FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0984, 592 aa 1>>>pF1KE0984 592 - 592 aa - 592 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1231+/-0.00133; mu= 5.6863+/- 0.077 mean_var=236.2474+/-53.392, 0's: 0 Z-trim(107.0): 727 B-trim: 258 in 1/52 Lambda= 0.083443 statistics sampled from 8486 (9315) to 8486 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 3.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 3936 488.0 1.5e-137 CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 3020 377.6 1.9e-104 CCDS75303.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 401) 2521 317.4 2.1e-86 CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1322 173.2 7e-43 CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1322 173.3 7.7e-43 CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 1038 138.9 1.1e-32 CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 1012 135.7 8.8e-32 CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 951 128.3 1.3e-29 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 876 119.8 1.6e-26 CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 876 119.8 1.7e-26 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 671 94.6 2e-19 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 662 93.5 4.1e-19 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 648 91.8 1.3e-18 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 632 89.9 5e-18 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 90.0 8e-18 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 90.0 8e-18 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 629 89.7 8.1e-18 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 627 89.4 8.4e-18 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 627 89.4 8.4e-18 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 629 89.7 8.5e-18 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 629 89.7 8.7e-18 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 627 89.5 1.1e-17 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 627 89.5 1.1e-17 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 627 89.6 1.2e-17 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 604 86.6 6.1e-17 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 604 86.7 6.3e-17 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 604 86.7 6.6e-17 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 608 87.4 7e-17 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 608 87.5 7.1e-17 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 608 87.5 7.1e-17 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 608 87.5 7.1e-17 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 599 86.1 1.1e-16 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 601 86.5 1.1e-16 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 599 86.2 1.1e-16 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 596 86.0 1.9e-16 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 596 86.0 1.9e-16 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 596 86.0 2e-16 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 591 85.3 2.4e-16 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 591 85.3 2.5e-16 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 591 85.3 2.6e-16 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 572 82.9 1.1e-15 CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 565 81.9 1.5e-15 CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 565 82.0 1.7e-15 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 563 81.7 1.8e-15 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 561 81.4 2.1e-15 CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 557 81.0 3e-15 CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 556 80.9 3.6e-15 CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 551 80.2 4.7e-15 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 534 78.2 2e-14 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 534 78.2 2.1e-14 >>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa) initn: 3936 init1: 3936 opt: 3936 Z-score: 2583.1 bits: 488.0 E(32554): 1.5e-137 Smith-Waterman score: 3936; 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CCDS35 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..:: CCDS35 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL : ::.::.::.. :: :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: : CCDS35 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL :.... . ...::::. .. :... ::.::: : ..::::..: ::: :.: :: CCDS35 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR . :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. .. . . : :. :. CCDS35 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL- 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC .:.::.. : . .: :.. .: . .: :.. : : ::: .: CCDS35 -FKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSR----TSHNKIVPSTSLKDC 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMP .... . . ::..::.. : . .: ...:.. .. . ..:.. :: : : CCDS35 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 NSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKD : :. : CCDS35 N-RHSPSGIYNINVTTLVSGPPLSDDSGADLPQMEHQH 460 470 480 490 >>CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (570 aa) initn: 1325 init1: 1124 opt: 1322 Z-score: 882.6 bits: 173.3 E(32554): 7.7e-43 Smith-Waterman score: 1413; 41.5% identity (71.0% similar) in 573 aa overlap (1-566:1-539) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQS-VNKIAMREIKFLKQFHH :: ::.:: ::::::: ::::..:.::.::::: : : ... :.::::::::.:::..: CCDS82 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN ::::::.:: ..::. .:::::.:::.::.:. . .::. . ..::::::. .: . ::. CCDS82 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG ::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..:: CCDS82 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL : ::.::.::.. :: :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: : CCDS82 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL :.... . ...::::. .. :... ::.::: : ..::::..: ::: :.: :: CCDS82 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR . :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. . . . :: . CCDS82 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQ-------DTNADPKIKDYK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC ..:.::.. : . .: :.. .: . .: :.. : : ::: .: CCDS82 LFKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSRT----SHNKIVPSTSLKDC 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE0 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMP .... . . ::..::.. : . .: ...:.. .. . ..:.. :: : : CCDS82 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KE0 NSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRK--EFHFPELPVTIQS : :. : . .. . .:.. . .:.. ..::.: . :... .:: . CCDS82 N-RHSPSGIYNINVTTLVSSEKN-----LFWASKKRREYSRTDVRLPELNYNHLP---EL 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 KDTKGMEVKQIKMLKRESKKTESSKIPTLLNVDQNQEKQEGGDGHCEGKNLKRNRFFFW . :. ... .. :.::: :.::.: .: CCDS82 RALGGI-ARNSRLTKKESKILSESRIPSLAAIDLHTPSITLHQVSGPPLSDDSGADLPQM 510 520 530 540 550 560 CCDS82 EHQH 570 >>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 871 init1: 871 opt: 1038 Z-score: 700.3 bits: 138.9 E(32554): 1.1e-32 Smith-Waterman score: 1039; 45.6% identity (74.4% similar) in 344 aa overlap (1-343:2-336) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFH :: :: .::.::::::.:.::....:::::::: : : .. : .:::.:::..:::.. CCDS96 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 HENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHS : :::::.::::.:...:::::. ::::: ::..: .:. . ... .: :.:... :. CCDS96 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 NNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSY .: ::::.::::::... .. ::::::::: :..:.: :::::::::::.:::.. ::.: CCDS96 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV : :::.::.::.. :. .: : :..::.: :. : .:.: :. :..:: . :.:: CCDS96 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 LPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPE .:. . . . :.:... ....::..::..:.. .:::: :: :: . CCDS96 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDL--- 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 LKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKV :: .. ..: : :.... . : : : .::.: CCDS96 --AKEHNKPTRKTLRK----SRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 RVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPPNPINPSTNCNGL CCDS96 NYRFPNI >>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa) initn: 455 init1: 455 opt: 1012 Z-score: 684.1 bits: 135.7 E(32554): 8.8e-32 Smith-Waterman score: 1012; 48.5% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-303) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFHH :: :: :.:.::::::.:.::..:..::.::.: : : .. : .:::.:::..:::..: CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN ::::::::::.:.:.:::::. :::.:.::.. .:. . ... :.: :.:... : . CCDS33 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG : :::::::::::....:: :.::::::. : ::: :::::::::::::::.. ::.:: CCDS33 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL . :::::.::.. :. ::.: :..::.: :. :. .:.: :. :.::... .: :. . CCDS33 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL :. . .. ..:. .. . .....::...: ::.. :.::. :: :.: : .. CCDS33 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSFQEA---QI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR : : .:.. CCDS33 KRKARNEGRNRRRQQVLPLKS 300 310 >>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (276 aa) initn: 940 init1: 771 opt: 951 Z-score: 645.1 bits: 128.3 E(32554): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 951; 51.8% identity (81.3% similar) in 257 aa overlap (1-256:2-258) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFH :: :: .::.::::::.:.::....:::::::: : : .. : .:::.:::..:::.. CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 HENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHS : :::::.::::.:...:::::. ::::: ::..: .:. . ... .: :.:... :. CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 NNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSY .: ::::.::::::... .. ::::::::: :..:.: :::::::::::.:::.. ::.: CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV : :::.::.::.. :. .: : :..::.: :. : .:.: :. :..:: . :.:: CCDS73 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 LPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPE .:. . . . :.:... CCDS73 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE 250 260 270 >>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa) initn: 729 init1: 560 opt: 876 Z-score: 589.7 bits: 119.8 E(32554): 1.6e-26 Smith-Waterman score: 880; 32.6% identity (66.9% similar) in 487 aa overlap (1-479:10-464) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPE-QSVNKIAMRE :. .: :: ::::.::.:.::.::.: .::::: : . : . :.. ..:: CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 IKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQIL .:.:. ...::.:.: :.::.. :..::::......:. :... .:. .....:..:.. CCDS83 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE0 RAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDI-YTDYVATRWYRAP .:: . :.:.:.::::::::.:.:.. . :::::::::.:. .. ::.::::::::.: CCDS83 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 ELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFS ::.: . ::: ::.:..::.. :.. :.: .:. :..: : : .: : . ...: CCDS83 ELLL-GAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 KSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKY-PKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTR ..: : :. .: :.::.. ...: ::..: :... :..::::: . . :.: : CCDS83 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 DGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKE-- . .... .:..:.: :: . : ..:: . . :: CCDS83 QRLLDR-------------------SPSRSAK----RKPYH--VESSTLSNRNQAGKSTA 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 IEKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPP ...... . .. ..: :.: . : .. . .: . :. .. :. : .. .: CCDS83 LQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNG---NLAGASLSPLHTKTYQASSQPG 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 NPINPSTNCNGLKE--NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRR . . :: :.. . .:. . : : .:. . . . ... .. . : . .. CCDS83 STSKDLTN-NNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKP--SEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFM 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 TSSQS-IGQVMPNSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFH :::: : ..:: .: CCDS83 ESSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQI 450 460 470 480 490 500 >>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030 aa) initn: 729 init1: 560 opt: 876 Z-score: 589.3 bits: 119.8 E(32554): 1.7e-26 Smith-Waterman score: 880; 32.6% identity (66.9% similar) in 487 aa overlap (1-479:10-464) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPE-QSVNKIAMRE :. .: :: ::::.::.:.::.::.: .::::: : . : . :.. ..:: CCDS14 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 IKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQIL .:.:. ...::.:.: :.::.. :..::::......:. :... .:. .....:..:.. CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE0 RAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDI-YTDYVATRWYRAP .:: . :.:.:.::::::::.:.:.. . :::::::::.:. .. ::.::::::::.: CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE0 ELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFS ::.: . ::: ::.:..::.. :.. :.: .:. :..: : : .: : . ...: CCDS14 ELLL-GAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE0 KSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKY-PKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTR ..: : :. .: :.::.. ...: ::..: :... :..::::: . . :.: : CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE0 DGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKE-- . .... .:..:.: :: . : ..:: . . :: CCDS14 QRLLDR-------------------SPSRSAK----RKPYH--VESSTLSNRNQAGKSTA 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE0 IEKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPP ...... . .. ..: :.: . : .. . .: . :. .. :. : .. .: CCDS14 LQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNG---NLAGASLSPLHTKTYQASSQPG 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 NPINPSTNCNGLKE--NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRR . . :: :.. . .:. . : : .:. . . . ... .. . : . .. CCDS14 STSKDLTN-NNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKP--SEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFM 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 TSSQS-IGQVMPNSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFH :::: : ..:: .: CCDS14 ESSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQI 450 460 470 480 490 500 592 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 03:13:23 2016 done: Sun Nov 6 03:13:24 2016 Total Scan time: 3.600 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]