FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3340, 984 aa 1>>>pF1KE3340 984 - 984 aa - 984 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2337+/-0.000694; mu= -5.5518+/- 0.042 mean_var=1029.2419+/-229.023, 0's: 0 Z-trim(113.1): 1267 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.039977 statistics sampled from 20905 (22309) to 20905 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 13.420 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 6599 399.1 5.9e-110 NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 5068 310.8 2.3e-83 NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 5057 310.2 3.5e-83 NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 5057 310.2 3.6e-83 XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 5046 309.5 5.4e-83 NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 4722 290.9 2.3e-77 NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 3861 241.2 2.1e-62 NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 3849 240.5 3.4e-62 NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 3847 240.4 3.6e-62 XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 3841 240.0 4.6e-62 NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 3838 239.9 5.2e-62 XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 3827 239.2 8e-62 NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 3777 236.3 5.9e-61 NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 3684 231.0 2.4e-59 XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 3640 228.5 1.4e-58 XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 3640 228.5 1.4e-58 XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 3640 228.5 1.4e-58 XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 3631 227.9 2e-58 NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3486 219.5 6.5e-56 NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3486 219.6 6.6e-56 NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3486 219.6 6.6e-56 XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 3375 213.1 5.5e-54 XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 3359 212.2 1.1e-53 NP_001092909 (OMIM: 611123) ephrin type-A receptor (1008) 2830 181.7 1.6e-44 XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 2593 167.3 1.4e-40 XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 2600 168.4 1.6e-40 NP_065387 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor 8 (1005) 2524 164.1 3.4e-39 XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 2470 161.0 2.9e-38 NP_001073917 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1130) 2374 155.5 1.4e-36 XP_011539272 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36 XP_011539275 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36 XP_011539271 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36 XP_011539274 (OMIM: 176945) PREDICTED: ephrin type ( 930) 2369 155.1 1.6e-36 NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2331 152.9 7.5e-36 NP_001296121 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r ( 928) 2289 150.5 3.9e-35 XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2240 147.6 2.7e-34 XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2236 147.4 3.2e-34 XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 2109 140.0 4.9e-32 XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 2105 139.8 5.9e-32 XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 2033 135.9 1.2e-30 XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 1917 129.0 1.1e-28 XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 1917 129.0 1.1e-28 NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1917 129.1 1.1e-28 NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1917 129.1 1.2e-28 NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1917 129.1 1.2e-28 XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 1898 127.6 2e-28 XP_011514181 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28 XP_006715944 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28 NP_004436 (OMIM: 602757) ephrin type-B receptor 6 (1022) 1898 128.0 2.5e-28 XP_011514182 (OMIM: 602757) PREDICTED: ephrin type (1022) 1898 128.0 2.5e-28 >>NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 prec (984 aa) initn: 6599 init1: 6599 opt: 6599 Z-score: 2095.0 bits: 399.1 E(85289): 5.9e-110 Smith-Waterman score: 6599; 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NP_059 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 PICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNI :.::.::::::.:: .. ::..::.:. ::: :::::..::: :::..:::.:..::: NP_059 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 ICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPF :::.: . : .:.:: :::...:::::::: :. ::.: ::: :::.:::.:::...::: NP_059 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 PPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNE :: .::::::::::::.: :::::: :. :::::: ::.::::.:::::..::::: .: NP_059 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 FNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQ .:.. .: :::. ..::. : .:: :::::::::::..:::: :::.:. .:.. ..:. NP_059 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 LPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPF :::: ::.:::.::....:.:.:::.:. .. :.::::::..:. .:::::::::: NP_059 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 TYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYS :::::::::::::::::.: ::::.:::::::::: .:.:::::::::.:::::::.::. 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NP_001 CNGDGEWLVPIGRCMCKAGFEAVENGTVCRGCPSGTFKANQGDEACTHCPINSRTTSEGA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 PICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGGRDDVTYNI :.::.::::::.:: .. ::..::.:. ::: :::::..::: :::..:::.:..::: NP_001 TNCVCRNGYYRADLDPLDMPCTTIPSAPQAVISSVNETSLMLEWTPPRDSGGREDLVYNI 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 ICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQAINGVSSKSPF :::.: . : .:.:: :::...:::::::: :. ::.: ::: :::.:::.:::...::: NP_001 ICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQAVNGVTDQSPF 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 PPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNE :: .::::::::::::.: :::::: :. :::::: ::.::::.:::::..::::: .: NP_001 SPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSE 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 FNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQ .:.. .: :::. ..::. : .:: :::::::::::..:::: :::.:. .:.. ..:. NP_001 YNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEK 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 LPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPF :::: ::.:::.::....:.:.:::.:. .. :.::::::..:. .:::::::::: NP_001 LPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 TYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYS :::::::::::::::::.: ::::.:::::::::: .:.:::::::::.:::::::.::. NP_001 TYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEFGEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYT 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTV :::::::::::::::::::::.:.:::::::: ::::::::::::.:::::::::::::: NP_001 EKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKSTPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTV 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 IQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTY ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::: NP_001 IQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTY 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 TSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIE ::.::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::: NP_001 TSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMTNQDVINAIE 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 QDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVP ::::::::::::.::::::::::::::: ::.:..:::::::::::: :::..: ... NP_001 QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI 850 860 870 880 890 900 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 SQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITL . :::::.:::.:.:.:::.:: :::: ::..:: .:::::...:.:: ::.::.:.:: NP_001 NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL 910 920 930 940 950 960 960 970 980 pF1KE3 AGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA :::::::::::. ::.:..: NP_001 AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEGQPLARRPRATGRTKRCQPRDVTKKTCNSNDGKKK 970 980 990 1000 1010 1020 >>XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephrin t (980 aa) initn: 5059 init1: 2345 opt: 5046 Z-score: 1610.9 bits: 309.5 E(85289): 5.4e-83 Smith-Waterman score: 5046; 73.9% identity (91.5% similar) in 963 aa overlap (18-978:12-974) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDENLNTIRTYQV .::::::. :::::::: ..: ::::::::::::.:::::::: XP_006 MAGYERHGRRWLEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSGYDENMNTIRTYQV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 CNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLPNVPGSCKETFNLYYYETDSV ::::: .::::: : :: :::::::..::.:.::::::.:.:::::::::::::::.: XP_006 CNVFESSQNNWLRTKFIRRRGAHRIHVEMKFSVRDCSSIPSVPGSCKETFNLYYYEADFD 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 IATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDY ::: : : :..:::::::::::::::.:::.::.:::::::::..:.::::::::: XP_006 SATKTFPNWMENPWVKVDTIAADESFSQVDLGGRVMKINTEVRSFGPVSRSGFYLAFQDY 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 GACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLYC :.::::..::::..::: :.:: :.: ::..:::::::: :::.:: ::::::::::::: XP_006 GGCMSLIAVRVFYRKCPRIIQNGAIFQETLSGAESTSLVAARGSCIANAEEVDVPIKLYC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE3 NGDGEWMVPIGRCTCKPGYEP-ENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASP ::::::.:::::: :: :.: ::...:..::.:::::.: :.:.::: :::. .:.. 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XP_006 PQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDYELQYYEKELSEY 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 NSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQL :.. .: :::. ..::. : .:: :::::::::::..:::: :::.:. .:.. ..:.: XP_006 NATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQTMTEAEYQTSIQEKL 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 PLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSK-EAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPF ::: ::.:::.::....:.:.:::.:.:.. . .. :.::::::..:. .:::::::::: XP_006 PLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRRRGFERADSEYTDKLQHYTSGHMTPGMKIYIDPF 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 TYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYS :::::::::::::::::.: ::::.:::::::::: .:.:::::::::.:::::::.::. 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XP_006 QDYRLPPPMDCPSALHQLMLDCWQKDRNHRPKFGQIVNTLDKMIRNPNSLKAMAPLSSGI 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 SQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSEDLLRIGITL . :::::.:::.:.:.:::.:: :::: ::..:: .:::::...:.:: ::.::.:.:: XP_006 NLPLLDRTIPDYTSFNTVDEWLEAIKMGQYKESFANAGFTSFDVVSQMMMEDILRVGVTL 900 910 920 930 940 950 960 970 980 pF1KE3 AGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA :::::::::::. ::.:..: XP_006 AGHQKKILNSIQVMRAQMNQIQSVEV 960 970 980 >>NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 prec (998 aa) initn: 3626 init1: 2261 opt: 4722 Z-score: 1509.9 bits: 290.9 E(85289): 2.3e-77 Smith-Waterman score: 4722; 70.6% identity (87.5% similar) in 978 aa overlap (6-979:26-993) 10 20 30 40 pF1KE3 MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPAS : :::: .. :.:::::::. .:.::.::..: : NP_004 MARARPPPPPSPPPGLLPLLPPLLLLPLLLLPAGCRALEETLMDTKWVTSELAWTSHPES 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 GWEEVSGYDENLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLP :::::::::: .: ::::::::: : .::::: : :: :: ..:.:.:..::::::.:.: NP_004 GWEEVSGYDEAMNPIRTYQVCNVRESSQNNWLRTGFIWRRDVQRVYVELKFTVRDCNSIP 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 NVPGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVDFGGRLMKVNT :.::::::::::.:::.:: .:. .: :: : ::.:::::: :::::..: : .::: NP_004 NIPGSCKETFNLFYYEADSDVASASSPFWMENPYVKVDTIAPDESFSRLDAG----RVNT 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 EVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIVQNFAVFPETMTGAESTSLVI .:::::::.. :::::::: ::::::.:::.:.::: : . .::.::::.:::: ::::: NP_004 KVRSFGPLSKAGFYLAFQDQGACMSLISVRAFYKKCASTTAGFALFPETLTGAEPTSLVI 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE3 ARGTCIPNAEEVDVPIKLYCNGDGEWMVPIGRCTCKPGYEPENSVA-CKACPAGTFKASQ : ::::::: ::.::.:::::::::::::.: ::: :.:: . . :. :: :..::.: NP_004 APGTCIPNAVEVSVPLKLYCNGDGEWMVPVGACTCATGHEPAAKESQCRPCPPGSYKAKQ 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 EAEGCSHCPSNSRSPAEASPICTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSII : :: :::. . :. ::::....:::: : . :::.::: ::.::: :::::.: NP_004 GEGPCLPCPPNSRTTSPAASICTCHNNFYRADSDSADSACTTVPSPPRGVISNVNETSLI 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 LEWHPPRETGGRDDVTYNIICKKCRA--DRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLW ::: ::. :::::. ::.:::::.. .::::::::::::::::::: :: :: : NP_004 LEWSEPRDLGGRDDLLYNVICKKCHGAGGASACSRCDDNVEFVPRQLGLTERRVHISHLL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 AHTPYTFDIQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQP ::: :::..::.::::.:::.::....::::::::::: :: .. :.. :.:::: : NP_004 AHTRYTFEVQAVNGVSGKSPLPPRYAAVNITTNQAAPSEVPTLRLHSSSGSSLTLSWAPP 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 EQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKF :.:::.:::::..:.:: .: .: . :: :....::::: ::::::::::::::.. 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NP_001 ADNGGRNDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 IQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSITLSWPQPEQPNGIIL ..:.::::. : ..:.:::.::::: : . . . .::. ::: .::.:::.: NP_001 VEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVIT 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 DYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQT .:::.::::.. : . : .......: :..:.:: ::: :.:: :.::::..: .. : NP_001 EYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVAT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 LTDDDYKSELREQLP--LIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYS : . . :: : .:: :.::....: .: :. :. .::: .:. .. NP_001 LEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFH 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 TGRGSPGMKIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGK :: : :::: ::::::.::..::::.:.: .:::.:::::::::: .:::::::: NP_001 FKF--PGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGK 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 REIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFMENG :.. :::::::.::.:::::::: ::::::::::::...::::::...::::. :::::: NP_001 RDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENG 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 ALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDF :::.:::..::::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::: NP_001 ALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDF 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 GLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSFGER :::: ..:: . .::.. :::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::: NP_001 GLSRVIEDDP-EAVYTTT-GGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGER 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 PYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIR :::::::::::.:::. :::: ::::::.:::::::::::.: ::.: .::. :::::: NP_001 PYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIR 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 NPASLKTVATITAVPSQPLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLV :: :::: . : .::::.. ::::.: .: .::.:::: .:.:.: .::..::. : NP_001 NPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESV 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 pF1KE3 TQMTSEDLLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA ..:: ::.. .::::.::::::..::..::.:. 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XP_016 ARMTIEDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV 950 960 970 980 984 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 05:35:54 2016 done: Sun Nov 6 05:35:56 2016 Total Scan time: 13.420 Total Display time: 0.430 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]