-18
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  711 92.8 1.1e-17
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572)  711 92.8 1.1e-17
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  694 90.6 2.2e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  694 90.6 2.2e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  694 90.6 2.3e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  694 90.7 2.5e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  694 90.7 2.6e-17
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881)  705 92.4 2.6e-17
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897)  705 92.4 2.6e-17
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590)  687 90.2 6.7e-17
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  669 87.8 1.3e-16
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647)  664 87.7 3.9e-16
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  582 78.7 1.8e-13
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  571 77.5 4.3e-13
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12        (3123)  572 77.9 6.5e-13
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  543 74.8 5.9e-12


>>CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15               (1828 aa)
 initn: 12296 init1: 12296 opt: 12296  Z-score: 7258.6  bits: 1356.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12296; 100.0% identity (100.0% similar) in 1828 aa overlap (1-1828:1-1828)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE9 PLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE9 KDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE9 HFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE9 MSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE9 EILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE9 IKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQAR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE9 AHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE9 NPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVSTSATDELLSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVSTSATDELLSQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE9 FKVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FKVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE9 QTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFI
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE9 KAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGK
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE9 GPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE9 WGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHIKLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRS
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CCDS10 QEEEEQKKKDDVTGGKKPFRPEASGSSRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHP
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CCDS10 RDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERKFNYGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRH
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CCDS10 MDAHRSGSYRPNNMSRKRPYDQYSSDRDHRGHRDYYDRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FRRMSDHRPAMGYHGQGPSDHYRSFHTDKLGEYKQPLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSK
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       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SPLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNVRKT
             1810      1820        

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       .: :::  :.:.:   .::.:.     ..:. .. :   .:  ..:.  :.. .:.::  
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                ....:  :  . .:..::. .: . . . .:. .:.: :..  : . ...:
CCDS34 LKKQQQQQQQQQHQASSNSGSEEDSSSSEDSDDSSSEVKRKKHKDEDWQMSGSGSPSQSG
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       ...::: :..: .  .      :.  :   ::. ... :. .   :..:.: :::.::::
CCDS34 SDSESEEEREKSSCDETESDYEPKNKVKSRKPQNRSKSKNGKKILGQKKRQIDSSEEDDD
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pF1KE9 --DDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDE-QQDNSETIEKVLDSR
         : .  ::..::.:. :::::::....::::::.:. :: : . .... ::::. .: :
CCDS34 EEDYDNDKRSSRRQATVNVSYKEDEEMKTDSDDLLEVCGEDVPQPEEEEFETIERFMDCR
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pF1KE9 LGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQ
       .:.::::::.::.::.::.:::.. :. .:. :::::::::::::.::.:::.::.:.::
CCDS34 IGRKGATGATTTIYAVEADGDPNAGFEKNKEPGEIQYLIKWKGWSHIHNTWETEETLKQQ
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pF1KE9 KVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSK
       .:.:.:::.:.:::..: :.:: ..:::::::.::::::...:.::::::::.::     
CCDS34 NVRGMKKLDNYKKKDQETKRWLKNASPEDVEYYNCQQELTDDLHKQYQIVERIIA-----
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                 :: . . .. :.: :::.::::::::::: :::.:::: ::: . :::.:
CCDS34 ----------HSNQKSAAGYPDYYCKWQGLPYSECSWEDGALISKKFQACIDEYFSRNQS
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       :: : ..::.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:::::::::::.:: ::::
CCDS34 KTTPFKDCKVLKQRPRFVALKKQPSYIGGHEGLELRDYQLNGLNWLAHSWCKGNSCILAD
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       ::::::::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :: ..:.:::.::. 
CCDS34 EMGLGKTIQTISFLNYLFHEHQLYGPFLLVVPLSTLTSWQREIQTWASQMNAVVYLGDIN
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pF1KE9 SRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLL
       ::: :: .:: : :::::::: :.::::::::::. ::..::::.:::::::::::::::
CCDS34 SRNMIRTHEWTHHQTKRLKFNILLTTYEILLKDKAFLGGLNWAFIGVDEAHRLKNDDSLL
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pF1KE9 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGKGRENGYQSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  ::::::.:::::: :: ::
CCDS34 YKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFSSWEDFEEEHGKGREYGYASL
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       :: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::..::::
CCDS34 HKELEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRMEMSALQKQYYKWILTRNYKALSKGSKGSTS
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       :::::.::::::::::::::::..::  : :: :  ::::::::::::::: ::::::::
CCDS34 GFLNIMMELKKCCNHCYLIKPPDNNEFYNKQEALQHLIRSSGKLILLDKLLIRLRERGNR
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       ::::::::::::::::::  ...::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::
CCDS34 VLIFSQMVRMLDILAEYLKYRQFPFQRLDGSIKGELRKQALDHFNAEGSEDFCFLLSTRA
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pF1KE9 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.:::
CCDS34 GGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGSVEEDILERA
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pF1KE9 KKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESE
       ::::::::::::::::::.:.:...:. :.:.:::::::.::::::::.:::: ::::.:
CCDS34 KKKMVLDHLVIQRMDTTGKTVLHTGSAPSSSTPFNKEELSAILKFGAEELFKEPEGEEQE
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pF1KE9 PQEMDIDEILRLAETRENEVST-SATDELLSQFKVANFATM-EDEEELE-ERPHKDWDEI
       ::::::::::. :::.::: .  .. ::::::::::::..: ::. ::: ::  :.:.::
CCDS34 PQEMDIDEILKRAETHENEPGPLTVGDELLSQFKVANFSNMDEDDIELEPERNSKNWEEI
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pF1KE9 IPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDSDTESKRQAQRSSASESETE
       :::.::...:::::::::::::::::.:. .:. . : :..    . ...: :.:.:.. 
CCDS34 IPEDQRRRLEEEERQKELEEIYMLPRMRNCAKQISFNGSEG---RRSRSRRYSGSDSDS-
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pF1KE9 DSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKS
         .. :.::.:::::.. .. ..::.:::::::::.::::: :::::. :::::::::::
CCDS34 -ISEGKRPKKRGRPRTIPRENIKGFSDAEIRRFIKSYKKFGGPLERLDAIARDAELVDKS
            1110      1120      1130      1140      1150      1160 

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pF1KE9 VADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE
        .::.:::::.::.:..:...     ...   :   :: .:::..:::::::.: .:.::
CCDS34 ETDLRRLGELVHNGCIKALKDSSSGTERT---GGRLGKVKGPTFRISGVQVNAKLVISHE
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pF1KE9 EEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKT
       ::.  :::::: ::::.:.: . :..::::::..:: :::: ::.::::.:::.::.:: 
CCDS34 EELIPLHKSIPSDPEERKQYTIPCHTKAAHFDIDWGKEDDSNLLIGIYEYGYGSWEMIKM
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CCDS34 DPDLSLTHKILPDDPDKKPQAKQLQTRADYLIKLLSRDLAKKEALSGAGSSK--RRKARA
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       ::.. .  .: ..                 :.:.:.   ::.                 :
CCDS34 KKNKAMKSIKVKE-----------------EIKSDS---SPLP----------------S
       1340                       1350                         1360

       1410      1420      1430      1440      1450      1460      
pF1KE9 SRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQ
        ..:.. ::  ....: .:. :        ::. :..::::::..:::::.: :...:::
CCDS34 EKSDEDDDKLSESKSDGRERSK--------KSSVSDAPVHITASGEPVPISE-ESEELDQ
             1370      1380              1390      1400       1410 

       1470      1480      1490      1500      1510      1520      
pF1KE9 ETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHI
       .::::::::::::: ::::::.:.:::. .:::::::.::.::::.:.:::: :.. :.:
CCDS34 KTFSICKERMRPVKAALKQLDRPEKGLSEREQLEHTRQCLIKIGDHITECLKEYTNPEQI
            1420      1430      1440      1450      1460      1470 

       1530      1540      1550      1560      1570      1580      
pF1KE9 KLWRRNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKMAHKKRSQEEEEQKKKDDVTGGKKPFRPEASGS
       : ::.:::::::::::::::::::::: : :::    .:.....: ... .:   .    
CCDS34 KQWRKNLWIFVSKFTEFDARKLHKLYKHAIKKR----QESQQNSDQNSNLNPHVIRNPDV
            1480      1490      1500          1510      1520       

       1590      1600      1610      1620      1630      1640      
pF1KE9 SRDSLISQSHTSHNLHPQKPHLPASHGPQMHGHPRDNYNHPNKRHFSNADRGDWQRERKF
        :     . .:.:.   .  .    :  :.: : .:       :: ... . . .:.: .
CCDS34 ER----LKENTNHDDSSRDSYSSDRHLTQYHDHHKD-------RHQGDSYKKSDSRKRPY
          1530      1540      1550             1560      1570      

        1650      1660      1670      1680      1690      1700     
pF1KE9 N-YGGGNNNPPWGSDRHHQYEQHWYKDHHYGDRRHMDAHRSGSYRPNNMSRKRPYDQYSS
       . ...:...  :    :.. ....:.:..   .:..: ::: ..: :        .   .
CCDS34 SSFSNGKDHRDWD---HYKQDSRYYSDRE--KHRKLDDHRSRDHRSN-------LEGSLK
       1580         1590      1600        1610             1620    

        1710      1720      1730      1740      1750      1760     
pF1KE9 DRDHRGHRDYYDRHHHDSKRRRSDEFRPQNYHQQDFRRMSDHRPAMGYHGQGPSDHYRSF
       ::.:  ::.. :.. : : .: :.:.     :... :   :.:    ::..   ::  : 
CCDS34 DRSHSDHRSHSDHRLH-SDHRSSSEYT----HHKSSR---DYR----YHSDWQMDHRAS-
         1630      1640       1650                 1660      1670  

        1770      1780      1790      1800      1810      1820     
pF1KE9 HTDKLGEYKQPLPPLHPAVSDPRSPPSQKSPHDSKSPLDHRSPLERSLEQKNNPDYNWNV
                          : :::: .:.::. :.::..:      :.:.:..:...:. 
CCDS34 ------------------SSGPRSPLDQRSPYGSRSPFEH------SVEHKSTPEHTWSS
                              1680      1690            1700       

          
pF1KE9 RKT
       :::
CCDS34 RKT
      1710

>>CCDS45356.1 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15               (501 aa)
 initn: 3351 init1: 3351 opt: 3351  Z-score: 1993.4  bits: 380.2 E(32554): 1e-104
Smith-Waterman score: 3351; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE9 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MMRNKDKSQEEDSSLHSNASSHSASEEASGSDSGSQSESEQGSDPGSGHGSESNSSSESS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE9 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESQSESESESAGSKSQPVLPEAKEKPASKKERIADVKKMWEEYPDVYGVRRSNRSRQEPS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE9 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RFNIKEEASSGSESGSPKRRGQRQLKKQEKWKQEPSEDEQEQGTSAESEPEQKKVKARRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE9 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VPRRTVPKPRVKKQPKTQRGKRKKQDSSDEDDDDDEAPKRQTRRRAAKNVSYKEDDDFET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE9 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE9 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE9 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EYFNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE9 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE9 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVV
       :::::::::::::::::::::                                       
CCDS45 NLELRDYQLEGLNWLAHSWCK                                       
              490       500                                        

>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX             (1058 aa)
 initn: 1255 init1: 633 opt: 1468  Z-score: 879.4  bits: 175.2 E(32554): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 1599; 32.2% identity (60.9% similar) in 1049 aa overlap (342-1347:55-1057)

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE9 KGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELAS
                                     :::: .....  :.. .         .  .
CCDS76 EDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAK-------APKSEK
           30        40        50        60        70              

             380       390       400       410        420       430
pF1KE9 ELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEY-LCKWMGLPYSECSWEDE
       :.. .:.   ..  .:  .  : ::.. ::  .:. .. :   :   .: :  . . : .
CCDS76 EMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQ
        80        90       100       110       120       130       

              440       450       460       470       480       490
pF1KE9 ALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKTIPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLGGENLELRDYQLE
       .::.       :  : :....       .. :     . .. .:.:. :    :::::..
CCDS76 SLISAG-----DYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGG--PLRDYQIR
        140            150       160       170       180           

              500       510       520       530       540       550
pF1KE9 GLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQR
       :::::   . .. . :::::::::::.:::..:.:: : ... :: ...:: ::: .:. 
CCDS76 GLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMN
     190       200       210       220       230       240         

              560       570       580       590       600       610
pF1KE9 EFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEILLKDKTVLGSIN
       ::. :.: . :. ..::  .: .. . : . ..     ... .:.::...:.:.:. ...
CCDS76 EFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGE-----WDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFH
     250       260       270       280            290       300    

              620       630       640       650       660       670
pF1KE9 WAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEF
       : .: .:::::.::. : : . . .:::..:::.:::::::.:.:::.::.:..:. :. 
CCDS76 WRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNS
          310       320       330       340       350       360    

                680         690       700       710       720      
pF1KE9 WEDFEE--DHGK--GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQK
        .::.   :  .  : ..  . :: ::.::::::.: ::::::: : :  . . .: .:.
CCDS76 ADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQR
          370       380       390       400       410       420    

        730       740       750       760       770       780      
pF1KE9 QYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEENERENGQEILLSL
       ..:  :: ..  .: .. . .   .:::.:.:.::::: ::.   : .   . .:    .
CCDS76 EWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDE---HI
          430       440       450       460       470          480 

        790       800       810       820       830       840      
pF1KE9 IRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIR
       . .:::...:::::..:.:.:.::::::::.:.:::: .:   . : . ::::.   : :
CCDS76 VSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEER
             490       500       510       520       530       540 

        850       860       870       880       890       900      
pF1KE9 KQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQ
       ..:.. ::: .:  : :.::::::::::::::::.:...::::::: ::::. :::::::
CCDS76 EEAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQ
             550       560       570       580       590       600 

        910       920       930       940       950       960      
pF1KE9 KKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKE
       :: : ..::.: .::::.:.:::. :. :: .:::.    :: : ..      :: . ::
CCDS76 KKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ----GRLIDQQ------SNKLAKE
             610       620       630           640             650 

        970       980       990      1000      1010         1020   
pF1KE9 ELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEILRLAETRENEVST---SATDELLSQFKV
       :.  ... ::  .:    ..:::  . ::  ::. .: .  :..    .  .  : .:..
CCDS76 EMLQMIRHGATHVFA---SKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
             660          670       680       690       700        

               1030      1040      1050                            
pF1KE9 ANFATM-----EDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRK-------------KVEEEE------
           ..     :: .: ..    .: :  :...::             .: : .      
CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPR
      710       720       730        740       750       760       

      1060      1070       1080       1090      1100        1110   
pF1KE9 --RQKELEEIYMLP-RIRSSTKKAQTNDSDS-DTESKRQAQRSSASESETEDSD--DDKK
         .: ..... ..: :.    .:       .   .  :. .  . . .. :..   :  .
CCDS76 PPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAE
       770       780       790       800       810       820       

          1120      1130         1140      1150      1160      1170
pF1KE9 PKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIR---RFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADL
       :    . .  .: :..:::.   :   .:::: .:.:   . .. :::..:   ::  ..
CCDS76 PLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGR--DDIDNIAREVE--GKSPEEV
       830       840       850       860         870         880   

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KE9 KRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHEEEFE
        . . .. . : . .:. :. . .   .:..  .::    :   ...   .   :. ...
CCDS76 MEYSAVFWERC-NELQDIEKIMAQ-IERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQ
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pF1KE9 MLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPEL
       .  ..     ::. .. : : ..   :: : .: .. :  .    .   .: .::.   .
CCDS76 YGTSKGKNYTEEEDRF-LICMLHKMGFDRE-NVYEELRQCVRNAPQFRFDW-FIKSRTAM
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pF1KE9 KLTDK--ILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKK
       ..  .   :    .:. .  . . ::.   .  .  . .:  . .. :.. ::   .:: 
CCDS76 EFQRRCNTLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
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pF1KE9 ENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSSR

>>CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2000 aa)
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            240       250       260       270       280       290  
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                                     ..:.:  : :.  ..  .      .:.:.:
CCDS32 HIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQ----QADGNP
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pF1KE9 SGDFDTE-KDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQW
       .       . ..: ....:: : :: : .: .: .:.   .  :   .:...:.:  .  
CCDS32 DVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLE---IFHLVMYRNYQRKNDMDE--
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pF1KE9 LGKVSPEDVEYFNCQQELASELNK----QY-QIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPA
            :  ..: . ...  :.  :    .: .. :.      .   .    .  ::    
CCDS32 -----PPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDK-
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pF1KE9 PSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSF--HSRNNSKTIPTRECKALKQR
        ... .:: ::  :::.. .::.. .   ....  .:.  : .      :..  :  :..
CCDS32 -KGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKK
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pF1KE9 PRF--------------VALKKQPAYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADE
        ..              :  . :: .. . .  :. :::::::::  :: .....:::::
CCDS32 KELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADE
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pF1KE9 MGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMS
       :::::::::: ::  :... .  ::::. .::::. .:.:::..:::.. ::.: ::  :
CCDS32 MGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDS
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pF1KE9 RNTIREYEWIHS-----------QTKR---LKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGV
       :  ::: :.              . ::   .::..:.:.::..  :...:::: :: : :
CCDS32 RAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVV
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pF1KE9 DEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEE
       ::::::::..: ....:  .: .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.:.  : : :
CCDS32 DEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLE
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pF1KE9 DHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR
       . .  ..:.  ..:: .: : .:::.: :: :..:::.: :.:::.: .::.:::.::::
CCDS32 EFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTR
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pF1KE9 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYL--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKL
       :..:: .   :.  ..:::.:.::::::: ::  .   :  .  .:     .::.:::::
CCDS32 NFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKL
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pF1KE9 ILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHF
       .::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.: ..:  . : ..:.::.: : .:..:.:.:
CCDS32 MLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRF
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pF1KE9 NADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIY
       :: :...:::::::::::::::::.::::.::::::::.::.:: .::::::: ..: ::
CCDS32 NAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIY
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       :.::...:::.: . ::.::.: :::.       :  : ...:      ..:.::  :::
CCDS32 RFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV-------RPGLGSKAGS-----MSKQELDDILK
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pF1KE9 FGAEDLFK-ELEGEESEPQ----EMDIDEILRLAETREN---EVSTSATDELLSQFKVAN
       ::.:.::: : :::..: .    ..: . : :: .  ..   .....  .: ::.::::.
CCDS32 FGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQ
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pF1KE9 FATMEDE--EELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTN
       ... :..  ::.:..  :. ... :.  .: .... .:.. .    : . .   :... :
CCDS32 YVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYN
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pF1KE9 DSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPK-RRGRPRSVR--KDL-------------
       :. .. ... :.. : .:: : :: :.  .:. ::   :..:  ::              
CCDS32 DAAQEDQDN-QSEYSVGSEEEDEDFDE--RPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNI
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pF1KE9 -VEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQ
        : ::.  . . :..:  ..:.:        .::  ..  : ::.   :   .. :: ..
CCDS32 EVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMP-------PQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFM
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pF1KE9 EYEEQLKENASEGKGPG-KRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE-EEFEMLHK--SIPV---D
       ..  .   ..::  . :  :.: . .   ....: :..... .::: ..   :.:    :
CCDS32 RHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPD
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pF1KE9 P--EEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKIL
       :  . :..   .  .:..    : .. ..             . : :.: :  :   .  
CCDS32 PSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGIRT-PLEKEEAENQ
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pF1KE9 PVETDKKPQ-GKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLK
         . .:. . :....:.::            . : . ::  .:. ::  .  :..:: . 
CCDS32 EEKPEKNSRIGEKMETEAD----------APSPAPSLGE--RLEPRK--IPLEDEVPGVP
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pF1KE9 EEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKE
        :   : .     .. . :.   . : :: :.   :...:  :..  ....:.: .::.:
CCDS32 GEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEK-PLDG-QEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRE
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pF1KE9 RKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERM
        . .   ...:.: ...   :... .   .:. :                          
CCDS32 LRPG--PRDEPRS-NGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
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pF1KE9 RPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHIKLWRRNLWIF
                                                                   
CCDS32 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

>>CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2059 aa)
 initn: 1589 init1: 688 opt: 1468  Z-score: 875.8  bits: 175.5 E(32554): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 2024; 33.9% identity (62.4% similar) in 1264 aa overlap (263-1450:568-1773)

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE9 KEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDP
                                     ..:.:  : :.  ..  .      .:.:.:
CCDS32 HIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQ----QADGNP
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pF1KE9 SGDFDTE-KDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQW
       .       . ..: ....:: : :: : .: .: .:.   .  :   .:...:.:  .  
CCDS32 DVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKELQLE---IFHLVMYRNYQRKNDMDE--
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pF1KE9 LGKVSPEDVEYFNCQQELASELNK----QY-QIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPA
            :  ..: . ...  :.  :    .: .. :.      .   .    .  ::    
CCDS32 -----PPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDK-
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pF1KE9 PSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSF--HSRNNSKTIPTRECKALKQR
        ... .:: ::  :::.. .::.. .   ....  .:.  : .      :..  :  :..
CCDS32 -KGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKK
             710       720       730       740       750       760 

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pF1KE9 PRF--------------VALKKQPAYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADE
        ..              :  . :: .. . .  :. :::::::::  :: .....:::::
CCDS32 KELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADE
             770       780       790       800       810       820 

              520       530       540       550       560       570
pF1KE9 MGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMS
       :::::::::: ::  :... .  ::::. .::::. .:.:::..:::.. ::.: ::  :
CCDS32 MGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDS
             830       840       850       860       870       880 

              580                     590       600       610      
pF1KE9 RNTIREYEWIHS-----------QTKR---LKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGV
       :  ::: :.              . ::   .::..:.:.::..  :...:::: :: : :
CCDS32 RAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVV
             890       900       910       920       930       940 

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE9 DEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEE
       ::::::::..: ....:  .: .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.:.  : : :
CCDS32 DEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLE
             950       960       970       980       990      1000 

        680        690       700       710       720       730     
pF1KE9 DHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR
       . .  ..:.  ..:: .: : .:::.: :: :..:::.: :.:::.: .::.:::.::::
CCDS32 EFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTR
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

         740       750       760         770       780       790   
pF1KE9 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYL--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKL
       :..:: .   :.  ..:::.:.::::::: ::  .   :  .  .:     .::.:::::
CCDS32 NFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKL
            1070      1080      1090      1100      1110      1120 

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pF1KE9 ILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHF
       .::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.: ..:  . : ..:.::.: : .:..:.:.:
CCDS32 MLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRF
            1130      1140      1150      1160      1170      1180 

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pF1KE9 NADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIY
       :: :...:::::::::::::::::.::::.::::::::.::.:: .::::::: ..: ::
CCDS32 NAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIY
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

           920       930       940       950       960       970   
pF1KE9 RLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILK
       :.::...:::.: . ::.::.: :::.       :  : ...:      ..:.::  :::
CCDS32 RFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV-------RPGLGSKAGS-----MSKQELDDILK
            1250      1260             1270           1280         

           980        990          1000         1010      1020     
pF1KE9 FGAEDLFK-ELEGEESEPQ----EMDIDEILRLAETREN---EVSTSATDELLSQFKVAN
       ::.:.::: : :::..: .    ..: . : :: .  ..   .....  .: ::.::::.
CCDS32 FGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQ
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

        1030        1040      1050      1060      1070      1080   
pF1KE9 FATMEDE--EELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTN
       ... :..  ::.:..  :. ... :.  .: .... .:.. .    : . .   :... :
CCDS32 YVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYN
    1350      1360      1370      1380      1390      1400         

          1090      1100      1110       1120                      
pF1KE9 DSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPK-RRGRPRSVR--KDL-------------
       :. .. ... :.. : .:: : :: :.  .:. ::   :..:  ::              
CCDS32 DAAQEDQDN-QSEYSVGSEEEDEDFDE--RPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNI
    1410       1420      1430        1440      1450      1460      

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pF1KE9 -VEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQ
        : ::.  . . :..:  ..:.:        .::  ..  : ::.   :   .. :: ..
CCDS32 EVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMP-------PQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFM
       1470      1480             1490      1500      1510         

       1190      1200       1210      1220       1230              
pF1KE9 EYEEQLKENASEGKGPG-KRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE-EEFEMLHK--SIPV---D
       ..  .   ..::  . :  :.: . .   ....: :..... .::: ..   :.:    :
CCDS32 RHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPD
    1520      1530      1540      1550      1560      1570         

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pF1KE9 P--EEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKIL
       :  . :..   .  .:..    : .. ..             . : :.: :  :   .  
CCDS32 PSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGIRT-PLEKEEAENQ
    1580      1590      1600      1610      1620       1630        

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pF1KE9 PVETDKKPQ-GKQLQTRADYLLKLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLK
         . .:. . :....:.::            . : . ::  .:. ::  .  :..:: . 
CCDS32 EEKPEKNSRIGEKMETEAD----------APSPAPSLGE--RLEPRK--IPLEDEVPGVP
     1640      1650                1660        1670        1680    

       1360      1370      1380      1390      1400      1410      
pF1KE9 EEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKE
        :   : .     .. . :.   . : :: :.   :...:  :..  ....:.: .::.:
CCDS32 GEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEK-PLDG-QEHRERPEGETGDLGKREDVKGDRE
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       1420      1430      1440      1450      1460      1470      
pF1KE9 RKKSKDKKEKPKSGDAKSSSKSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERM
        . .   ...:.: ...   :... .   .:. :                          
CCDS32 LRPG--PRDEPRS-NGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIW
             1750       1760      1770      1780      1790         

       1480      1490      1500      1510      1520      1530      
pF1KE9 RPVKKALKQLDKPDKGLNVQEQLEHTRNCLLKIGDRIAECLKAYSDQEHIKLWRRNLWIF
                                                                   
CCDS32 HRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLL
    1800      1810      1820      1830      1840      1850         

>>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (1966 aa)
 initn: 1495 init1: 688 opt: 1447  Z-score: 863.7  bits: 173.2 E(32554): 8.7e-42
Smith-Waterman score: 1978; 36.6% identity (64.9% similar) in 1056 aa overlap (263-1245:509-1526)

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE9 KEDDDFETDSDDLIEMTGEGVDEQQDNSETIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDP
                                     ..:.:  : :.  ..  .      .:.:.:
CCDS32 HIHCLNPPLPDIPNGEWLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPPVAVPAPQ----QADGNP
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pF1KE9 SGDFDTE-KDEGEIQYLIKWKGWSYIHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQW
       .       . ..: ....:: : :: : .: .:    : ..  :   .:...:.:  .  
CCDS32 DVPPPRPLQGRSEREFFVKWVGLSYWHCSWAKE---LQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDE--
          540       550       560          570       580           

             360       370            380       390       400      
pF1KE9 LGKVSPEDVEYFNCQQELASELNK----QY-QIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPA
            :  ..: . ...  :.  :    .: .. :.      .   .    .  ::    
CCDS32 -----PPPLDYGSGEDDGKSDKRKVKDPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVD--
          590       600       610       620       630       640    

        410       420       430       440         450       460    
pF1KE9 PSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKKFQNCIDSF--HSRNNSKTIPTRECKALKQR
        ... .:: ::  :::.. .::.. .   ....  .:.  : .      :..  :  :..
CCDS32 KKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNIPEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKK
            650       660       670       680       690       700  

                        470       480       490       500       510
pF1KE9 PRF--------------VALKKQPAYLGGENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADE
        ..              :  . :: .. . .  :. :::::::::  :: .....:::::
CCDS32 KELQGDGPPSSPTNDPTVKYETQPRFITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADE
            710       720       730       740       750       760  

              520       530       540       550       560       570
pF1KE9 MGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMS
       :::::::::: ::  :... .  ::::. .::::. .:.:::..:::.. ::.: ::  :
CCDS32 MGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDS
            770       780       790       800       810       820  

                    580               590       600       610      
pF1KE9 RNTIREYEW------IHSQTK--------RLKFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGV
       :  ::: :.      :..  :        ..::..:.:.::..  :...:::: :: : :
CCDS32 RAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKMKREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVV
            830       840       850       860       870       880  

        620       630       640       650       660       670      
pF1KE9 DEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEE
       ::::::::..: ....:  .: .:.::.:::::::.:.::. ::.:. ::.:.  : : :
CCDS32 DEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLE
            890       900       910       920       930       940  

        680        690       700       710       720       730     
pF1KE9 DHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTR
       . .  ..:.  ..:: .: : .:::.: :: :..:::.: :.:::.: .::.:::.::::
CCDS32 EFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTR
            950       960       970       980       990      1000  

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pF1KE9 NYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYL--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKL
       :..:: .   :.  ..:::.:.::::::: ::  .   :  .  .:     .::.:::::
CCDS32 NFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKL
           1010      1020      1030      1040      1050      1060  

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pF1KE9 ILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHF
       .::.:.: .:.:.:.::::::::..:::.: ..:  . : ..:.::.: : .:..:.:.:
CCDS32 MLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRF
           1070      1080      1090      1100      1110      1120  

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pF1KE9 NADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIY
       :: :...:::::::::::::::::.::::.::::::::.::.:: .::::::: ..: ::
CCDS32 NAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIY
           1130      1140      1150      1160      1170      1180  

           920       930       940       950       960       970   
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       :.::...:::.: . ::.::.: :::.       :  : ...:      ..:.::  :::
CCDS32 RFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVV-------RPGLGSKAGS-----MSKQELDDILK
           1190      1200             1210           1220      1230

           980        990          1000         1010      1020     
pF1KE9 FGAEDLFK-ELEGEESEPQ----EMDIDEILRLAETREN---EVSTSATDELLSQFKVAN
       ::.:.::: : :::..: .    ..: . : :: .  ..   .....  .: ::.::::.
CCDS32 FGTEELFKDENEGENKEEDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVAQ
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

        1030        1040      1050      1060      1070      1080   
pF1KE9 FATMEDE--EELEERPHKDWDEIIPEEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTN
       ... :..  ::.:..  :. ... :.  .: .... .:.. .    : . .   :... :
CCDS32 YVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNYN
             1300      1310      1320      1330      1340      1350

          1090      1100      1110       1120                      
pF1KE9 DSDSDTESKRQAQRSSASESETEDSDDDKKPK-RRGRPRSVR--KDL-------------
       :. .. ... :.. : .:: : :: :.  .:. ::   :..:  ::              
CCDS32 DAAQEDQDN-QSEYSVGSEEEDEDFDE--RPEGRRQSKRQLRNEKDKPLPPLLARVGGNI
              1360      1370        1380      1390      1400       

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KE9 -VEGFTDAEIRRFIKAYKKFGLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQ
        : ::.  . . :..:  ..:.:        .::  ..  : ::.   :   .. :: ..
CCDS32 EVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMP-------PQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLFM
      1410      1420      1430             1440      1450      1460

       1190      1200       1210      1220       1230              
pF1KE9 EYEEQLKENASEGKGPG-KRRGPTIKISGVQVNVKSIIQHE-EEFEMLHK--SIPV---D
       ..  .   ..::  . :  :.: . .   ....: :..... .::: ..   :.:    :
CCDS32 RHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMPD
             1470      1480      1490      1500      1510      1520

    1240      1250      1260      1270      1280      1290         
pF1KE9 PEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPV
       :   .:                                                      
CCDS32 PSADSKRSSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGIRTPLEKEEAENQE
             1530      1540      1550      1560      1570      1580

>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4              (1052 aa)
 initn: 1440 init1: 607 opt: 1435  Z-score: 860.0  bits: 171.6 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1563; 33.7% identity (61.4% similar) in 1011 aa overlap (393-1351:96-1035)

            370       380       390       400       410        420 
pF1KE9 FNCQQELASELNKQYQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWM-GLP
                                     : ::.. ::  .:: .. :    :   : :
CCDS37 SPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRP
          70        80        90       100       110       120     

             430       440       450          460       470        
pF1KE9 YSECSWEDEALIGKKFQNCIDSFHSRNNSKT---IPTRECKALKQRPRFVALKKQPAYLG
         .   .::    ... .  :  : :....    . :.  :: .   ::   . .:.:. 
CCDS37 RIK---KDEK---QNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRF---EDSPSYV-
            130          140       150       160          170      

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE9 GENLELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLI
        .  .:::::..:::::   . .. . :::::::::::.::::.:.:. : ... :: ..
CCDS37 -KWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMV
          180       190       200       210       220       230    

      540       550       560       570       580       590        
pF1KE9 VVPLSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIHSQTKRLKFNALITTYEI
       .:: ::: .:. ::. :.: .  :  :::  .: .     ....     .... .:.::.
CCDS37 LVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAA-----FVRDVLLPGEWDVCVTSYEM
          240       250       260            270       280         

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE9 LLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGTPLQNSLKELWS
       :.:.:.:. ..:: .: .:::::.::. : : . . .::...:::.:::::::.:.::::
CCDS37 LIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWS
     290       300       310       320       330       340         

      660       670           680       690       700       710    
pF1KE9 LLHFIMPEKFEFWEDFEE----DHGKGRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVEKSLPAKVE
       ::.:..:. :.  .::.     ..  : ..  . :: ::.::::::.: ::::::: : :
CCDS37 LLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKE
     350       360       370       380       390       400         

          720       730       740       750       760       770    
pF1KE9 QILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCYLIKPPEEN
         . : .: .:...:  :: ..   : .. . .   .:::.:.:.::::: ::.   : .
CCDS37 VKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG
     410       420       430       440       450       460         

          780       790       800       810       820       830    
pF1KE9 ERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILAEYLTIKHYPF
          . .   . :. .:::...::::: .:.:.:.::::::::.:.:::: .:   ..: .
CCDS37 PPYTTD---MHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEY
     470          480       490       500       510       520      

          840       850       860       870       880       890    
pF1KE9 QRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVIFDSDWNPQND
        ::::.   . :..... .:  .:  : :.:::::::::::::.::.:...::::::: :
CCDS37 CRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVD
        530       540       550       560       570       580      

          900       910       920       930       940       950    
pF1KE9 LQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMDTTGRTILENN
       :::. ::::::: : : ..:..: .::::.:.:::. :. :: .:::.    :: . .: 
CCDS37 LQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQ----GRLVDQN-
        590       600       610       620       630           640  

          960       970       980       990       1000        1010 
pF1KE9 SGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKELEGEESEPQEMDIDEIL-RLAE-TRE-NEVST
             : ..:.:.  ... ::  .:    ..:::  . ::: :: : :. : : ::  .
CCDS37 -----LNKIGKDEMLQMIRHGATHVF---ASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLS
                  650       660          670       680       690   

            1020            1030      1040      1050               
pF1KE9 SATDELLSQF------KVANFATMEDEEELEERPHKDWDEIIPEEQRK------------
       .  .  : .:      .: ::   :: .: ..    .: :  :...::            
CCDS37 KMGESSLRNFTMDTESSVYNFEG-EDYREKQKIAFTEWIEP-PKRERKANYAVDAYFREA
           700       710        720       730        740       750 

                   1060      1070                1080      1090    
pF1KE9 -KVEEEE--------RQKELEEIYMLP-RIRSSTKK---------AQTNDSDSDTESKRQ
        .: : .        .: ..... ..: :.    .:         .     . .  .  :
CCDS37 LRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQ
             760       770       780       790       800       810 

         1100      1110      1120      1130         1140      1150 
pF1KE9 AQRSSASESETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDLVEGFTDAEIR---RFIKAYKKFGLPLE
       ::.    . .  .: .:.. ...      .: :..:::. . :   .:::: .:.:   .
CCDS37 AQKEEQLKIDEAESLNDEELEEK------EKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGR--D
             820       830             840       850       860     

            1160      1170      1180      1190      1200      1210 
pF1KE9 RLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPGKRRGPTIK
        .: :::..:   :.  .. . . .. . : . .:. :. . .   .:..  .::    :
CCDS37 DIENIAREVE--GKTPEEVIEYSAVFWERC-NELQDIEKIMAQ-IERGEARIQRRISIKK
           870         880       890        900        910         

            1220      1230      1240      1250      1260      1270 
pF1KE9 ISGVQVNVKSIIQHEEEFEMLHKSIPVDPEEKKKYCLTCRVKAAHFDVEWGVEDDSRLLL
          ....  .   :. .. .  ..     ::. .. : : ..   :: : .: :. :   
CCDS37 ALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRF-LICMLHKLGFDKE-NVYDELR---
     920       930       940       950        960        970       

            1280      1290      1300      1310      1320       1330
pF1KE9 GIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLLKLL-RKGLEKKGA
                 . :...:.... : .:  .:     . .:: : . :. :. :...:    
CCDS37 ----------QCIRNSPQFRF-DWFLKSRT-----AMELQRRCNTLITLIERENME----
                    980        990           1000      1010        

             1340      1350      1360      1370      1380      1390
pF1KE9 VTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEVKDDGLEKSPMKK
       .   :.:. ::: :. . ...                                       
CCDS37 LEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKLKL                      
         1020      1030      1040      1050                        

>>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12               (1905 aa)
 initn: 1632 init1: 699 opt: 1416  Z-score: 845.6  bits: 169.8 E(32554): 8.9e-41
Smith-Waterman score: 2012; 34.9% identity (63.0% similar) in 1220 aa overlap (292-1426:516-1688)

             270       280       290       300            310      
pF1KE9 TIEKVLDSRLGKKGATGASTTVYAIEANGDPSGDFDTEKD---EG--EIQYLIKWKGWSY
                                     :..: .: .    ::  : :...::.: ::
CCDS76 CTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSY
         490       500       510       520       530       540     

        320       330       340       350       360       370      
pF1KE9 IHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQ
        : .: :: .:.   ..    ..:...:.:  .   :  . .. .    ...  ..  : 
CCDS76 WHCSWVSELQLE---LHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEK----SRKRKNKDPKF
         550          560       570       580           590        

        380       390       400       410       420       430      
pF1KE9 YQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKK
        .. ::      .   .    .  ::     ... .:: ::  :::.. :::.: .  . 
CCDS76 AEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDK--KGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQD
      600       610       620         630       640       650      

        440        450       460                     470       480 
pF1KE9 FQNCIDSF-HSRNNSKTIPTRECKALKQ-------RPR-------FVALKKQPAYLGGEN
       ..   .:. . :.  .    :  : ::.       ::         :  ..:: :: . .
CCDS76 YDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATG
        660       670       680       690       700       710      

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE9 LELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVP
         :. ::.::::::  :: .....:::::::::::.::  ::  :... .  ::::. .:
CCDS76 GTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAP
        720       730       740       750       760       770      

             550       560       570       580                     
pF1KE9 LSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIH-----------SQTKR---L
       :::. .:.::::.:::.. ::.:.::  ::  ::: :.             :. :.   .
CCDS76 LSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASV
        780       790       800       810       820       830      

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE9 KFNALITTYEILLKDKTVLGSINWAFLGVDEAHRLKNDDSLLYKTLIDFKSNHRLLITGT
       ::..:.:.::..  : ..::::.:: : :::::::::..: ....:  .. .:.::.:::
CCDS76 KFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGT
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pF1KE9 PLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVE
       ::::.:.::. ::.:. ::.:.  : : :. .  ..:.  ..:: .: : .:::.: :: 
CCDS76 PLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVF
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pF1KE9 KSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCY
       :..:.:.: :.:::.: .::.:::.:::::..::     :.  ..::.::.::::::: :
CCDS76 KNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPY
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pF1KE9 L--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILA
       :  .   :  .  ::.    .:::.::::.::.:.:  :.: :.::::::::..:::.: 
CCDS76 LFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLE
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pF1KE9 EYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVI
       ..:  . : ..:.::.: :..:..:.:.::: :...:::::::::::::::::.::::.:
CCDS76 DFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVII
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pF1KE9 FDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMD
       .::::::.::.:: .:::::::.:.: :::.::...:::.: . :::::.: :::.    
CCDS76 YDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----
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pF1KE9 TTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKEL---------EGEESEPQEMDI
          :  : ...:      ..:.::  :::::.:.:::.          :::.:   ..: 
CCDS76 ---RPGLGSKTGS-----MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDD
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pF1KE9 DEILRLAETRENEVSTS---ATDELLSQFKVANFATMEDE----EELEERPHKDWDEIIP
         : :: .  ..:.  .   . .: ::.::::.... :.:    ::.:..  :. . . :
CCDS76 KAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDP
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pF1KE9 EEQRKKVEEEERQKELEEIYMLPRIRSSTKKAQTNDSDS------DTESKRQAQRSSASE
       .  .: .... .:.. .    : . .   :... ::...      : .:  :.. : :::
CCDS76 DYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASE
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pF1KE9 SETEDSDDDKKPKRRGRPRSVRKDL----------------VEGFTDAEIRRFIKAYKKF
          :: :. ..  ::   ...:.:                 : ::.  . . :..:  ..
CCDS76 EGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRY
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pF1KE9 GLPLERLECIARDAELVDKSVADLKRLGELIHNSCVSAMQEYEEQLKENASEGKGPG-KR
       :.:        .::  ..  : ::.  .:   .. :: ....  .   ...:  . :  :
CCDS76 GMP-------PQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPR
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pF1KE9 RGPTIKISGVQVNVKSIIQHE-EEFEMLHK--SIP--VDPEEKKKYCL--TCRVKAAHFD
       .: . .   ....: :.:... .::: ..   :.:  .. ::.::.    .   :.   .
CCDS76 EGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPS
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pF1KE9 VEWGVEDDSRLLLGIYEHGYGNWELIKTDPELKLTDKILPVETDKKPQGKQLQTRADYLL
       .   .. ..   .   : :      :: . : .: ..   .: .:. ..   .: :    
CCDS76 TPGDTQPNTPAPVPPAEDG------IKIE-ENSLKEE-ESIEGEKEVKSTAPET-AIECT
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pF1KE9 KLLRKGLEKKGAVTGGEEAKLKKRKPRVKKENKVPRLKEEHGIELSSPRHSDNPSEEGEV
       .    . : . .:.   :.. : .: .::.... :   : .:        .:   :. : 
CCDS76 QAPAPASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGA-------AD--VEKVEE
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pF1KE9 KDDGLEKSPM--KKKQKKKENKENKEKQMSSRKDKEGDKERKKSKDKKEKPKSGDAKSSS
       :. ... .:.  . :..:::..:.:: .... .  .  ...:..:. :..          
CCDS76 KS-AIDLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGF
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pF1KE9 KSKRSQGPVHITAGSEPVPIGEDEDDDLDQETFSICKERMRPVKKALKQLDKPDKGLNVQ
                                                                   
CCDS76 TELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPF
     1700      1710      1720      1730      1740      1750        

>>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12                (1912 aa)
 initn: 1632 init1: 699 opt: 1416  Z-score: 845.5  bits: 169.8 E(32554): 8.9e-41
Smith-Waterman score: 2012; 34.9% identity (63.0% similar) in 1220 aa overlap (292-1426:523-1695)

             270       280       290       300            310      
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CCDS85 CTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGMSY
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pF1KE9 IHSTWESEESLQQQKVKGLKKLENFKKKEDEIKQWLGKVSPEDVEYFNCQQELASELNKQ
        : .: :: .:.   ..    ..:...:.:  .   :  . .. .    ...  ..  : 
CCDS85 WHCSWVSELQLE---LHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEK----SRKRKNKDPKF
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pF1KE9 YQIVERVIAVKTSKSTLGQTDFPAHSRKPAPSNEPEYLCKWMGLPYSECSWEDEALIGKK
        .. ::      .   .    .  ::     ... .:: ::  :::.. :::.: .  . 
CCDS85 AEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDK--KGHVHYLIKWRDLPYDQASWESEDVEIQD
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pF1KE9 FQNCIDSF-HSRNNSKTIPTRECKALKQ-------RPR-------FVALKKQPAYLGGEN
       ..   .:. . :.  .    :  : ::.       ::         :  ..:: :: . .
CCDS85 YDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERPPETPTVDPTVKYERQPEYLDATG
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pF1KE9 LELRDYQLEGLNWLAHSWCKNNSVILADEMGLGKTIQTISFLSYLFHQHQLYGPFLIVVP
         :. ::.::::::  :: .....:::::::::::.::  ::  :... .  ::::. .:
CCDS85 GTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAP
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pF1KE9 LSTLTSWQREFEIWAPEINVVVYIGDLMSRNTIREYEWIH-----------SQTKR---L
       :::. .:.::::.:::.. ::.:.::  ::  ::: :.             :. :.   .
CCDS85 LSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASV
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       ::..:.:.::..  : ..::::.:: : :::::::::..: ....:  .. .:.::.:::
CCDS85 KFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTGT
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pF1KE9 PLQNSLKELWSLLHFIMPEKFEFWEDFEEDHGK-GRENGYQSLHKVLEPFLLRRVKKDVE
       ::::.:.::. ::.:. ::.:.  : : :. .  ..:.  ..:: .: : .:::.: :: 
CCDS85 PLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADVF
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pF1KE9 KSLPAKVEQILRVEMSALQKQYYKWILTRNYKALAKGTRGSTSGFLNIVMELKKCCNHCY
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CCDS85 KNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPY
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pF1KE9 L--IKPPEENERENGQEILLSLIRSSGKLILLDKLLTRLRERGNRVLIFSQMVRMLDILA
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CCDS85 LFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLE
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pF1KE9 EYLTIKHYPFQRLDGSIKGEIRKQALDHFNADGSEDFCFLLSTRAGGLGINLASADTVVI
       ..:  . : ..:.::.: :..:..:.:.::: :...:::::::::::::::::.::::.:
CCDS85 DFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVII
          1090      1100      1110      1120      1130      1140   

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pF1KE9 FDSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKKQVNIYRLVTKGTVEEEIIERAKKKMVLDHLVIQRMD
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CCDS85 YDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVV----
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pF1KE9 TTGRTILENNSGRSNSNPFNKEELTAILKFGAEDLFKEL---------EGEESEPQEMDI
          :  : ...:      ..:.::  :::::.:.:::.          :::.:   ..: 
CCDS85 ---RPGLGSKTGS-----MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYDD
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pF1KE9 DEILRLAETRENEVSTS---ATDELLSQFKVANFATMEDE----EELEERPHKDWDEIIP
         : :: .  ..:.  .   . .: ::.::::.... :.:    ::.:..  :. . . :
CCDS85 KAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDP
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       .  .: .... .:.. .    : . .   :... ::...      : .:  :.. : :::
CCDS85 DYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASE
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          :: :. ..  ::   ...:.:                 : ::.  . . :..:  ..
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