FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6288, 784 aa 1>>>pF1KB6288 784 - 784 aa - 784 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2643+/-0.000539; mu= -15.7608+/- 0.034 mean_var=721.7074+/-163.001, 0's: 0 Z-trim(119.8): 965 B-trim: 0 in 0/59 Lambda= 0.047741 statistics sampled from 32830 (34191) to 32830 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16 Scan time: 14.730 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003103 (OMIM: 600540) transcription factor Sp4 ( 784) 5031 362.9 3e-99 NP_001313471 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 767) 4932 356.1 3.3e-97 XP_005249885 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 767) 4932 356.1 3.3e-97 XP_011513788 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 711) 4529 328.3 7.2e-89 XP_005249886 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 706) 4500 326.3 2.9e-88 XP_016868046 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 661) 3998 291.7 7.1e-78 XP_011513791 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 562) 3486 256.3 2.6e-67 XP_011513789 (OMIM: 600540) PREDICTED: transcripti ( 572) 3478 255.8 3.9e-67 NP_001313472 (OMIM: 600540) transcription factor S ( 471) 3067 227.4 1.1e-58 NP_001238754 (OMIM: 189906) transcription factor S ( 737) 1120 93.5 3.6e-18 XP_011536998 (OMIM: 189906) PREDICTED: transcripti ( 778) 1117 93.3 4.2e-18 NP_003100 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 ( 778) 1117 93.3 4.2e-18 NP_612482 (OMIM: 189906) transcription factor Sp1 ( 785) 1117 93.3 4.3e-18 NP_001017371 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 713) 1048 88.5 1.1e-16 NP_001166183 (OMIM: 601804) transcription factor S ( 778) 1048 88.6 1.1e-16 NP_003102 (OMIM: 601804) transcription factor Sp3 ( 781) 1048 88.6 1.1e-16 XP_011523441 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 727) 792 70.9 2.2e-11 XP_011523439 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 768) 787 70.6 2.9e-11 XP_006722086 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 667) 783 70.2 3.2e-11 XP_011523440 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 760) 784 70.4 3.4e-11 XP_006722090 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_016880458 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_006722089 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_006722088 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_011523445 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_016880457 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 XP_011523444 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 660) 782 70.1 3.4e-11 NP_003101 (OMIM: 601801) transcription factor Sp2 ( 613) 781 70.0 3.4e-11 XP_011523438 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 771) 784 70.4 3.4e-11 XP_011523442 (OMIM: 601801) PREDICTED: transcripti ( 717) 782 70.2 3.6e-11 XP_011509461 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 454) 767 68.9 5.4e-11 NP_001003845 (OMIM: 609391) transcription factor S ( 398) 746 67.4 1.4e-10 XP_005246599 (OMIM: 609391) PREDICTED: transcripti ( 442) 746 67.5 1.5e-10 NP_945194 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8 ( 490) 663 61.8 8.2e-09 NP_874359 (OMIM: 608306) transcription factor Sp8 ( 508) 663 61.8 8.4e-09 XP_011536202 (OMIM: 606633,613849) PREDICTED: tran ( 413) 618 58.6 6.3e-08 NP_001287766 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 413) 618 58.6 6.3e-08 NP_001166938 (OMIM: 606633,613849) transcription f ( 431) 618 58.6 6.5e-08 NP_690599 (OMIM: 606633,613849) transcription fact ( 431) 618 58.6 6.5e-08 NP_954871 (OMIM: 608613) transcription factor Sp6 ( 376) 582 56.1 3.3e-07 XP_006722178 (OMIM: 608613) PREDICTED: transcripti ( 376) 582 56.1 3.3e-07 NP_001245177 (OMIM: 608613) transcription factor S ( 376) 582 56.1 3.3e-07 NP_057079 (OMIM: 605328,612001) Krueppel-like fact ( 288) 496 50.0 1.7e-05 NP_001027453 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 1 ( 469) 471 48.5 7.6e-05 NP_005646 (OMIM: 601878) Krueppel-like factor 10 i ( 480) 471 48.6 7.7e-05 NP_001197 (OMIM: 602902) Krueppel-like factor 9 [H ( 244) 458 47.3 9.4e-05 NP_114124 (OMIM: 606139) Krueppel-like factor 16 [ ( 252) 451 46.8 0.00013 NP_001171189 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 452 47.3 0.0002 NP_001171187 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like f ( 495) 452 47.3 0.0002 NP_003588 (OMIM: 603301,610508) Krueppel-like fact ( 512) 452 47.3 0.0002 >>NP_003103 (OMIM: 600540) transcription factor Sp4 isof (784 aa) initn: 5031 init1: 5031 opt: 5031 Z-score: 1902.8 bits: 362.9 E(85289): 3e-99 Smith-Waterman score: 5031; 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