FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4113, 485 aa 1>>>pF1KE4113 485 - 485 aa - 485 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0109+/-0.00097; mu= 4.6336+/- 0.060 mean_var=243.3142+/-49.409, 0's: 0 Z-trim(113.9): 66 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.082222 statistics sampled from 14447 (14512) to 14447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.446), width: 16 Scan time: 3.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 3231 395.9 4.9e-110 CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 2324 288.3 1.2e-77 CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 2324 288.4 1.3e-77 CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 1357 173.7 4.3e-43 CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 1305 167.5 2.9e-41 CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 998 131.0 2.3e-30 >>CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 (485 aa) initn: 3231 init1: 3231 opt: 3231 Z-score: 2089.0 bits: 395.9 E(32554): 4.9e-110 Smith-Waterman score: 3231; 100.0% identity (100.0% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 LIFYA ::::: CCDS10 LIFYA >>CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (461 aa) initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1507.8 bits: 288.3 E(32554): 1.2e-77 Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:7-461) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP ::. :. . . .:: .: CCDS13 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL .:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.: CCDS13 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE :: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.::::::: CCDS13 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA ::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::. 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CCDS13 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS ::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..:::::::: CCDS13 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI .:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: :::::::::::::::: CCDS13 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH :::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::. CCDS13 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE :::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::: CCDS13 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE 460 470 480 490 500 510 pF1KE4 LIFYA ::::: CCDS13 LIFYA 520 >>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa) initn: 1264 init1: 978 opt: 1357 Z-score: 887.1 bits: 173.7 E(32554): 4.3e-43 Smith-Waterman score: 1372; 45.1% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (8-484:28-524) 10 20 30 40 pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAP :.. ::: : .::.::.. :. . :. : CCDS12 MAAGGSGGRASCPPGVGVGPGTGGSPGPSANAAATPAPGNAAAAAAAAAAAAAAPGPTPP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 pF1KE4 APPPPAPAPPTLGNNHQE---SPG-----------WRCCRPTLRERNALMFNNELMADVH ::: :. . : .. : .:: :. .::..:: :..::::.. ::: CCDS12 APPGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVH 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 FVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYS :.:: ... .:::..::::::.:: ::: : .: ...::..::::::::: :::..:: CCDS12 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 DEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQR ::... .::..:::.:::: :::: ::.::. .:.: :: .::.:.:::.::.:.. CCDS12 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 CWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLP : : :: .. :. .::: .:: .:: .. :..:. .:. .:.::. :.::::.:: : CCDS12 CLENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQ 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFP .::.:.:.:::.:: :.:.: ::.:::: : ::: ::. .:. :.:: .:.. :::..: CCDS12 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 LTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE : : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:.:..:.::::: : .. CCDS12 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTD 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 YSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELS :.:.:.. . ..::.:: : : :::..:: : :..::.: .. ::: :.: : . : CCDS12 YQVNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-S 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 pF1KE4 YFGQEGMTEVQC------GKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA ..: .:. .: .:. : : .. ..:::.:. :::::.::: CCDS12 HYGTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT 480 490 500 510 520 >>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa) initn: 1274 init1: 790 opt: 1305 Z-score: 854.3 bits: 167.5 E(32554): 2.9e-41 Smith-Waterman score: 1312; 44.7% identity (72.6% similar) in 481 aa overlap (23-484:7-481) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE ::.:..:. . . :.:: ::: :.: .:: :. 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CCDS10 TLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRS :::: : ::: ::. .:. ..:: .:.. :::... : : ..: .:::. : CCDS10 EEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR- 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 NQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFM : : : : :.:.:.::. :.:.::::: : ..:.:.:.. . .:.:: : : CCDS10 --WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFS 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 SDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEV-----QCGKVAFQF ::..::: : :..:... .. ::: :.: : . :..: .:. .: .:..: : CCDS10 CDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACATLKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFF 400 410 420 430 440 450 470 480 pF1KE4 QCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA : ..:::... :::::.::: CCDS10 FSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT 460 470 480 >>CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (385 aa) initn: 1053 init1: 790 opt: 998 Z-score: 658.7 bits: 131.0 E(32554): 2.3e-30 Smith-Waterman score: 1005; 46.2% identity (73.2% similar) in 351 aa overlap (23-361:7-352) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE ::.:..:. . . :.:: ::: :.: .:: :. CCDS32 MASLGPAAAGEQAS--GAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQR 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 SP--GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGP------PGATRTVPAHKYVLAVGSS : .:. . .:.:: :..::.::..::.::.: :. . .:::..:::.::. CCDS32 EPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 VFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPA :: ::: : .: ...::..::::::::: ::...::::... .::..:::.:::: ::: CCDS32 VFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPA 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 LAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQ : ::.:: :.: :: .::.:.:::.::.:.. : ..:: .. :. .::: .:: . CCDS32 LEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDID 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 TLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTL :: .. :..:. .:. .: ::. ::::::.:: ::.: ::..:::.:: :.:.: ::. CCDS32 TLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE4 EEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRS :::: : ::: ::. .:. ..:: .:.. :::... : : ..: .:::. : CCDS32 EEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR- 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 NQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSD : : : : :. CCDS32 --WGYSGTSDRIRSLNMRKSKPWDRMIPALVVMGQLTHSGSCSRNP 350 360 370 380 485 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:11:13 2016 done: Sun Nov 6 04:11:14 2016 Total Scan time: 3.690 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]