FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2531, 701 aa 1>>>pF1KE2531 701 - 701 aa - 701 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7679+/-0.000467; mu= 17.1125+/- 0.029 mean_var=83.7964+/-15.904, 0's: 0 Z-trim(110.0): 119 B-trim: 36 in 1/51 Lambda= 0.140108 statistics sampled from 18185 (18311) to 18185 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16 Scan time: 10.440 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta iso ( 701) 4808 982.7 0 NP_001295100 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta ( 700) 4789 978.9 0 XP_011524315 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 628) 3051 627.5 4.6e-179 XP_011524316 (OMIM: 600389) PREDICTED: meprin A su ( 577) 2692 554.9 3e-157 XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 774) 1791 372.9 2.6e-102 XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A su ( 705) 1789 372.5 3.1e-102 NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha pr ( 746) 1789 372.5 3.3e-102 NP_001002036 (OMIM: 608860) astacin-like metalloen ( 431) 460 103.7 1.6e-21 XP_011509508 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 432) 460 103.7 1.6e-21 XP_011509507 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 436) 460 103.7 1.6e-21 NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 444 100.7 2.9e-20 NP_001191689 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like pr ( 392) 434 98.4 5.5e-20 XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 434 98.6 8e-20 XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 434 98.6 9e-20 NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 434 98.6 9.1e-20 XP_006716449 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 813) 434 98.6 9.9e-20 XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 434 98.7 1.1e-19 NP_006120 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 986) 434 98.7 1.2e-19 NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 434 98.7 1.2e-19 XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 398 91.4 1.6e-17 XP_011509510 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 252) 380 87.4 7.4e-17 XP_011509509 (OMIM: 608860) PREDICTED: astacin-lik ( 418) 377 86.9 1.7e-16 NP_705691 (OMIM: 609626) MAM domain-containing gly ( 955) 285 68.6 1.3e-10 XP_016866223 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 961) 283 68.2 1.8e-10 XP_006715119 (OMIM: 609626) PREDICTED: MAM domain- ( 973) 283 68.2 1.8e-10 XP_006717587 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 889) 183 47.9 0.0002 XP_006717585 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 907) 183 47.9 0.0002 NP_001231901 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform d ( 917) 183 47.9 0.00021 XP_006717584 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 924) 183 47.9 0.00021 NP_057331 (OMIM: 607056,613581,616152) interphotor (1241) 184 48.2 0.00023 XP_016872355 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 742) 171 45.4 0.00093 XP_006717588 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 888) 171 45.5 0.0011 XP_016872354 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 899) 171 45.5 0.0011 NP_001316997 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform f ( 906) 171 45.5 0.0011 NP_001231902 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform e ( 916) 171 45.5 0.0011 NP_003864 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform a pr ( 923) 171 45.5 0.0011 XP_016881400 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty ( 840) 164 44.1 0.0027 NP_002836 (OMIM: 176888) receptor-type tyrosine-pr (1452) 164 44.2 0.0043 NP_001098714 (OMIM: 176888) receptor-type tyrosine (1465) 164 44.2 0.0043 XP_011524014 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1482) 164 44.2 0.0043 XP_011524012 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1490) 164 44.2 0.0044 XP_011524010 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty (1507) 164 44.2 0.0044 XP_016881401 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty ( 793) 155 42.2 0.0092 XP_016881399 (OMIM: 176888) PREDICTED: receptor-ty ( 835) 155 42.2 0.0096 >>NP_005916 (OMIM: 600389) meprin A subunit beta isoform (701 aa) initn: 4808 init1: 4808 opt: 4808 Z-score: 5254.3 bits: 982.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4808; 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82.3% identity (82.3% similar) in 701 aa overlap (1-701:1-577) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDIRLDRAQI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMD ::: XP_011 LSG--------------------------------------------------------- 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 FSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHS XP_011 ------------------------------------------------------------ 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 NMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 -------SGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIR 190 200 210 220 230 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDI 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLI 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVG 360 370 380 390 400 410 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQIQLTP 420 430 440 450 460 470 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 APSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSST 480 490 500 510 520 530 670 680 690 700 pF1KE2 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF 540 550 560 570 >>XP_011512930 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A subuni (774 aa) initn: 1632 init1: 599 opt: 1791 Z-score: 1957.9 bits: 372.9 E(85289): 2.6e-102 Smith-Waterman score: 1845; 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XP_011 GFYHEQSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNK 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 NGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQ :.. :::...: .:...::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.::::: XP_011 NASVPTITAKIPEFNSIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQ 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRG .. :..:: . ... : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: XP_011 GTRDDTDWAHQDSAQAG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRK 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 FQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKV :::::. .:: ::.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: XP_011 QQCLQFFYKMTGSPSDRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKE 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TKKFRVVFEGRKGSGA-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSP .::: .:.: ::. : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: XP_011 EQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSP 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 pF1KE2 PFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDI ::.:.::.: . : ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::. XP_011 RFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDV 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RQRMSNQRSITTDPFMTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHE :.:::.. .::. :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. XP_011 RNRMSSSMVFTTSKSHTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQ 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 pF1KE2 RLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA-------------------- :: :.:.:.::. :.. :::.::..:.. .:.: XP_011 MLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAM 610 620 630 640 650 660 610 620 pF1KE2 -------------PSVQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAEC :: : : :. . :.:::.:. : : : XP_011 LEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASC 670 680 690 700 710 720 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 RCQSGEDWWYMGERCEKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSS :: ::. ..: ::::. ... .....:..:. : . : XP_011 RCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLGMVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK 730 740 750 760 770 690 700 pF1KE2 NRPNLTPQNQHAF >>XP_011512931 (OMIM: 600388) PREDICTED: meprin A subuni (705 aa) initn: 1558 init1: 599 opt: 1789 Z-score: 1956.3 bits: 372.5 E(85289): 3.1e-102 Smith-Waterman score: 1789; 45.3% identity (71.9% similar) in 612 aa overlap (4-596:3-604) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: XP_011 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. XP_011 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: XP_011 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE : ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:. XP_011 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP ..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ... XP_011 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : XP_011 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. XP_011 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : XP_011 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLY 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. XP_011 PNSRESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : XP_011 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 LLTVEDISHLNSTQIQLTPAPSVQDLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGE .. :::.::..:.. XP_011 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS 590 600 610 620 630 640 >>NP_005579 (OMIM: 600388) meprin A subunit alpha precur (746 aa) initn: 1632 init1: 599 opt: 1789 Z-score: 1956.0 bits: 372.5 E(85289): 3.3e-102 Smith-Waterman score: 1843; 41.0% identity (66.0% similar) in 744 aa overlap (4-670:3-736) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI : : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.::: NP_005 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET :... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::. 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NP_005 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : NP_005 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. NP_005 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : NP_005 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLY 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. 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