FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4054, 305 aa 1>>>pF1KE4054 305 - 305 aa - 305 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9206+/-0.00108; mu= 12.4200+/- 0.064 mean_var=87.0621+/-17.454, 0's: 0 Z-trim(104.6): 106 B-trim: 36 in 1/49 Lambda= 0.137455 statistics sampled from 7887 (7996) to 7887 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 2.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 2073 421.3 4.6e-118 CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 1191 246.4 2.5e-65 CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 887 186.2 3.7e-47 CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 830 174.9 9.7e-44 CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 691 147.3 2e-35 CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 653 139.8 3.4e-33 CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 609 131.0 1.4e-30 CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 609 131.0 1.5e-30 >>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 (305 aa) initn: 2073 init1: 2073 opt: 2073 Z-score: 2233.0 bits: 421.3 E(32554): 4.6e-118 Smith-Waterman score: 2073; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQVGNEITSELGESG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQVGNEITSELGESG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 VFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 EKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 EKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 RMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCKC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 LRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCKC 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 DILKT ::::: CCDS47 DILKT >>CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 (376 aa) initn: 1149 init1: 728 opt: 1191 Z-score: 1286.4 bits: 246.4 E(32554): 2.5e-65 Smith-Waterman score: 1191; 55.4% identity (81.0% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQVGNEITSELGESG : .:.. ....:: :...:.. :.: ....: :..::.:.:::.. :::::.: CCDS57 MHLLKVGTWRNNTASSWLMKFSVLWLVSQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 VFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAA ::: : :.::.::.. ::: ::::.: : ::: : ...:::::::::::::.::.::. CCDS57 VFGRSSTLKRVAGVIVPPEGKIQNACNPNTIFSRSKYSETWLALIERGGCTFTQKIKVAT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 EKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVG ::::.:::::: :::..:::: ::. :..:.:::.:::: ::.: :.::: .:...::: CCDS57 EKGASGVIIYNVPGTGNQVFPMFHQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 RMHMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLT-PRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQL : :. :..::.. . .::.::: . . :: :. : :: ... ::..... :: CCDS57 RKHIIWMNHYLVSFVIVTTATLAYFIFYHIHRLCLARIQN---RRWQRLTTDLQNTFGQL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCK ::::.::::::.. : :.::.::. :::.:.:::::::::::: :::::.: : :::.:: CCDS57 QLRVVKEGDEEINPNGDSCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICK 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 CDILKT ::::: CCDS57 CDILKVLGIQVVVENGTEPLQVLMSNELPETLSPSEEETNNEVSPAGTSDKVIHVEENPT 300 310 320 330 340 350 >>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa) initn: 838 init1: 428 opt: 887 Z-score: 960.2 bits: 186.2 E(32554): 3.7e-47 Smith-Waterman score: 887; 48.4% identity (78.4% similar) in 273 aa overlap (39-304:29-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 STHSSVSSGLLRLSIFLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITF--QVGNEITSELGESGVFGNHS .:....:. ...: . : : ::.: : CCDS14 MNQENRSSFFWLLVIFTFLLKITASFSMSAYVTVTYYNETSNYTAIETCECGVYGLAS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PLERVSGVVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLALIERGGCTFTHKINVAAEKGANG :. . :::..:.. : .:: :.:: :. :.::::::.:::..::..:....:.. CCDS14 PVANAMGVVGIPKNNNYQACDHNTEFSNTKK--PWIALIERGNCTFSEKIQTAGRRNADA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 VIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQKGVYVTVIIEVGRMHMQW :.::: ::.... :.. :. .:::.::.:::: .::.:::.:. ::..::::. : : CCDS14 VVIYNAPETGNQTIQMANFGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 VSHYIMYL-----FTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQL :.:: ... : . :::..:: . . :: : . .:.. :.:.:.:::: .::: CCDS14 VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRL--RNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 RVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCD :.::.::.:. . :.:.::.. :::.:.::::::.:.:::.:.::::: :::::::::: CCDS14 RTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCD 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ILKT ::: CCDS14 ILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEH 300 310 320 330 340 350 >>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa) initn: 1001 init1: 428 opt: 830 Z-score: 898.7 bits: 174.9 E(32554): 9.7e-44 Smith-Waterman score: 1003; 51.3% identity (76.3% similar) in 308 aa overlap (16-304:18-323) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLS--FPDSNG-KAIWTAHLNITFQVG----NE : :: ..: :: : : : .:.:::.::....: :. CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLLALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVNR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE4 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALPEGWNQ-NACHPLTNFSRPKQADS-----WLALI . ::.: ::.:. :::: :.::.. :.: . :::.: :::. : : ::::: CCDS14 TVWELSEEGVYGQDSPLEPVAGVLVPPDGPGALNACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSWLALI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ERGG-CTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEIL .::: :::. ::..: :.::.:..:.:. :: ..:.:::: :. .:::.::.:::: .:: CCDS14 QRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKGTKIL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 HSIQKGVYVTVIIEVGRMHMQWVSHYIMYL-----FTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVPN .:::.:. ::..::::. : ::.:: ... : . :::..:: . . :: : CCDS14 QSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPWVNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRL--RNAR 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 SFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHF . .:.. :.:.:.:::: .::::.::.::.:. . :.:.::.. :::.:.::::::.:. CCDS14 AQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTCNHI 240 250 260 270 280 290 280 290 300 pF1KE4 FHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT :::.:.::::: ::::::::::::: CCDS14 FHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEEDNR 300 310 320 330 340 350 >>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa) initn: 624 init1: 375 opt: 691 Z-score: 749.6 bits: 147.3 E(32554): 2e-35 Smith-Waterman score: 693; 36.9% identity (66.9% similar) in 314 aa overlap (13-304:13-324) 10 20 30 40 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSI--FLLLSFPDSNGKAIWTAHLNITFQV---------- ..:. :: . . .: :.: .. . .:: .:::. CCDS34 MAMSLIQACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAA 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ---GNEITSELGESGVFGNHSPLERVSG-VVALPEGWNQNACHPLTNFSRPKQADSWLAL : :. .: : : .:.::: . . : :: . .. :: : :.:. : .. .:.:: CCDS34 GGGGAELHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAHDRLACDPNTKFAAPTRGKNWIAL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 IERGGCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEIL : .:.::. :: : ..:..:.:.: .. .... : : :.:.:::.:: . :: ::. CCDS34 IPKGNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 HSIQKGVYVTVIIEVGRMHMQ-WVSH----YIMYLF-TFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVP ..... ::. : .: ..: .::. .. : ... ..:.. . . :. : CCDS34 SLLERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRF--RYA 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 NSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKH :. : . .. .::::..::.:..:.::.: . . :::.::.. :::.:::::: :.: CCDS34 NARDRNQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 pF1KE4 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT .:::.:.::::: :::::::: .::: CCDS34 LFHKSCVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGAS 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa) initn: 664 init1: 338 opt: 653 Z-score: 709.5 bits: 139.8 E(32554): 3.4e-33 Smith-Waterman score: 737; 41.4% identity (69.1% similar) in 307 aa overlap (17-304:14-315) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLL-LSFPDSNGKAI-W-TAHLNITF---QVGNEITS :.: :... : : : . :.:. : .: .:: . :.. . : CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCVPGARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ELGESGVFGNHSPLERVSGVVALP--EGWNQNACHPLTNFSRP----KQADSWLALIERG ..::: ::. :: : . :.:..: : . ..: : : : : . : :.::. :: CCDS20 -VSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGGDLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVARG 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSIQ :::: :. :::...:..:..:: . :. ..:::: :: :::..::: :: :::. .: CCDS20 GCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELVQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 KGVYVTVIIEVGRMHMQ-WVSHYIMYLFTFLA-ATIAYFYLDCVWRLTPRVPNSFTRRRS ::. ::. : :: :.: ..: . .:.: : :... .. .: . . . : : CCDS20 KGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSV---VFVAIAFITMMIISLAWLIFYYI-QRFLYTGS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 QI-----KTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKHFFH :: . ..::.: :: :...:.:.. .:.. .::.::....: .:..::: :::.:: CCDS20 QIGSQSHRKETKKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFH 240 250 260 270 280 290 290 300 pF1KE4 KACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT . ::::::: :::::::: :..: CCDS20 RICIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPDDD 300 310 320 330 340 350 >>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa) initn: 554 init1: 338 opt: 609 Z-score: 662.6 bits: 131.0 E(32554): 1.4e-30 Smith-Waterman score: 636; 37.6% identity (64.0% similar) in 311 aa overlap (16-304:7-310) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLS---FP---DSNGKAIWTAHLNITFQV---GNE .: ::. . ::. .: :. .. .:: .:.: : : CCDS64 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALP---EGWNQN-ACHPLTNFSRPKQADSWLALIER .: .. . : .: :: .: : : : .: .. .: : : : : . .:.::..: CCDS64 LTFRI-DRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GGCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSI :.::: .::. :: ..: .:.::: .. : :.: :: .:.::::..:.: .:: . CCDS64 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPV-TMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 QKGVYVTVIIEVG-RM--------HMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVP .:.. : . : :: :: . .:: .. :. . .: . ..... . : CCDS64 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKI-----RYT 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 NSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKH :. : . .. .::::..: :..:.::.: : . :.:.::...:: .:::::: ::: CCDS64 NARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKH 230 240 250 260 270 280 280 290 300 pF1KE4 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT :::.:.:::: : :::::: .::: CCDS64 VFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALG 290 300 310 320 330 340 >>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (419 aa) initn: 554 init1: 338 opt: 609 Z-score: 662.0 bits: 131.0 E(32554): 1.5e-30 Smith-Waterman score: 636; 37.6% identity (64.0% similar) in 311 aa overlap (16-304:7-310) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLS---FP---DSNGKAIWTAHLNITFQV---GNE .: ::. . ::. .: :. .. .:: .:.: : : CCDS44 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALP---EGWNQN-ACHPLTNFSRPKQADSWLALIER .: .. . : .: :: .: : : : .: .. .: : : : : . .:.::..: CCDS44 LTFRI-DRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 GGCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSI :.::: .::. :: ..: .:.::: .. : :.: :: .:.::::..:.: .:: . CCDS44 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPV-TMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 QKGVYVTVIIEVG-RM--------HMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVP .:.. : . : :: :: . .:: .. :. . .: . ..... . : CCDS44 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKI-----RYT 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 NSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKH :. : . .. .::::..: :..:.::.: : . :.:.::...:: .:::::: ::: CCDS44 NARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKH 230 240 250 260 270 280 280 290 300 pF1KE4 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT :::.:.:::: : :::::: .::: CCDS44 VFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALG 290 300 310 320 330 340 305 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:06:26 2016 done: Sun Nov 6 04:06:26 2016 Total Scan time: 2.320 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]