FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3429, 655 aa 1>>>pF1KE3429 655 - 655 aa - 655 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2932+/-0.000426; mu= 9.5108+/- 0.027 mean_var=311.5128+/-65.139, 0's: 0 Z-trim(119.8): 195 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.072667 statistics sampled from 34090 (34321) to 34090 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16 Scan time: 12.120 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003128 (OMIM: 601939) SRSF protein kinase 1 [Ho ( 655) 4386 474.0 7.3e-133 NP_872634 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 699) 1527 174.3 1.3e-42 XP_005250607 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1527 174.4 1.3e-42 XP_016868051 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1527 174.4 1.4e-42 XP_016868052 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1527 174.4 1.4e-42 XP_005250606 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 811) 1527 174.4 1.4e-42 XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 618) 1522 173.7 1.7e-42 XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1522 173.8 1.8e-42 NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 ( 688) 1522 173.8 1.8e-42 NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 688) 1522 173.8 1.8e-42 XP_016868050 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1522 173.8 1.8e-42 XP_011514840 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42 XP_005250608 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42 XP_006716161 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42 XP_016868053 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1522 173.8 1.9e-42 XP_016868049 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 725) 1522 173.8 1.9e-42 XP_011514838 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1522 173.8 1.9e-42 XP_016875521 (OMIM: 603496) PREDICTED: dual specif ( 528) 350 50.8 1.5e-05 NP_003574 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 528) 350 50.8 1.5e-05 NP_006473 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 601) 350 50.9 1.6e-05 XP_011507449 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053 XP_016855732 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053 XP_016855731 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053 XP_016855730 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053 XP_016855733 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 295 44.6 0.00053 NP_001281268 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 271) 295 44.6 0.00055 XP_005244935 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 497) 295 45.0 0.00079 NP_003984 (OMIM: 602989) dual specificity protein ( 498) 295 45.0 0.0008 XP_011507445 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 498) 295 45.0 0.0008 NP_001281267 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 499) 295 45.0 0.0008 NP_003983 (OMIM: 602990) dual specificity protein ( 490) 280 43.4 0.0023 XP_016877398 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 280 43.4 0.0023 XP_016877399 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 280 43.4 0.0023 NP_001123500 (OMIM: 602990) dual specificity prote ( 638) 280 43.6 0.0027 XP_005254208 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 652) 280 43.6 0.0028 XP_016877396 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 655) 280 43.6 0.0028 XP_016877395 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 669) 280 43.6 0.0028 NP_003836 (OMIM: 609181) dual specificity tyrosine ( 520) 270 42.4 0.005 NP_004062 (OMIM: 601951) dual specificity protein ( 484) 268 42.1 0.0056 NP_001155879 (OMIM: 601951) dual specificity prote ( 526) 268 42.2 0.0058 XP_011507446 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 279) 260 41.0 0.0071 NP_065717 (OMIM: 607969) dual specificity protein ( 481) 261 41.4 0.0092 >>NP_003128 (OMIM: 601939) SRSF protein kinase 1 [Homo s (655 aa) initn: 4386 init1: 4386 opt: 4386 Z-score: 2506.3 bits: 474.0 E(85289): 7.3e-133 Smith-Waterman score: 4386; 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XP_005 VLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 YIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRM :.::.::::::::..::::::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::. XP_005 YVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE3 QEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQD :::::.:.:. . . :......: : :: . .. .. . ... ..: XP_005 QEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAED 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KE3 QTL--------MERDTEGGAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKE : .:.: . :. . :: :: .. :. ..: .: XP_005 QEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEE 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 pF1KE3 DLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMV : : .. .... : ::.. :. ::. . :: . : . : . .. XP_005 DCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVA 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 CQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPL : : . :. ..::. :. : .:... .: : :.:. :...::::: XP_005 CGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPL 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 EPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFE .:.::.:..:::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.:::::::::::::: XP_005 DPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFE 530 540 550 560 570 580 550 560 570 pF1KE3 LATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIA-------------------------------LIIEL ::::::::::::::.:.::::::: ::::: XP_005 LATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRDHIALIIEL 590 600 610 620 630 640 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 LGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLP ::::::: . :::::::::.::.:.::::::::.::.:::::: : .:.:: XP_005 LGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIP 650 660 670 680 690 700 640 650 pF1KE3 MLELIPEKRATAAECLRHPWLNS XP_005 MLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS 710 720 730 >>XP_016868051 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (780 aa) initn: 2607 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.6 bits: 174.4 E(85289): 1.4e-42 Smith-Waterman score: 2593; 58.1% identity (76.7% similar) in 708 aa overlap (4-655:86-780) 10 20 30 pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS .:::.::::.: : ..: .: : :... XP_016 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY : . :: :::::::::.::::: :::::::: ::::::::::: XP_016 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY 120 130 140 150 160 170 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN :::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.::: XP_016 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL ..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.:::::: XP_016 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL 240 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA ::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: :: XP_016 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 pF1KE3 DKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPV :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......: XP_016 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI----------- : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :. XP_016 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. . XP_016 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:... XP_016 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::::::::::::::::::: XP_016 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVP ::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: ::::::..: XP_016 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIP 650 660 670 680 690 700 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 RKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELI :.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::.. 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XP_016 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRPK--REKHPKKPEPQQKAP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY : . :: :::::::::.::::: :::::::: ::::::::::: XP_016 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY 120 130 140 150 160 170 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN :::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.::: XP_016 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL ..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.:::::: XP_016 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL 240 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA ::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: :: XP_016 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 pF1KE3 DKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPV :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......: XP_016 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI----------- : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :. XP_016 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. . XP_016 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:... XP_016 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::::::::::::::::::: XP_016 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVP ::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::: XP_016 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIALIIELLGKVP 650 660 670 680 690 700 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 RKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELI :: . :::::::::.::.:.::::::::.::.:::::: : .:.:: :::::.::::.. XP_016 RKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMV 710 720 730 740 750 760 640 650 pF1KE3 PEKRATAAECLRHPWLNS :::::.:.:::::::::: XP_016 PEKRASAGECLRHPWLNS 770 780 >>XP_005250606 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (811 aa) initn: 2239 init1: 1515 opt: 1527 Z-score: 885.4 bits: 174.4 E(85289): 1.4e-42 Smith-Waterman score: 2355; 55.5% identity (72.3% similar) in 708 aa overlap (4-624:86-780) 10 20 30 pF1KE3 MERKVLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGS .:::.::::.: :..: .: : :... XP_005 EKRPREERWCETRGGAGQGRAHGAAGGATGRVLAIQARKRRP--KREKHPKKPEPQQKAP 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 pF1KE3 -------------APHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCKGGYHLVKIGDLFNGRY : . :: :::::::::.::::: :::::::: ::::::::::: XP_005 LVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRY 120 130 140 150 160 170 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 HVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPN :::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::::.::: ::.:::.::: XP_005 HVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDEIKLLKCVRESDPSDPN 180 190 200 210 220 230 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 REMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGL ..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::. :::.::.:::::: XP_005 KDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGL 240 250 260 270 280 290 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAPPPSGSAVSTAPQPKPA ::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::::::::::::::: :: XP_005 DYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAPPPSGSAVSTAPQQKPI 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 pF1KE3 DKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------GPGQKRPNKQEESESPV :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . . :......: XP_005 GKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCP 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 pF1KE3 ERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEGGAAEI----------- : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . :. XP_005 EVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDDVDQELANIDPTWIESP 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 pF1KE3 NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESSFLSSQ-----NGDSST . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::.. :. ::. . XP_005 KTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESDYTYSSSYEQFNGELPN 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 -------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQLQESIRAEIPCEDEQE :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. : .:... XP_005 GRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS---------PSHDRSR 540 550 560 570 580 470 480 490 500 510 pF1KE3 Q---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::::::::::::::::::: XP_005 TVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQY 590 600 610 620 630 640 520 530 540 550 560 pF1KE3 RSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIA---------- ::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::: XP_005 RSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIP 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 pF1KE3 ---------------------LIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPW :::::::::::: . :::::::::.::.:.:::::::: XP_005 RHFALSGKYSREFFNRRDHIALIIELLGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPW 710 720 730 740 750 760 610 620 630 640 650 pF1KE3 GLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS .::.:::::: : .:.:: XP_005 SLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS 770 780 790 800 810 >>XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (618 aa) initn: 1917 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.8 bits: 173.7 E(85289): 1.7e-42 Smith-Waterman score: 1911; 56.6% identity (74.9% similar) in 549 aa overlap (35-540:73-610) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK : . :: :::::::::.::::: :::: XP_016 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE :::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::: XP_016 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL :.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::: XP_016 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP :. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::: XP_016 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G :::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . XP_016 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG . :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . XP_016 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD 350 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS :. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::. XP_016 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ . :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. XP_016 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA : .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::: XP_016 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR ::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::: XP_016 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMENCDTSPS 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE >>XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (688 aa) initn: 2559 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.3 bits: 173.8 E(85289): 1.8e-42 Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK : . :: :::::::::.::::: :::: XP_016 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE :::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::: XP_016 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL :.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::: XP_016 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP :. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::: XP_016 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G :::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . XP_016 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG . :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . XP_016 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS :. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::. XP_016 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ . :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. XP_016 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA : .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::: XP_016 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR ::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.: XP_016 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE :::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .: XP_016 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE 600 610 620 630 640 650 630 640 650 pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS .:: :::::.::::..:::::.:.:::::::::: XP_016 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS 660 670 680 >>NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isof (688 aa) initn: 2559 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.3 bits: 173.8 E(85289): 1.8e-42 Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK : . :: :::::::::.::::: :::: NP_001 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE :::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::: NP_001 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL :.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::: NP_001 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP :. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::: NP_001 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G :::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . NP_001 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG . :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . NP_001 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS :. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::. NP_001 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ . :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. NP_001 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA : .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::: NP_001 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR ::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.: NP_001 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE :::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .: NP_001 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE 600 610 620 630 640 650 630 640 650 pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS .:: :::::.::::..:::::.:.:::::::::: NP_001 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS 660 670 680 >>NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isoform (688 aa) initn: 2559 init1: 1515 opt: 1522 Z-score: 883.3 bits: 173.8 E(85289): 1.8e-42 Smith-Waterman score: 2553; 59.9% identity (78.5% similar) in 664 aa overlap (35-655:36-688) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 VLALQARKKRTKAKKDKAQRKSETQHRGSAPHSESDLPEQEEEILGSDDDEQEDPNDYCK : . :: :::::::::.::::: :::: NP_872 EKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTPPEPEEEILGSDDEEQEDPADYCK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GGYHLVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDE :::: ::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::::::::::.::::::::: NP_872 GGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYTETALDE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL :.::: ::.:::.:::..:::::.:::::::.:: :.::::::::::::::::::::::: NP_872 IKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 PLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATEWQRSGAP :. :::.::.::::::::::.::.::::::::::::. :.. :.::.::::::::..::: NP_872 PVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEWQKAGAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PPSGSAVSTAPQPKPADKMSKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRMQEIEEMEKES-------G :::::::::::: :: :.::::::::::::::::::::::.:::::.:.:. . NP_872 PPSGSAVSTAPQQKPIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAERKIIEEN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KE3 PGQKRPNKQEESESPVERPLKENPPNKMTQEKLEESSTIGQDQTL--------MERDTEG . :......: : :: . .. .. . ... ..:: .:.: . NP_872 ITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKENIEKDEDD 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 pF1KE3 GAAEI-----------NCNGVIEVINYT--QNSNNETLRHKEDLHNANDCDVQNLNQESS :. . :: :: .. :. ..: .:: : .. .... : ::. NP_872 VDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDED-DDEEDCPNPEEYNLDEPNAESD 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 pF1KE3 FLSSQ-----NGDSST-------SQETDSCTPITSEVSDTMVCQSSSTVGQSFSEQHISQ . :. ::. . :: . : . : . ..: : . :. ..::. :. NP_872 YTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLTEQEESS 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 LQESIRAEIPCEDEQEQ---EHNGPLDNKGKSTAGNFLVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNA : .:... .: : :.:. :...:::::.:.::.:..::::::::: NP_872 ---------PSHDRSRTVSASSTGDLP-KAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNA 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTR ::::::::::::::::::.:::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.:.: NP_872 CWVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSR 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQE :::::: ::::::..::.. ..::::.:::...:.:.::::::::.::.:::::: : .: NP_872 DEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHE 600 610 620 630 640 650 630 640 650 pF1KE3 EAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS .:: :::::.::::..:::::.:.:::::::::: NP_872 DAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS 660 670 680 655 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:09:46 2016 done: Sun Nov 6 05:09:48 2016 Total Scan time: 12.120 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]