Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2479
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2479, 848 aa
1>>>pF1KE2479 848 - 848 aa - 848 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2695+/-0.00131; mu= 15.9199+/- 0.078
mean_var=85.9747+/-17.074, 0's: 0 Z-trim(102.1): 63 B-trim: 48 in 1/49
Lambda= 0.138321
statistics sampled from 6737 (6794) to 6737 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 5556 1119.7 0
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 5556 1119.7 0
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 4519 912.7 0
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 3832 775.7 0
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 2767 563.1 6.9e-160
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 2447 499.2 1.1e-140
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 803 171.2 6.8e-42
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 803 171.2 6.8e-42
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 803 171.2 7.2e-42
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 803 171.2 7.8e-42
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 803 171.2 7.8e-42
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 786 167.8 8.2e-41
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 747 160.0 1.5e-38
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 747 160.0 1.5e-38
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 483 107.3 1.1e-22
>>CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (848 aa)
initn: 5556 init1: 5556 opt: 5556 Z-score: 5991.5 bits: 1119.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5556; 100.0% identity (100.0% similar) in 848 aa overlap (1-848:1-848)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 IAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 YYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 MRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 RLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKL
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NPSMLRCE
::::::::
CCDS37 NPSMLRCE
>>CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 (921 aa)
initn: 5556 init1: 5556 opt: 5556 Z-score: 5991.0 bits: 1119.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5556; 100.0% identity (100.0% similar) in 848 aa overlap (1-848:74-921)
10 20 30
pF1KE2 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGGLEPRSAPSQREPHGYCPPPFSHGPDLSMEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFN
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVT
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAY
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSH
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 SRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFV
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 VGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHA
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 ASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMW
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 SECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDL
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 SEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISL
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSE
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 VTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARS
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 KLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLN
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 LFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LFTQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQD
830 840 850 860 870 880
820 830 840
pF1KE2 ISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
890 900 910 920
>>CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 (862 aa)
initn: 2788 init1: 2426 opt: 4519 Z-score: 4873.0 bits: 912.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4519; 81.1% identity (92.5% similar) in 841 aa overlap (8-844:12-849)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVR
:: :..::::::::.::::.:::..::::: :::::::.::::::::::
CCDS47 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 KMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVR
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS47 KMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 IVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVV
:::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::: ::::::::::::.::.:
CCDS47 IVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 HMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVL
:.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.:::::::: ::::::::::::
CCDS47 HILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEP
::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..
CCDS47 TALELSNELARLANIETEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDTEEVEAILNGDVNFQ--
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVV
. .:. ::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.:.::.: :.:. :
CCDS47 VWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPN
..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: ::::::: ::::::::. ::::
CCDS47 SIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVAHAVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 ITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGM
: :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.: ::::::.:.:::.:::::
CCDS47 ETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQI
::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.::::. ::::::::: ::::::
CCDS47 LSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::
CCDS47 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 ILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNV
::::: ::: : :::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
CCDS47 NLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 TMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSF
:::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::::::::.:.::: ::.::::::::
CCDS47 TMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 VYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQP
:.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . . :.. : :. . :. :..:
CCDS47 YYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-QAGMRNSENLTANNTLSKP
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 TRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAIL
::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::: :
CCDS47 TRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADL
780 790 800 810 820 830
840
pF1KE2 IHKLSEKLNPSMLRCE
:..::::.. ..
CCDS47 IQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
840 850 860
>>CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 (931 aa)
initn: 4189 init1: 2192 opt: 3832 Z-score: 4131.6 bits: 775.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4158; 73.3% identity (88.7% similar) in 858 aa overlap (8-841:67-921)
10 20 30
pF1KE2 MEGSPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLT
::.::.:::::: : ::::.::.::.:::.
CCDS83 ELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLAHRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 AEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESKTLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKE
::::::::::::::::::::::: ..::::::::::::::::::.:::::.::::::::
CCDS83 IEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVDYMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKE
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 NLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRF
::.:.::::::::::::::::::::.::.:: .:::. :: ..:::.:::::::::::::
CCDS83 NLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATSPSQSELQQDDFYAYDEDGTRF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINA
: :.::::::::::.::.:: :: :::::::::::::::.:: .::.:::::::::::::
CCDS83 SHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQKQKHDSFSHSRSRINA
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 YKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLC
::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::::::::.::::::::::::.::::
CCDS83 YKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQCKDFVVGLLDLC
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 RDSEEVEAILNGDLESAEPLEVHRH-KASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYE
:..::::::::::.:. :. : . .:::.::::::::::::::::::::::.::::
CCDS83 RNTEEVEAILNGDVET---LQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSIWYE
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIF
::::::.::.:.: ::::.::.::::::. ::.::::..:::.:.:::::::::::: ::
CCDS83 NLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LGLLVFNASDRFEGITTLPNITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKEL
:::::.::.::::: ::: : :: ::.::.::. :.: ::::. ::.::.:.::::.
CCDS83 LGLLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEI
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460 470 480 490 500 510
pF1KE2 WLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLP
: .::.::...:::.::::::.:: :.: :::.:: .:.:::. .:. .::..:::
CCDS83 WTQGPKEYLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLG
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 PEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKD
...:.. :: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DNVKYYNLARIKWDPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKD
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 IFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVL
::::::.::::: ::::::: :::::.::: : ::::::::::::::.::::::: :::.
CCDS83 IFKFMVIFIMVFVAFMIGMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVI
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640 650 660 670 680 690
pF1KE2 KYDHKFIENIGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSY
.:.:::::::::::::.::::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.:::.::
CCDS83 NYNHKFIENIGYVLYGVYNVTMVIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSY
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700 710 720 730 740 750
pF1KE2 FDDGKTLPPPFSLVPSPKSFVYFIMR----IVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLF
:..:.::: ::.:::::::. :.... : .. . ... .:.: ::. : ...:...
CCDS83 FEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKLKKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGIL
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760 770 780 790
pF1KE2 -------------------TQSNSRVFESHSFNSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVD
: . : :. .::. : : .::.:::::::::::.::.:
CCDS83 GSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHLNSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQID
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800 810 820 830 840
pF1KE2 KENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
::.::::::::::::::::::::::::.::: ::.:: ::..:.:::.
CCDS83 KESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLAELIRELGEKLSMEPNQEETNR
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:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS54 KMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVR
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pF1KE2 IVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVV
:::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::: ::::::::::::.::.:
CCDS54 IVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIV
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:.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.:::::::: ::::::::::::
CCDS54 HILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVL
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240 250 260 270 280 290
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::::::::::.::::: :::
CCDS54 TALELSNELARLANIETEFK----------------------------------------
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:::::::::::::.:::::::::.:.::.: :.:. :
CCDS54 -----------------------FVAHPNCQQQLLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGV
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..:::::::.:::::::.::. ::::::::::::.:: ::::::: ::::::::. ::::
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: :::::::::::::::.::::::: :::::.::::::.: ::::::.:.:::.:::::
CCDS54 ETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSECKEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGM
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::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.::::. ::::::::: ::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::
CCDS54 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMF
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pF1KE2 ILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNV
::::: ::: : :::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 NLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNV
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pF1KE2 TMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSF
:::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::::::::.:.::: ::.::::::::
CCDS54 TMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSF
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pF1KE2 VYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQP
:.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . . :.. : :. . :. :..:
CCDS54 YYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-QAGMRNSENLTANNTLSKP
660 670 680 690 700 710
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pF1KE2 TRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAIL
::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::: :
CCDS54 TRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADL
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840
pF1KE2 IHKLSEKLNPSMLRCE
:..::::.. ..
CCDS54 IQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
780 790 800
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:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS54 KMLEESKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVR
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 IVEAILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVV
:::::::::.:: ..:::::: ::::.::::::::::::::: ::::::::::::.::.:
CCDS54 IVEAILNHPAFAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIV
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pF1KE2 HMLLMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVL
:.::.:::::::::::::::..: ::::.:::::::::.:::::::: ::::::::::::
CCDS54 HILLLKGARIERPHDYFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVL
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pF1KE2 TALELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEP
::::::::::.::::: :::
CCDS54 TALELSNELARLANIETEFK----------------------------------------
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pF1KE2 LEVHRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVV
CCDS54 ------------------------------------------------------------
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::::.:.:::::.:::.::.:: :::..::.. : .:.::::. ::::::::: ::::::
CCDS54 LSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPPEVAYFTYARDKWWPSDPQI
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pF1KE2 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::
CCDS54 ISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMIGMF
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pF1KE2 ILYSYYLGAKVNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYVLYGIYNV
::::: ::: : :::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 NLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGYVLYGVYNV
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pF1KE2 TMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSLVPSPKSF
:::::::::::::::.::::::.:.::::::::.::::::::.:.::: ::.::::::::
CCDS54 TMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSPKSF
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720 730 740 750 760 770
pF1KE2 VYFIMRI----VNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSILNQP
:.:::: ... : . . ..:.:::: ::: . . . :.. : :. . :. :..:
CCDS54 YYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRY-QAGMRNSENLTANNTLSKP
610 620 630 640 650 660
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 TRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEELAIL
::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::: ::: :
CCDS54 TRYQKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADL
670 680 690 700 710 720
840
pF1KE2 IHKLSEKLNPSMLRCE
:..::::.. ..
CCDS54 IQQLSEKFGKNLNKDHLRVNKGKDI
730 740
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pF1KE2 SPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESK
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CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAE
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pF1KE2 T---LNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
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CCDS45 IYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFN--VYVGDALLHAIRKEVVGAVEL
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pF1KE2 ILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLL
.::: .. :.. : : : .: ..:.::::::::::: ..::....:.
CCDS45 LLNHKKPSGEKQVP--PI---LLDKQF-------SEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLV
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pF1KE2 MKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALE
.::. . :::. :.: .:. .. ::. :::::.: ::.::::. ..:::::: :::..
CCDS45 QKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQ
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pF1KE2 LSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVH
:: :: .:...:.:::..:..:: :::.:. .:: :.:.:.: ::: .. . : .
CCDS45 LSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILN--YRDDNSLIEE
230 240 250 260 270 280
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pF1KE2 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
. .:.:.::::::. :.:::.::::: : . ::... : :.. :.: .. ....: .
CCDS45 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
290 300 310 320 330 340
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pF1KE2 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVT
: ... : ::: : :: ..:.::.::. :.::.. :: ::.. .. .: .
CCDS45 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQ----------HIDRS
350 360 370 380 390
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pF1KE2 DYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIF
: .: : .: .:. ::::..:.: :..: : ..:: . ::..:: : :..
CCDS45 DLNRQ-----GPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLY
400 410 420 430 440
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pF1KE2 IAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEG
.:... ...::.. . .: : :..: : ...:.
CCDS45 LATISLKIVAFVKYS------------------ALNP--------RESWDMWHPTLVAEA
450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYS
:.::: ..: :. .. :: .::::::::: . ::.::. .. .:..:: :. ::
CCDS45 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 YYLGAK-----------VNAAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVTSVVLKYDHKFIENIGYV
:: .: : ::.:. :....:::::::: .. . .: .:.: : .: .
CCDS45 YYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGAT
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 LYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSL
..: ::: .::::::::::.:.::: :
CCDS45 MFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIARRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRD
600 610 620 630 640 650
>>CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (836 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 SPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESK
. :. :. .:.:.: :. :.: :::..
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAE
10 20 30 40 50
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pF1KE2 T---LNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
.:.::.: .:..:: .:. ::.::. ::::. . . .::::: :: : : ::
CCDS45 IYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFN--VYVGDALLHAIRKEVVGAVEL
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