FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4410, 423 aa 1>>>pF1KE4410 423 - 423 aa - 423 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0352+/-0.00112; mu= 12.1718+/- 0.067 mean_var=59.2371+/-11.693, 0's: 0 Z-trim(101.0): 28 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.166639 statistics sampled from 6316 (6328) to 6316 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 2.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7978.1 TCN1 gene_id:6947|Hs108|chr11 ( 433) 2731 665.5 2.7e-191 CCDS7977.1 GIF gene_id:2694|Hs108|chr11 ( 417) 595 152.0 1e-36 CCDS13881.1 TCN2 gene_id:6948|Hs108|chr22 ( 427) 432 112.8 6.5e-25 CCDS54519.1 TCN2 gene_id:6948|Hs108|chr22 ( 400) 406 106.6 4.6e-23 >>CCDS7978.1 TCN1 gene_id:6947|Hs108|chr11 (433 aa) initn: 2731 init1: 2731 opt: 2731 Z-score: 3547.7 bits: 665.5 E(32554): 2.7e-191 Smith-Waterman score: 2731; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRQSHQLPLVGLLLFSFIPSQLCEICEVSEENYIRLKPLLNTMIQSNYNRGTSAVNVVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 MRQSHQLPLVGLLLFSFIPSQLCEICEVSEENYIRLKPLLNTMIQSNYNRGTSAVNVVLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LKLVGIQIQTLMQKMIQQIKYNVKSRLSDVSSGELALIILALGVCRNAEENLIYDYHLID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 LKLVGIQIQTLMQKMIQQIKYNVKSRLSDVSSGELALIILALGVCRNAEENLIYDYHLID 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 KLENKFQAEIENMEAHNGTPLTNYYQLSLDVLALCLFNGNYSTAEVVNHFTPENKNYYFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 KLENKFQAEIENMEAHNGTPLTNYYQLSLDVLALCLFNGNYSTAEVVNHFTPENKNYYFG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 SQFSVDTGAMAVLALTCVKKSLINGQIKADEGSLKNISIYTKSLVEKILSEKKENGLIGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 SQFSVDTGAMAVLALTCVKKSLINGQIKADEGSLKNISIYTKSLVEKILSEKKENGLIGN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 TFSTGEAMQALFVSSDYYNENDWNCQQTLNTVLTEISQGAFSNPNAAAQVLPALMGKTFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 TFSTGEAMQALFVSSDYYNENDWNCQQTLNTVLTEISQGAFSNPNAAAQVLPALMGKTFL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DINKDSSCVSASGNFNISADEPITVTPPDSQSYISVNYSVRINETYFTNVTVLNGSVFLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 DINKDSSCVSASGNFNISADEPITVTPPDSQSYISVNYSVRINETYFTNVTVLNGSVFLS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 VMEKAQKMNDTIFGFTMEERSWGPYITCIQGLCANNNDRTYWELLSGGEPLSQGAGSYVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS79 VMEKAQKMNDTIFGFTMEERSWGPYITCIQGLCANNNDRTYWELLSGGEPLSQGAGSYVV 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 RNG ::: CCDS79 RNGENLEVRWSKY 430 >>CCDS7977.1 GIF gene_id:2694|Hs108|chr11 (417 aa) initn: 505 init1: 179 opt: 595 Z-score: 772.7 bits: 152.0 E(32554): 1e-36 Smith-Waterman score: 631; 34.3% identity (61.4% similar) in 399 aa overlap (37-422:33-406) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 LPLVGLLLFSFIPSQLCEICEVSEENYIRLKPLLNTMIQSNYNRGTSAV----NVVLSLK .::.: . : ::.. ....... 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