FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4145, 578 aa 1>>>pF1KE4145 578 - 578 aa - 578 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6613+/-0.000415; mu= 17.0862+/- 0.025 mean_var=91.5641+/-19.862, 0's: 0 Z-trim(113.3): 318 B-trim: 550 in 1/50 Lambda= 0.134033 statistics sampled from 22205 (22612) to 22205 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 10.320 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 1199 242.7 2.6e-63 NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 1077 219.0 2.8e-56 XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 848 174.8 7e-43 NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 798 165.1 5.6e-40 NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 798 165.2 5.7e-40 XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 787 163.0 2.3e-39 NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 781 161.9 5.5e-39 XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 772 160.1 1.9e-38 NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 769 159.5 2.6e-38 NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 766 158.9 4e-38 NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 766 159.0 4.7e-38 NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 766 159.0 4.9e-38 XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38 XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38 XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38 XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 766 159.1 5.1e-38 XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 766 159.1 5.1e-38 XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38 XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38 XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 766 159.1 5.2e-38 XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 748 155.5 4.5e-37 NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 748 155.6 5.5e-37 NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 739 153.8 1.8e-36 NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 739 153.8 1.8e-36 NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 693 144.9 8.2e-34 NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 691 144.5 1.1e-33 NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 688 143.9 1.5e-33 XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 686 143.5 1.9e-33 NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 686 143.5 1.9e-33 NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 686 143.5 1.9e-33 NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 686 143.5 1.9e-33 XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 686 143.5 1.9e-33 NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 673 140.9 8.9e-33 XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 673 140.9 9.7e-33 XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 663 139.0 3.7e-32 NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 663 139.0 4e-32 NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 662 138.8 4.5e-32 NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 662 138.9 4.7e-32 XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 662 138.9 4.8e-32 XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 649 136.4 2.8e-31 NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 649 136.4 2.8e-31 XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 649 136.4 2.8e-31 >>NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 isoform (597 aa) initn: 1165 init1: 388 opt: 1199 Z-score: 1257.7 bits: 242.7 E(85289): 2.6e-63 Smith-Waterman score: 1241; 38.4% identity (63.9% similar) in 571 aa overlap (8-562:10-559) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTL-LVGGRELPCHRSLLALSSPY : : :.:: ..: ::..::.. :. :::: .:::..: ::..:: .::: NP_055 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 FHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPS :.:::::.. :: . ::.:. : : .. :.:: ::::.... :.: : :.: :.::. 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NP_001 APKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQ 470 480 490 500 530 540 550 560 570 pF1KE4 QGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH >>XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa) initn: 764 init1: 474 opt: 848 Z-score: 890.9 bits: 174.8 E(85289): 7e-43 Smith-Waterman score: 867; 30.5% identity (59.5% similar) in 568 aa overlap (14-561:47-590) 10 20 30 40 pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRE :::...:. ....:.. ..:: . : :.: XP_016 RDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGKE 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LPCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNV .::::..:. : ::.::: .: :: ::. . .. ....::::.. :: :: XP_016 FPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENV 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 EALTRTAARLHFPSVQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFE . : .:.. ... .. .:...:..::: ::::: .:.. ..: . .: : ..:: XP_016 QYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFE 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 AVAREDEFLQLPRERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVH :....:::.: ...:. . .: : . :. .::.:::: . . : : :::. :. 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