Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5783
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5783, 681 aa
  1>>>pF1KE5783 681 - 681 aa - 681 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7171+/-0.000969; mu= 9.1204+/- 0.059
 mean_var=135.1426+/-27.170, 0's: 0 Z-trim(109.9): 36  B-trim: 49 in 1/50
 Lambda= 0.110326
 statistics sampled from 11196 (11218) to 11196 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.345), width:  16
 Scan time:  3.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47897.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8         ( 681) 4585 741.5 9.2e-214
CCDS47898.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8         ( 677) 4533 733.2 2.8e-211
CCDS47895.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8         ( 659) 4364 706.3 3.5e-203
CCDS47896.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8         ( 608) 4070 659.5 3.9e-189
CCDS10863.1 ESRP2 gene_id:80004|Hs108|chr16        ( 717) 2636 431.3 2.3e-120
CCDS47070.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4          ( 318)  356 68.2   2e-11


>>CCDS47897.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8              (681 aa)
 initn: 4585 init1: 4585 opt: 4585  Z-score: 3951.2  bits: 741.5 E(32554): 9.2e-214
Smith-Waterman score: 4585; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
              610       620       630       640       650       660

              670       680 
pF1KE5 EDGLIHTNDQARTLPKEWVCI
       :::::::::::::::::::::
CCDS47 EDGLIHTNDQARTLPKEWVCI
              670       680 

>>CCDS47898.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8              (677 aa)
 initn: 3665 init1: 3665 opt: 4533  Z-score: 3906.5  bits: 733.2 E(32554): 2.8e-211
Smith-Waterman score: 4533; 99.4% identity (99.4% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-677)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
       :::::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSPPPC----LSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
                  550       560       570       580       590      

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
        600       610       620       630       640       650      

              670       680 
pF1KE5 EDGLIHTNDQARTLPKEWVCI
       :::::::::::::::::::::
CCDS47 EDGLIHTNDQARTLPKEWVCI
        660       670       

>>CCDS47895.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8              (659 aa)
 initn: 3665 init1: 3665 opt: 4364  Z-score: 3761.3  bits: 706.3 E(32554): 3.5e-203
Smith-Waterman score: 4364; 99.4% identity (99.4% similar) in 657 aa overlap (1-657:1-653)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
       :::::::    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSPPPC----LSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
                  550       560       570       580       590      

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS47 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQCLK
        600       610       620       630       640       650      

              670       680 
pF1KE5 EDGLIHTNDQARTLPKEWVCI
                            
CCDS47 DVW                  
                            

>>CCDS47896.1 ESRP1 gene_id:54845|Hs108|chr8              (608 aa)
 initn: 4070 init1: 4070 opt: 4070  Z-score: 3509.0  bits: 659.5 E(32554): 3.9e-189
Smith-Waterman score: 4070; 100.0% identity (100.0% similar) in 607 aa overlap (1-607:1-607)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVVDLANKKVGQLHEVLVRPDQLEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNIGVGTSFCLCTDGQLHVRQILHP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDVATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGIL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATIEDILDFLGEFATDIRTHGVHMV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYVEVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLSPPPCKLPCLSPPSYTFPAPAAVIPTEAAIYQPSVILNPRALQPSTAYYPAGTQLFMN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE5 YTAYYPSPPGSPNSLGYFPTAANLSGVPPQPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYAT
       :::::::                                                     
CCDS47 YTAYYPSV                                                    
                                                                   

>>CCDS10863.1 ESRP2 gene_id:80004|Hs108|chr16             (717 aa)
 initn: 2696 init1: 1779 opt: 2636  Z-score: 2274.3  bits: 431.3 E(32554): 2.3e-120
Smith-Waterman score: 2785; 60.2% identity (82.1% similar) in 694 aa overlap (5-681:27-717)

                                     10        20        30        
pF1KE5                       MTASPDYLVVLFGITAGATGAKLGSDEKELILLFWKVV
                                 :  :::::: :::: :  ::::: .:::: :.::
CCDS10 MTPPPPPPPPPGPDPAADPAADPCPWPGSLVVLFGATAGALGRDLGSDETDLILLVWQVV
               10        20        30        40        50        60

       40        50        60        70        80        90        
pF1KE5 DLANKKVGQLHEVLVRPDQLELTEDCKEETKIDVESLSSASQLDQALRQFNQSVSNELNI
       .  ...:: ::. ::: .   :. .:.: . ....::. :  ::..:.::.: :.... .
CCDS10 EPRSRQVGTLHKSLVRAEAAALSTQCREASGLSADSLARAEPLDKVLQQFSQLVNGDVAL
               70        80        90       100       110       120

      100       110       120       130       140       150        
pF1KE5 GVGTSFCLCTDGQLHVRQILHPEASKKNVLLPECFYSFFDLRKEFKKCCPGSPDIDKLDV
         :  . ::::::  .::.::::::.::..::. :.::.:::.::.   :..     : :
CCDS10 LGGGPYMLCTDGQQLLRQVLHPEASRKNLVLPDMFFSFYDLRREFHMQHPSTCPARDLTV
              130       140       150       160       170       180

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE5 ATMTEYLNFEKSSSVSRYGASQVEDMGNIILAMISEPYNHRFSDPERVNYKFESGTCSKM
       :::.. :..: ... . .:. .:. :  .:: ...:: .. :: :: .. :.:.: ::: 
CCDS10 ATMAQGLGLETDATEDDFGVWEVKTMVAVILHLLKEPSSQLFSKPEVIKQKYETGPCSKA
              190       200       210       220       230       240

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE5 ELIDDNTVVRARGLPWQSSDQDIARFFKGLNIAKGGAALCLNAQGRRNGEALVRFVSEEH
       ...:..::::::::::::::::.::::::::.:.::.:::::::::::::::.:::. :.
CCDS10 DVVDSETVVRARGLPWQSSDQDVARFFKGLNVARGGVALCLNAQGRRNGEALIRFVDSEQ
              250       260       270       280       290       300

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE5 RDLALQRHKHHMGTRYIEVYKATGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQVIVRMRGLPFTAT
       :::::::::::::.:::::::::::.:.::::::: :::.:::.:.:::.:.:::::.: 
CCDS10 RDLALQRHKHHMGVRYIEVYKATGEEFVKIAGGTSLEVARFLSREDQVILRLRGLPFSAG
              310       320       330       340       350       360

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE5 AEEVVAFFGQHCPITGGKEGILFVTYPDGRPTGDAFVLFACEEYAQNALRKHKDLLGKRY
         .:..:.: .::.::: ::.::: .::::::::::.:::::: :: :::.:: .:::::
CCDS10 PTDVLGFLGPECPVTGGTEGLLFVRHPDGRPTGDAFALFACEELAQAALRRHKGMLGKRY
              370       380       390       400       410       420

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE5 IELFRSTAAEVQQVLNRFSSAPLIPLPTPPIIPVLPQQFVPPTNVRDCIRLRGLPYAATI
       :::::::::::::::::..:.::.:  : :..:. :  ..: :. :::.:::::::.:::
CCDS10 IELFRSTAAEVQQVLNRYASGPLLPTLTAPLLPI-PFPLAPGTG-RDCVRLRGLPYTATI
              430       440       450        460        470        

      460       470       480       490       500       510        
pF1KE5 EDILDFLGEFATDIRTHGVHMVLNHQGRPSGDAFIQMKSADRAFMAAQKCHKKNMKDRYV
       ::::.:::: :.::: ::::::::.:::::::::::: ::.::. :::.:::: ::.:::
CCDS10 EDILSFLGEAAADIRPHGVHMVLNQQGRPSGDAFIQMTSAERALAAAQRCHKKVMKERYV
      480       490       500       510       520       530        

      520       530       540       550        560       570       
pF1KE5 EVFQCSAEEMNFVLMGGTLNRNGLSPPPCKLPCLSPPSYT-FPAPAAVIPTEAAIYQPSV
       ::  ::.:::. :::::::.:.:.:::::::::::::.:: : :  ..::::.:   :: 
CCDS10 EVVPCSTEEMSRVLMGGTLGRSGMSPPPCKLPCLSPPTYTTFQATPTLIPTETAALYPSS
      540       550       560       570       580       590        

       580           590        600       610         620          
pF1KE5 ILNPRALQPST----AYYPA-GTQLFMNYTAYYPSPPGSPNSLGYF--PTAANLSGVPP-
        : : :  :..    ::::. .:::..:::::::::: ::...::.  :::: :...:  
CCDS10 ALLPAARVPAAPTPVAYYPGPATQLYLNYTAYYPSPPVSPTTVGYLTTPTAA-LASAPTS
      600       610       620       630       640       650        

        630       640       650       660         670          680 
pF1KE5 ---QPGTVVRMQGLAYNTGVKEILNFFQGYQYATED--GLIHTNDQARTL---PKEWVCI
          : :..:::::. :..:.:..:. ::.::  ..:  .:. ..:  ::.   ::::::.
CCDS10 VLSQSGALVRMQGVPYTAGMKDLLSVFQAYQLPADDYTSLMPVGDPPRTVLQAPKEWVCL
       660       670       680       690       700       710       

>>CCDS47070.1 GRSF1 gene_id:2926|Hs108|chr4               (318 aa)
 initn: 409 init1: 154 opt: 356  Z-score: 318.4  bits: 68.2 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 401; 28.5% identity (57.1% similar) in 326 aa overlap (239-524:2-313)

      210       220       230       240       250         260      
pF1KE5 KFESGTCSKMELIDDNTVVRARGLPWQSSDQDIARFFKGLNIAKG--GAALCLNAQGRRN
                                     .:.  ::.   : .:  :  . :: .:.: 
CCDS47                              MEDVLNFFSDCRIRNGENGIHFLLNRDGKRR
                                            10        20        30 

        270       280       290       300       310       320      
pF1KE5 GEALVRFVSEEHRDLALQRHKHHMGTRYIEVYKATGEDFLKIAGGTSNEVAQFLSKENQV
       :.::... ::.  . ::..:. .:: ::.:::. ..::   .  . . . .  .   :. 
CCDS47 GDALIEMESEQDVQKALEKHRMYMGQRYVEVYEINNEDVDALMKSLQVKSSPVV---NDG
              40        50        60        70        80           

        330       340       350       360        370       380     
pF1KE5 IVRMRGLPFTATAEEVVAFFGQHCPITGGKEGILFVT-YPDGRPTGDAFVLFACEEYAQN
       .::.::::.. . ...: ::.    .      : ::  :   : ::.:.: :   :.:..
CCDS47 VVRLRGLPYSCNEKDIVDFFAGLNIVD-----ITFVMDYRGRRKTGEAYVQFEEPEMANQ
       90       100       110            120       130       140   

         390       400       410       420             430         
pF1KE5 ALRKHKDLLGKRYIELFRSTAAEVQQVLNRFSSAPLIPLPT------PPII---------
       :: ::.. .:.::::.: :   ::.  .. ...  .  .::      : ..         
CCDS47 ALLKHREEIGNRYIEIFPSRRNEVRTHVGSYKGKKIASFPTAKYITEPEMVFEEHEVNED
           150       160       170       180       190       200   

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