FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2325, 1977 aa 1>>>pF1KE2325 1977 - 1977 aa - 1977 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7827+/-0.00122; mu= 12.4268+/- 0.073 mean_var=127.1595+/-26.110, 0's: 0 Z-trim(105.0): 118 B-trim: 27 in 1/50 Lambda= 0.113737 statistics sampled from 8077 (8195) to 8077 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 6.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 13014 2148.4 0 CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8808 1458.3 0 CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8808 1458.3 0 CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 8561 1417.7 0 CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 8538 1414.0 0 CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 8503 1408.2 0 CCDS44891.1 SCN8A 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:::..:::.::::::: CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLEAGK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 QLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRR .:::::::::: ::: ::::::::: .:::::::::::.: ::.::::::.:.::.:.:. CCDS33 SLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPIRK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFC ..:::::::::.:::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS33 LAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA . .:::::::::::::.::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE2 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKC-----------------FRNSL ::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: : ::: CCDS33 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNNSL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE2 ENNETLE----SIMNTLESEEDFRKYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRN ..: : ::.: : :: ...::.:::..:::::: :.:.::::::: ::: ::: CCDS33 DGNGTTFNRTVSIFNWDEYIED-KSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGRN 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 PDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINL :.::::::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::.:::::::::::: CCDS33 PNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 ILAVVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAA-AEYTSIRRSRI :::::::::::::::..:::.::: ::::::..:::.::::.: :::: :: .. . CCDS33 ILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAGG 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 MGL-SESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSF .:. ::::: .::::::: :: .::::::.::. :. :::.: .. :::::::::::.: CCDS33 IGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKND--RVRKSESEDSIRRKGF 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 HLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDE ....:: : ..:::.:.:.:: ::::::::: ::.::.:::::.::..:::::..::::: CCDS33 RFSLEGSRLTYEKRFSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRGRAKDIGSENDFADDE 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 HSIFGDNESRRGSLFVPHRPQERRSSNISQASRSP---PMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLV :: : ::.::: ::::::: ::: ::.:::::. :.::.::::::::::::::::: CCDS33 HSTFEDNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLPILPMNGKMHSAVDCNGVVSLV 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 DGRSALMLPNGQLLPEGTTNQIH-KKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVE : :.: :::::::::.. . .::: ::: .: :.:.::. :::::: :::::::.: CCDS33 GGPSTLT-SAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ELEESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFM ::::::::::: ::.::. :::.: :.: :. . ..::::::::::::::::::::: CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 AMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLV ::::.::::.:..::..:::::::::.::: ::.:::::: ::: ::::::..::.:::. CCDS33 AMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLM 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 ELFLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFA :: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFA 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 VVGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQ ::::::::::::::::::..:: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VVGMQLFGKSYKECVCKISNDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQ 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 AMCLIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINY .::: :.::::::::::::::::::::::::::::.: ..: . ::::::: :..:::.. 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CCDS33 SLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPIRK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFC ..:::::::::.:::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS33 LAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA . .:::::::::::::.::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE2 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKC-----------------FRNSL ::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: : ::: CCDS33 LIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNNSL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE2 ENNETLE----SIMNTLESEEDFRKYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRN ..: : ::.: : :: ...::.:::..:::::: :.:.::::::: ::: ::: CCDS33 DGNGTTFNRTVSIFNWDEYIED-KSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGRN 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 PDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINL :.::::::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::.:::::::::::: CCDS33 PNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 ILAVVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAA-AEYTSIRRSRI :::::::::::::::..:::.::: ::::::..:::.::::.: :::: :: .. . 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CCDS33 KNKMRECFQKAFFRKPKVI-EIHE----GNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSG 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 -GFGSSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRL : ::::.:......: .:::.::::::::::: ::::.::.:.::.::.:. : :: .: CCDS33 VGTGSSVEKYVIDENDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEFSSESELEESKEKL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 NRSSSSECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDEPEACFTDGCVRRFSCCQVNIESGKGKIWW : .:::: :::: :: :::.::.:: .. .::::::.::...: :::. : ::::::: CCDS33 NATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLKPEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWW 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 NIRKTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFIL :.:::::.::::.:::.:::.:::::::::::::::::..:::: .::::::.::::::: CCDS33 NLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFIL 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 EMLLKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLR ::::::.:::..::::::::::::::::::::.::::.::::.:: :::::::::::::: CCDS33 EMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLR 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 ALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRF :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:.: : :. : CCDS33 ALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTGNMF 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 PASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSV :.: : :.: :: ....::::.:::::::: :::.:::::::::: :::::::: CCDS33 DISDVNNLSDCQAL---GKQARWKNVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 NVDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQK .: :: :: .::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: CCDS33 DVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQK 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE2 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQ :::::::::::::::::::::.::.:: .::.:: :.::::::.:::::::::::: . : CCDS33 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQ 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE2 SQHMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLI ...:: :: ::.:::.::::: ::::.::::::::.:::::::::::.::::::::..: CCDS33 GKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEMI 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 ETYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYA : ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYA 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KE2 IFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKK ::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: CCDS33 IFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDT 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 VHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDF .::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS33 IHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE2 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE2 DILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRA ::::::::::::::::::.:: :::.:::..:::::::::::::::::::.:::..::: CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRN 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 YRRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDD-DLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSY .: : :.: .::::: : :.. . :: :.:: .:..: ::.:::::..::::::::: CCDS33 FRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNSTPEKTDGSSSTTSPPSY 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1950 1960 1970 pF1KE2 DSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK ::::::::::.:.:. :::.:::. .:..: CCDS33 DSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKEVRENQK 1980 1990 2000 >>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa) initn: 9286 init1: 4690 opt: 8538 Z-score: 7568.8 bits: 1414.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 10081; 76.8% identity (90.5% similar) in 1997 aa overlap (3-1970:5-1998) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEAGKQ .: ::::.:: ::..::: ::.::::.:.:.:: .::::::..:::.:::::::. CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEAGKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRI :::::::::: ::::::::::::: .:::::::::::.::::.:: :::.:.::.:::.: CCDS33 LPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPLRKI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCV .:::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::. CCDS33 AIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGFCL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGAL .:::::::::::::.::.:::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGAL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE2 IQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFR----------NSLENNETLE- :::::::::::::::::::::::::::::::::..::.. .:.:.: :.. CCDS33 IQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNITVNY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE2 --SIMNTLESEEDFR------KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDY ...: : :.. .: :.::: :::::: :.:.::::::: ::: ::::.: CCDS33 NGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNY 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 GYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILA :::::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::.::::::::::::::: CCDS33 GYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILA 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 VVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLS ::::::::::::..:::.::: :::::...:::.:: :. :.:.: : . : :: CCDS33 VVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLS 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVE .::::.:::::::::::::::::..::. :.:::: : ....:::::::::::.:....: CCDS33 DSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIE 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 GHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFG :.: ..::: :.:.:: ::::::::: ::.::::::::.::..:.:::..::::::: : CCDS33 GNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFE 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DNESRRGSLFVPHRPQERRSSNISQASRSPPML---PVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSA :::::: :::::.: :::.::.::.::: :: :.::::::.:::::::::: : :. 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CCDS33 DVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVE 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 KQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYY ::::: :::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: CCDS33 LQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYY 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQH :::::::::::::::::::::.:: .::.:: :.::::::.:::::::::::: . ::.. 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CCDS54 IQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNITVNY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE2 --SIMNTLESEEDFR------KYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDY ...: : :.. .: :.::: :::::: :.:.::::::: ::: ::::.: CCDS54 NGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNY 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 GYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILA :::::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::.::::::::::::::: CCDS54 GYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILA 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 VVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLS ::::::::::::..:::.::: :::::...:::.:: :. :.:.: : . : :: CCDS54 VVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLS 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 ESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVE .::::.:::::::::::::::::..::. :.:::: : ....:::::::::::.:....: CCDS54 DSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEK-DEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIE 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 GHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFG :.: ..::: :.:.:: ::::::::: ::.::::::::.::..:.:::..::::::: : CCDS54 GNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFE 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DNESRRGSLFVPHRPQERRSSNISQASRSPPML---PVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSA :::::: :::::.: :::.::.::.::: :: :.::::::.::::::::: CCDS54 DNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGVVSL------ 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 LMLPNGQLLPEGTTNQIH-KKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVEELEES :::.. . .::: ::. .: :.:.::. :::::: :::::::::::::: CCDS54 -----------GTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRAMSIASILTNTVEELEES 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 RQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHH :::::: ::.:.. ::::.:::::.: :. . ..:::::::::::::::::::::::::. CCDS54 RQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHY 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 PMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLA :::..:.:::..:::::::::.::: ::.:::::: ::: ::::::..::::::::: :: CCDS54 PMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLA 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 DVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQ .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 NVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQ 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 LFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLI :::::::.::::: .:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLT 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 VYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQTL :.::::::::::::::::::::::::.:::.: ..: . ::::::: :..::. :::. . CCDS54 VFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKI 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 REFILKAFSKKPKISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKDKIS---GFG ::: ..: .: :: ::. .:::.::.. .:::: ::..: ..::. . . : : CCDS54 YEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHT-AEIGKDLDYLKDVNGTTSGIGTG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 SSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSS :::.:.....:: .:::.::::::::::: ::::.::.:.:..::.:: : :: .::.:: CCDS54 SSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEDFSSESDLEESKEKLNESS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 SS-ECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDEPEACFTDGCVRRFSCCQVNIESGKGKIWWNIR :: : :::: : : :. .:: .. :::::::.:::.::.:::.:.: :.:: :::.: CCDS54 SSSEGSTVDIGAPVE-EQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 KTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEML .::..::::.:::.:::.::::::::::::::::...:::: .::::::.:::::::::: CCDS54 RTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEML 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 LKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALS :::.::::.::::::::::::::::::::.:.::.::::.:: ::::::::::::::::: CCDS54 LKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALS 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 RFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPAS ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: :.:: CCDS54 RFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 QVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNVD .: :...:. :.. ....::::.::::::::.:::::::::::::: :::::::: ::. CCDS54 DVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVE 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 KQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYY ::::: :::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: CCDS54 LQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYY 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQH :::::::::::::::::::::.:: .::.:: :.::::::.:::::::::::: . ::.. CCDS54 NAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEY 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 MTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETY .: .: ::.:::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::: : CCDS54 VTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKY 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 FVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFG :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFG 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 MSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHP ::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.: CCDS54 MSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNP 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 GSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMF ::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: CCDS54 GSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMF 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 YEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL ::::::::::::::.:: :::.:::::.::: . .:::.::::::::::::::::::::: CCDS54 YEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDIL 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 FAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRR :::::::::::::::.:: :::::::..:::::::.:::::::::::.:::..::::::: CCDS54 FAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRR 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 YRLRQNVKNISSIYIKDGDRDD-DLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTS-PPSYDS . :...::. : : :. . .:: :.:: .: .:::: :::: : ::.. ::::: CCDS54 HLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDR 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1950 1960 1970 pF1KE2 VTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK :::: ::.::. ... ::: CCDS54 VTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK 1970 1980 >>CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980 aa) initn: 6560 init1: 2045 opt: 7660 Z-score: 6790.2 bits: 1269.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9189; 70.9% identity (86.0% similar) in 2005 aa overlap (3-1976:5-1979) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKE----EKKDDDEEAPKPSSDLE .: ::::.:: :: .::: ::.:::: : :.: . ...::.. :::.:::: CCDS44 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AGKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSP :::.::::::::: :.:. ::::.:::: .:::.:::.:::.:::.::::::.::::. 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CCDS44 DVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKP 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 DKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKY :.::::: ..:::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS44 DEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKY 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQ ::::::::::::::::::: ::::: .::.::.::::: ::.:::::::::::: . ::. CCDS44 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSK 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 HMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIET .: ..:::::.::.:.:: :::::...:::::::.:::::::::::.:::::::::.:: CCDS44 QMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEK 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIF ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: CCDS44 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIF 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 GMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVH :::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::: :::: .::::. : : CCDS44 GMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILN-RPPDCSLDKEH 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 PGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEM :::. .:::::::::::.::::::::::.:::::::.::::::::::::..:::::::: CCDS44 PGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFET 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 FYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDI :::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..::::::::::::::::::: CCDS44 FYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDI 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 LFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYR ::::::::::.:::.: ::.::::::...::::::::::::::.::::.:::.:.::::: CCDS44 LFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYR 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 RYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSV . :.. .. :: . : .. :: ..: ::.: :::::: CCDS44 GHLARRG-----------------FICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSV 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE2 TKPDKEKY---EQDRTEKEDKGKDSKESKK :::.::: :. : :. . :. .::: CCDS44 TKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1960 1970 1980 >>CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980 aa) initn: 6554 init1: 2045 opt: 7660 Z-score: 6790.2 bits: 1269.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9183; 70.9% identity (86.0% similar) in 2005 aa overlap (3-1976:5-1979) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKE----EKKDDDEEAPKPSSDLE .: ::::.:: :: .::: ::.:::: : :.: . ...::.. :::.:::: CCDS81 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 AGKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSP :::.::::::::: :.:. ::::.:::: .:::.:::.:::.:::.::::::.::::. 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CCDS81 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 ESEE--DFRKYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWAF . :: . . :: . : . :::: :.:.::::::: :.: ::::.::::::::::::: CCDS81 DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 LALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQA ::::::::::::::::: ::::::::::::::.:::.:::::.::::::::::::::::: CCDS81 LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KE2 NIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIM-------GLSESSSE ..:::.::: ::. ::..:::.::::.: :: :. .. .. : : .:::: CCDS81 TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQA-AAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSE 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 TSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRA :::::::::::::::::..::.:: :::::: ::. ::::::..:::.:.: .: . CCDS81 ISKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRL--PDNRIG 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 HEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGR--DIGSETEFADDEHSIFGDNE ...: ::: ::: :: : .:..:..:.:::.: :: : :::.:::::::: ..: CCDS81 --RKFSIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE2 SRRGSLFVPHRPQERRSS-----NISQASRSPPMLPV---NGKMHSAVDCNGVVSLVDGR .:: :::.: : .::::: . ::.::: ..: . : .:.:::::::::. : CCDS81 GRRDSLFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGP 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 SALMLPNGQLLPEGTTNQIHKKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNT-VEELE .. . .:.::::.::. ::. .: :.: :.: . . ..: : :..::: ::::: CCDS81 GSHI--GGRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELE 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAME ::..:::: ::.::. ::::.: :::::.:. . .::::::::::::::::::::::::: CCDS81 ESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAME 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 HHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELF ::::: .:..:::.:::::::::.::: ::::::::: ::: ::::::..::.:::.:: CCDS81 HHPMTPQFEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELS 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 LADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS81 LADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVG 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 MQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMC ::::::::::::::::.:: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS81 MQLFGKSYKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMC 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 LIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQ :::.::::::::::::::::::::::::.:::.: ..: . :::::.: :::::. ..: CCDS81 LIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKL 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 TLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKD-KISGFG .. :. :... . :.. ..: :: : :.::: :.. .. .: :. . ::.: CCDS81 KVHAFMQAHFKQRE--ADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIG 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 SSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSS :::.:... : : .:::.::.::: :::: ::::.::.:.:..::.:: : :: .:. .: CCDS81 SSVEKYII-DEDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 SSECSTVDNPLPGEGEEAEAE-PMNSDEPEACFTDGCVRRFSCCQVNIESGKGKIWWNIR ::: ::.: . : ::. .: : . .:.::::.:::.::.::::::: : :: :: .: CCDS81 SSEGSTID--IKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILR 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 KTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEML :::. ::::.:::.::..:::::::::::::::::..:::. :::::::.:::::::::: CCDS81 KTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEML 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 LKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALS ::: :::. .::::::::::::: ::::.:.::.::::.:: ::::::::::::::::: CCDS81 LKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALS 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 RFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPAS ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.. :.: :. :: CCDS81 RFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 QVPNRSECFALMNVSQN-VRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNV .: :..:: ::. ... .::::.:.:::::: :::.:::::::::: :::::::: . CCDS81 DVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKP 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 DKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKY :.::::: ..:::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS81 DEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKY 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQ ::::::::::::::::::: ::::: .::.::.::::: ::.:::::::::::: . ::. CCDS81 YNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSK 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 HMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIET .: ..:::::.::.:.:: :::::...:::::::.:::::::::::.:::::::::.:: CCDS81 QMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEK 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIF ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: CCDS81 YFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIF 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 GMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVH :::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::: :::: .::::. : : CCDS81 GMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILN-RPPDCSLDKEH 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 PGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEM :::. .:::::::::::.::::::::::.:::::::.::::::::::::..:::::::: CCDS81 PGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFET 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 FYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDI :::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..::::::::::::::::::: CCDS81 FYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDI 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 LFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYR ::::::::::.:::.: ::.::::::...::::::::::::::.::::.:::.:.::::: CCDS81 LFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYR 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 RYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSV . :.. .. :: . : .. :: ..: ::.: :::::: CCDS81 GHLARRG-----------------FICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSV 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE2 TKPDKEKY---EQDRTEKEDKGKDSKESKK :::.::: :. : :. . :. .::: CCDS81 TKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC 1960 1970 1980 >>CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951 aa) initn: 7673 init1: 3131 opt: 6985 Z-score: 6191.7 bits: 1159.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9753; 74.6% identity (88.3% similar) in 2004 aa overlap (2-1977:4-1951) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEAGKQ :.: ::::.:: ::..::: ::.: ::.:.:.::.:. .:::. :::.:::::::. 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