Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4226
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4226, 801 aa
  1>>>pF1KE4226 801 - 801 aa - 801 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2841+/-0.000929; mu= -2.1983+/- 0.056
 mean_var=271.5193+/-55.372, 0's: 0 Z-trim(113.8): 45  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.077835
 statistics sampled from 14392 (14424) to 14392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.443), width:  16
 Scan time:  5.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19      ( 801) 5423 622.8  7e-178
CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19      ( 757) 5103 586.8 4.4e-167
CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1      ( 775) 1635 197.4 7.6e-50
CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1      ( 426) 1503 182.4 1.4e-45
CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9       ( 559) 1153 143.2 1.1e-33
CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9       (1009) 1153 143.4 1.8e-33
CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1      ( 396) 1002 126.1 1.1e-28


>>CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19           (801 aa)
 initn: 5423 init1: 5423 opt: 5423  Z-score: 3307.0  bits: 622.8 E(32554): 7e-178
Smith-Waterman score: 5423; 99.9% identity (100.0% similar) in 801 aa overlap (1-801:1-801)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 LRAPALPSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRAPALPSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 WAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNI
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSMGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 PRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 SADPSIWGDPKPSPLTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SADPSIWGDPKPSPLTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 PTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSN
              730       740       750       760       770       780

              790       800 
pF1KE4 CQKSQPSSRPRVADLKKCFEG
       :::::::::::::::::::::
CCDS45 CQKSQPSSRPRVADLKKCFEG
              790       800 

>>CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19           (757 aa)
 initn: 5103 init1: 5103 opt: 5103  Z-score: 3113.2  bits: 586.8 E(32554): 4.4e-167
Smith-Waterman score: 5103; 99.9% identity (100.0% similar) in 757 aa overlap (45-801:1-757)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE4 WFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVEREPPSPAVQHFTFALT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77                               MQMVPKFCFPFDVEREPPSPAVQHFTFALT
                                             10        20        30

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE4 DLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQDQVTEAEELLQNLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQDQVTEAEELLQNLF
               40        50        60        70        80        90

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE4 QQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDSGRLPSIPENRNLTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDSGRLPSIPENRNLTE
              100       110       120       130       140       150

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE4 LVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPH
              160       170       180       190       200       210

          260       270       280       290       300       310    
pF1KE4 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
              220       230       240       250       260       270

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE4 LRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEVFLAQKPGAPLQAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEVFLAQKPGAPLQAF
              280       290       300       310       320       330

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE4 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
              340       350       360       370       380       390

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE4 ALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGSLRAPALPSRSDRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGSLRAPALPSRSDRLQ
              400       410       420       430       440       450

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE4 QRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSG
              460       470       480       490       500       510

          560       570       580       590       600       610    
pF1KE4 EELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPE
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EELDLLSEILDSLSMGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPE
              520       530       540       550       560       570

          620       630       640       650       660       670    
pF1KE4 PQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTASADPSIWGDPKPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTASADPSIWGDPKPSP
              580       590       600       610       620       630

          680       690       700       710       720       730    
pF1KE4 LTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILAPTKPNFDIAWTSQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILAPTKPNFDIAWTSQP
              640       650       660       670       680       690

          740       750       760       770       780       790    
pF1KE4 LDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVAD
              700       710       720       730       740       750

          800 
pF1KE4 LKKCFEG
       :::::::
CCDS77 LKKCFEG
              

>>CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1           (775 aa)
 initn: 1718 init1: 848 opt: 1635  Z-score: 1008.4  bits: 197.4 E(32554): 7.6e-50
Smith-Waterman score: 1692; 46.9% identity (72.3% similar) in 599 aa overlap (1-584:1-592)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
       :. :....   .::  ... : :: .::: .: .:: :: ::: .: :::::::::::: 
CCDS72 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
         . . :::::.:::. ...::::::: .:   ::::::.::::::.::::::..: ::.
CCDS72 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
       .  .. .: :..:... .   .. :.: ... . ..  : .    .    : : :.::: 
CCDS72 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLK--DQPALVPHSYFIAPDV
              130       140       150       160         170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
         ::.:::.:::::  :::  .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::
CCDS72 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
       : :.:. ::.::::::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.
CCDS72 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
       :.. :: :::: :. .:.: . : :.::.: ::.::: :::.:::::  .::.:.:: ::
CCDS72 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
        :. .. .. .. : . :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. :  .:  :
CCDS72 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGNPR
      360        370       380       390       400       410       

              430       440       450           460       470      
pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKS----GLKGVQSLLMYKDGDSVLQ
       ::: :. ..:::: ::.... .:. :::.. :. ::.    ::: :.: : .:...    
CCDS72 SYQQWVHTVKKGG-ALFNTAMTKATPAVRTAYKFAKNHAKLGLKEVKSKLKHKENEEDYG
       420       430        440       450       460       470      

        480         490         500       510       520       530  
pF1KE4 RGGS--LRAPALPSRSDRL--QQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPL
         .:    .:.   ....   ...  ..:   : :::. :    : .  ..     .  :
CCDS72 TCSSSVQYTPVYKLHNEKGGNSEKRKLAQARLK-RPLK-SLDGALYDDEDDDDIERASKL
        480       490       500        510        520       530    

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pF1KE4 SPED--EGCPWAEEALDSSFLG-----SGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDC
       : ::  :.  .  :. ::         ::: .:::.::::.::. ... :.:  ..::: 
CCDS72 SSEDGEEASAYLYESDDSVETRVKTPYSGE-MDLLGEILDTLSTHSSDQGKLAAAKSLDF
          540       550       560        570       580       590   

         590       600       610       620       630       640     
pF1KE4 CHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPS
                                                                   
CCDS72 FRSMDDIDYKPTNKSNAPSENNLAFLCGGSGDQAEWNLGQDDSALHGKHLPPSPRKRVSS
           600       610       620       630       640       650   

>>CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1           (426 aa)
 initn: 1475 init1: 827 opt: 1503  Z-score: 932.0  bits: 182.4 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 1503; 53.2% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-414)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
       :. :....   .::  ... : :: .::: .: .:: :: ::: .: :::::::::::: 
CCDS41 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
         . . :::::.:::. ...::::::: .:   ::::::.::::::.::::::..: ::.
CCDS41 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
       .  .. .: :..:... .   .. :.: ... . ..  : .    .    : : :.::: 
CCDS41 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKD--QPALVPHSYFIAPDV
              130       140       150       160         170        

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pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
         ::.:::.:::::  :::  .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::
CCDS41 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
       : :.:. ::.::::::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.
CCDS41 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
       :.. :: :::: :. .:.: . : :.::.: ::.::: :::.:::::  .::.:.:: ::
CCDS41 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
        :. .. .. .. : . :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. :  .:   
CCDS41 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDK
      360        370       380       390       400       410       

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pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
                                                                   
CCDS41 LQYDYPFSQ                                                   
       420                                                         

>>CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9            (559 aa)
 initn: 1139 init1: 991 opt: 1153  Z-score: 717.9  bits: 143.2 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1584; 48.4% identity (72.6% similar) in 525 aa overlap (1-511:1-502)

               10        20          30        40        50        
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPAS--LQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVE
       : :: . .  ..:. . :.: : .     :: . :::: :. :::..: . :::::: :.
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 REPPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLL
           : . :.:::.:::. ...::::::: .:..::.::::.:::::::::::: ..:  
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE4 AQDQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAP
       .. : .. .:::..: .  .  : .:: : . :  ::                      :
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTV----------------------P
              130       140       150                              

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE4 DSGRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALL
       :. .::::::::::::  :::  .:.. :.:..: :::.:.  :::::::.:.:.: :.:
CCDS35 DTRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAML
      160       170       180       190       200       210        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE4 YPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETT
       ::: :.:: ::.::::::::::::::::::.: :: :.::. ::.:::.::::.::::: 
CCDS35 YPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETP
      220       230       240       250       260       270        

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pF1KE4 FNDVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFS
       :.:.:.:: ::.: :. ::.::. . :.::.: :::::: .::.::.::   : .:.:: 
CCDS35 FDDLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFC
      280       290       300       310       320       330        

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pF1KE4 EEVFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGA
       ::.:...  .. .. : . :..::::::::..::. ::.:::::: ::.::.  :  .:.
CCDS35 EEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQLQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEIN-MGEYAGS
      340       350       360       370       380       390        

      420       430       440       450           460       470    
pF1KE4 LRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKS----GLKGVQSLLMYKD----
        . :. : ....::.::.:..::.:..::.:..:. ::.    :.: :.. :  ::    
CCDS35 DKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVKTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAEN
       400       410       420       430       440       450       

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pF1KE4 GDSVL---QRGGSLRAPALPSRSDRLQQ-RLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPG
       : .     :   .  .: . ... .:.. : ::: :::. :: ::               
CCDS35 GCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKDPKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKRPKSNIAVEGR
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pF1KE4 AGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCC
                                                                   
CCDS35 RTSVPSPEQNTIATPATLHILQKSITHFAAKFPTRGWTSSSH                  
       520       530       540       550                           

>>CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9            (1009 aa)
 initn: 1176 init1: 991 opt: 1153  Z-score: 714.2  bits: 143.4 E(32554): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 1642; 39.2% identity (63.7% similar) in 811 aa overlap (1-786:1-770)

               10        20          30        40        50        
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPAS--LQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVE
       : :: . .  ..:. . :.: : .     :: . :::: :. :::..: . :::::: :.
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 REPPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLL
           : . :.:::.:::. ...::::::: .:..::.::::.:::::::::::: ..:  
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE4 AQDQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAP
       .. : .. .:::..: .  .  : .:: : . :  ::                      :
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTV----------------------P
              130       140       150                              

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE4 DSGRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALL
       :. .::::::::::::  :::  .:.. :.:..: :::.:.  :::::::.:.:.: :.:
CCDS35 DTRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAML
      160       170       180       190       200       210        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE4 YPMRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETT
       ::: :.:: ::.::::::::::::::::::.: :: :.::. ::.:::.::::.::::: 
CCDS35 YPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETP
      220       230       240       250       260       270        

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE4 FNDVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFS
       :.:.:.:: ::.: :. ::.::. . :.::.: :::::: .::.::.::   : .:.:: 
CCDS35 FDDLQSLPNDVISSLKNRLKKVSTTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFC
      280       290       300       310       320       330        

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE4 EEVFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGA
       ::.:...  .. .. : . :..::::::::..::. ::.:::::: ::.::.  :  .:.
CCDS35 EEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQLQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEIN-MGEYAGS
      340       350       360       370       380       390        

      420       430       440       450           460       470    
pF1KE4 LRSYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKS----GLKGVQSLLMYKD----
        . :. : ....::.::.:..::.:..::.:..:. ::.    :.: :.. :  ::    
CCDS35 DKLYHQWLSTVRKGSGAILNTVKTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAEN
       400       410       420       430       440       450       

                 480       490        500       510       520      
pF1KE4 GDSVL---QRGGSLRAPALPSRSDRLQQ-RLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPG
       : .     :   .  .: . ... .:.. : ::: :::. :: ::   ..  ...    :
CCDS35 GCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAKDPKLREDRRPITVHFGQVRPPRPHVVKR-PKSNIAVEG
       460       470       480       490       500        510      

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pF1KE4 AGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCC
         :   :::.   :   ..:  :  . :.: .   . . . :.:   :   : . :.:  
CCDS35 RRTSVPSPEQ---PQPYRTLRESDSAEGDEAESPEQQVRK-STGPVPAPPDR-AASIDLL
        520          530       540       550        560        570 

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pF1KE4 HR--GDLDSCFSLPNIPRWQP-DDKKLPEP-EPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQL
       .   ..::   .:  . . .  .: . :.  . :: ..    .  .: ..  :.     :
CCDS35 EDVFSNLDMEAALQPLGQAKSLEDLRAPKDLREQPGTFD--YQRLDLGGSERSRGVTVAL
             580       590       600       610         620         

            650       660        670        680       690          
pF1KE4 IPSESDQEVTSPSQSSTA-SADPSIWGDPKPSPLT-EPLILHLTPSHKAA--EDSTAQEN
         ..  ... : .:.. :  . :   .  ::: :  . : :   :... .  . :  .: 
CCDS35 KLTHPYNKLWSLGQDDMAIPSKPPAASPEKPSALLGNSLALPRRPQNRDSILNPSDKEEV
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      700       710          720       730       740       750     
pF1KE4 PTPWLSTAPTEPSPP--ESPQI-LAPTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKAL
       ::: :..  : : :   ..:.. ..:  :        .:   ..  ..: :   :  .. 
CCDS35 PTPTLGSI-TIPRPQGRKTPELGIVPPPP------IPRPAKLQAAGAALGDVSERL-QTD
     690        700       710             720       730        740 

         760       770       780       790       800               
pF1KE4 LAERAHLQPREEPGALNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVADLKKCFEG              
         .:: :.:   ::..  :  ::   :  .:                             
CCDS35 RDRRAALSPGLLPGVV--PQGPTELLQPLSPGPGAAGTSSDALLALLDPLSTAWSGSTLP
             750         760       770       780       790         

CCDS35 SRPATPNVATPFTPQFSFPPAGTPTPFPQPPLNPFVPSMPAAPPTLPLVSTPAGPFGAPP
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>>CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1           (396 aa)
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Smith-Waterman score: 1412; 54.0% identity (77.0% similar) in 396 aa overlap (22-417:12-384)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
                            :  .  .: .: .:: :: ::: .: :::::::::::: 
CCDS72           MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
         . . :::::.:::. ...::::::: .:   ::::::.::::::.::::::..: ::.
CCDS72 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
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pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
       .  .. .: :..:... .  :.:.. ..:    .: :                 :.::: 
CCDS72 ELENDLNETLRSLYNHPV--PKANTPVNL----SVHSY----------------FIAPDV
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              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
         ::.:::.:::::  :::  .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::
CCDS72 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
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pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
       : :.:. ::.::::::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.
CCDS72 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
      210       220       230       240       250       260        

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pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
       :.. :: :::: :. .:.: . : :.::.: ::.::: :::.:::::  .::.:.:: ::
CCDS72 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
      270       280       290       300       310       320        

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
        :. .. .. .. : . :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. :  .:   
CCDS72 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDK
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CCDS72 LQYDYPFSQ                                                   
       390                                                         




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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