FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6629, 290 aa 1>>>pF1KE6629 290 - 290 aa - 290 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9963+/-0.000739; mu= 11.6178+/- 0.045 mean_var=70.9476+/-14.337, 0's: 0 Z-trim(109.0): 24 B-trim: 240 in 1/52 Lambda= 0.152267 statistics sampled from 10557 (10580) to 10557 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 2.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 ( 290) 1989 445.7 1.8e-125 CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 264) 738 170.9 8.9e-43 CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 ( 260) 696 161.7 5.3e-40 CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 ( 261) 673 156.6 1.8e-38 CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 ( 262) 645 150.5 1.3e-36 CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 ( 260) 640 149.4 2.7e-36 CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX ( 317) 620 145.0 6.7e-35 CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 ( 208) 612 143.2 1.5e-34 CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 ( 305) 607 142.1 4.7e-34 CCDS10186.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 343) 498 118.2 8.4e-27 CCDS10185.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 354) 498 118.2 8.7e-27 CCDS947.1 CA14 gene_id:23632|Hs108|chr1 ( 337) 478 113.8 1.7e-25 CCDS6585.1 CA9 gene_id:768|Hs108|chr9 ( 459) 475 113.2 3.6e-25 CCDS32684.1 CA10 gene_id:56934|Hs108|chr17 ( 328) 468 111.6 7.8e-25 CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 447 107.2 7.4e-23 CCDS12729.1 CA11 gene_id:770|Hs108|chr19 ( 328) 430 103.3 2.5e-22 CCDS30578.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 308) 424 101.9 6e-22 CCDS57970.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 313) 424 101.9 6.1e-22 CCDS11624.1 CA4 gene_id:762|Hs108|chr17 ( 312) 398 96.2 3.2e-20 CCDS76767.1 CA12 gene_id:771|Hs108|chr15 ( 283) 393 95.1 6.2e-20 CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 395 95.8 2e-19 CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 395 95.8 3.1e-19 CCDS57971.1 CA6 gene_id:765|Hs108|chr1 ( 248) 325 80.2 1.7e-15 >>CCDS6174.1 CA8 gene_id:767|Hs108|chr8 (290 aa) initn: 1989 init1: 1989 opt: 1989 Z-score: 2366.0 bits: 445.7 E(32554): 1.8e-125 Smith-Waterman score: 1989; 100.0% identity (100.0% similar) in 290 aa overlap (1-290:1-290) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREAR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 YDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKSKSVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 YDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKSKSVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 RENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 RENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 AVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWILFRYPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 AVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWILFRYPL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 TISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ 250 260 270 280 290 >>CCDS10821.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (264 aa) initn: 712 init1: 332 opt: 738 Z-score: 881.4 bits: 170.9 E(32554): 8.9e-43 Smith-Waterman score: 738; 41.8% identity (71.6% similar) in 268 aa overlap (29-290:7-263) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGY--EEG-VEWGLVFPDANGEYQSPINLNSR ::: ..: .: ..: :.:. :::::. : CCDS10 MTGHHGWGYGQDDGPSHWHKLYPIAQGDRQSPINIISS 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKS---KSVLSGGPLPQGHEFELYE .: :.::: ..:: : .: . .::.::..:: ... ..:..:::: .: ..: . CCDS10 QAVYSPSLQPLELS--YEACMSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPL-EG-PYRLKQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGK .::::.... ::::::. :.:: ::::.:::. .... ::.. : :.:....:.. : CCDS10 FHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGVFLETGD 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWI :: ... .:. : ...:: . . ::::. ::: : ::.: :::: :: ::.:::: CCDS10 EHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPAS--RHYWTYPGSLTTPPLSESVTWI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ ..: :. ::. :. .:: : . : .. . .:::: :::. ::..:.:. CCDS10 VLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDERIH-----MVNNFRPPQPLKGRVVKASFRA 220 230 240 250 260 >>CCDS6239.1 CA2 gene_id:760|Hs108|chr8 (260 aa) initn: 527 init1: 174 opt: 696 Z-score: 831.7 bits: 161.7 E(32554): 5.3e-40 Smith-Waterman score: 696; 41.4% identity (71.6% similar) in 268 aa overlap (29-290:5-260) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGY--EEGVE-WGLVFPDANGEYQSPINLNSR ::: ..: : : :: :.:: :::...... CCDS62 MSHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTH 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVIL---KSKSVLSGGPLPQGHEFELYE :.::::: :: .: . .. :.::...: . ..:.::.:::: .: ..: . CCDS62 TAKYDPSLKP--LSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPL-DG-TYRLIQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGK .:::: . .::::::. : . ::::.::: : .:.. .:: .: :.:....:...:. CCDS62 FHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWN-TKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGS 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWI . ::. :...:..:. :::: . :.: :::. : :::.: :::: :: : :::: CCDS62 AKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESL--DYWTYPGSLTTPPLLECVTWI 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ ... :...:. :. .::.: . .: . .. ::.::.:::..: :.:.:. CCDS62 VLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEP-----EELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK 210 220 230 240 250 260 >>CCDS6237.1 CA1 gene_id:759|Hs108|chr8 (261 aa) initn: 569 init1: 303 opt: 673 Z-score: 804.4 bits: 156.6 E(32554): 1.8e-38 Smith-Waterman score: 673; 39.2% identity (70.9% similar) in 268 aa overlap (28-289:5-261) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEE--GVE-WGLVFPDANGEYQSPINLNSR .:::.. : : :. ..: :::. :::..... CCDS62 MASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTS 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILK---SKSVLSGGPLPQGHEFELYE :...: :: . .: : .. . :. : ::...: .. ..:::.:::. .. ..:.. CCDS62 ETKHDTSLKPISVSYNPATAK--EIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDS--YRLFQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGK .:::: :..::::::. . :::. ::::. ..:. ::..: :.:.:......:. CCDS62 FHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGE 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWI . :. : . :: :. ::: . :.:.::::. : :.:.: :::: :: :.:::: CCDS62 ANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSL--DFWTYPGSLTHPPLYESVTWI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ . . ...:. :. .:: : ..:.: . : . : ::::::. :..::.: CCDS62 ICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVP-----MQHNNRPTQPLKGRTVRASF 220 230 240 250 260 >>CCDS6236.1 CA13 gene_id:377677|Hs108|chr8 (262 aa) initn: 627 init1: 274 opt: 645 Z-score: 771.1 bits: 150.5 E(32554): 1.3e-36 Smith-Waterman score: 645; 38.5% identity (69.3% similar) in 270 aa overlap (29-290:6-262) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEEG---VEWGLVFPDANGEYQSPINLNSR :::.: ..: :: :.:. ::::..... CCDS62 MSRLSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTK 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EARYDPSL--LDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVIL---KSKSVLSGGPLPQGHEFEL :..:: :: :... .:. . ..:.::...: . ..:::: :::: . ..: CCDS62 EVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKI----ISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGS--YRL 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YEVRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQI .:..::: ...:::: :. .. :::..:::: . :. ::. .: :.:....:.:: CCDS62 RQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQI 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GKEHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVT :. . :. .:. :..:. :::. . :. .::: :::.: ::::.:: :.:: CCDS62 GEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSW--DYWTYPGSLTVPPLLESVT 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 WILFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ ::... :..::. :. .:: : ..: ..: .: :: :::. : .::.:. CCDS62 WIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGE-----AAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH 210 220 230 240 250 260 >>CCDS6238.1 CA3 gene_id:761|Hs108|chr8 (260 aa) initn: 566 init1: 173 opt: 640 Z-score: 765.2 bits: 149.4 E(32554): 2.7e-36 Smith-Waterman score: 640; 37.2% identity (68.4% similar) in 269 aa overlap (28-290:4-260) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MADLSFIEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGY--EEGVE-WGLVFPDANGEYQSPINLNSR :::: ..: . : .::.:.:: :::..:... CCDS62 MAKEWGYASHNGPDHWHELFPNAKGENQSPVELHTK 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 EARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKS---KSVLSGGPLPQGHEFELYE . :.:::: .: . . . :.:.: .:.. . .:.: ::::: ..: . CCDS62 DIRHDPSLQPWSVSYDGGSAKT--ILNNGKTCRVVFDDTYDRSMLRGGPLPG--PYRLRQ 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 VRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGK ..::: ...::::::. . ::::.::: .... ::. . :::.:..:..::. CCDS62 FHLHWGSSDDHGSEHTVDGVKYAAELHLVHWNPK-YNTFKEALKQRDGIAVIGIFLKIGH 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWI :. .. . :. :. ::: . :.:. :.: ::::.:.::.: ::: : ..:. CCDS62 ENGEFQIFLDALDKIKTKGKEAPFTKFDPSCLFPA--CRDYWTYQGSFTTPPCEECIVWL 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ :.. :.:.:. :. ..: : . ... : : .:.:: ::...::.::.:. CCDS62 LLKEPMTVSSDQMAKLRSLLSSAENEPPVP-----LVSNWRPPQPINNRVVRASFK 210 220 230 240 250 260 >>CCDS14171.1 CA5B gene_id:11238|Hs108|chrX (317 aa) initn: 587 init1: 292 opt: 620 Z-score: 740.0 bits: 145.0 E(32554): 6.7e-35 Smith-Waterman score: 620; 39.4% identity (69.9% similar) in 249 aa overlap (46-290:61-297) 20 30 40 50 60 70 pF1KE6 KEEDEEEEEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREARYDPSLLDVRLSPNYV :. :::::. :.. :::.: . .: . . CCDS14 ARPCSLYTCTYKTRNRALHPLWESVDLVPGGDRQSPINIRWRDSVYDPGLKPLTISYDPA 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE6 VCRDCEVTNDGHTIQVILKS---KSVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWGRENQRGSEHTVN .: .: :.:... : ... :::..:::: :...: . .:::: . ::::::. CCDS14 TC--LHVWNNGYSFLVEFEDSTDKSVIKGGPLE--HNYRLKQFHFHWGAIDAWGSEHTVD 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 pF1KE6 FKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLKAVTEILQDIQYK : :: ::::.:::.. : ....:. . .:.:.:..:...::.: :. ... : .:..: CCDS14 SKCFPAELHLVHWNAVRFENFEDAALEENGLAVIGVFLKLGKHHKELQKLVDTLPSIKHK 150 160 170 180 190 200 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 GKSKTIPCFNPNTLLPD-PLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWILFRYPLTISQLQIEEFR . :.:. :.: : :::.: :::: :: ::.::::. . :. ... :.:.:: CCDS14 DALVEFGSFDPSCLMPTCP---DYWTYSGSLTTPPLSESVTWIIKKQPVEVDHDQLEQFR 210 220 230 240 250 260 260 270 280 290 pF1KE6 RLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ : .: . . . ::::: ::: .:..:..:. CCDS14 TLLFTSEGEK-----EKRMVDNFRPLQPLMNRTVRSSFRHDYVLNVQAKPKPATSQATP 270 280 290 300 310 >>CCDS42173.1 CA7 gene_id:766|Hs108|chr16 (208 aa) initn: 624 init1: 332 opt: 612 Z-score: 733.6 bits: 143.2 E(32554): 1.5e-34 Smith-Waterman score: 612; 42.0% identity (73.1% similar) in 212 aa overlap (82-290:5-207) 60 70 80 90 100 pF1KE6 INLNSREARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKS---KSVLSGGPLPQGH .::.::..:: ... ..:..:::: .: CCDS42 MSLSITNNGHSVQVDFNDSDDRTVVTGGPL-EG- 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 EFELYEVRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIAL ..: . .::::.... ::::::. :.:: ::::.:::. .... ::.. : :.:.... CCDS42 PYRLKQFHFHWGKKHDVGSEHTVDGKSFPSELHLVHWNAKKYSTFGEAASAPDGLAVVGV 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 FVQIGKEHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCS :.. : :: ... .:. : ...:: . . ::::. ::: : ::.: :::: :: : CCDS42 FLETGDEHPSMNRLTDALYMVRFKGTKAQFSCFNPKCLLPAS--RHYWTYPGSLTTPPLS 100 110 120 130 140 150 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 EGVTWILFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAA :.::::..: :. ::. :. .:: : . : .. . .:::: :::. ::..:. CCDS42 ESVTWIVLREPICISERQMGKFRSLLFTSEDDERIH-----MVNNFRPPQPLKGRVVKAS 160 170 180 190 200 290 pF1KE6 FQ :. CCDS42 FRA >>CCDS10965.1 CA5A gene_id:763|Hs108|chr16 (305 aa) initn: 582 init1: 302 opt: 607 Z-score: 724.9 bits: 142.1 E(32554): 4.7e-34 Smith-Waterman score: 607; 38.9% identity (65.8% similar) in 257 aa overlap (37-290:52-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 IEDTVAFPEKEEDEEEEEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREARYDPSLL : . .: :::::.. :.. :::.: CCDS10 PLWSRSMRPGRWCSQRSCAWQTSNNTLHPLWTVPVSVPGGTRQSPINIQWRDSVYDPQLK 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 DVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKSK---SVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWGREN .:.: . . : . : :. .:: . . : .::::: ..: ..: . .:::: : CCDS10 PLRVSYEAASC--LYIWNTGYLFQVEFDDATEASGISGGPL-ENH-YRLKQFHFHWGAVN 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 QRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLKAVT . ::::::. .:.: ::::.::::. . . ::: .:.:.:..:...: .: :. .. 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