FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2297, 1660 aa 1>>>pF1KE2297 1660 - 1660 aa - 1660 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7646+/-0.00117; mu= -15.0907+/- 0.070 mean_var=497.5079+/-101.749, 0's: 0 Z-trim(114.9): 44 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.057501 statistics sampled from 15445 (15474) to 15445 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.475), width: 16 Scan time: 7.070 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2 (1795) 11461 966.9 0 CCDS47120.1 TET2 gene_id:54790|Hs108|chr4 (2002) 2045 185.8 1.3e-45 CCDS7281.1 TET1 gene_id:80312|Hs108|chr10 (2136) 1727 159.4 1.2e-37 >>CCDS46339.2 TET3 gene_id:200424|Hs108|chr2 (1795 aa) initn: 11461 init1: 11461 opt: 11461 Z-score: 5154.7 bits: 966.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 11461; 100.0% identity (100.0% similar) in 1660 aa 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CCDS47 EQEQKSQQASVLQGYKNRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQK 890 900 910 920 930 940 530 540 550 560 570 pF1KE2 SLA--------LFAPSPSRDSLLPPTQ----EMRSPSPMT-ALQPGSTGPLPPADDKLEE . :. . .... : :. .:. : . . .: . : ..: . CCDS47 DTQKHAALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPENKTWK 950 960 970 980 990 1000 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 LIRQFEAEFGDSFGLPGPPSVPIQDPENQQTCLPA--PESPFATRSPKQIKIESSGAVTV . . : .. .. . .. . .: . .. .. .: ::.:.: :: ::: CCDS47 KVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKSQKQVKVEMSGPVTV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 640 650 660 670 680 pF1KE2 LS-----------TTCFHSEEGGQEATPTKAENPLTPTLSGFLESPLKYLDTPTKSLLDT :. : .... ..: :::: . .:..:.::: : :::: :.:::: CCDS47 LTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTA--ASVLNNFIESPSKLLDTPIKNLLDT 1070 1080 1090 1100 1110 1120 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 PAKRAQAEFPTCDCVEQIVEKDEGPYYTHLGSGPTVASIRELMEERYGEKGKAIRIEKVI :.: .: .::.: :::::.::::::.:::::.::.::.:::.::::.:.::::::::.:: CCDS47 PVK-TQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTHLGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 YTGKEGKSSRGCPIAKWVIRRHTLEEKLLCLVRHRAGHHCQNAVIVILILAWEGIPRSLG :::::::::.::::::::.:: . :::::::::.:::: :. ::::::::.::::: ::. 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CCDS47 LENSSNKNEKEK-SAPSRTKQTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQP----QPLQK--- 1490 1500 1510 1520 1530 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 FKYSGNAVVESYSVLGNCRPSDPYSMNSVYSYHSYYAQPSLTSVNGFHSKYALPSFSYYG .: .: ... . . .. :. :::.. .. . . :. CCDS47 ------------------QPPQPQQQQRPQQQQPHH--PQTESVNSYSASGS--TNPYMR 1540 1550 1560 1570 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 FPSSNPVFPSQFLGPGAWGHSGSSGSFEKKPDLHALHNSLSPAYGGAEFAELPSQAVPTD : ::: : :.. .:... ...: :: .: :::. . CCDS47 RP--NPVSPY----PNS-SHTSD------------IYGSTSPM----NFYSTSSQAAGSY 1580 1590 1600 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 AHHPTPHHQQPAYPGPKEYLLPKAPLLHSVSRDPSPFAQSSNCYNRSIKQEPVDP-LTQA . .: . : ::: ::.. .. : : .: : ... . .: : . CCDS47 LNSSNPMN--P-YPG----------LLNQNTQYP-----SYQC-NGNLSVDNCSPYLGSY 1610 1620 1630 1640 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 EPV--PRDAGKM-GKTPLSEVSQNGGPSHLWGQYSGGPSMSPKRTNGVGGSWGVFSSGES : : : .. .. :::..: : : : : :.: :. .. ..: : CCDS47 SPQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSL--PPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQNMQGDGFS 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 PAIVPDKLSSFGASCLAPSHFTDGQWGLFPGEGQQAASHSGGRLRGKPWSPCKFGNSTSA . .. : :.: ::. : : :.:. : ..: : :. : CCDS47 SCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGH---FMG----ATSRLPPNL-SNPNMDYKNGEHHS- 1710 1720 1730 1740 1750 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 LAGPSLTEKPWALGAGDFNSALKGSPGFQDKLWNPMKGEEGRIPAAGASQLDRAWQSFGL :: . .. . : :::.:.. .:.: : : .. : : :.. : CCDS47 ---PSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALH-LQNKE-NDMLSH----TANGLSKM--------L 1760 1770 1780 1790 1800 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 PLGSSEKLFGALKSEEKLWDPFSLEEGPAEEPPSKGAVKEEKGGGGAEEEEEELWSDSEH : . .. . . .:: : .: ..: . .: ... :...:.:::::. 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