Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2621, 668 aa
1>>>pF1KE2621 668 - 668 aa - 668 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7893+/-0.00076; mu= 10.6404+/- 0.046
mean_var=186.0599+/-37.059, 0's: 0 Z-trim(115.4): 36 B-trim: 9 in 1/53
Lambda= 0.094026
statistics sampled from 15914 (15947) to 15914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7999.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 668) 4685 647.8 1.4e-185
CCDS58137.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 592) 3223 449.5 6.4e-126
CCDS58138.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 601) 3023 422.3 9.5e-118
CCDS1171.1 CD5L gene_id:922|Hs108|chr1 ( 347) 714 108.9 1.2e-23
CCDS53742.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1121) 632 98.2 6.5e-20
CCDS8578.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1156) 632 98.3 6.6e-20
CCDS8577.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1453) 610 95.4 6.2e-19
CCDS73434.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1463) 610 95.4 6.2e-19
CCDS59424.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 ( 951) 582 91.4 6.3e-18
CCDS46196.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 (1573) 582 91.6 9.2e-18
CCDS44491.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (1785) 481 77.9 1.3e-13
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 481 78.1 1.7e-13
CCDS44490.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2413) 481 78.1 1.7e-13
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 447 73.1 1.9e-12
CCDS5585.1 SSC4D gene_id:136853|Hs108|chr7 ( 575) 426 70.0 1e-11
>>CCDS7999.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 (668 aa)
initn: 4685 init1: 4685 opt: 4685 Z-score: 3445.3 bits: 647.8 E(32554): 1.4e-185
Smith-Waterman score: 4685; 99.6% identity (99.9% similar) in 668 aa overlap (1-668:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS79 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFTPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGLPGQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 PGLPGQHYCGHKEDAGAVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FILLRIKGKYALPVMVNHQHLPTTIPAGSNSYQPVPITIPKEVFMLPIQVQAPPPEDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 FILLRIKGKYALPVMVNHQHLPTTIPAGSNSYQPVPITIPKEVFMLPIQVQAPPPEDSDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 GSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NLELASTQPAFSAGPPADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPPSEEQFGCPGSPSPQPDSTDND
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 NLELAGTQPAFSAGPPADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPPSEEQFGCPGSPSPQPDSTDND
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DYDDISAA
::::::::
CCDS79 DYDDISAA
>>CCDS58137.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 (592 aa)
initn: 3977 init1: 3223 opt: 3223 Z-score: 2374.1 bits: 449.5 E(32554): 6.4e-126
Smith-Waterman score: 3952; 88.0% identity (88.5% similar) in 668 aa overlap (1-668:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFTPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGLPGQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGLPGQHYCGHKEDAGAVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FILLRIKGKYALPVMVNHQHLPTTIPAGSNSYQPVPITIPKEVFMLPIQVQAPPPEDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FILLRIKGKYALPVMVNHQHLPTTIPAGSNSYQPVPITIPKE------------------
430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 -----------------------DSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NLELASTQPAFSAGPPADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPPSEEQFGCPGSPSPQPDSTDND
:::::.:::::: :::::::::::::
CCDS58 NLELAGTQPAFS-----------------------------------GSPSPQPDSTDND
560 570 580
pF1KE2 DYDDISAA
::::::::
CCDS58 DYDDISAA
590
>>CCDS58138.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 (601 aa)
initn: 4056 init1: 3012 opt: 3023 Z-score: 2227.4 bits: 422.3 E(32554): 9.5e-118
Smith-Waterman score: 4043; 89.5% identity (89.8% similar) in 668 aa overlap (1-668:1-601)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MWLFFGITGLLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFTPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PGLPGQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGLPGQHYCGHKEDAGAVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FILLRIKGKYALPVMVNHQHLPTTIPAGSNSYQPVPITIPKEVFMLPIQVQAPPPEDSDS
:::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS58 FILLRIKGKY--------------------------------VFMLPIQVQAPPPEDSDS
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSDSDYEHYDFSAQPPVALTTFYNSQRHRVTDEEVQQSRFQMPPLEEGLEELHASHIPTA
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPGHCITDPPSLGPQYHPRSNSESSTSSGEDYCNSPKSKLPPWNPQVFSSERSSFLEQPP
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NLELASTQPAFSAGPPADDSSSTSSGEWYQNFQPPPQPPSEEQFGCPGSPSPQPDSTDND
:::::.:::::: :::::::::::::
CCDS58 NLELAGTQPAFS-----------------------------------GSPSPQPDSTDND
570 580 590
pF1KE2 DYDDISAA
::::::::
CCDS58 DYDDISAA
600
>>CCDS1171.1 CD5L gene_id:922|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 615 init1: 236 opt: 714 Z-score: 537.8 bits: 108.9 E(32554): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 723; 38.2% identity (62.1% similar) in 338 aa overlap (45-361:24-346)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 LSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALW
:::..: : : :::. ...: .: :
CCDS11 MALLFSLILAICTRPGFLASPSGVRLVGGLHRCEGRVEVEQKGQWGTVCDDGW
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 DSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANATLAGAPALLCSGAEW
: . . ..:: :::: ::: . :. : ::: . .: .. . :.:.:
CCDS11 DIKDVAVLCRELGCG---AAS--GTPSGILYEPPAEKEQKVLIQS-------VSCTGTED
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180
pF1KE2 RL--CEVVE-HACRSDGRRARVTCAEN---------RALRLVDGGGACAGRVEMLEHGEW
: :: : . : : . : ..: :: ...::.:: : : ::::. ....:
CCDS11 TLAQCEQEEVYDCSHD-EDAGASC-ENPESSFSPVPEGVRLADGPGHCKGRVEVKHQNQW
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAV--QALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDC
.::. :.:. :.::::::::: :: : . : . :: :: .:..::: :: : ::
CCDS11 YTVCQTGWSLRAAKVVCRQLGCGRAVLTQKRCNKHAY-GRKPIWLSQMSCSGREATLQDC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE2 PGLP-GQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEA
:. : :.. :.: ::. : : . . ::.:: . : :..:: .:::..:::..: .:
CCDS11 PSGPWGKNTCNHDEDTWVECEDPFDLRLVGGDNLCSGRLEVLHKGVWGSVCDDNWGEKED
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KVLCQSLGCGTAVE---RPKGLPHSLSGRMYYS---CNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQS
.:.:..:::: .. : . ::.. . :.::: .: .:. :: . . :...
CCDS11 QVVCKQLGCGKSLSPSFRDRKCYGPGVGRIWLDNVRCSGEEQSLEQCQHRFWGFHDCTHQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLL
. :.::
CCDS11 EDVAVICSG
340
>>CCDS53742.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1121 aa)
initn: 411 init1: 411 opt: 632 Z-score: 471.0 bits: 98.2 E(32554): 6.5e-20
Smith-Waterman score: 725; 35.0% identity (60.7% similar) in 354 aa overlap (40-377:154-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LLTAALSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPA
: : .::: :.. ::: .:..... : .
CCDS53 ESALWDCKHDGWGKHSNCTHQQDAGVTCSDGSNLEMRLTRGGNMCSGRIEIKFQGRWGTV
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 CGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANATLAGAPALLC
: .. : ..:: : ::.: . : :... . .. :.:
CCDS53 CDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFS---------------GSSNFGEGSGPIWFDDLIC
190 200 210 220
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SGAE---WRLCEVV---EHACRSDGRRARVTCAE--NRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGE
.: : : :. .: : . .. : : :.. . .:::::: :.::.:. .::
CCDS53 NGNESALWN-CKHQGWGKHNC-DHAEDAGVICSKGADLSLRLVDGVTECSGRLEVRFQGE
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 WGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDCP
::..::: :: :: :.:.:::: :: :. .. : : : :.:.:.: : .:.:
CCDS53 WGTICDDGWDSYDAAVACKQLGCPTAVTAIGRVNASKGFGHIWLDSVSCQGHEPAIWQCK
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290
pF1KE2 GLP-GQHYCGHKEDAGVVCSEHQSW--RLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSE
:.:::.:.:::::.::. .. :: ::..:: : :::... . . ::: : .:
CCDS53 HHEWGKHYCNHNEDAGVTCSDGSDLELRLRGGGSRCAGTVEVEIQRLLGKVCDRGWGLKE
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AKVLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYY----SCNGEELTLSNC-SWRFNNSNLCSQS
: :.:..::::.:.. . .... . ::::.: .: .: .:.... . :..
CCDS53 ADVVCRQLGCGSALKTSYQVYSKIQATNTWLFLSSCNGNETSLWDCKNWQWGGLT-CDHY
410 420 430 440 450 460
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLL
:.. ::: : : ..: :
CCDS53 EEAKITCSAHRE-PRLVGGDIPCSGRVEVKHGDTWGSICDSDFSLEAASVLCRELQCGTV
470 480 490 500 510 520
>--
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10 20 30 40
pF1KE2 MWLFFGITGLLTAALSGHPS-----PAPPDQLNTSSAESELWEPGE
:: : :. : .: : ..
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50 60 70 80 90
pF1KE2 RLP-VRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGA---EAASQL
: .::.::.. : : ::.. ..: :.. :: . :...:. : :: : .....
CCDS53 RYTEIRLVNGKTPCEGRVELKTLGAWGSLCNSHWDIEDAHVLCQQLKCGVALSTPGGARF
580 590 600 610 620 630
100 110 120 130 140
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. . .. :. :.: .:.: . ...::: . . . .
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640 650 660 670 680 690
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pF1KE2 SDGR-----RARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGEWGSVCDDTWDLEDAHVVCR
. : .. :.: :. ::::.::: ::::::. ..: ::..:::.::: :::::::
CCDS53 GPTRPTIPEESAVACIESGQLRLVNGGGRCAGRVEIYHEGSWGTICDDSWDLSDAHVVCR
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::::: :..: . :: : ::: :...:.: :. .:.: . ::. : :::::::.:
CCDS53 QLGCGEAINATGSAHFGEGTGPIWLDEMKCNGKESRIWQCHSHGWGQQNCRHKEDAGVIC
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:: .: :::. :.: : :..:: . :.:.:: : . . :.:..:::. . :
CCDS53 SEFMSLRLTSEASREACAGRLEVFYNGAWGTVGKSSMSETTVGVVCRQLGCADKGKINPA
820 830 840 850 860 870
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GLPHSLSGRMYYS---CNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLCSASRSLHNLSTPE
.: ...: :. . : :: .: .. : : : . . :
CCDS53 SLDKAMSIPMWVDNVQCPKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSC
880 890 900 910 920 930
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 VPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIAFILLRIKGKYALP
CCDS53 SGRVEIWHGGSWGTVCDDSWDLDDAQVVCQQLGCGPALKAFKEAEFGQGTGPIWLNEVKC
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140 150 160 170 180 190
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.:: .: .:.::::. . : ::.::::.:
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::.::.:::.::::: :..:. .: : ::: ..:.:.: :. :::::. :. :
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::::::.: :.. . . :: ..: . . : . :: .. . .. .. .
CCDS53 GHKEDAAVNCTDISVQKTPQKATTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKRRQR
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: :. .. : ..: :... : . :: :...: : : :
CCDS53 QRLAVSS---RGENLVHQIQYREMNSCLNADDLDLMNSSGGHSEPH
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pF1KE2 SRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIAFI
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10 20 30 40 50 60
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: : .::: :.. ::: .:..... : .
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: .. : ..:: : ::.: . : :... . .. :.:
CCDS85 CDDNFNIDHASVICRQLECGSAVSFS---------------GSSNFGEGSGPIWFDDLIC
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130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SGAE---WRLCEVV---EHACRSDGRRARVTCAE--NRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGE
.: : : :. .: : . .. : : :.. . .:::::: :.::.:. .::
CCDS85 NGNESALWN-CKHQGWGKHNC-DHAEDAGVICSKGADLSLRLVDGVTECSGRLEVRFQGE
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 WGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFMPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDCP
::..::: :: :: :.:.:::: :: :. .. : : : :.:.:.: : .:.:
CCDS85 WGTICDDGWDSYDAAVACKQLGCPTAVTAIGRVNASKGFGHIWLDSVSCQGHEPAIWQCK
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290
pF1KE2 GLP-GQHYCGHKEDAGVVCSEHQSW--RLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSE
:.:::.:.:::::.::. .. :: ::..:: : :::... . . ::: : .:
CCDS85 HHEWGKHYCNHNEDAGVTCSDGSDLELRLRGGGSRCAGTVEVEIQRLLGKVCDRGWGLKE
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 AKVLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYY----SCNGEELTLSNC-SWRFNNSNLCSQS
: :.:..::::.:.. . .... . ::::.: .: .: .:.... . :..
CCDS85 ADVVCRQLGCGSALKTSYQVYSKIQATNTWLFLSSCNGNETSLWDCKNWQWGGLT-CDHY
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pF1KE2 LAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLL
:.. ::: : : ..: :
CCDS85 EEAKITCSAHRE-PRLVGGDIPCSGRVEVKHGDTWGSICDSDFSLEAASVLCRELQCGTV
470 480 490 500 510 520
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Smith-Waterman score: 729; 34.7% identity (58.9% similar) in 377 aa overlap (17-360:549-925)
10 20 30 40
pF1KE2 MWLFFGITGLLTAALSGHPS-----PAPPDQLNTSSAESELWEPGE
:: : :. : .: : ..
CCDS85 LQCGTVVSILGGAHFGEGNGQIWAEEFQCEGHESHLSLCPVAPRPEGTCSHSRDVGVVCS
520 530 540 550 560 570
50 60 70 80 90
pF1KE2 RLP-VRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGA---EAASQL
: .::.::.. : : ::.. ..: :.. :: . :...:. : :: : .....
CCDS85 RYTEIRLVNGKTPCEGRVELKTLGAWGSLCNSHWDIEDAHVLCQQLKCGVALSTPGGARF
580 590 600 610 620 630
100 110 120 130 140
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. . .. :. :.: .:.: . ...::: . . . .
CCDS85 GKGNGQIWRHMFHCTGTEQHMGDCPVTALGASLCPSEQVASVICSGNQSQTLSSCNSSSL
640 650 660 670 680 690
150 160 170 180 190 200
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. : .. :.: :. ::::.::: ::::::. ..: ::..:::.::: :::::::
CCDS85 GPTRPTIPEESAVACIESGQLRLVNGGGRCAGRVEIYHEGSWGTICDDSWDLSDAHVVCR
700 710 720 730 740 750
210 220 230 240 250
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::::: :..: . :: : ::: :...:.: :. .:.: . ::. : :::::::.:
CCDS85 QLGCGEAINATGSAHFGEGTGPIWLDEMKCNGKESRIWQCHSHGWGQQNCRHKEDAGVIC
760 770 780 790 800 810
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pF1KE2 SEHQSWRLTGGADR--CEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAKVLCQSLGCGTAVE-RPK
:: .: :::. :.: : :..:: . :.:.:: : . . :.:..:::. . :
CCDS85 SEFMSLRLTSEASREACAGRLEVFYNGAWGTVGKSSMSETTVGVVCRQLGCADKGKINPA
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.: ...: :. . : :: .: .. : : : . . :
CCDS85 SLDKAMSIPMWVDNVQCPKGPDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSC
880 890 900 910 920 930
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CCDS85 SGRVEIWHGGSWGTVCDDSWDLDDAQVVCQQLGCGPALKAFKEAEFGQGTGPIWLNEVKC
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140 150 160 170 180 190
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.:: .: .:.::::. . : ::.::::.:
CCDS85 PDTLWQCPSSPWEKRLASPSEETWITCDNKIRLQEGPTSCSGRVEIWHGGSWGTVCDDSW
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::::::.: :.. . . :: ..: . . : . :: .. . .. .. .
CCDS85 GHKEDAAVNCTDISVQKTPQKATTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKRRQR
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: :. .. : ..: :... : . :: :...: : : : .::. : ...: : :.
CCDS85 QRLAVSS---RGENLVHQIQYREMNSCLNADDLDLMNSS---ENSHE-SADFSAAELISV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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:. :
CCDS85 SKFLPISGMEKEAILSHTEKENGNL
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10 20 30 40 50 60
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: : .::..::..::: ::::.. .:
CCDS85 NESFLWDCRHSGTVNFDCLHQNDVSVICSDGADLELRLADGSNNCSGRVEVRIHEQWWTI
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: : .. : .::. ::: . .:. : :. : .. :. . :
CCDS85 CDQNWKNEQALVVCKQLGCPFSVFGSRRAKPSNE--------ARDIWINS-------ISC
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.: : : : .: :. :: : : :.. . :::: . . : ::.:. .::::
CCDS85 TGNESALWDCTYDGKAKRTCFRRSDAGVICSDKADLDLRLVGAHSPCYGRLEVKYQGEWG
440 450 460 470 480 490
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.:: : :. ..: :::.::::: .... .: . ::: :.:.: : :. .:::
CCDS85 TVCHDRWSTRNAAVVCKQLGCGKPLHVFGMTYFKEASGPIWLDDVSCIGNESNIWDCEHS
500 510 520 530 540 550
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:.: : :.::. :.:: .: ::.::..:: :..::.:.: :.::::. : . :
CCDS85 GWGKHNCVHREDVIVTCSGDATWGLRLVGGSNRCSGRLEVYFQGRWGTVCDDGWNSKAAA
560 570 580 590 600 610
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:.:..: : ... :: .. .: ... ::.:.: : .: ..: ::.:
CCDS85 VVCSQLDCPSSII-GMGLGNASTGYGKIWLDDVSCDGDESDLWSCRNSGWGNNDCSHSED
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. :.:: . ..
CCDS85 VGVICSDASDMELRLVGGSSRCAGKVEVNVQGAVGILCANGWGMNIAEVVCRQLECGSAI
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20 30 40 50 60 70
pF1KE2 LSGHPSPAPPDQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALW
:::.::.:.:.: ::. . . : : . :
CCDS85 HLALCPIVQHPEDTCIHSREVGVVCSRYTDVRLVNGKSQCDGQVEINVLGHWGSLCDTHW
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: . :...:: :.:: : ... .. . .. :: :. : :. :::
CCDS85 DPEDARVLCRQLSCGTALSTTGGKYIGERSVRVWGHRFHCLGNESLLDNCQMTVLGAPPC
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...:.:. . : .: . . . . . : :.. :::::: . :::::
CCDS85 IHGNTVSVICTGSLTQPLFPCLANVSDPYLSAVPEGSALICLEDKRLRLVDGDSRCAGRV
990 1000 1010 1020 1030 1040
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:. . : ::..::: ::: ::::::..:::: : .: . :: : ::: :..::.: :
CCDS85 EIYHDGFWGTICDDGWDLSDAHVVCQKLGCGVAFNATVSAHFGEGSGPIWLDDLNCTGME
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KE2 AYLWDCPGLP-GQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADR--CEGQVEVHFRGVWNTVCD
..::.::. ::: : :::::::.::: . :: . .. : :..:: . :.:..:
CCDS85 SHLWQCPSRGWGQHDCRHKEDAGVICSEFTALRLYSETETESCAGRLEVFYNGTWGSVGR
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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. . : ..:..:::: ..: : .. :: :. . : .... .:
CCDS85 RNITTAIAGIVCRQLGCGENGVVSLAPLSKTGSGFMWVDDIQCPKTHISIWQCLSAPWER
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KE2 NLCSQSLAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIV
CCDS85 RISSPAEETWITCEDRIRVRGGDTECSGRVEIWHAGSWGTVCDDSWDLAEAEVVCQQLGC
1230 1240 1250 1260 1270 1280
>--
initn: 874 init1: 278 opt: 460 Z-score: 343.4 bits: 75.0 E(32554): 8.3e-13
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40 50 60 70 80 90
pF1KE2 GERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAP
: :.. :. .::. ::: . : ...
CCDS85 GTDLELRLVNGDGPCSGTVEVKFQGQWGTVCDDGWNTTASTVVCKQLGCPFSFAMFRFGQ
50 60 70 80 90 100
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pF1KE2 PTPELPPPPAAGNTSVAANATLAGAPALL-CSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTC--A
. . :. . . .. :: :. :: : : :. . :.:
CCDS85 AVTR------HGKIWLDDVSCYGNESALWECQHREWG-----SHNCYH-GEDVGVNCYGE
110 120 130 140 150
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pF1KE2 ENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGEWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHF
: .::::::...:.::::. . .::..::: :.:. : :::::::: . . :.
CCDS85 ANLGLRLVDGNNSCSGRVEVKFQERWGTICDDGWNLNTAAVVCRQLGCPSSFIS-SGVVN
160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 MPGR-GPIHRDQVNCSGAEAYLWDCPGLP-GQHYCGHKEDAGVVC--SEHQSWRLTGGAD
:. :: :.. :.: : ::.: :.: :.:.::. ..: : ::.::..
CCDS85 SPAVLRPIWLDDILCQGNELALWNCRHRGWGNHDCSHNEDVTLTCYDSSDLELRLVGGTN
210 220 230 240 250 260
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pF1KE2 RCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAKVLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYY----
:: :.::....: :.::: .: . : :.:..::::::.. :::: ::
CCDS85 RCMGRVELKIQGRWGTVCHHKWNNAAADVVCKQLGCGTALHFA-GLPHLQSGSDVVWLDG
270 280 290 300 310 320
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::.:.: : .: . . : .. . :.::
CCDS85 VSCSGNESFLWDCRHSGTVNFDCLHQNDVSVICSDGADLELRLADGSNNCSGRVEVRIHE
330 340 350 360 370 380
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CCDS85 QWWTICDQNWKNEQALVVCKQLGCPFSVFGSRRAKPSNEARDIWINSISCTGNESALWDC
390 400 410 420 430 440
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CCDS73 VGVICSDASDMELRLVGGSSRCAGKVEVNVQGAVGILCANGWGMNIAEVVCRQLECGSAI
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CCDS73 RISSPAEETWITCEDRIRVRGGDTECSGRVEIWHAGSWGTVCDDSWDLAEAEVVCQQLGC
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CCDS73 TICDQNWKNEQALVVCKQLGCPFSVFGSRRAKPSNEARDIWINSISCTGNESALWDCTYD
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CCDS46 NPQNASRKKSPRPKQAKSTRAPLLTTGAPRQERLRLVSGPHRCAGRLEVWHGGRWGTVCD
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CCDS46 LGCGGALAAPGGAFFGEGSGPIILDDLRCRGNETALRFCPARPWGQHDCHHREDAGAVCD
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 ASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESRELMLLIPSIVLGILLLGSLIFIAF
CCDS46 GMPLGYVPPTAPTDSNNSTPREAASRPPSTMTSQAPGTAGVSPPPASPTVLWEPGPEAGS
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